Heatmap: Cluster_93 (Lactuca sativa (Lsa) Coexpression Clusters (HCCA Algorithm))

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(Values are log2 transformed ratios of a genes expression in a sample divided by the mean expression level)

Gene
Light: 268 uE m-2 s-1
Light: 202.5 uE m-2 s-1 (Control)
Light: 135 uE m-2 s-1
Light: 67.5 uE m-2 s-1
Photoperiod: L24
Photoperiod: L20D4 (Control)
Photoperiod: L12D12
Photoperiod: L8D16
RBW: 4:1:1 (Control)
RBW: 4:1:0
RBW: 3:1:1
RBW: 3:1:0
Nitrogen: 0%
Nitrogen: 25%
Nitrogen: 50%
Nitrogen: 100% (Control)
Nitrogen: 150%
Phosphorous: 0%
Phosphorous: 25%
Phosphorous: 50%
Phosphorous: 100% (Control)
Phosphorous: 150%
Potassium: 0%
Potassium: 25%
Potassium: 50%
Potassium: 100% (Control)
Potassium: 150%
Temperature: 20°C
Temperature: 25°C (Control)
Temperature: 30°C
Temperature: 35°C
0.25 0.44 0.29 0.17 0.32 -0.09 -0.62 -0.8 -0.42 -0.67 -0.24 -0.49 -0.2 0.44 0.42 -0.22 -0.47 0.97 -0.09 -0.58 -0.33 -0.5 1.59 -0.51 -0.43 -0.5 -0.49 -0.6 -0.11 -0.14 0.21
-0.23 -0.2 -0.07 0.03 0.53 0.36 -0.73 -1.08 -0.2 -0.27 -0.16 -0.3 0.04 0.7 0.51 -0.1 -0.19 0.92 -0.26 -0.5 -0.32 -0.33 1.07 -0.48 -0.41 -0.2 -0.2 -0.27 0.04 -0.09 0.1
-0.1 -0.15 -0.39 -0.34 0.53 0.09 -0.54 -0.57 -0.51 -0.73 -0.55 -0.72 0.01 0.54 0.6 -0.18 -0.34 0.98 -0.16 -0.49 -0.45 -0.61 1.8 -0.53 -0.42 -0.43 -0.43 -0.61 0.18 0.13 0.31
0.71 0.85 0.62 0.23 0.78 0.28 -0.77 -0.81 -0.7 -0.77 -0.54 -0.77 -0.35 0.51 0.28 -0.35 -0.65 1.33 -0.45 -0.86 -0.63 -0.66 1.63 -0.93 -0.72 -0.61 -0.59 -0.62 -0.43 -0.35 -0.65
0.78 0.6 0.74 0.27 0.2 -0.05 -0.46 -0.42 -0.99 -0.97 -0.83 -0.77 0.02 0.22 0.09 -0.36 -0.37 1.37 -0.61 -0.81 -0.74 -0.73 1.95 -0.71 -0.67 -0.65 -0.72 -0.63 -0.37 -0.46 -0.27
0.36 0.43 -0.12 -0.29 0.71 0.25 -0.6 -0.64 -0.47 -0.32 -0.34 -0.38 0.01 0.55 0.45 -0.06 -0.26 0.99 -0.11 -0.47 -0.47 -0.34 1.19 -0.67 -0.42 -0.3 -0.32 -0.54 -0.08 -0.21 -0.17
-0.11 -0.23 0.0 0.39 0.49 0.23 -0.41 -0.62 -0.26 -0.25 -0.17 -0.31 -0.37 0.7 0.37 -0.26 -0.52 1.28 -0.25 -0.56 -0.57 -0.46 1.37 -0.56 -0.55 -0.45 -0.35 -0.31 0.07 -0.17 -0.35
0.89 1.01 0.42 -0.82 0.6 -0.16 -1.34 -0.96 -1.3 -1.4 -1.4 -1.18 -0.23 0.54 0.22 -0.8 -0.78 2.0 -0.94 -1.43 -1.26 -1.07 2.57 -1.33 -1.26 -1.21 -1.23 -1.02 -0.69 -0.63 -0.88
-0.11 -0.15 -0.08 0.19 0.72 0.21 -0.58 -0.71 -0.16 -0.09 0.11 -0.02 -0.42 0.59 0.53 -0.16 -0.33 0.33 -0.13 -0.39 -0.38 -0.31 1.24 -0.34 -0.39 -0.41 -0.34 -0.44 0.01 -0.01 -0.01
0.18 0.04 0.16 -0.05 0.34 0.11 -0.31 -0.44 -0.35 -0.39 -0.28 -0.35 -0.05 0.62 0.3 -0.07 -0.25 0.71 -0.24 -0.5 -0.39 -0.29 1.1 -0.44 -0.32 -0.21 -0.23 -0.22 0.08 0.01 0.13
0.32 -0.08 0.49 0.25 0.43 0.18 -0.4 -0.27 -0.6 -0.6 -0.59 -0.56 0.22 0.55 0.27 -0.29 -0.41 0.74 -0.47 -0.59 -0.51 -0.51 1.52 -0.53 -0.41 -0.43 -0.38 -0.42 -0.12 -0.1 0.26
0.79 0.91 1.02 0.37 1.06 -0.05 -0.83 -0.92 -0.96 -1.07 -0.81 -1.0 -0.52 0.57 0.43 -0.58 -0.98 1.21 -0.6 -1.14 -1.25 -0.96 2.45 -2.01 -1.54 -1.37 -1.19 -1.08 -0.56 -1.24 -1.49
0.89 0.73 0.52 -0.74 -0.54 -0.52 -0.44 -0.23 -1.03 -1.03 -1.07 -0.9 -0.08 0.92 0.22 -0.76 -0.72 1.64 -0.49 -0.93 -1.19 -0.79 2.34 -0.68 -0.98 -0.77 -0.77 -0.81 -0.67 -0.8 -0.37
0.5 0.76 0.19 0.19 0.73 0.11 -1.34 -1.79 -0.81 -1.14 -0.72 -0.85 -0.6 1.12 0.7 -0.2 -0.59 1.83 -0.46 -0.94 -0.92 -0.73 1.75 -1.32 -0.91 -0.61 -0.53 -0.74 -0.57 -0.8 -0.79
-0.17 -0.3 0.05 0.21 0.17 0.09 -0.68 -0.89 -0.32 -0.13 -0.32 -0.23 -0.14 0.52 0.2 -0.06 -0.15 0.91 -0.4 -0.47 -0.52 -0.4 1.85 -0.5 -0.35 -0.34 -0.14 -0.32 -0.12 -0.24 -0.26
0.09 0.31 -0.33 -0.65 0.47 0.1 -0.46 -0.36 -0.62 -0.72 -0.56 -0.63 0.13 0.73 0.42 -0.18 -0.47 1.36 -0.38 -0.64 -0.51 -0.57 1.79 -0.6 -0.58 -0.56 -0.56 -0.59 -0.23 -0.15 0.14
0.51 0.61 0.74 0.52 0.76 0.34 -0.65 -0.76 -0.68 -0.64 -0.61 -0.61 -0.36 0.15 0.06 -0.34 -0.66 1.15 -0.71 -0.91 -0.73 -0.58 1.93 -0.86 -0.65 -0.66 -0.55 -0.45 -0.32 -0.5 -0.65
0.71 0.66 0.74 0.15 0.96 0.34 -1.0 -1.27 -0.81 -0.81 -0.69 -0.86 -0.5 0.67 0.5 -0.27 -0.68 1.24 -0.49 -1.02 -0.69 -0.72 1.77 -0.96 -0.83 -0.76 -0.58 -0.77 -0.27 -0.46 -0.46
0.59 0.04 0.57 0.68 1.03 0.5 -0.67 -0.66 -0.96 -0.84 -0.54 -1.21 -0.31 0.95 0.62 -0.46 -0.91 0.73 -0.53 -1.08 -0.57 -0.58 2.19 -1.4 -1.13 -1.07 -0.65 -0.77 -0.28 -0.81 -1.85
0.07 0.18 0.09 0.26 0.47 0.11 -0.32 -0.34 -0.45 -0.49 -0.28 -0.44 -0.24 0.68 0.39 -0.08 -0.29 0.94 -0.2 -0.44 -0.36 -0.43 1.11 -0.52 -0.49 -0.29 -0.37 -0.29 -0.03 -0.09 0.05
0.18 0.18 -0.16 -0.19 1.31 0.44 -1.26 -1.83 -0.25 -0.27 -0.15 -0.39 -0.48 0.42 0.39 -0.21 -0.58 0.81 -0.44 -0.76 -0.61 -0.61 1.87 -0.98 -0.9 -0.66 -0.58 -0.58 0.17 0.07 -0.08
0.05 0.88 0.61 -0.67 0.1 -1.11 -1.21 -1.71 -0.84 -1.39 -1.01 -0.58 0.47 0.82 0.41 -0.67 -0.52 1.59 -0.4 -0.55 -0.84 -1.27 2.02 -0.77 -0.74 -0.72 -0.81 -1.23 -0.6 -0.23 1.0
0.26 -0.09 0.29 0.2 0.7 0.29 -0.56 -0.68 -0.43 -0.43 -0.3 -0.57 -0.22 0.35 0.15 -0.26 -0.45 0.75 -0.33 -0.64 -0.4 -0.37 1.68 -0.66 -0.52 -0.38 -0.42 -0.44 0.04 0.01 0.11
0.85 0.93 1.38 0.95 0.57 -0.51 -1.11 -0.76 -0.62 -0.68 -0.32 -0.16 0.04 -0.55 -0.63 -0.93 -1.04 1.58 -0.97 -1.13 -1.15 -1.02 1.39 -1.27 -1.09 -0.85 -0.67 -1.41 -0.33 -0.16 0.63
0.09 0.15 0.25 -0.17 0.8 0.25 -0.59 -0.63 -0.45 -0.53 -0.41 -0.48 -0.13 0.54 0.52 -0.12 -0.26 0.95 -0.29 -0.62 -0.67 -0.47 1.4 -0.79 -0.54 -0.51 -0.41 -0.68 0.01 0.11 0.32
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0.87 0.8 1.11 0.45 0.18 -0.25 -1.53 -1.72 -1.15 -0.79 -0.87 -1.19 0.36 0.5 0.24 -0.46 -0.5 1.14 -0.67 -0.97 -0.73 -0.57 1.94 -0.76 -0.74 -0.41 -0.54 -0.75 -0.58 -0.71 0.0
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-0.12 0.38 -0.12 -0.05 0.37 -0.27 -0.93 -0.99 -1.07 -1.11 -0.97 -1.17 -0.2 0.68 0.27 -0.26 -0.29 1.77 -0.55 -1.04 -0.98 -1.04 2.65 -1.04 -0.87 -0.78 -0.59 -1.34 -0.59 -0.67 -0.52
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0.78 -0.3 -0.26 -0.44 1.67 0.41 -1.7 -2.09 -0.59 -0.93 -0.47 -0.63 -0.56 0.41 0.92 -0.29 -0.6 0.31 -0.6 -1.0 -0.68 -0.34 1.91 -0.65 -0.83 -1.0 -0.47 -0.69 0.12 -0.0 0.28
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0.18 -0.01 0.2 0.24 0.05 -0.04 -0.23 -0.27 -0.43 -0.31 -0.23 -0.32 0.07 0.33 0.19 -0.07 -0.22 0.68 0.02 -0.37 -0.45 -0.4 1.31 -0.49 -0.39 -0.28 -0.3 -0.51 -0.07 0.01 0.34
0.49 -0.14 0.39 0.14 0.77 0.43 -0.4 -0.37 -0.28 -0.28 -0.41 -0.6 -0.68 0.62 0.3 -0.5 -0.48 0.87 -0.43 -0.57 -0.47 -0.62 1.36 -0.62 -0.71 -0.34 -0.28 -0.46 0.02 0.07 -0.06
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0.28 -0.09 0.11 0.44 0.67 0.49 -0.82 -0.74 -0.35 -0.21 -0.28 -0.55 -0.22 0.75 0.38 -0.31 -0.45 0.18 -0.26 -0.54 -0.47 -0.34 1.33 -0.58 -0.45 -0.27 -0.39 -0.37 0.2 0.09 0.07
-0.37 -0.19 0.32 0.5 0.74 0.31 -1.15 -0.87 -0.3 -0.26 0.03 -0.21 -0.39 0.73 0.45 -0.26 -0.55 0.56 -0.29 -0.73 -0.58 -0.56 1.52 -0.55 -0.57 -0.61 -0.46 -0.81 0.15 0.23 0.3
0.75 0.6 0.94 0.73 0.02 0.18 -0.5 -0.68 -0.29 -0.22 -0.2 -0.23 -0.37 -0.47 -0.46 -0.33 -0.49 1.06 0.12 -0.32 -0.4 -0.47 1.2 -0.66 -0.57 -0.29 -0.31 -0.63 -0.46 -0.32 -0.39
0.11 0.52 0.18 -0.24 1.06 0.18 -0.78 -1.01 -0.88 -1.07 -0.83 -0.77 -0.27 0.64 0.4 -0.17 -0.58 1.58 -0.51 -1.34 -1.02 -0.9 2.27 -0.97 -0.9 -0.95 -0.95 -0.73 -0.6 -0.35 -0.51
Lsat_1_v5_gn_3_140280.1 (UBDK GAMMA 4)
0.2 0.27 -0.2 -0.6 0.71 0.34 -0.34 -0.48 -0.79 -0.67 -0.82 -0.89 -0.41 0.55 0.37 -0.2 -0.47 1.24 -0.13 -0.56 -0.56 -0.44 2.03 -0.71 -0.65 -0.47 -0.51 -0.49 -0.14 -0.32 -0.47
0.32 -0.28 0.36 0.67 0.66 0.28 -0.47 -1.05 -0.18 -0.29 -0.15 -0.47 -0.57 0.47 0.63 -0.39 -0.81 0.85 -0.22 -0.71 -0.39 -0.56 1.8 -0.87 -0.79 -0.61 -0.65 -1.03 0.16 -0.25 -0.44
0.08 -0.95 0.0 0.68 0.87 0.33 -1.18 -1.89 -0.23 -0.24 -0.33 -0.65 -1.14 0.58 0.26 -0.65 -0.8 1.73 -0.37 -0.57 -0.39 -0.58 1.69 -0.56 -0.68 -0.63 -0.69 -0.32 -0.02 -0.13 -0.2
0.17 -0.15 0.09 0.26 0.94 0.17 -1.1 -1.34 -0.79 -0.82 -0.87 -0.99 -0.57 0.86 0.62 -0.49 -0.9 1.94 -0.49 -0.98 -1.0 -0.94 2.29 -1.02 -1.1 -0.95 -0.97 -1.11 -0.5 -0.69 -0.71
0.28 1.06 0.22 -0.17 -0.09 -0.4 -0.91 -0.9 -0.48 -0.42 -0.43 -0.33 0.5 0.23 0.17 -0.21 -0.32 0.78 -0.32 -0.44 -0.52 -0.73 1.33 -0.5 -0.5 -0.57 -0.49 -0.83 0.06 0.18 0.93
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0.14 0.11 0.09 0.16 0.42 0.16 -0.25 -0.27 -0.47 -0.51 -0.37 -0.38 -0.07 0.39 0.36 -0.07 -0.2 0.8 -0.32 -0.5 -0.23 -0.26 1.17 -0.49 -0.32 -0.28 -0.29 -0.22 -0.03 0.0 -0.01
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0.36 0.38 0.59 0.32 0.44 0.01 -0.94 -1.03 -0.57 -0.73 -0.52 -0.59 -0.04 0.67 0.3 -0.17 -0.44 0.63 -0.37 -0.76 -0.69 -0.68 1.94 -0.74 -0.58 -0.53 -0.61 -0.62 -0.18 -0.16 0.26
-0.7 -1.42 0.22 0.8 0.97 0.07 -2.6 -3.37 -0.6 -0.65 -0.24 -0.3 -0.99 0.43 0.32 -0.85 -0.76 2.14 -0.67 -0.79 -0.74 -0.6 2.19 -1.51 -0.98 -0.7 -0.41 -0.95 -0.49 -0.7 0.21
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-0.17 0.86 -1.39 -1.3 1.47 0.77 -0.52 -1.18 -1.15 -1.57 -1.25 -1.39 0.07 0.83 1.06 0.02 -0.64 1.74 -0.38 -1.04 -0.65 -0.88 1.58 -1.0 -1.04 -0.77 -1.21 -1.09 -0.71 -0.64 0.32
-0.21 -0.2 -0.06 0.27 0.6 0.42 -0.3 -0.54 -0.11 -0.19 0.04 -0.13 -0.37 0.38 0.12 -0.23 -0.43 0.0 -0.4 -0.46 -0.25 -0.16 1.19 -0.37 -0.17 -0.07 -0.09 -0.28 0.09 0.19 0.21
-0.36 -0.41 -0.38 0.19 0.61 0.28 -0.51 -0.61 -0.22 -0.3 0.01 0.02 -0.34 0.17 0.32 -0.03 -0.3 0.51 -0.79 -0.55 -0.46 -0.53 1.88 -0.51 -0.64 -0.54 -0.43 -0.28 0.04 0.25 0.29
-0.46 -0.63 -0.91 -0.66 1.27 0.66 -1.86 -1.71 -0.35 -0.21 -0.2 -0.24 -0.71 0.6 0.19 -0.43 -0.9 1.02 -0.38 -0.82 -0.56 -0.54 2.02 -0.57 -0.44 -0.57 -0.28 -1.18 0.38 0.27 0.42
0.32 -0.22 0.09 0.25 0.66 0.57 -0.5 -1.23 -1.23 -1.29 -1.27 -1.66 -1.47 1.03 0.96 -0.94 -1.35 1.72 0.02 -1.26 -0.49 -0.64 2.49 -1.3 -1.0 -1.09 -0.83 -0.96 -0.66 -1.21 -1.24
0.38 0.36 0.77 0.52 0.55 -0.1 -0.55 -0.71 -0.36 -0.19 -0.14 -0.24 -0.57 0.58 0.37 -0.29 -0.48 0.2 -0.29 -0.61 -0.58 -0.57 1.48 -0.76 -0.66 -0.44 -0.37 -0.67 -0.01 -0.02 0.12
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0.15 -0.27 0.11 0.05 0.39 0.42 -0.49 -0.76 -0.31 -0.34 -0.16 -0.32 -0.45 0.74 0.4 -0.16 -0.41 1.04 -0.27 -0.57 -0.38 -0.31 1.32 -0.55 -0.41 -0.21 -0.32 -0.58 -0.05 0.04 -0.06
-0.26 -0.6 0.52 0.16 -0.17 -0.04 -0.61 -0.99 -0.37 -0.39 -0.42 -0.23 -0.14 -0.02 -0.2 -0.26 -0.25 1.17 -0.48 -0.37 -0.49 -0.45 2.24 -0.43 -0.46 -0.33 -0.38 -0.52 -0.43 -0.32 0.26
0.52 0.24 0.92 1.21 0.34 -0.02 -0.97 -1.27 -0.32 -0.27 -0.03 -0.47 -0.48 0.26 -0.07 -0.4 -0.88 1.0 -0.75 -0.9 -0.54 -0.59 1.55 -0.69 -0.57 -0.36 -0.48 -0.83 -0.05 -0.17 -0.18
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Details

Dark gray cells indicate values where the raw expression is zero (cannot be log-transformed). Blue cells indicate samples where the expression of the gene is below average and red cells indicate the gene is expressed above average in the sample. White cells are average.