Heatmap: Cluster_200 (Lactuca sativa (Lsa) Coexpression Clusters (HCCA Algorithm))

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(Values are log₂ transformed ratios of a genes expression in a sample divided by the mean expression level)

Gene	Light: 268 uE m-2 s-1	Light: 202.5 uE m-2 s-1 (Control)	Light: 135 uE m-2 s-1	Light: 67.5 uE m-2 s-1	Photoperiod: L24	Photoperiod: L20D4 (Control)	Photoperiod: L12D12	Photoperiod: L8D16	RBW: 4:1:1 (Control)	RBW: 4:1:0	RBW: 3:1:1	RBW: 3:1:0	Nitrogen: 0%	Nitrogen: 25%	Nitrogen: 50%	Nitrogen: 100% (Control)	Nitrogen: 150%	Phosphorous: 0%	Phosphorous: 25%	Phosphorous: 50%	Phosphorous: 100% (Control)	Phosphorous: 150%	Potassium: 0%	Potassium: 25%	Potassium: 50%	Potassium: 100% (Control)	Potassium: 150%	Temperature: 20°C	Temperature: 25°C (Control)	Temperature: 30°C	Temperature: 35°C
Lsat_1_v5_gn_0_21141.1	-0.41	-0.21	-0.27	-0.05	0.54	0.69	-0.27	-0.47	-0.35	-0.39	-0.05	-0.28	0.04	0.59	0.36	0.01	-0.21	0.58	-0.17	-0.3	-0.2	-0.1	0.57	-0.32	-0.32	-0.11	-0.02	-0.14	0.1	-0.06	0.0
Lsat_1_v5_gn_0_47540.1 (G6PD6)	-0.88	-0.83	-1.15	-1.3	0.9	0.49	-0.75	-0.45	-0.81	-0.65	-0.66	-0.58	-0.12	0.86	0.83	-0.26	-0.41	1.67	-0.0	-0.62	-0.56	-0.39	1.45	-0.46	-0.5	-0.56	-0.43	-0.36	0.15	-0.16	0.24
Lsat_1_v5_gn_0_8161.1	-0.08	-0.16	-0.0	-0.05	0.35	0.33	0.08	0.15	-0.55	-0.38	-0.38	-0.37	0.13	0.36	0.1	-0.14	-0.25	0.81	-0.15	-0.37	-0.13	-0.03	0.77	-0.51	-0.27	-0.31	-0.24	-0.17	0.06	-0.04	0.25
Lsat_1_v5_gn_1_20920.1 (FLDH)	-0.89	-0.69	-0.86	-0.45	1.05	0.97	-1.72	-1.6	-0.66	-0.68	-0.77	-0.53	-0.47	1.72	1.21	-0.22	-0.77	1.7	-0.04	-0.93	-0.45	-0.89	1.36	-1.01	-1.11	-0.77	-0.71	-0.58	-0.35	-0.94	-0.19
Lsat_1_v5_gn_1_25581.1 (UGT85A4)	-1.03	-0.72	-1.15	-1.07	0.73	0.64	-0.74	-0.56	-1.03	-1.23	-1.09	-1.39	0.28	1.34	0.76	-0.57	-0.75	2.08	-0.72	-1.33	-0.97	-0.93	1.78	-0.57	-0.4	-0.53	-0.6	-1.25	0.04	0.0	0.09
Lsat_1_v5_gn_1_36740.1 (ELF7)	-0.19	-0.24	-0.32	-0.26	0.59	0.35	-0.31	-0.33	-0.32	-0.38	-0.11	-0.31	-0.03	0.73	0.49	-0.1	-0.3	0.56	-0.06	-0.5	-0.31	-0.2	0.85	-0.47	-0.36	-0.15	-0.15	-0.36	0.19	0.22	0.23
Lsat_1_v5_gn_1_37780.1 (SEC22)	-0.07	-0.17	-0.21	-0.45	0.54	0.39	-0.14	-0.19	-0.37	-0.34	-0.25	-0.22	0.04	0.29	0.13	-0.19	-0.2	0.89	-0.14	-0.29	-0.22	-0.07	0.95	-0.41	-0.32	-0.22	-0.03	-0.1	0.04	-0.02	-0.0
Lsat_1_v5_gn_1_49341.1	-2.26	-7.04	-7.51	-9.42	-0.02	0.8	-5.29	-4.5	-3.96	-4.87	-3.41	-5.25	-0.33	2.04	2.08	-1.74	-3.62	2.48	-0.32	-3.16	-1.16	-0.78	2.94	-0.65	-0.89	-0.86	-0.48	-1.24	-2.83	-4.31	-8.18
Lsat_1_v5_gn_1_53221.1 (IDH-V)	0.29	0.09	-0.15	-0.3	0.53	0.25	-0.22	-0.03	-0.29	-0.14	-0.16	0.02	0.35	0.03	-0.04	-0.17	-0.24	0.45	-0.19	-0.32	-0.31	-0.11	0.63	-0.04	-0.12	-0.18	-0.2	0.27	-0.16	-0.17	-0.08
Lsat_1_v5_gn_1_55341.1	-0.51	0.29	-0.41	-0.95	1.11	0.48	-0.28	-0.4	-0.9	-0.93	-0.84	-1.03	-0.7	0.94	1.02	-0.04	-0.4	1.52	0.37	-0.51	-0.41	-0.58	0.98	-0.67	-0.38	-0.7	-0.53	-0.83	0.1	0.09	-0.69
Lsat_1_v5_gn_1_55401.1	-0.36	-0.29	-0.33	-0.39	0.7	0.44	-0.62	-0.33	-0.38	-0.35	-0.09	-0.18	-0.22	0.79	0.64	0.06	-0.5	0.96	-0.2	-0.43	-0.27	-0.23	0.51	-0.31	-0.39	-0.26	-0.15	-0.55	0.26	0.23	0.16
Lsat_1_v5_gn_1_6641.1	-0.31	-0.27	-0.53	-0.34	0.84	0.4	-0.21	-0.53	-0.2	-0.2	-0.16	-0.42	-0.52	0.74	0.73	0.15	-0.09	0.73	0.07	-0.31	-0.15	-0.21	0.83	-0.58	-0.38	-0.31	-0.11	-0.3	0.0	-0.08	-0.37
Lsat_1_v5_gn_1_72181.1 (GB1)	-0.48	-0.48	-0.41	-0.23	0.67	0.64	-0.34	-0.35	-0.35	-0.43	-0.46	-0.34	0.28	0.86	0.47	-0.19	-0.19	0.61	-0.23	-0.29	-0.3	-0.2	0.79	-0.23	-0.32	-0.14	-0.37	-0.25	0.24	0.08	0.02
Lsat_1_v5_gn_1_77620.1	-0.19	-0.39	-0.88	-0.89	0.56	0.69	-0.45	-0.35	-0.68	-0.67	-0.61	-0.4	0.07	0.82	0.64	-0.3	-0.69	1.1	-0.05	-0.45	-0.29	-0.21	0.83	-0.09	-0.05	-0.34	-0.23	-0.14	0.31	0.07	0.21
Lsat_1_v5_gn_1_83660.1 (MC1)	-0.6	-0.38	-0.82	-0.7	0.46	0.29	-0.17	-0.05	-0.41	-0.35	-0.07	-0.24	0.12	0.54	0.38	0.01	-0.18	1.03	-0.1	-0.34	-0.21	-0.23	0.99	-0.36	-0.32	-0.12	-0.2	-0.17	-0.15	-0.03	0.32
Lsat_1_v5_gn_1_9221.1 (NRPD6A)	-0.47	-0.71	-0.75	-0.57	0.35	0.54	-0.18	-0.29	-0.55	-0.44	-0.24	-0.45	0.18	0.72	0.48	0.01	-0.18	0.64	-0.02	-0.25	-0.05	-0.0	0.9	-0.12	-0.08	0.05	-0.01	-0.06	-0.01	-0.21	-0.02
Lsat_1_v5_gn_1_93820.1 (APE2)	-0.57	-0.4	-0.64	-0.19	1.11	0.53	-0.72	-0.59	-0.8	-0.58	-0.36	-0.6	-0.63	1.2	0.8	0.01	-0.6	1.06	-0.21	-1.0	-0.72	-0.44	0.95	-0.73	-0.49	-0.57	-0.53	-0.76	0.34	0.49	0.57
Lsat_1_v5_gn_2_104220.1 (VAMP727)	-0.25	-0.42	-0.65	-0.45	0.72	0.86	-0.26	-0.54	-0.39	-0.47	-0.44	-0.75	-0.43	1.05	0.76	-0.02	-0.37	0.72	0.25	-0.66	-0.32	-0.38	1.13	-0.43	-0.36	-0.31	-0.36	-0.45	0.02	-0.1	-0.04
Lsat_1_v5_gn_2_106341.1 (CPK2)	-0.45	-0.51	-1.12	-1.25	1.52	0.89	-1.75	-2.23	-1.16	-1.06	-0.84	-1.26	-0.63	1.49	1.21	-0.05	-0.45	1.62	0.11	-0.98	-0.51	-0.24	1.12	-0.83	-0.61	-0.53	-0.41	-0.59	-0.19	-0.37	-0.45
Lsat_1_v5_gn_2_106620.1 (PCRK1)	-0.78	-0.95	-0.96	-0.59	1.01	0.55	-0.46	-0.62	-0.27	-0.38	-0.22	-0.56	-0.56	0.98	0.77	-0.38	-0.79	1.2	-0.04	-0.56	-0.37	-0.27	1.34	-0.67	-0.62	-0.37	-0.37	-0.44	0.31	0.06	0.16
Lsat_1_v5_gn_2_107900.1 (TOPP5)	0.1	-0.71	-1.05	-0.32	1.64	0.89	-1.42	-1.73	-0.71	-0.39	-0.33	-0.85	-0.8	0.99	1.1	-0.31	-0.99	1.58	-0.59	-1.26	-0.79	-0.3	1.33	-1.11	-0.97	-0.62	-0.28	-0.09	0.13	-0.25	-1.47
Lsat_1_v5_gn_2_112360.1 (UBL5)	0.1	-0.06	-0.33	-0.43	0.39	0.52	-0.52	-0.31	-0.65	-0.63	-0.53	-0.71	-0.39	0.58	0.26	-0.5	-0.7	1.23	-0.03	-0.37	-0.24	-0.05	1.36	-0.14	-0.19	-0.15	-0.02	-0.2	0.03	-0.17	-0.16
Lsat_1_v5_gn_2_116140.1 (UPF2)	-0.22	-0.34	-0.26	-0.41	0.49	0.2	-0.0	0.17	-0.32	-0.25	-0.46	-0.62	-0.18	0.75	0.46	-0.14	-0.25	0.76	-0.13	-0.52	-0.35	-0.37	1.11	-0.48	-0.16	-0.19	-0.13	-0.63	0.08	0.05	0.27
Lsat_1_v5_gn_2_120520.1	-0.54	-0.64	-0.75	-0.2	0.91	0.59	-0.79	-0.91	-0.32	-0.36	-0.44	-0.55	-0.43	1.08	0.91	-0.19	-0.46	1.27	-0.07	-0.54	-0.53	-0.55	1.05	-0.63	-0.71	-0.39	-0.42	-1.0	0.1	0.21	0.46
Lsat_1_v5_gn_2_122741.1 (CLC2)	-0.48	-0.54	-0.55	-0.67	0.74	0.44	-0.36	-0.54	-0.36	-0.3	-0.18	-0.17	0.06	0.59	0.4	0.07	-0.21	1.15	-0.18	-0.44	-0.37	-0.24	0.75	-0.45	-0.19	-0.26	-0.13	-0.27	0.11	0.05	0.28
Lsat_1_v5_gn_2_131801.1 (MSBP2)	-0.81	-0.83	-1.02	-1.17	0.3	0.63	-0.66	-0.8	-0.71	-0.73	-0.6	-0.82	0.2	1.05	0.89	0.06	-0.28	1.26	0.05	-0.28	-0.24	-0.14	1.31	-0.32	-0.24	-0.17	-0.02	-0.1	-0.05	-0.34	-0.23
Lsat_1_v5_gn_2_17460.1	-0.63	-0.52	-0.52	-0.58	0.43	0.61	-0.31	-0.3	-0.55	-0.39	-0.58	-0.66	0.05	0.78	0.53	0.03	-0.09	0.81	-0.09	-0.32	-0.14	-0.13	0.82	-0.07	-0.1	-0.13	-0.0	-0.16	0.18	-0.02	0.01
Lsat_1_v5_gn_2_20341.1 (CNBT1)	-0.86	-0.67	-1.32	-1.14	0.51	0.37	-0.03	-0.01	-0.58	-0.53	-0.51	-0.45	0.01	0.99	0.79	0.07	-0.11	1.05	-0.2	-0.58	-0.54	-0.39	1.35	-0.34	-0.26	-0.32	-0.13	-0.33	0.09	0.09	-0.12
Lsat_1_v5_gn_2_28141.1	-0.8	-0.7	-0.76	-0.76	0.65	0.7	-0.63	-0.77	-0.44	-0.39	-0.47	-0.53	0.06	0.91	0.51	-0.19	-0.51	1.19	-0.05	-0.31	-0.39	-0.54	1.29	-0.63	-0.46	-0.19	-0.32	-0.24	0.19	0.17	0.29
Lsat_1_v5_gn_2_39121.1 (PSI1)	-0.35	-0.32	-0.98	-0.47	1.71	0.59	-1.12	-1.37	-0.76	-0.82	-0.33	-1.05	-1.16	1.77	1.2	-0.62	-1.46	1.68	0.07	-0.92	-0.8	-0.65	1.12	-1.02	-1.08	-0.82	-0.88	-0.61	-0.12	-0.64	-1.06
Lsat_1_v5_gn_2_44040.1	-0.28	-0.3	-0.58	-0.49	1.14	0.98	-0.41	-0.24	-0.75	-0.89	-0.67	-1.28	-0.16	1.03	0.14	-0.5	-0.88	1.42	0.16	-1.17	-0.42	-0.38	1.33	-0.79	-0.33	-0.2	0.04	-0.53	0.0	-0.61	-0.23
Lsat_1_v5_gn_2_60861.1 (CCT2)	-0.24	-0.32	-0.38	-0.25	0.61	0.59	-0.09	-0.06	-0.4	-0.4	-0.2	-0.32	-0.08	0.7	0.5	-0.05	-0.38	0.63	0.14	-0.3	-0.22	-0.12	0.33	-0.28	-0.27	-0.13	-0.09	-0.07	0.11	-0.06	-0.15
Lsat_1_v5_gn_2_73121.1 (PP7)	-0.07	-0.23	-0.32	-0.38	0.58	0.61	-0.38	-0.6	-0.42	-0.34	-0.22	-0.28	-0.15	0.41	0.5	0.3	0.01	0.25	0.22	-0.15	-0.04	0.01	0.59	-0.26	-0.11	0.07	-0.03	0.0	-0.09	-0.2	-0.42
Lsat_1_v5_gn_2_78381.1	-0.31	-0.3	-0.23	-0.09	0.79	0.31	-0.46	-0.59	-0.27	-0.3	-0.15	-0.49	-0.26	0.96	0.75	-0.14	-0.36	0.96	-0.08	-0.49	-0.43	-0.48	0.62	-0.49	-0.51	-0.42	-0.4	-0.49	0.23	0.17	0.36
Lsat_1_v5_gn_2_81601.1	0.04	-1.31	-	-	0.77	0.89	-	-	-2.51	-2.53	-0.23	-	-0.11	2.02	1.45	-1.56	-	2.23	-2.41	-2.22	-4.27	-3.9	3.24	-4.12	-1.49	-3.21	-0.42	-3.95	-2.51	-1.25	-2.8
Lsat_1_v5_gn_2_83381.1 (VDAC2)	0.28	-0.01	-0.08	-0.12	0.34	0.17	-0.49	-0.21	-0.24	-0.31	-0.11	0.07	0.36	-0.05	-0.09	-0.1	-0.22	0.88	-0.29	-0.36	-0.11	-0.05	0.23	-0.1	-0.0	-0.15	-0.08	0.34	-0.02	-0.15	-0.09
Lsat_1_v5_gn_2_90800.1 (UMP1a)	-0.52	-0.63	-0.87	-0.77	0.45	0.42	-0.43	-0.51	-0.43	-0.33	-0.45	-0.47	0.35	0.64	0.46	-0.24	-0.15	0.97	-0.12	-0.34	-0.25	-0.02	1.02	-0.16	-0.14	-0.11	-0.12	0.04	0.07	0.02	0.21
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Details

Dark gray cells indicate values where the raw expression is zero (cannot be log-transformed). Blue cells indicate samples where the expression of the gene is below average and red cells indicate the gene is expressed above average in the sample. White cells are average.