Heatmap: Cluster_5 (Lactuca sativa (Lsa) Coexpression Clusters (HCCA Algorithm))

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(Values are log₂ transformed ratios of a genes expression in a sample divided by the mean expression level)

Gene	Light: 268 uE m-2 s-1	Light: 202.5 uE m-2 s-1 (Control)	Light: 135 uE m-2 s-1	Light: 67.5 uE m-2 s-1	Photoperiod: L24	Photoperiod: L20D4 (Control)	Photoperiod: L12D12	Photoperiod: L8D16	RBW: 4:1:1 (Control)	RBW: 4:1:0	RBW: 3:1:1	RBW: 3:1:0	Nitrogen: 0%	Nitrogen: 25%	Nitrogen: 50%	Nitrogen: 100% (Control)	Nitrogen: 150%	Phosphorous: 0%	Phosphorous: 25%	Phosphorous: 50%	Phosphorous: 100% (Control)	Phosphorous: 150%	Potassium: 0%	Potassium: 25%	Potassium: 50%	Potassium: 100% (Control)	Potassium: 150%	Temperature: 20°C	Temperature: 25°C (Control)	Temperature: 30°C	Temperature: 35°C
Lsat_1_v5_gn_0_16520.1	-0.51	-0.3	-0.43	-0.28	0.58	0.54	-0.17	-0.29	0.02	0.08	0.18	-0.02	-0.22	0.28	0.3	0.06	-0.3	-0.25	-0.05	-0.16	-0.18	-0.06	0.2	-0.21	-0.1	-0.08	0.08	-0.13	0.28	0.28	0.14
Lsat_1_v5_gn_0_27881.1 (ARFA1D)	-0.19	-0.29	-0.59	-0.66	0.1	0.44	0.32	0.46	-0.34	-0.32	-0.18	-0.28	0.13	0.35	0.18	0.08	0.03	0.03	0.02	-0.06	0.01	0.11	-0.32	-0.07	0.01	0.1	0.11	0.03	0.06	0.05	-0.02
Lsat_1_v5_gn_1_117081.1 (NF-YA7)	-0.44	-0.33	-1.17	-0.86	0.15	0.25	0.49	0.68	-0.22	-0.21	-0.19	-0.33	-0.08	0.72	0.54	0.04	-0.08	-0.15	0.05	-0.13	-0.09	-0.1	-0.24	-0.2	-0.12	-0.05	-0.05	-0.22	0.2	0.24	0.38
Lsat_1_v5_gn_1_118520.1 (F6'H2)	-0.65	-0.39	-0.75	-0.51	0.27	0.53	0.29	0.4	0.07	0.11	0.13	0.33	-0.53	-0.66	-0.54	-0.0	-0.16	-0.9	-0.08	-0.24	0.01	-0.08	0.36	0.14	0.17	0.22	0.22	-0.13	0.1	0.38	0.39
Lsat_1_v5_gn_1_15161.1 (AFA1)	-0.21	0.17	-0.35	-0.2	0.32	0.67	0.59	0.51	0.09	0.08	0.05	-0.2	-0.82	0.73	0.57	0.39	0.32	-1.75	0.05	-0.24	-0.09	-0.22	-0.97	-0.68	-0.42	-0.28	-0.18	-0.05	0.34	-0.12	-0.79
Lsat_1_v5_gn_1_61320.1 (MYR2)	-0.87	0.59	-0.31	-0.08	0.82	0.65	0.79	0.73	-0.29	-0.24	-0.4	-0.28	-0.38	0.66	0.78	0.08	0.03	-2.32	0.2	-0.14	-0.42	-0.39	-1.42	-0.34	-0.24	-0.38	-0.09	-0.49	-0.07	-0.05	-0.05
Lsat_1_v5_gn_1_64080.1 (AQC1)	-0.98	-0.83	-0.81	-0.63	0.25	0.28	-0.07	0.04	0.05	0.01	0.12	0.04	-0.16	0.26	0.11	0.03	-0.06	-0.19	0.0	0.02	-0.01	-0.03	0.03	-0.07	-0.0	0.02	0.13	0.07	0.46	0.37	0.43
Lsat_1_v5_gn_1_65461.1 (GRIK2)	-0.35	-0.18	-0.39	-0.47	0.68	0.51	0.47	0.78	-0.12	0.0	-0.11	-0.18	-0.49	0.29	0.32	0.2	0.02	-0.78	0.09	-0.14	-0.23	-0.05	-0.87	-0.18	-0.11	-0.08	0.03	-0.05	0.08	-0.03	-0.07
Lsat_1_v5_gn_1_78380.1 (MYB4)	-1.85	-1.42	-2.03	-1.46	0.25	0.41	0.27	0.36	-0.32	-0.35	-0.3	-0.56	-0.13	0.48	0.94	0.28	-0.19	0.24	0.38	0.02	0.04	-0.08	0.44	-0.09	-0.06	0.01	0.07	-0.48	0.46	0.33	0.27
Lsat_1_v5_gn_1_80680.1 (VETH3)	-1.54	-0.35	-1.3	-0.55	0.18	0.77	0.6	0.22	-0.02	-0.01	0.1	0.07	-0.4	-0.19	-0.07	0.25	-0.03	-1.45	-0.23	-0.33	-0.18	-0.04	0.3	-0.1	0.17	0.05	0.07	-0.13	0.34	0.48	0.68
Lsat_1_v5_gn_1_83041.1 (UGT85A5)	-1.38	-0.62	-1.78	-1.64	-0.16	0.54	0.76	0.78	-0.21	-0.2	-0.22	-0.43	-0.5	0.84	0.78	0.1	-0.05	-0.16	0.18	-0.39	-0.32	-0.21	0.27	-0.24	-0.23	-0.17	-0.14	-0.44	0.62	0.5	0.19
Lsat_1_v5_gn_1_92880.1 (KCO6)	-1.28	-1.6	-1.68	-0.83	0.79	0.41	0.26	0.43	0.15	-0.01	0.19	-0.31	-0.95	0.16	0.42	-0.17	-0.56	-0.17	-0.32	-0.24	-0.24	-0.17	1.03	-0.02	-0.12	-0.23	-0.06	-0.46	0.63	0.47	0.59
Lsat_1_v5_gn_2_121900.1	-0.35	-0.61	-0.81	-0.19	0.19	0.06	0.23	0.56	0.0	-0.14	0.04	-0.03	-0.06	0.27	0.29	-0.11	-0.23	-0.12	-0.29	-0.25	-0.09	-0.15	1.05	-0.21	-0.15	-0.06	-0.0	-0.28	0.17	0.1	-0.04
Lsat_1_v5_gn_2_131160.1 (CHAL)	-0.72	-1.03	-1.17	-0.91	0.25	0.84	0.19	0.28	-0.26	-0.25	-0.07	-0.14	0.1	0.4	0.15	0.05	-0.07	0.08	0.24	-0.26	-0.23	0.01	0.31	0.02	0.04	0.01	-0.03	-0.21	0.12	0.18	0.38
Lsat_1_v5_gn_2_17221.1 (PP2-B10)	0.04	0.08	-0.21	-0.21	0.67	0.83	0.75	0.68	-0.29	-0.29	-0.5	-0.81	-0.81	0.14	0.23	0.1	-0.19	-1.37	0.42	-0.08	-0.16	0.08	-0.82	-0.27	-0.08	-0.04	0.12	-0.05	0.26	-0.02	-0.65
Lsat_1_v5_gn_2_31920.1	-0.82	-1.62	-1.14	-1.35	-0.14	0.3	0.51	1.12	-0.27	-0.37	-0.2	-0.29	0.61	0.38	0.48	-0.1	0.0	-0.06	-0.01	-0.27	-0.22	0.42	0.19	0.11	-0.08	-0.5	0.18	-0.13	-0.09	0.13	0.21
Lsat_1_v5_gn_2_59321.1 (VAMP714)	-0.53	-0.14	-0.06	-0.04	0.92	0.66	-0.11	-0.17	-0.13	0.1	-0.11	-0.34	-0.0	0.44	0.32	-0.13	-0.34	-0.02	-0.25	-0.4	-0.2	-0.12	0.12	-0.3	-0.19	-0.22	-0.37	-0.32	0.33	0.21	0.24
Lsat_1_v5_gn_2_68820.1 (NUDT17)	-3.07	-3.17	-2.41	-1.55	0.47	0.71	0.69	1.0	-0.18	-0.24	-0.2	-0.55	-1.01	0.44	0.67	0.07	-0.18	-0.45	0.19	-0.11	-0.03	0.07	0.62	-0.17	-0.03	-0.04	0.1	-0.25	0.64	0.41	-0.1
Lsat_1_v5_gn_3_137700.1	-0.72	-0.42	-1.36	-1.46	0.34	0.58	0.42	0.49	-0.48	-0.62	-0.38	-0.35	0.16	0.41	0.2	-0.08	-0.03	0.33	-0.13	-0.11	-0.16	0.11	0.63	0.24	0.16	-0.03	-0.04	0.05	-0.06	0.03	0.09
Lsat_1_v5_gn_3_14161.1	-1.3	-1.48	-0.96	-0.39	0.22	0.3	0.25	0.25	-0.02	0.13	0.13	-0.1	-0.18	0.13	0.27	-0.09	-0.38	0.31	0.2	0.01	-0.14	-0.28	0.45	0.02	-0.09	-0.32	-0.16	-0.44	0.35	0.32	0.83
Lsat_1_v5_gn_3_16181.1 (TOE2)	-0.57	-0.52	-0.89	-0.81	0.32	0.64	0.14	0.42	-0.39	-0.19	-0.16	-0.24	0.24	0.52	0.23	0.12	-0.11	0.22	0.05	-0.21	-0.15	0.15	-0.04	0.06	0.02	-0.07	-0.03	-0.04	0.03	-0.01	0.08
Lsat_1_v5_gn_3_27741.1 (FLZ10)	-2.21	-2.26	-1.98	-1.12	0.41	0.62	0.37	0.15	-0.02	-0.04	0.22	-0.14	-0.82	-0.34	0.34	-0.18	-0.34	-0.11	0.64	0.2	-0.06	0.04	0.06	0.05	0.15	-0.14	0.04	-0.36	0.5	0.53	0.93
Lsat_1_v5_gn_3_31020.1 (AGM1)	-0.51	-0.4	-1.11	-1.19	0.04	0.47	0.29	0.72	-0.26	-0.29	-0.12	-0.26	0.14	-0.05	-0.1	0.18	-0.02	0.41	0.09	-0.21	0.12	0.09	-0.1	0.11	0.09	-0.01	0.2	-0.14	0.19	0.12	0.1
Lsat_1_v5_gn_3_35861.1 (GRF9)	-0.63	-0.29	-0.19	-0.26	0.51	0.64	-0.02	-0.09	-0.34	-0.26	-0.23	-0.3	0.01	0.19	0.12	0.08	-0.06	0.14	-0.12	-0.15	-0.09	0.04	0.15	-0.27	-0.06	0.1	0.12	-0.18	0.22	0.09	0.39
Lsat_1_v5_gn_3_39461.1 (PP2C52)	-0.48	-0.53	-0.58	-0.58	0.55	0.76	0.14	0.25	-0.28	-0.15	-0.1	-0.13	0.05	0.15	0.28	0.09	-0.2	-0.24	-0.16	-0.24	-0.04	-0.01	-0.24	-0.07	0.02	-0.06	0.02	-0.07	0.18	0.2	0.44
Lsat_1_v5_gn_3_63181.1 (HCS1)	-0.68	-0.49	-0.75	-0.49	0.17	0.93	-0.03	0.08	-0.24	-0.11	0.08	-0.35	-0.5	0.46	0.31	-0.06	-0.18	-0.59	0.19	-0.25	0.16	0.12	-0.68	0.12	0.1	0.3	0.35	-0.34	0.37	0.12	0.27
Lsat_1_v5_gn_3_84881.1 (HAT9)	-0.96	-1.74	-0.74	-0.49	0.75	0.54	0.33	0.16	-0.06	-0.02	0.12	-0.13	-0.54	-0.11	0.36	0.13	-0.04	0.19	-0.25	-0.15	-0.03	0.05	0.54	-0.42	-0.15	0.07	-0.03	-0.58	0.47	0.18	0.3
Lsat_1_v5_gn_3_8800.1 (DDA1)	-0.29	-0.69	-0.33	-0.31	0.74	0.51	-0.31	-0.46	0.09	0.13	0.1	-0.09	-0.01	0.31	0.41	-0.05	-0.2	0.07	-0.28	-0.4	-0.11	-0.1	0.11	-0.22	-0.23	-0.11	-0.09	-0.18	0.25	0.14	0.52
Lsat_1_v5_gn_4_104420.1 (MSG2)	-1.82	-1.75	-1.8	-1.76	0.03	-0.08	0.7	1.59	-0.58	-1.0	-0.69	-0.69	0.28	0.38	-0.14	-0.2	-0.01	-0.16	0.18	-0.48	-1.15	-0.46	-0.15	-1.41	-0.56	-0.59	-0.1	-1.0	1.38	1.17	1.44
Lsat_1_v5_gn_4_108440.1 (PBL20)	-1.07	-0.52	-1.21	-1.28	-0.1	0.23	-0.16	0.44	-0.15	-0.06	-0.01	0.01	0.17	0.55	0.56	0.21	-0.11	-0.29	-0.06	-0.01	0.08	0.28	0.12	-0.07	0.06	0.1	0.2	-0.23	0.03	0.11	0.38
Lsat_1_v5_gn_4_119740.1	-0.82	-0.54	-1.09	-0.67	0.26	0.43	0.21	0.35	0.0	-0.08	0.07	-0.03	0.1	0.08	0.1	-0.01	-0.09	-0.24	0.0	-0.2	-0.16	-0.0	0.26	-0.03	-0.04	-0.04	-0.01	-0.16	0.35	0.38	0.46
Lsat_1_v5_gn_4_133401.1 (NQR)	-0.08	-0.09	-0.23	-0.09	0.87	0.9	0.04	0.07	-0.6	-0.48	-0.39	-0.62	0.04	0.39	0.29	0.11	-0.12	0.21	-0.34	-0.6	-0.23	-0.01	-0.01	-0.5	-0.32	-0.2	-0.22	-0.26	0.53	0.09	0.22
Lsat_1_v5_gn_4_135220.1 (FUT13)	-0.49	-0.63	-0.62	-0.53	0.27	0.31	0.24	0.52	-0.28	-0.06	-0.17	-0.22	-0.03	0.35	0.46	0.13	0.13	0.12	0.08	-0.13	-0.12	0.11	0.02	-0.24	-0.07	-0.04	-0.03	-0.23	0.13	0.09	0.08
Lsat_1_v5_gn_4_135241.1	0.08	0.27	-0.04	-0.49	0.08	0.43	0.61	0.62	-0.41	-0.6	-0.31	-0.61	-0.29	0.65	0.25	0.13	-0.1	-0.9	-0.07	-0.44	-0.06	0.03	-0.28	-0.14	0.02	0.16	-0.09	-0.38	0.31	0.04	0.1
Lsat_1_v5_gn_4_144841.1 (APE2)	-0.77	-0.56	-0.49	-0.45	0.36	0.6	0.13	0.44	-0.32	-0.26	-0.29	-0.02	0.1	0.39	0.24	0.02	-0.1	-0.13	-0.36	-0.32	-0.19	0.05	0.39	-0.23	-0.07	-0.08	0.09	0.13	0.06	0.08	0.45
Lsat_1_v5_gn_4_30241.1	-1.24	-0.73	-1.03	-0.42	-0.17	0.2	-0.13	0.14	-0.12	-0.14	0.2	-0.02	0.13	0.35	0.34	0.12	-0.12	-0.16	-0.04	0.02	-0.09	0.01	0.09	0.07	-0.03	0.18	-0.09	-0.06	0.36	0.45	0.56
Lsat_1_v5_gn_4_41841.1 (COG4)	-0.88	-0.61	-0.87	-0.52	0.65	0.47	-0.47	-0.83	0.26	0.12	0.4	-0.09	0.03	0.52	0.46	0.25	-0.24	0.32	-0.08	-0.48	-0.18	-0.1	-0.16	-0.31	-0.41	-0.16	0.05	-0.15	0.29	0.14	0.66
Lsat_1_v5_gn_4_49080.1 (TRM5b)	-0.28	-0.41	-0.7	-1.23	-0.28	0.28	0.24	0.61	0.12	0.04	0.17	-0.01	-0.28	0.5	0.55	0.13	-0.29	-0.3	0.1	-0.04	0.02	-0.03	-0.08	0.08	-0.07	-0.07	0.06	-0.54	0.14	0.16	0.09
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Details

Dark gray cells indicate values where the raw expression is zero (cannot be log-transformed). Blue cells indicate samples where the expression of the gene is below average and red cells indicate the gene is expressed above average in the sample. White cells are average.