Heatmap: Cluster_211 (Lactuca sativa (Lsa) Coexpression Clusters (HCCA Algorithm))

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(Values are log₂ transformed ratios of a genes expression in a sample divided by the mean expression level)

Gene	Light: 268 uE m-2 s-1	Light: 202.5 uE m-2 s-1 (Control)	Light: 135 uE m-2 s-1	Light: 67.5 uE m-2 s-1	Photoperiod: L24	Photoperiod: L20D4 (Control)	Photoperiod: L12D12	Photoperiod: L8D16	RBW: 4:1:1 (Control)	RBW: 4:1:0	RBW: 3:1:1	RBW: 3:1:0	Nitrogen: 0%	Nitrogen: 25%	Nitrogen: 50%	Nitrogen: 100% (Control)	Nitrogen: 150%	Phosphorous: 0%	Phosphorous: 25%	Phosphorous: 50%	Phosphorous: 100% (Control)	Phosphorous: 150%	Potassium: 0%	Potassium: 25%	Potassium: 50%	Potassium: 100% (Control)	Potassium: 150%	Temperature: 20°C	Temperature: 25°C (Control)	Temperature: 30°C	Temperature: 35°C
Lsat_1_v5_gn_0_14680.1	-0.47	-0.84	-0.66	-0.62	0.1	0.32	-0.17	-0.24	-0.06	-0.13	-0.06	-0.24	0.27	0.52	0.35	-0.11	-0.14	0.0	0.04	-0.17	-0.06	-0.11	0.4	-0.19	0.0	-0.04	0.01	-0.07	0.15	0.19	0.82
Lsat_1_v5_gn_0_33621.1 (SWC4)	-0.73	-0.73	-0.84	-0.64	0.24	0.16	-0.16	-0.0	-0.27	-0.26	-0.18	-0.21	0.33	0.52	0.45	-0.04	-0.27	0.23	0.06	-0.15	-0.15	-0.12	0.38	-0.07	-0.23	-0.08	-0.1	-0.2	0.27	0.39	0.85
Lsat_1_v5_gn_1_16420.1 (alpha1-COP)	-0.42	-0.31	-0.44	-0.37	0.28	0.28	-0.19	-0.31	-0.26	-0.2	-0.12	-0.07	0.46	0.52	0.24	0.11	-0.02	-0.07	-0.09	-0.26	-0.21	-0.13	-0.08	-0.2	-0.12	-0.08	-0.12	-0.09	0.39	0.36	0.62
Lsat_1_v5_gn_1_3281.1 (GRF2)	-1.1	-0.65	-0.95	-1.41	0.57	0.04	-0.6	-0.82	-0.22	-0.34	-0.29	-0.16	0.75	0.24	0.59	-0.26	-0.04	0.42	-0.41	-0.39	-0.22	-0.25	-0.28	-0.29	-0.15	0.05	0.03	-0.38	0.18	0.64	1.64
Lsat_1_v5_gn_1_50640.1 (KDTA)	-1.3	-0.97	-1.95	-1.63	0.61	0.39	-0.62	-0.37	-0.87	-0.47	-0.32	-0.51	0.25	1.22	0.55	0.26	-0.38	0.61	-0.37	-0.67	-0.25	-0.27	0.66	-0.43	0.05	-0.7	-0.18	-0.54	0.2	0.07	1.67
Lsat_1_v5_gn_1_78540.1	-0.77	-0.76	-0.86	-0.61	0.02	-0.03	-0.16	-0.07	-0.27	-0.0	-0.05	0.07	0.34	0.45	0.21	-0.0	-0.02	0.12	0.08	-0.04	-0.05	0.06	0.1	0.02	-0.03	0.04	0.02	-0.22	0.18	0.23	0.81
Lsat_1_v5_gn_2_104861.1 (PDR6)	-0.83	-0.69	-0.92	-0.99	0.52	0.04	-1.0	-0.87	-0.08	-0.17	-0.1	-0.01	0.29	0.73	0.37	0.04	-0.21	0.45	-0.18	-0.27	-0.47	-0.48	0.96	-0.31	-0.17	-0.37	-0.29	-0.85	0.4	0.58	1.23
Lsat_1_v5_gn_2_119300.1 (IDN2)	-0.98	-0.92	-1.06	-0.84	0.56	0.46	-0.36	-0.32	-0.46	-0.4	-0.24	-0.28	0.66	0.75	0.56	-0.01	-0.13	0.37	0.18	-0.2	-0.21	-0.14	-0.09	-0.29	-0.29	-0.14	-0.16	-0.39	0.16	0.29	1.09
Lsat_1_v5_gn_2_120280.1	-0.52	-0.69	-0.77	-0.53	0.28	-0.13	-0.4	-0.37	-0.1	-0.03	-0.17	-0.1	0.5	0.13	0.34	0.02	0.04	0.06	0.1	-0.01	-0.21	-0.27	0.17	0.07	-0.0	-0.04	-0.12	-0.12	0.24	0.33	0.96
Lsat_1_v5_gn_2_127520.1 (FBIP1)	-1.06	-1.07	-0.94	-0.94	0.05	-0.05	-0.1	-0.03	-0.33	-0.15	-0.15	-0.23	0.36	0.74	0.59	0.17	0.06	0.0	0.04	-0.08	-0.28	-0.19	0.21	-0.28	-0.15	-0.13	-0.14	-0.55	0.42	0.54	1.12
Lsat_1_v5_gn_2_64261.1 (ROS5)	-1.25	-0.97	-0.69	-0.56	0.03	0.32	-0.15	-0.04	-0.28	-0.16	-0.06	-0.03	0.13	0.71	0.38	-0.15	-0.07	-0.21	0.19	-0.19	-0.15	-0.01	0.27	-0.1	0.19	-0.04	-0.08	-0.41	0.28	0.26	0.97
Lsat_1_v5_gn_3_105980.1 (MAP70-2)	-0.92	-0.82	-1.16	-0.74	0.51	0.26	-0.56	-0.69	-0.16	-0.18	-0.2	-0.05	0.73	0.61	0.44	0.02	-0.07	0.11	-0.03	-0.25	-0.14	0.11	-0.17	-0.09	-0.21	-0.0	0.15	-0.11	0.27	0.3	0.82
Lsat_1_v5_gn_3_110661.1	-0.7	-0.9	-1.07	-1.21	0.46	0.16	-0.65	-0.76	-0.41	-0.3	-0.12	-0.3	0.49	0.94	0.28	-0.32	-0.8	0.57	0.16	-0.48	-0.43	-0.35	1.23	-0.31	-0.33	-0.3	-0.06	-0.85	0.38	0.02	1.36
Lsat_1_v5_gn_3_125620.1 (NRPE7)	-0.59	-0.78	-0.79	-0.71	0.13	0.16	-0.18	-0.01	-0.35	-0.37	-0.14	-0.29	0.62	0.7	0.62	-0.01	-0.14	-0.01	-0.06	-0.01	-0.17	-0.15	0.29	-0.02	0.06	0.02	-0.2	-0.29	0.18	0.04	0.82
Lsat_1_v5_gn_3_27560.1	-0.84	-0.85	-1.26	-0.8	0.18	-0.03	-0.15	0.03	-0.37	-0.15	-0.23	-0.49	0.33	0.65	0.45	0.05	-0.14	0.4	0.09	-0.01	-0.43	-0.3	0.78	-0.4	-0.19	-0.17	-0.15	-0.17	0.44	0.4	0.9
Lsat_1_v5_gn_3_69700.1	-0.99	-0.78	-1.1	-0.97	0.27	0.1	-0.14	-0.32	-0.18	-0.1	-0.03	-0.13	0.45	0.84	0.31	0.05	-0.19	0.03	0.13	-0.03	-0.4	-0.2	-0.04	0.05	-0.07	-0.17	0.07	-0.48	0.24	0.43	1.04
Lsat_1_v5_gn_4_109201.1	-2.48	-2.1	-1.15	-0.74	0.7	0.34	-0.57	-1.09	-0.47	-0.54	-0.03	-0.24	-0.06	0.94	0.95	-0.19	-0.05	1.09	0.29	-0.47	-0.96	-1.12	1.51	-0.85	-0.38	-0.84	-0.06	-1.31	0.26	0.42	0.96
Lsat_1_v5_gn_4_139660.1 (ACINUS)	-0.86	-0.93	-0.82	-0.58	-0.23	-0.04	0.03	0.13	-0.24	-0.17	-0.14	0.02	0.52	0.85	0.56	0.1	-0.06	0.31	-0.01	-0.13	-0.34	-0.11	0.09	-0.17	-0.31	-0.15	-0.18	-0.29	0.14	0.2	0.91
Lsat_1_v5_gn_4_144000.1	-1.59	-0.68	-1.12	-0.44	0.57	-0.03	-0.58	-0.51	-0.31	0.08	0.15	0.06	-0.2	0.78	0.53	-0.21	-0.63	0.8	-0.01	-0.52	-0.46	-0.79	1.19	-0.43	-0.26	-0.81	-0.31	-1.16	0.54	0.44	1.17
Lsat_1_v5_gn_4_151800.1	-1.03	-0.54	-1.1	-1.1	0.32	0.26	-0.39	-0.45	-0.25	-0.15	-0.03	-0.01	0.51	0.66	0.35	0.18	-0.06	0.24	-0.2	-0.23	-0.23	-0.08	0.48	-0.14	-0.14	-0.1	-0.08	-0.43	0.3	0.39	0.84
Lsat_1_v5_gn_4_26681.1	-0.84	-0.33	-0.55	-0.33	0.33	0.3	-0.1	-0.14	-0.1	-0.21	-0.03	-0.01	0.12	0.31	0.37	0.08	-0.06	-0.04	0.06	-0.2	-0.27	-0.07	-0.01	-0.03	-0.1	-0.15	-0.05	-0.16	0.27	0.4	0.65
Lsat_1_v5_gn_4_88801.1 (PEPR1)	-1.13	-0.69	-1.32	-1.68	-0.06	-0.1	-0.04	-0.15	-0.06	-0.05	0.03	-0.23	0.17	0.86	0.65	0.15	-0.18	-0.03	-0.01	-0.3	-0.23	-0.22	0.5	-0.49	-0.02	-0.18	-0.02	-0.6	0.35	0.5	1.21
Lsat_1_v5_gn_4_93741.1 (THY-1)	-0.89	-1.05	-1.35	-0.94	0.36	0.23	-0.24	-0.21	-0.32	-0.2	-0.33	-0.15	0.62	0.89	0.66	-0.1	-0.02	-0.21	-0.29	-0.11	-0.3	-0.06	0.32	-0.1	-0.05	-0.27	-0.25	-0.17	0.3	0.35	1.05
Lsat_1_v5_gn_5_10741.1 (SIA2)	-1.5	-0.73	-0.92	-0.86	0.03	0.06	-0.79	-0.56	-0.19	-0.16	0.11	0.0	0.61	0.75	0.39	-0.29	-0.06	0.19	-0.3	-0.34	-0.32	-0.02	-0.08	-0.21	0.03	0.12	-0.09	-0.14	0.41	0.6	1.24
Lsat_1_v5_gn_5_118681.1 (gamma2-COP)	-0.5	-0.5	-0.61	-0.67	0.21	0.22	-0.22	-0.26	-0.28	-0.18	-0.12	0.0	0.53	0.29	0.17	0.1	0.03	0.08	-0.13	-0.21	-0.18	-0.05	0.03	-0.14	0.01	-0.04	-0.06	-0.01	0.33	0.42	0.71
Lsat_1_v5_gn_5_159481.1 (RPB5B)	-0.72	-0.85	-0.44	-0.36	0.28	0.37	-0.5	-0.15	-0.32	-0.12	-0.4	-0.27	0.66	0.61	0.32	-0.07	-0.18	0.45	-0.1	-0.33	-0.31	-0.16	0.32	-0.23	-0.25	-0.22	-0.28	-0.49	0.3	0.35	1.04
Lsat_1_v5_gn_5_189400.1	-0.61	-0.57	-0.63	-0.6	0.0	-0.04	-0.31	-0.59	-0.11	-0.23	-0.1	-0.15	0.51	0.67	0.52	0.02	0.01	-0.02	0.3	0.0	-0.09	-0.05	0.05	0.01	0.03	0.09	0.0	-0.17	0.18	0.19	0.5
Lsat_1_v5_gn_5_21981.1 (PGAP1)	-0.67	-0.59	-1.04	-0.71	0.35	0.12	-0.45	-0.19	-0.24	0.01	0.03	0.07	0.53	0.33	0.21	0.08	-0.02	-0.21	-0.18	-0.12	-0.15	-0.12	0.25	-0.2	-0.08	-0.14	0.06	-0.08	0.25	0.36	0.97
Lsat_1_v5_gn_5_6720.1 (NMA)	-1.39	-2.11	-1.96	-1.7	0.18	0.48	-2.58	-2.17	-0.78	-0.92	-0.19	0.01	-0.16	1.37	0.86	-0.04	-0.74	0.94	-0.22	-1.45	-0.26	-0.99	1.73	-0.81	-0.66	-1.36	-0.53	-0.85	0.82	0.41	1.73
Lsat_1_v5_gn_6_108420.1 (PRP40A)	-0.84	-0.71	-0.47	-0.37	0.43	0.19	-0.51	-0.72	-0.19	-0.15	0.13	-0.24	0.36	0.67	0.44	-0.08	-0.27	0.01	0.01	-0.19	-0.19	0.02	0.18	-0.24	-0.23	-0.12	-0.05	-0.24	0.25	0.29	1.04
Lsat_1_v5_gn_6_111581.1 (PRP40B)	-0.26	-0.42	-0.24	-0.33	0.27	0.19	-0.48	-0.54	-0.24	-0.12	0.05	-0.09	0.31	0.55	0.37	0.03	-0.22	0.27	-0.06	-0.33	-0.24	-0.17	0.56	-0.3	-0.02	-0.05	-0.25	-0.43	0.01	0.27	0.74
Lsat_1_v5_gn_6_56180.1	-0.37	-0.38	-0.77	-0.69	0.2	0.16	-0.18	-0.04	-0.22	-0.05	-0.13	0.03	0.43	0.47	0.23	-0.09	0.01	0.11	-0.09	-0.25	-0.18	0.1	-0.07	0.01	-0.02	-0.13	-0.0	0.08	0.13	0.18	0.65
Lsat_1_v5_gn_6_95640.1	-0.72	-0.7	-0.94	-0.88	0.29	0.38	-0.32	-0.14	-0.29	-0.25	-0.14	-0.25	0.59	0.62	0.33	0.14	0.05	0.22	-0.22	-0.36	-0.23	0.01	0.32	-0.27	-0.21	-0.17	-0.18	-0.24	0.31	0.39	0.88
Lsat_1_v5_gn_7_29060.1 (GALT2)	-0.95	-0.59	-1.42	-1.3	0.31	0.3	-0.11	-0.29	-0.24	-0.07	0.05	-0.16	0.56	0.48	0.41	0.1	0.03	-0.2	0.13	-0.08	-0.17	-0.05	0.01	-0.12	-0.08	0.07	0.01	-0.12	0.19	0.28	0.86
Lsat_1_v5_gn_7_30940.1 (PRP39-2)	-0.59	-0.92	-0.6	-0.35	-0.07	0.04	-0.19	-0.01	-0.07	0.03	-0.07	-0.21	0.11	0.53	0.23	-0.05	-0.03	-0.18	0.12	-0.11	-0.09	-0.1	0.49	-0.26	-0.09	0.02	-0.19	-0.17	0.13	0.4	0.95
Lsat_1_v5_gn_7_51941.1 (APTG1)	-0.96	-0.61	-0.74	-0.57	0.07	0.18	-0.24	-0.09	-0.23	-0.3	0.03	-0.14	0.37	0.51	0.25	-0.02	-0.04	0.19	0.17	-0.22	-0.14	-0.11	-0.16	-0.2	0.0	0.13	0.06	-0.28	0.23	0.27	1.05
Lsat_1_v5_gn_7_77960.1 (PYM)	-0.75	-0.74	-0.77	-0.74	0.02	0.25	-0.04	0.04	-0.47	-0.5	0.16	-0.22	0.61	0.71	0.63	0.0	-0.04	0.28	-0.03	-0.28	-0.04	-0.16	0.16	-0.23	-0.31	0.1	-0.08	-0.37	0.11	0.05	0.81
Lsat_1_v5_gn_7_92661.1 (EBS)	-0.82	-0.47	-1.01	-0.4	0.21	0.13	-0.03	-0.1	-0.22	0.03	0.07	-0.16	0.42	0.53	0.31	-0.21	-0.05	0.03	-0.14	-0.19	-0.23	-0.07	0.25	-0.1	-0.05	-0.08	-0.07	-0.36	0.19	0.4	0.85
Lsat_1_v5_gn_7_9321.1 (CHO)	-0.73	-0.64	-1.06	-0.84	0.41	0.08	-0.49	-0.77	-0.2	-0.02	-0.1	-0.01	0.74	0.38	0.01	-0.12	-0.21	0.11	-0.21	-0.17	-0.18	0.06	0.57	-0.13	-0.05	-0.11	-0.11	-0.12	0.29	0.3	1.09
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Details

Dark gray cells indicate values where the raw expression is zero (cannot be log-transformed). Blue cells indicate samples where the expression of the gene is below average and red cells indicate the gene is expressed above average in the sample. White cells are average.