Heatmap: Cluster_104 (Lactuca sativa (Lsa) Coexpression Clusters (HCCA Algorithm))

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(Values are log₂ transformed ratios of a genes expression in a sample divided by the mean expression level)

Gene	Light: 268 uE m-2 s-1	Light: 202.5 uE m-2 s-1 (Control)	Light: 135 uE m-2 s-1	Light: 67.5 uE m-2 s-1	Photoperiod: L24	Photoperiod: L20D4 (Control)	Photoperiod: L12D12	Photoperiod: L8D16	RBW: 4:1:1 (Control)	RBW: 4:1:0	RBW: 3:1:1	RBW: 3:1:0	Nitrogen: 0%	Nitrogen: 25%	Nitrogen: 50%	Nitrogen: 100% (Control)	Nitrogen: 150%	Phosphorous: 0%	Phosphorous: 25%	Phosphorous: 50%	Phosphorous: 100% (Control)	Phosphorous: 150%	Potassium: 0%	Potassium: 25%	Potassium: 50%	Potassium: 100% (Control)	Potassium: 150%	Temperature: 20°C	Temperature: 25°C (Control)	Temperature: 30°C	Temperature: 35°C
Lsat_1_v5_gn_0_37300.1	-0.25	-0.38	-0.12	-0.02	0.33	-0.37	-0.28	-0.92	-0.43	-0.4	0.08	-0.35	0.1	0.78	0.32	-0.2	0.09	-0.3	0.35	-0.88	-0.45	-0.75	-0.27	-0.34	-0.76	-0.35	-0.12	-0.84	0.31	0.7	1.81
Lsat_1_v5_gn_0_8260.1 (STUbL2)	-2.59	-1.65	-1.51	-2.31	0.67	0.26	-3.63	-2.53	-3.03	-0.29	-0.34	-0.9	-0.86	2.01	1.76	-0.93	-1.15	0.08	-0.27	-0.39	-0.83	-0.2	-0.13	-0.22	-1.25	-0.48	-1.02	-1.69	0.16	0.43	2.45
Lsat_1_v5_gn_1_13300.1	-0.65	-0.25	-1.4	-0.78	0.14	0.37	-0.73	-0.84	-0.68	-0.72	-0.57	-0.38	0.3	1.07	0.46	-0.27	-0.36	0.18	0.23	-0.69	-0.56	-0.14	0.65	-0.03	-0.04	-0.33	-0.24	-0.93	0.68	0.52	1.47
Lsat_1_v5_gn_1_13321.1 (OTP87)	-0.82	-0.86	-0.49	-0.81	-0.61	-0.56	-1.34	-1.55	-1.37	-0.69	-0.7	-0.47	0.6	1.44	0.13	-0.57	-0.61	0.18	0.6	-1.03	-0.26	-0.18	0.21	0.24	-0.06	-0.16	-0.12	-0.26	0.6	0.62	1.87
Lsat_1_v5_gn_1_24500.1 (WAVE3)	-2.02	-1.32	-1.01	-0.89	-0.26	-0.37	-0.99	-0.94	-1.11	0.12	-0.72	-0.69	-0.31	0.74	0.45	-0.67	-0.89	1.04	0.05	0.07	-0.23	0.27	0.94	-0.19	0.54	-0.42	0.2	-1.07	0.07	0.72	1.76
Lsat_1_v5_gn_1_44961.1	-0.46	-0.87	-0.88	-0.82	-0.23	0.08	-1.29	-0.59	-0.6	-1.41	-1.03	-0.24	0.51	1.31	0.66	-0.44	-0.62	0.02	0.09	-0.49	-0.78	0.24	-0.05	0.2	-0.09	-0.37	-1.2	-0.35	0.64	0.73	1.84
Lsat_1_v5_gn_1_5920.1	-0.33	-0.35	-0.51	-0.2	0.02	-0.01	-0.2	0.09	-0.11	-0.2	0.04	-0.19	0.46	0.69	0.37	0.03	-0.28	-0.03	-0.55	-0.27	-0.34	-0.32	0.28	-0.13	-0.15	0.03	-0.43	-0.54	0.35	0.28	1.01
Lsat_1_v5_gn_2_108000.1 (MEF9)	-0.4	-0.5	-0.66	-0.77	-0.31	-0.19	-0.82	-0.82	-0.09	-0.55	-0.56	-0.1	0.33	1.21	0.87	-0.17	-0.37	-0.56	-0.07	-0.83	-0.41	0.09	-0.19	0.15	-0.15	-0.15	-0.83	-0.66	0.69	0.65	1.6
Lsat_1_v5_gn_2_115520.1 (APO3)	-0.52	-0.36	-0.85	-0.37	-0.14	0.09	-0.65	-0.23	-0.41	0.07	-0.22	-0.01	0.42	0.91	0.36	-0.45	-0.23	0.07	0.02	-0.59	-0.71	-0.55	0.25	0.03	-0.19	-0.05	-0.37	-0.8	0.6	0.49	1.4
Lsat_1_v5_gn_2_128460.1	0.09	-0.63	-1.34	-1.36	-0.06	-0.24	-1.68	-0.94	-0.29	-0.73	-0.2	-0.23	0.22	1.27	0.64	-0.57	-0.18	-0.15	-0.92	-0.62	-0.31	-0.23	0.58	0.14	-0.6	-0.1	-0.26	-0.86	0.64	0.87	1.73
Lsat_1_v5_gn_2_128820.1 (OTP70)	-0.03	-0.36	-0.52	-0.28	-0.49	-0.08	-0.8	-0.78	-0.62	-1.18	-0.12	0.06	0.35	1.14	0.33	-0.72	-0.4	-0.41	-0.32	-0.44	-0.03	-0.21	0.31	0.32	-0.34	-0.1	-0.19	-0.74	0.52	0.42	1.66
Lsat_1_v5_gn_2_63940.1	-0.69	-0.87	-1.78	-1.01	-0.1	-0.1	-0.32	-0.26	-0.29	-0.39	0.31	0.33	0.27	0.58	0.65	0.11	-0.39	-0.38	-0.49	-0.4	-0.24	-0.15	-0.25	-0.54	-0.38	-0.29	-0.07	-0.64	0.69	0.75	1.75
Lsat_1_v5_gn_2_69500.1 (CRR28)	-0.18	-0.13	-0.36	-0.34	0.1	0.15	-0.49	0.11	-0.39	-0.36	-0.03	-0.09	-0.26	0.73	0.34	0.01	0.01	-1.15	-0.17	-0.24	-0.03	-0.29	-0.15	0.09	0.16	-0.04	-0.26	-0.47	0.35	0.54	1.07
Lsat_1_v5_gn_2_7520.1	-1.42	-0.26	-1.09	-0.97	-0.63	-0.44	-3.71	-1.33	-0.99	-2.95	-0.39	-0.1	0.12	1.68	1.01	-0.54	-0.45	-0.54	-0.09	-0.61	-0.37	-0.07	0.39	0.03	-0.36	-0.49	0.22	-0.66	0.93	0.09	2.11
Lsat_1_v5_gn_2_82221.1	-0.77	-0.56	-1.21	-1.08	-0.02	0.17	-0.82	0.19	-0.51	-0.51	-0.37	0.09	0.04	1.43	0.47	-0.39	-0.62	-0.72	-0.35	-0.74	-0.42	-0.26	0.02	0.05	-0.26	-0.39	-0.5	-0.79	0.78	0.58	1.83
Lsat_1_v5_gn_2_83800.1	-0.74	-0.59	-0.9	-0.43	0.2	-0.18	-0.91	-0.98	-0.55	-0.6	-0.0	-0.44	0.22	1.39	0.58	-0.14	-0.23	0.24	-0.34	-1.11	-0.48	-0.24	0.15	-0.13	-0.09	-0.58	-0.07	-1.38	0.64	0.6	1.69
Lsat_1_v5_gn_2_87781.1 (emb2076)	-0.91	-0.47	-1.03	-0.58	0.09	0.08	-1.39	-1.03	-0.54	-0.55	-0.28	0.03	0.56	1.26	0.41	-0.48	-0.61	0.17	-0.28	-0.59	-0.32	-0.16	0.76	0.18	-0.15	-0.11	-0.46	-0.5	0.51	0.31	1.46
Lsat_1_v5_gn_2_90480.1 (PDM3)	-0.03	0.12	-0.28	-0.19	0.42	0.28	-0.34	-0.24	-0.46	-0.25	-0.22	-0.21	-0.15	0.63	0.29	-0.1	-0.33	-1.13	-0.05	-0.71	-0.15	-0.05	-0.05	-0.1	-0.26	-0.05	-0.13	-0.66	0.56	0.56	1.18
Lsat_1_v5_gn_2_95580.1 (ISE3)	-0.38	-0.74	-0.6	-1.24	-0.01	-0.06	-1.14	-0.85	-0.6	-0.13	-0.31	0.02	0.23	0.84	0.44	-0.66	-0.62	0.56	-0.15	-0.39	-0.39	-0.07	0.9	0.16	-0.09	-0.01	-0.18	-0.26	0.16	0.29	1.46
Lsat_1_v5_gn_3_108961.1 (LRRAC1)	-0.26	-0.14	-0.12	-0.26	-0.05	0.33	-0.04	-0.18	-0.14	-0.09	0.24	0.0	0.32	0.44	0.33	0.05	-0.03	-0.72	-0.33	-0.53	-0.21	-0.23	0.0	-0.31	-0.44	0.07	-0.05	-0.69	0.25	0.48	0.96
Lsat_1_v5_gn_3_111421.1	-1.25	-0.82	-1.54	-1.24	0.35	0.15	-0.43	-0.01	-0.06	-0.72	-0.2	-0.25	0.07	0.87	0.68	0.04	-0.22	0.28	-0.48	-0.3	-0.65	-0.55	0.77	0.09	-0.34	-0.32	-0.32	-0.69	0.55	0.52	1.44
Lsat_1_v5_gn_3_117141.1	-1.82	-1.0	-0.77	-0.39	-0.69	-0.57	-1.46	-1.09	-0.88	-0.64	-0.3	0.05	0.14	1.28	0.55	-0.08	-0.46	-0.59	-0.21	-0.52	-0.0	-0.69	1.28	-0.92	-0.14	-0.04	-0.32	-0.96	0.68	0.89	1.84
Lsat_1_v5_gn_3_25780.1 (CRR22)	0.2	-0.05	-0.18	-0.26	-0.35	-0.43	-0.71	-0.69	-0.66	-0.41	-0.18	-0.01	0.2	0.92	0.55	-0.06	-0.24	-0.93	-0.01	-0.68	-0.02	-0.14	-0.56	0.1	0.15	-0.59	-0.02	-0.67	0.49	0.58	1.47
Lsat_1_v5_gn_3_31441.1	-1.05	-0.99	-1.9	-0.11	-0.23	-0.61	-0.9	-0.99	-0.34	-0.62	-0.12	-0.02	-0.41	0.73	0.7	-0.15	-0.35	0.48	-0.13	-0.41	-0.26	0.16	0.5	-0.01	0.23	0.22	-0.32	-0.82	0.24	0.81	1.66
Lsat_1_v5_gn_3_53741.1	-0.42	-1.07	-0.73	-0.68	-0.46	0.13	-1.0	-0.57	-0.68	-0.25	-0.11	-0.2	0.24	0.92	0.33	-0.41	-0.55	0.24	0.11	-0.49	-0.35	-0.12	0.63	0.12	-0.24	-0.04	0.15	-0.59	0.52	0.18	1.61
Lsat_1_v5_gn_3_54941.1 (RECG)	-0.2	-0.04	-0.04	-0.19	0.22	0.05	-0.18	0.15	-0.18	-0.23	-0.0	0.06	0.27	0.73	0.1	-0.24	-0.33	-0.66	-0.32	-0.36	-0.39	-0.21	0.09	-0.02	-0.25	-0.15	-0.17	-0.44	0.27	0.41	0.99
Lsat_1_v5_gn_3_56000.1	-1.0	-1.49	-0.51	-0.4	-0.94	0.13	-0.71	-0.52	-1.14	-1.07	-0.42	-0.14	-0.18	1.2	0.96	-0.5	-0.04	0.01	-0.07	-0.56	-0.2	-0.15	0.77	-0.81	-0.15	-0.44	-0.62	-1.05	0.58	0.97	1.79
Lsat_1_v5_gn_3_580.1	-2.33	-2.25	-2.44	-1.84	-0.33	-0.83	-1.11	-0.93	-0.04	-0.08	-0.07	-0.01	0.68	1.38	0.71	0.06	-0.41	0.61	0.58	-0.5	-0.43	-0.93	-0.26	-1.3	-0.78	-0.33	-0.74	-1.37	0.35	0.9	2.18
Lsat_1_v5_gn_4_104040.1 (VAC1)	-0.35	-0.22	-0.39	-0.39	-0.59	-0.23	-0.67	-0.12	-0.27	-0.98	-0.29	0.03	0.01	1.19	0.64	-0.7	-0.75	-0.79	0.0	-1.26	-0.44	0.17	0.8	0.04	-0.67	-0.19	-0.45	-0.26	0.58	0.47	1.57
Lsat_1_v5_gn_4_133160.1 (ELP)	-0.76	-0.53	-0.16	-0.42	-0.14	-0.04	-0.7	-0.82	-0.1	-0.09	0.03	-0.19	0.34	0.82	0.42	0.01	-0.48	-0.26	0.08	-0.28	0.02	-0.16	-0.11	-0.14	-0.17	0.06	-0.27	-0.31	0.38	0.38	1.34
Lsat_1_v5_gn_4_140021.1	-0.19	-0.02	-0.48	-0.63	-0.0	0.26	-0.34	-0.1	-0.23	-0.29	0.02	-0.06	0.18	0.86	0.21	-0.29	-0.53	-0.79	-0.0	-0.39	-0.12	-0.06	0.25	0.04	-0.12	0.01	-0.1	-0.4	0.53	0.32	0.88
Lsat_1_v5_gn_4_143781.1	-1.47	-0.86	-1.71	-1.02	0.25	-0.08	-1.05	-0.59	-0.41	-0.67	-0.45	-0.65	-0.17	1.36	0.84	-0.82	-0.73	0.23	0.55	-0.62	-0.02	-0.44	-0.03	0.43	-0.4	-0.8	-0.89	-0.53	0.67	0.81	1.85
Lsat_1_v5_gn_4_20701.1	-0.66	0.07	-0.89	-0.55	-0.24	0.22	-1.27	-0.6	-0.87	0.18	-0.07	-0.29	-0.05	1.46	0.43	-0.68	-0.26	-0.45	-0.46	-0.5	-0.54	-0.35	0.03	-0.26	0.1	0.17	-0.25	-0.81	0.75	0.6	1.45
Lsat_1_v5_gn_4_34040.1 (ALA10)	-1.46	-0.6	-1.27	-1.28	0.08	-1.88	-2.22	-1.9	-0.23	-0.39	-0.65	-0.32	0.15	1.39	0.05	-1.3	-0.79	0.47	-0.42	-1.62	-0.36	-0.17	0.42	-0.92	0.01	-0.28	-0.77	-1.48	1.34	0.61	2.51
Lsat_1_v5_gn_4_43500.1 (ATFP8)	-1.53	-1.27	-1.39	-0.59	0.05	-0.07	-1.27	-0.44	-0.61	-0.76	0.28	-0.08	-0.73	1.15	0.74	-0.34	-0.44	-0.04	0.26	-0.34	-0.42	-0.71	0.81	-0.03	-0.11	-0.13	0.05	-0.45	0.42	0.66	1.61
Lsat_1_v5_gn_4_50841.1	-2.77	-1.3	-1.39	-1.77	0.05	-0.01	-1.45	-2.44	-0.28	0.45	-0.85	-1.4	0.56	1.48	0.62	-0.14	-0.42	1.13	0.43	-1.08	-0.05	-1.5	0.21	-0.97	-0.36	-0.62	-0.61	-0.63	0.03	0.53	2.15
Lsat_1_v5_gn_4_50920.1 (MSH5)	-0.88	-0.71	-0.24	-0.3	-0.42	-0.23	-1.87	-1.05	-0.55	-1.08	0.45	-0.19	-0.06	1.17	0.75	-0.53	-0.6	0.93	-0.29	-1.26	-0.92	-0.73	0.01	-0.35	-0.35	-0.32	-0.14	-1.28	0.76	0.68	1.98
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Details

Dark gray cells indicate values where the raw expression is zero (cannot be log-transformed). Blue cells indicate samples where the expression of the gene is below average and red cells indicate the gene is expressed above average in the sample. White cells are average.