Heatmap: Cluster_201 (Lactuca sativa (Lsa) Coexpression Clusters (HCCA Algorithm))

View as: (view zlog-transformed or row-normalized)

View using InCHLib : here ( Experimental feature, still under development)

(Showing raw values)

Gene
Light: 268 uE m-2 s-1
Light: 202.5 uE m-2 s-1 (Control)
Light: 135 uE m-2 s-1
Light: 67.5 uE m-2 s-1
Photoperiod: L24
Photoperiod: L20D4 (Control)
Photoperiod: L12D12
Photoperiod: L8D16
RBW: 4:1:1 (Control)
RBW: 4:1:0
RBW: 3:1:1
RBW: 3:1:0
Nitrogen: 0%
Nitrogen: 25%
Nitrogen: 50%
Nitrogen: 100% (Control)
Nitrogen: 150%
Phosphorous: 0%
Phosphorous: 25%
Phosphorous: 50%
Phosphorous: 100% (Control)
Phosphorous: 150%
Potassium: 0%
Potassium: 25%
Potassium: 50%
Potassium: 100% (Control)
Potassium: 150%
Temperature: 20°C
Temperature: 25°C (Control)
Temperature: 30°C
Temperature: 35°C
0.0 0.0 0.0 0.0 0.07 0.1 0.04 0.0 0.07 0.0 0.25 0.0 0.08 0.52 0.27 0.34 0.04 24.93 0.0 0.06 0.03 0.04 35.37 0.53 0.06 0.06 0.12 0.0 0.14 0.08 0.03
1.33 2.06 1.45 1.34 1.94 1.82 1.26 1.33 1.27 1.29 1.5 1.42 2.31 3.37 3.5 1.27 1.27 30.0 1.4 1.13 1.13 1.27 42.8 1.41 1.78 1.67 1.26 1.31 1.64 2.35 2.27
0.3 0.9 0.29 0.61 0.54 0.2 0.17 0.01 0.01 0.07 0.0 0.12 1.08 0.12 0.1 0.15 0.19 5.6 0.0 0.07 0.1 0.03 10.23 0.05 0.22 0.15 0.06 0.14 0.06 0.22 0.61
0.65 0.43 0.72 0.04 3.52 5.57 0.54 0.39 0.49 0.24 0.1 0.3 5.35 5.08 2.28 2.25 0.34 120.3 1.24 0.08 0.33 0.7 146.87 1.0 0.45 0.4 0.59 1.62 1.25 0.21 0.62
0.0 0.0 0.0 0.0 0.03 0.03 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.09 0.08 0.12 0.0 0.0 4.98 0.0 0.0 0.0 0.01 7.63 0.01 0.02 0.0 0.02 0.0 0.02 0.01 0.02
153.72 262.34 197.3 122.82 415.2 455.89 583.86 724.08 216.73 190.18 200.35 161.96 269.38 741.88 640.51 346.02 325.9 1800.18 482.31 353.21 358.85 431.3 3420.3 298.77 398.65 413.85 418.23 274.87 647.5 682.27 769.87
0.12 0.2 0.06 0.02 0.22 0.32 0.04 0.01 0.02 0.04 0.02 0.0 0.26 0.17 0.05 0.01 0.05 4.84 0.02 0.03 0.02 0.07 7.13 0.09 0.06 0.02 0.02 0.0 0.09 0.09 0.66
0.81 1.98 0.76 0.74 2.23 0.53 0.78 0.74 1.44 0.28 1.21 0.38 1.49 2.87 1.67 1.03 0.93 28.5 1.28 0.68 0.65 1.13 37.0 0.9 0.83 1.35 1.37 0.52 0.73 1.87 1.38
0.03 0.1 0.0 0.02 2.35 1.82 0.09 0.04 0.03 0.01 0.12 0.05 2.25 1.97 5.4 0.26 0.14 62.02 0.37 0.13 0.35 0.17 98.47 0.36 0.7 0.15 0.46 0.33 0.26 0.8 0.1
1.6 1.39 2.29 1.72 0.3 0.53 0.25 0.12 0.3 0.51 0.25 0.2 0.56 1.02 0.74 0.33 0.46 9.01 0.76 0.19 0.38 0.09 14.15 0.2 0.35 0.35 0.53 0.04 0.39 0.57 1.18
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.07 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.7 0.03 0.0 0.0 0.0 1.18 0.0 0.04 0.0 0.0 0.0 0.0 0.07 0.04
1.12 1.13 1.33 0.86 2.0 1.79 1.14 0.98 1.04 1.21 1.15 1.12 1.82 2.55 1.85 1.34 1.31 17.0 1.52 1.23 1.06 0.91 27.78 1.35 1.52 1.33 1.47 1.34 1.43 1.33 2.75
0.22 0.21 0.33 0.0 0.23 0.17 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.11 0.0 0.0 0.24 0.0 0.0 11.49 0.0 0.0 0.0 0.0 15.47 0.0 0.28 0.0 0.0 0.0 0.0 0.28 0.19
0.0 0.0 0.0 0.8 1.6 4.21 7.49 1.3 0.29 0.0 0.94 0.62 20.51 3.62 5.9 0.37 0.3 30929.77 0.0 1.27 1.37 0.83 48407.8 4.06 19.02 1.09 3.28 3.74 2.49 1.58 10.87
0.0 0.0 0.04 0.04 0.25 0.2 0.0 0.02 0.06 0.0 0.05 0.03 0.12 0.02 0.04 0.0 0.0 2.33 0.01 0.03 0.0 0.06 3.5 0.0 0.0 0.12 0.02 0.0 0.0 0.0 0.0
0.05 0.08 0.0 0.0 0.65 0.44 0.12 0.03 0.21 0.17 0.36 0.12 0.85 0.37 0.42 0.23 0.1 15.14 0.2 0.07 0.34 0.16 23.35 0.27 0.24 0.3 0.27 0.19 0.2 0.23 1.36
0.38 0.35 0.36 0.24 0.28 0.43 0.44 0.39 0.22 0.27 0.25 0.31 0.99 0.9 0.68 0.22 0.27 7.75 0.48 0.24 0.31 0.28 10.89 0.33 0.26 0.26 0.35 0.46 0.17 0.09 0.33
0.23 0.51 0.14 0.05 0.26 0.15 0.27 0.03 0.09 0.06 0.06 0.05 0.55 0.27 0.36 0.14 0.02 163.1 0.15 0.07 0.13 0.09 202.6 0.07 0.9 0.03 0.12 0.14 0.13 0.14 0.15
0.03 0.0 0.0 0.01 0.29 0.41 0.01 0.03 0.02 0.01 0.06 0.05 0.71 0.02 0.06 0.01 0.0 32.69 0.0 0.03 0.0 0.0 49.27 0.09 0.35 0.01 0.12 0.01 0.01 0.02 0.0
0.12 0.0 0.0 0.05 0.48 0.2 0.08 0.02 0.06 0.05 0.07 0.03 0.49 0.44 0.71 0.05 0.04 7.32 0.2 0.04 0.23 0.03 12.74 0.1 0.25 0.14 0.04 0.11 0.02 0.05 0.27
34.2 27.24 23.51 22.4 38.14 38.32 45.75 52.36 32.71 32.11 34.1 35.15 61.07 57.94 47.74 34.64 40.53 134.7 36.43 34.22 35.65 35.34 282.63 39.59 37.52 34.42 34.61 40.51 35.86 37.21 48.13
0.35 0.28 0.17 0.46 0.91 0.51 0.14 0.08 0.15 0.34 0.37 0.28 0.74 0.92 1.19 0.35 0.47 7.77 0.26 0.46 0.32 0.19 10.36 0.33 0.33 0.28 0.27 0.27 0.23 0.29 0.34
6.65 6.94 6.92 5.33 8.51 5.36 3.74 3.46 3.46 3.36 3.94 3.22 4.61 6.69 5.15 3.56 3.59 25.78 4.25 3.1 3.25 3.42 43.29 3.65 3.68 3.42 3.51 3.62 4.04 4.47 4.92
0.36 0.14 0.24 0.42 5.11 3.24 0.36 0.19 0.45 0.27 0.37 0.5 3.9 4.93 2.31 0.46 0.3 83.63 0.67 0.36 0.54 0.44 137.53 0.48 2.28 0.46 0.43 0.52 0.35 1.04 0.41
1.19 0.68 0.72 0.82 18.8 16.72 0.66 2.02 2.26 2.03 3.03 2.27 3.24 19.5 7.17 5.05 1.74 92.69 6.35 1.76 2.99 3.77 168.37 4.04 3.58 2.88 3.73 2.17 5.24 4.1 3.68
78.9 67.32 60.74 39.91 43.71 37.23 34.14 37.52 30.98 30.3 32.21 37.07 54.7 33.29 30.9 29.89 32.51 214.53 32.61 31.86 34.47 36.08 324.0 36.23 37.33 37.32 34.63 38.74 33.31 31.99 38.79
0.67 0.72 0.28 0.49 0.62 0.47 0.43 0.58 0.29 0.37 0.65 0.53 0.61 0.45 0.38 0.38 0.43 23.46 0.26 0.22 0.26 0.35 31.34 0.29 0.54 0.15 0.3 0.27 0.23 0.27 0.56
30.32 28.68 37.31 45.28 35.51 23.85 7.52 9.44 15.66 15.58 17.62 14.47 10.5 14.33 18.04 14.07 10.24 205.01 12.65 10.99 14.41 14.38 328.73 12.54 13.38 13.69 15.14 11.71 18.1 16.37 10.11
0.0 0.06 0.0 0.0 0.22 0.13 0.0 0.0 0.02 0.0 0.0 0.0 0.48 0.15 0.03 0.0 0.0 17.71 0.0 0.02 0.01 0.11 27.62 0.12 0.48 0.0 0.0 0.02 0.01 0.03 0.02
6.62 40.07 5.05 0.65 14.88 12.95 0.62 0.36 0.98 0.39 2.08 0.18 6.59 6.43 1.88 1.26 0.24 251.68 0.9 1.02 0.66 0.53 384.93 1.26 3.76 2.45 0.54 0.5 1.72 3.58 1.82
22.57 23.48 18.0 13.87 27.29 23.87 15.33 13.91 12.94 13.52 13.66 12.91 21.17 31.04 24.45 16.8 14.97 111.96 16.9 12.67 15.04 15.27 187.96 13.42 14.16 15.88 15.07 15.19 17.85 15.65 16.5
0.54 0.57 0.14 0.3 1.45 1.74 0.51 0.33 0.09 0.14 0.22 0.18 2.42 2.54 1.32 0.29 0.34 235.95 0.41 0.07 0.28 0.13 288.58 0.97 1.69 0.19 0.4 0.1 0.66 1.14 0.93
11.49 22.61 7.47 4.52 15.14 22.2 14.97 18.03 8.69 9.37 9.19 8.06 7.86 18.75 19.62 13.26 11.48 318.85 23.63 11.08 11.15 11.63 500.64 12.77 14.61 10.72 10.83 11.47 8.78 12.63 11.57
16.13 14.66 19.9 17.67 17.47 15.24 9.71 10.47 12.12 14.49 13.44 12.26 17.04 16.64 15.13 14.44 12.89 58.59 12.23 10.99 12.34 12.16 96.74 9.9 11.1 12.19 11.95 12.07 12.13 14.72 14.44
5.69 5.24 5.47 5.29 7.74 7.87 8.37 11.82 5.95 6.34 6.05 6.8 9.0 10.46 9.74 6.6 7.49 23.24 8.86 7.36 6.25 6.64 45.15 6.85 6.62 6.87 6.49 5.51 8.95 9.24 10.91
1.13 0.9 0.74 0.94 2.44 1.99 0.8 0.84 0.9 0.87 1.21 1.1 4.11 4.05 5.07 1.06 1.22 40.31 1.37 1.08 1.21 1.01 59.51 1.63 1.69 1.11 1.02 1.54 1.26 2.46 2.34
0.08 0.13 0.06 0.02 0.3 0.15 0.05 0.04 0.02 0.1 0.04 0.01 0.4 0.4 0.16 0.12 0.13 4.77 0.1 0.04 0.02 0.02 7.42 0.14 0.25 0.02 0.14 0.02 0.06 0.32 0.19
0.24 0.3 0.23 0.27 0.49 0.42 0.33 0.22 0.48 0.42 0.41 0.47 0.75 0.94 1.09 0.39 0.49 51.72 0.48 0.39 0.37 0.44 71.8 0.56 0.79 0.51 0.29 0.36 0.33 0.68 0.79
0.36 0.32 0.41 0.43 1.03 1.37 1.15 1.68 0.9 0.73 1.05 0.69 2.95 3.64 3.02 1.01 0.75 29.05 1.19 1.14 0.95 0.83 38.95 1.33 1.12 0.89 0.88 0.67 1.29 1.62 2.83
0.56 4.15 1.26 0.48 3.49 4.34 0.8 0.49 1.0 0.69 1.23 0.94 1.05 1.29 1.73 1.44 0.95 35.26 0.69 1.12 1.04 1.18 51.45 1.01 1.48 2.02 0.89 0.61 1.05 1.85 2.25
5.02 5.31 1.34 1.3 2.04 1.69 0.63 0.37 0.2 0.2 0.29 0.14 2.09 3.84 1.35 0.33 0.16 136.61 0.39 0.08 0.16 0.17 202.08 0.11 0.16 0.23 0.1 0.1 0.85 0.32 0.74
0.02 0.02 0.01 0.06 0.37 0.29 0.02 0.06 0.04 0.07 0.03 0.05 0.41 0.43 0.16 0.07 0.01 3.41 0.06 0.06 0.06 0.07 5.63 0.08 0.11 0.08 0.05 0.02 0.06 0.05 0.17
1.8 1.45 0.86 0.69 2.61 2.11 0.65 0.82 0.85 0.71 1.16 0.52 0.86 3.17 2.04 0.83 0.75 14.48 1.32 0.83 1.16 1.03 19.69 1.31 1.58 1.24 1.26 0.82 1.2 1.23 1.3
46.79 44.2 36.51 38.6 69.26 74.59 65.62 76.84 45.42 51.66 47.58 52.84 72.31 85.84 74.61 62.2 62.32 233.95 54.67 52.83 54.85 59.45 370.13 58.09 59.53 56.76 59.22 58.9 59.91 60.7 64.18
0.15 0.19 0.18 0.07 1.09 0.44 0.33 0.07 0.46 0.64 0.38 0.28 0.26 0.75 0.48 0.85 0.18 40.48 0.89 0.67 0.24 0.5 67.21 0.28 1.34 0.58 0.44 0.18 0.91 1.8 1.29
0.11 0.0 0.0 0.03 0.5 0.26 0.27 0.0 0.12 0.02 0.12 0.0 0.13 0.52 0.21 0.02 0.06 39.58 0.2 0.17 0.02 0.11 72.62 0.14 0.89 0.09 0.24 0.04 0.02 0.12 0.1
0.05 0.05 0.09 0.08 0.1 0.23 0.18 0.14 0.08 0.07 0.08 0.06 0.18 0.06 0.1 0.13 0.06 4.84 0.05 0.08 0.04 0.11 6.84 0.14 0.11 0.08 0.04 0.06 0.19 0.29 0.2
0.0 0.02 0.0 0.01 0.13 0.12 0.03 0.0 0.01 0.01 0.0 0.04 0.26 0.11 0.25 0.03 0.02 16.14 0.04 0.0 0.03 0.02 20.53 0.12 0.05 0.02 0.03 0.03 0.04 0.07 0.04
0.09 0.03 0.0 0.08 0.22 0.2 0.09 0.03 0.05 0.0 0.06 0.09 0.33 0.09 0.15 0.01 0.03 9.75 0.04 0.02 0.02 0.05 12.0 0.1 0.17 0.08 0.06 0.07 0.07 0.08 0.05
0.0 0.0 0.0 0.0 0.19 0.43 0.13 0.0 0.0 0.12 0.57 0.07 0.3 0.14 0.4 0.0 0.12 109.51 0.11 0.0 0.21 0.11 151.32 0.51 0.12 0.44 0.0 0.12 0.2 0.0 0.56
2.03 4.67 0.98 0.4 1.61 0.82 0.98 0.71 0.63 0.16 0.52 0.96 2.12 1.37 0.95 1.16 0.74 12.79 0.31 0.48 0.47 0.39 22.28 0.08 0.35 0.7 0.63 0.69 0.17 0.27 0.11
0.11 0.03 0.02 0.03 3.51 3.63 0.22 0.21 0.13 0.14 0.37 0.1 8.8 3.67 3.88 0.14 0.23 187.92 0.85 0.18 0.69 0.6 274.98 2.17 1.65 0.17 1.31 0.55 0.53 0.78 4.39
0.95 0.82 0.62 0.91 2.44 2.12 1.57 1.37 1.06 0.74 1.21 1.03 1.84 3.53 2.64 1.51 1.37 15.05 1.3 1.35 1.22 1.08 22.07 1.04 1.7 1.06 1.5 1.26 1.71 1.92 1.79
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 1.72 0.0 0.0 0.0 0.0 2.25 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.58 0.96 0.18 0.37 0.14 0.42 0.19 0.85 0.0 0.4 0.36 0.0 0.58 0.0 0.0 0.23 0.0 48.2 0.0 0.0 0.48 0.0 65.78 0.0 0.0 0.0 0.0 0.5 0.0 0.0 0.18
0.1 0.08 0.02 0.01 2.83 2.27 0.16 0.09 0.05 0.11 0.09 0.03 2.08 4.59 5.0 0.15 0.06 55.47 1.13 0.25 0.52 0.43 90.32 1.05 0.63 0.14 0.53 0.3 0.24 1.04 0.08
0.28 0.04 0.11 0.0 3.55 2.34 0.11 0.11 0.12 0.08 0.26 0.04 2.05 4.1 5.16 0.12 0.16 59.27 1.2 0.19 0.51 0.52 81.86 1.12 0.7 0.14 0.59 0.23 0.22 0.83 0.14
0.15 0.24 0.07 0.04 0.28 0.21 0.09 0.12 0.02 0.06 0.03 0.04 0.14 0.14 0.08 0.12 0.04 5.35 0.09 0.02 0.08 0.06 6.32 0.06 0.07 0.1 0.04 0.09 0.12 0.03 0.15
0.04 0.03 0.05 0.0 0.1 0.27 0.04 0.01 0.04 0.01 0.03 0.03 0.33 0.71 0.12 0.06 0.01 4.73 0.14 0.08 0.12 0.04 6.03 0.09 0.03 0.09 0.07 0.02 0.07 0.06 0.14
6.25 6.82 5.16 5.43 10.6 10.44 8.1 8.66 6.38 6.33 6.75 8.12 13.67 14.9 12.32 10.71 10.65 38.12 6.65 6.89 8.23 8.22 78.79 9.85 8.75 9.62 9.1 8.5 8.4 9.12 12.97
0.0 0.05 0.0 0.11 0.18 0.22 0.13 0.04 0.05 0.17 0.04 0.05 0.24 0.52 0.47 0.07 0.17 79.49 0.16 0.28 0.4 0.02 96.87 0.39 1.2 0.09 0.27 0.17 0.16 0.33 0.32
0.0 0.0 0.0 0.0 0.03 0.0 0.0 0.0 0.03 0.0 0.0 0.0 0.13 0.23 0.24 0.0 0.0 6.32 0.0 0.0 0.0 0.0 6.98 0.01 0.0 0.0 0.03 0.0 0.0 0.01 0.0
0.0 0.4 0.54 0.53 0.73 0.31 0.58 0.93 0.56 0.15 0.77 0.68 0.0 1.9 1.75 0.37 0.16 10.7 1.01 0.48 0.19 0.17 13.71 0.0 0.2 0.12 0.51 0.12 0.83 0.48 0.33
4.47 6.57 11.53 7.34 18.48 11.0 5.11 10.02 9.18 10.68 10.27 12.43 14.48 15.3 22.66 7.62 9.89 2413.71 11.65 8.34 15.52 3.65 2825.8 15.6 32.6 6.22 17.21 8.61 19.86 33.11 31.66
10.5 12.41 13.58 13.34 30.23 22.27 12.47 12.11 12.63 11.82 13.8 12.89 24.22 37.26 33.26 19.83 16.64 318.44 16.39 11.53 12.25 11.33 535.91 12.68 15.08 12.8 14.18 10.95 15.08 20.56 22.01
1.72 2.0 2.29 0.16 13.1 8.84 0.07 0.14 0.29 0.32 0.23 0.41 2.26 5.1 8.21 1.34 0.57 99.33 1.65 0.2 1.32 0.24 130.82 1.64 1.57 1.86 1.41 1.1 1.09 1.71 0.35
0.08 0.0 0.06 0.05 0.19 0.3 0.13 0.1 0.13 0.09 0.04 0.08 0.73 0.68 0.29 0.1 0.11 16.19 0.19 0.07 0.1 0.11 26.73 0.13 0.18 0.07 0.07 0.14 0.12 0.04 0.08
1.14 0.76 0.36 0.24 1.29 1.17 0.72 0.44 0.26 0.2 0.29 0.37 0.71 1.69 1.63 0.86 0.52 21.75 0.59 0.61 0.46 0.49 31.89 0.57 0.57 0.36 0.63 0.79 0.53 0.52 0.25

Details

Raw expression values (TPM normalized), Green cells indicate low expression and red high. (Dark gray cells indicate missing values)