Heatmap: Cluster_95 (Lactuca sativa (Lsa) Coexpression Clusters (HCCA Algorithm))

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(Values are log₂ transformed ratios of a genes expression in a sample divided by the mean expression level)

Gene	Light: 268 uE m-2 s-1	Light: 202.5 uE m-2 s-1 (Control)	Light: 135 uE m-2 s-1	Light: 67.5 uE m-2 s-1	Photoperiod: L24	Photoperiod: L20D4 (Control)	Photoperiod: L12D12	Photoperiod: L8D16	RBW: 4:1:1 (Control)	RBW: 4:1:0	RBW: 3:1:1	RBW: 3:1:0	Nitrogen: 0%	Nitrogen: 25%	Nitrogen: 50%	Nitrogen: 100% (Control)	Nitrogen: 150%	Phosphorous: 0%	Phosphorous: 25%	Phosphorous: 50%	Phosphorous: 100% (Control)	Phosphorous: 150%	Potassium: 0%	Potassium: 25%	Potassium: 50%	Potassium: 100% (Control)	Potassium: 150%	Temperature: 20°C	Temperature: 25°C (Control)	Temperature: 30°C	Temperature: 35°C
Lsat_1_v5_gn_0_17741.1 (CEL3)	-2.29	-1.67	-1.7	-1.49	-0.34	-0.73	-0.84	-1.58	-0.17	0.24	0.27	0.08	0.19	0.98	1.29	0.07	0.05	0.77	-0.03	-0.24	-0.41	-0.71	-1.54	0.09	-0.41	-0.34	-0.12	-1.16	0.3	1.0	1.64
Lsat_1_v5_gn_0_28220.1 (MDAR4)	-1.03	-0.9	-0.72	-0.46	-0.03	-0.24	-0.45	-0.37	0.06	0.15	0.25	0.36	0.47	0.76	0.84	-0.01	0.14	0.57	-0.13	-0.02	-0.35	-0.46	-1.3	0.01	-0.09	-0.2	-0.14	-0.43	0.27	0.35	0.55
Lsat_1_v5_gn_1_23220.1	-1.04	-1.06	-1.47	-0.87	0.22	0.65	0.07	0.02	-0.28	-0.21	-0.03	-0.5	-0.23	0.57	0.48	-0.09	-0.18	1.57	0.3	-0.3	-0.41	-0.15	-0.07	-0.1	-0.17	-0.08	-0.13	-0.6	0.07	0.22	0.28
Lsat_1_v5_gn_1_27281.1 (CYP71A25)	-1.29	-0.59	-1.27	-1.41	0.42	1.17	-0.15	-0.35	-0.66	-0.68	-0.4	-0.75	-0.54	0.99	0.66	0.14	-0.45	1.48	0.18	-0.65	-0.31	-0.28	0.5	-0.36	-0.39	-0.23	-0.15	-0.66	0.37	0.21	0.26
Lsat_1_v5_gn_1_43161.1 (PEC1)	-0.31	-0.46	-0.65	-0.09	0.05	0.1	-0.09	0.43	-0.29	-0.18	-0.2	-0.19	-0.27	0.7	0.5	0.03	-0.03	0.6	-0.12	-0.26	-0.24	-0.23	-0.48	-0.49	-0.2	-0.15	-0.09	-0.22	0.45	0.45	0.57
Lsat_1_v5_gn_1_45280.1 (IQD19)	-0.95	-1.76	-1.02	-0.77	-0.21	-0.36	-0.37	-0.04	-0.09	-1.11	0.54	0.18	-0.24	1.16	0.99	-0.51	0.01	1.33	0.12	-0.07	-0.3	-1.08	-2.12	0.01	-0.49	-0.39	-0.01	-1.14	0.1	0.35	1.37
Lsat_1_v5_gn_1_48000.1 (NPF2.3)	-1.39	-0.79	-1.0	-0.49	0.16	-0.36	-0.38	-0.38	0.11	0.01	0.19	0.22	-0.92	1.1	0.95	0.27	0.21	0.03	0.36	-0.1	-0.08	-0.53	-0.28	0.06	-0.09	-0.07	-0.07	-0.64	0.19	0.52	0.3
Lsat_1_v5_gn_1_54920.1	-1.75	-0.93	-0.97	-0.79	0.19	-0.32	-0.72	-0.68	-0.05	-0.09	0.06	-0.03	0.3	1.24	0.96	-0.04	0.02	0.65	0.03	-0.29	-0.62	-0.81	-4.24	0.33	-0.04	-0.37	-0.29	-0.84	0.42	0.76	1.24
Lsat_1_v5_gn_1_57281.1 (HVA22J)	-1.33	-1.0	-0.7	-0.48	-0.2	-0.27	-0.37	-0.32	-0.06	0.16	0.13	0.25	0.32	0.61	0.53	0.27	0.17	0.69	-0.04	-0.13	-0.38	-0.14	-1.45	0.17	0.21	0.03	-0.02	-0.33	0.04	0.43	0.67
Lsat_1_v5_gn_1_66321.1 (SAP5)	-1.24	-1.7	-3.24	-3.01	-0.88	0.4	0.47	0.55	-0.66	-1.18	-1.14	-1.35	0.29	1.19	1.05	0.02	-0.24	1.67	0.07	-0.13	-0.23	-0.28	0.4	-0.14	-0.31	0.01	0.01	-0.77	0.32	0.34	0.01
Lsat_1_v5_gn_1_72961.1 (LTP6)	-1.58	-0.89	-1.45	-2.62	0.1	0.08	-0.18	0.35	-0.37	-0.32	-0.17	-0.46	-0.85	0.93	1.01	0.16	0.07	0.78	0.11	-0.4	-0.18	-0.34	-5.53	-0.29	-0.01	-0.58	-0.22	-1.0	1.13	1.26	0.84
Lsat_1_v5_gn_2_108501.1 (VAT1)	-0.91	-1.04	-0.99	-0.64	0.5	0.2	-0.31	-0.53	-0.0	0.04	0.24	0.15	0.29	0.87	0.75	0.05	0.09	-0.03	0.09	-0.2	-0.18	-0.27	-2.39	0.25	0.03	-0.27	-0.02	-0.12	0.07	0.39	0.58
Lsat_1_v5_gn_2_113381.1	-0.89	-0.37	-0.66	-0.44	0.33	0.22	-0.08	0.04	-0.21	-0.1	0.06	-0.2	-0.12	0.78	0.64	-0.02	-0.2	0.73	0.11	-0.28	-0.14	0.0	-0.0	-0.35	-0.28	-0.14	-0.06	-0.57	0.18	0.21	0.32
Lsat_1_v5_gn_2_120201.1	-0.67	-0.5	-0.75	-1.01	0.43	0.26	0.06	0.16	-0.13	-0.1	-0.18	-0.0	0.39	0.5	0.43	0.14	0.12	0.76	-0.27	-0.18	-0.16	-0.15	-1.28	0.01	-0.29	-0.13	-0.15	-0.4	0.37	0.25	0.48
Lsat_1_v5_gn_2_122340.1	-0.75	-1.06	-0.83	0.13	0.28	0.08	-0.36	-0.1	-0.37	-0.23	0.08	-0.09	-0.4	1.14	0.83	-0.06	-0.1	0.83	0.13	-0.12	-0.19	-0.21	-0.15	-0.55	-0.35	-0.34	-0.13	-0.37	0.25	0.26	0.33
Lsat_1_v5_gn_2_124260.1 (SNG2)	-1.31	-0.99	-0.75	-0.55	0.06	-0.45	-0.38	-0.56	-0.05	0.06	0.05	-0.0	0.26	0.81	0.94	0.19	0.17	0.17	0.06	0.07	-0.35	-0.36	-2.04	0.27	-0.02	-0.15	-0.06	-0.51	-0.02	0.48	1.19
Lsat_1_v5_gn_2_127301.1	-1.99	-1.14	-1.7	-0.74	0.01	-0.66	-0.3	-0.48	0.13	-0.05	0.27	0.09	0.83	0.36	0.92	0.23	0.39	1.22	-0.3	0.22	-0.2	-0.54	-3.75	0.41	0.08	0.02	0.13	-0.31	0.24	0.42	-0.48
Lsat_1_v5_gn_2_45721.1 (ENOR3L3)	-1.38	-0.91	-1.06	-1.17	0.35	0.33	-0.14	-0.15	-0.14	-0.31	0.14	-0.19	-0.35	1.13	0.98	-0.07	-0.33	0.5	-0.05	-0.57	-0.12	-0.57	-1.75	-0.29	0.17	-0.88	-0.17	-0.37	1.05	0.71	0.7
Lsat_1_v5_gn_2_54380.1 (PSE1)	-1.48	-0.92	-0.85	-0.34	-0.07	-0.4	-0.66	-0.55	0.18	0.24	0.22	0.03	0.09	0.81	0.66	0.09	-0.06	0.6	-0.02	-0.32	-0.56	-0.59	-2.72	0.3	-0.16	-0.09	-0.09	-0.85	0.26	0.72	1.39
Lsat_1_v5_gn_2_74261.1 (MAD3)	-1.63	-1.14	-0.99	-0.7	-0.02	-0.58	-0.83	-0.6	-0.02	0.01	0.11	0.05	0.17	1.36	0.98	-0.06	-0.05	1.12	-0.07	-0.3	-0.62	-0.8	-1.69	0.16	-0.19	-0.37	-0.25	-1.07	0.23	0.55	1.22
Lsat_1_v5_gn_2_74501.1	-1.35	-1.09	-0.54	0.1	0.33	0.17	-0.62	-0.42	-0.26	0.04	0.21	0.22	-0.71	1.13	1.0	-0.05	-0.31	0.99	0.25	-0.16	-0.5	-0.24	-0.01	-0.4	-0.39	-0.18	-0.25	-0.43	0.26	0.19	-0.19
Lsat_1_v5_gn_2_86580.1 (ICME-LIKE2)	-1.75	-1.07	-1.34	-0.93	-0.08	-0.4	-0.5	-0.83	-0.08	-0.04	0.0	0.07	0.19	1.1	1.14	0.16	0.09	0.73	-0.26	-0.12	-0.37	-0.72	-0.83	-0.02	-0.18	-0.32	0.02	-0.96	0.17	0.67	1.28
Lsat_1_v5_gn_2_94621.1	-0.6	-0.76	-0.79	-0.46	0.24	-0.19	-0.18	-0.57	0.12	0.23	0.23	0.33	0.26	0.71	0.54	0.1	0.0	-0.09	0.15	0.01	-0.1	-0.27	-1.8	-0.11	0.08	-0.03	0.26	0.13	-0.04	0.14	0.42
Lsat_1_v5_gn_3_12101.1 (VDOF1)	-0.67	-0.74	-0.61	-0.53	-0.01	-0.06	-0.17	-0.14	-0.22	-0.07	-0.09	-0.28	-0.02	0.99	0.71	0.05	0.04	0.76	0.22	-0.23	-0.34	-0.36	-0.8	-0.0	-0.12	-0.23	-0.11	-0.41	0.12	0.33	0.84
Lsat_1_v5_gn_3_131720.1	-1.11	-1.31	-1.02	-1.17	0.0	-0.13	-0.26	-0.81	0.2	0.4	0.31	0.27	0.33	0.86	0.91	0.21	0.21	0.8	0.1	-0.18	-0.35	-0.44	-2.38	0.31	0.15	-0.14	0.1	-0.19	-0.28	0.08	0.28
Lsat_1_v5_gn_3_13600.1 (PUX10)	-2.01	-1.19	-1.13	-0.65	0.03	-0.26	-0.42	-0.26	-0.25	-0.13	0.38	-0.26	0.06	1.34	0.94	-0.04	-0.16	1.26	0.13	-0.34	-0.43	-0.82	-1.07	-0.28	-0.57	-0.41	-0.21	-0.98	0.02	0.31	1.38
Lsat_1_v5_gn_3_55121.1 (E-4PDHase)	-1.33	-0.82	-0.59	0.06	0.05	-0.53	-0.35	0.08	0.12	-0.16	0.14	0.43	0.2	-0.23	0.88	0.31	0.12	1.51	0.21	-0.09	-0.09	-0.33	-4.73	0.5	0.0	-0.42	-0.24	-0.21	-0.25	-0.53	0.03
Lsat_1_v5_gn_3_59100.1	-0.49	-0.42	-0.89	-0.74	0.19	0.48	-0.18	-0.25	-0.6	-0.73	-0.4	-0.66	-0.68	0.9	0.81	0.21	0.05	0.9	0.16	-0.25	-0.24	-0.09	0.53	-0.34	-0.25	-0.14	0.04	-0.39	0.26	0.26	0.36
Lsat_1_v5_gn_4_117861.1	-2.04	-1.84	-1.25	-0.51	0.27	0.19	0.27	0.19	-0.46	-0.0	-0.11	-0.09	-0.87	1.04	0.81	-0.07	-0.35	1.14	0.42	-0.19	-0.6	-0.3	-1.9	0.17	-0.07	-0.95	-0.07	-0.89	0.5	0.59	0.86
Lsat_1_v5_gn_4_136921.1 (ATB2)	-1.81	-1.43	-1.3	-0.45	0.03	0.69	-0.4	-0.46	-0.22	-0.24	-0.67	-0.57	-0.91	0.87	0.67	0.02	-0.33	1.96	0.5	-0.22	-0.35	-0.72	0.19	-0.74	-0.01	-0.29	-0.68	-1.17	0.15	0.19	0.93
Lsat_1_v5_gn_4_154921.1 (TRE1)	-1.87	-1.23	-0.75	-0.44	0.26	0.22	-0.44	-0.22	-0.12	-0.54	-0.06	-0.1	-0.25	0.92	0.7	-0.08	-0.32	1.52	0.35	-0.59	-0.38	-0.17	-0.14	-0.47	-0.5	-0.54	-0.21	-0.71	0.4	0.1	1.04
Lsat_1_v5_gn_4_169720.1 (PME31)	-0.49	-0.25	-0.24	-0.25	0.13	-0.11	-0.41	-0.54	0.03	-0.05	0.17	0.08	-0.4	0.93	0.81	0.17	0.08	0.17	0.05	-0.13	-0.22	-0.33	-2.37	0.07	-0.13	-0.17	-0.06	-0.51	0.28	0.47	0.58
Lsat_1_v5_gn_4_170780.1 (ATPQ)	-2.06	-1.4	-1.83	-2.03	0.35	-0.33	-0.3	-1.09	0.36	-0.01	0.3	-0.02	-0.17	1.24	0.69	-0.26	-0.3	1.28	0.13	0.08	-0.49	-0.3	0.06	-0.27	-0.34	-0.02	-0.34	-0.94	0.28	0.51	0.86
Lsat_1_v5_gn_4_32381.1 (MYC5)	-1.95	-1.53	-1.04	-0.39	-0.42	-0.31	-0.27	-0.05	-0.23	-0.18	-0.09	-0.23	0.11	1.18	0.98	-0.06	0.1	1.03	-0.16	-0.31	-0.45	-0.57	-0.86	0.13	-0.26	-0.26	-0.12	-1.03	0.39	0.59	1.16
Lsat_1_v5_gn_4_41620.1 (NPC4)	-1.19	-0.72	-0.66	-0.58	0.16	-0.55	-0.52	-0.47	-0.77	-0.18	0.28	-0.18	-0.3	1.12	0.94	0.18	0.02	1.45	0.25	-0.35	-0.69	-0.35	-1.0	-0.09	-0.27	-0.06	-0.18	-1.02	0.19	0.51	0.63
Lsat_1_v5_gn_4_54361.1 (SNG2)	-1.08	-1.63	-0.9	-0.61	-0.11	-0.39	-0.68	-0.26	0.05	0.07	0.29	-0.03	-0.03	0.74	0.89	0.19	0.1	0.85	-0.08	-0.34	-0.45	-0.6	-1.17	0.05	-0.34	-0.1	-0.07	-0.83	0.3	0.64	1.29
Lsat_1_v5_gn_4_62200.1	-1.05	-0.86	-0.43	-0.65	0.09	-0.15	-0.65	-0.64	-0.16	-0.35	-0.2	-0.4	-0.12	0.96	0.92	0.07	0.05	1.22	0.21	-0.36	-0.43	-0.38	-2.06	0.01	-0.27	-0.2	0.06	-0.85	0.17	0.63	1.13
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Details

Dark gray cells indicate values where the raw expression is zero (cannot be log-transformed). Blue cells indicate samples where the expression of the gene is below average and red cells indicate the gene is expressed above average in the sample. White cells are average.