Heatmap: Cluster_112 (Lactuca sativa (Lsa) Coexpression Clusters (HCCA Algorithm))

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(Values are log₂ transformed ratios of a genes expression in a sample divided by the mean expression level)

Gene	Light: 268 uE m-2 s-1	Light: 202.5 uE m-2 s-1 (Control)	Light: 135 uE m-2 s-1	Light: 67.5 uE m-2 s-1	Photoperiod: L24	Photoperiod: L20D4 (Control)	Photoperiod: L12D12	Photoperiod: L8D16	RBW: 4:1:1 (Control)	RBW: 4:1:0	RBW: 3:1:1	RBW: 3:1:0	Nitrogen: 0%	Nitrogen: 25%	Nitrogen: 50%	Nitrogen: 100% (Control)	Nitrogen: 150%	Phosphorous: 0%	Phosphorous: 25%	Phosphorous: 50%	Phosphorous: 100% (Control)	Phosphorous: 150%	Potassium: 0%	Potassium: 25%	Potassium: 50%	Potassium: 100% (Control)	Potassium: 150%	Temperature: 20°C	Temperature: 25°C (Control)	Temperature: 30°C	Temperature: 35°C
Lsat_1_v5_gn_1_106281.1	-0.68	-0.43	-0.83	-0.45	0.31	0.46	0.25	0.51	-0.32	-0.3	-0.21	-0.43	-0.11	0.71	0.38	-0.02	-0.36	0.06	0.06	-0.34	-0.13	-0.08	0.59	-0.33	-0.14	-0.24	-0.17	-0.49	0.32	0.26	0.52
Lsat_1_v5_gn_1_1681.1 (GRF8)	-0.24	-0.44	-0.55	-0.49	0.25	0.52	0.31	0.45	-0.24	-0.32	-0.19	-0.21	0.44	0.16	0.12	0.26	0.08	-0.5	-0.38	-0.23	-0.05	0.09	0.47	-0.18	-0.02	0.05	0.0	-0.04	0.03	-0.09	0.02
Lsat_1_v5_gn_1_25121.1 (FC1)	-0.86	-0.65	-1.37	-1.29	0.3	0.43	0.01	0.27	-0.55	-0.45	-0.49	-0.45	0.08	0.52	0.39	0.15	-0.1	0.92	0.06	-0.26	-0.28	0.0	0.93	-0.22	-0.15	-0.0	-0.19	-0.29	0.24	0.24	0.25
Lsat_1_v5_gn_1_27241.1 (PPT)	-0.75	-0.69	-0.98	-0.8	0.19	0.25	0.06	0.26	-0.39	-0.3	-0.15	-0.26	0.15	0.83	0.61	0.18	-0.04	0.14	-0.01	-0.08	-0.05	-0.1	0.6	-0.02	-0.18	0.08	-0.1	0.02	-0.03	-0.14	0.1
Lsat_1_v5_gn_1_30880.1	-0.38	-0.03	0.08	0.04	0.17	0.39	0.16	0.51	-0.61	-0.59	-0.44	-0.55	0.22	0.96	0.6	0.25	-0.18	0.43	-0.33	-0.81	-0.52	-0.27	0.82	-0.65	-0.38	-0.42	-0.01	-0.44	0.04	-0.14	-0.11
Lsat_1_v5_gn_1_43380.1 (FBL6)	-1.74	-1.86	-0.78	-0.02	0.58	0.5	0.33	0.17	-0.18	-0.15	-0.1	-0.26	-0.7	0.8	0.7	-0.01	-0.15	0.3	-0.04	-0.27	-0.19	-0.1	0.52	-0.37	-0.25	-0.05	-0.16	-0.4	0.29	0.09	0.43
Lsat_1_v5_gn_1_48120.1	-0.71	-0.79	-0.86	-0.73	0.34	0.34	-0.05	0.05	-0.21	-0.21	-0.12	-0.24	-0.1	0.29	0.38	0.08	-0.06	0.32	0.15	-0.09	-0.07	-0.08	0.83	-0.03	0.01	-0.03	0.05	-0.39	0.17	0.14	0.25
Lsat_1_v5_gn_1_51960.1 (PCRK1)	-0.95	-0.37	-1.08	-1.2	0.78	0.75	0.37	0.5	-0.34	-0.29	-0.22	-0.51	-0.22	0.79	0.92	0.07	-0.37	-0.27	0.07	-0.41	-0.13	-0.08	0.77	-0.58	-0.23	-0.14	-0.2	-0.13	0.14	-0.07	-0.37
Lsat_1_v5_gn_1_52741.1 (LOS4)	-0.31	-0.28	-0.49	-0.61	0.27	0.4	0.22	0.31	-0.4	-0.28	-0.27	-0.24	0.28	0.29	0.11	0.1	-0.05	-0.05	-0.06	-0.16	-0.05	0.05	0.55	-0.23	-0.15	0.07	-0.1	-0.05	0.08	0.05	0.23
Lsat_1_v5_gn_1_56320.1 (CNX7)	-0.4	-0.53	-0.36	-0.66	0.49	0.82	-0.0	0.3	-0.45	-0.18	-0.18	-0.41	0.01	0.7	0.43	-0.07	-0.26	0.2	-0.07	-0.35	-0.23	-0.06	0.44	-0.14	-0.31	-0.04	-0.13	-0.2	-0.07	-0.05	0.36
Lsat_1_v5_gn_1_70641.1	-0.7	-0.44	-0.82	-0.67	0.24	0.09	0.07	0.04	-0.28	-0.28	-0.22	-0.33	0.02	0.44	0.23	-0.12	-0.19	0.9	0.09	-0.35	-0.12	-0.03	0.85	-0.25	-0.07	0.07	0.01	-0.26	0.15	0.13	0.22
Lsat_1_v5_gn_1_8721.1 (HAC8)	-0.19	-0.31	-0.78	-0.76	0.43	0.47	-0.07	0.17	-0.67	-0.68	-0.45	-0.38	0.29	0.81	0.55	0.07	-0.06	0.71	-0.13	-0.28	-0.18	-0.11	0.62	-0.22	-0.2	-0.18	-0.23	-0.13	0.03	-0.17	0.19
Lsat_1_v5_gn_1_9980.1	-0.88	-0.68	-1.63	-1.16	0.38	0.42	0.23	0.41	-0.17	-0.43	-0.27	-0.19	0.25	0.28	0.24	0.13	0.14	-0.21	-0.24	-0.26	-0.09	0.29	0.48	-0.14	0.22	-0.01	0.07	0.15	0.25	0.24	0.13
Lsat_1_v5_gn_2_101660.1	-2.56	-2.46	-2.31	-1.8	0.31	0.56	0.25	0.23	-0.01	-0.11	-0.04	-0.37	-0.72	-0.07	0.14	-0.38	-0.67	0.71	0.2	-0.15	-0.3	-0.17	1.51	-0.07	-0.22	-0.3	-0.19	-1.04	0.55	0.54	1.15
Lsat_1_v5_gn_2_107361.1 (UBP12)	-0.21	-0.21	-0.76	-0.81	0.23	0.31	0.28	0.4	-0.28	-0.29	-0.14	-0.29	0.01	0.39	0.26	-0.02	-0.08	-0.03	0.03	-0.25	-0.13	-0.06	0.58	-0.21	-0.07	-0.1	-0.11	-0.13	0.23	0.18	0.32
Lsat_1_v5_gn_2_65001.1 (GID1B)	-0.1	-0.02	0.14	-0.12	-0.23	0.3	-0.03	0.52	-0.25	-0.3	-0.29	-0.3	0.15	1.29	0.71	-0.29	-0.59	0.02	-0.05	-0.6	-0.55	-0.5	1.09	-0.38	-0.61	-0.66	-0.52	-0.69	-0.13	-0.02	0.24
Lsat_1_v5_gn_2_66660.1	-0.16	-0.15	0.01	0.03	0.29	0.31	0.05	0.22	-0.33	-0.23	-0.27	-0.36	0.22	0.58	0.38	0.03	-0.12	0.26	-0.19	-0.47	-0.35	-0.2	0.34	-0.3	-0.29	-0.11	-0.12	-0.33	0.1	0.06	0.33
Lsat_1_v5_gn_2_78361.1	0.02	-0.36	-0.55	-0.63	0.37	0.54	-0.07	0.19	-0.38	-0.33	-0.42	-0.29	0.2	0.75	0.57	0.02	-0.29	0.55	-0.07	-0.16	-0.3	-0.08	0.62	-0.36	-0.23	-0.2	-0.07	-0.23	-0.19	-0.14	0.11
Lsat_1_v5_gn_2_85181.1 (LSM6A)	-0.28	-0.69	-0.54	-0.41	0.32	0.44	-0.1	-0.07	-0.46	-0.38	-0.4	-0.33	0.37	0.66	0.31	-0.14	-0.16	0.59	-0.21	-0.22	-0.15	-0.02	0.74	-0.14	-0.1	-0.0	-0.12	0.12	0.05	-0.14	0.11
Lsat_1_v5_gn_3_10161.1 (ADNT1)	-0.93	-0.57	-1.07	-0.88	0.43	0.53	0.22	0.39	-0.37	-0.32	-0.32	-0.24	0.31	0.27	0.21	-0.05	-0.03	0.17	0.03	-0.28	-0.2	-0.12	0.86	-0.12	-0.11	-0.13	-0.1	-0.17	0.28	0.16	0.32
Lsat_1_v5_gn_3_131740.1	-0.91	-0.72	-1.12	-1.36	0.04	0.46	0.45	0.62	-0.31	-0.04	-0.09	-0.35	0.18	0.57	0.55	0.14	-0.1	-0.34	-0.09	-0.16	-0.18	-0.07	0.8	-0.04	0.02	-0.14	-0.05	-0.19	-0.09	0.04	0.23
Lsat_1_v5_gn_3_134960.1 (GET3a)	-0.43	-0.35	-0.55	-0.64	0.28	0.47	0.21	0.51	-0.49	-0.2	-0.31	-0.36	0.24	0.39	0.18	-0.19	-0.07	0.41	-0.11	-0.25	-0.15	-0.19	0.67	-0.21	-0.14	0.0	-0.16	-0.08	0.15	0.02	0.2
Lsat_1_v5_gn_3_15981.1	-0.75	-0.61	-0.98	-0.95	-0.18	-0.14	-0.36	-0.48	-0.09	-0.04	-0.12	0.07	0.48	0.65	1.04	0.17	0.19	-0.28	0.02	-0.02	-0.41	-0.28	1.49	-0.04	-0.11	-0.06	-0.11	-0.16	-0.72	-0.52	0.1
Lsat_1_v5_gn_3_26120.1 (LOG8)	-0.42	-0.54	-0.25	-0.32	0.56	0.59	0.08	0.34	-0.37	-0.24	-0.09	-0.17	0.24	0.82	0.48	-0.11	-0.15	-0.28	-0.15	-0.37	-0.36	-0.19	0.54	-0.22	-0.28	-0.12	-0.14	-0.45	-0.06	-0.04	0.3
Lsat_1_v5_gn_3_28520.1	-0.91	-0.96	-1.16	-1.22	-0.26	0.17	0.43	0.37	-0.19	-0.16	-0.05	-0.26	-0.11	0.91	0.84	0.12	0.11	-0.72	0.13	-0.07	-0.17	-0.16	1.01	-0.12	-0.11	-0.18	-0.0	-0.22	-0.12	-0.0	0.24
Lsat_1_v5_gn_3_31340.1	-0.79	-0.71	-1.28	-1.13	0.39	0.58	0.09	0.4	-0.6	-0.45	-0.4	-0.45	0.14	0.66	0.57	0.02	-0.3	0.64	-0.03	-0.31	-0.18	-0.19	0.84	-0.12	-0.13	-0.12	-0.13	-0.15	0.25	0.07	0.23
Lsat_1_v5_gn_3_39660.1	-0.33	-0.09	-0.82	-0.84	0.14	0.35	0.25	0.54	-0.37	-0.44	-0.22	-0.27	0.26	0.35	0.17	0.1	-0.04	0.06	-0.04	-0.26	-0.04	0.08	0.46	-0.31	-0.16	0.04	0.07	0.05	0.01	-0.09	0.32
Lsat_1_v5_gn_3_51481.1 (PBL34)	-0.33	-0.1	-0.78	-0.51	0.67	0.5	-0.15	-0.03	-0.12	-0.21	-0.03	-0.22	-0.36	0.47	0.36	-0.09	-0.47	0.44	-0.07	-0.32	-0.23	-0.15	0.74	-0.26	-0.21	-0.11	-0.03	-0.3	0.28	0.2	0.09
Lsat_1_v5_gn_3_54040.1	-0.62	-0.48	-1.09	-0.91	0.35	0.49	0.22	0.3	-0.4	-0.52	-0.34	-0.53	0.35	0.7	0.6	0.17	0.01	0.61	-0.01	-0.51	-0.23	-0.11	0.74	-0.46	-0.27	-0.13	-0.19	-0.21	0.07	-0.11	0.28
Lsat_1_v5_gn_3_56080.1 (ELM2)	-1.0	-0.85	-0.72	-0.41	0.21	0.36	0.13	-0.1	-0.2	-0.23	0.0	-0.2	0.02	0.51	0.14	-0.12	-0.14	0.27	0.06	-0.17	-0.19	-0.41	0.95	-0.29	-0.19	-0.16	0.08	-0.3	0.41	0.39	0.45
Lsat_1_v5_gn_3_7200.1 (YDA)	-0.57	-1.07	-0.37	0.01	0.16	0.02	-0.14	-0.1	-0.18	-0.05	0.06	-0.07	-0.05	0.67	0.56	0.07	-0.08	-0.27	0.02	-0.12	-0.17	-0.06	0.45	-0.21	-0.27	-0.03	-0.1	-0.41	0.26	0.22	0.61
Lsat_1_v5_gn_3_97520.1 (RPK2)	-0.62	-0.93	-0.3	0.13	0.33	0.15	-0.11	-0.1	-0.05	-0.05	-0.08	-0.15	-0.48	0.64	0.56	0.1	-0.12	-0.25	0.01	-0.21	-0.13	-0.1	0.29	-0.16	-0.15	0.02	0.02	-0.19	0.3	0.23	0.36
Lsat_1_v5_gn_4_110360.1 (ELM2)	-1.05	-0.98	-0.72	-0.31	0.4	0.62	0.13	0.17	-0.31	-0.34	-0.15	-0.27	-0.59	0.69	0.47	0.08	-0.23	0.22	0.08	-0.32	-0.19	-0.04	0.57	-0.26	-0.12	-0.14	0.01	-0.39	0.29	0.23	0.53
Lsat_1_v5_gn_4_110741.1	-0.29	-0.32	-0.49	-0.59	0.08	0.36	0.08	0.48	-0.3	-0.35	-0.06	-0.24	0.38	0.65	0.38	-0.01	-0.05	-0.02	-0.17	-0.34	-0.26	-0.21	0.67	-0.18	-0.31	-0.13	-0.13	-0.16	-0.08	0.04	0.4
Lsat_1_v5_gn_4_155300.1	-0.74	-0.73	-0.47	-0.32	0.29	0.19	0.16	0.25	-0.32	-0.22	-0.12	-0.09	-0.27	0.66	0.43	0.15	0.06	0.21	-0.32	-0.32	-0.18	-0.09	0.44	-0.12	-0.06	-0.02	-0.02	-0.2	0.14	0.12	0.4
Lsat_1_v5_gn_4_158780.1 (WAVH2)	-2.78	-2.14	-1.92	-1.61	0.02	0.43	0.08	-0.27	-0.21	-0.2	-0.14	-0.35	-0.21	0.49	0.65	0.01	-0.06	0.77	0.28	-0.12	0.07	-0.17	1.14	-0.57	-0.1	-0.03	-0.03	-0.63	0.7	0.44	0.46
Lsat_1_v5_gn_4_34561.1 (BPS1)	-0.17	-0.39	-0.43	-0.55	0.39	0.5	0.17	0.24	-0.19	-0.31	-0.07	-0.24	-0.02	0.5	0.43	0.14	0.02	-0.39	-0.1	-0.28	-0.15	-0.09	0.5	-0.09	-0.14	-0.02	-0.09	-0.17	-0.01	0.06	0.08
Lsat_1_v5_gn_4_50621.1	-0.44	-0.24	-0.78	-0.86	0.11	0.21	0.28	0.32	-0.28	-0.31	-0.25	-0.39	0.01	0.67	0.52	0.03	-0.01	0.12	0.32	-0.1	-0.22	-0.09	0.79	-0.13	-0.12	-0.2	-0.06	-0.27	0.01	-0.09	0.1
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Details

Dark gray cells indicate values where the raw expression is zero (cannot be log-transformed). Blue cells indicate samples where the expression of the gene is below average and red cells indicate the gene is expressed above average in the sample. White cells are average.