Heatmap: Cluster_69 (Lactuca sativa (Lsa) Coexpression Clusters (HCCA Algorithm))

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(Values are log2 transformed ratios of a genes expression in a sample divided by the mean expression level)

Gene
Light: 268 uE m-2 s-1
Light: 202.5 uE m-2 s-1 (Control)
Light: 135 uE m-2 s-1
Light: 67.5 uE m-2 s-1
Photoperiod: L24
Photoperiod: L20D4 (Control)
Photoperiod: L12D12
Photoperiod: L8D16
RBW: 4:1:1 (Control)
RBW: 4:1:0
RBW: 3:1:1
RBW: 3:1:0
Nitrogen: 0%
Nitrogen: 25%
Nitrogen: 50%
Nitrogen: 100% (Control)
Nitrogen: 150%
Phosphorous: 0%
Phosphorous: 25%
Phosphorous: 50%
Phosphorous: 100% (Control)
Phosphorous: 150%
Potassium: 0%
Potassium: 25%
Potassium: 50%
Potassium: 100% (Control)
Potassium: 150%
Temperature: 20°C
Temperature: 25°C (Control)
Temperature: 30°C
Temperature: 35°C
-1.48 -1.53 -1.03 -0.39 0.25 0.01 -0.79 -1.64 -0.04 -0.12 0.05 -0.06 -0.03 1.43 1.15 0.36 0.15 0.09 0.39 -0.08 -0.14 -0.18 -0.99 -0.29 -0.24 -0.29 -0.07 -0.5 0.11 0.09 0.9
-3.3 -4.32 -4.21 -4.51 0.46 0.32 -1.94 -1.7 -1.52 -1.84 -1.69 -2.06 -0.21 3.11 2.14 -0.8 -1.13 1.57 0.07 -1.24 -1.22 -1.18 0.24 -1.5 -1.11 -1.19 -1.0 -1.44 -0.27 -0.66 0.47
-0.56 -0.24 -0.04 -0.82 0.58 1.01 -0.12 0.18 -0.65 -0.75 -0.09 -0.93 -0.89 2.2 0.86 -0.1 -0.62 -0.61 0.28 -0.87 -0.46 0.0 -0.1 -0.58 -0.29 -0.21 0.05 -0.08 -0.2 -1.18 -1.28
-3.44 -1.83 -2.36 -2.43 0.08 0.1 -0.79 -0.18 -0.48 -0.66 -0.61 -0.71 -1.94 2.78 1.98 -0.61 -1.19 0.12 0.55 -0.6 -0.92 -0.38 -3.26 -0.64 -0.5 -0.81 -0.24 -1.13 0.6 0.19 0.49
- - - - -2.04 -0.59 -3.18 -2.01 -3.22 - -3.06 - -2.53 3.66 2.59 -0.11 -1.77 1.65 0.59 -1.94 -1.94 -3.01 - -1.85 - -1.99 -0.76 -1.16 0.03 -1.57 0.35
-0.56 -0.46 -0.66 -0.9 0.17 0.13 -0.63 -0.69 -0.11 -0.04 0.02 -0.21 -0.02 1.49 1.05 0.2 -0.19 0.48 -0.12 -0.6 -0.53 -0.37 0.35 -0.47 -0.62 -0.19 -0.29 -0.75 0.29 0.33 0.5
-0.38 -1.47 -2.11 -2.71 -0.8 0.68 0.49 0.48 -2.04 -2.66 -2.56 -2.85 -0.42 2.65 2.24 0.73 0.69 -2.4 -0.13 -1.14 -1.09 -1.01 -1.38 -1.58 -1.44 -0.74 -1.14 -0.12 0.52 0.16 -0.61
-1.6 -1.32 -2.73 -2.62 0.66 0.73 -0.36 -0.16 -1.1 -1.04 -0.17 -0.63 -0.77 2.83 1.28 -0.11 -0.27 -1.71 0.87 -0.5 -0.21 0.07 -4.22 -0.33 -0.66 -0.26 0.11 -1.0 -0.28 -0.81 -0.65
-0.55 -0.33 -0.69 -0.97 0.41 0.35 -0.35 -0.49 -0.35 -0.15 0.01 -0.24 -0.48 1.6 1.12 -0.02 -0.19 0.92 0.13 -0.64 -0.59 -0.68 0.2 -0.84 -0.63 -0.56 -0.26 -0.67 0.2 0.2 0.31
-0.21 0.24 -0.04 -0.55 0.14 0.26 -0.96 -0.47 -0.75 -0.62 -0.54 -0.29 -0.91 2.41 0.82 -0.72 -0.86 1.08 1.8 -1.07 -1.05 -1.42 -0.07 -1.11 -1.43 -1.17 -1.16 -1.12 -0.13 -0.77 -0.6
-1.57 -1.35 -2.38 -2.87 1.0 0.87 -0.82 -0.78 -0.55 -1.2 -1.21 -1.01 0.19 2.2 1.66 0.12 0.13 0.47 0.1 -0.6 -0.5 -0.7 -0.11 -0.09 -0.46 -0.54 -0.46 -1.02 -0.3 -0.38 0.41
-1.18 -0.89 -0.62 -0.2 0.18 0.13 -0.3 -0.24 -0.13 -0.02 -0.04 -0.02 0.27 1.35 0.86 0.14 0.16 0.15 -0.49 -0.33 -0.38 -0.24 -0.72 -0.35 -0.33 -0.19 -0.14 -0.34 0.26 0.24 0.69
-2.63 -2.64 - - -1.77 -0.43 -3.87 -2.31 -1.28 -2.92 -1.95 - -2.96 4.38 1.2 - -2.24 0.07 -1.3 - -2.19 -1.74 -1.88 -0.61 -4.07 -1.19 -0.84 -2.38 -2.32 -3.07 -0.69
-0.67 -0.59 -0.37 -0.48 -0.17 -0.04 0.06 -0.01 -0.25 -0.23 -0.08 -0.1 -0.41 1.51 0.95 0.36 0.16 -0.08 -0.12 -0.12 -0.05 0.0 -0.12 -0.26 -0.24 -0.02 0.0 -0.23 -0.23 -0.25 -0.12
-2.23 -0.78 -0.77 -0.66 0.16 -0.18 -0.21 -0.25 -0.17 0.05 -0.12 -0.45 -0.64 1.9 1.53 0.15 -0.09 0.01 0.07 -0.17 -0.72 -0.08 -4.89 -0.91 -0.38 -0.48 -0.43 -1.07 0.39 0.2 1.11
-2.5 -2.5 -2.32 -1.89 -0.93 -0.05 0.25 0.73 -0.56 -0.3 -0.48 -0.58 -0.24 2.22 1.66 0.12 0.08 -1.84 0.66 0.0 -0.32 -0.3 -4.33 0.19 -0.06 -0.2 -0.06 -0.12 -0.24 -0.5 0.28
-0.77 -0.5 -0.11 0.04 -0.72 -0.27 -0.26 -0.19 -0.56 -0.29 -0.65 -0.47 -0.14 2.16 1.32 -0.57 -0.36 0.04 0.53 -0.37 -0.42 -0.37 0.72 -0.63 -0.55 -0.54 -0.55 -0.25 -0.39 -0.7 0.14
-1.3 -0.75 -1.09 -1.33 0.55 0.31 -0.2 0.19 -0.35 -0.35 -0.22 -0.49 -1.31 1.83 1.46 0.02 -0.29 -0.17 0.67 -0.13 -0.22 -0.09 -4.51 -0.15 -0.37 -0.36 -0.17 -0.29 0.44 0.09 -0.12
-0.57 -0.69 0.03 -0.3 -0.12 0.42 0.05 0.41 -0.5 -0.4 -0.34 -0.52 -0.74 2.15 1.33 0.11 -0.29 0.19 0.27 -0.72 -0.64 -0.59 0.27 -0.75 -0.83 -0.85 -0.83 -0.69 -0.12 -0.43 -0.29
-2.1 -1.87 -2.12 -1.47 0.44 -0.36 -0.54 -0.7 -0.42 -0.25 -0.53 -0.36 -0.63 2.09 2.07 -0.31 -0.32 1.09 0.6 0.13 -0.59 -0.61 -2.07 -0.83 -0.97 -0.95 -0.93 -0.6 0.23 -0.04 0.57
-0.81 -0.75 -0.44 -0.5 0.13 0.04 -0.49 -0.31 -0.14 -0.37 -0.35 -0.16 -0.06 1.5 0.86 0.13 -0.23 0.36 0.01 -0.28 -0.48 -0.35 0.23 -0.38 -0.48 -0.24 -0.28 -0.58 0.34 0.28 0.81
-0.7 -0.75 -1.05 -1.04 0.49 0.53 -0.35 -0.39 -0.89 -0.91 -0.92 -0.82 -0.38 2.11 1.48 -0.1 -0.42 0.55 0.32 -0.62 -0.47 -0.6 0.24 -0.52 -0.71 -0.32 -0.39 -0.68 0.13 0.1 0.14
-1.36 -1.54 -0.55 -0.37 0.18 0.66 -0.29 -0.77 -0.59 -0.27 -0.22 -0.32 -0.82 2.22 1.5 -0.01 -0.17 -1.81 0.57 -0.31 -0.2 -0.02 -1.51 -0.46 -0.49 -0.12 0.05 -0.13 -0.07 -0.54 -0.21
- -1.99 - -2.83 0.04 -0.64 -1.35 -1.6 -2.31 -2.61 -0.08 -1.31 -0.3 3.36 2.08 -0.99 -0.96 -3.22 -0.26 -0.75 -1.39 -1.34 0.6 -1.94 -2.4 -1.4 -0.9 -3.17 -0.13 -0.19 1.63
-0.22 -0.22 0.0 -0.44 0.44 0.25 -0.3 -0.38 -0.33 -0.48 -0.21 -0.31 0.17 1.1 0.75 0.02 0.04 -0.43 0.06 -0.39 -0.19 -0.14 -0.11 -0.2 -0.23 -0.19 -0.18 -0.0 0.16 0.21 0.29
-0.4 -0.69 -6.05 -3.54 -0.96 -0.83 -0.97 -1.84 0.09 -0.04 0.38 0.15 -1.87 2.81 2.38 0.15 0.18 - 0.18 -0.01 -0.12 -0.6 -5.47 -1.36 -1.44 -1.23 -0.55 -1.45 -1.22 -0.19 0.25
-1.26 -1.68 -1.29 -1.86 0.28 0.42 -0.4 -0.92 -0.48 -0.69 -0.56 -0.54 -0.12 1.92 1.41 -0.15 0.04 0.14 -0.25 -0.35 0.02 -0.38 -0.04 -0.22 -0.17 -0.17 0.11 -0.27 0.22 0.12 0.56
-3.49 -2.68 -3.14 -2.53 0.79 0.73 -0.63 -0.29 -0.84 -0.93 -0.77 -1.13 -0.55 2.4 1.95 0.22 -0.06 -1.07 0.57 -0.16 -0.59 -0.35 -4.78 -0.31 -0.58 -0.41 -0.35 -0.9 0.15 -0.28 0.76
-1.64 -1.21 -1.64 -1.6 0.79 0.81 -0.36 -0.66 -0.55 -0.27 -0.06 -0.67 -1.4 1.99 1.4 0.29 0.06 -0.3 0.57 -0.11 0.1 -0.15 -0.9 -0.32 -0.48 -0.46 -0.58 -0.65 0.45 -0.16 -0.3
-1.99 -1.79 -2.03 -2.43 -0.91 -0.53 -1.58 -1.48 -1.72 -1.76 -1.62 -1.78 -1.47 3.62 2.53 -1.11 -1.43 -2.1 0.96 -1.36 -1.45 -1.38 -4.59 -1.22 -1.51 -1.4 -1.42 -1.67 -0.01 -0.98 -0.08
-1.44 -0.9 -1.63 -1.0 -0.09 0.3 -0.79 -0.6 -1.48 -1.28 -0.82 -1.03 -0.58 2.83 2.25 -0.2 -0.51 -0.07 0.41 -0.93 -1.1 -0.96 -0.03 -0.97 -1.04 -0.92 -0.91 -1.25 0.1 -0.41 -0.23
-6.24 -5.57 -6.05 -6.23 -0.77 -1.31 -4.58 -5.17 -3.01 -2.79 -2.74 -2.88 -2.82 4.09 2.76 -1.88 -2.68 -2.15 0.64 -2.24 -3.0 -2.76 -7.08 -2.64 -3.31 -3.17 -2.78 -3.96 -0.56 -1.8 0.08
-0.31 -0.31 -0.57 0.34 -0.46 -0.22 -0.61 0.8 -2.61 -1.59 -2.03 -1.98 -1.06 2.73 1.62 -1.0 -1.42 0.57 0.31 -1.26 -1.38 -1.0 0.49 -1.74 -0.79 -1.69 -1.11 -1.2 0.84 0.16 -0.02
- - - - -1.41 -0.18 -1.17 - - - - - 1.18 3.78 1.22 - - 1.77 - - - - 1.97 - - - - - - 0.57 1.13
-0.66 -0.85 -0.06 -0.02 -0.13 -0.03 -0.7 -0.48 -0.3 -0.22 -0.27 -0.2 -0.02 1.36 0.88 0.13 -0.12 0.32 0.11 -0.44 -0.28 -0.24 0.15 -0.21 -0.1 -0.25 -0.31 -0.28 0.01 0.14 0.71
-0.79 -0.55 -0.68 -0.8 -0.02 0.33 0.33 0.15 -0.32 -0.29 -0.32 -0.39 -0.01 1.68 1.0 0.16 0.0 -1.4 0.16 -0.25 -0.19 -0.07 0.01 -0.32 -0.22 -0.06 -0.08 -0.26 -0.02 -0.2 0.01
-0.7 -1.22 -0.49 -0.76 0.5 0.62 -0.56 -0.92 -1.09 -1.04 -0.65 -0.87 -0.56 2.48 1.71 -0.15 -0.21 -0.64 0.47 -0.68 -0.31 -0.21 -1.29 -0.6 -0.67 -0.48 -0.46 -0.51 0.2 -0.48 0.02
-1.94 -1.84 -3.91 -4.1 0.7 0.89 0.13 -0.09 -1.47 -1.56 -1.48 -1.57 -0.62 2.48 1.96 -0.64 -1.09 1.28 0.66 -0.9 -0.73 -0.42 0.43 -0.53 -0.99 -0.72 -0.65 -0.47 -0.38 -1.35 -0.69
-0.78 -1.45 -2.14 -1.95 -0.08 -0.51 -0.68 -0.28 -0.89 -1.09 -0.82 -1.04 -0.56 2.26 1.92 -0.78 -0.54 0.75 1.03 -0.16 -0.54 -0.48 0.01 -0.09 -0.37 -0.44 -0.51 -0.83 0.55 0.05 -0.67
-0.4 -0.26 -0.69 -0.61 0.06 0.73 0.1 0.7 -0.42 -0.58 -0.33 -0.75 -0.55 2.09 1.08 -0.14 -0.77 -1.2 0.05 -0.6 -0.24 -0.18 0.35 -0.35 -0.56 -0.6 -0.2 -0.89 -0.04 -0.47 -0.0
-1.37 -4.42 -5.43 -6.48 -0.58 -2.76 -3.4 -4.3 -1.55 -2.01 -1.5 -1.65 -2.22 3.13 2.73 -1.95 -1.57 1.22 1.25 -0.62 -1.17 -1.48 -0.96 -0.26 -1.1 -1.16 -1.11 -1.84 0.5 0.11 -1.12
-0.38 -1.15 -0.17 0.21 -0.23 0.11 -0.61 -0.87 -0.56 -0.55 -0.37 -0.47 -0.34 1.77 1.22 0.35 0.14 0.72 0.05 -0.38 -0.22 0.03 -0.68 -0.63 -0.3 0.03 -0.03 0.01 -0.32 -0.42 -0.21
1.49 1.46 -0.04 -1.19 -1.74 -2.27 -1.73 -1.99 -2.11 -1.73 -2.01 -0.82 0.35 3.09 0.91 0.53 0.47 0.07 -1.24 -1.38 -1.94 -0.9 -2.02 -1.74 -1.06 -0.58 -0.88 -1.18 -0.84 -1.29 -0.24
-1.19 -0.9 -1.79 -2.07 -0.27 0.43 0.52 0.77 -1.09 -1.11 -0.72 -1.07 -0.11 2.68 1.37 0.0 -0.54 -0.83 0.04 -0.55 -0.43 -0.34 -0.41 -0.29 -0.31 -0.25 -0.34 -0.85 -0.3 -0.58 -0.45
-2.08 -1.62 -3.57 -4.58 0.71 1.18 -0.37 0.24 -2.16 -2.42 -2.03 -2.53 -0.29 2.55 1.95 -0.49 -1.1 0.92 0.72 -0.93 -1.02 -1.1 0.71 -0.55 -0.88 -1.21 -0.92 -1.53 0.35 -0.47 -0.45
-0.97 -1.97 -1.99 -3.73 -2.54 -1.14 -3.39 -4.59 -4.43 -4.52 -2.96 -4.69 -2.2 4.46 1.11 -2.09 -2.85 -2.91 -1.02 -3.43 -2.09 -2.66 -5.33 -3.71 -2.47 -3.1 -2.47 -1.43 0.22 -0.92 -1.26
-0.88 -3.32 -4.89 -6.44 -0.33 -2.8 -3.11 -4.0 -1.65 -2.17 -1.57 -1.73 -2.2 3.14 2.66 -2.11 -1.56 1.24 1.35 -0.56 -1.08 -1.41 -1.98 -0.25 -1.08 -0.97 -1.23 -2.07 0.42 0.13 -0.94
-1.82 -2.23 -1.59 -2.35 -0.1 1.02 -0.72 -0.41 -2.65 -3.38 -2.14 -2.98 0.11 2.92 1.8 -0.96 -1.14 1.23 -1.56 -1.64 -2.07 -2.23 0.86 -1.75 -1.11 -0.97 -0.98 -1.5 0.48 -0.17 1.18
-1.98 -1.67 -2.64 -2.77 0.38 1.33 -0.02 0.38 -2.18 -3.59 -2.14 -3.5 -0.03 2.91 2.27 0.77 0.31 -0.52 -0.5 -1.66 -1.43 -0.89 -2.46 -1.11 -3.06 -1.35 -1.12 -0.38 -0.52 -0.05 -1.19
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-0.68 0.0 -0.49 -0.35 0.22 -0.01 -1.04 -0.77 -0.5 -0.31 -0.32 -0.24 0.13 1.65 0.98 0.26 0.07 -0.53 0.24 0.03 -0.1 -0.09 -1.07 -0.2 -0.25 0.06 -0.07 -0.47 -0.05 0.04 0.45
-1.02 -0.88 -0.91 -0.26 -0.07 -0.35 0.05 -0.18 -0.08 -0.29 -0.24 -0.18 -0.38 2.07 1.48 0.25 0.19 -2.73 0.06 -0.08 0.03 -0.01 -5.72 -0.35 -0.24 -0.1 -0.33 -0.66 0.25 -0.2 0.16
-0.93 -1.38 -1.3 -1.33 0.44 0.36 -0.85 -1.48 -0.54 -0.68 -0.5 -1.22 -1.76 2.35 1.86 -0.13 -0.85 0.52 0.71 -0.48 -0.57 -0.5 0.02 -0.83 -0.98 -0.83 -0.59 -1.41 0.69 0.2 0.22
-2.55 -2.59 -2.71 -1.81 0.47 0.02 -0.82 -0.65 -0.31 -0.57 0.01 -0.56 0.14 1.87 1.41 -0.58 -0.32 0.43 0.39 -0.32 -0.71 -0.02 -0.41 -0.11 0.0 -0.43 -0.46 -0.66 0.13 0.1 1.35
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-0.54 -0.78 - -2.78 -2.55 0.44 -2.01 -4.26 - -2.66 -1.03 -4.15 -0.15 3.54 2.03 -0.85 -0.81 -3.24 -0.33 -2.3 -1.55 0.26 -0.15 -3.23 -1.18 -1.82 -4.0 -1.86 0.92 0.25 0.58
-1.44 -1.39 -1.09 -1.01 0.66 0.66 -1.16 -1.02 -1.27 -0.76 -0.67 -1.19 -1.13 2.12 1.36 -0.04 -0.91 1.31 0.46 -1.11 -0.71 -0.74 0.06 -0.75 -0.99 -0.77 -0.38 -1.63 0.79 0.45 0.84
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- - - - 1.06 -0.08 - -0.9 - -0.48 -1.36 -1.39 -0.72 3.94 0.93 - - -0.88 2.01 - 0.59 - -1.38 -1.43 -1.44 - -2.23 -0.54 - - -
-2.19 -1.62 -1.72 -2.24 0.4 0.46 -0.78 -0.82 -0.7 -1.19 -0.77 -1.39 0.3 2.03 1.4 -0.21 -0.49 0.96 0.42 -0.42 -0.75 -0.3 -0.71 -0.28 -0.44 -0.57 -0.09 -1.32 0.42 0.46 1.14
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- - - - 1.15 0.46 -2.52 - -2.51 - - - -1.57 4.16 2.22 - - 0.04 -2.87 - - -1.12 0.1 - -1.64 - - - - - 0.17
-1.4 -2.75 -1.43 -1.81 0.31 0.63 -1.38 -4.17 -0.17 -0.41 0.18 0.03 -1.25 3.05 0.92 -1.48 -1.63 0.74 -0.82 -2.6 -2.11 -1.7 1.14 -0.25 -1.5 -0.21 -1.42 -1.91 -0.69 -0.26 1.16
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-1.42 -2.45 -1.14 -1.5 0.88 0.58 -1.73 -2.56 -1.58 -0.78 -1.3 -1.07 0.07 2.48 1.4 0.06 -0.33 1.22 -1.22 -1.27 -1.13 -0.84 0.94 -1.01 -0.23 -0.75 -0.7 -0.71 0.05 0.03 0.65
- - - - -2.04 -0.59 -3.18 -2.01 -3.22 - -3.06 - -2.53 3.66 2.59 -0.11 -1.77 1.65 0.59 -1.94 -1.94 -3.01 - -1.85 - -1.99 -0.76 -1.16 0.03 -1.57 0.35
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- -1.27 -0.96 - -2.69 -0.97 -1.96 -2.66 -4.73 - - - -4.54 4.47 1.89 -4.48 -2.08 -2.22 0.25 -4.83 - -3.03 -3.15 -4.65 -3.69 -3.04 -3.48 -3.29 -3.52 -2.64 -1.5
- -1.68 - - -2.17 -2.74 -2.7 -0.54 -3.77 -2.76 -1.01 -1.19 -2.05 4.06 2.15 -3.23 -1.01 1.18 -2.81 -0.09 -2.23 -1.5 0.07 - - -2.19 -0.93 - -3.67 - -0.85

Details

Dark gray cells indicate values where the raw expression is zero (cannot be log-transformed). Blue cells indicate samples where the expression of the gene is below average and red cells indicate the gene is expressed above average in the sample. White cells are average.