1. Home
  2. Tools
  3. Expression Heatmap
  4. Results

Heatmap: Cluster_187 (Lactuca sativa (Lsa) Coexpression Clusters (HCCA Algorithm))

View as: (view zlog-transformed or row-normalized)

View using InCHLib : here ( Experimental feature, still under development)

(Showing raw values)

 Transpose table  Download table
Gene
Light: 268 uE m-2 s-1
Light: 202.5 uE m-2 s-1 (Control)
Light: 135 uE m-2 s-1
Light: 67.5 uE m-2 s-1
Photoperiod: L24
Photoperiod: L20D4 (Control)
Photoperiod: L12D12
Photoperiod: L8D16
RBW: 4:1:1 (Control)
RBW: 4:1:0
RBW: 3:1:1
RBW: 3:1:0
Nitrogen: 0%
Nitrogen: 25%
Nitrogen: 50%
Nitrogen: 100% (Control)
Nitrogen: 150%
Phosphorous: 0%
Phosphorous: 25%
Phosphorous: 50%
Phosphorous: 100% (Control)
Phosphorous: 150%
Potassium: 0%
Potassium: 25%
Potassium: 50%
Potassium: 100% (Control)
Potassium: 150%
Temperature: 20°C
Temperature: 25°C (Control)
Temperature: 30°C
Temperature: 35°C
0.0 0.04 0.0 0.22 0.2 0.11 0.09 0.08 0.07 0.08 0.09 0.11 0.04 0.0 0.08 0.04 0.08 0.1 0.03 0.1 0.07 0.04 0.19 0.07 0.26 0.09 0.22 0.42 0.03 0.11 0.09
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.37 0.4 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.36 0.0 0.0 0.0 0.0 0.48 0.0 0.0 0.0 0.0 0.44 0.0
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.03 0.03 0.03 0.0 0.0 0.01 0.03 0.0 0.09 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.05 0.0 0.0 0.0 0.0 0.06 0.0 0.03 0.0 0.03 0.06
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.1 0.0 0.0 0.0 0.0 0.12 0.0 0.0 0.32 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.01 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
2.52 2.59 0.0 0.0 2.17 3.7 2.31 2.16 1.74 4.72 1.38 3.91 1.37 0.37 1.14 4.99 5.8 1.23 1.43 2.3 0.64 2.96 2.0 2.71 7.77 5.79 3.48 1.06 2.12 4.98 3.11
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.11 0.0 0.0 0.0 0.0 0.05
0.03 0.02 0.07 0.07 0.05 0.04 0.01 0.07 0.04 0.0 0.0 0.03 0.01 0.02 0.01 0.0 0.0 0.02 0.03 0.0 0.0 0.0 0.0 0.02 0.01 0.07 0.0 0.01 0.0 0.04 0.06
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.01 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.03 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.0 0.04 0.0 0.04 0.0 0.0 0.0 0.0 0.03 0.0 0.0 0.03 0.0 0.0 0.04 0.04 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.19 0.1 0.0 0.0 0.0 0.08 0.13
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.01 0.0 0.0 0.0 0.0 0.1 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.19 0.0 0.12 0.1 0.0 0.34 0.0 0.0 0.13 0.24 0.1
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.02 0.02 0.0 0.0 0.0 0.0 0.01 0.0 0.0 0.0 0.01 0.0 0.0 0.0 0.03 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.07 0.05 0.31 0.15 0.13 0.13 0.2 0.2 0.15 0.27 0.21 0.36 0.25 0.16 0.21 0.15 0.34 0.26 0.43 0.29 0.5 0.2 0.0 0.16 0.32 0.12 0.19 0.16 0.08 0.2 0.41
0.0 0.36 0.0 0.0 0.0 0.8 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.3 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.34 0.0 0.0 0.31 0.0 0.0 0.0 0.31 0.93 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.04 0.0 0.0 0.03 0.0 0.0 0.01 0.0 0.0 0.06 0.0 0.04 0.04 0.0 0.0 0.05 0.04 0.0 0.0 0.01 0.0 0.02 0.0 0.0 0.0 0.01 0.0 0.0 0.0 0.05 0.08
0.15 0.41 0.38 0.24 0.16 0.11 0.24 0.27 0.22 0.17 0.24 0.19 0.45 0.19 0.2 0.4 0.2 0.19 0.41 0.25 0.31 0.37 0.17 0.32 0.41 0.12 0.37 0.27 0.42 0.32 0.58
0.16 0.0 0.0 0.0 0.0 0.04 0.0 0.25 0.09 0.0 0.38 0.09 0.0 0.1 0.0 0.0 0.09 0.0 0.07 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.3 0.0 0.0 0.04 0.0 0.0 0.0
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.01 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.01 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.02 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.04 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.03 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.56 0.0 1.31 0.41 0.87 0.3 0.39 0.0 0.35 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.75 1.34 0.0 4.9 0.0 0.0 2.05 0.59 0.5 0.44 0.0 3.35 0.0 0.0 0.46 1.38 1.82
0.0 0.0 0.0 0.03 0.0 0.0 0.04 0.0 0.0 0.0 0.0 0.01 0.03 0.02 0.01 0.03 0.05 0.02 0.05 0.03 0.0 0.03 0.0 0.01 0.06 0.01 0.05 0.01 0.05 0.01 0.04
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.0 0.21 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.2 0.4 0.39 0.0 0.0 0.2 0.7 0.0 0.26 0.63 2.1 0.0 0.0 0.37 0.0 0.0 0.0 0.2 1.04 0.23 0.42 0.0 0.0 0.0
0.67 0.1 1.4 0.18 0.33 0.51 0.44 0.0 0.36 0.6 0.93 0.41 0.77 0.49 0.2 0.33 0.89 0.47 0.15 0.22 0.98 0.35 0.96 0.93 0.16 0.56 0.64 0.31 0.75 0.38 1.17
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.01 0.04 0.0 0.0 0.01 0.0 0.02 0.04 0.01 0.0 0.01 0.0 0.01 0.0 0.03 0.01 0.0 0.05 0.02 0.02 0.0 0.06 0.0 0.0 0.02
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.02 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.03 0.0 0.03 0.0 0.0 0.0
0.0 0.0 0.0 0.0 0.05 0.0 0.0 0.02 0.0 0.0 0.0 0.02 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.05 0.0 0.0 0.0 0.02 0.04 0.0 0.0 0.07 0.0 0.0 0.02 0.0 0.05
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 1.46 0.68 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 1.36 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.02 0.02 0.0 0.01 0.04 0.0 0.0 0.03 0.0 0.0 0.0 0.02 0.0 0.0 0.01 0.0 0.0 0.0 0.0 0.09 0.05 0.05 0.06 0.03 0.05 0.03
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.02 0.0 0.0 0.0 0.02 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.02 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.0 0.0 0.01 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.01 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.3 0.17 0.34 0.08 0.35 0.33 0.13 0.07 0.14 0.39 0.11 0.11 0.29 0.33 0.08 0.17 0.07 0.28 0.11 0.35 0.03 0.33 0.14 0.34 0.1 0.21 0.16 0.15 0.14 0.35 0.27
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.02 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.03 0.0 0.0 0.0 0.0 0.03 0.01
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.01 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.0 0.0 0.06 0.0 0.05 0.05 0.05 0.0 0.0 0.0 0.1 0.0 0.0 0.0 0.0 0.06 0.06 0.05 0.0 0.0 0.0 0.1 0.0 0.0 0.0 0.24 0.04 0.0 0.0 0.0 0.16
0.04 0.0 0.02 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.04 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.0 0.0 0.0 0.0 0.97 0.13 0.0 0.15 0.0 0.0 0.65 0.0 0.0 0.15 0.0 0.0 0.0 1.07 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 1.78 0.0 0.39 0.3 0.0 0.43
0.05 0.0 0.0 0.13 0.41 0.03 0.0 0.21 0.0 0.08 0.04 0.0 0.08 0.04 0.38 0.0 0.07 0.29 0.08 0.1 0.0 0.0 0.07 0.1 0.11 0.13 0.12 0.23 0.0 0.14 0.18
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.12 0.1 0.0 0.0 0.11 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.14 0.0 0.0 0.0 0.0 0.49 0.73 0.11 0.0 0.0 0.0 0.21 0.0
0.09 0.0 0.0 0.0 0.07 0.08 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.09 0.0 0.0 0.0 0.21 0.07 0.14 0.21 0.0 0.0 0.0 0.0 0.51 0.0 0.0 0.0 0.08 0.15
0.59 0.81 0.08 0.72 0.11 0.19 0.22 0.42 0.31 0.3 0.68 0.25 0.66 0.32 0.74 0.67 1.1 0.0 0.18 0.52 0.35 0.59 0.16 0.37 0.2 0.96 0.21 0.43 0.2 0.71 0.32
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.02 0.0 0.0 0.0 0.0 0.11 0.0 0.0 0.02 0.0 0.1 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.08 0.0 0.15 0.0 0.04 0.0 0.0 0.03
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.11 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.0 0.05 0.05 0.0 0.0 0.0 0.04 0.08 0.0 0.48 0.0 0.0 0.19 0.0 0.0 0.26 0.04 0.16 0.0 0.08 0.12 0.0 0.0 0.24 0.67 0.17 0.0 0.08 0.0 0.12 0.22
0.0 2.13 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 2.15 0.0 0.0 0.0 0.0 0.52 0.0 0.43 2.11 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.0 0.0 0.02 0.07 0.15 0.2 0.08 0.13 0.07 0.02 0.02 0.0 0.0 0.12 0.02 0.07 0.11 0.03 0.0 0.0 0.02 0.0 0.0 0.07 0.07 0.11 0.0 0.0 0.11 0.02 0.0
0.0 0.0 0.11 0.0 0.0 0.0 0.09 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.1 0.0 0.0 0.0 0.09 0.0 0.0 0.0 0.0 0.1 0.0 0.0 0.0 0.0 0.1
0.0 0.0 0.0 0.0 0.34 0.67 0.0 0.0 1.04 0.0 3.47 0.0 0.0 0.0 0.45 0.0 0.0 1.92 1.24 0.0 0.0 0.0 0.5 0.0 2.02 2.33 0.0 0.0 1.45 1.25 0.6
0.0 0.18 0.76 0.18 1.15 0.28 1.34 0.15 0.98 2.07 0.39 2.03 2.04 0.0 2.09 1.61 1.79 1.24 1.0 0.67 0.82 0.0 1.31 0.34 3.0 0.58 0.0 0.94 1.58 0.84 2.0
0.0 0.0 0.0 0.0 0.01 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.01 0.0 0.01 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.01 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
7.65 7.82 7.25 1.55 8.51 15.11 11.71 12.02 3.81 4.16 10.95 7.06 15.63 12.06 13.74 15.44 11.1 18.45 6.19 8.16 15.03 7.72 15.05 13.97 10.02 24.36 10.45 11.87 7.4 10.1 19.13
0.0 0.0 0.0 0.01 0.0 0.0 0.0 0.01 0.0 0.0 0.0 0.0 0.03 0.01 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.02 0.0 0.01 0.0 0.0 0.03 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.07 0.0 0.07 0.0 0.31 0.1 0.16 0.13 0.19 0.0 0.13 0.0 0.13 0.27 0.0 0.21 0.26 0.11 0.18 0.26 0.22 0.14 0.2 0.05 0.11 0.73 0.25 0.0 0.12 0.11 0.27
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.06 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.1 0.0 0.02 0.0 0.0 0.0 0.0 0.14 0.0 0.0 0.0 0.02 0.0 0.0
0.01 0.0 0.0 0.0 0.01 0.0 0.0 0.01 0.0 0.02 0.0 0.02 0.02 0.0 0.01 0.01 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.01 0.0 0.03 0.0 0.0 0.02 0.0 0.01 0.01
0.01 0.0 0.0 0.0 0.0 0.01 0.0 0.0 0.01 0.04 0.01 0.0 0.05 0.02 0.0 0.02 0.02 0.04 0.0 0.0 0.0 0.0 0.02 0.0 0.07 0.0 0.0 0.0 0.02 0.02 0.04
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.14 0.06 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.18 0.0 0.0 0.0 0.06 0.0 0.0 0.0 0.31 0.0 0.14 0.0 0.0 0.07 0.06
0.0 0.0 0.0 0.0 0.1 0.15 0.0 0.05 0.08 0.14 0.12 0.0 0.04 0.0 0.28 0.05 0.04 0.22 0.08 0.29 0.0 0.0 0.04 0.0 0.44 0.03 0.0 0.21 0.0 0.27 0.08
0.0 0.0 0.0 0.21 0.0 0.0 0.0 0.21 0.0 0.67 0.14 0.13 0.12 0.14 0.13 0.16 0.36 0.11 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.24 0.0 0.8 0.9
0.0 0.0 0.0 0.0 0.01 0.0 0.0 0.0 0.01 0.0 0.0 0.0 0.01 0.01 0.0 0.03 0.0 0.04 0.0 0.01 0.0 0.0 0.06 0.0 0.06 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.01
0.0 0.0 0.0 0.0 0.04 0.0 0.0 0.0 0.0 0.04 0.05 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.02 0.05 0.0 0.04 0.0 0.07 0.0 0.02 0.0 0.0 0.0
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.07 0.0 0.05 0.0 0.0 0.0 0.08 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.04 0.0 0.0 0.0 0.15 0.07 0.0 0.05 0.0 0.0 0.0
0.26 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.11 0.0 0.0 0.12 0.0 0.16 0.13 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.13 0.0 0.0 0.0 0.24 0.0 0.0 0.13 0.14 0.23
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.07 0.0 0.06 0.09 0.0 0.09 0.0 0.0 0.03
0.0 0.0 0.0 0.36 0.0 0.29 0.13 0.0 0.0 0.0 0.14 0.24 0.41 0.0 0.0 0.17 0.23 0.29 0.34 0.0 0.32 0.62 0.0 0.0 0.0 0.76 0.1 0.11 0.0 0.11 0.76

Details

Raw expression values (TPM normalized), Green cells indicate low expression and red high. (Dark gray cells indicate missing values)