Heatmap: Cluster_240 (Lactuca sativa (Lsa) Coexpression Clusters (HCCA Algorithm))

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(Values are log₂ transformed ratios of a genes expression in a sample divided by the mean expression level)

Gene	Light: 268 uE m-2 s-1	Light: 202.5 uE m-2 s-1 (Control)	Light: 135 uE m-2 s-1	Light: 67.5 uE m-2 s-1	Photoperiod: L24	Photoperiod: L20D4 (Control)	Photoperiod: L12D12	Photoperiod: L8D16	RBW: 4:1:1 (Control)	RBW: 4:1:0	RBW: 3:1:1	RBW: 3:1:0	Nitrogen: 0%	Nitrogen: 25%	Nitrogen: 50%	Nitrogen: 100% (Control)	Nitrogen: 150%	Phosphorous: 0%	Phosphorous: 25%	Phosphorous: 50%	Phosphorous: 100% (Control)	Phosphorous: 150%	Potassium: 0%	Potassium: 25%	Potassium: 50%	Potassium: 100% (Control)	Potassium: 150%	Temperature: 20°C	Temperature: 25°C (Control)	Temperature: 30°C	Temperature: 35°C
Lsat_1_v5_gn_0_27580.1 (OPNR)	-1.53	-1.39	-0.78	-0.84	0.17	0.81	-0.09	-0.08	-0.21	-0.24	-0.09	-0.21	0.17	0.97	0.81	-0.05	-0.02	-0.29	-0.03	-0.55	-0.45	-0.31	0.56	-0.19	-0.04	-0.13	-0.14	-0.64	0.06	0.28	0.99
Lsat_1_v5_gn_1_110001.1	-0.53	-0.39	-0.42	-0.45	0.25	0.36	0.01	0.17	-0.43	-0.2	-0.07	-0.22	0.29	0.46	0.27	0.14	-0.04	-0.18	-0.04	-0.18	-0.21	-0.08	0.26	-0.2	-0.14	-0.18	-0.22	-0.22	0.23	0.28	0.72
Lsat_1_v5_gn_1_114420.1 (DSP4)	-0.7	-0.79	-0.68	-0.47	0.3	0.48	0.01	0.17	-0.37	-0.25	-0.46	-0.31	0.02	0.78	0.79	0.07	-0.1	-0.02	0.01	-0.04	-0.42	0.02	0.37	-0.11	-0.27	-0.06	-0.11	-0.26	0.2	0.11	0.48
Lsat_1_v5_gn_1_26821.1 (CBC2)	-0.99	-0.94	-0.8	-0.29	0.44	0.37	-0.36	-0.44	-0.03	-0.05	0.1	0.03	0.11	0.37	0.3	0.12	0.05	0.35	-0.21	-0.19	-0.19	-0.13	0.86	-0.38	-0.1	-0.13	0.06	-0.33	-0.03	0.15	0.57
Lsat_1_v5_gn_1_27120.1 (GGL29)	-0.9	-0.44	-0.54	-0.33	0.13	0.31	-0.06	0.09	-0.31	-0.37	0.0	-0.22	0.56	0.7	0.45	0.13	-0.21	-0.45	-0.22	-0.15	-0.02	-0.12	0.18	-0.29	-0.13	0.03	-0.11	-0.36	0.21	0.33	0.69
Lsat_1_v5_gn_1_28080.1	-0.76	-0.86	-0.62	-0.42	0.2	0.31	0.12	0.11	-0.26	-0.03	-0.15	-0.2	0.09	0.79	0.48	-0.14	-0.29	0.03	-0.14	-0.1	-0.2	-0.14	0.37	-0.06	-0.21	-0.06	0.05	-0.1	0.22	0.19	0.51
Lsat_1_v5_gn_1_34320.1 (SUS2)	-0.28	-0.26	-0.51	-0.38	0.21	-0.1	-0.55	-0.33	-0.58	-0.49	-0.44	-0.28	0.72	0.98	0.4	0.09	-0.1	-1.74	-0.3	-0.69	-0.33	-0.51	1.15	-0.31	-0.31	-0.33	-0.65	-0.14	0.52	0.51	1.13
Lsat_1_v5_gn_1_34800.1	-0.82	-0.97	-0.75	-0.16	0.71	0.38	-0.73	-0.87	-0.36	-0.1	-0.04	-0.13	0.22	0.62	0.4	0.06	-0.24	0.2	-0.15	-0.2	-0.3	-0.2	0.63	-0.27	-0.09	-0.06	-0.1	-0.42	0.39	0.36	0.76
Lsat_1_v5_gn_1_59401.1	-1.67	-1.03	-1.17	-0.87	0.71	0.32	-0.72	-0.36	-0.19	-0.2	0.07	-0.09	0.28	0.41	0.48	-0.0	-0.16	0.2	-0.01	-0.13	-0.19	-0.46	0.96	-0.21	-0.17	-0.21	0.01	-0.34	0.12	0.43	0.93
Lsat_1_v5_gn_2_108561.1 (RPF8)	-0.93	-1.31	-1.01	-0.2	0.28	0.34	-0.24	0.18	-0.8	-0.48	-0.57	-0.7	0.0	1.02	0.92	-0.08	-0.3	-0.6	-0.21	-0.14	-0.53	0.16	0.78	-0.3	-0.35	-0.06	-0.34	-0.82	0.65	0.39	1.15
Lsat_1_v5_gn_2_115380.1	-0.65	-0.25	-0.66	-0.58	0.45	0.13	-0.51	-0.62	-0.04	-0.04	0.17	-0.06	0.52	0.77	0.49	-0.07	-0.07	0.01	-0.23	-0.44	-0.5	-0.28	0.58	-0.34	-0.37	-0.21	-0.21	-0.5	0.21	0.42	0.86
Lsat_1_v5_gn_2_119161.1	-0.35	-1.13	-0.55	-0.64	-0.04	0.11	-0.72	-0.6	0.34	-0.01	0.48	-0.44	-0.06	0.69	0.42	-0.37	-0.22	-0.09	0.27	-0.99	-0.25	-0.28	0.18	-0.1	-0.1	-0.03	0.05	-1.1	0.07	0.79	1.39
Lsat_1_v5_gn_2_134221.1 (DFA)	-0.62	-0.72	-0.51	-0.29	0.11	0.18	-0.56	-0.57	-0.1	-0.19	0.07	-0.1	0.51	0.7	0.41	0.13	-0.09	-0.23	-0.08	-0.3	-0.17	-0.08	0.67	-0.06	0.04	0.01	-0.16	-0.11	-0.11	0.12	0.67
Lsat_1_v5_gn_2_63860.1	-0.44	-0.5	-0.38	-0.12	0.52	0.25	-0.44	-0.88	-0.21	-0.17	0.14	-0.01	0.23	0.34	0.09	-0.15	-0.07	0.41	-0.18	-0.24	-0.28	-0.2	0.88	-0.31	-0.28	-0.09	-0.05	-0.2	0.2	0.18	0.57
Lsat_1_v5_gn_2_73681.1 (MLH3)	-0.55	-0.42	-0.29	-0.5	-0.14	-0.08	-0.27	-0.18	0.08	-0.03	0.1	0.12	0.31	0.58	0.17	-0.31	-0.43	-0.61	-0.37	-0.12	-0.16	-0.12	0.46	-0.05	0.08	-0.09	-0.08	-0.55	0.38	0.4	1.09
Lsat_1_v5_gn_2_90201.1 (AUG5)	-0.42	-0.55	-0.86	-0.32	0.4	0.04	-0.39	-0.69	-0.27	0.02	0.08	-0.15	0.44	0.15	-0.05	-0.07	-0.3	-0.05	-0.25	-0.13	-0.24	-0.17	1.23	-0.34	-0.22	-0.31	-0.46	-0.11	0.39	0.51	0.88
Lsat_1_v5_gn_2_91880.1 (PBAC3)	-0.82	-0.8	-0.76	-0.92	0.35	0.4	-0.19	0.1	-0.07	-0.05	-0.33	-0.32	0.41	0.69	0.67	0.03	-0.09	0.07	-0.16	-0.3	-0.4	-0.14	0.41	0.04	-0.23	-0.07	0.01	-0.22	0.23	0.06	0.6
Lsat_1_v5_gn_3_10441.1	-0.64	-0.63	-0.68	-0.66	0.24	0.44	-0.17	-0.09	-0.26	-0.33	-0.06	-0.02	0.45	0.65	0.34	0.19	-0.05	-0.41	-0.11	-0.24	-0.16	-0.11	0.37	-0.04	-0.05	0.1	-0.03	-0.06	0.12	0.14	0.51
Lsat_1_v5_gn_3_110861.1	-0.45	-0.45	-0.45	-0.01	0.51	0.32	-0.39	-0.61	-0.08	-0.02	0.11	-0.1	-0.13	0.52	0.36	0.09	-0.22	-0.54	-0.12	-0.29	-0.2	-0.13	0.56	-0.15	-0.18	-0.14	0.06	-0.3	0.38	0.35	0.48
Lsat_1_v5_gn_3_114561.1 (TSL)	-0.55	-0.37	-0.63	-0.28	0.28	0.34	-0.04	-0.24	-0.18	-0.04	-0.06	-0.16	0.52	0.53	0.52	-0.0	-0.17	-0.51	-0.21	-0.28	-0.16	-0.01	0.34	-0.21	-0.2	-0.11	-0.16	-0.31	0.21	0.27	0.67
Lsat_1_v5_gn_3_116780.1 (ckl10)	-0.3	-0.26	-0.24	-0.23	0.29	0.29	-0.2	-0.3	-0.14	-0.03	-0.04	-0.05	0.23	0.36	0.2	0.04	-0.09	0.19	-0.16	-0.24	-0.26	-0.03	0.38	-0.27	-0.13	0.03	-0.02	-0.27	0.14	0.22	0.37
Lsat_1_v5_gn_3_124080.1 (LFR)	-0.37	-0.35	-0.68	-0.39	0.17	0.27	0.06	0.35	-0.28	-0.21	-0.13	-0.17	0.29	0.57	0.32	0.04	-0.09	-0.1	-0.11	-0.22	-0.34	-0.09	0.19	-0.15	-0.1	-0.08	-0.14	-0.19	0.2	0.22	0.61
Lsat_1_v5_gn_3_32040.1 (CPL3)	0.08	-0.14	-0.45	-0.33	0.41	0.26	-0.45	-0.97	-0.31	-0.26	-0.22	-0.3	0.14	0.68	0.4	-0.1	0.01	0.12	-0.2	-0.2	-0.27	-0.25	0.64	-0.15	-0.28	-0.1	0.01	-0.16	0.31	0.2	0.54
Lsat_1_v5_gn_3_39780.1	-0.76	-0.74	-0.62	-0.76	0.22	0.31	-0.42	-0.48	-0.19	-0.2	-0.07	-0.13	0.44	0.45	0.31	0.09	0.1	-0.13	-0.15	-0.06	-0.2	0.06	0.89	-0.2	-0.36	0.1	-0.19	-0.41	0.17	0.29	0.81
Lsat_1_v5_gn_3_52320.1 (APY6)	-0.47	-0.33	-0.39	-0.1	0.44	0.34	-0.42	-0.81	-0.11	-0.06	0.06	-0.11	0.13	0.38	0.38	-0.01	-0.11	0.3	-0.25	-0.39	-0.15	0.01	0.67	-0.31	-0.16	-0.05	-0.04	-0.23	0.15	0.24	0.33
Lsat_1_v5_gn_3_68061.1	-0.49	-0.64	-0.5	-0.39	0.4	0.45	-0.2	-0.2	-0.2	0.01	-0.06	-0.11	0.22	0.52	0.34	-0.14	-0.33	0.08	-0.18	0.03	-0.24	-0.24	0.64	-0.03	-0.12	-0.13	-0.31	-0.1	0.08	0.25	0.5
Lsat_1_v5_gn_3_71621.1 (PP2C.D6)	-0.74	-0.52	-0.48	-0.1	0.49	0.37	-0.38	-0.28	-0.1	0.03	0.12	0.03	0.17	0.52	0.28	-0.04	-0.26	-0.25	-0.23	-0.27	-0.24	-0.2	0.35	-0.21	-0.12	-0.09	0.03	-0.37	0.21	0.36	0.7
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Lsat_1_v5_gn_4_115701.1 (LDL3)	-0.9	-0.55	-0.75	-0.35	0.21	0.17	0.06	0.11	-0.27	-0.15	0.02	-0.1	0.1	0.48	0.33	0.05	-0.08	-0.36	-0.07	-0.22	-0.24	-0.1	0.79	-0.17	-0.06	-0.09	-0.08	-0.24	0.19	0.3	0.66
Lsat_1_v5_gn_4_14760.1 (CP2)	-0.71	-0.64	-0.74	-0.63	0.13	0.38	-0.13	-0.14	-0.26	-0.05	-0.13	-0.26	0.37	0.69	0.43	0.02	0.07	-0.25	-0.26	-0.05	-0.18	0.06	0.3	-0.07	-0.07	0.09	0.09	-0.07	0.02	0.05	0.67
Lsat_1_v5_gn_4_16581.1	-0.88	-0.77	-0.92	-0.56	0.25	0.46	0.04	0.16	-0.15	0.0	-0.3	-0.23	0.0	0.81	0.62	0.0	-0.24	-0.08	-0.02	-0.16	-0.49	-0.24	0.49	-0.06	-0.07	-0.13	-0.24	-0.37	0.25	0.19	0.74
Lsat_1_v5_gn_4_168780.1	-0.65	-0.78	-0.84	-0.59	0.07	0.43	-0.02	0.11	-0.27	-0.29	-0.19	-0.06	0.43	0.54	0.41	0.07	0.11	-0.52	-0.2	-0.19	-0.13	-0.03	0.32	0.18	-0.08	0.09	-0.12	0.1	0.19	0.14	0.48
Lsat_1_v5_gn_4_37041.1 (QUA3)	-0.45	-0.3	-0.34	-0.36	0.47	0.25	-0.66	-0.89	-0.16	-0.09	-0.09	-0.24	0.23	0.55	0.45	0.17	0.02	-0.05	0.04	-0.22	-0.28	-0.09	0.54	-0.22	-0.19	-0.1	0.05	-0.2	0.17	0.23	0.51
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Lsat_1_v5_gn_4_95441.1	-0.96	-1.04	-1.91	-2.39	0.27	0.81	-0.5	-0.8	-0.46	-0.71	-0.45	-0.47	1.06	1.11	0.82	0.2	-0.19	-0.33	-0.16	-0.48	-0.16	-0.37	0.79	-0.1	0.03	-0.27	-0.6	-0.32	0.09	0.34	1.07
Lsat_1_v5_gn_5_127360.1 (ROS4)	-0.47	-0.51	-0.64	-0.59	0.16	0.41	0.15	0.2	-0.18	-0.16	-0.17	-0.27	0.17	0.56	0.38	0.07	-0.06	-0.19	-0.11	-0.3	-0.27	-0.09	0.65	-0.11	-0.03	-0.05	0.01	-0.37	0.01	0.09	0.56
Lsat_1_v5_gn_5_130960.1 (GC5)	-0.61	-0.49	-0.74	-0.54	0.27	0.19	-0.31	-0.62	-0.3	-0.09	-0.06	0.01	0.28	0.34	0.21	0.0	-0.17	0.11	-0.1	-0.13	-0.17	0.03	0.87	-0.22	-0.06	-0.14	-0.07	-0.28	0.19	0.25	0.84
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Details

Dark gray cells indicate values where the raw expression is zero (cannot be log-transformed). Blue cells indicate samples where the expression of the gene is below average and red cells indicate the gene is expressed above average in the sample. White cells are average.