Heatmap: Cluster_61 (Lactuca sativa (Lsa) Coexpression Clusters (HCCA Algorithm))

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(Values are log₂ transformed ratios of a genes expression in a sample divided by the mean expression level)

Gene	Light: 268 uE m-2 s-1	Light: 202.5 uE m-2 s-1 (Control)	Light: 135 uE m-2 s-1	Light: 67.5 uE m-2 s-1	Photoperiod: L24	Photoperiod: L20D4 (Control)	Photoperiod: L12D12	Photoperiod: L8D16	RBW: 4:1:1 (Control)	RBW: 4:1:0	RBW: 3:1:1	RBW: 3:1:0	Nitrogen: 0%	Nitrogen: 25%	Nitrogen: 50%	Nitrogen: 100% (Control)	Nitrogen: 150%	Phosphorous: 0%	Phosphorous: 25%	Phosphorous: 50%	Phosphorous: 100% (Control)	Phosphorous: 150%	Potassium: 0%	Potassium: 25%	Potassium: 50%	Potassium: 100% (Control)	Potassium: 150%	Temperature: 20°C	Temperature: 25°C (Control)	Temperature: 30°C	Temperature: 35°C
Lsat_1_v5_gn_1_111020.1	-1.11	-0.1	-0.36	-0.61	-0.16	-0.86	-0.63	-0.54	-0.26	-0.36	-0.31	-0.34	-0.29	0.37	0.3	-0.37	-0.21	0.96	0.02	-0.56	-0.71	-0.76	-5.05	-0.05	-0.26	-0.58	-0.5	-1.23	1.09	1.32	2.04
Lsat_1_v5_gn_1_122121.1	-0.94	-0.65	-0.79	-0.19	-0.48	-0.26	0.27	0.19	0.04	0.28	0.35	0.29	0.02	-0.05	0.44	0.14	0.02	-2.11	0.23	0.17	-0.08	0.05	-2.18	0.4	0.21	0.36	0.03	-0.05	-0.25	0.36	0.76
Lsat_1_v5_gn_1_29100.1 (PolIB)	-0.33	-0.39	-0.51	-0.39	-0.26	0.09	-0.1	0.18	-0.2	-0.15	-0.08	0.15	0.49	0.76	0.39	0.16	0.1	-1.44	-0.41	-0.27	-0.09	-0.02	-0.56	0.13	0.0	-0.01	-0.17	-0.22	0.19	0.35	0.83
Lsat_1_v5_gn_1_30200.1	-0.42	-0.48	-0.63	-0.96	-0.92	-0.46	0.46	0.78	-0.04	0.08	0.07	0.1	0.17	0.26	-0.05	-0.02	0.02	-0.15	-0.08	0.3	-0.02	-0.12	-2.85	0.38	0.24	-0.09	-0.03	0.02	0.21	0.41	0.63
Lsat_1_v5_gn_1_40861.1	-3.28	-1.42	-2.44	-1.91	-1.53	-0.59	0.52	1.04	-0.34	-0.13	0.2	0.17	0.72	0.14	0.2	-0.35	0.1	-0.26	0.16	0.26	0.19	0.05	-5.11	0.39	0.36	0.07	0.03	0.21	0.66	0.34	0.87
Lsat_1_v5_gn_1_65761.1 (FYF)	-	-	-	0.95	-1.28	-4.2	-3.86	-3.06	0.69	0.87	0.25	1.61	-0.21	-	-0.92	0.52	-0.32	-2.8	-1.35	-0.74	-3.39	-2.12	-3.25	0.04	-0.43	-1.09	-1.0	-4.49	0.41	1.81	2.98
Lsat_1_v5_gn_1_72901.1	-5.01	-0.99	-1.54	-1.99	-1.19	-1.85	-0.6	-1.7	-1.06	-0.78	-0.51	-0.97	-1.2	0.65	0.93	-0.84	-0.37	0.29	-0.42	-1.3	-1.22	-1.25	-4.75	-1.59	-0.95	-1.1	-0.98	-3.36	1.91	2.31	2.76
Lsat_1_v5_gn_1_72921.1	-	-0.52	-1.18	-0.96	-0.85	-2.78	0.18	-2.31	-1.76	-1.16	-0.62	-1.68	-0.53	-0.98	-0.18	-0.1	0.0	0.81	0.1	-2.4	-0.67	-1.81	-	-1.67	-1.0	-1.34	-1.42	-4.04	2.08	2.48	2.63
Lsat_1_v5_gn_1_72941.1	-5.01	-0.99	-1.54	-1.99	-1.19	-1.85	-0.6	-1.7	-1.06	-0.78	-0.51	-0.97	-1.2	0.65	0.93	-0.84	-0.37	0.29	-0.42	-1.3	-1.22	-1.25	-4.75	-1.59	-0.95	-1.1	-0.98	-3.36	1.91	2.31	2.76
Lsat_1_v5_gn_1_81241.1 (RNJ)	-0.28	-0.14	-0.19	-0.11	-0.21	0.01	-0.21	-0.05	0.04	-0.03	0.24	0.25	0.59	0.68	0.12	-0.19	-0.21	-1.36	-0.16	-0.27	-0.25	-0.1	-0.84	0.09	-0.13	-0.11	-0.17	-0.34	0.15	0.37	1.01
Lsat_1_v5_gn_1_81341.1 (SVR9)	-1.12	0.45	-0.23	-0.36	-0.21	-0.1	0.28	0.17	-0.36	-0.54	-0.15	-0.5	-0.76	0.34	0.29	0.3	0.16	-0.9	-0.5	-0.98	0.2	-0.18	-1.24	-0.42	-0.4	-0.48	-0.32	-2.17	0.76	1.18	1.8
Lsat_1_v5_gn_1_9961.1	-0.26	-0.11	-0.83	-1.44	-0.59	-0.12	-0.07	-0.1	-0.28	-0.29	-0.38	-0.12	-0.25	0.79	0.22	-0.28	-0.24	-1.44	0.15	-0.22	0.08	0.48	-1.42	0.48	0.17	0.13	0.25	-0.03	0.33	0.49	1.31
Lsat_1_v5_gn_2_113481.1	-1.07	-0.63	-1.21	-0.79	0.0	0.27	0.77	0.82	0.13	0.03	0.12	0.19	-0.17	-0.17	0.15	0.37	0.17	-1.27	0.09	0.04	0.02	-0.02	-1.07	-0.07	0.02	-0.1	0.15	-0.25	0.21	0.21	0.49
Lsat_1_v5_gn_2_120781.1 (EFR)	-0.8	-0.11	-0.5	-0.68	0.59	0.7	0.0	0.15	-0.15	-0.51	0.03	-0.33	-0.47	0.07	0.47	0.46	0.14	-2.15	-0.38	-0.26	-0.06	-0.13	-1.56	-0.34	0.0	0.1	-0.03	-0.62	0.41	0.59	1.32
Lsat_1_v5_gn_2_134940.1 (SMC2B)	-1.53	-1.18	-0.44	-0.08	-0.81	-0.7	-0.34	0.18	0.11	0.34	0.26	0.31	-0.28	0.32	0.49	-0.04	-0.05	-0.29	0.2	0.29	-0.1	0.06	-1.23	0.03	-0.09	0.14	-0.05	-0.72	0.35	0.7	1.06
Lsat_1_v5_gn_2_24780.1	0.2	-0.32	-0.64	-1.04	-0.23	-0.59	-0.19	-0.37	0.01	0.16	0.17	0.02	-0.31	0.44	0.56	-0.01	0.02	-0.4	0.21	0.14	-0.14	-0.17	-3.03	0.34	0.1	0.13	0.16	-0.34	0.18	0.59	0.94
Lsat_1_v5_gn_2_31121.1 (ENODL18)	-0.23	-0.22	-0.07	-0.31	-0.15	0.21	0.0	-0.4	-0.13	-0.34	-0.21	-0.26	-0.23	0.64	0.4	0.24	0.05	-0.14	0.14	-0.13	-0.16	-0.04	-0.85	-0.21	-0.0	0.18	0.17	-0.27	0.4	0.43	0.47
Lsat_1_v5_gn_2_38340.1 (OEX1)	-0.32	-0.32	-0.41	-0.4	-0.11	0.16	-0.16	-0.17	-0.22	-0.14	0.11	-0.04	0.26	0.75	0.4	0.12	0.04	-0.94	-0.05	-0.17	-0.03	0.05	-0.24	0.09	0.11	-0.05	-0.03	-0.0	0.13	0.17	0.46
Lsat_1_v5_gn_2_67061.1 (RK3)	-0.81	-0.62	-0.79	-0.09	-0.16	-0.16	0.63	1.37	0.05	0.06	0.21	0.32	0.66	-0.34	0.51	0.2	0.29	-0.45	-0.58	0.06	-0.26	-0.34	-1.23	0.12	0.08	-0.26	-0.17	-0.29	-0.63	-0.04	-0.17
Lsat_1_v5_gn_2_83701.1	-0.16	-0.33	-0.38	-0.3	-0.15	0.17	-0.34	-0.14	0.08	0.13	0.23	0.29	0.55	0.62	0.26	0.07	0.15	-1.81	-0.32	-0.21	-0.22	-0.07	-1.52	0.21	0.08	-0.01	-0.17	-0.07	0.16	0.25	0.72
Lsat_1_v5_gn_2_8920.1	-1.08	-0.68	-0.92	-1.19	-0.64	-0.45	0.11	-0.22	0.47	-0.1	0.51	-0.21	-0.9	0.76	0.72	0.31	0.13	-1.74	0.02	-0.26	-0.13	0.03	-4.16	-0.01	-0.04	-0.07	-0.05	-1.17	0.5	0.94	1.59
Lsat_1_v5_gn_2_8960.1	-1.99	-1.67	-0.95	-1.78	-0.99	0.17	0.47	-0.29	0.21	-0.21	0.19	-0.28	-0.97	0.81	0.27	0.48	0.26	-1.8	0.31	-0.16	-0.38	-0.19	-3.02	0.09	0.01	0.09	0.1	-1.14	0.66	1.08	1.68
Lsat_1_v5_gn_3_1301.1 (TNY)	-3.48	-4.56	-2.56	-1.23	-0.7	-1.14	-0.11	-0.64	-0.76	-0.24	-0.06	0.35	-0.31	0.64	0.13	0.58	0.59	0.44	0.66	0.28	-0.56	-0.8	-3.84	0.92	0.31	-0.1	-1.32	-1.31	0.83	0.99	1.77
Lsat_1_v5_gn_3_13220.1 (NLM8)	-0.41	0.13	-0.27	-0.45	0.03	-0.37	0.01	0.02	-0.1	-0.28	-0.13	-0.32	-0.8	0.98	0.71	0.04	-0.05	-0.38	0.48	-0.16	-0.08	-0.18	-4.82	-0.42	-0.1	0.16	0.0	-0.63	0.47	0.31	1.08
Lsat_1_v5_gn_3_17581.1	-0.21	0.04	-0.39	-0.13	0.45	0.06	-0.5	-0.06	-0.55	-0.64	-0.25	-0.93	-0.6	0.69	0.56	-0.57	-0.76	0.34	0.7	-0.43	-0.42	-0.31	-5.78	-0.07	0.07	-0.16	-0.2	-0.32	0.65	0.76	1.38
Lsat_1_v5_gn_3_18460.1	-0.24	-0.35	-0.38	-0.32	-0.17	0.23	-0.02	0.21	-0.06	0.09	-0.01	0.05	0.49	0.3	-0.02	-0.15	-0.06	-1.89	-0.03	-0.12	0.03	0.09	-0.88	0.23	0.08	0.12	0.07	0.03	0.0	0.21	0.78
Lsat_1_v5_gn_3_26320.1	-0.82	-0.5	-1.11	-1.35	-1.07	-1.35	-0.27	-0.84	-0.19	0.3	-0.07	0.02	-0.54	-2.21	-0.71	-0.15	0.25	1.12	1.35	0.27	-0.35	-0.14	-3.66	-0.02	0.15	0.21	-0.42	-1.24	-0.0	1.03	1.91
Lsat_1_v5_gn_3_6081.1	-	-0.67	-0.96	-3.51	-1.32	-0.26	-0.12	0.12	-0.37	-0.12	-0.49	-0.55	0.34	-0.05	0.02	0.79	0.69	-0.82	0.24	0.49	0.05	0.05	-4.37	-0.82	-0.28	-0.56	0.31	-1.43	0.58	1.42	1.9
Lsat_1_v5_gn_3_73920.1 (VND2)	-0.71	-0.95	-0.77	-0.42	-0.11	0.14	0.25	-0.17	0.06	-0.09	-0.14	0.07	-0.14	0.45	0.69	0.14	0.27	-1.08	0.27	0.28	-0.18	-0.19	-3.12	-0.11	-0.0	-0.41	-0.38	-0.6	0.39	0.87	1.2
Lsat_1_v5_gn_3_96021.1 (MES11)	-1.18	-0.9	-2.02	-2.11	-0.27	-0.15	0.7	0.83	-0.09	0.01	0.14	0.05	-0.47	-0.63	-0.32	0.58	0.38	-2.31	0.11	0.38	0.04	0.16	-0.99	0.2	0.31	0.31	0.19	-0.26	0.19	0.86	0.66
Lsat_1_v5_gn_4_107341.1 (NPF4.5)	-1.14	0.17	-0.93	-1.38	-0.77	0.21	0.5	0.43	0.13	-0.11	-0.02	-0.11	-1.46	0.3	-0.1	0.22	0.28	-4.18	0.39	-0.25	-0.09	0.03	-4.81	-0.26	-0.14	-0.18	-0.22	-1.0	0.58	0.75	1.93
Lsat_1_v5_gn_4_11320.1	-0.21	0.04	-0.39	-0.13	0.45	0.06	-0.5	-0.06	-0.55	-0.64	-0.25	-0.93	-0.6	0.69	0.56	-0.57	-0.76	0.34	0.7	-0.43	-0.42	-0.31	-5.78	-0.07	0.07	-0.16	-0.2	-0.32	0.65	0.76	1.38
Lsat_1_v5_gn_4_122561.1 (CYP82F1)	-0.23	-0.14	-0.43	-0.44	0.15	0.23	-0.1	-0.1	-0.14	-0.27	0.05	-0.18	-0.32	0.46	0.32	0.17	-0.12	-0.87	0.18	-0.04	-0.13	-0.1	-2.45	0.05	0.15	0.06	0.06	-0.19	0.39	0.66	0.85
Lsat_1_v5_gn_4_137601.1 (FtsHi4)	-0.38	-0.48	-0.66	-0.58	0.18	0.39	-0.17	0.04	-0.19	-0.09	-0.02	0.09	0.51	0.7	0.29	-0.02	-0.06	-0.9	-0.0	-0.2	-0.14	0.01	-0.34	0.13	0.05	-0.03	0.02	-0.03	-0.02	0.16	0.56
Lsat_1_v5_gn_4_145700.1 (MEF20)	-1.16	-0.95	-0.61	-1.29	-0.44	0.41	-0.86	-0.05	-1.07	-0.76	-0.09	0.21	0.46	0.81	0.41	-0.43	-0.13	-0.77	0.37	-0.36	-0.19	0.31	-0.45	0.42	0.1	0.1	-0.6	-0.52	0.65	0.91	1.22
Lsat_1_v5_gn_4_147601.1	-0.9	-1.2	-0.59	-0.52	-1.1	-0.33	-0.11	0.32	0.21	0.33	0.42	0.61	0.62	0.23	0.12	-0.1	-0.19	-0.45	-0.5	-0.26	-0.26	-0.14	-1.47	0.06	0.2	-0.1	-0.24	-0.27	0.04	0.51	1.44
Lsat_1_v5_gn_4_183440.1 (UBP13)	-1.39	-0.69	-0.75	-0.42	-0.82	-0.36	0.13	0.27	0.27	0.28	0.42	0.07	-0.12	0.19	0.32	0.06	-0.02	-1.18	-0.07	0.33	0.0	0.18	-1.68	0.34	0.29	0.1	0.35	-0.18	0.27	0.41	0.59
Lsat_1_v5_gn_4_5181.1 (TBL2)	-0.09	-0.24	-0.12	-0.39	-0.53	-0.34	0.11	-0.28	0.0	0.02	0.19	0.11	0.4	0.05	0.16	-0.11	0.16	-0.93	0.14	0.11	-0.01	-0.06	-0.91	0.04	0.11	0.03	0.03	0.04	0.21	0.45	0.6
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Details

Dark gray cells indicate values where the raw expression is zero (cannot be log-transformed). Blue cells indicate samples where the expression of the gene is below average and red cells indicate the gene is expressed above average in the sample. White cells are average.