Heatmap: Cluster_53 (Lactuca sativa (Lsa) Coexpression Clusters (HCCA Algorithm))

View as: (view raw or row-normalized)

View using InCHLib : here ( Experimental feature, still under development)

(Values are log₂ transformed ratios of a genes expression in a sample divided by the mean expression level)

Gene	Light: 268 uE m-2 s-1	Light: 202.5 uE m-2 s-1 (Control)	Light: 135 uE m-2 s-1	Light: 67.5 uE m-2 s-1	Photoperiod: L24	Photoperiod: L20D4 (Control)	Photoperiod: L12D12	Photoperiod: L8D16	RBW: 4:1:1 (Control)	RBW: 4:1:0	RBW: 3:1:1	RBW: 3:1:0	Nitrogen: 0%	Nitrogen: 25%	Nitrogen: 50%	Nitrogen: 100% (Control)	Nitrogen: 150%	Phosphorous: 0%	Phosphorous: 25%	Phosphorous: 50%	Phosphorous: 100% (Control)	Phosphorous: 150%	Potassium: 0%	Potassium: 25%	Potassium: 50%	Potassium: 100% (Control)	Potassium: 150%	Temperature: 20°C	Temperature: 25°C (Control)	Temperature: 30°C	Temperature: 35°C
Lsat_1_v5_gn_0_13981.1	-	-	2.99	2.91	-	1.35	-	-	-	-	-	-	-	1.43	0.22	0.42	-	-	-	-	-	-	0.39	0.24	-	0.3	-	-	0.17	1.57	-
Lsat_1_v5_gn_1_118900.1 (ORF25)	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	4.95	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-
Lsat_1_v5_gn_1_128061.1 (RBCL)	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	4.95	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-
Lsat_1_v5_gn_1_27341.1 (CYP71A25)	1.61	-	-	2.59	-	-	1.21	-	-	-	-	1.22	2.31	-	2.41	-	-	-	-	-	-	-	-	-	2.24	-	-	-	-	-	1.19
Lsat_1_v5_gn_1_80420.1 (MAGL15)	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	4.95	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-
Lsat_1_v5_gn_1_91120.1	-	-	-	2.44	-	-	-	-	-	-	3.35	-	-	-	-	2.74	-	2.07	2.17	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-
Lsat_1_v5_gn_1_92961.1 (APX4)	-	-	-	3.23	-	2.2	-	-	-	1.89	-	-	-	-	-	-	3.12	0.55	-	-	-0.31	-	-	-	-	-	1.25	-	-	-	-
Lsat_1_v5_gn_1_96561.1	-	1.74	-	3.52	-	-	-	-	-	1.79	-	0.71	-	-	1.99	-	-	-	-	-	0.65	-	-	-	-	0.4	-	-	-	0.99	1.15
Lsat_1_v5_gn_2_108440.1 (AS2)	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	3.73	-	-	-	-	-	-	3.56	-	-	2.58	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-
Lsat_1_v5_gn_2_20500.1 (CGF1)	-	0.76	0.73	3.55	-	0.84	1.8	0.45	-	-0.31	-	-	-	-0.22	0.79	1.36	0.98	-	-	-	-	-	-	-0.5	-	-	-	-0.68	-	-	-
Lsat_1_v5_gn_2_23581.1 (DEI1)	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	4.95	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-
Lsat_1_v5_gn_2_23920.1 (COR15B)	-0.97	-0.7	-0.62	0.71	-1.22	-1.4	0.51	0.86	0.05	0.38	0.43	0.29	0.37	-0.99	-0.3	0.08	0.4	-0.17	-0.57	0.28	-0.18	-0.5	0.49	-0.16	-0.05	-0.37	-0.15	-0.02	-0.45	0.39	0.39
Lsat_1_v5_gn_2_30001.1 (WAKL2)	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	4.57	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	2.86
Lsat_1_v5_gn_2_43880.1 (PETA)	-	-	-	4.95	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-
Lsat_1_v5_gn_2_71320.1 (CRK3)	0.09	0.85	1.05	2.82	-	-1.52	-1.02	1.99	-1.3	-3.2	0.28	-0.81	-2.12	-1.42	-1.43	0.35	-0.71	-	-2.28	-0.5	-0.08	0.49	-0.82	-0.96	0.63	-1.81	0.21	-0.01	-3.13	-0.7	-
Lsat_1_v5_gn_2_74281.1 (GDPD6)	-	-	-	2.73	2.36	-	-	-	-	-	-	-	-	-	2.52	-	-	3.09	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	2.31	-
Lsat_1_v5_gn_3_137840.1	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	4.95	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-
Lsat_1_v5_gn_3_16101.1	-	0.17	1.13	1.62	1.3	1.4	0.02	0.09	-2.25	-0.5	0.69	-	-	0.09	1.57	-0.04	-0.11	-	-	-	-2.32	-2.12	2.21	-1.16	-0.1	-0.34	-1.88	-	-1.1	-0.36	-2.14
Lsat_1_v5_gn_3_42201.1 (CRK15)	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	4.95	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-
Lsat_1_v5_gn_3_58180.1 (PRXQ)	-	-	3.12	3.08	-	-	-	2.99	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	2.56	-	-	-
Lsat_1_v5_gn_3_59200.1 (HSC70)	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	4.95	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-
Lsat_1_v5_gn_3_86540.1	-	-	-	4.47	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	3.15	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-
Lsat_1_v5_gn_4_1060.1 (SVP)	-1.55	0.73	0.87	2.37	-0.62	-0.4	-1.18	-2.28	-1.06	-0.12	0.03	-0.83	0.25	0.75	0.44	-1.03	-0.53	0.61	-0.28	-1.99	-0.37	-1.09	-0.6	-0.93	-1.82	-1.19	-1.8	-2.83	0.21	0.96	1.19
Lsat_1_v5_gn_4_10720.1	1.77	2.03	-	3.04	0.71	1.27	-	-0.11	-	-	2.03	-	-	-	-	-	-	-	-	-	0.2	-	-	-	0.61	0.38	-0.51	-	0.6	-	-
Lsat_1_v5_gn_4_12620.1 (LST8-1)	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	4.95	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-
Lsat_1_v5_gn_4_127280.1	-	-	-	4.95	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-
Lsat_1_v5_gn_4_136001.1 (SUS5)	-	-	-	4.95	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-
Lsat_1_v5_gn_4_136281.1 (PXC2)	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	4.95	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-
Lsat_1_v5_gn_4_148261.1 (RLM1)	-	-	0.63	2.19	1.65	1.79	-	0.1	-	0.13	-	0.02	0.27	-	-	-	0.37	2.26	0.98	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	0.44	2.16
Lsat_1_v5_gn_4_148880.1 (PKp3)	-	-	-	0.6	0.71	-	-	-	-0.08	-	2.57	0.87	-0.69	-0.34	-	0.44	-	2.21	-0.92	-	-0.89	0.83	-	-	0.78	-	-0.9	-	1.21	0.53	1.53
Lsat_1_v5_gn_4_160601.1	-	-	-	4.95	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-
Lsat_1_v5_gn_4_168381.1	-	-	-	4.95	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-
Lsat_1_v5_gn_4_46000.1 (AAC1)	-	-	-	-	-0.26	-	-	-0.39	0.85	-	3.61	-	-	-	-	-	-	3.47	-	1.83	-0.47	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-
Lsat_1_v5_gn_4_46440.1	0.74	0.1	1.95	3.31	-	-	-	0.5	-	-	-0.11	-	-0.02	0.76	-	-0.95	0.41	2.18	-	-	-0.42	-	-	-1.33	-	-	0.93	-	-	-	-
Lsat_1_v5_gn_4_7901.1 (MYB113)	2.09	-	2.26	3.69	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	1.61	-	-	-	-	-	-0.27	-	-	-0.2	-0.49	1.17	0.39
Lsat_1_v5_gn_4_94880.1 (SGT)	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	4.95	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-
Lsat_1_v5_gn_5_140320.1 (APAP1)	-	-	-	4.54	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	2.96	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-
Lsat_1_v5_gn_5_150541.1 (SEC31B)	-	-	-	4.95	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-
Lsat_1_v5_gn_5_170421.1	-	-	-	-	2.15	2.08	-	-	-	-	3.21	-	-	-	-	-	-	3.04	-	-	-	-	-	-	-	-	2.27	-	-	-	-
Lsat_1_v5_gn_5_17100.1 (AtVEX1)	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	4.95	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-
Lsat_1_v5_gn_5_37701.1 (APX4)	-	-	-	2.63	-	1.57	-	-	1.86	1.31	-	-	-	-	-	-	2.74	2.2	-	-	1.23	-	-	-	-	-	1.07	-	-	-	-
Lsat_1_v5_gn_5_54640.1 (MCM5)	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	4.95	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-
Lsat_1_v5_gn_5_77320.1	-	-	-	4.95	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-
Lsat_1_v5_gn_5_92780.1 (MCTP10)	-	-	-	4.03	-	1.3	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	3.61	-	-	-	-	-	-
Lsat_1_v5_gn_6_117321.1 (CHR17)	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	4.95	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-
Lsat_1_v5_gn_6_14760.1	2.44	-	3.13	3.14	-	0.4	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	1.95	-	-	-	0.4	0.56	-	-	-	-	-	-	-	-
Lsat_1_v5_gn_6_37120.1	-	-	2.63	2.48	-	-	-	-	-	-	-	-	2.53	-	-	1.84	-	2.05	0.22	-	-	-	-	-	-	-	0.67	-	1.58	-	-
Lsat_1_v5_gn_6_66280.1 (ZIFL1)	3.04	2.35	-	4.06	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	0.06	-	-	-	-	-
Lsat_1_v5_gn_6_69181.1	-	-	-	3.48	-	-	-	-	-	2.21	2.88	-	-	-	1.49	-	-	-	-	-	-	-	-	1.16	-	-	-	-	-	1.5	-
Lsat_1_v5_gn_6_70320.1 (AR2)	-	-	-	4.05	-	-	-	-	2.73	-	-	-	-	-	-	2.97	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-
Lsat_1_v5_gn_6_79980.1 (HSFB3)	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	4.95	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-
Lsat_1_v5_gn_7_100680.1 (RPS2)	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	4.95	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-
Lsat_1_v5_gn_7_111240.1 (NIP6)	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	4.95	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-
Lsat_1_v5_gn_7_13621.1 (REF6)	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	4.95	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-
Lsat_1_v5_gn_7_19381.1	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	4.95	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-
Lsat_1_v5_gn_7_57480.1 (PRK1)	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	3.63	-	-	-	-	-	-	3.03	-	-	-	-	-	-	-	-	-	2.31	-	1.42	1.5
Lsat_1_v5_gn_7_96661.1	-	-	-0.16	0.03	0.55	-2.08	0.86	-3.53	-0.09	0.46	2.84	-0.57	1.17	-0.14	-2.06	0.79	0.13	-1.27	-	-2.21	0.33	-	1.35	-	-2.06	-0.08	-2.2	-	-0.46	-1.61	1.15
Lsat_1_v5_gn_8_104441.1	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-0.61	4.16	-	-	-	-	-	-	3.5	-	-	-	0.18	-	-	-	-	-	-	-	-	-
Lsat_1_v5_gn_8_107941.1	-	-	-	-	-	-	0.87	-	1.27	-	3.55	-	-	-	-	0.89	-	-	-	1.31	-	-	1.57	-	2.69	-	-	-	-	0.35	-
Lsat_1_v5_gn_8_120961.1	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	4.08	-	-	-	2.38	-	-	-	-	-	1.01	-	-	2.05	-	-	-	-	-	1.43	-
Lsat_1_v5_gn_8_121921.1 (ARFA1F)	1.55	-	-	-	0.91	1.12	-	1.09	-	-	4.1	-	-	-	-	-	-	1.14	-	-	-	-	-	-	-	-	1.36	-	-	-	-
Lsat_1_v5_gn_8_131601.1 (AtNEAP2)	-	-	-	3.6	2.13	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	3.47	-	-	-	-	-	-	1.79	-
Lsat_1_v5_gn_8_141701.1 (ATBCAT-5)	-	-	-	4.53	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	2.98	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-
Lsat_1_v5_gn_8_160861.1 (WNK8)	-	-	-	3.12	-	-	-	2.95	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	2.99	2.72
Lsat_1_v5_gn_8_2060.1 (PILS6)	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	4.95	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-
Lsat_1_v5_gn_8_34420.1 (SVR2)	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	4.95	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-
Lsat_1_v5_gn_8_45701.1 (GEM1)	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	4.95	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-
Lsat_1_v5_gn_8_50241.1 (MYB93)	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	3.33	-	-	-	1.28	-	-	3.28	-	-	-	-	-	-	-	-	-	0.93	-	-	2.78
Lsat_1_v5_gn_8_54261.1 (ROXY5)	-	0.49	2.0	3.77	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	3.44	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	0.13
Lsat_1_v5_gn_8_74860.1 (GBF3)	-	-	-	3.66	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	3.09	3.3	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-
Lsat_1_v5_gn_8_77200.1 (YCF3)	-	0.87	-0.13	1.45	-	1.17	-0.27	-	-	-0.38	3.27	-	0.88	-0.21	-	-	-0.34	1.14	-	0.45	-0.56	-	-	-	-	-	-	-	-	-	2.12
Lsat_1_v5_gn_8_79101.1 (NTMC2T5.2)	-1.26	-0.38	2.01	2.16	-	0.79	-0.21	-1.41	-0.53	-1.87	1.21	0.66	0.27	1.17	-0.76	-0.28	-1.46	-	-2.53	-1.75	-0.79	-2.93	-0.51	-1.9	-0.12	-0.19	-	-0.35	0.44	-0.01	0.21
Lsat_1_v5_gn_8_80261.1	-	-	-	4.95	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-
Lsat_1_v5_gn_9_105600.1	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	4.14	-	2.39	-	-	-	-	2.0	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	2.04	-
Lsat_1_v5_gn_9_118840.1	-	-	-	3.55	2.79	-	-	-	-	-	-	-	-	1.37	-	-	-	-	-	-	1.03	-	2.72	-	0.22	-	-	-	-	-	-
Lsat_1_v5_gn_9_119180.1 (CR88)	-	-	-	4.95	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-
Lsat_1_v5_gn_9_123281.1 (PIN4)	-	-	-	4.95	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-
Lsat_1_v5_gn_9_17001.1 (YCF2.2)	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	4.95	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-
Lsat_1_v5_gn_9_20500.1 (GIA1)	-1.29	0.51	0.16	1.48	-3.33	-0.74	0.91	0.98	0.06	0.34	-0.27	-2.36	0.02	-0.41	-1.6	-0.85	-0.9	-0.3	-0.43	-0.5	-0.22	-1.51	0.63	-3.44	-0.43	-0.18	-0.58	-0.85	0.32	0.32	1.9
Lsat_1_v5_gn_9_42081.1 (AAP2)	-	2.89	-	3.64	-	0.43	-	-	-	-	0.5	-	-	1.65	-	-	-	-	-	-	-	-	-	1.98	-	-	-	-	-	0.36	-
Lsat_1_v5_gn_9_67201.1 (EF1alpha)	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	4.95	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-

Details

Dark gray cells indicate values where the raw expression is zero (cannot be log-transformed). Blue cells indicate samples where the expression of the gene is below average and red cells indicate the gene is expressed above average in the sample. White cells are average.