Heatmap: Cluster_134 (Lactuca sativa (Lsa) Coexpression Clusters (HCCA Algorithm))

View as: (view raw or row-normalized)

View using InCHLib : here ( Experimental feature, still under development)

(Values are log2 transformed ratios of a genes expression in a sample divided by the mean expression level)

Gene
Light: 268 uE m-2 s-1
Light: 202.5 uE m-2 s-1 (Control)
Light: 135 uE m-2 s-1
Light: 67.5 uE m-2 s-1
Photoperiod: L24
Photoperiod: L20D4 (Control)
Photoperiod: L12D12
Photoperiod: L8D16
RBW: 4:1:1 (Control)
RBW: 4:1:0
RBW: 3:1:1
RBW: 3:1:0
Nitrogen: 0%
Nitrogen: 25%
Nitrogen: 50%
Nitrogen: 100% (Control)
Nitrogen: 150%
Phosphorous: 0%
Phosphorous: 25%
Phosphorous: 50%
Phosphorous: 100% (Control)
Phosphorous: 150%
Potassium: 0%
Potassium: 25%
Potassium: 50%
Potassium: 100% (Control)
Potassium: 150%
Temperature: 20°C
Temperature: 25°C (Control)
Temperature: 30°C
Temperature: 35°C
- - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 4.95 - - - - - - - - -
- - - - - 4.95 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
- - - - - 4.95 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
- 1.18 0.66 - 1.45 2.18 - - - - 0.57 - - 0.29 - 0.42 1.97 -0.14 - - - - 1.01 -0.08 - 0.99 0.83 - -1.42 0.37 1.38
- - - - 2.7 2.74 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 4.16
- - - - - 2.4 1.75 - - 1.82 2.01 - - 1.7 - - - 2.25 - 2.16 - - - 0.32 - - - 0.1 - - -
- - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 4.95 - - - - - - - - -
- - - - - - - - - - - - 3.89 - - - - - - - - 4.01 - - - - - - - - -
-5.66 - - - -0.04 -0.49 -0.42 -0.88 0.0 -0.35 -0.31 0.57 1.49 - - -0.87 0.44 -2.96 -2.31 0.25 1.38 1.68 1.82 -2.12 -0.29 0.02 1.42 1.47 -7.11 - -0.25
- - - - - 2.13 - - - 0.01 0.11 0.09 - 1.46 - - - - - 0.99 -0.08 0.22 - 2.06 2.39 0.1 - 1.97 0.19 0.03 -
- - - - - - - - - - - - - - 2.62 - - -22.75 - - 3.25 2.54 - - - 2.15 - 2.36 - - -
- - - - - 4.45 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 3.19 - - - -
- - - - - 4.95 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
- - - - - -0.91 - - - -0.88 -1.91 -0.37 0.77 - - 0.75 1.96 -1.1 -0.99 -0.05 0.47 0.99 2.47 1.11 0.83 -0.93 -0.95 0.46 - 0.83 1.41
- - - - - - -0.64 -0.59 0.3 -0.68 -0.75 1.02 0.64 - 0.73 0.13 -0.16 0.39 - -0.94 -0.41 0.94 2.59 1.17 1.3 - - 0.7 -0.86 0.31 0.46
- - - - - 4.95 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
0.62 -0.35 0.14 0.78 1.08 -1.0 -1.47 0.29 0.09 -0.11 0.16 0.13 0.64 -1.75 -0.84 -1.11 -0.57 0.73 -0.15 -1.14 0.2 0.39 1.32 -1.47 -0.75 -1.05 -0.1 -0.4 -0.39 -0.84 0.56
- - - - - 3.99 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 3.91
- - - - - - - - 0.88 - - - - - 3.26 1.5 - - - - - 2.76 - - - - - 2.05 1.95 - 1.01
- - - - - 4.95 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
- - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 3.98 - - - 2.56 - - 3.23 - -
- - - - - 3.74 - - - - - - - - - - - 3.84 - - - - - - - - - - - - 1.7
0.4 -1.44 - -0.51 0.57 0.81 -0.72 -0.27 0.13 -0.71 -0.67 0.47 0.48 0.64 0.52 -0.13 -0.35 0.33 -2.16 -2.18 0.13 1.09 0.86 -0.47 -1.12 -0.34 0.12 -1.62 0.3 0.12 0.76
- - - - 0.86 2.88 1.24 - - - 1.05 -0.05 - - 0.32 - 0.31 1.89 - - - 2.24 1.42 - - 0.88 - - - - -0.02
- -0.33 - -0.45 - -0.71 1.87 - - 1.73 - 0.48 0.66 0.77 - -0.02 0.7 - 0.43 0.52 - 2.48 - - - - - -0.75 -0.41 2.06 -0.46
- - - - - 4.95 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
1.01 -0.36 0.74 0.94 0.59 0.03 -3.61 -2.23 -0.01 0.64 -0.03 1.18 0.67 -1.8 -1.2 -1.17 -0.46 -1.61 -0.49 -0.44 -0.6 0.25 1.38 -0.73 -0.5 0.1 0.09 -0.65 -1.4 -3.01 0.78
0.21 0.67 -0.55 -0.87 0.95 1.07 -2.8 - 0.13 0.29 -0.35 0.36 -0.14 -0.82 -0.77 -1.14 -0.01 -2.52 -1.05 -0.03 0.68 0.66 1.17 -1.07 -0.16 0.23 0.57 0.23 -0.09 -1.07 0.35
- - - - - - - - - - - 1.41 2.75 - - - 1.59 2.32 - - - 3.11 - 1.34 - - 0.22 - - - 0.38
- - - - 3.65 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 4.2
- - - - - 4.95 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
- - - - - 4.35 - 1.72 - - - - - - - - - - - - - - - - 1.87 - - - - - 1.85
- - - - 0.62 1.91 0.31 -1.38 0.13 - - - - 1.55 0.48 -0.14 1.28 2.09 -0.34 -1.48 - -0.14 - 0.19 0.66 - - 0.3 2.09 -1.34 -1.32
- - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 4.95 - - - - - - - - -
- - - - - 4.09 - - - - - - - - - - - - - - - - - 2.84 - - - 2.76 - - -
- - - - - - - - - - - - - - - - - 3.48 - - - 3.05 - 1.84 1.91 - 2.07 - - - -
- - - - - 4.24 - - - - - - - 2.44 - - - - - - - - - - - - - - - 2.73 -
- - - - - 4.95 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
- - - - - - - - - - - - - - - - - 3.11 - - - 4.49 - - - - - - - - -
- - - - 1.37 - - - - - - - - 0.73 - 0.59 - - 2.88 - 0.13 3.3 1.47 - - - - - - 1.25 0.83
- - - - - 3.25 - - 1.45 2.08 - - - - - 0.74 - - - 1.55 - 0.85 0.63 - - 1.88 - - - 1.54 -
- - 1.59 - - 2.37 - - - 1.33 - - - - 1.53 - - 2.27 - - - - - - 1.34 - - - - - 3.33
- - - - 2.83 2.04 - - - - - - 2.32 - - - - - - - - 2.31 - - - - 2.41 - - - 2.16
- - - - - 3.99 2.83 - - - - - - - - - - - - 2.99 - - - - - - - - - - -
- - 0.01 - -0.31 1.53 0.65 - - -0.99 - -0.12 2.12 - 1.07 - 0.13 - 1.27 - 1.91 0.53 - -0.22 0.37 -0.47 - - 0.72 0.11 1.34
- - - - - - - 2.55 - - - - - - - - - - - - - 4.42 - - - - - - 1.89 - -
- - - - - 3.63 - - - - - - - - - - - - - - - 4.22 - - - - - - - - -
- - - - -0.73 - 1.94 -1.26 1.02 - - 0.34 -0.13 - 1.06 - 0.86 1.1 1.23 0.41 -1.58 -0.29 -0.3 1.99 - -0.41 - - 1.56 0.21 0.54
2.25 - - 1.08 - - 1.08 - - - - -1.1 - - - - -0.44 - - -5.58 - 3.17 - -2.07 3.01 - - -14.66 1.75 - -3.13
- - - - 3.73 - - - - - - - - - - - - - - - - 4.15 - - - - - - - - -
- - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 4.95 - - - - - - - - -
- 0.27 - 1.26 -1.0 1.44 -1.03 - -0.97 -0.71 - - -0.82 -0.61 - -0.66 - 2.94 0.55 0.99 1.54 - - - 1.7 - 0.36 - -0.85 -0.9 0.1
-1.64 -1.89 -1.68 -1.53 -0.26 0.08 1.19 0.21 -0.73 -0.24 -0.32 0.27 0.79 -1.35 0.59 -0.06 0.49 -1.95 -1.02 0.64 0.56 0.93 1.29 -1.1 -0.34 -0.14 0.4 1.26 -1.9 -1.86 -1.25
- 1.04 - 0.96 - - - 0.54 - 0.55 - - 0.66 - - 0.88 - - 1.0 - 2.16 2.37 - - 0.66 - - - 0.65 2.12 0.61
-1.19 -2.38 -0.36 -2.38 -1.08 -1.74 -0.54 -0.27 1.37 0.26 0.57 0.18 -1.66 -0.51 -0.52 1.0 0.74 1.12 - 0.98 -2.85 0.07 -0.76 0.11 0.64 0.92 -0.22 0.89 0.35 -1.78 -0.77
- - - - - - - - 0.99 0.3 - 1.11 - - - 2.15 0.32 - - 0.98 1.61 2.22 - - - 1.1 - 0.84 1.69 1.63 -
- 0.67 0.14 -1.08 - -0.58 - -1.05 0.79 2.3 0.42 1.52 1.68 -4.71 - - -0.17 0.61 -0.17 - - 1.17 - -1.59 - -1.29 1.11 - - - 2.04
- - - - - 4.95 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
- - - - - 0.96 - - 1.37 - - - - - 1.41 - - 3.64 - - - 2.83 - - - - - - - 1.05 1.11
- - - - - - - - 3.48 - - - - - - - 3.19 - - - - 3.41 - - - - - - - - -
- - - - - - - - - - - - - - - - - 3.82 - - - 4.07 - - - - - - - - -
- - - - - 0.8 - - - - - - - - - - - - - - - 3.69 4.03 - - - - - - - -
- - - - - 1.54 - - - - - - - - - 1.9 - 2.52 - - - 3.04 2.88 1.62 - - - - - - -
- - - -0.11 0.28 0.29 - -0.51 -0.58 0.51 0.62 -0.41 0.56 - 0.89 - 1.16 -0.26 -0.32 - -0.35 2.62 - -0.29 2.07 -0.46 - - 1.42 - -
0.06 1.64 3.39 - -0.64 - -1.81 - 1.48 -0.83 - - - - - -0.7 - - - - - 2.71 - 1.33 - 0.1 - - 0.46 - -
- - 1.5 - 1.21 - - - -1.2 2.39 - - - - - - - - - 1.26 - 1.52 - - 1.39 2.28 - 2.89 - - -
- - - - 1.54 4.18 - - - - - - - - - 2.12 - - - 2.49 - - - - - - - - - - -
- - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 3.19 4.45 - - - - - - - - -
- - - - - - - - - - - - - - - - - - - 3.79 - 4.1 - - - - - - - - -
- - - - - -0.12 -0.16 - 0.22 1.3 - 1.27 - 0.61 - - - - 0.21 - 2.26 2.46 0.92 - - - - - 1.28 - 2.54
- - 2.24 - 1.93 1.98 - - - - - 0.75 - - - - - 1.75 - 1.78 - 2.06 - - - - 1.14 - - - 1.88
- -0.33 0.01 -1.4 0.06 1.36 0.26 -0.69 0.09 -2.75 -2.6 -1.63 0.72 1.29 -0.14 0.12 0.72 0.45 -1.21 -0.53 -1.07 0.57 -0.37 - - -0.17 1.19 -1.25 0.45 0.25 1.37
- - - - 2.72 4.05 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 2.97
- - - 0.07 1.02 0.16 0.84 0.58 0.53 0.03 0.96 - -1.58 1.23 0.3 -0.69 0.36 -0.15 -1.8 0.22 - - - 0.87 - 0.83 0.05 0.06 0.91 0.47 0.98
- 3.17 - - - - - - - 2.79 - - - - - - - - 2.82 - - 3.01 - - - - - - - - -
- - - - - 1.36 2.22 -0.12 2.34 - - - - - - 1.51 - 2.12 0.12 2.06 - - - 1.66 - - - 0.16 - - 0.09
- - - - - 3.86 - - - - - - - - - 2.62 - - - - - - - - - - - - 2.42 2.33 -
- - - - 1.12 2.44 0.12 0.92 0.02 0.7 -1.21 0.34 - 0.77 -1.24 1.1 0.48 -0.6 0.25 -1.53 -1.51 -0.79 - -2.47 0.16 1.0 -0.47 0.25 -2.28 -0.09 -0.1
- - - - - 4.01 - - - - - - - - - - - 3.89 - - - - - - - - - - - - -
0.24 - - - -0.83 -0.55 - -1.14 - -0.26 - - -1.44 1.16 -1.15 -1.21 -0.35 1.83 -1.32 -0.29 - 1.62 0.99 0.76 -1.16 -1.24 - 0.75 1.65 1.24 1.78
- - - - - 3.12 - - - - - - - - - - - 1.98 - - - 4.2 - - - - - - - - -
- - - - - 3.92 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 3.99 - -
0.69 0.84 0.11 -1.54 0.82 1.49 1.06 -1.07 -1.15 -1.38 0.84 -2.7 -2.62 0.52 -1.69 0.38 -0.86 -1.96 -0.64 -2.01 -0.26 -2.6 -1.87 -1.3 1.14 -0.46 -0.44 1.01 0.95 0.41 -0.46
- - - - - - 2.69 1.37 - 1.42 - - - - - - 1.65 - - - - 2.62 - - 1.41 2.31 - 1.24 - - -
-0.47 -0.69 -0.66 - 0.66 2.3 0.78 - - - - -0.05 -0.78 1.45 - -0.73 -0.68 0.55 -0.08 -1.0 - - - -0.04 - 0.01 0.78 0.72 2.15 0.19 0.54
- - - - 1.73 - - - - - - - - - - 2.5 - - - - - 3.55 - - 2.38 - - - - - 2.36
- - - - 3.36 3.44 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 3.3 -
- - - - - 4.95 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
-0.37 -0.3 0.05 0.37 0.64 1.13 0.46 0.3 -0.03 -0.24 -0.22 -0.12 -0.19 0.41 0.66 -0.13 -0.11 -0.24 -0.24 -0.52 -0.63 -0.36 -0.52 -0.56 -0.74 -0.37 -0.16 0.13 0.41 -0.45 -0.16

Details

Dark gray cells indicate values where the raw expression is zero (cannot be log-transformed). Blue cells indicate samples where the expression of the gene is below average and red cells indicate the gene is expressed above average in the sample. White cells are average.