1. Home
  2. Tools
  3. Expression Heatmap
  4. Results

Heatmap: Cluster_239 (Lactuca sativa (Lsa) Coexpression Clusters (HCCA Algorithm))

View as: (view zlog-transformed or row-normalized)

View using InCHLib : here ( Experimental feature, still under development)

(Showing raw values)

 Transpose table  Download table
Gene
Light: 268 uE m-2 s-1
Light: 202.5 uE m-2 s-1 (Control)
Light: 135 uE m-2 s-1
Light: 67.5 uE m-2 s-1
Photoperiod: L24
Photoperiod: L20D4 (Control)
Photoperiod: L12D12
Photoperiod: L8D16
RBW: 4:1:1 (Control)
RBW: 4:1:0
RBW: 3:1:1
RBW: 3:1:0
Nitrogen: 0%
Nitrogen: 25%
Nitrogen: 50%
Nitrogen: 100% (Control)
Nitrogen: 150%
Phosphorous: 0%
Phosphorous: 25%
Phosphorous: 50%
Phosphorous: 100% (Control)
Phosphorous: 150%
Potassium: 0%
Potassium: 25%
Potassium: 50%
Potassium: 100% (Control)
Potassium: 150%
Temperature: 20°C
Temperature: 25°C (Control)
Temperature: 30°C
Temperature: 35°C
13.18 9.65 7.59 6.3 20.67 29.28 26.36 26.85 12.57 9.34 13.85 12.08 35.13 63.32 47.32 22.02 22.28 96.84 24.03 19.28 17.31 17.69 218.06 16.48 15.8 19.15 18.75 18.55 14.35 15.88 14.11
0.04 0.02 0.04 0.03 0.32 0.22 0.07 0.06 0.07 0.09 0.09 0.11 0.16 0.33 0.3 0.14 0.07 0.9 0.09 0.06 0.08 0.11 1.63 0.04 0.06 0.11 0.12 0.05 0.09 0.13 0.53
0.0 0.0 0.0 0.0 0.02 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.01 0.0 0.12 0.11 0.06 0.0 0.03 0.55 0.0 0.01 0.0 0.0 0.95 0.0 0.0 0.01 0.04 0.0 0.01 0.0 0.12
0.11 0.07 0.1 0.06 0.56 0.57 0.2 0.23 0.1 0.03 0.16 0.1 0.71 1.16 0.61 0.18 0.14 5.03 0.33 0.07 0.14 0.09 9.59 0.25 0.13 0.08 0.13 0.08 0.4 0.36 0.75
0.0 0.19 0.65 0.15 0.79 0.35 0.22 0.15 0.44 0.37 0.59 0.29 2.66 3.01 1.11 0.41 0.77 10.77 0.48 0.26 0.21 0.28 14.95 0.43 0.58 0.83 0.25 0.32 0.73 0.9 4.58
2.66 4.29 2.93 3.2 4.08 5.61 9.5 10.37 4.62 5.32 4.78 6.17 10.08 7.37 9.27 8.84 9.01 27.67 6.6 6.11 4.79 4.48 89.3 5.29 6.47 5.65 5.24 4.0 6.85 10.71 13.13
4.27 5.48 6.24 5.78 5.75 5.72 8.73 8.32 6.12 6.85 6.65 7.79 11.41 7.19 9.41 8.54 9.7 28.57 6.22 7.67 6.4 5.83 66.23 6.35 8.01 6.56 6.22 5.06 7.7 12.4 15.64
19.24 22.3 23.33 27.75 41.67 35.61 27.8 34.79 32.35 36.14 32.69 35.14 62.54 47.92 41.99 32.6 33.8 114.63 18.31 27.05 29.41 24.58 285.92 26.39 25.86 25.5 27.18 26.18 40.56 38.38 40.1
1.11 1.75 1.12 1.05 3.79 4.07 2.5 2.37 1.96 1.37 2.02 1.54 1.68 9.53 4.59 1.98 1.81 9.11 2.42 1.49 2.04 1.55 25.46 1.6 1.17 1.66 2.11 1.22 1.66 1.59 1.93
10.0 6.07 5.5 13.87 28.76 9.71 6.56 4.93 18.09 7.79 21.49 16.2 19.65 63.4 40.55 10.17 9.35 199.45 11.07 7.89 17.11 12.9 300.81 11.04 19.09 14.6 11.37 10.53 26.98 25.05 69.36
0.15 0.09 0.13 0.15 0.6 0.4 0.08 0.07 0.09 0.03 0.12 0.06 0.33 1.56 0.64 0.11 0.07 1.38 0.17 0.05 0.11 0.1 3.35 0.08 0.11 0.11 0.16 0.05 0.22 0.14 0.19
0.07 0.12 0.0 0.05 0.35 0.3 0.43 0.59 0.12 0.09 0.16 0.06 0.69 2.16 0.81 0.25 0.22 5.11 0.3 0.17 0.22 0.25 11.87 0.27 0.29 0.16 0.14 0.46 0.27 0.21 0.44
5.26 5.13 5.03 4.46 7.19 7.06 5.15 6.44 4.05 4.58 5.01 5.62 13.05 11.25 11.82 6.09 6.34 26.13 5.67 5.74 4.56 5.88 55.48 6.21 7.64 4.59 5.03 6.63 7.64 8.57 12.33
0.0 0.0 0.0 0.0 0.01 0.05 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.08 0.12 0.1 0.0 0.01 1.22 0.01 0.0 0.0 0.0 3.29 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.03
9.57 10.64 4.07 2.6 18.06 24.62 16.53 18.67 8.3 7.7 8.62 7.05 14.6 76.85 52.94 15.65 14.43 51.64 21.52 11.1 12.33 12.7 176.78 12.24 11.39 11.63 11.99 15.16 13.01 10.87 8.26
0.05 0.0 0.0 0.0 0.1 0.07 0.01 0.03 0.0 0.01 0.01 0.01 0.92 0.28 0.11 0.02 0.02 5.76 0.03 0.01 0.02 0.0 9.97 0.03 0.03 0.0 0.01 0.02 0.0 0.01 0.01
1.8 1.8 1.17 1.38 3.34 4.08 2.44 2.3 1.91 1.84 2.18 2.29 3.78 10.93 6.89 2.71 2.3 8.26 4.17 1.91 2.4 2.48 23.84 2.53 2.67 2.39 2.42 2.09 3.53 2.89 3.8
0.0 0.0 0.1 0.0 0.16 0.27 0.2 0.08 0.17 0.21 0.7 0.04 0.79 0.07 0.35 0.19 0.09 51.64 0.29 0.37 0.27 0.02 118.3 0.28 0.08 0.29 0.11 0.06 0.46 0.91 1.0
2.35 2.91 2.74 4.17 8.64 8.97 4.22 4.41 4.83 5.07 5.47 4.56 9.85 9.09 8.38 5.72 4.88 28.76 4.96 3.95 4.78 4.96 69.71 4.19 4.51 4.61 4.84 3.92 5.66 6.71 8.21
1.02 1.2 1.45 0.97 1.6 1.84 0.91 0.71 1.54 1.69 1.45 1.67 2.32 3.02 1.58 1.49 1.6 18.29 1.43 1.14 0.99 1.0 42.81 1.78 1.18 1.57 1.62 0.68 2.42 3.57 5.34
0.3 0.0 0.16 0.04 0.64 0.1 0.2 0.04 0.22 0.17 0.0 0.48 0.21 0.0 0.0 0.12 0.0 4.06 0.56 0.0 0.53 0.31 12.92 0.73 0.1 0.15 0.35 0.19 0.22 0.25 1.89
0.04 0.02 0.03 0.06 0.06 0.15 0.02 0.02 0.04 0.04 0.06 0.03 0.15 0.13 0.04 0.04 0.05 0.72 0.02 0.04 0.04 0.02 1.57 0.05 0.06 0.01 0.02 0.07 0.03 0.05 0.15
0.02 0.05 0.11 0.1 0.19 0.22 0.14 0.14 0.19 0.19 0.29 0.2 0.36 0.51 0.37 0.23 0.21 2.09 0.12 0.28 0.28 0.23 3.09 0.21 0.22 0.25 0.2 0.21 0.27 0.3 0.42
0.03 0.08 0.0 0.15 0.11 0.07 0.05 0.03 0.05 0.03 0.2 0.03 0.47 0.0 0.02 0.04 0.07 1.74 0.04 0.04 0.08 0.04 3.68 0.12 0.11 0.13 0.06 0.1 0.09 0.11 0.19
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.01 0.04 0.0 0.0 0.01 0.25 0.0 0.0 0.0 0.0 0.54 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.0 0.0 0.0 0.0 2.16 0.33 0.02 0.0 0.19 0.28 0.41 0.13 1.31 3.63 1.93 0.03 0.11 13.1 0.12 0.1 0.07 0.09 24.11 0.08 0.02 0.0 0.15 0.03 0.01 0.02 1.06
0.09 0.02 0.05 0.08 0.23 0.28 0.14 0.12 0.14 0.16 0.26 0.2 0.33 0.36 0.33 0.14 0.1 1.46 0.11 0.21 0.13 0.07 2.62 0.18 0.11 0.08 0.17 0.19 0.15 0.17 0.49
0.34 0.34 0.31 0.29 0.69 0.91 0.52 0.49 0.25 0.19 0.39 0.27 0.35 2.6 1.15 0.46 0.36 2.78 0.53 0.32 0.45 0.6 6.93 0.35 0.28 0.25 0.49 0.23 0.68 0.64 0.68
6.3 4.14 3.98 4.36 15.0 14.88 7.15 6.62 4.06 4.37 4.95 4.37 9.07 50.75 29.77 7.7 6.49 55.12 13.19 5.49 6.71 7.01 146.25 6.76 6.27 5.4 5.96 7.24 9.29 6.08 8.92
2.71 3.02 1.69 2.25 6.9 6.5 3.33 2.77 4.58 3.81 4.21 4.22 6.15 9.35 9.89 6.63 5.15 27.4 5.6 5.72 4.47 4.59 48.84 3.15 3.57 4.75 4.55 2.81 3.61 3.29 6.3
0.03 0.05 0.13 0.07 0.08 0.14 0.1 0.05 0.06 0.02 0.05 0.12 0.09 0.32 0.26 0.12 0.13 1.73 0.0 0.02 0.0 0.04 3.54 0.0 0.09 0.14 0.01 0.03 0.07 0.03 0.13
0.49 0.98 0.49 1.05 1.77 1.14 0.91 0.97 1.15 1.06 1.21 1.07 1.13 1.59 1.68 0.96 0.94 6.11 1.2 1.14 1.04 0.96 8.1 0.95 0.88 0.94 0.83 0.67 1.25 1.3 2.34
0.01 0.0 0.0 0.0 0.05 0.06 0.05 0.01 0.03 0.07 0.06 0.04 0.04 0.0 0.0 0.01 0.06 1.26 0.04 0.04 0.05 0.01 3.78 0.01 0.01 0.08 0.02 0.07 0.01 0.02 0.07
9.5 9.01 4.32 7.87 21.0 13.77 2.6 5.53 7.89 6.26 7.01 7.48 19.67 44.51 19.05 8.12 8.14 121.44 13.17 9.36 6.79 16.74 217.37 4.53 11.01 9.13 6.27 8.04 24.84 36.39 50.16
0.31 0.39 0.48 0.27 0.89 0.92 0.24 0.3 0.66 0.48 0.58 0.66 2.11 1.2 1.17 0.68 0.62 5.33 0.67 0.49 0.49 0.39 9.01 0.73 1.02 0.52 0.69 0.61 0.6 0.96 2.11
0.09 0.13 0.02 0.07 1.11 0.74 0.18 0.04 0.11 0.08 0.08 0.08 2.07 2.11 0.63 0.08 0.07 10.09 0.25 0.04 0.31 0.06 24.53 0.27 0.4 0.14 0.13 0.12 0.15 0.79 2.38
1.67 2.61 2.62 2.68 5.34 7.45 6.93 5.6 3.55 2.95 2.67 2.23 3.69 13.02 8.36 5.42 4.67 13.2 4.4 3.55 3.72 4.31 34.03 4.23 4.55 4.34 4.77 3.61 4.46 3.69 5.24
0.4 0.07 0.07 0.0 1.48 1.54 0.01 0.04 0.24 0.07 0.47 0.13 2.69 2.24 0.52 0.04 0.11 109.68 1.7 0.04 0.4 0.59 189.15 1.32 1.38 0.31 0.37 0.22 0.01 0.03 0.34
0.81 0.57 0.74 0.96 1.87 1.68 1.24 1.05 0.83 1.01 0.93 1.04 2.95 2.71 1.94 1.48 1.56 7.59 1.03 0.97 1.16 0.9 13.85 0.97 1.23 1.01 1.02 1.08 1.19 1.48 3.52
0.22 0.2 0.1 0.26 1.26 1.03 0.46 0.42 0.49 0.6 0.7 0.35 0.54 1.37 1.11 0.63 0.39 5.88 0.66 0.45 0.6 0.73 11.39 0.41 0.63 0.37 0.71 0.2 1.09 0.95 1.27
0.39 0.33 0.08 0.22 0.37 0.04 0.18 0.71 0.21 0.64 0.21 0.13 0.69 0.69 0.62 0.2 0.18 3.94 0.17 0.31 0.12 0.11 6.23 0.35 0.15 0.14 0.14 0.07 0.07 0.22 0.21
0.23 0.7 0.59 0.59 3.66 2.56 1.46 1.37 1.82 1.62 2.01 1.94 2.78 7.98 4.53 1.75 1.95 12.97 2.29 1.38 1.49 1.76 28.67 1.21 1.5 1.86 2.14 1.08 2.32 1.56 2.46
1.07 0.35 0.2 0.47 0.92 1.64 1.76 1.57 0.5 0.49 1.2 0.18 2.34 4.66 2.83 1.44 1.69 13.16 2.74 0.26 0.74 0.67 33.57 1.04 1.46 1.3 0.75 0.78 1.17 1.91 5.26
0.0 0.01 0.02 0.01 0.16 0.11 0.12 0.08 0.03 0.06 0.1 0.07 0.14 0.46 0.56 0.02 0.02 8.3 0.0 0.06 0.05 0.0 16.02 0.23 0.0 0.02 0.15 0.02 0.11 0.08 0.05
0.84 0.48 0.21 0.34 1.2 2.46 0.78 0.66 0.71 0.93 0.78 0.95 3.72 3.52 2.52 1.29 1.09 8.85 0.44 0.47 0.42 0.86 18.11 0.77 1.01 1.13 1.03 0.61 1.35 1.62 3.82
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 7.73 0.0 0.22 0.0 0.0 14.9 0.0 0.12 0.0 0.1 0.0 0.0 0.12 0.16
0.33 0.2 0.21 0.22 1.33 1.28 1.46 0.97 2.03 1.93 2.11 2.13 3.32 1.6 2.32 2.06 2.19 30.71 1.73 2.35 2.22 1.77 67.92 1.86 2.13 2.16 2.34 1.38 0.72 0.72 0.75
1.51 0.99 1.05 0.9 2.87 2.77 1.95 1.99 2.06 2.16 2.52 2.75 2.36 5.33 5.05 2.66 3.02 8.03 2.82 1.9 2.2 2.01 19.02 1.86 2.32 1.75 2.46 2.39 2.15 2.39 2.86
0.76 0.98 1.26 1.8 6.36 5.84 2.3 1.45 4.13 3.72 3.68 5.22 4.81 4.26 6.13 4.1 4.02 40.72 3.45 3.34 4.37 3.57 94.81 2.87 3.38 2.95 4.16 1.98 6.97 6.28 7.11
0.97 0.72 1.08 1.17 2.22 2.22 1.09 1.03 1.32 1.02 1.11 1.27 3.46 2.83 2.17 1.55 1.54 7.11 1.57 1.53 1.1 1.22 14.36 1.69 1.52 1.23 1.54 1.2 1.88 2.14 2.88
1.0 0.68 0.87 0.83 1.69 1.37 0.75 0.75 1.17 0.95 0.96 1.02 2.14 2.0 1.61 0.97 1.18 5.98 1.45 0.99 0.93 0.95 13.52 1.16 1.04 0.84 0.79 1.13 1.21 1.34 2.02
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.01 0.02 0.02 0.0 0.0 0.0 0.0 0.13 0.04 0.0 0.0 0.01 0.54 0.01 0.01 0.0 0.0 1.01 0.0 0.02 0.0 0.0 0.01 0.04 0.02 0.08
1.01 2.3 0.8 1.26 27.52 19.68 2.45 3.36 4.52 4.74 4.35 4.77 22.01 19.54 18.9 16.37 6.98 79.59 9.53 4.88 7.42 7.37 229.71 7.03 8.56 6.08 5.14 8.13 25.28 16.23 24.76
0.14 0.23 0.08 0.15 0.53 0.34 0.38 0.42 0.4 0.41 0.35 0.61 4.37 0.71 0.94 0.5 0.51 15.73 0.28 0.37 0.42 0.49 19.2 0.53 0.52 0.63 0.4 0.38 0.34 0.45 3.99
0.58 0.75 1.15 0.58 1.56 1.41 1.86 1.84 1.54 1.87 2.35 2.65 2.36 3.29 5.07 2.11 2.0 9.24 1.91 1.8 1.94 1.45 22.46 1.58 1.73 1.6 1.84 0.87 2.2 2.66 2.46
19.88 19.11 17.19 19.25 33.52 32.15 20.51 19.92 19.71 19.9 22.04 19.96 31.32 70.39 45.27 27.72 23.24 46.98 30.65 23.14 23.3 23.67 141.34 24.76 22.27 23.67 24.99 20.27 30.64 29.08 29.3
0.37 0.45 1.34 2.91 3.72 4.02 1.45 1.35 2.51 1.91 3.53 3.5 8.83 2.31 1.75 3.05 2.58 19.91 1.1 1.7 2.47 2.31 48.22 2.84 2.75 2.33 2.16 2.22 2.63 2.85 8.79
1.59 1.31 1.09 0.74 2.5 2.72 2.14 1.52 3.16 3.14 3.72 3.38 6.51 10.6 5.88 2.41 2.63 16.15 3.16 2.84 2.59 1.8 30.47 2.65 2.47 2.2 1.99 1.54 2.09 3.04 6.83
1.75 2.17 1.56 1.06 1.71 1.94 2.23 1.96 1.72 1.82 1.4 1.51 1.41 6.51 2.89 1.53 1.26 15.52 2.17 1.83 1.33 1.99 34.86 1.84 2.3 1.06 2.15 0.93 3.32 3.71 8.97
9.25 7.32 6.51 5.36 10.15 13.42 15.18 19.43 11.45 11.39 12.46 9.96 21.86 34.32 29.46 15.08 15.2 51.75 16.12 12.38 12.51 11.85 111.24 12.91 12.9 12.54 12.61 15.33 12.88 13.96 21.43

Details

Raw expression values (TPM normalized), Green cells indicate low expression and red high. (Dark gray cells indicate missing values)