Heatmap: Cluster_207 (Lactuca sativa (Lsa) Coexpression Clusters (HCCA Algorithm))

View as: (view zlog-transformed or row-normalized)

View using InCHLib : here ( Experimental feature, still under development)

(Showing raw values)

Gene
Light: 268 uE m-2 s-1
Light: 202.5 uE m-2 s-1 (Control)
Light: 135 uE m-2 s-1
Light: 67.5 uE m-2 s-1
Photoperiod: L24
Photoperiod: L20D4 (Control)
Photoperiod: L12D12
Photoperiod: L8D16
RBW: 4:1:1 (Control)
RBW: 4:1:0
RBW: 3:1:1
RBW: 3:1:0
Nitrogen: 0%
Nitrogen: 25%
Nitrogen: 50%
Nitrogen: 100% (Control)
Nitrogen: 150%
Phosphorous: 0%
Phosphorous: 25%
Phosphorous: 50%
Phosphorous: 100% (Control)
Phosphorous: 150%
Potassium: 0%
Potassium: 25%
Potassium: 50%
Potassium: 100% (Control)
Potassium: 150%
Temperature: 20°C
Temperature: 25°C (Control)
Temperature: 30°C
Temperature: 35°C
6.05 4.6 5.98 3.17 21.68 30.22 40.98 54.07 15.35 12.81 10.63 12.54 24.0 105.64 83.47 31.02 33.01 32.18 24.01 22.07 18.92 21.96 19.21 18.97 24.92 21.7 18.04 17.17 33.42 26.39 41.26
24.05 25.48 23.61 31.11 45.38 41.86 27.88 28.48 34.75 33.89 36.66 34.06 40.09 67.81 60.84 36.46 33.08 33.33 31.64 26.18 29.24 31.04 36.23 28.93 29.19 32.89 33.04 24.11 41.23 39.91 51.99
4.16 2.83 1.64 1.65 4.63 6.75 4.85 7.11 2.87 2.93 2.94 4.1 5.58 14.58 10.14 4.25 4.5 7.16 4.51 3.52 5.13 4.26 6.01 5.09 4.12 4.39 3.64 4.08 6.93 5.64 8.58
7.19 8.33 6.45 5.99 12.95 12.56 10.15 10.72 11.44 11.11 12.71 10.81 12.14 36.31 21.14 11.78 11.74 15.79 12.43 11.13 10.78 10.02 9.96 10.52 11.87 11.66 13.08 7.66 19.16 18.01 20.42
4.91 4.19 4.66 4.3 8.44 8.34 4.17 4.41 5.0 4.72 5.65 6.17 9.97 15.45 11.99 6.46 5.27 6.12 6.21 4.81 6.12 6.4 8.47 6.46 6.27 6.88 5.08 6.01 9.77 7.73 11.88
0.23 0.26 0.35 0.92 1.76 2.34 1.03 0.93 1.03 0.91 1.04 0.79 1.76 9.89 4.55 1.98 1.33 2.99 2.73 1.61 1.53 0.71 1.31 1.57 1.16 1.82 2.09 0.87 2.65 2.62 3.73
2.39 1.99 2.36 2.94 4.04 3.79 2.4 1.87 3.16 3.41 3.01 2.88 4.27 7.24 5.56 3.83 3.6 3.54 4.14 2.8 2.41 2.46 4.44 2.58 2.42 2.69 2.44 2.45 3.96 4.33 7.16
4.5 5.36 3.83 4.5 6.52 6.73 5.13 5.9 6.19 6.41 7.45 6.59 7.73 13.31 10.01 7.0 6.77 6.45 7.58 6.33 6.47 7.08 6.0 7.95 7.26 6.51 6.89 4.68 8.58 9.18 12.6
0.12 0.45 0.05 0.07 0.72 0.29 0.7 0.65 0.41 0.43 0.47 0.47 0.27 3.02 1.58 0.44 0.39 0.77 0.56 0.43 0.27 0.25 0.5 0.26 0.25 0.37 0.33 0.15 0.71 1.07 1.48
24.13 24.92 19.9 20.02 45.45 50.2 30.36 28.48 28.16 24.65 29.92 28.88 46.99 75.79 60.61 38.14 31.72 40.91 38.26 33.97 32.75 37.09 38.67 33.05 33.51 32.17 33.1 29.95 45.91 40.12 58.54
12.41 10.94 12.88 11.1 19.41 19.9 13.31 13.5 15.12 14.95 17.51 14.06 17.93 54.68 40.67 16.62 14.32 16.4 21.28 16.55 13.69 13.77 5.48 19.66 16.94 19.74 14.02 9.7 17.83 16.35 25.3
1.52 1.14 0.5 0.31 1.54 2.25 2.45 5.98 1.03 0.82 1.13 1.37 3.4 9.32 8.19 2.16 2.19 2.59 3.08 1.62 1.83 1.57 1.02 2.08 1.52 1.52 1.91 1.55 2.71 2.37 3.15
5.62 5.12 5.0 3.94 7.92 8.0 5.54 6.09 4.95 4.97 5.16 5.22 7.3 13.65 11.59 6.77 5.45 6.06 6.42 5.3 5.14 5.44 6.54 5.34 4.83 5.85 5.08 4.87 9.12 7.98 10.95
13.12 13.08 12.06 12.19 16.99 19.09 14.81 16.83 13.83 14.39 15.15 16.34 24.39 29.97 22.52 16.59 17.31 15.85 15.93 15.07 16.48 16.63 14.8 17.9 16.46 16.27 14.89 16.61 18.67 16.92 21.68
2.33 3.42 1.36 2.08 6.12 9.54 10.01 9.29 6.04 5.28 6.76 5.0 7.17 27.65 19.25 8.61 7.35 8.06 10.55 7.52 7.09 7.56 5.96 7.38 7.48 7.29 8.17 5.91 10.86 10.0 12.65
1.13 1.31 0.89 1.0 2.53 3.5 1.58 1.62 1.49 1.85 1.41 1.53 2.74 8.18 3.35 1.89 1.49 1.99 2.02 1.58 1.99 2.44 2.59 1.96 1.98 2.0 1.41 1.39 4.09 2.98 6.72
23.95 22.91 26.7 36.12 45.39 42.32 38.69 39.36 37.41 42.08 40.84 34.86 49.35 58.23 55.83 39.55 30.71 50.42 30.26 34.14 32.04 34.08 46.64 35.56 32.16 34.99 34.9 33.06 42.76 42.1 51.33
19.89 26.76 27.96 24.2 85.71 97.38 37.98 61.08 76.17 66.15 64.05 51.82 53.67 327.94 204.5 96.76 60.47 62.19 87.81 64.61 58.28 72.29 76.76 67.15 60.82 69.5 69.99 43.63 95.5 97.61 114.03
4.94 4.69 4.01 3.61 7.22 8.86 4.98 7.11 3.86 4.51 3.86 4.86 8.9 14.99 10.65 6.33 5.59 6.75 5.2 4.6 5.25 5.68 6.5 5.53 5.94 5.12 4.49 4.49 9.09 8.23 12.27
2.62 2.89 1.4 0.81 4.83 4.67 4.19 4.28 3.7 3.21 4.26 2.97 4.39 28.03 11.97 4.92 4.88 2.98 7.65 4.3 3.43 4.27 3.2 5.57 4.8 4.38 4.21 2.91 11.82 9.62 15.3
5.08 5.86 5.77 5.33 16.7 20.35 9.01 8.09 8.67 8.95 8.92 8.79 18.51 32.97 24.93 15.21 10.94 17.0 13.27 9.53 11.04 10.71 11.64 10.84 10.68 11.94 13.12 7.48 15.29 14.96 20.98
1.86 1.89 1.6 2.03 4.36 4.71 2.58 4.24 2.41 2.59 2.6 3.45 3.82 7.79 5.35 3.6 3.15 2.83 3.05 2.6 3.1 2.98 3.75 2.98 3.02 2.96 2.67 2.9 5.95 4.67 7.07
1.95 1.79 1.28 1.61 3.18 4.52 3.56 4.2 1.6 2.23 2.2 2.17 3.83 8.25 5.3 2.95 2.65 3.04 2.55 2.26 2.55 3.15 4.07 2.45 2.59 2.59 2.36 2.51 5.69 3.84 5.12
1.1 0.99 0.97 1.08 2.45 3.66 3.21 3.5 1.75 1.89 1.62 2.19 5.03 9.9 6.34 3.76 3.5 3.36 3.1 2.22 2.67 3.43 4.67 3.04 2.98 2.95 2.4 2.48 5.87 4.38 7.52
1.32 1.18 0.94 1.08 1.99 2.14 1.77 1.96 1.4 1.7 1.21 1.64 2.87 4.72 3.4 1.63 1.8 1.89 1.52 1.41 1.53 1.71 2.79 1.24 1.57 1.72 1.43 1.34 3.19 2.66 4.77
6.2 6.58 6.43 6.83 8.73 11.02 11.95 15.71 7.51 7.37 8.37 9.11 15.87 22.68 15.99 9.08 8.13 10.15 9.15 8.02 7.54 7.71 13.83 8.98 8.0 7.66 8.09 6.61 9.66 9.83 16.16
2.05 2.38 2.66 4.42 10.56 9.04 3.81 3.45 4.58 4.86 5.66 4.48 7.04 16.92 12.28 6.08 4.6 9.47 7.5 4.53 4.42 5.13 9.46 4.68 4.75 4.8 4.89 3.85 9.29 8.23 13.21
4.93 5.66 5.49 6.5 9.25 9.1 5.95 6.45 6.5 6.62 7.28 7.08 8.75 12.88 10.39 8.79 7.43 6.74 7.03 6.17 5.93 6.33 8.98 6.36 6.43 7.47 7.25 5.94 8.25 8.62 10.88
1.32 1.27 0.95 1.23 2.11 2.18 1.56 2.2 0.88 0.99 1.04 1.2 1.39 3.91 2.83 1.71 1.23 1.1 1.62 1.06 1.31 1.49 1.6 1.34 1.24 1.81 1.51 1.43 2.95 2.35 2.75
1.59 1.43 0.97 1.0 2.75 3.35 1.27 2.98 1.5 1.24 1.7 2.04 3.08 8.52 3.74 2.36 1.78 1.49 1.69 1.37 1.6 2.53 2.18 2.76 1.96 2.06 1.89 2.09 4.21 3.55 6.45
3.58 4.04 4.47 4.67 7.8 8.29 6.01 6.16 5.77 5.83 6.34 6.52 9.05 14.2 10.95 8.63 6.74 7.73 7.63 6.09 7.09 6.24 7.79 6.31 7.21 7.12 7.33 6.22 9.32 8.73 10.52
11.07 12.97 12.51 13.54 18.38 19.03 17.61 23.42 11.72 10.05 10.71 13.32 23.46 36.19 27.31 13.69 16.31 22.6 13.75 14.22 14.3 14.59 22.15 13.5 14.31 14.35 14.71 14.03 17.27 17.11 23.53
7.32 7.07 5.02 5.53 14.12 14.46 7.04 6.34 7.32 7.96 7.48 8.59 14.6 19.56 18.26 11.12 9.16 8.98 8.88 8.28 9.53 9.08 12.39 9.52 9.16 10.27 9.62 10.87 10.57 10.41 15.61
1.33 1.09 1.22 0.83 2.23 3.07 3.82 5.74 1.66 1.89 1.57 1.86 5.94 9.52 5.89 2.54 2.44 5.09 2.88 2.12 1.95 2.81 5.96 2.67 2.31 2.51 2.11 2.36 2.97 2.91 5.32
2.3 3.06 2.79 2.29 2.94 3.91 2.78 2.98 2.81 2.64 2.9 2.82 2.46 9.64 6.6 3.13 3.07 2.83 5.98 3.37 3.17 2.68 3.46 3.44 2.33 3.22 3.04 1.99 5.26 5.07 8.75
0.19 3.77 3.02 2.04 6.84 8.43 3.72 6.87 6.66 5.72 5.8 6.24 9.19 29.44 16.26 9.26 6.62 7.53 9.64 4.57 4.09 5.47 6.35 5.69 4.63 3.42 4.15 4.95 9.95 12.49 25.16
3.96 4.57 3.42 3.06 6.52 6.6 4.96 6.36 4.44 4.2 4.72 4.51 4.76 9.12 7.46 5.01 4.37 4.98 5.77 4.33 5.04 4.83 5.83 4.8 5.19 5.08 5.01 4.41 7.23 6.68 8.39
0.67 0.76 0.64 0.69 1.24 1.01 0.45 0.49 0.49 0.58 0.87 0.8 0.62 2.8 2.11 0.84 0.82 1.05 1.34 0.73 0.93 0.89 1.38 0.88 0.92 0.98 0.91 0.65 1.98 1.91 2.6
6.02 6.04 7.68 8.01 11.33 11.89 12.75 14.23 8.81 9.17 11.06 9.05 16.18 20.41 17.05 10.24 8.71 15.75 11.13 10.13 8.78 10.4 15.35 10.09 8.97 9.4 9.28 8.85 11.28 12.23 19.06
4.44 4.88 4.74 5.67 8.65 7.9 5.35 5.08 5.73 5.73 6.31 5.71 6.65 11.81 9.72 6.17 5.67 8.65 5.79 5.22 5.67 5.57 6.39 5.29 5.12 5.75 5.81 5.13 8.81 7.54 8.89
14.44 11.33 10.69 9.7 19.98 19.46 12.0 12.77 12.85 13.21 14.19 14.48 21.51 24.9 21.64 14.75 14.95 15.87 14.1 14.02 14.81 15.9 16.61 16.99 15.02 14.92 14.11 17.76 16.93 17.26 20.68
1.15 1.22 1.74 1.36 1.88 3.02 2.81 3.94 1.89 1.84 2.57 2.01 2.2 10.85 6.29 1.52 1.06 1.8 3.81 1.5 1.9 2.48 0.77 3.04 2.43 1.84 1.34 0.96 3.19 3.92 4.78
17.91 29.94 15.36 24.88 27.06 27.4 42.56 58.01 33.3 22.53 41.78 28.82 20.04 213.46 110.46 29.18 29.15 3.06 33.48 35.7 31.76 44.21 1.42 34.57 26.04 33.73 51.46 16.61 52.26 49.83 80.31
4.53 4.96 4.21 4.1 7.15 6.61 4.93 5.38 4.6 4.85 5.02 5.12 5.41 10.04 8.11 6.0 4.83 4.31 5.35 4.31 4.46 4.75 6.95 4.73 4.58 5.12 5.48 4.53 6.88 6.77 8.61
26.42 26.97 25.48 31.83 64.06 74.58 45.88 58.96 30.52 38.96 36.43 52.79 105.04 158.48 101.81 68.23 66.12 75.39 54.6 53.99 60.31 61.09 70.88 72.97 67.06 63.53 52.13 63.56 93.83 71.81 108.44
5.76 8.19 9.3 9.18 13.48 12.97 8.72 9.14 9.38 8.97 9.7 8.84 8.1 24.79 19.71 11.55 8.54 11.53 8.89 6.44 7.68 8.71 14.7 7.9 6.66 8.36 9.72 4.49 14.21 14.44 19.65
1.85 1.6 1.06 1.05 2.41 2.58 1.58 2.04 1.44 1.38 1.5 1.97 3.15 6.56 4.21 2.54 2.24 1.55 2.05 1.5 1.99 1.93 2.77 2.04 1.94 1.96 1.81 2.17 3.47 2.62 4.27
0.59 0.85 0.95 0.86 2.14 1.66 0.63 0.87 1.11 1.05 1.27 1.14 1.31 3.87 3.13 1.43 1.02 1.94 1.21 0.94 1.02 0.88 1.47 0.98 1.05 1.23 1.05 0.78 1.93 1.95 2.36
5.02 4.6 4.58 4.86 7.27 6.57 4.92 5.11 5.67 5.17 6.42 5.29 5.89 10.87 8.84 5.77 4.67 5.09 5.4 4.91 5.03 5.08 6.62 5.24 5.02 5.04 5.86 4.77 6.79 6.6 8.65
2.42 2.64 2.13 2.25 4.99 4.67 3.61 4.13 2.61 2.28 2.67 2.69 4.17 8.32 6.2 3.95 2.91 4.8 3.43 3.4 3.49 3.05 2.71 2.84 2.73 3.4 3.22 3.01 4.71 4.38 6.11
9.51 10.31 8.57 7.73 12.09 13.42 8.36 11.54 7.42 9.29 9.55 9.68 17.8 22.62 16.45 10.51 10.63 9.83 9.98 8.22 10.53 10.99 15.26 11.79 11.31 10.04 9.2 9.48 18.71 17.21 24.39
5.93 7.31 7.45 6.46 16.78 15.35 9.53 10.39 9.71 8.53 9.77 8.92 10.97 37.02 24.27 14.38 11.6 20.77 12.39 8.77 10.81 11.12 13.35 9.15 11.08 11.73 12.34 9.75 20.51 20.8 21.25
3.63 3.94 3.25 3.43 6.66 7.07 7.64 7.23 6.24 6.65 6.6 6.21 7.39 15.01 12.03 6.55 6.53 6.33 6.53 5.76 5.42 6.07 4.9 5.85 5.78 6.04 6.29 5.21 8.85 8.37 9.38
1.39 1.09 1.77 1.38 1.65 2.24 1.64 1.42 1.46 1.47 1.51 1.33 2.12 3.77 2.75 2.14 1.79 2.01 1.87 1.36 1.13 1.32 2.14 1.42 1.3 1.47 1.59 1.26 2.25 2.45 3.89
3.12 3.53 3.07 3.26 5.41 6.03 4.09 3.86 4.17 4.25 4.54 3.79 3.68 8.67 7.98 4.59 3.84 3.03 3.89 3.06 3.76 3.8 6.8 3.63 3.71 3.62 3.89 2.77 5.47 5.44 7.52
16.91 17.16 17.15 21.15 25.4 23.49 20.45 23.08 19.79 20.07 22.32 21.03 24.87 34.62 28.99 22.62 20.99 25.09 19.28 17.94 18.48 19.51 21.46 18.47 19.32 20.85 20.14 19.26 25.34 24.65 28.06
1.81 1.13 0.8 0.65 1.78 1.96 2.84 4.11 1.41 1.31 1.59 1.78 3.09 5.27 3.92 2.03 2.26 3.01 2.39 2.11 1.93 2.01 4.25 2.13 2.14 2.23 2.05 1.94 2.72 2.5 4.1
7.15 6.85 4.67 4.2 7.64 9.4 6.76 9.98 5.16 5.66 5.77 8.16 10.32 17.88 12.84 7.91 7.95 4.26 7.36 6.58 7.68 8.55 10.18 9.87 8.68 8.15 5.88 8.25 12.54 10.96 15.62
6.51 7.69 6.86 7.8 14.04 13.9 10.52 11.88 10.64 10.33 11.69 9.45 11.78 20.83 18.08 10.52 9.7 13.32 10.52 9.47 9.6 8.55 10.36 10.02 9.55 9.51 10.67 8.56 13.69 13.32 15.55
2.62 2.48 2.1 3.31 5.05 4.54 3.37 3.17 3.43 3.76 3.95 3.39 4.24 6.55 5.96 3.79 3.15 3.22 3.46 2.91 3.08 3.2 4.34 2.72 3.01 3.53 3.6 3.22 4.46 4.37 5.71
4.22 4.83 4.62 5.25 9.68 8.84 5.78 5.64 5.48 5.28 6.0 5.11 7.43 14.67 11.54 6.89 5.74 9.32 6.0 5.02 5.38 5.24 8.77 5.15 5.28 5.6 5.95 5.04 8.61 7.73 9.33
2.69 3.6 2.68 4.85 8.02 9.42 7.97 11.08 5.37 5.55 5.48 5.69 8.39 18.72 14.95 7.06 6.27 6.08 6.54 4.17 5.67 5.51 4.62 5.64 6.2 6.71 6.27 5.43 9.38 8.81 12.31
254.57 199.47 185.97 145.83 415.75 381.17 306.5 338.58 260.83 246.32 268.84 278.34 315.79 823.94 688.03 298.75 361.0 528.89 453.74 324.36 294.55 321.06 449.76 292.17 271.02 348.12 300.99 334.39 414.2 434.64 476.38
12.9 14.95 12.28 13.19 18.21 17.63 17.14 19.99 13.02 14.33 13.03 14.52 23.99 29.87 26.84 17.56 17.53 19.72 15.33 15.0 14.76 14.29 17.08 16.05 14.66 16.75 15.68 14.72 16.58 15.93 21.7
10.51 9.69 9.28 11.46 13.08 15.13 10.43 12.56 11.69 12.07 13.02 12.95 16.35 27.43 17.33 12.5 11.68 8.9 13.13 11.7 12.41 13.35 9.4 14.5 11.93 12.26 11.78 12.19 16.9 16.98 25.38
24.09 24.41 24.22 26.82 44.24 39.55 30.9 32.34 26.58 30.89 33.8 31.61 33.78 63.16 55.72 33.35 28.83 50.0 30.77 24.87 24.27 29.57 28.55 26.58 25.89 29.53 28.68 24.87 40.01 37.09 47.93
0.36 0.15 0.06 0.08 0.27 0.37 0.25 0.15 0.17 0.18 0.04 0.19 0.55 0.82 1.14 0.22 0.24 0.05 0.12 0.11 0.15 0.27 0.99 0.46 0.29 0.28 0.14 0.34 0.99 0.67 0.71
0.61 0.35 0.47 0.31 0.49 1.4 0.68 0.4 0.39 0.37 0.53 0.48 0.92 2.83 2.9 0.82 0.6 0.59 1.1 0.63 0.9 0.68 1.55 0.63 0.58 0.79 0.52 0.75 2.57 2.22 2.5
4.76 4.87 4.26 5.35 7.39 8.16 6.83 6.69 5.43 6.22 6.81 6.0 6.05 11.78 10.18 6.41 5.77 7.6 6.49 5.43 5.49 5.81 7.5 6.25 5.62 6.62 6.9 4.55 7.87 8.15 10.12
1.73 1.9 1.73 1.54 3.27 3.52 1.95 2.15 1.9 2.09 2.2 2.35 2.73 4.99 3.69 2.44 2.11 2.54 2.67 1.89 2.26 2.45 3.76 2.39 2.37 2.5 2.26 2.04 3.11 2.97 5.13
12.06 15.04 9.4 8.75 20.64 25.31 20.89 17.25 16.29 17.07 17.22 16.84 15.81 50.24 37.75 21.74 17.01 19.5 23.7 16.36 16.73 16.46 17.48 14.88 17.29 18.65 17.28 14.41 23.48 19.87 23.38
5.04 5.42 4.7 6.16 10.48 9.76 6.23 5.6 6.04 6.74 7.22 5.99 7.97 13.12 12.12 7.73 6.84 9.05 7.08 6.16 6.0 6.26 9.23 6.03 6.5 6.14 7.15 6.49 8.78 8.93 10.78
4.73 4.03 2.63 2.37 6.02 6.81 4.16 6.01 3.84 4.31 4.62 5.7 7.59 13.91 8.74 5.7 5.54 3.88 5.22 3.83 5.56 5.95 6.5 6.32 6.05 5.61 4.69 5.38 8.99 8.27 13.19
1.73 2.03 2.47 3.86 6.0 4.79 3.08 2.54 4.14 4.53 4.33 4.1 3.76 9.43 8.02 3.82 3.72 6.98 4.28 3.39 3.32 3.61 4.82 3.04 3.14 3.51 4.11 2.77 5.9 5.17 6.95
7.5 7.31 9.11 11.52 12.25 13.88 12.64 15.13 9.47 10.07 11.37 10.13 14.67 25.52 17.66 11.84 11.7 13.57 10.71 9.98 9.67 10.61 15.43 10.53 10.06 11.11 11.13 10.46 14.36 13.41 16.22
1.64 1.72 1.53 1.19 3.01 3.91 1.67 1.94 1.9 1.76 1.99 1.7 2.28 6.2 4.96 2.15 2.07 3.19 2.24 2.22 2.46 2.45 2.59 2.23 1.94 2.37 1.73 2.08 3.65 3.68 4.8
10.26 12.99 9.03 10.94 23.01 28.92 21.63 18.12 14.38 15.95 15.32 13.92 18.62 50.61 43.81 20.97 17.54 20.51 18.05 14.7 13.47 15.23 18.48 14.0 14.24 17.21 16.64 9.38 22.85 21.93 28.5

Details

Raw expression values (TPM normalized), Green cells indicate low expression and red high. (Dark gray cells indicate missing values)