Heatmap: Cluster_83 (Lactuca sativa (Lsa) Coexpression Clusters (HCCA Algorithm))

View as: (view raw or row-normalized)

View using InCHLib : here ( Experimental feature, still under development)

(Values are log₂ transformed ratios of a genes expression in a sample divided by the mean expression level)

Gene	Light: 268 uE m-2 s-1	Light: 202.5 uE m-2 s-1 (Control)	Light: 135 uE m-2 s-1	Light: 67.5 uE m-2 s-1	Photoperiod: L24	Photoperiod: L20D4 (Control)	Photoperiod: L12D12	Photoperiod: L8D16	RBW: 4:1:1 (Control)	RBW: 4:1:0	RBW: 3:1:1	RBW: 3:1:0	Nitrogen: 0%	Nitrogen: 25%	Nitrogen: 50%	Nitrogen: 100% (Control)	Nitrogen: 150%	Phosphorous: 0%	Phosphorous: 25%	Phosphorous: 50%	Phosphorous: 100% (Control)	Phosphorous: 150%	Potassium: 0%	Potassium: 25%	Potassium: 50%	Potassium: 100% (Control)	Potassium: 150%	Temperature: 20°C	Temperature: 25°C (Control)	Temperature: 30°C	Temperature: 35°C
Lsat_1_v5_gn_0_6901.1 (SAND)	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	4.12	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	2.27	-	-	3.13
Lsat_1_v5_gn_0_960.1	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	4.95	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-
Lsat_1_v5_gn_1_100941.1 (TOR)	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	4.95	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-
Lsat_1_v5_gn_1_15280.1	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	4.95	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-
Lsat_1_v5_gn_1_42540.1	0.82	-	-	-0.24	-	1.43	-0.55	1.67	-0.69	-0.3	0.54	-	-	1.81	-	1.52	0.52	0.4	-	-	1.59	-	-	-0.59	-	-0.5	-	-	2.25	-0.62	-
Lsat_1_v5_gn_1_61800.1 (UAH)	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	4.95	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-
Lsat_1_v5_gn_1_75200.1	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	1.48	-	-	-	2.11	1.47	-	-	-	2.58	-	1.67	-	3.18	-	-	1.54	-	-	-
Lsat_1_v5_gn_1_91041.1 (Hsp70-2)	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	4.95	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-
Lsat_1_v5_gn_1_9140.1	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	4.33	-	-	-	3.44	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-
Lsat_1_v5_gn_1_97901.1 (POLH)	-	-	-	-	-	-	-	-0.38	2.39	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	3.73	-	0.42	-	-	-	0.21	0.65	0.05	1.43	1.97
Lsat_1_v5_gn_2_101280.1 (ROPGEF5)	-	-1.99	-0.38	-1.03	-2.19	-1.68	-3.29	-0.63	0.56	-0.78	0.87	0.31	0.09	0.36	0.98	-0.59	0.53	1.15	0.14	0.24	0.54	0.08	0.84	-0.85	-1.15	-0.6	-0.17	-2.27	1.08	0.57	0.59
Lsat_1_v5_gn_2_114901.1 (DEK3)	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	4.95	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-
Lsat_1_v5_gn_2_119880.1 (UGT73B4)	-	-	-	-	-	-	-	-	2.38	0.16	0.28	-	-	-	-	-	1.26	2.75	-	-	2.83	-	-	-	-	-	-	-	1.91	0.15	1.22
Lsat_1_v5_gn_2_29280.1 (CYP71)	-	-	-	-	-	2.86	1.23	-	1.01	-	-	-	0.89	-	-	-	2.29	-	-	0.65	2.27	-	-	0.77	-	-	1.0	-	-	-	1.34
Lsat_1_v5_gn_2_63001.1	-	-	-	-	2.01	0.12	-	-	-	-	-	-	-	-	0.45	2.28	-	2.75	-	-	3.53	-	-	-	-	-	-	-	0.4	-	-
Lsat_1_v5_gn_3_116540.1	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	4.95	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-
Lsat_1_v5_gn_3_118680.1 (HLQ)	-	-	-	-	-	1.82	-	-	-	-	-	-	-	4.54	2.05	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-
Lsat_1_v5_gn_3_129221.1 (SPT16)	-	-	-	-	1.62	2.59	-	-	-	-	-	-	-	2.23	-	-	-	-	-	-	3.54	2.47	-	-	-	-	-	-	-	-	-
Lsat_1_v5_gn_3_133701.1 (U11/U12-65K)	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	4.95	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-
Lsat_1_v5_gn_3_134220.1	-	-	-	-	-	-	-	1.18	-	1.91	-	0.84	-	3.68	1.19	1.26	-	-	0.78	-	-	-	0.99	-	-	-	-	0.99	-	-	-
Lsat_1_v5_gn_3_32901.1 (DIM)	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	3.12	-	-	3.3	-	-	-	-	3.64	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-
Lsat_1_v5_gn_3_52440.1	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	4.95	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-
Lsat_1_v5_gn_3_76901.1	0.55	-0.57	-	-	0.09	-0.8	-	-	0.59	-	-0.36	-	-0.28	1.75	-	-0.43	-0.68	0.32	-	1.23	-	-	2.33	0.92	-	-	2.37	-0.93	-0.53	1.29	-
Lsat_1_v5_gn_4_107900.1	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	4.95	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-
Lsat_1_v5_gn_4_132261.1 (EOL1)	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	0.79	-	-	3.66	-	-	1.59	0.68	0.71	-	-	-	1.77	-	-	-	-	-	1.88	-	1.73
Lsat_1_v5_gn_4_137040.1 (ARI8)	0.78	-	-	-	0.89	-0.14	-	-	-	1.47	-	0.83	-	-	2.52	0.15	-	-	-	-	2.28	1.14	-	-	0.23	1.6	-	-	-	-	1.95
Lsat_1_v5_gn_4_159541.1 (AHL3)	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	4.95	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-
Lsat_1_v5_gn_4_167801.1 (PFA4)	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	4.95	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-
Lsat_1_v5_gn_4_17100.1	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	4.95	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-
Lsat_1_v5_gn_4_24880.1 (PUT5)	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	4.09	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	3.8	-	-	-
Lsat_1_v5_gn_4_42520.1 (RUK)	-	-	1.3	-	0.59	-	-0.07	0.87	-	-	-0.28	-	0.3	-0.95	0.46	-	-0.29	0.41	-	-1.49	2.2	1.54	2.13	-0.41	-0.32	-	-	-1.25	-0.23	-0.39	1.22
Lsat_1_v5_gn_4_68941.1 (PAT15)	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	4.95	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-
Lsat_1_v5_gn_5_105161.1	2.07	-	-	2.01	-	-	-	-	1.98	-	-	-	-	3.93	-	-	-	-	-	1.83	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-
Lsat_1_v5_gn_5_134021.1 (TADA)	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	4.14	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	2.79	2.69	-	-
Lsat_1_v5_gn_5_142400.1	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	4.95	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-
Lsat_1_v5_gn_5_158920.1 (MLO11)	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	4.95	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-
Lsat_1_v5_gn_5_168661.1 (HTA6)	-	-	-	-	1.43	-	-	-	-	-	-	-	2.71	-	-	-	1.44	-	-	-	2.73	-	-	-	-	-	-	2.55	-	-	2.72
Lsat_1_v5_gn_5_17301.1 (THO6)	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	4.95	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-
Lsat_1_v5_gn_5_33481.1	0.32	0.3	-0.73	-0.42	0.22	-1.02	0.1	-0.21	-0.96	-1.08	-	0.44	0.74	-1.87	-0.08	-0.22	0.1	-0.32	0.35	-0.37	0.57	0.64	-2.04	0.55	1.86	-1.45	-	-0.61	-0.26	-0.42	1.36
Lsat_1_v5_gn_5_36040.1 (PHS1)	-	-	-	-	-	-	-	1.58	-	1.6	-	-	-	3.79	-	-	-	-	-	-	-	-	2.56	-	-	-	-	-	-	-	2.4
Lsat_1_v5_gn_5_38441.1 (ABCF2)	-	-	-	-	-	2.07	-	-	1.65	-	-	0.49	-	-	1.85	-	1.54	-	-	-	2.37	1.6	-	0.48	-	0.57	-	-	1.52	0.84	-
Lsat_1_v5_gn_5_45420.1	-	-	-	-	-	-	0.77	-	1.8	-	2.82	-	-	3.75	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	1.84	-	0.76
Lsat_1_v5_gn_5_52000.1 (OPS)	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	4.12	-	-	-	-	-	-	-	-	3.76	-	-	-	-	-	-	-	-
Lsat_1_v5_gn_5_56341.1 (DCA1)	0.49	-	-	-	-0.13	-	-	-	-	-	-	-	-	2.82	0.31	-	-	-0.14	-	0.92	-	-	3.01	-	-	-	2.33	1.8	-	0.07	-
Lsat_1_v5_gn_5_75221.1	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	4.95	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-
Lsat_1_v5_gn_5_77280.1 (SMU2)	0.6	-1.47	-	0.15	1.5	0.87	0.99	-1.51	-	-0.72	-1.64	1.37	-	-1.33	0.82	-1.4	-0.48	-	1.85	-1.9	1.82	0.72	-	-0.17	-	1.29	0.22	-	-1.61	-1.46	-
Lsat_1_v5_gn_6_114800.1 (NAP5)	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	1.71	2.37	-	-	3.74	2.62	-	-	-	-	-	-	-	-	1.6
Lsat_1_v5_gn_6_40681.1 (NAC095)	-	-	-	-	-	-	2.94	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	3.04	-	-	3.92	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-
Lsat_1_v5_gn_6_61600.1 (PHE2)	-1.39	-1.89	-	0.09	-0.84	-2.73	-0.66	0.01	0.23	-0.82	0.32	0.52	0.5	0.39	-0.81	-0.02	0.42	0.68	-1.24	1.3	0.33	-2.99	-	-0.28	0.36	-0.9	0.48	-0.69	0.93	1.47	0.76
Lsat_1_v5_gn_7_1120.1	2.21	-	-	-	0.6	-	-	-	-	-	-	-	-	3.45	-	-	2.03	2.97	-	-	0.97	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-
Lsat_1_v5_gn_7_17601.1 (CYP71A23)	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	4.95	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-
Lsat_1_v5_gn_7_19581.1 (IEN1)	-	-	-	1.26	-	1.71	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	3.28	-	-	3.57	-	-	-	-	-	-	-	-	1.9	-
Lsat_1_v5_gn_7_25060.1 (CAT3)	-	-1.35	0.38	-	1.11	1.11	-0.76	0.45	-1.61	1.22	-1.44	-0.77	0.37	0.17	0.54	-0.35	-0.69	0.35	-0.15	-0.06	1.37	0.14	-	-1.21	-	-2.84	0.37	0.05	-0.37	1.6	-0.72
Lsat_1_v5_gn_7_37661.1	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	3.58	-	-	1.99	-	-	-	-	-	-	3.91	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-
Lsat_1_v5_gn_7_40200.1 (HSP91)	-	-	-	-	-	-	-	2.37	-	-	2.34	2.07	-	-	-	-	2.01	-	-	-	3.02	-	-	-	-	-	-	-	-	2.15	-
Lsat_1_v5_gn_7_4280.1 (RS41)	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	4.95	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-
Lsat_1_v5_gn_7_67680.1 (ELF5)	-	-	-	3.34	-	-	-	-	-	-	-	-	-	4.38	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-
Lsat_1_v5_gn_7_76960.1 (RPL14)	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	4.95	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-
Lsat_1_v5_gn_7_81460.1 (UGT85A2)	-	-	-	-	-	-	-	1.26	-	-	0.37	0.19	1.45	-	-	-	-	0.11	-	0.02	2.56	1.41	-	-	-	1.8	-	-	1.79	-	2.56
Lsat_1_v5_gn_7_82461.1 (WNK9)	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	1.42	-	3.41	-	-	-	1.19	1.25	-	-	3.7	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-
Lsat_1_v5_gn_8_106460.1	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	4.95	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-
Lsat_1_v5_gn_8_114121.1 (SAE2)	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	4.34	-	-	3.43	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-
Lsat_1_v5_gn_8_24661.1 (PSD2)	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	4.95	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-
Lsat_1_v5_gn_8_43401.1 (TRS85)	-	-	-	-	1.07	-	-	-	-	-	-	-	-	3.0	-	-	1.73	2.55	-	-	2.45	1.94	-	-	-	-	-	1.29	-	-	-
Lsat_1_v5_gn_8_81780.1 (ftsh9)	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	4.95	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-
Lsat_1_v5_gn_8_90401.1	-	-	-	-	1.67	-	-	-	-	-	-	-	-	3.08	-	-	-	-	-	-	-	1.83	3.3	-	-	-	1.5	-	-	-	1.66
Lsat_1_v5_gn_8_95561.1 (UPL1)	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	4.95	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-
Lsat_1_v5_gn_8_97340.1 (AUXILIN-LIKE4)	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	4.95	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-
Lsat_1_v5_gn_9_118200.1	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	4.95	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-
Lsat_1_v5_gn_9_119901.1	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	4.95	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-
Lsat_1_v5_gn_9_122621.1	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	4.27	-	-	-	-	-	-	-	3.54	-	-
Lsat_1_v5_gn_9_13820.1 (XLG3)	0.85	-	-	-1.61	0.28	-2.01	0.39	-2.03	1.37	0.16	0.81	-0.06	-1.89	0.59	-0.15	-0.13	-0.87	0.53	0.23	0.51	1.45	1.25	-	-0.45	-0.41	0.67	-0.11	-0.27	-1.91	-2.02	-0.37
Lsat_1_v5_gn_9_2700.1	-3.43	-0.86	0.22	-0.32	-1.7	-0.4	-0.01	-0.35	-1.0	-0.74	0.22	0.76	0.46	0.09	0.25	0.24	-0.47	0.44	1.18	0.61	-0.07	-1.58	-0.78	-1.3	-0.2	-0.13	-0.98	0.14	0.49	1.15	0.69
Lsat_1_v5_gn_9_46561.1 (NUDX24)	-	-	-	-	-	-0.64	-	0.48	-1.76	-0.48	0.77	-0.58	-0.49	-1.4	1.2	-0.33	-	0.52	-	0.55	1.37	-0.3	-0.32	-1.66	-0.62	1.54	-0.39	-1.49	-0.47	1.82	2.34
Lsat_1_v5_gn_9_58381.1	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	1.03	4.72	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	1.4
Lsat_1_v5_gn_9_67901.1 (POK2)	-	-	-	-	-	-	1.71	-	-	-	-	-	-	3.0	-	-	-	-	-	-	-	2.53	2.05	-	-	-	-	1.7	-	-	2.71
Lsat_1_v5_gn_9_76821.1	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	4.95	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-

Details

Dark gray cells indicate values where the raw expression is zero (cannot be log-transformed). Blue cells indicate samples where the expression of the gene is below average and red cells indicate the gene is expressed above average in the sample. White cells are average.