1. Home
  2. Tools
  3. Expression Heatmap
  4. Results

Heatmap: Cluster_185 (Lactuca sativa (Lsa) Coexpression Clusters (HCCA Algorithm))

View as: (view raw or zlog-transformed)

View using InCHLib : here ( Experimental feature, still under development)

(Values are normalized against highest expression of the row)

 Transpose table  Download table
Gene
Light: 268 uE m-2 s-1
Light: 202.5 uE m-2 s-1 (Control)
Light: 135 uE m-2 s-1
Light: 67.5 uE m-2 s-1
Photoperiod: L24
Photoperiod: L20D4 (Control)
Photoperiod: L12D12
Photoperiod: L8D16
RBW: 4:1:1 (Control)
RBW: 4:1:0
RBW: 3:1:1
RBW: 3:1:0
Nitrogen: 0%
Nitrogen: 25%
Nitrogen: 50%
Nitrogen: 100% (Control)
Nitrogen: 150%
Phosphorous: 0%
Phosphorous: 25%
Phosphorous: 50%
Phosphorous: 100% (Control)
Phosphorous: 150%
Potassium: 0%
Potassium: 25%
Potassium: 50%
Potassium: 100% (Control)
Potassium: 150%
Temperature: 20°C
Temperature: 25°C (Control)
Temperature: 30°C
Temperature: 35°C
0.31 0.3 0.29 0.33 0.46 0.4 0.44 0.45 0.3 0.37 0.39 0.37 0.91 0.66 0.55 0.41 0.39 0.5 0.39 0.38 0.39 0.37 0.51 0.44 0.39 0.39 0.38 0.36 0.5 0.51 1.0
0.23 0.18 0.18 0.19 0.31 0.24 0.23 0.2 0.28 0.29 0.28 0.33 0.67 0.67 0.43 0.26 0.26 0.45 0.22 0.23 0.24 0.27 0.47 0.25 0.27 0.28 0.27 0.29 0.44 0.45 1.0
0.4 0.4 0.37 0.54 0.59 0.62 0.54 0.54 0.5 0.51 0.52 0.53 0.77 0.72 0.6 0.57 0.49 0.49 0.53 0.43 0.5 0.52 0.62 0.5 0.55 0.56 0.51 0.48 0.65 0.66 1.0
0.22 0.27 0.17 0.21 0.39 0.45 0.36 0.46 0.33 0.33 0.37 0.36 0.75 0.63 0.5 0.43 0.42 0.38 0.38 0.35 0.35 0.38 0.57 0.4 0.4 0.39 0.38 0.36 0.51 0.54 1.0
0.31 0.34 0.28 0.31 0.61 0.56 0.45 0.43 0.39 0.43 0.45 0.45 0.75 0.59 0.57 0.48 0.45 0.43 0.46 0.44 0.39 0.41 0.45 0.44 0.46 0.43 0.42 0.41 0.5 0.5 1.0
0.32 0.32 0.38 0.59 0.6 0.57 0.46 0.45 0.5 0.54 0.47 0.5 0.76 0.89 0.69 0.54 0.5 0.52 0.52 0.49 0.43 0.48 0.6 0.47 0.43 0.51 0.49 0.41 0.61 0.61 1.0
0.07 0.09 0.08 0.14 0.23 0.28 0.29 0.33 0.19 0.2 0.15 0.27 0.58 0.77 0.57 0.33 0.36 0.35 0.29 0.3 0.27 0.3 0.47 0.34 0.32 0.27 0.22 0.25 0.58 0.5 1.0
0.38 0.4 0.36 0.33 0.6 0.53 0.37 0.41 0.41 0.49 0.5 0.51 0.82 0.87 0.71 0.47 0.43 0.55 0.5 0.44 0.43 0.46 0.72 0.49 0.47 0.46 0.43 0.47 0.65 0.63 1.0
0.43 0.42 0.52 0.54 0.52 0.42 0.39 0.34 0.46 0.43 0.49 0.48 0.67 0.77 0.71 0.55 0.48 0.53 0.46 0.37 0.41 0.44 0.53 0.48 0.45 0.43 0.5 0.34 0.52 0.68 1.0
0.28 0.4 0.23 0.29 0.54 0.54 0.34 0.37 0.37 0.45 0.49 0.48 0.84 0.78 0.59 0.54 0.49 0.4 0.45 0.39 0.38 0.42 0.49 0.44 0.43 0.46 0.44 0.41 0.6 0.66 1.0
0.42 0.46 0.5 0.65 0.68 0.56 0.49 0.44 0.56 0.58 0.62 0.6 0.96 0.73 0.65 0.64 0.6 0.54 0.47 0.5 0.5 0.52 0.64 0.49 0.51 0.52 0.51 0.57 0.62 0.67 1.0
0.19 0.2 0.19 0.17 0.3 0.29 0.24 0.28 0.3 0.29 0.24 0.31 0.71 0.53 0.39 0.29 0.3 0.48 0.26 0.24 0.28 0.3 0.34 0.34 0.31 0.32 0.29 0.25 0.43 0.48 1.0
0.27 0.27 0.33 0.33 0.44 0.45 0.35 0.41 0.35 0.4 0.41 0.42 0.71 0.6 0.54 0.42 0.39 0.32 0.42 0.37 0.35 0.37 0.52 0.37 0.38 0.37 0.32 0.32 0.5 0.56 1.0
0.18 0.22 0.15 0.19 0.43 0.42 0.24 0.36 0.22 0.26 0.25 0.32 0.48 0.73 0.51 0.32 0.31 0.29 0.32 0.23 0.29 0.3 0.57 0.37 0.31 0.31 0.26 0.26 0.61 0.58 1.0
0.41 0.49 0.46 0.71 0.71 0.65 0.6 0.53 0.57 0.55 0.59 0.56 0.69 0.83 0.73 0.58 0.61 0.53 0.59 0.52 0.47 0.54 0.87 0.48 0.51 0.52 0.55 0.48 0.7 0.76 1.0
0.24 0.27 0.28 0.33 0.49 0.37 0.25 0.3 0.33 0.35 0.38 0.38 0.56 0.61 0.56 0.38 0.37 0.32 0.32 0.29 0.31 0.33 0.48 0.34 0.33 0.34 0.3 0.29 0.47 0.57 1.0
0.29 0.26 0.31 0.39 0.44 0.46 0.37 0.37 0.39 0.45 0.46 0.49 0.66 0.68 0.54 0.41 0.41 0.57 0.42 0.44 0.39 0.4 0.55 0.41 0.46 0.48 0.4 0.39 0.53 0.64 1.0
0.27 0.27 0.21 0.2 0.37 0.34 0.35 0.35 0.35 0.36 0.32 0.33 0.66 0.6 0.56 0.36 0.35 0.43 0.38 0.34 0.31 0.32 0.49 0.37 0.32 0.31 0.32 0.28 0.45 0.54 1.0
0.09 0.09 0.08 0.09 0.25 0.17 0.13 0.13 0.16 0.16 0.17 0.15 0.6 0.4 0.32 0.18 0.17 0.37 0.13 0.13 0.16 0.19 0.4 0.2 0.16 0.15 0.2 0.11 0.2 0.3 1.0
0.2 0.2 0.14 0.2 0.41 0.38 0.31 0.28 0.29 0.28 0.25 0.25 0.91 0.65 0.65 0.28 0.26 0.47 0.37 0.33 0.27 0.33 0.42 0.32 0.31 0.32 0.3 0.27 0.38 0.34 1.0
0.24 0.18 0.17 0.15 0.44 0.37 0.2 0.25 0.29 0.31 0.35 0.42 0.7 0.63 0.59 0.29 0.34 0.45 0.35 0.38 0.31 0.34 0.58 0.35 0.33 0.3 0.31 0.31 0.41 0.49 1.0
0.25 0.18 0.16 0.2 0.37 0.34 0.27 0.45 0.26 0.26 0.26 0.27 0.78 0.68 0.56 0.36 0.34 0.41 0.27 0.3 0.29 0.36 0.39 0.31 0.33 0.33 0.23 0.31 0.5 0.41 1.0
0.24 0.33 0.22 0.23 0.39 0.38 0.26 0.27 0.28 0.25 0.22 0.29 0.61 0.8 0.57 0.35 0.34 0.31 0.35 0.23 0.31 0.31 0.49 0.28 0.31 0.31 0.23 0.33 0.56 0.5 1.0
0.15 0.17 0.09 0.13 0.26 0.26 0.19 0.26 0.16 0.16 0.19 0.24 0.65 0.58 0.39 0.28 0.27 0.29 0.18 0.2 0.24 0.25 0.43 0.27 0.26 0.23 0.21 0.27 0.44 0.48 1.0
0.31 0.28 0.24 0.23 0.43 0.41 0.33 0.36 0.32 0.35 0.37 0.34 0.87 0.74 0.63 0.37 0.35 0.53 0.45 0.32 0.34 0.34 0.55 0.36 0.34 0.33 0.33 0.33 0.44 0.6 1.0
0.2 0.22 0.17 0.27 0.38 0.34 0.3 0.24 0.29 0.31 0.38 0.3 0.55 0.66 0.48 0.4 0.31 0.38 0.39 0.31 0.26 0.29 0.4 0.27 0.28 0.27 0.3 0.25 0.41 0.5 1.0
0.06 0.08 0.08 0.13 0.17 0.17 0.17 0.17 0.22 0.23 0.2 0.22 0.48 0.59 0.41 0.22 0.21 0.3 0.23 0.2 0.17 0.18 0.37 0.23 0.25 0.16 0.18 0.13 0.4 0.35 1.0
0.52 0.42 0.38 0.44 0.65 0.62 0.53 0.51 0.5 0.52 0.52 0.54 0.88 0.89 0.78 0.55 0.51 0.65 0.51 0.49 0.53 0.53 0.76 0.46 0.56 0.52 0.53 0.59 0.66 0.67 1.0
0.14 0.17 0.26 0.4 0.56 0.43 0.29 0.25 0.39 0.37 0.43 0.44 0.57 0.56 0.66 0.39 0.35 0.45 0.42 0.38 0.33 0.3 0.49 0.35 0.32 0.37 0.34 0.33 0.4 0.51 1.0
0.16 0.18 0.19 0.17 0.46 0.42 0.26 0.21 0.3 0.29 0.37 0.37 0.66 0.57 0.47 0.39 0.32 0.48 0.28 0.32 0.28 0.28 0.46 0.3 0.29 0.28 0.28 0.29 0.41 0.46 1.0
0.24 0.31 0.28 0.34 0.46 0.46 0.39 0.42 0.36 0.43 0.43 0.47 0.67 0.75 0.58 0.45 0.45 0.45 0.49 0.4 0.39 0.42 0.63 0.39 0.44 0.44 0.41 0.37 0.57 0.61 1.0
0.2 0.23 0.17 0.18 0.46 0.44 0.35 0.46 0.25 0.25 0.27 0.29 0.89 0.7 0.5 0.37 0.35 0.44 0.25 0.25 0.32 0.33 0.48 0.36 0.35 0.34 0.29 0.34 0.41 0.39 1.0
0.23 0.28 0.25 0.3 0.53 0.48 0.38 0.45 0.46 0.44 0.54 0.54 0.86 0.58 0.51 0.46 0.5 0.38 0.42 0.44 0.41 0.47 0.3 0.47 0.48 0.5 0.44 0.41 0.55 0.6 1.0
0.39 0.44 0.45 0.55 0.6 0.48 0.37 0.32 0.5 0.51 0.55 0.5 0.7 0.69 0.6 0.5 0.47 0.54 0.46 0.44 0.41 0.43 0.55 0.42 0.44 0.46 0.43 0.43 0.64 0.71 1.0
0.28 0.29 0.29 0.45 0.52 0.43 0.44 0.46 0.4 0.43 0.44 0.44 0.63 0.71 0.62 0.52 0.46 0.44 0.46 0.39 0.41 0.41 0.58 0.44 0.41 0.42 0.41 0.4 0.6 0.67 1.0
0.27 0.29 0.27 0.28 0.47 0.45 0.33 0.36 0.36 0.35 0.37 0.38 0.77 0.71 0.58 0.39 0.35 0.3 0.38 0.33 0.33 0.37 0.4 0.37 0.36 0.36 0.35 0.33 0.45 0.5 1.0
0.09 0.13 0.14 0.11 0.19 0.22 0.12 0.15 0.22 0.19 0.2 0.32 0.53 0.58 0.35 0.32 0.29 0.35 0.18 0.19 0.23 0.24 0.56 0.21 0.26 0.22 0.25 0.29 0.41 0.44 1.0
0.34 0.37 0.33 0.36 0.55 0.52 0.39 0.34 0.44 0.5 0.5 0.54 0.81 0.75 0.61 0.54 0.51 0.38 0.44 0.44 0.39 0.44 0.55 0.42 0.47 0.47 0.44 0.46 0.64 0.66 1.0
0.11 0.08 0.05 0.04 0.21 0.21 0.07 0.14 0.2 0.13 0.18 0.25 0.71 0.42 0.24 0.2 0.21 0.31 0.2 0.16 0.17 0.14 0.17 0.21 0.21 0.23 0.18 0.15 0.32 0.42 1.0
0.25 0.27 0.25 0.23 0.45 0.48 0.34 0.41 0.29 0.34 0.34 0.34 0.81 0.82 0.55 0.34 0.34 0.56 0.36 0.33 0.35 0.36 0.46 0.37 0.39 0.35 0.36 0.34 0.5 0.5 1.0
0.28 0.26 0.33 0.42 0.55 0.44 0.3 0.21 0.44 0.44 0.5 0.49 0.8 0.75 0.8 0.46 0.45 0.4 0.4 0.39 0.34 0.37 0.74 0.44 0.39 0.35 0.37 0.37 0.44 0.63 1.0
0.25 0.23 0.18 0.19 0.34 0.36 0.28 0.38 0.27 0.28 0.29 0.29 0.81 0.48 0.43 0.33 0.37 0.43 0.34 0.3 0.37 0.35 0.42 0.36 0.34 0.35 0.34 0.29 0.38 0.41 1.0
0.27 0.34 0.31 0.29 0.46 0.47 0.31 0.37 0.35 0.36 0.33 0.39 0.58 0.74 0.58 0.39 0.39 0.44 0.38 0.31 0.38 0.41 0.42 0.44 0.39 0.36 0.36 0.33 0.61 0.58 1.0
0.34 0.35 0.41 0.66 0.6 0.47 0.43 0.34 0.45 0.47 0.59 0.5 0.67 0.79 0.72 0.52 0.46 0.53 0.44 0.49 0.46 0.52 0.71 0.38 0.45 0.49 0.51 0.4 0.62 0.72 1.0
0.36 0.44 0.54 0.61 0.64 0.53 0.5 0.43 0.51 0.65 0.66 0.62 0.71 0.82 0.72 0.63 0.65 0.61 0.59 0.53 0.55 0.51 0.79 0.53 0.52 0.63 0.51 0.55 0.62 0.74 1.0
0.28 0.26 0.3 0.34 0.47 0.43 0.38 0.37 0.41 0.42 0.49 0.46 0.76 0.51 0.52 0.37 0.42 0.41 0.4 0.39 0.39 0.42 0.37 0.46 0.45 0.45 0.4 0.35 0.51 0.6 1.0
0.17 0.18 0.14 0.17 0.36 0.51 0.39 0.4 0.35 0.34 0.38 0.36 0.8 0.47 0.43 0.41 0.36 0.36 0.35 0.31 0.37 0.35 0.32 0.37 0.38 0.36 0.36 0.3 0.43 0.42 1.0
0.28 0.29 0.23 0.3 0.41 0.46 0.38 0.38 0.38 0.42 0.38 0.41 0.67 0.8 0.64 0.44 0.44 0.42 0.4 0.34 0.37 0.42 0.47 0.42 0.39 0.42 0.4 0.37 0.6 0.64 1.0
0.15 0.16 0.14 0.13 0.26 0.23 0.2 0.19 0.29 0.29 0.28 0.31 0.63 0.4 0.32 0.29 0.3 0.37 0.23 0.23 0.24 0.23 0.53 0.33 0.33 0.28 0.26 0.29 0.38 0.47 1.0
0.16 0.2 0.16 0.21 0.3 0.33 0.25 0.3 0.21 0.24 0.21 0.28 0.55 0.51 0.37 0.31 0.3 0.28 0.25 0.24 0.25 0.25 0.5 0.26 0.28 0.26 0.25 0.24 0.41 0.45 1.0
Lsat_1_v5_gn_9_109381.1 (ATPI4K ALPHA)
 0.46 0.5 0.47 0.52 0.75 0.6 0.47 0.4 0.59 0.6 0.63 0.59 0.81 0.77 0.68 0.62 0.6 0.53 0.57 0.51 0.5 0.54 0.75 0.51 0.55 0.58 0.56 0.56 0.73 0.78 1.0
0.13 0.18 0.14 0.16 0.38 0.51 0.39 0.46 0.31 0.36 0.39 0.41 0.7 0.55 0.54 0.43 0.39 0.36 0.34 0.38 0.36 0.41 0.47 0.42 0.38 0.39 0.43 0.33 0.43 0.5 1.0
0.15 0.21 0.18 0.18 0.39 0.38 0.21 0.26 0.3 0.29 0.3 0.31 0.55 0.85 0.52 0.32 0.28 0.43 0.36 0.27 0.28 0.32 0.43 0.25 0.26 0.32 0.28 0.24 0.48 0.52 1.0
0.14 0.15 0.11 0.1 0.35 0.37 0.23 0.22 0.19 0.22 0.19 0.21 0.38 0.74 0.57 0.28 0.23 0.37 0.32 0.19 0.2 0.21 0.5 0.24 0.21 0.24 0.24 0.17 0.57 0.48 1.0
0.12 0.13 0.12 0.19 0.32 0.27 0.17 0.17 0.21 0.27 0.27 0.26 0.65 0.49 0.42 0.28 0.24 0.37 0.24 0.24 0.27 0.24 0.42 0.25 0.26 0.23 0.24 0.2 0.4 0.41 1.0
0.23 0.24 0.21 0.23 0.39 0.43 0.35 0.39 0.33 0.39 0.38 0.38 0.7 0.53 0.41 0.38 0.36 0.27 0.34 0.34 0.32 0.36 0.35 0.36 0.35 0.37 0.33 0.34 0.45 0.53 1.0

Details

Expression values normalized per gene (using the maximum value, Green cells indicate low expression and red high. (Dark gray cells indicate missing values)