Heatmap: Cluster_190 (Lactuca sativa (Lsa) Coexpression Clusters (HCCA Algorithm))

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(Values are log2 transformed ratios of a genes expression in a sample divided by the mean expression level)

Gene
Light: 268 uE m-2 s-1
Light: 202.5 uE m-2 s-1 (Control)
Light: 135 uE m-2 s-1
Light: 67.5 uE m-2 s-1
Photoperiod: L24
Photoperiod: L20D4 (Control)
Photoperiod: L12D12
Photoperiod: L8D16
RBW: 4:1:1 (Control)
RBW: 4:1:0
RBW: 3:1:1
RBW: 3:1:0
Nitrogen: 0%
Nitrogen: 25%
Nitrogen: 50%
Nitrogen: 100% (Control)
Nitrogen: 150%
Phosphorous: 0%
Phosphorous: 25%
Phosphorous: 50%
Phosphorous: 100% (Control)
Phosphorous: 150%
Potassium: 0%
Potassium: 25%
Potassium: 50%
Potassium: 100% (Control)
Potassium: 150%
Temperature: 20°C
Temperature: 25°C (Control)
Temperature: 30°C
Temperature: 35°C
-2.09 -1.25 -1.81 -1.04 -1.08 -1.27 -0.77 -1.25 0.11 -0.27 0.29 -0.01 1.11 0.48 0.41 -0.26 -0.4 1.62 -0.92 -0.52 -0.67 -0.77 -0.03 -0.55 -0.31 -0.21 -1.43 -0.88 -0.09 0.97 2.14
-4.59 -5.0 -6.66 -2.77 -2.18 -3.18 -1.76 -2.34 -0.34 -0.15 0.4 0.63 1.28 0.22 0.93 -0.25 0.17 1.47 -0.5 0.09 -0.56 -1.02 0.84 0.01 0.04 -0.7 -1.19 -1.17 -0.45 0.38 2.27
-0.96 -1.19 -1.31 -0.59 -0.32 -0.43 -0.78 -0.56 -0.06 0.23 -0.04 0.16 -0.2 0.84 0.76 0.13 -0.24 0.81 -0.14 -0.41 -0.44 -0.39 0.16 -0.21 0.17 -0.01 -0.05 -0.6 0.47 0.59 1.08
-0.79 -0.69 -0.76 -0.43 0.15 -0.0 -0.18 -0.06 -0.24 -0.11 -0.08 -0.06 0.28 0.51 0.51 0.01 -0.22 0.53 0.11 -0.19 -0.13 -0.04 0.15 -0.19 -0.37 0.17 0.04 -0.2 0.17 0.18 0.67
-1.43 -0.94 -1.2 -0.61 -0.05 -0.26 -1.16 -0.12 -0.41 -0.59 -0.1 0.0 -0.14 1.12 0.87 -0.14 -0.53 0.94 -0.01 -0.22 -0.51 -0.26 0.98 -0.42 -0.22 -0.05 -0.1 -1.02 0.21 0.41 1.15
-0.95 -0.09 -0.85 -0.03 0.42 -0.11 -1.36 -0.71 -0.47 -0.17 -0.49 -0.99 -0.3 1.38 1.16 -0.08 -0.51 1.2 -0.13 0.12 -0.62 -0.47 1.23 -0.9 -0.96 -0.6 -0.28 -0.87 -0.14 -0.17 0.77
-0.85 -0.38 -1.22 -0.31 0.32 -0.22 -0.94 -1.78 -0.48 -0.42 -0.67 -0.62 -0.06 1.05 0.79 0.01 -0.95 1.47 0.22 -0.51 -0.91 -0.92 1.49 -0.67 -0.66 -0.86 -0.32 -0.85 -0.05 0.45 1.32
-0.5 -0.72 -0.86 -0.55 0.17 0.18 -0.16 0.14 -0.56 -0.52 -0.28 -0.34 0.41 0.73 0.68 -0.09 -0.22 1.0 -0.15 -0.3 -0.23 -0.2 0.4 -0.24 -0.11 -0.16 -0.12 -0.42 0.31 0.05 0.56
-1.39 -0.12 -0.55 -0.71 -0.93 -0.82 -0.63 -0.3 -0.61 -0.62 -0.31 -0.35 -0.11 0.77 0.89 -0.21 -0.21 1.26 0.3 -0.21 -0.24 -0.84 1.08 -0.35 -0.53 -0.41 -0.33 -1.2 0.61 0.42 1.27
-1.21 -1.28 -0.94 -0.31 -0.62 -0.41 -0.44 -0.38 -0.4 -0.05 -0.07 0.01 0.8 0.93 0.63 0.08 0.16 -0.16 -0.18 -0.04 0.02 -0.38 1.11 0.17 -0.06 -0.36 -0.24 -0.28 -0.15 0.07 0.75
-3.0 - -2.27 -1.26 -1.72 -1.67 -1.45 -2.29 -0.95 0.08 -0.05 0.11 1.42 0.91 0.4 -0.91 -0.66 1.96 -1.36 -0.52 -0.99 -1.63 -1.7 0.13 -0.27 -0.82 -1.34 -1.75 -0.19 0.56 2.75
-0.42 -0.66 -0.53 -0.43 -0.17 0.06 -0.54 -0.22 -0.6 -0.81 -0.56 -0.56 -0.16 0.69 0.52 -0.24 -0.53 1.26 0.68 -0.03 0.04 0.01 0.29 -0.11 0.0 0.05 -0.11 -0.24 0.14 0.2 0.5
- - - - -1.06 -2.92 - - -1.11 -1.56 -1.97 -0.82 1.3 0.83 1.33 -0.41 -0.81 2.1 -4.35 -0.53 -1.86 -0.53 0.86 0.14 -0.99 -2.73 -1.61 -3.19 -0.6 0.3 3.14
-3.47 - - - -2.67 -5.66 -6.35 -4.73 -1.04 -1.01 -0.38 -0.06 1.34 0.71 1.56 -0.94 -0.6 2.13 -1.51 -0.67 -1.74 -1.21 1.2 -0.02 -1.24 -2.17 -1.99 -3.6 -0.5 0.12 2.91
-1.62 -1.25 -1.35 -1.07 -0.61 -0.69 -0.78 -0.43 -0.04 0.14 -0.02 0.32 0.04 0.82 0.83 -0.44 -0.18 1.03 -0.15 -0.41 -0.4 -0.5 0.64 -0.13 -0.2 -0.3 -0.19 -0.87 0.23 0.53 1.55
- -0.77 - - -0.69 -0.13 -3.4 - -5.09 -2.18 - -4.98 1.66 2.25 1.27 -1.9 -2.75 2.48 -1.11 -4.12 -2.85 - 0.17 -1.74 -3.48 -3.5 -2.59 - -1.64 -0.75 3.14
- - - - - - - - - - - - - - - - - 2.88 - - - - 1.82 - - - - - - - 4.33
-1.43 -0.84 -0.94 -0.94 0.04 -0.36 -0.6 -0.42 -0.67 -0.46 0.01 -0.02 0.78 1.18 0.75 -0.22 -0.43 1.08 -0.39 -0.35 -0.97 -1.08 1.49 -0.76 -0.48 -0.76 -0.97 -1.05 -0.04 0.02 1.52
-0.46 -0.54 -0.57 -0.53 -0.17 0.05 -0.36 -0.03 -0.4 -0.31 -0.17 -0.64 0.04 0.68 0.3 -0.17 -0.39 0.89 -0.02 0.04 -0.06 0.03 0.44 -0.16 -0.15 0.14 0.24 -0.26 0.2 0.29 0.54
-0.85 -0.97 -0.75 -0.54 0.3 -0.17 -0.36 0.03 -0.33 -0.01 0.01 -0.37 -0.02 0.91 0.55 -0.42 -0.28 1.06 -0.09 -0.35 -0.53 -0.3 0.48 -0.4 -0.31 -0.38 -0.27 -0.8 0.28 0.48 1.14
-1.63 -1.28 -1.04 -0.98 -0.56 -0.77 -0.13 0.36 -0.2 0.0 0.09 0.15 -0.02 0.85 0.82 -0.01 -0.09 0.78 -0.14 -0.31 -0.57 -0.43 0.36 -0.4 -0.45 -0.61 -0.56 -0.86 0.51 0.66 1.47
-0.95 -0.28 -0.44 -1.27 0.39 0.09 -1.15 -1.56 0.17 0.08 0.11 -0.87 -0.55 1.3 1.08 -0.09 -0.29 0.8 0.03 -0.68 -0.32 -0.98 0.47 -1.01 -0.85 -0.35 -0.28 -2.12 0.72 0.71 1.18
-1.04 -1.11 -0.98 -1.32 -0.19 -0.39 -0.67 -0.52 -0.06 -0.3 -0.05 -0.03 0.73 1.01 0.73 -0.16 -0.03 0.59 -0.32 0.05 -0.26 -0.45 0.89 -0.07 0.22 -0.19 -0.08 -0.44 -0.25 0.02 0.98
-3.42 -5.82 -4.62 -2.11 0.01 -0.41 -0.63 -0.82 -0.18 -0.05 -0.15 0.19 -0.14 1.19 1.08 -0.38 -0.49 1.46 -0.14 -0.15 -0.58 -0.36 0.75 -0.4 -0.33 -0.19 0.21 -0.68 0.42 0.28 1.33
-2.84 -4.39 -2.78 -2.03 -0.44 -0.9 -0.34 -0.95 0.05 0.07 0.21 0.35 0.16 0.75 0.9 -0.45 -0.71 0.86 -0.21 0.15 -0.48 -0.07 0.67 -0.09 0.09 -0.53 0.1 -1.15 0.39 0.24 1.84
- - - - - - - - - - - - - - - - - 3.68 - - - - - 2.92 - - - - - - 3.41
- - - 0.14 - -2.29 -2.1 - -0.38 - - 0.05 0.15 - -1.07 - -0.03 2.82 - - -1.47 - 0.65 -1.32 -0.76 -0.09 - - 0.39 0.88 3.46
-0.53 0.13 -0.41 -0.08 0.04 -0.54 -0.73 -0.34 -0.61 -0.45 -0.44 -0.45 -0.68 1.03 0.64 -0.52 -0.62 1.13 0.19 -0.47 -0.63 -0.49 1.33 -0.51 -0.44 -0.33 -0.56 -0.97 0.47 0.5 0.87
-1.17 -1.17 -1.11 -0.82 -0.09 0.05 -0.09 0.57 -0.3 -0.43 -0.16 -0.6 0.72 0.25 0.61 -0.19 0.16 1.45 -0.24 -0.02 -0.41 -0.13 0.24 -0.76 -0.37 -0.13 -0.44 -0.38 0.21 -0.02 0.9
-1.07 -0.72 -0.75 -0.38 0.13 0.23 0.02 0.26 -0.58 -0.21 -0.26 -0.2 0.44 0.55 0.63 -0.08 -0.06 0.92 0.03 -0.18 -0.15 -0.26 0.12 -0.47 -0.27 -0.07 -0.32 -0.33 0.24 -0.01 0.74
-1.48 -0.84 -1.24 -3.48 -0.49 0.05 -0.07 0.06 -1.29 -0.51 -0.29 -0.67 1.09 1.08 0.22 -0.68 0.27 2.05 -0.83 -0.63 -0.96 -0.8 0.92 -0.63 -0.37 -0.41 -0.96 -0.21 0.13 -0.49 1.23
-1.52 -1.03 -1.42 -1.63 -0.08 0.09 -0.37 0.33 -0.51 -0.52 -0.33 -0.6 1.36 0.43 0.49 -0.32 0.21 1.53 -0.46 -0.37 -0.67 -0.29 0.77 -0.78 -0.7 -0.04 -0.62 -0.59 0.25 -0.49 1.23
-0.71 -0.48 -0.39 -0.32 0.12 -0.09 -0.31 -0.17 -0.01 0.18 0.25 0.18 0.2 0.41 0.37 -0.16 -0.08 0.13 -0.13 -0.13 -0.32 -0.15 -0.03 -0.05 -0.21 0.01 0.06 -0.65 0.22 0.41 0.78
1.09 - - 0.96 0.47 - - - - - - - - - - - 1.94 2.31 - - - - - - - - -0.22 - 0.83 -0.07 3.72
-3.16 -2.46 -1.75 -0.94 -1.89 -2.19 -2.53 -2.33 -1.36 -1.19 -0.32 -1.14 0.87 2.02 1.64 -0.6 -0.67 1.83 -0.35 -0.98 -1.38 -1.94 0.95 -1.1 -0.79 -1.05 -1.46 -2.09 -0.77 0.03 2.46
-1.07 -0.91 -0.65 -0.24 0.19 0.2 -0.11 0.13 -0.39 -0.31 -0.32 -0.37 0.15 0.93 0.64 0.12 -0.23 0.91 0.04 -0.14 -0.24 -0.12 0.31 -0.21 -0.33 -0.09 -0.1 -0.58 0.19 -0.02 0.48
-2.1 -2.09 -2.46 -2.62 -0.86 -0.51 -1.81 -1.83 -0.91 -1.18 -0.12 -0.52 1.94 0.06 0.52 -0.56 -0.26 1.62 -2.5 -0.37 -0.53 -1.1 1.16 0.09 -0.64 -1.09 -1.46 -1.47 -0.68 0.46 2.5
-0.53 -0.61 -0.42 -0.36 -0.13 -0.18 0.03 0.13 -0.56 -0.48 -0.34 -0.43 0.07 0.72 0.52 -0.04 0.07 0.96 -0.16 -0.12 -0.2 -0.08 0.24 -0.36 -0.36 -0.13 -0.21 -0.34 0.56 0.26 0.66
- - - - - - - - - - - - - - - - - 3.88 - - - - - - - - - - - - 4.02
-3.84 -1.11 -1.46 -2.25 0.13 -0.75 -1.07 -0.68 -0.58 -0.52 -0.34 -0.67 0.32 1.47 1.51 -0.77 -0.59 1.63 -0.57 -0.96 -1.08 -1.99 1.75 -1.12 -1.55 -0.79 -1.59 -2.49 0.44 0.6 1.61
- - -4.16 - -2.2 -1.9 -1.6 -4.6 -0.96 -2.0 -0.96 -0.98 0.98 -0.91 -0.08 -1.35 -0.32 2.6 -1.82 -4.71 -1.05 -1.92 1.45 -0.98 -1.22 -1.27 -1.7 - -0.32 0.53 3.31
-2.2 -1.92 -1.77 -1.7 -0.35 -0.38 -0.52 -0.15 -0.69 -0.75 -0.52 -0.77 0.01 1.85 1.12 -0.19 -0.73 1.4 0.19 -0.74 -1.05 -0.98 0.57 -0.61 -0.72 -0.46 -0.3 -0.88 0.37 0.51 1.63
-1.26 -1.28 -1.27 -1.2 -0.09 -0.16 -1.08 -0.49 -0.23 -0.27 -0.07 -0.27 -0.3 0.95 0.66 -0.15 -0.32 1.34 0.29 -0.19 -0.6 -0.51 0.99 -0.41 -0.37 -0.54 -0.42 -0.78 0.29 0.48 1.41
-1.7 -0.96 -0.59 -0.48 -0.29 -0.68 -0.71 -0.63 -0.44 -0.21 -0.27 -0.05 0.54 0.85 0.87 0.15 0.25 1.25 -0.39 -0.3 -0.51 -0.7 0.52 -0.1 -0.27 -0.18 -0.13 -0.87 0.02 0.31 1.17
-1.63 -1.33 -1.08 0.09 -0.9 -0.41 -0.93 -0.53 0.09 -0.48 -0.25 0.01 0.16 0.67 0.7 -0.44 -0.29 1.36 -0.31 -0.47 -0.46 -0.63 1.26 -0.2 -0.38 -0.81 -0.55 -0.67 0.38 0.58 1.36
-0.8 -0.79 -1.25 -1.11 -0.12 -0.02 0.09 0.12 -0.03 -0.1 -0.01 -0.27 -0.8 1.24 0.64 -0.31 -0.66 0.89 -0.29 -0.52 -0.52 -0.42 0.45 -0.37 -0.28 -0.2 -0.13 -0.93 0.87 0.83 0.63
-1.45 -1.29 -1.39 -1.1 -0.54 -0.11 -0.66 -0.53 -0.44 -0.37 -0.72 -0.5 0.11 1.51 1.14 -0.11 -0.2 0.93 0.13 -0.35 -0.39 -0.37 0.71 -0.23 -0.21 -0.66 -0.46 -1.43 0.48 0.53 1.28
-1.61 -1.38 -1.25 -0.64 -0.05 -0.2 -0.44 -0.68 -0.08 -0.22 -0.16 -0.33 0.32 0.84 0.67 -0.19 -0.13 1.22 -0.16 -0.35 -0.36 -0.5 1.1 -0.59 -0.35 -0.37 -0.56 -0.35 -0.03 0.34 1.33
-1.12 -1.11 -0.64 -0.32 0.25 -0.17 -0.8 -0.9 -0.13 -0.07 -0.06 -0.2 -0.33 0.5 0.74 -0.1 -0.67 1.4 -0.41 -0.67 -0.63 -0.4 1.2 -0.65 -0.73 -0.54 -0.31 -0.96 0.44 0.74 1.2
-0.63 -0.5 -0.43 -0.37 0.02 0.02 -0.02 0.03 -0.11 -0.01 -0.02 -0.02 0.22 0.4 0.19 -0.03 -0.17 0.49 0.0 -0.21 -0.35 -0.29 0.48 -0.18 -0.19 -0.13 -0.12 -0.43 0.22 0.35 0.73
-1.75 -1.17 -1.03 -1.0 -0.18 -0.65 -0.6 -0.82 -0.3 -0.43 0.15 0.09 0.74 1.15 0.75 -0.28 -0.11 1.25 -0.66 -0.35 -0.38 -0.8 0.22 -0.15 -0.49 -0.37 -0.35 -0.77 -0.21 0.41 1.69
- - - - - - - - - - 2.88 - - - - - 1.79 2.53 - - - - - - - - - - - - 3.85
-3.23 -2.11 -1.1 -1.44 -1.0 -1.68 -0.92 -2.18 -0.56 -0.09 0.0 -0.12 1.21 0.83 0.79 -0.25 0.35 1.72 -1.46 -0.51 -1.94 -1.47 -1.36 -0.29 -0.91 -0.62 -0.96 -1.02 0.41 0.93 2.37
-5.4 - -4.42 -2.57 -1.18 -2.22 -1.56 -3.43 -1.09 -0.38 -0.08 -0.24 1.33 1.12 1.43 -0.29 0.45 0.94 -0.08 0.77 0.02 -0.63 0.89 -0.03 -0.04 -0.57 -0.72 -1.2 -1.52 0.01 1.99
-0.65 -0.64 -0.58 -0.23 0.19 0.28 -0.03 0.28 -0.61 -0.58 -0.28 -0.23 0.2 0.56 0.35 0.09 -0.13 0.89 -0.02 -0.22 -0.21 -0.31 0.3 -0.24 -0.24 -0.07 -0.02 -0.2 0.23 0.13 0.49
-1.04 -1.68 -0.5 -0.15 -0.0 -0.22 -0.44 -0.27 -0.18 -0.11 -0.11 0.1 0.37 0.84 0.66 -0.25 -0.26 1.26 -0.21 -0.43 -0.25 -0.55 0.67 -0.42 -0.33 -0.6 -0.31 -0.66 0.12 0.38 0.89
-1.54 -1.84 -1.71 -1.37 -0.13 0.28 -0.34 0.3 -1.18 -0.73 -0.5 -0.36 0.98 1.09 0.84 0.15 0.02 1.35 0.12 -0.43 -0.4 -0.54 0.07 -0.44 -0.17 -0.32 -0.21 -0.18 -0.05 -0.05 1.02
-2.06 -1.2 -1.76 -2.32 -0.84 -0.67 -0.66 -0.55 -0.68 -0.9 -0.58 -0.25 0.81 1.31 0.92 0.4 0.15 1.23 -0.22 -0.22 -0.46 -0.77 0.43 0.18 -0.18 -0.41 -0.34 -0.73 0.11 0.74 1.3
-1.38 -0.6 -1.3 -1.12 -0.79 -0.42 -0.38 -0.23 -0.23 -0.61 -0.12 -0.13 -0.12 1.06 1.17 -0.38 -0.34 1.5 0.26 -0.58 -0.41 -0.78 0.66 -0.69 -0.53 -1.07 -0.42 -1.24 0.83 0.77 0.96
-2.04 -1.5 -0.92 -1.0 -0.62 -0.9 -1.12 -1.22 -0.23 -0.17 0.01 0.07 0.81 0.65 0.73 -0.2 0.11 1.21 -0.31 -0.34 -0.43 -1.08 -0.82 0.11 -0.33 -0.25 -0.45 -1.14 0.06 0.82 2.05
-1.06 -0.76 -1.04 -0.46 -0.12 -0.28 -0.45 -0.92 0.19 0.44 0.17 0.35 0.08 0.8 0.88 -0.18 -0.16 0.5 0.06 -0.15 -0.39 -0.73 -0.11 -0.46 -0.13 -0.51 -0.58 -0.78 0.27 0.61 1.27
-1.09 -0.91 -0.8 -0.55 0.22 0.2 -0.06 0.06 -0.41 -0.1 -0.44 -0.21 0.36 0.8 0.62 -0.1 -0.09 0.89 -0.2 -0.29 -0.37 -0.2 0.17 -0.32 -0.21 -0.02 -0.2 -0.26 0.3 0.1 0.78
-1.56 -0.22 -1.15 -0.89 -0.38 -0.44 -0.75 -0.13 -0.23 -0.44 0.02 -0.23 -0.22 1.41 0.84 -0.42 -0.25 1.18 -0.25 -0.51 -0.74 -0.68 0.53 -0.23 -0.58 -0.42 -0.31 -1.12 0.69 0.78 1.07
- - - - - - - - - - - - - - - - - 3.75 - - - - 2.51 - - - - - - - 3.57
-3.57 -2.91 -3.68 -5.29 -2.59 -1.17 -1.81 -1.5 -1.08 -0.2 -1.37 -0.51 1.32 2.03 1.56 -0.43 -0.21 0.53 -0.05 -0.45 -0.86 -2.07 1.34 0.05 -0.57 -0.31 -0.69 -2.14 -1.62 0.21 2.18
-1.22 -1.65 -0.92 -1.1 -0.17 -0.03 -0.5 -0.14 0.24 0.27 0.13 0.45 -0.2 0.88 0.97 0.02 -0.19 0.39 0.18 -0.07 -0.22 -0.24 -0.06 -0.5 -0.36 -0.37 -0.16 -0.74 -0.1 0.3 1.27
-1.45 -2.62 -5.59 -2.33 -0.69 -0.48 -1.52 -0.77 -0.39 -1.21 -0.13 -0.43 0.68 1.36 0.62 -0.07 -0.4 1.54 -0.09 -0.28 0.01 -1.0 0.4 -0.39 -0.23 -1.46 -1.5 -0.94 0.36 0.7 2.15
-1.3 -1.02 -1.21 -0.95 0.25 0.06 0.07 0.12 -0.43 -0.54 -0.37 -0.4 -0.23 1.59 1.13 -0.09 -0.12 1.0 0.31 -0.52 -0.51 -0.46 0.43 -0.72 -0.58 -0.47 -0.51 -0.97 -0.17 -0.01 1.06

Details

Dark gray cells indicate values where the raw expression is zero (cannot be log-transformed). Blue cells indicate samples where the expression of the gene is below average and red cells indicate the gene is expressed above average in the sample. White cells are average.