Heatmap: Cluster_162 (Lactuca sativa (Lsa) Coexpression Clusters (HCCA Algorithm))

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(Values are log₂ transformed ratios of a genes expression in a sample divided by the mean expression level)

Gene	Light: 268 uE m-2 s-1	Light: 202.5 uE m-2 s-1 (Control)	Light: 135 uE m-2 s-1	Light: 67.5 uE m-2 s-1	Photoperiod: L24	Photoperiod: L20D4 (Control)	Photoperiod: L12D12	Photoperiod: L8D16	RBW: 4:1:1 (Control)	RBW: 4:1:0	RBW: 3:1:1	RBW: 3:1:0	Nitrogen: 0%	Nitrogen: 25%	Nitrogen: 50%	Nitrogen: 100% (Control)	Nitrogen: 150%	Phosphorous: 0%	Phosphorous: 25%	Phosphorous: 50%	Phosphorous: 100% (Control)	Phosphorous: 150%	Potassium: 0%	Potassium: 25%	Potassium: 50%	Potassium: 100% (Control)	Potassium: 150%	Temperature: 20°C	Temperature: 25°C (Control)	Temperature: 30°C	Temperature: 35°C
Lsat_1_v5_gn_0_25980.1 (TOM20-3)	0.15	0.11	0.09	-0.19	0.14	0.12	0.3	0.35	-0.22	-0.21	-0.2	-0.26	0.44	-0.23	-0.06	0.03	0.05	-0.16	-0.3	-0.14	-0.07	-0.07	0.6	-0.14	0.03	-0.02	-0.02	0.12	-0.19	-0.3	-0.3
Lsat_1_v5_gn_1_102320.1	0.09	0.02	-0.2	-0.81	-0.87	-0.14	0.88	0.8	-0.21	-0.35	-0.52	-0.19	0.32	-0.39	-0.27	0.13	0.28	-0.87	-0.26	-0.02	-0.01	0.13	0.41	0.05	0.23	0.21	-0.07	0.06	-0.23	-0.03	0.12
Lsat_1_v5_gn_2_15001.1 (PP2C74)	0.21	0.39	-0.39	-0.48	0.54	0.49	0.4	0.62	-0.39	-0.38	-0.37	-0.45	-0.21	0.08	0.1	0.04	-0.13	0.19	-0.08	-0.27	-0.13	-0.05	0.54	-0.26	-0.13	-0.11	-0.08	-0.1	-0.04	-0.2	-0.47
Lsat_1_v5_gn_2_76540.1 (HBI1)	0.25	0.28	-0.1	-0.76	-0.35	0.22	0.3	0.28	-0.49	-0.62	-0.53	-0.28	0.46	0.67	-0.13	-0.33	-0.11	-0.24	0.09	-0.36	-0.07	-0.01	1.44	-0.26	-0.13	0.01	-0.12	-0.18	-0.67	-0.7	0.09
Lsat_1_v5_gn_3_113400.1 (CAM6)	0.12	0.49	-0.37	-0.95	0.36	0.33	-0.0	-0.02	-0.55	-0.53	-0.53	-0.67	0.26	0.32	0.41	0.24	0.06	0.27	0.14	-0.1	0.05	0.06	0.31	-0.27	-0.07	0.19	0.03	0.16	-0.14	-0.33	-0.57
Lsat_1_v5_gn_3_1661.1	0.21	0.32	-0.19	-0.38	0.04	0.23	0.15	0.4	-0.49	-0.54	-0.36	-0.3	0.12	0.51	0.48	0.02	-0.08	0.11	-0.12	-0.26	-0.19	-0.02	0.53	-0.08	-0.1	-0.16	-0.03	-0.19	-0.02	-0.18	-0.29
Lsat_1_v5_gn_3_2961.1 (CYP706A7)	1.0	1.69	0.5	0.45	0.07	0.2	0.87	0.87	-1.78	-1.91	-0.77	-1.98	-1.02	-2.73	-2.42	-0.72	-0.91	1.36	-0.93	-1.94	-0.74	-0.75	1.58	-1.61	-0.75	-1.01	-0.68	-1.38	0.7	0.04	0.2
Lsat_1_v5_gn_3_2981.1 (CYP706A7)	0.66	1.72	0.51	0.38	0.22	0.63	0.96	1.21	-1.42	-1.03	-0.64	-1.63	-0.96	-1.66	-1.87	-0.86	-1.0	0.76	-1.05	-2.04	-0.65	-0.79	0.66	-0.58	-0.69	-1.09	-0.65	-0.69	0.88	0.4	0.1
Lsat_1_v5_gn_3_34740.1 (PICC)	0.21	0.29	-0.03	-0.44	0.33	0.4	0.51	0.63	-0.77	-0.79	-0.55	-0.76	-0.03	0.54	0.33	0.17	0.01	-0.15	-0.22	-0.48	-0.14	-0.02	0.42	-0.47	-0.12	-0.07	-0.13	0.08	0.2	-0.12	-0.44
Lsat_1_v5_gn_3_37261.1	-0.59	0.41	-1.87	-2.84	-0.55	0.43	0.73	1.44	-0.78	-1.12	-0.63	-1.25	-0.08	-0.01	0.02	0.15	-0.12	0.27	-0.25	-0.42	-0.22	-0.16	1.66	-0.01	0.03	-0.14	0.02	-0.75	-0.07	0.1	-0.22
Lsat_1_v5_gn_3_70920.1 (AO)	0.42	0.12	-0.73	-1.38	-0.14	0.07	0.7	0.83	-0.41	-0.67	-0.55	-0.58	0.1	-0.34	0.07	0.13	0.04	-0.02	-0.16	-0.3	-0.04	-0.11	1.77	-0.36	-0.08	-0.21	-0.23	0.06	-0.4	-0.54	-0.94
Lsat_1_v5_gn_3_80500.1 (BUL1)	-0.27	-0.21	-0.41	-0.18	-0.19	-0.25	0.59	0.74	0.06	-0.14	0.11	-0.08	0.01	-0.47	-0.16	0.07	0.14	0.14	-0.19	0.0	-0.01	0.03	0.48	-0.16	-0.03	0.05	-0.08	0.0	-0.06	-0.13	-0.14
Lsat_1_v5_gn_3_83740.1 (NUP62)	0.07	-0.01	-1.87	-0.58	-0.62	-0.02	0.39	1.05	-0.09	-0.7	-0.4	0.1	1.26	-0.53	-0.16	-0.41	-0.33	-1.47	-1.43	-0.47	-0.54	-1.17	1.89	-0.23	-0.17	0.14	-0.35	0.01	-0.28	-0.08	0.47
Lsat_1_v5_gn_4_105621.1 (GALT5)	0.57	0.47	0.01	-0.68	0.01	0.05	0.28	0.15	-0.47	-0.38	-0.21	-0.42	0.55	0.5	0.33	-0.02	-0.0	0.45	-0.24	-0.3	-0.3	-0.25	0.2	-0.44	-0.28	-0.06	-0.22	-0.17	-0.21	-0.22	0.13
Lsat_1_v5_gn_4_122501.1 (VAL1)	-1.62	-0.53	-4.62	-3.67	-1.06	-0.18	0.23	1.87	-0.39	-2.4	-1.29	0.07	-0.21	0.54	-0.18	-1.12	0.02	0.08	-0.06	-0.21	-0.71	-0.35	2.3	-1.89	-0.99	-0.86	-0.5	-1.87	0.72	0.67	0.88
Lsat_1_v5_gn_4_123720.1 (CYP82G1)	0.45	0.22	-0.04	-0.74	-0.01	0.77	0.81	1.28	-0.54	-0.88	-0.75	-0.51	0.37	0.54	-0.12	-0.43	-0.35	-2.22	-0.15	-0.67	-0.25	-0.66	1.71	-0.17	-0.47	-0.38	-0.77	-0.66	-0.23	-0.62	-0.56
Lsat_1_v5_gn_4_140321.1 (MEE32)	-0.04	0.24	-0.69	-0.92	-2.32	-1.39	1.43	1.57	-0.38	-0.32	-0.31	-0.23	1.14	-2.25	-1.35	0.02	0.44	-0.69	-0.59	-0.3	-0.27	-0.31	1.74	-0.39	-0.17	-0.04	-0.35	0.43	-2.0	-1.43	-0.75
Lsat_1_v5_gn_4_184621.1 (AtATP23)	0.15	0.38	-0.09	-0.68	0.04	0.16	0.12	0.34	-0.54	-0.29	-0.33	-0.2	0.36	0.36	0.2	0.2	0.04	0.01	0.01	-0.2	-0.12	-0.16	0.28	-0.24	-0.05	-0.09	-0.0	-0.19	-0.09	-0.11	0.07
Lsat_1_v5_gn_4_31520.1 (CCD1)	0.64	0.26	-0.04	-0.38	-0.12	-0.1	0.69	1.02	-0.26	-0.28	-0.29	-0.42	0.03	0.06	-0.03	-0.2	-0.12	-1.33	-0.16	-0.15	-0.15	-0.13	0.84	-0.22	-0.16	-0.12	-0.16	-0.11	-0.01	-0.14	-0.39
Lsat_1_v5_gn_4_3481.1	0.4	0.21	-0.07	-0.29	-0.12	0.07	0.28	0.53	-0.24	-0.37	-0.3	-0.36	-0.05	0.29	0.06	-0.02	-0.16	-0.23	-0.05	-0.06	-0.07	-0.07	0.97	0.01	-0.09	-0.04	0.03	0.0	-0.3	-0.34	-0.68
Lsat_1_v5_gn_4_79260.1	0.42	0.23	-0.32	-0.26	0.21	0.04	0.31	0.39	-0.13	-0.11	-0.25	-0.27	-0.07	-0.28	-0.11	0.08	0.04	-0.37	-0.34	-0.31	-0.13	0.1	0.86	-0.15	0.0	-0.07	-0.1	0.27	-0.11	-0.05	-0.36
Lsat_1_v5_gn_5_131840.1	0.61	0.68	-0.18	-1.02	0.63	0.52	0.26	0.71	-0.72	-0.67	-0.65	-0.85	-0.12	0.86	0.59	-0.27	-0.42	0.09	-0.1	-0.44	-0.36	-0.29	0.34	-0.31	-0.31	-0.28	-0.11	-0.26	0.03	-0.13	-0.48
Lsat_1_v5_gn_5_139061.1	0.54	0.4	0.35	-0.22	-0.04	0.06	0.31	0.37	-0.49	-0.6	-0.39	-0.52	-0.14	0.3	0.22	0.06	-0.02	0.08	0.19	-0.2	-0.22	-0.16	-0.03	-0.29	-0.19	-0.21	-0.02	-0.07	0.05	-0.04	0.08
Lsat_1_v5_gn_5_14040.1 (CYP71A26)	0.89	-0.03	0.79	0.59	-1.57	-0.8	0.43	0.88	-0.89	-0.45	-0.66	-0.1	1.23	-0.94	-0.55	-0.04	0.33	-2.34	-0.76	-0.3	-0.07	-0.27	1.53	-0.37	-0.24	-0.37	-0.25	1.13	-1.92	-2.32	-3.92
Lsat_1_v5_gn_5_145201.1 (OXS3)	0.59	0.46	-0.28	-1.51	-0.19	0.84	0.89	0.6	-0.89	-1.07	-0.85	-1.11	0.32	1.09	0.5	0.04	-0.73	-0.9	0.13	-0.39	0.11	0.24	0.91	-0.67	-0.27	0.15	-0.15	0.33	-0.75	-1.29	-2.52
Lsat_1_v5_gn_5_153560.1	0.57	1.34	-0.72	0.08	-0.51	-0.37	1.56	1.73	-0.34	-0.51	-0.36	-0.67	-0.4	-1.94	-1.72	-0.89	-1.03	0.62	-1.5	-0.83	-0.73	-0.51	0.78	-0.28	-0.21	-0.38	-0.29	-0.31	0.13	0.03	-0.6
Lsat_1_v5_gn_5_164201.1	0.68	0.8	0.18	-0.41	0.34	0.25	-0.19	0.43	-0.73	-0.25	-0.29	-0.07	0.57	0.47	-0.04	0.06	0.04	-0.27	-0.58	-0.54	-0.32	-0.17	-0.56	-0.29	-0.13	-0.01	-0.06	-0.14	-0.43	-0.07	0.17
Lsat_1_v5_gn_5_168820.1 (ADF1)	0.34	0.18	-0.01	-0.17	0.28	0.21	0.13	0.44	-0.26	-0.3	-0.19	-0.26	-0.07	0.13	-0.11	-0.15	-0.18	0.13	-0.25	-0.26	-0.09	0.06	0.08	-0.08	-0.05	-0.06	-0.01	0.08	0.15	0.05	-0.14
Lsat_1_v5_gn_5_33600.1 (VTE1)	0.37	0.08	-0.02	-0.15	-0.31	-0.45	0.31	0.47	-0.12	-0.14	-0.08	0.02	0.21	0.25	0.14	-0.26	-0.01	-0.51	0.07	-0.07	-0.15	-0.14	0.65	0.04	-0.01	-0.18	-0.27	0.01	-0.15	-0.15	-0.12
Lsat_1_v5_gn_5_61080.1 (PGR6)	0.6	0.11	-0.05	-0.34	-0.01	0.36	0.1	0.22	-0.24	-0.23	-0.09	-0.21	-0.19	0.33	0.04	-0.1	-0.14	-1.31	0.08	-0.21	-0.12	0.01	1.2	-0.09	-0.11	-0.13	-0.13	0.04	-0.24	-0.26	-0.55
Lsat_1_v5_gn_6_101381.1 (CEK2)	0.95	0.93	0.12	-0.47	0.3	0.31	0.42	0.36	-0.74	-0.85	-0.71	-0.85	-0.32	1.11	0.54	0.11	-0.23	-0.08	-0.78	-0.72	-0.51	-0.32	0.92	-0.7	-0.52	-0.36	-0.28	-0.19	-0.24	-0.39	-0.55
Lsat_1_v5_gn_6_102081.1 (MUB6)	0.15	0.2	-0.45	-0.51	0.68	0.62	0.44	0.42	-0.22	-0.28	-0.09	-0.31	-0.28	0.63	0.3	-0.1	-0.28	0.42	-0.18	-0.31	-0.25	-0.18	-0.23	-0.37	-0.4	-0.06	-0.11	-0.11	-0.07	-0.04	-0.3
Lsat_1_v5_gn_6_39480.1 (INV-E)	0.24	0.16	-0.06	-0.11	0.16	0.26	0.32	0.59	-0.15	-0.19	-0.04	-0.14	-0.01	0.4	0.09	-0.23	-0.28	-0.87	0.08	-0.28	-0.19	-0.06	0.48	-0.16	-0.19	-0.2	-0.19	-0.18	0.1	-0.01	-0.13
Lsat_1_v5_gn_6_41860.1 (STUbL5)	0.23	0.47	-0.89	-1.56	0.66	0.41	0.46	0.74	-0.53	-0.49	-0.47	-0.83	0.04	0.58	0.48	-0.33	-0.5	0.49	0.17	-0.46	-0.38	-0.25	0.26	-0.08	-0.25	-0.33	-0.26	-0.38	0.12	0.04	0.19
Lsat_1_v5_gn_7_1141.1 (REC1)	-0.44	-0.23	-0.66	-0.65	-0.61	0.01	0.45	0.89	-0.25	-0.21	-0.12	-0.07	0.42	0.3	0.01	0.12	0.2	-1.89	-0.3	-0.18	-0.08	-0.02	0.68	0.04	0.01	0.09	-0.05	0.02	0.08	0.08	0.22
Lsat_1_v5_gn_7_116321.1 (AAP7)	0.6	0.26	0.48	0.01	-0.08	-0.11	0.29	0.29	-0.45	-0.6	-0.56	-0.72	0.56	0.54	0.32	0.2	0.26	0.27	0.01	-0.17	-0.26	-0.21	0.42	-0.62	-0.46	-0.52	-0.48	-0.08	0.03	-0.34	-0.55
Lsat_1_v5_gn_7_12620.1 (NRPA1)	0.61	0.61	0.82	0.44	0.15	0.01	0.17	0.32	-0.64	-0.65	-0.68	-0.58	-0.66	0.09	0.08	-0.34	-0.45	0.82	-0.11	-0.68	-0.99	-0.73	0.76	-0.09	-0.79	-0.51	-0.37	-1.12	0.16	0.27	0.66
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Details

Dark gray cells indicate values where the raw expression is zero (cannot be log-transformed). Blue cells indicate samples where the expression of the gene is below average and red cells indicate the gene is expressed above average in the sample. White cells are average.