Heatmap: Cluster_167 (Lactuca sativa (Lsa) Coexpression Clusters (HCCA Algorithm))

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(Values are log₂ transformed ratios of a genes expression in a sample divided by the mean expression level)

Gene	Light: 268 uE m-2 s-1	Light: 202.5 uE m-2 s-1 (Control)	Light: 135 uE m-2 s-1	Light: 67.5 uE m-2 s-1	Photoperiod: L24	Photoperiod: L20D4 (Control)	Photoperiod: L12D12	Photoperiod: L8D16	RBW: 4:1:1 (Control)	RBW: 4:1:0	RBW: 3:1:1	RBW: 3:1:0	Nitrogen: 0%	Nitrogen: 25%	Nitrogen: 50%	Nitrogen: 100% (Control)	Nitrogen: 150%	Phosphorous: 0%	Phosphorous: 25%	Phosphorous: 50%	Phosphorous: 100% (Control)	Phosphorous: 150%	Potassium: 0%	Potassium: 25%	Potassium: 50%	Potassium: 100% (Control)	Potassium: 150%	Temperature: 20°C	Temperature: 25°C (Control)	Temperature: 30°C	Temperature: 35°C
Lsat_1_v5_gn_0_23901.1	-0.25	-0.16	0.37	0.23	0.31	0.01	-0.54	-0.89	-0.06	0.03	0.21	0.21	0.69	-0.13	-0.16	-0.03	0.01	-0.26	-0.19	-0.07	-0.17	-0.22	-1.44	-0.07	0.04	0.04	-0.02	-0.18	-0.11	0.16	0.95
Lsat_1_v5_gn_0_37201.1	-0.17	0.05	0.39	0.62	-0.18	-0.77	-0.15	-0.35	0.21	0.27	0.18	0.22	0.17	0.2	0.34	0.12	0.19	-1.33	-0.01	-0.18	-0.77	-0.4	-2.14	-0.03	-0.34	-0.05	-0.0	-0.31	0.28	0.49	0.71
Lsat_1_v5_gn_1_53040.1 (TRFL8)	0.66	0.04	0.62	0.19	-0.23	-0.26	-0.26	-0.24	-0.19	-0.22	-0.12	-0.17	-0.05	-0.33	0.06	0.12	0.03	0.05	-0.27	-0.18	-0.33	-0.14	0.69	-0.26	-0.2	-0.27	-0.31	-0.27	0.09	0.18	0.55
Lsat_1_v5_gn_2_101821.1 (FLA17)	-0.01	0.02	-0.19	-0.97	-0.38	-0.43	-0.37	-0.78	-0.45	-0.39	-0.36	-0.11	0.63	0.78	0.54	0.44	0.72	-0.43	0.25	0.07	0.03	0.15	-1.75	-0.05	0.19	0.27	0.17	0.25	-0.29	-0.14	0.06
Lsat_1_v5_gn_2_127881.1	0.3	0.17	0.05	-0.48	-0.34	0.29	-0.65	-0.76	-0.93	-0.7	-0.57	-0.29	0.04	1.63	0.83	0.83	0.71	-1.85	-0.01	-0.29	-0.13	0.24	-3.2	-0.3	-0.09	0.22	0.19	0.4	-0.81	-0.5	-0.43
Lsat_1_v5_gn_2_129780.1 (GT18)	0.08	-0.02	0.29	-0.22	-0.44	-0.51	-0.13	-0.22	-0.5	-0.36	-0.3	-0.14	-0.24	1.26	0.33	0.46	0.63	-0.11	0.16	0.05	0.03	0.22	-2.39	-0.36	-0.08	0.15	0.16	-0.1	0.05	-0.08	-0.54
Lsat_1_v5_gn_2_131941.1	-1.44	-1.05	0.15	0.42	-0.54	-0.58	-0.58	-0.79	-0.26	-0.18	-0.17	-0.06	0.27	1.65	1.16	0.4	0.23	-0.01	0.09	0.03	-0.21	-0.49	-0.85	-0.55	-0.42	0.17	-0.07	-0.69	-0.0	0.02	0.13
Lsat_1_v5_gn_2_24820.1	-0.6	-0.65	0.2	-0.07	0.29	0.76	-0.87	-1.08	-1.01	-0.56	-0.62	-0.46	0.89	0.84	0.53	0.32	0.19	0.57	0.55	-0.22	-0.18	-0.14	-1.13	-0.17	0.09	-0.18	0.09	-0.16	-0.13	-0.55	0.25
Lsat_1_v5_gn_2_35801.1	-0.48	-0.74	0.26	0.09	-0.5	-0.3	-0.51	-0.78	-0.28	-0.15	-0.03	-0.09	0.49	1.01	0.6	0.43	0.43	-1.44	0.1	-0.04	-0.07	0.14	-1.68	-0.12	-0.06	0.13	0.02	0.05	0.01	0.1	0.56
Lsat_1_v5_gn_2_60440.1 (PLP6)	-2.08	-1.88	-0.43	-0.26	0.17	-0.75	-0.46	-1.6	-0.88	-0.46	-0.58	-0.04	0.56	1.64	1.19	-0.24	0.65	0.99	0.49	0.12	-0.1	-0.5	-2.39	-0.11	-0.07	-0.4	-0.69	0.0	-0.07	-0.18	0.62
Lsat_1_v5_gn_2_84081.1	0.45	0.53	0.74	-0.02	-0.28	-0.81	-0.78	0.23	-0.06	0.13	0.11	0.46	1.03	-1.64	-1.27	-0.36	-0.24	-0.5	-0.27	-0.19	-0.48	-0.26	-1.85	0.18	-0.03	-0.08	-0.03	-0.41	-0.37	0.11	1.36
Lsat_1_v5_gn_2_89561.1 (COB)	-0.35	-0.67	-0.24	-0.4	-0.13	-0.02	-0.52	-0.98	-0.49	-0.4	-0.27	-0.27	0.3	1.01	0.48	0.21	0.36	-0.2	0.39	0.0	0.01	0.08	-0.18	-0.23	0.03	0.11	0.13	0.22	0.24	0.18	0.01
Lsat_1_v5_gn_3_104620.1 (TMK1)	0.17	0.06	0.04	-0.37	-0.18	0.12	0.12	0.23	-0.27	-0.24	-0.18	-0.19	0.37	0.56	0.25	0.24	0.14	-0.66	-0.07	-0.22	-0.13	-0.08	-0.14	-0.1	-0.04	-0.0	-0.1	-0.04	-0.06	-0.05	0.23
Lsat_1_v5_gn_3_117520.1	-0.13	-0.12	0.12	-0.01	0.05	-0.03	-0.1	-0.44	-0.1	-0.07	0.06	0.04	0.39	-0.06	0.02	0.2	0.3	-0.92	-0.0	0.1	0.02	0.11	-0.98	-0.08	0.05	0.14	0.15	0.06	0.1	0.17	0.2
Lsat_1_v5_gn_3_123820.1 (KCS20)	0.39	1.36	0.02	0.11	0.52	0.34	0.3	-0.07	-0.97	-0.95	-0.61	-0.58	0.37	0.41	0.48	0.71	0.6	-0.73	-0.07	-0.3	-0.28	-0.11	-1.45	-0.76	-0.42	0.1	0.01	0.04	-0.58	-0.68	-1.33
Lsat_1_v5_gn_3_15780.1 (NPSN11)	0.16	0.05	0.38	0.1	-0.12	-0.13	-0.33	-0.64	-0.23	-0.14	-0.06	-0.01	0.57	0.17	-0.26	0.12	0.26	-0.74	-0.21	-0.1	-0.17	0.03	-1.23	-0.01	0.01	0.27	0.21	0.1	0.07	0.14	0.52
Lsat_1_v5_gn_3_17560.1 (ZP1)	-0.23	0.05	-0.04	-0.26	-1.12	-0.06	0.45	0.91	-0.42	-0.27	-0.18	-0.23	0.24	0.66	0.22	0.89	0.84	-4.01	0.07	0.06	0.01	0.08	-4.44	-0.09	-0.08	0.21	0.35	0.69	-0.74	-0.64	-1.65
Lsat_1_v5_gn_3_35181.1	0.62	0.17	0.7	-0.11	-0.33	-0.14	-0.35	-0.17	-0.32	-0.14	-0.05	-0.02	0.56	-0.39	-0.36	-0.14	0.01	-0.29	0.01	-0.05	-0.25	-0.19	0.15	-0.01	-0.02	-0.04	-0.18	-0.19	-0.22	0.1	0.62
Lsat_1_v5_gn_3_39581.1 (SETH3)	-0.15	-0.2	-0.48	-0.7	-0.07	0.1	-0.14	-0.32	-0.13	-0.05	0.0	-0.07	0.2	0.49	0.27	-0.03	0.04	0.34	0.25	0.15	0.03	0.21	-1.49	0.07	0.11	0.26	0.11	0.14	-0.12	-0.1	0.15
Lsat_1_v5_gn_3_59180.1	-0.63	-0.56	-0.2	0.02	0.02	0.13	-0.22	-0.51	-0.12	-0.15	0.02	-0.06	0.64	0.03	-0.13	0.07	0.11	0.03	-0.1	0.1	-0.0	0.17	-1.39	-0.19	0.22	0.3	0.27	0.0	0.06	0.04	0.71
Lsat_1_v5_gn_3_80440.1 (TRM22)	-1.08	-0.69	-0.02	0.44	0.05	-0.06	-0.6	-1.17	0.08	0.2	0.3	0.14	0.74	-1.01	-0.84	-0.09	-0.14	0.09	-0.59	-0.01	-0.14	-0.11	-0.82	-0.19	0.05	0.24	-0.06	-0.13	0.25	0.41	1.45
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Lsat_1_v5_gn_4_127800.1	-0.35	-0.41	0.28	0.12	0.0	-0.07	-0.75	-1.18	-0.38	-0.19	-0.08	-0.25	0.31	0.92	0.4	0.28	0.43	-0.16	0.22	0.03	-0.1	0.06	-1.46	-0.3	-0.15	0.26	0.2	0.01	0.08	0.19	0.07
Lsat_1_v5_gn_4_132241.1 (FRK5)	-0.03	0.14	0.41	0.65	-0.41	-0.64	0.1	-0.06	0.07	-0.05	0.22	0.31	0.42	-0.68	-0.12	0.38	0.3	-1.49	-0.0	0.05	-0.29	-0.22	-	-0.22	-0.06	-0.0	0.01	-0.23	-0.15	0.61	0.67
Lsat_1_v5_gn_4_158361.1 (CGR3)	0.0	-0.2	0.08	-0.42	-0.45	0.02	0.29	-0.06	-0.64	-0.51	-0.51	-0.44	0.56	0.35	0.05	0.53	0.68	-1.23	0.12	0.1	0.13	0.21	-3.05	0.18	0.17	0.31	0.31	0.58	-0.23	-0.11	-0.3
Lsat_1_v5_gn_4_160900.1 (MEL1)	0.69	-0.15	0.3	-0.55	-0.27	0.11	-0.71	-0.6	-0.67	-0.7	-0.53	-0.71	0.41	1.08	0.39	0.43	0.32	-1.25	-0.02	-0.33	-0.17	0.16	-1.51	0.08	0.25	0.39	0.28	-0.0	-0.13	-0.06	0.34
Lsat_1_v5_gn_4_162541.1 (ANX2)	0.56	0.64	0.37	0.14	-0.32	-0.06	-0.06	-0.49	-0.37	-0.59	-0.26	-0.45	-0.03	0.54	0.48	0.41	0.51	-2.09	0.11	0.04	-0.09	-0.1	-3.24	-0.18	0.09	0.27	0.1	-0.12	0.04	0.11	-0.06
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Lsat_1_v5_gn_4_174860.1 (bZIP42)	0.96	0.9	0.19	0.06	-0.03	0.84	0.44	0.02	-0.47	-1.01	-0.54	-0.67	0.55	1.13	0.62	0.41	0.3	-1.3	-0.24	-0.44	-0.5	-0.86	-2.5	-0.72	-0.59	-0.25	-0.55	0.18	-0.37	-0.71	-0.25
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Lsat_1_v5_gn_4_183821.1 (CXE16)	0.4	0.05	-0.0	-0.24	-0.12	0.01	-0.03	-0.14	-0.29	-0.14	-0.14	-0.14	0.56	-0.04	-0.13	0.06	0.2	-0.19	-0.16	-0.12	0.07	0.05	-0.7	0.08	-0.07	0.02	0.07	0.12	-0.12	0.14	0.41
Lsat_1_v5_gn_4_3300.1 (MAP65-8)	-0.63	0.33	0.72	-0.35	-0.46	-0.38	0.42	-1.2	0.31	0.21	0.28	0.08	0.54	-0.21	-0.27	-0.2	0.34	-0.37	-0.86	-0.28	-0.14	-0.66	-3.26	0.07	0.32	-0.34	-0.32	-0.4	-0.16	0.76	1.28
Lsat_1_v5_gn_4_34601.1	-0.36	-0.25	-0.21	0.05	0.2	0.12	-0.35	-0.27	0.04	-0.0	0.06	0.23	-0.16	0.88	0.65	0.26	0.29	-0.25	-0.06	-0.03	-0.28	0.15	-0.86	-0.57	-0.16	0.04	0.25	-0.03	-0.26	-0.16	-0.14
Lsat_1_v5_gn_4_8180.1 (BIR3)	-1.39	-0.26	-0.3	0.19	-0.05	-0.39	-0.76	-0.94	-0.4	0.22	0.27	0.26	1.25	-0.38	-0.57	0.13	0.23	0.35	-0.34	-0.16	-0.75	-0.31	-2.35	-0.44	-0.33	0.11	-0.28	-0.22	0.51	0.65	1.45
Lsat_1_v5_gn_4_95281.1 (BGAL1)	-0.9	-0.66	0.18	0.18	0.43	-0.47	-1.06	-1.78	0.31	0.36	0.41	0.49	0.45	-0.86	-0.19	0.05	0.24	-0.66	-0.5	-0.05	-0.11	-0.24	-1.57	0.1	0.03	0.17	0.17	-0.51	0.06	0.48	1.36
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Details

Dark gray cells indicate values where the raw expression is zero (cannot be log-transformed). Blue cells indicate samples where the expression of the gene is below average and red cells indicate the gene is expressed above average in the sample. White cells are average.