1. Home
  2. Tools
  3. Expression Heatmap
  4. Results

Heatmap: Cluster_182 (Lactuca sativa (Lsa) Coexpression Clusters (HCCA Algorithm))

View as: (view zlog-transformed or row-normalized)

View using InCHLib : here ( Experimental feature, still under development)

(Showing raw values)

 Transpose table  Download table
Gene
Light: 268 uE m-2 s-1
Light: 202.5 uE m-2 s-1 (Control)
Light: 135 uE m-2 s-1
Light: 67.5 uE m-2 s-1
Photoperiod: L24
Photoperiod: L20D4 (Control)
Photoperiod: L12D12
Photoperiod: L8D16
RBW: 4:1:1 (Control)
RBW: 4:1:0
RBW: 3:1:1
RBW: 3:1:0
Nitrogen: 0%
Nitrogen: 25%
Nitrogen: 50%
Nitrogen: 100% (Control)
Nitrogen: 150%
Phosphorous: 0%
Phosphorous: 25%
Phosphorous: 50%
Phosphorous: 100% (Control)
Phosphorous: 150%
Potassium: 0%
Potassium: 25%
Potassium: 50%
Potassium: 100% (Control)
Potassium: 150%
Temperature: 20°C
Temperature: 25°C (Control)
Temperature: 30°C
Temperature: 35°C
3.49 0.0 0.0 0.0 4.43 2.01 1.9 1.03 0.35 1.03 1.28 0.31 0.99 5.82 7.82 1.83 0.84 53.16 2.29 1.59 2.72 2.82 12.89 3.84 3.56 2.97 2.76 0.64 1.53 0.0 0.0
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.19 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.0 0.04 0.0 0.04 0.28 0.58 0.16 0.12 0.13 0.03 0.0 0.15 0.45 0.46 1.26 0.04 0.06 87.76 0.14 0.16 0.31 0.03 18.2 0.26 0.33 0.0 0.33 0.07 0.13 0.27 0.03
0.0 0.0 0.0 0.0 0.19 0.54 0.04 0.0 0.09 0.14 0.07 0.07 0.47 0.45 0.26 0.04 0.03 30.89 0.0 0.15 0.15 0.0 11.91 0.25 0.29 0.0 0.1 0.11 0.07 0.0 0.0
0.0 0.0 0.0 0.0 0.38 0.15 0.04 0.0 0.03 0.03 0.19 0.07 0.34 0.09 0.11 0.01 0.06 88.97 0.05 0.02 0.12 0.03 46.12 0.47 0.29 0.04 0.08 0.03 0.1 0.05 0.09
0.04 0.13 0.08 0.08 4.19 1.82 0.18 0.1 0.3 0.27 0.14 0.19 1.73 4.3 10.09 0.33 0.26 85.18 0.87 0.25 0.4 0.38 32.93 0.68 0.53 0.3 0.56 0.44 0.41 0.82 0.38
0.13 0.2 0.0 0.0 0.05 0.02 0.0 0.03 0.0 0.0 0.0 0.0 0.08 0.52 0.4 0.0 0.0 8.28 0.0 0.0 0.0 0.0 3.54 0.0 0.02 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
1.82 0.47 0.63 0.58 0.64 0.38 0.17 0.14 0.11 0.37 0.32 0.15 1.06 1.34 1.58 0.32 0.69 37.07 0.27 0.32 0.3 0.23 10.15 0.4 0.36 0.28 0.25 0.54 0.1 0.28 0.58
0.0 0.0 0.0 0.0 0.01 0.05 0.01 0.05 0.02 0.01 0.0 0.04 0.01 0.08 0.19 0.0 0.0 7.82 0.05 0.07 0.0 0.0 1.92 0.0 0.02 0.01 0.01 0.01 0.0 0.0 0.0
0.16 0.04 0.14 0.0 0.33 0.19 0.06 0.09 0.02 0.05 0.11 0.03 0.16 0.8 1.43 0.16 0.1 6.16 0.14 0.07 0.11 0.06 1.97 0.06 0.05 0.12 0.05 0.09 0.08 0.05 0.0
0.38 0.11 0.12 0.13 0.58 0.36 0.0 0.0 0.02 0.02 0.02 0.02 0.35 0.82 1.88 0.04 0.0 25.91 0.19 0.0 0.09 0.0 8.88 0.19 0.25 0.06 0.05 0.05 0.08 0.02 0.25
1.64 5.0 1.51 1.22 5.44 5.24 1.3 1.4 2.27 2.17 2.57 2.35 5.63 4.52 5.72 3.43 2.21 36.14 2.57 3.02 2.82 2.63 16.41 2.6 2.36 3.42 1.77 2.05 3.06 3.45 4.44
0.01 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.17 0.0 0.0 0.0 0.0 0.05 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.36 2.01 0.51 0.06 1.57 0.37 0.06 0.02 0.06 0.0 0.0 0.01 0.2 0.32 0.22 0.02 0.01 16.2 0.03 0.0 0.05 0.09 5.59 0.06 0.06 0.03 0.11 0.01 0.01 0.03 0.0
0.0 0.02 0.0 0.0 0.04 0.0 0.05 0.01 0.01 0.02 0.01 0.0 0.05 0.03 0.07 0.04 0.0 0.98 0.01 0.0 0.01 0.01 0.51 0.0 0.02 0.0 0.02 0.01 0.0 0.02 0.0
0.02 0.0 0.0 0.0 0.19 0.14 0.01 0.01 0.01 0.0 0.03 0.0 0.08 0.11 0.34 0.0 0.0 17.6 0.08 0.02 0.0 0.01 5.34 0.04 0.09 0.01 0.03 0.0 0.0 0.04 0.02
0.12 0.04 0.01 0.0 0.32 0.17 0.04 0.02 0.04 0.03 0.2 0.01 0.11 0.48 0.31 0.07 0.04 19.58 0.11 0.1 0.05 0.03 5.8 0.11 0.09 0.03 0.04 0.04 0.05 0.03 0.05
1.01 7.11 2.89 0.47 2.56 0.58 1.05 1.9 0.92 0.0 0.0 0.69 0.84 9.08 10.64 1.54 0.0 286.25 1.19 0.0 0.74 2.04 101.91 0.0 0.83 0.38 2.02 0.38 1.2 1.06 4.16
0.0 0.0 0.0 0.0 0.11 0.0 0.05 0.02 0.0 0.0 0.07 0.02 0.38 0.0 0.0 0.05 0.0 2.11 0.0 0.08 0.01 0.0 0.03 0.0 0.03 0.0 0.0 0.05 0.0 0.06 0.13
0.0 0.0 0.0 0.0 0.01 0.0 0.03 0.0 0.01 0.01 0.01 0.0 0.0 0.0 0.04 0.01 0.0 0.16 0.0 0.0 0.0 0.0 0.03 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.01
2.74 1.97 0.96 0.52 10.08 9.25 1.27 0.85 3.15 2.65 2.64 2.38 2.88 13.41 11.78 3.87 2.69 83.18 4.67 3.64 2.86 2.97 32.09 4.38 3.5 3.07 3.37 2.39 2.7 4.24 3.62
1.86 2.55 1.11 0.56 3.91 2.29 0.65 0.6 0.38 0.23 0.3 0.27 1.23 2.65 2.94 0.63 0.47 21.46 0.84 0.4 0.91 0.41 7.87 0.48 0.6 0.3 0.84 0.92 0.76 0.46 0.35
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.4 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.03 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.99 1.18 1.99 1.31 5.3 5.11 2.39 1.68 2.76 1.45 2.37 2.19 4.6 8.01 6.44 2.52 4.05 40.31 2.65 2.68 2.59 1.49 14.1 3.26 3.47 2.46 3.22 2.67 2.45 2.56 3.89
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.12 0.0 0.0 0.0 0.0 0.02 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.03 0.04 0.05 0.01 0.37 0.22 0.08 0.03 0.04 0.13 0.05 0.02 0.39 0.41 0.61 0.1 0.08 8.35 0.18 0.07 0.05 0.13 4.01 0.1 0.15 0.13 0.15 0.1 0.08 0.05 0.15
0.39 2.13 0.54 0.53 2.84 1.68 0.21 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.65 1.51 1.94 0.0 0.08 95.64 0.16 0.11 0.0 0.03 18.36 0.07 0.51 0.03 0.11 0.08 0.0 0.09 0.0
0.0 0.0 0.0 0.0 0.02 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 1.78 0.0 0.0 0.0 0.0 0.1 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.0 0.0 0.0 0.9 2.56 1.09 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 1.41 0.0 1.22 0.0 0.0 197.07 0.0 0.0 0.0 0.0 68.5 0.38 0.0 0.0 0.0 0.4 0.0 0.0 0.0
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.01 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.01 0.0 0.0 0.0 0.0 0.57 0.0 0.0 0.0 0.0 0.13 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.01 0.0 0.02
0.0 0.0 0.0 0.1 0.01 0.0 0.0 0.0 0.03 0.0 0.0 0.01 0.03 0.04 0.0 0.01 0.0 0.53 0.0 0.0 0.0 0.01 0.26 0.01 0.0 0.01 0.02 0.0 0.08 0.07 0.02
0.04 0.02 0.0 0.0 1.4 0.91 0.0 0.03 0.0 0.0 0.14 0.04 0.91 3.47 5.78 0.06 0.0 72.44 0.43 0.02 0.05 0.15 28.85 0.64 1.15 0.0 0.38 0.14 0.15 0.1 0.06
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.14 0.0 0.0 0.0 0.0 0.03 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.05 0.0 0.0 0.0 0.0 0.6 0.0 0.0 0.0 0.0 0.13 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.06
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.01 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.01 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.01 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.0 0.0 0.0 0.0 0.03 0.02 0.06 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.14 0.02 0.02 0.0 0.0 4.48 0.0 0.0 0.0 0.0 1.01 0.0 0.0 0.0 0.05 0.0 0.0 0.0 0.0
0.03 0.04 0.04 0.09 0.08 0.04 0.04 0.04 0.11 0.06 0.08 0.1 0.29 0.13 0.12 0.09 0.1 1.89 0.01 0.07 0.05 0.09 1.32 0.15 0.04 0.07 0.1 0.08 0.08 0.12 0.15
0.24 0.59 0.76 0.54 1.28 1.32 0.63 0.7 0.4 0.61 0.69 0.5 1.87 2.91 1.97 0.7 0.73 49.8 0.81 0.58 0.6 0.83 16.41 0.64 1.39 0.44 0.88 0.41 1.01 2.23 1.81
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.03 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.01 0.0 0.0 0.0 0.0 0.01 0.0 0.01 0.0 0.01 0.01 0.01 0.43 0.0 0.0 0.0 0.01 0.17 0.01 0.01 0.01 0.02 0.01 0.0 0.01 0.0
1.83 3.16 1.49 0.94 42.25 11.36 0.92 0.44 1.03 1.05 1.45 0.61 7.12 17.05 23.63 1.92 0.91 260.6 7.79 1.15 3.63 2.89 82.04 6.26 4.37 1.95 4.23 3.5 1.27 5.29 0.59
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.37 0.0 0.0 0.0 0.0 0.17 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.04 0.0
4.07 10.42 0.73 1.55 8.97 7.19 4.87 8.49 2.28 1.54 4.22 2.55 5.54 10.72 11.38 5.05 4.37 126.16 5.31 3.38 2.9 3.6 28.42 4.36 2.62 2.56 3.16 3.02 4.42 6.88 5.9
0.02 0.02 0.03 0.0 0.14 0.1 0.01 0.0 0.06 0.0 0.03 0.0 0.03 0.06 0.1 0.06 0.02 1.57 0.02 0.03 0.0 0.01 0.05 0.06 0.03 0.03 0.04 0.0 0.0 0.01 0.34
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.07 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.0 0.01 0.0 0.01 0.16 0.18 0.0 0.0 0.04 0.0 0.02 0.02 0.08 0.22 0.16 0.01 0.04 9.71 0.03 0.02 0.03 0.08 4.41 0.16 0.03 0.01 0.02 0.04 0.03 0.01 0.05
0.0 0.0 0.0 0.0 0.04 0.21 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.47 0.0 0.05 0.0 0.0 9.88 0.0 0.0 0.0 0.04 3.43 0.08 0.0 0.0 0.0 0.0 0.05 0.0 0.0
0.12 0.11 0.05 0.0 9.32 6.48 0.45 0.3 0.36 0.19 0.4 0.24 4.84 11.04 33.95 1.44 0.6 574.06 5.9 0.83 2.04 1.69 164.93 4.74 3.65 1.04 2.19 2.25 3.71 2.39 0.49
0.94 1.52 0.94 0.68 1.97 2.26 5.09 6.6 2.0 2.55 1.58 2.99 5.05 3.09 3.58 4.43 3.7 57.52 2.03 1.84 1.99 1.91 17.73 2.85 2.51 2.03 1.69 1.75 2.03 3.1 4.21
0.89 0.76 0.77 0.67 0.27 0.16 0.17 0.16 0.24 0.23 0.32 0.24 1.2 0.6 0.58 0.5 0.43 14.94 0.14 0.36 0.31 0.14 3.74 0.37 0.19 0.36 0.34 0.22 0.17 0.21 0.7
0.0 0.02 0.0 0.11 0.25 0.05 0.02 0.0 0.13 0.05 0.03 0.02 0.03 0.02 0.12 0.08 0.08 1.43 0.0 0.03 0.06 0.05 1.12 0.0 0.02 0.0 0.04 0.03 0.03 0.05 0.15
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.06 0.0 0.0 0.0 0.0 0.04 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
1.31 1.02 1.53 0.77 1.63 0.91 0.51 0.16 0.64 0.4 0.14 0.44 1.39 1.55 1.47 0.24 0.57 26.88 0.64 0.42 0.29 0.34 9.61 0.48 0.68 0.55 0.77 0.57 0.26 0.44 0.89
0.0 0.01 0.0 0.0 0.12 0.1 0.0 0.0 0.0 0.03 0.02 0.03 0.01 0.09 0.16 0.0 0.03 2.98 0.0 0.0 0.0 0.0 1.05 0.05 0.03 0.0 0.06 0.03 0.02 0.02 0.0
0.34 0.11 0.0 0.21 1.28 0.93 0.18 0.37 0.23 0.44 0.51 0.22 1.15 1.35 1.12 0.61 0.34 9.8 0.31 0.19 0.45 0.18 2.53 0.28 0.23 0.18 0.28 0.15 0.1 0.52 0.91
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 4.02 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.08 0.66 0.0 0.0 1.42 2.59 0.04 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.33 2.31 2.05 0.0 0.0 57.21 0.27 0.09 0.06 0.14 13.23 0.12 0.48 0.03 0.0 0.03 0.06 0.09 0.0
0.05 0.08 0.03 0.14 0.03 0.09 0.03 0.05 0.01 0.0 0.07 0.04 0.03 0.0 0.01 0.02 0.06 5.4 0.01 0.03 0.04 0.07 1.75 0.0 0.02 0.01 0.02 0.02 0.09 0.04 0.03
0.25 0.28 0.17 0.01 0.47 0.39 0.13 0.06 0.09 0.06 0.07 0.03 0.18 0.49 1.2 0.12 0.14 8.32 0.08 0.11 0.08 0.09 2.12 0.12 0.09 0.1 0.08 0.05 0.07 0.06 0.05
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 4.11 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.0 0.0 0.0 0.04 0.01 0.01 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.01 0.0 0.0 0.0 0.0 8.81 0.0 0.0 0.0 0.02 2.96 0.0 0.01 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.01
1.61 2.17 3.82 5.0 4.19 2.64 1.0 1.57 1.27 1.54 1.63 1.27 1.34 7.36 4.5 1.43 0.83 64.82 2.31 1.07 0.86 0.84 19.6 0.69 1.1 1.5 1.12 0.88 1.92 2.19 2.14
0.0 0.0 0.09 0.0 0.0 0.0 0.07 0.0 0.0 0.03 0.0 0.0 0.0 0.03 0.0 0.0 0.06 1.69 0.0 0.0 0.0 0.0 0.39 0.05 0.02 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.23
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.01 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.0 0.0 0.0 0.0 0.03 0.01 0.01 0.01 0.0 0.01 0.03 0.03 0.02 0.01 0.03 0.01 0.01 5.57 0.0 0.01 0.0 0.01 2.96 0.02 0.05 0.01 0.02 0.02 0.0 0.02 0.01
7.13 7.17 5.93 6.17 8.01 7.36 5.11 5.56 4.15 4.44 4.73 4.04 7.88 8.75 8.18 4.9 4.79 46.79 5.21 4.29 4.15 4.74 15.57 4.45 4.84 4.78 5.24 3.9 5.42 5.27 6.89
0.03 0.0 0.0 0.0 0.29 0.31 0.06 0.0 0.16 0.06 0.02 0.0 0.08 0.06 0.02 0.03 0.05 5.28 0.06 0.01 0.09 0.0 0.0 0.02 0.02 0.05 0.09 0.02 0.1 0.06 1.5

Details

Raw expression values (TPM normalized), Green cells indicate low expression and red high. (Dark gray cells indicate missing values)