Heatmap: Cluster_178 (Lactuca sativa (Lsa) Coexpression Clusters (HCCA Algorithm))

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(Values are log₂ transformed ratios of a genes expression in a sample divided by the mean expression level)

Gene	Light: 268 uE m-2 s-1	Light: 202.5 uE m-2 s-1 (Control)	Light: 135 uE m-2 s-1	Light: 67.5 uE m-2 s-1	Photoperiod: L24	Photoperiod: L20D4 (Control)	Photoperiod: L12D12	Photoperiod: L8D16	RBW: 4:1:1 (Control)	RBW: 4:1:0	RBW: 3:1:1	RBW: 3:1:0	Nitrogen: 0%	Nitrogen: 25%	Nitrogen: 50%	Nitrogen: 100% (Control)	Nitrogen: 150%	Phosphorous: 0%	Phosphorous: 25%	Phosphorous: 50%	Phosphorous: 100% (Control)	Phosphorous: 150%	Potassium: 0%	Potassium: 25%	Potassium: 50%	Potassium: 100% (Control)	Potassium: 150%	Temperature: 20°C	Temperature: 25°C (Control)	Temperature: 30°C	Temperature: 35°C
Lsat_1_v5_gn_0_26880.1 (KCR1)	-1.13	-1.26	-1.03	-0.62	0.08	-0.11	-0.11	0.07	0.32	0.43	0.3	0.28	-0.74	0.8	0.8	0.06	0.18	-1.02	0.2	0.31	-0.17	-0.02	-2.19	0.18	-0.15	-0.06	-0.03	-0.11	0.24	0.56	0.26
Lsat_1_v5_gn_0_33121.1	-0.34	-1.1	-1.0	-1.97	-0.32	-0.31	0.73	0.79	0.04	-0.12	0.05	-0.4	0.38	0.72	0.77	0.21	0.24	-1.16	0.34	0.32	0.04	0.08	-2.75	0.06	-0.02	-0.15	-0.08	0.31	-0.24	-0.01	0.15
Lsat_1_v5_gn_1_104541.1 (scpl40)	-1.23	-1.04	-1.63	-1.8	0.2	0.53	0.23	-0.05	0.07	0.0	0.04	0.0	0.12	-0.1	0.44	0.76	0.69	-1.22	0.05	0.46	0.27	0.32	-3.64	0.1	0.24	0.5	0.42	0.31	-0.54	-0.34	-0.16
Lsat_1_v5_gn_1_105541.1	-0.2	-0.12	-0.46	-0.37	-0.15	0.25	0.33	0.21	-0.07	-0.23	-0.02	-0.45	0.08	0.45	0.54	0.29	0.1	-0.74	0.13	-0.03	-0.07	0.07	-1.35	-0.01	0.07	0.02	0.12	-0.16	0.04	0.19	0.3
Lsat_1_v5_gn_1_114540.1 (NFRKB1)	-0.68	-0.97	-1.12	-0.97	-0.08	0.11	0.38	-0.27	-0.3	-0.24	-0.56	-0.35	-0.72	1.42	1.02	-0.25	-0.13	-1.47	0.38	0.29	0.24	0.48	-4.35	0.12	0.37	0.66	0.51	0.24	-0.72	-0.65	0.27
Lsat_1_v5_gn_1_67980.1	-0.18	-0.44	-1.19	-1.82	0.27	0.28	0.1	0.1	0.01	-0.07	0.03	-0.02	-0.02	0.37	0.41	-0.02	-0.12	-0.02	0.31	0.11	0.09	0.17	-0.62	0.14	0.17	0.11	0.19	0.02	0.06	-0.08	0.02
Lsat_1_v5_gn_1_69020.1	-0.37	-0.53	-0.98	-0.93	0.26	0.33	-0.1	-0.18	-0.09	-0.15	-0.01	-0.13	0.08	0.28	0.37	0.27	0.13	-0.53	0.27	0.13	0.13	0.1	-0.51	0.18	0.15	0.19	0.14	0.05	0.27	0.12	-0.05
Lsat_1_v5_gn_1_93440.1 (SD2-5)	-0.91	-1.91	-1.91	-1.61	-0.12	-0.69	-0.23	-0.31	-0.06	0.32	-0.18	0.26	-0.57	1.04	1.32	0.36	0.66	-2.11	0.53	0.42	0.07	0.25	-3.97	-0.06	-0.09	0.07	-0.29	-0.6	-0.21	0.54	0.99
Lsat_1_v5_gn_2_102421.1 (CYP77A4)	-0.46	-0.74	0.03	-1.17	-0.64	-0.73	-0.32	-0.55	-0.09	0.07	0.09	0.12	-0.1	0.52	0.71	0.69	0.9	-1.66	0.29	0.5	0.02	0.15	-3.99	0.41	0.14	0.18	0.26	0.53	-0.2	-0.09	-0.48
Lsat_1_v5_gn_2_116020.1 (KCS12)	-2.17	-2.01	-2.54	-1.93	-0.32	-0.11	0.72	0.41	-0.0	-0.03	-0.26	-0.35	-0.83	0.68	0.99	0.3	0.54	-4.65	0.79	0.63	0.26	0.37	-	0.31	0.31	0.33	0.48	0.56	0.16	-0.09	-1.03
Lsat_1_v5_gn_2_116501.1 (ACR9)	-0.75	-1.04	-2.37	-2.99	0.02	0.19	0.74	0.75	0.3	0.19	0.33	0.19	-0.92	0.13	0.57	0.12	0.19	-2.89	0.47	0.53	0.4	0.3	-2.08	0.37	0.33	0.22	0.39	0.36	-0.46	-0.4	-1.18
Lsat_1_v5_gn_2_126100.1	-1.0	-0.54	-1.27	-1.73	-0.24	0.97	0.46	-0.42	0.06	-0.06	0.08	-0.51	-0.73	0.6	0.95	0.83	0.59	-3.18	0.45	0.12	0.12	0.21	-3.22	0.02	0.04	0.14	0.2	-0.53	-0.21	0.07	0.3
Lsat_1_v5_gn_2_17141.1 (SGC)	-0.68	-0.74	-1.05	-1.02	-0.73	-0.33	0.45	0.76	-0.09	-0.09	-0.03	-0.04	0.02	0.83	0.96	0.31	0.28	-1.97	0.3	0.11	-0.04	0.19	-1.7	0.32	0.09	0.07	-0.04	-0.16	0.03	-0.04	0.16
Lsat_1_v5_gn_2_21541.1 (RAT4)	-1.41	-0.94	-1.51	-1.9	-0.86	-0.12	0.81	0.6	-0.06	-0.03	-0.04	-0.17	0.36	0.88	1.08	0.35	0.39	-2.05	0.7	0.38	-0.02	0.18	-5.59	0.05	0.07	0.16	0.11	0.1	-0.44	-0.26	-0.17
Lsat_1_v5_gn_2_39940.1 (FAO3)	-2.53	-3.03	-3.25	-3.6	-1.42	-1.02	0.99	0.17	-0.04	-0.36	-0.32	-0.66	0.01	1.28	1.59	0.63	0.85	-1.89	0.55	0.62	-0.19	-0.31	-5.73	0.39	0.17	-0.13	0.08	-0.54	-0.31	0.13	0.66
Lsat_1_v5_gn_2_50580.1 (sks11)	-2.15	-1.79	-1.93	-2.06	-0.76	-1.53	0.44	0.21	0.09	-0.36	-0.19	0.2	-0.5	1.23	1.31	0.34	0.66	0.24	0.32	0.14	0.06	-0.82	-0.89	0.45	0.44	-0.09	0.3	-1.14	-0.1	0.23	0.2
Lsat_1_v5_gn_2_56001.1 (NHL1)	-1.05	-1.1	-1.29	-1.1	0.35	0.58	-0.01	-0.31	-0.17	-0.23	-0.15	-0.32	-0.43	0.79	0.91	0.58	0.4	-0.58	0.38	0.08	0.25	0.3	-1.56	-0.18	0.03	0.22	0.28	-0.08	0.07	0.0	-0.1
Lsat_1_v5_gn_2_69680.1	-1.08	-1.5	-1.29	-1.94	-0.59	0.05	0.39	0.23	-0.05	0.06	-0.13	-0.3	-0.6	1.48	1.56	0.49	0.41	-2.61	0.38	0.31	0.02	-0.28	-1.78	-0.33	-0.19	0.23	-0.61	-0.22	0.03	0.32	-0.01
Lsat_1_v5_gn_3_122140.1 (PH2)	-0.72	-0.65	-1.9	-2.08	-0.67	0.45	0.72	0.62	0.08	-0.33	-0.22	-0.33	0.46	0.82	0.32	-0.04	0.27	-0.41	0.69	0.4	-0.24	-0.17	-1.31	0.08	0.02	0.13	0.05	-0.02	-0.24	0.1	0.08
Lsat_1_v5_gn_3_137320.1 (GPAT4)	-1.06	-0.97	-0.51	-0.19	-0.28	-0.17	-0.09	-0.22	0.18	0.19	0.28	0.18	-0.28	0.63	0.62	0.29	0.27	-1.04	0.24	0.21	0.07	0.19	-1.93	0.07	0.01	0.19	0.19	-0.16	0.17	0.24	0.22
Lsat_1_v5_gn_3_15361.1 (UGLYAH)	-0.34	-0.75	-0.71	-0.6	-0.46	-0.22	0.22	0.5	0.06	0.02	0.08	-0.07	0.46	0.39	0.45	0.22	0.22	-0.61	0.23	0.23	0.0	-0.05	-1.01	0.04	-0.01	0.17	0.04	-0.1	-0.07	-0.02	0.28
Lsat_1_v5_gn_3_24280.1 (NDL2)	-1.72	-1.39	-1.38	-0.32	-0.27	-0.01	0.29	-0.12	0.07	0.09	0.03	0.13	-0.15	0.95	1.02	-0.03	0.37	-1.62	0.9	0.43	0.19	0.15	-4.37	0.04	0.04	0.05	0.11	-0.02	-0.05	-0.15	-0.07
Lsat_1_v5_gn_3_43860.1 (XK1)	-0.31	-0.62	-0.64	-0.66	0.04	0.16	-0.23	-0.14	0.14	0.02	0.23	0.15	0.04	0.89	0.75	0.11	0.14	-1.74	0.1	0.11	0.07	-0.06	-1.45	0.22	0.12	0.08	0.27	0.05	-0.21	-0.17	0.13
Lsat_1_v5_gn_3_6461.1 (ATT1)	-1.58	-1.69	-1.18	-0.84	-0.37	-0.3	0.25	0.18	0.15	0.14	0.16	0.09	-1.02	0.9	1.14	0.44	0.38	-2.25	0.63	0.44	0.11	0.08	-0.51	0.04	-0.12	-0.02	0.07	-0.01	0.17	0.01	-0.41
Lsat_1_v5_gn_3_79841.1 (G2)	-0.68	-0.79	-0.45	-0.39	-0.08	0.11	-0.04	-0.05	0.15	0.2	0.17	0.14	-0.24	0.59	0.67	0.56	0.4	-0.97	0.27	0.16	0.08	0.07	-1.56	-0.04	-0.13	-0.02	0.05	-0.08	0.02	0.11	-0.18
Lsat_1_v5_gn_4_138121.1 (RAB7)	-0.44	-0.8	-0.93	-1.08	0.03	0.35	0.13	-0.02	0.34	0.26	0.28	0.09	-0.47	1.16	1.16	0.35	0.26	-1.87	0.43	0.19	-0.1	-0.05	-2.86	-0.36	-0.37	-0.34	-0.2	0.11	0.03	-0.09	-0.24
Lsat_1_v5_gn_4_142741.1	-1.13	-1.08	-1.49	-1.91	-0.1	-0.24	-0.16	-0.27	-0.27	-0.14	-0.26	-0.06	0.13	1.27	1.16	0.31	0.53	-0.78	0.51	0.39	0.07	0.14	-3.51	-0.01	0.13	0.08	0.22	-0.22	0.24	-0.02	0.13
Lsat_1_v5_gn_4_177360.1	-1.43	-1.21	-1.28	-0.7	-0.25	0.21	0.11	-0.36	-0.09	0.01	0.02	0.03	-0.07	0.31	0.57	0.58	0.35	-1.07	0.45	0.47	0.22	0.42	-1.73	0.16	0.19	0.29	0.18	0.03	-0.3	-0.05	0.51
Lsat_1_v5_gn_4_180161.1 (GlcAT14B)	-0.73	-0.42	-0.78	-0.46	0.1	0.32	0.01	-0.35	-0.09	-0.09	0.09	-0.12	0.2	0.35	0.34	0.21	0.27	-0.33	0.08	0.09	0.02	0.1	-0.41	0.01	0.11	0.2	0.11	0.13	0.01	-0.07	0.25
Lsat_1_v5_gn_4_2460.1 (KCR1)	-0.42	-1.33	-1.57	-0.92	-0.16	-0.12	0.12	-0.22	0.1	0.28	0.41	0.35	-0.18	0.82	0.89	0.37	0.47	-3.68	0.19	0.4	0.08	0.0	-2.86	0.3	-0.11	-0.43	-0.15	-0.17	-0.03	0.33	0.61
Lsat_1_v5_gn_4_33660.1 (MEE47)	-1.11	-0.66	-1.2	-1.0	-0.09	0.4	0.19	0.04	-0.18	-0.22	-0.15	-0.38	-0.17	0.87	0.92	0.43	0.25	-0.46	0.36	0.07	0.17	0.19	-1.46	0.03	0.05	0.15	0.16	-0.12	0.04	-0.1	0.19
Lsat_1_v5_gn_4_34340.1 (TBL25)	-0.8	-1.85	-0.43	0.27	0.17	0.37	-0.2	-0.43	-0.16	-0.16	0.2	-0.02	-0.52	0.96	0.83	0.27	-0.0	-1.07	0.47	-0.06	0.21	0.18	-2.74	-0.03	0.09	0.23	0.32	0.18	0.07	0.04	-0.57
Lsat_1_v5_gn_4_34921.1 (ATL67)	-0.84	-1.11	-0.65	-0.25	0.07	0.35	0.05	-0.1	-0.04	-0.0	-0.05	-0.02	-0.12	0.54	0.54	0.45	0.32	-1.77	0.12	0.22	0.21	0.15	-2.45	0.13	-0.03	0.24	0.34	0.12	0.13	0.15	0.06
Lsat_1_v5_gn_4_42220.1	-0.07	-0.22	-0.44	-0.42	0.18	0.26	-0.0	0.07	-0.2	-0.21	-0.06	-0.09	0.09	0.18	0.13	0.11	0.01	0.03	0.16	-0.08	0.02	0.1	-0.18	0.0	0.05	0.08	0.07	0.1	0.08	0.04	-0.07
Lsat_1_v5_gn_4_5001.1	-0.88	-1.1	-0.6	-0.07	0.05	0.31	0.09	0.02	-0.02	-0.01	0.1	0.13	0.15	0.23	0.36	0.45	0.28	-0.73	0.26	0.2	0.04	0.03	-1.52	-0.12	0.1	0.24	0.21	0.11	-0.2	-0.03	0.19
Lsat_1_v5_gn_4_58400.1 (B70)	-0.4	-0.03	-0.48	-0.42	-0.12	0.22	0.28	-0.08	-0.28	-0.34	-0.11	-0.04	0.05	0.73	0.75	0.29	0.17	-0.86	0.32	0.08	0.04	0.06	-1.47	0.0	-0.03	0.15	0.08	-0.17	-0.25	-0.14	0.32
Lsat_1_v5_gn_4_60640.1	-0.83	-0.69	-0.57	-0.64	0.06	0.22	-0.08	0.02	-0.19	-0.12	0.01	-0.0	0.2	0.52	0.67	0.41	0.41	-1.19	0.33	0.1	0.05	0.09	-0.69	-0.12	0.02	0.03	0.05	0.16	-0.14	-0.03	0.28
Lsat_1_v5_gn_4_63601.1 (AtHMP35)	-0.73	-0.99	-0.32	-0.14	-0.33	-0.02	0.01	-0.22	-0.21	-0.09	-0.03	0.09	0.28	0.47	0.47	0.46	0.49	-1.26	0.26	0.25	0.17	0.2	-0.94	-0.09	0.1	0.35	0.28	0.14	-0.25	-0.24	0.06
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Details

Dark gray cells indicate values where the raw expression is zero (cannot be log-transformed). Blue cells indicate samples where the expression of the gene is below average and red cells indicate the gene is expressed above average in the sample. White cells are average.