Heatmap: Cluster_232 (Lactuca sativa (Lsa) Coexpression Clusters (HCCA Algorithm))

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(Values are log₂ transformed ratios of a genes expression in a sample divided by the mean expression level)

Gene	Light: 268 uE m-2 s-1	Light: 202.5 uE m-2 s-1 (Control)	Light: 135 uE m-2 s-1	Light: 67.5 uE m-2 s-1	Photoperiod: L24	Photoperiod: L20D4 (Control)	Photoperiod: L12D12	Photoperiod: L8D16	RBW: 4:1:1 (Control)	RBW: 4:1:0	RBW: 3:1:1	RBW: 3:1:0	Nitrogen: 0%	Nitrogen: 25%	Nitrogen: 50%	Nitrogen: 100% (Control)	Nitrogen: 150%	Phosphorous: 0%	Phosphorous: 25%	Phosphorous: 50%	Phosphorous: 100% (Control)	Phosphorous: 150%	Potassium: 0%	Potassium: 25%	Potassium: 50%	Potassium: 100% (Control)	Potassium: 150%	Temperature: 20°C	Temperature: 25°C (Control)	Temperature: 30°C	Temperature: 35°C
Lsat_1_v5_gn_1_117561.1	-0.68	-0.48	-0.58	-0.32	0.34	0.4	-0.16	-0.28	-0.16	-0.07	0.04	0.05	-0.06	0.94	0.8	0.11	-0.18	-0.06	0.01	-0.24	-0.1	-0.2	0.08	-0.43	-0.24	-0.19	-0.22	-0.5	0.35	0.21	0.31
Lsat_1_v5_gn_1_16301.1	-0.41	-0.45	-0.62	-0.18	0.52	0.59	-0.05	-0.08	-0.13	-0.12	-0.03	-0.28	-0.33	1.2	0.77	0.08	-0.43	-0.15	0.09	-0.32	-0.29	-0.29	0.08	-0.26	-0.31	-0.22	-0.13	-0.39	0.05	0.0	0.28
Lsat_1_v5_gn_1_31080.1 (MRP11)	-0.12	-0.07	-0.22	-0.13	0.64	0.27	-0.51	-0.76	0.02	-0.01	0.12	0.11	-0.11	0.86	0.82	0.09	0.02	-1.09	0.12	-0.2	-0.16	-0.17	-1.87	-0.23	-0.05	-0.16	-0.24	-0.34	0.18	0.22	0.48
Lsat_1_v5_gn_1_32381.1 (VNI2)	-0.29	0.32	0.4	0.43	0.43	0.22	0.16	0.12	-0.11	-0.02	0.01	-0.32	-0.89	1.01	0.88	-0.3	-0.3	-0.78	0.33	-0.4	-0.57	-0.61	-0.3	-0.89	-1.07	-0.48	-0.47	-0.88	0.49	0.49	0.34
Lsat_1_v5_gn_1_99420.1 (FH16)	-0.38	0.13	0.1	0.32	1.23	0.43	-0.73	-1.4	-0.16	-0.53	-0.09	-0.79	-1.77	1.75	1.41	-0.08	-1.1	0.4	0.7	-0.23	-0.55	-0.31	-4.16	-1.03	-0.95	-0.43	-0.5	-1.39	0.08	-0.08	0.2
Lsat_1_v5_gn_2_105320.1	-0.66	-1.05	-0.53	-0.2	0.51	0.44	-0.32	-0.56	0.01	-0.27	-0.09	-0.34	-1.04	1.15	1.04	-0.05	-0.35	-0.11	0.01	-0.31	-0.16	-0.1	0.57	-0.41	-0.43	-0.1	0.04	-0.43	0.33	0.38	0.23
Lsat_1_v5_gn_2_111241.1 (AtHMP18)	-0.38	-0.1	-0.12	-0.04	0.26	0.12	-0.2	-0.3	0.0	0.05	0.14	0.14	0.08	0.81	0.69	-0.02	-0.24	-0.64	0.08	-0.08	-0.2	-0.21	-0.93	-0.21	0.01	0.01	-0.12	-0.27	0.06	0.02	0.45
Lsat_1_v5_gn_2_115420.1 (SDJ1)	-0.49	-0.33	-0.23	0.04	0.34	0.32	-0.05	-0.07	-0.0	0.11	0.11	-0.21	-0.25	1.06	0.61	-0.09	-0.32	0.14	0.03	-0.46	-0.4	-0.32	0.21	-0.48	-0.39	-0.21	-0.05	-0.52	0.14	0.14	0.23
Lsat_1_v5_gn_2_125901.1	0.01	0.06	-0.18	-0.24	0.57	0.4	-0.12	0.22	-0.26	-0.26	-0.18	-0.2	-0.33	0.72	0.37	0.16	-0.13	0.01	-0.07	-0.22	-0.29	-0.22	0.01	-0.34	-0.24	-0.12	-0.15	-0.24	0.02	0.09	0.31
Lsat_1_v5_gn_2_35701.1 (LHW)	-0.22	-0.36	0.03	0.0	0.43	0.32	-0.37	-0.49	-0.31	-0.39	-0.17	-0.4	-0.1	1.14	0.72	-0.11	-0.3	0.19	-0.0	-0.39	-0.38	-0.21	0.22	-0.31	-0.39	-0.04	-0.14	-0.32	0.17	0.08	0.46
Lsat_1_v5_gn_2_51881.1	-0.04	-0.1	0.05	-0.1	0.5	0.26	-0.48	-0.39	-0.31	-0.28	-0.14	-0.09	0.07	0.87	0.63	0.06	-0.01	-0.63	0.05	-0.28	-0.25	-0.24	0.25	-0.1	-0.11	-0.13	-0.18	-0.08	0.22	0.06	-0.12
Lsat_1_v5_gn_2_620.1	-0.34	-0.21	-0.26	-0.01	0.31	0.08	-0.14	-0.15	-0.15	-0.01	0.03	-0.07	-0.26	0.9	0.73	0.05	-0.16	-0.02	-0.04	-0.23	-0.23	-0.16	0.12	-0.4	-0.37	-0.1	-0.09	-0.23	0.28	0.1	0.11
Lsat_1_v5_gn_2_68221.1 (SKOR)	-0.19	-0.32	0.24	-0.27	0.24	0.63	-0.3	-0.59	-0.5	-0.41	-0.15	-0.25	-0.08	1.1	0.53	0.15	-0.08	0.04	0.05	-0.44	-0.33	-0.37	-0.29	-0.38	-0.17	-0.12	0.04	-0.28	0.33	0.34	0.26
Lsat_1_v5_gn_2_73381.1	-0.6	-0.7	-0.29	0.28	0.41	0.28	-0.25	0.02	-0.43	-0.26	-0.14	-0.34	-0.12	1.13	0.77	-0.16	-0.25	0.28	-0.21	-0.41	-0.41	-0.27	0.38	-0.29	-0.39	-0.31	-0.17	-0.39	0.22	0.17	0.51
Lsat_1_v5_gn_2_90600.1	-0.77	0.02	0.58	0.75	-0.0	0.21	-0.25	0.51	-0.69	-0.57	-0.38	-0.3	-0.78	1.45	0.73	-0.23	-0.35	-0.83	0.47	-0.61	-0.73	-0.63	-9.01	-0.5	-0.89	-0.31	-0.39	-0.77	1.03	0.82	0.33
Lsat_1_v5_gn_3_108620.1 (NCRK)	0.08	0.27	0.19	-0.38	0.96	0.68	0.02	-0.04	-0.46	-0.28	0.14	-1.17	-2.04	1.54	1.24	-0.68	-0.59	-0.3	0.1	-0.94	-0.64	-0.32	-3.86	-0.42	-0.36	-0.5	-0.41	-0.55	0.51	0.17	0.33
Lsat_1_v5_gn_3_127881.1 (PME17)	-0.83	-1.67	-1.06	-0.76	0.71	0.83	-1.1	-0.69	-0.35	-0.5	0.34	-0.69	-0.44	1.72	0.91	-0.3	-0.8	0.33	0.13	-0.16	-0.47	-0.24	0.78	-0.66	-0.48	-0.25	-0.44	-1.45	0.28	0.05	0.85
Lsat_1_v5_gn_3_2341.1 (AEP2)	-0.68	-0.8	-0.27	0.28	0.96	0.4	-0.54	-0.61	-0.39	-0.67	-0.34	-0.79	-1.12	1.95	1.04	-0.21	-0.67	0.33	0.17	-0.6	-0.72	-0.8	0.3	-0.93	-0.68	-0.41	-0.16	-1.15	0.38	0.32	0.35
Lsat_1_v5_gn_3_94760.1 (ERD5)	0.71	-0.56	0.89	-0.27	0.36	-0.65	-3.29	-4.54	-2.83	-2.45	-2.17	-2.28	-0.23	3.07	2.43	0.35	0.14	0.09	-1.28	-1.67	-1.79	-1.67	0.57	-2.71	-1.96	-1.12	-1.41	-1.46	-2.07	-2.13	-2.48
Lsat_1_v5_gn_4_10101.1 (SCL23)	0.05	-0.15	-0.0	0.12	0.09	0.09	-0.1	-0.56	-0.18	-0.17	-0.1	-0.22	0.06	0.63	0.42	0.24	-0.02	-0.55	0.14	-0.13	-0.06	-0.01	0.35	-0.2	-0.28	-0.03	-0.11	0.01	0.08	0.0	-0.02
Lsat_1_v5_gn_4_145920.1	0.09	0.11	0.18	0.2	0.37	0.38	0.08	-0.09	-0.18	-0.15	-0.16	-0.23	-0.57	0.75	0.41	0.0	-0.11	-0.96	0.2	-0.24	-0.3	-0.27	-0.76	-0.18	-0.3	-0.18	-0.06	-0.06	0.26	0.13	0.38
Lsat_1_v5_gn_4_176301.1 (SAW1)	-0.01	-0.08	0.39	0.39	0.29	0.35	-0.3	-0.39	-0.24	-0.15	0.01	-0.22	-0.11	1.09	0.79	0.35	0.05	-2.4	-0.03	-0.33	-0.28	-0.24	-1.89	-0.38	-0.35	-0.22	-0.16	-0.36	0.37	0.18	0.31
Lsat_1_v5_gn_4_36761.1 (AHDP)	-0.26	-0.68	-0.08	0.15	0.31	0.09	-0.23	-0.43	-0.05	-0.14	0.04	-0.01	0.11	0.89	0.83	0.12	-0.02	-0.89	0.14	-0.09	-0.18	-0.19	-0.95	-0.24	-0.3	-0.15	-0.09	-0.31	0.12	0.23	0.57
Lsat_1_v5_gn_5_116880.1	-0.16	-0.17	-0.2	-0.23	0.3	0.16	-0.01	-0.07	0.07	0.08	0.16	0.12	-0.01	0.31	0.27	0.09	-0.02	-0.86	0.04	-0.11	-0.07	-0.01	-0.03	-0.1	-0.03	-0.01	0.02	-0.13	-0.03	0.06	0.15
Lsat_1_v5_gn_5_174441.1	-0.57	-0.63	-0.21	-0.42	0.34	0.22	-0.43	-0.41	-0.25	-0.17	-0.21	-0.16	0.05	1.05	0.84	0.29	-0.03	-0.13	0.35	-0.11	-0.3	-0.02	-0.77	-0.25	-0.4	-0.15	-0.26	-0.45	0.24	0.33	0.63
Lsat_1_v5_gn_5_190180.1 (DAAR2)	-0.55	-0.43	-0.61	0.08	0.38	0.37	-0.28	-0.44	-0.21	-0.06	0.03	-0.23	-0.14	1.2	0.84	-0.13	-0.12	0.05	-0.23	-0.51	-0.26	-0.23	0.7	-0.34	-0.43	-0.16	-0.2	-0.42	0.11	-0.09	0.28
Lsat_1_v5_gn_5_1921.1 (D6PK)	-0.15	-0.34	-0.08	-0.18	0.11	0.26	0.15	-0.0	-0.21	-0.23	-0.17	-0.24	0.21	0.23	0.27	0.24	0.16	-0.48	-0.1	-0.06	-0.07	-0.03	0.08	-0.1	-0.07	0.08	0.07	-0.03	0.1	0.06	0.16
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Lsat_1_v5_gn_5_53421.1	-0.13	0.33	-0.01	-0.53	0.53	0.7	-0.35	-0.02	-0.41	-0.38	0.36	-1.58	-1.65	1.68	1.63	-0.76	-1.19	-0.41	0.01	-0.87	-0.37	-1.0	-1.53	-1.36	-1.06	-0.74	-0.64	-1.87	0.9	0.46	0.98
Lsat_1_v5_gn_6_104380.1 (VQ9)	-0.99	-0.99	-0.46	-0.04	0.38	0.21	-0.38	-0.56	-0.29	-0.3	-0.12	-0.34	-0.37	1.39	1.01	-0.03	-0.2	0.05	-0.06	-0.33	-0.2	-0.23	0.57	-0.27	-0.26	0.05	-0.05	-0.55	0.28	0.03	0.25
Lsat_1_v5_gn_6_107080.1	-0.31	-0.51	0.01	0.3	0.05	0.31	-0.58	-0.93	-0.02	-0.12	0.03	-0.04	-0.16	0.54	0.47	0.11	-0.24	-0.51	-0.06	-0.25	-0.06	-0.03	0.8	-0.05	-0.21	0.03	0.04	-0.38	0.14	0.17	0.23
Lsat_1_v5_gn_6_115080.1 (RR2)	-0.38	-0.22	0.09	0.04	0.36	-0.06	-0.42	-0.57	-0.32	-0.23	-0.14	-0.12	-0.05	1.26	0.95	0.14	-0.05	0.44	0.13	-0.24	-0.45	-0.45	0.37	-0.6	-0.68	-0.25	-0.28	-0.5	0.12	0.01	-0.04
Lsat_1_v5_gn_6_117840.1 (SPL1)	-0.31	-0.31	-0.06	0.23	0.37	0.21	-0.36	-0.66	-0.25	-0.18	-0.2	-0.26	-0.12	1.07	0.81	0.07	-0.06	-0.19	0.06	-0.33	-0.26	-0.31	0.33	-0.42	-0.32	-0.18	-0.13	-0.44	0.15	0.17	0.31
Lsat_1_v5_gn_6_14101.1 (IDD11)	-0.13	-0.07	0.32	0.41	-0.04	0.17	-0.31	-0.62	-0.26	-0.22	-0.15	-0.39	-0.15	1.04	0.79	0.01	-0.2	-0.78	0.16	-0.27	-0.31	-0.13	0.3	-0.44	-0.39	-0.03	-0.05	-0.48	0.2	0.09	0.3
Lsat_1_v5_gn_6_14400.1 (NOT4A)	-0.41	-0.23	-0.01	0.16	0.14	-0.02	-0.44	-0.66	-0.13	0.11	-0.12	-0.04	-0.14	0.69	0.68	0.32	-0.26	-0.21	0.16	-0.25	-0.06	-0.16	0.71	-0.43	-0.31	-0.06	0.03	-0.27	0.18	0.05	-0.16
Lsat_1_v5_gn_6_21201.1 (KOC1)	-0.61	-0.7	-0.14	-0.04	0.52	0.44	-0.31	-0.81	-0.16	-0.17	0.01	-0.42	-0.48	0.98	0.89	0.07	-0.23	-0.29	0.15	-0.33	-0.25	-0.26	0.82	-0.52	-0.51	-0.31	-0.2	-0.59	0.32	0.33	0.36
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Details

Dark gray cells indicate values where the raw expression is zero (cannot be log-transformed). Blue cells indicate samples where the expression of the gene is below average and red cells indicate the gene is expressed above average in the sample. White cells are average.