1. Home
  2. Tools
  3. Expression Heatmap
  4. Results

Heatmap: Cluster_34 (Lactuca sativa (Lsa) Coexpression Clusters (HCCA Algorithm))

View as: (view raw or row-normalized)

View using InCHLib : here ( Experimental feature, still under development)

(Values are log2 transformed ratios of a genes expression in a sample divided by the mean expression level)

 Transpose table  Download table
Gene
Light: 268 uE m-2 s-1
Light: 202.5 uE m-2 s-1 (Control)
Light: 135 uE m-2 s-1
Light: 67.5 uE m-2 s-1
Photoperiod: L24
Photoperiod: L20D4 (Control)
Photoperiod: L12D12
Photoperiod: L8D16
RBW: 4:1:1 (Control)
RBW: 4:1:0
RBW: 3:1:1
RBW: 3:1:0
Nitrogen: 0%
Nitrogen: 25%
Nitrogen: 50%
Nitrogen: 100% (Control)
Nitrogen: 150%
Phosphorous: 0%
Phosphorous: 25%
Phosphorous: 50%
Phosphorous: 100% (Control)
Phosphorous: 150%
Potassium: 0%
Potassium: 25%
Potassium: 50%
Potassium: 100% (Control)
Potassium: 150%
Temperature: 20°C
Temperature: 25°C (Control)
Temperature: 30°C
Temperature: 35°C
- - - - - 3.09 - - - 2.25 - - - - - 3.92 - 1.35 - - - - - - - - - - - - -
- 0.09 - - 0.62 0.59 - - 0.14 - - 1.55 - - 0.05 2.27 - - - - -0.06 0.18 2.16 -0.03 2.01 1.06 - - - -0.01 1.26
- - - - - - - - - 3.93 - - - - 1.85 - - - - - - - - - - 1.75 - - - 3.14 -
- - - - - - - - 2.12 3.43 - - - 1.38 - - - - - 2.05 - - - - - - - - 2.78 1.16 -
- - - - - - - - - 3.35 - 1.15 - - - 1.66 2.37 2.07 - - 1.11 - - 1.01 - 0.89 - - - - -
- - 2.77 - - - - - - 2.71 - - 2.53 - 2.73 - 2.39 - - - - - - - - - - - - - -
- - - 0.4 1.3 1.05 - -0.28 0.03 1.88 0.31 0.28 0.27 -1.29 - -0.31 -0.51 1.5 - 0.01 -1.69 -1.19 1.03 -1.51 0.05 - 0.74 1.55 0.53 - -
- - - - 1.6 1.54 - - - 0.48 0.75 - 0.82 - - 2.38 - - 1.93 - 1.39 - - 1.43 - 0.27 - - 0.58 1.67 -
- - - - - - - - - - - - - - - 4.95 - - - - - - - - - - - - - - -
- - - - - - - - - - - - - - - 4.95 - - - - - - - - - - - - - - -
- - -16.92 - - - 1.81 - - 2.89 - - - - - - 2.71 - 1.81 - 0.08 - - 2.44 - - - 1.52 -0.54 - -
- - - - - - - - - - - - - - - 4.95 - - - - - - - - - - - - - - -
0.91 - -0.68 - 1.02 -1.09 -1.15 0.81 - 2.55 0.22 0.89 -0.25 0.6 - 0.58 0.47 1.3 1.58 0.04 - -1.7 - - - - 0.93 -1.17 - - -0.82
- - - - - -0.49 - -0.91 -2.31 1.74 -1.02 -0.42 1.92 0.46 1.61 -1.89 0.21 0.78 -1.17 0.9 0.05 - - - 0.42 -0.14 0.52 - - 1.23 2.09
- - 1.39 2.42 -0.18 1.64 - - - 0.3 - - - - 2.54 2.33 0.93 -0.0 - - - - - - - 0.95 0.31 -0.15 - - -
- - - - - - - - - 2.68 - 2.99 2.72 - - - - - - - - - - - - - - 2.23 - - 2.43
- 0.08 0.57 0.56 0.19 0.18 -0.16 - 1.41 2.06 - 1.19 -1.17 - 1.26 - - - 0.94 0.11 -1.44 - - 1.2 - -1.27 1.34 - -0.27 - 1.27
- - - - - - - - - 3.98 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 3.93
- - - - - - - - - 4.57 - - - - - - - - - - - - - - - - - 2.86 - - -
- - - - - - - - - - - - - - - 4.95 - - - - - - - - - - - - - - -
- - - - - - - 1.79 - 4.11 - - - 2.74 - - - - - - - - - - - - - - - 1.82 -
- - - - 0.3 - - - 0.52 2.8 - 1.48 - 1.74 0.96 -0.16 -0.23 - -0.66 1.61 - - - -1.11 -1.05 - 1.07 0.39 -1.17 1.39 -1.12
- -0.24 - - -0.89 1.33 0.53 - - 2.86 1.06 -0.76 - - 1.17 -0.16 - -0.87 0.75 - -0.83 - 0.4 1.63 1.33 -0.6 - -0.52 -0.5 -0.36 -
- - - - - - 2.79 2.71 - - - - - 3.19 - 3.07 - - - - - - - - - - - - - - -
- - - - - 1.48 - - - 3.34 - 2.73 - - 1.76 - 3.01 - - - - - - - - - - - - - -
- - - - - 2.76 - - - - - - - - - 3.26 - - - - - - - 2.83 2.91 - - - - - -
- - - - - - - - - 2.97 - - - - 3.48 - - - 2.18 - - - - - - - - - 1.29 1.49 1.18
- - - - - - - - - - - - 4.23 - - 3.61 - - - - - - - - - - - - - - -
Lsat_1_v5_gn_4_24101.1 (Sec. 61-alpha1)
 - - - - - - - - - 4.95 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
- - - - - - - - - 4.95 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
- - - - - - - - - 3.79 - - - - - - - - - - - - - - - - - 3.34 - 2.82 -
- - - - - - - - - - - - - - - 4.95 - - - - - - - - - - - - - - -
- - - - - - - - - 3.79 - - - - - 4.1 - - - - - - - - - - - - - - -
- - - - - - - - - 3.04 2.98 - - - - 3.03 - - - - - - - - - - - - 2.75 - -
- - 2.43 3.42 - - - - 2.27 3.33 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
- - - - - - - - - 3.58 - - 2.06 1.22 - 1.48 - 3.28 - - - - - - - - - - - - -
- - - - - - - - - 4.95 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
-1.6 - -0.02 - 0.49 - 1.64 - - 2.77 - 1.81 0.88 - - - 0.86 1.37 -0.42 0.86 - - 0.76 - -0.46 - - - -0.36 - 1.52
- - - - - - - - - - - - - - - 4.52 - - - - 3.01 - - - - - - - - - -
-1.14 -1.08 1.98 -1.19 0.88 -0.52 0.49 -0.28 0.74 1.5 - - 0.12 0.99 0.29 0.25 0.83 0.02 -0.7 -1.69 - -1.21 - - -0.55 0.05 1.06 -1.47 -0.38 -0.59 0.25
- - - - - - 2.69 - - 3.67 2.8 - 1.23 - 1.34 - - - - - - - - - - - - - - - -
- - - - - - - - - 4.95 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
- - - - - - - - - - - - - - - 4.95 - - - - - - - - - - - - - - -
- - - - - 1.92 - - - 3.57 - - - - 2.32 - - - - 0.98 - 3.06 - - - - - - - - -
- - - - - - - - - 3.23 - - 3.62 - - 2.45 - - - - - 1.96 - - - - - - - - -
- -3.42 0.7 -0.28 -5.49 2.06 - -0.9 2.02 0.53 - - 1.93 - - 2.01 -1.84 -0.01 -1.14 - - 0.45 0.68 0.76 1.02 - - - 0.75 - -1.92
- - - - - - - - - - - - - - - 4.95 - - - - - - - - - - - - - - -
1.22 0.13 - - - - - - - 2.35 -0.01 - -0.11 -0.01 -0.01 0.99 - 2.53 - -0.3 - 0.08 - -0.27 0.72 - 1.49 0.58 -0.08 - 0.28
- - - - - - - 2.18 - 3.77 - - - - - 2.39 - - - - - - - - - - - 1.74 2.08 - -
- - - - - - - - - - - - - - - 4.95 - - - - - - - - - - - - - - -
0.89 - - - - - - 1.74 0.72 2.13 - 0.41 0.58 0.73 0.76 2.37 - - - - 0.36 - - - 0.56 - - - 0.64 1.44 0.51
- - - 2.2 1.26 - 1.38 - - - - - 1.31 - 1.94 2.11 1.05 - - - - - - 0.22 - - 0.38 1.91 - 1.33 -
- - - - - - - - - 4.38 - - - - 3.34 - - - - - - - - - - - - - - - -
- - - - - - - - - 4.95 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
- - - - - - - - - 4.95 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
- -1.59 1.36 0.55 -0.75 0.56 -0.79 - -0.31 1.78 -1.68 -0.18 -0.49 0.95 -0.63 -0.78 1.56 1.42 -1.98 - -1.1 -1.49 0.24 - -0.24 -0.01 0.18 - 0.32 -1.73 1.19
- - - - - - - - - 4.95 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
- - - - - - - - - - - - - - - 4.95 - - - - - - - - - - - - - - -
-1.18 0.77 -0.67 -2.24 -1.09 0.23 0.07 1.36 -1.09 1.58 -0.53 -1.61 0.75 1.45 -1.42 -2.17 -1.59 1.01 0.98 -1.76 0.5 - - -0.15 -0.37 0.26 -0.09 -0.04 0.44 -2.71 -0.06
- - - - - - - - - 4.95 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
0.49 - -1.59 1.05 -2.15 - -0.68 1.11 - 1.42 -0.73 1.32 0.78 -1.54 -1.79 -0.1 0.01 0.9 - 0.95 -2.1 0.62 - -0.05 1.32 - 1.05 -0.33 -0.85 0.1 -0.67
- - - - - - - - - - - - - - - 4.95 - - - - - - - - - - - - - - -
- 1.31 1.65 0.24 1.32 - - - 0.88 2.28 -1.59 - 0.15 1.04 1.66 0.07 -0.09 -0.77 0.58 - -0.74 -0.41 -0.23 -1.76 -1.74 - - - - -0.19 -0.72
- - - - - - - - - 4.95 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
1.72 -0.39 - 1.08 -0.77 0.2 -0.22 - -1.75 0.43 - - 2.15 - 0.12 0.56 -0.61 - - 1.19 - -1.59 - -0.81 1.4 1.3 -0.48 0.15 -0.11 - 0.94
-0.13 -0.24 - -1.32 1.22 1.37 - - -0.37 - -1.17 -0.42 1.33 - 0.87 1.72 - - 1.71 -1.48 0.9 1.14 -1.29 - -1.35 0.96 - 1.8 - - -1.37
0.26 0.33 1.01 -0.36 0.26 -1.02 -2.22 -0.75 0.1 1.08 - -1.39 -1.1 1.2 0.55 -0.69 0.5 -0.47 -3.06 0.27 -0.33 -0.73 -0.17 0.7 -0.94 -0.84 0.48 -1.19 0.26 1.09 0.28
- - - - - - - - - 4.57 - - - - - - - - - - - - 2.87 - - - - - - - -
1.08 - - - - - - 1.6 - 2.42 - 0.69 0.78 - - - - 1.44 - 1.59 - - - - 2.19 1.54 - 0.8 - - 1.17
- - - - - - - - - 3.24 1.06 - - - - 2.91 - 2.29 - - - - - - - 0.4 - - - 2.52 -
- - - - - - - - - 4.6 - - - - - - - 2.75 - - - - - - - - - - - - -
- - - - - - - - - - - - - - - 4.95 - - - - - - - - - - - - - - -
1.63 1.53 - 1.33 1.19 - -3.8 1.15 0.67 2.42 - 1.95 -11.02 - - 1.09 - -19.86 - - - - - -11.33 - - - 2.32 - - -
- - - - - - - 1.76 - - - 1.81 - - - 3.28 - - - - - - 1.94 - - - 1.71 - - 2.86 -
2.58 - - - - - - - - 3.93 - - - 3.29 - - - - - - - - - - - - - - - - -
- - - - - - - - - 4.95 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
- - - 1.82 - 2.45 - 1.69 1.29 4.03 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
- - - - - - - - - - - - - - - 4.95 - - - - - - - - - - - - - - -
- - - - - - - - - 3.75 - - - - - - - - 2.06 - - - - - - 2.63 2.85 - - - -
- - - - - - - - 0.73 2.93 - - 2.13 - - - - 2.83 - - - - - - - 1.33 - - - - 2.95
- - - - - - - - 1.74 - - - - 1.77 2.66 3.92 - - - - - - - - - - - - - 1.5 -
- - - - - - - - - - - - - - - 4.95 - - - - - - - - - - - - - - -
- - - - - - - - 0.66 3.52 - - - 0.92 - - - - - - - - 2.75 - - - - - 3.22 - -
- - - - - - - - - 4.24 2.72 - - - - - - 2.47 - - - - - - - - - - - - -
- 2.77 - - - - 1.26 - - 3.44 - - - 1.88 - 2.0 - - - - - - - - 1.7 - - - - - -
-1.79 -1.79 1.59 -1.87 2.06 0.99 -0.47 0.86 -1.32 1.79 -0.03 -0.21 -0.96 0.92 -1.03 -0.4 - -0.82 -1.27 -0.38 -1.35 -1.26 0.61 -2.34 -1.28 0.36 - -2.11 - -0.29 1.06
- - - - 0.93 - - - - 3.2 2.22 - - - - - - 2.46 - - 0.8 - - - - 2.01 - - 1.1 0.91 -

Details

Dark gray cells indicate values where the raw expression is zero (cannot be log-transformed). Blue cells indicate samples where the expression of the gene is below average and red cells indicate the gene is expressed above average in the sample. White cells are average.