Heatmap: Cluster_193 (Lactuca sativa (Lsa) Coexpression Clusters (HCCA Algorithm))

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(Values are log₂ transformed ratios of a genes expression in a sample divided by the mean expression level)

Gene	Light: 268 uE m-2 s-1	Light: 202.5 uE m-2 s-1 (Control)	Light: 135 uE m-2 s-1	Light: 67.5 uE m-2 s-1	Photoperiod: L24	Photoperiod: L20D4 (Control)	Photoperiod: L12D12	Photoperiod: L8D16	RBW: 4:1:1 (Control)	RBW: 4:1:0	RBW: 3:1:1	RBW: 3:1:0	Nitrogen: 0%	Nitrogen: 25%	Nitrogen: 50%	Nitrogen: 100% (Control)	Nitrogen: 150%	Phosphorous: 0%	Phosphorous: 25%	Phosphorous: 50%	Phosphorous: 100% (Control)	Phosphorous: 150%	Potassium: 0%	Potassium: 25%	Potassium: 50%	Potassium: 100% (Control)	Potassium: 150%	Temperature: 20°C	Temperature: 25°C (Control)	Temperature: 30°C	Temperature: 35°C
Lsat_1_v5_gn_1_110320.1 (FMT)	-0.46	-0.47	-0.64	-0.54	-0.13	-0.05	0.1	0.3	-0.36	-0.29	-0.22	-0.09	0.7	0.41	0.26	0.17	0.13	-0.34	-0.27	-0.15	-0.12	-0.11	0.73	-0.04	-0.04	-0.03	-0.12	0.03	-0.03	-0.01	0.5
Lsat_1_v5_gn_1_117821.1	-0.7	-0.31	-0.85	-0.69	0.12	0.3	-0.08	0.05	-0.28	-0.13	-0.01	-0.31	0.04	0.51	0.24	0.03	-0.16	0.83	-0.1	-0.46	-0.26	-0.22	0.95	-0.32	-0.19	-0.13	-0.02	-0.39	0.08	0.28	0.41
Lsat_1_v5_gn_1_21720.1 (CTL05)	-0.6	-0.49	-0.75	-0.39	0.06	0.18	0.07	0.2	-0.19	-0.32	-0.21	-0.11	0.45	0.53	0.35	-0.01	0.01	0.58	-0.23	-0.28	-0.19	-0.27	0.92	-0.24	-0.18	-0.09	-0.16	-0.25	-0.16	-0.03	0.39
Lsat_1_v5_gn_1_32141.1 (SDF2)	-0.6	-0.67	-1.09	-0.92	0.36	0.29	-0.7	-0.41	-0.59	-0.47	-0.32	-0.43	-0.15	0.52	0.51	-0.16	-0.44	1.48	0.19	-0.43	-0.28	-0.26	1.04	-0.44	-0.4	-0.27	-0.11	-0.47	0.64	0.37	0.41
Lsat_1_v5_gn_1_7381.1 (LAZ1H1)	-0.81	-0.5	-0.77	-0.66	0.14	-0.2	-0.71	-0.51	-0.09	-0.32	-0.01	-0.06	0.26	0.75	0.42	-0.45	-0.58	1.59	-0.48	-0.44	-0.91	-0.52	1.16	-0.5	-0.15	-0.55	-0.17	-1.06	0.04	0.07	1.16
Lsat_1_v5_gn_2_103201.1 (BTR1)	-0.91	-1.7	-1.61	-1.5	-1.15	-1.0	-0.3	-0.25	-0.56	-0.47	0.25	-0.13	1.08	-1.48	-1.15	-0.56	-0.04	1.38	-0.3	-0.26	-0.33	-0.32	2.05	0.19	0.08	0.14	-0.55	0.38	-0.79	0.09	0.91
Lsat_1_v5_gn_2_103280.1 (STUbL5)	-1.03	-0.46	-1.5	-1.56	0.19	0.06	-0.2	0.39	-0.44	-0.26	-0.35	-0.29	0.23	0.72	0.39	-0.11	-0.37	1.23	-0.24	-0.66	-0.65	-0.34	1.4	-0.55	-0.36	-0.32	-0.34	-0.71	0.08	0.1	1.01
Lsat_1_v5_gn_2_126320.1	-0.72	-0.6	-1.01	-0.75	0.16	0.31	-0.26	-0.15	-0.44	-0.4	-0.4	-0.16	0.56	0.48	0.25	-0.02	-0.02	0.56	-0.11	-0.32	-0.17	-0.07	0.88	-0.12	-0.07	-0.14	-0.21	-0.07	0.2	0.15	0.69
Lsat_1_v5_gn_2_128520.1	-1.07	-1.1	-1.04	-0.72	0.2	0.43	-0.72	-0.42	-0.94	-0.59	-0.71	-0.96	0.07	1.25	0.55	-0.24	-0.69	1.29	-0.7	-0.85	-0.21	-0.33	1.75	-0.53	-0.48	-0.42	-0.28	-0.9	0.31	0.08	0.98
Lsat_1_v5_gn_2_135521.1 (SLP1)	-0.43	-0.25	-0.63	-0.78	0.04	0.11	-0.45	-0.4	-0.58	-0.49	-0.34	-0.28	0.62	0.58	0.34	0.13	0.03	0.49	-0.09	-0.26	-0.08	-0.06	1.05	-0.02	-0.06	-0.13	-0.31	-0.01	0.09	0.09	0.32
Lsat_1_v5_gn_2_21280.1 (FBA8)	-1.04	-1.0	-1.05	-1.15	-0.05	-0.09	-0.51	-0.6	-0.44	-0.33	-0.31	-0.1	0.5	0.16	0.07	0.02	0.13	1.34	-0.38	-0.23	-0.07	-0.07	1.33	-0.0	-0.03	-0.17	-0.11	-0.22	0.21	0.1	0.47
Lsat_1_v5_gn_2_38821.1	-0.69	-0.74	-0.93	-0.76	0.06	0.23	0.01	0.4	-0.47	-0.33	-0.28	-0.12	0.47	0.34	0.12	0.05	0.03	0.49	-0.22	-0.18	-0.03	0.02	0.57	-0.07	0.09	0.03	-0.08	-0.05	0.07	0.11	0.45
Lsat_1_v5_gn_2_39760.1 (U1-70K)	-4.56	-1.07	-1.66	-2.28	-0.66	-0.45	-1.11	-1.66	-0.78	-0.57	-1.33	-0.97	0.53	0.92	0.57	-0.28	-0.71	2.44	-0.84	-1.03	-0.9	-0.69	1.88	-0.67	-1.71	-1.32	-0.87	-1.43	0.6	0.11	1.69
Lsat_1_v5_gn_2_50861.1 (PSL4)	-0.72	-0.51	-0.87	-0.81	0.16	0.12	-0.2	-0.04	-0.48	-0.21	-0.21	-0.16	0.59	0.34	0.16	0.05	-0.18	0.23	-0.11	-0.29	-0.29	0.08	1.06	-0.2	-0.12	0.02	-0.08	-0.23	0.04	0.13	0.84
Lsat_1_v5_gn_2_56160.1	-0.72	-0.46	-0.88	-0.85	0.23	0.18	-0.19	-0.23	-0.43	-0.34	-0.34	-0.27	0.23	0.42	0.26	0.09	-0.02	0.58	0.12	-0.14	-0.1	0.03	0.87	-0.01	0.05	-0.03	-0.03	-0.08	0.08	0.1	0.36
Lsat_1_v5_gn_2_6441.1	-0.7	-0.63	-1.02	-0.92	-0.07	0.18	-0.09	0.14	-0.66	-0.43	-0.4	-0.2	0.25	0.75	0.27	-0.36	-0.43	1.15	0.07	-0.28	-0.47	-0.24	1.25	-0.15	-0.29	-0.45	-0.26	-0.41	0.1	0.27	0.71
Lsat_1_v5_gn_2_67440.1	-0.6	-0.73	-0.8	-0.52	-0.02	0.2	-0.0	0.22	-0.45	-0.32	-0.22	-0.15	0.45	0.41	0.27	0.05	0.02	0.31	-0.28	-0.22	-0.13	-0.1	0.64	0.01	0.04	-0.02	-0.18	-0.01	0.13	0.06	0.65
Lsat_1_v5_gn_2_69141.1 (NOB1)	-4.73	-3.79	-1.6	-2.01	-0.52	-0.03	-2.67	-1.58	-1.38	-3.92	-0.19	-0.77	-0.07	1.19	0.61	0.14	-0.36	2.51	-0.01	-1.26	-1.11	-0.33	1.91	-1.01	-1.42	-2.46	-0.53	-3.36	-0.19	-0.35	1.98
Lsat_1_v5_gn_2_7301.1 (ALBA1)	-1.41	-1.65	-1.34	-0.62	0.27	0.4	0.28	0.92	-0.63	-0.56	-0.33	-0.42	-0.19	0.65	0.35	-0.3	-0.53	0.87	-0.11	-0.54	-0.28	-0.32	1.04	-0.28	-0.35	-0.32	-0.15	-0.56	0.36	0.26	0.98
Lsat_1_v5_gn_2_75581.1 (LARP1b)	-0.39	-0.62	-0.74	-0.61	0.25	0.15	-0.27	-0.11	-0.37	-0.46	-0.25	-0.08	0.51	0.2	0.1	-0.04	-0.01	0.29	-0.16	-0.24	-0.15	-0.19	1.05	-0.16	-0.13	-0.05	-0.05	-0.01	0.08	0.23	0.68
Lsat_1_v5_gn_2_90740.1 (SNL2)	-0.29	-0.2	-0.74	-0.38	0.22	0.23	0.02	0.1	-0.2	-0.14	-0.07	-0.08	0.4	0.34	0.2	-0.03	-0.11	-0.02	-0.21	-0.35	-0.23	-0.13	0.78	-0.18	-0.15	-0.16	-0.07	-0.07	-0.04	0.08	0.55
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Lsat_1_v5_gn_3_11280.1 (KELP)	-0.98	-0.93	-1.37	-1.47	-0.01	0.12	0.01	0.44	-0.75	-0.46	-0.23	-0.24	0.72	0.43	0.21	-0.1	-0.27	1.21	-0.17	-0.49	-0.42	-0.1	1.0	-0.41	-0.14	-0.15	0.01	-0.72	-0.16	-0.08	1.15
Lsat_1_v5_gn_3_138360.1 (LCBK2)	-0.44	-0.34	-0.91	-0.45	0.16	0.37	-0.17	0.11	-0.37	-0.26	-0.15	-0.1	0.54	0.29	0.16	0.05	0.04	-0.25	-0.21	-0.26	-0.12	-0.02	0.84	-0.01	-0.06	-0.11	-0.26	-0.1	0.16	0.16	0.49
Lsat_1_v5_gn_3_4280.1 (RAP2.1)	-	-5.29	-4.21	-2.95	-0.13	-0.9	-2.06	-1.3	-1.31	-0.99	-0.78	-0.44	0.53	0.75	0.07	-0.82	-1.23	2.43	-0.36	-1.73	-1.48	-1.17	2.38	-0.69	-1.41	-0.24	-1.11	-1.02	-0.26	0.04	2.05
Lsat_1_v5_gn_3_45301.1 (XCT)	-0.65	-0.46	-0.71	-0.67	0.02	0.05	-0.1	0.07	-0.5	-0.33	-0.24	-0.24	0.5	0.23	0.08	-0.05	-0.16	0.87	-0.1	-0.18	-0.13	-0.13	0.87	0.01	0.01	-0.08	-0.03	-0.1	0.01	-0.02	0.55
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Lsat_1_v5_gn_3_53181.1 (EXO70A1)	-1.51	-1.2	-0.92	-0.66	0.44	-0.03	-1.23	-1.92	-0.55	-0.54	-0.85	-0.3	0.54	0.26	0.15	-0.53	-0.5	2.12	-0.42	-0.76	-0.87	-0.74	1.72	-0.68	-0.45	-0.59	-0.84	-1.24	-0.08	0.09	1.59
Lsat_1_v5_gn_3_59680.1 (PDF1)	-0.26	-0.41	-0.47	-0.47	0.16	0.22	-0.11	-0.05	-0.16	-0.07	-0.22	-0.08	0.47	0.32	0.11	0.07	-0.08	-0.25	-0.15	-0.04	-0.1	-0.0	0.68	-0.07	-0.14	-0.03	-0.04	0.07	0.05	0.05	0.35
Lsat_1_v5_gn_3_68661.1 (NFD3)	-0.98	-1.05	-1.02	-1.04	-0.04	0.08	-0.11	0.24	-0.53	-0.35	-0.3	-0.15	0.7	0.11	0.13	-0.13	0.06	0.71	-0.1	-0.25	-0.16	-0.06	1.14	0.16	0.06	-0.17	-0.2	-0.07	-0.15	0.04	0.75
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Lsat_1_v5_gn_3_79681.1 (ELP5)	-0.2	-0.55	-1.01	-0.9	-0.26	-0.38	-0.32	-0.19	-0.73	-0.38	-0.63	-0.21	0.72	0.88	0.29	-0.04	-0.21	0.52	-0.44	-0.33	-0.35	-0.38	1.3	-0.17	-0.21	-0.15	-0.51	-0.14	0.28	0.1	1.12
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Lsat_1_v5_gn_4_134160.1	-0.69	-0.48	-0.99	-0.69	-0.34	-0.02	0.26	1.04	-0.74	-0.7	-0.73	-0.47	0.53	0.52	0.22	-0.31	-0.16	0.45	-0.11	-0.21	-0.23	-0.21	1.03	-0.17	-0.31	-0.37	-0.38	-0.37	0.3	0.02	1.04
Lsat_1_v5_gn_4_137100.1	-0.55	-0.65	-0.63	-0.48	0.28	0.28	-0.17	-0.13	-0.26	-0.22	-0.19	-0.15	0.45	0.17	0.2	0.14	-0.11	0.65	-0.17	-0.22	-0.13	-0.01	0.79	-0.11	-0.11	-0.11	-0.12	-0.07	0.08	0.13	0.23
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Lsat_1_v5_gn_9_52061.1 (EYE)	-0.77	-0.29	-0.6	-0.55	0.1	0.12	-0.44	-0.68	-0.35	-0.05	-0.06	-0.18	0.53	0.37	0.07	-0.15	-0.08	0.32	-0.17	-0.19	-0.28	-0.08	1.03	-0.22	-0.1	-0.05	-0.13	-0.26	0.24	0.39	0.75
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Lsat_1_v5_gn_9_61701.1 (ERA1)	-1.81	-0.94	-2.31	-1.73	-0.53	-0.41	-0.06	-1.08	-0.6	-0.44	-0.76	-1.34	-0.2	1.15	-0.44	-1.06	0.2	2.57	-0.04	-1.68	-1.55	-0.85	1.94	-1.96	-0.61	-0.71	-0.51	-1.12	0.27	-0.44	1.25
Lsat_1_v5_gn_9_64841.1 (ARP5)	-1.37	-1.05	-1.13	-0.89	-0.13	0.1	-0.63	-0.62	-0.21	-0.22	-0.13	-0.07	0.66	0.38	0.16	-0.06	-0.17	0.84	-0.23	-0.46	-0.37	-0.24	1.46	-0.25	-0.08	-0.05	-0.15	-0.18	-0.15	0.2	1.06

Details

Dark gray cells indicate values where the raw expression is zero (cannot be log-transformed). Blue cells indicate samples where the expression of the gene is below average and red cells indicate the gene is expressed above average in the sample. White cells are average.