Heatmap: Cluster_30 (Lactuca sativa (Lsa) Coexpression Clusters (HCCA Algorithm))

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(Values are log₂ transformed ratios of a genes expression in a sample divided by the mean expression level)

Gene	Light: 268 uE m-2 s-1	Light: 202.5 uE m-2 s-1 (Control)	Light: 135 uE m-2 s-1	Light: 67.5 uE m-2 s-1	Photoperiod: L24	Photoperiod: L20D4 (Control)	Photoperiod: L12D12	Photoperiod: L8D16	RBW: 4:1:1 (Control)	RBW: 4:1:0	RBW: 3:1:1	RBW: 3:1:0	Nitrogen: 0%	Nitrogen: 25%	Nitrogen: 50%	Nitrogen: 100% (Control)	Nitrogen: 150%	Phosphorous: 0%	Phosphorous: 25%	Phosphorous: 50%	Phosphorous: 100% (Control)	Phosphorous: 150%	Potassium: 0%	Potassium: 25%	Potassium: 50%	Potassium: 100% (Control)	Potassium: 150%	Temperature: 20°C	Temperature: 25°C (Control)	Temperature: 30°C	Temperature: 35°C
Lsat_1_v5_gn_0_12040.1	-0.72	-0.52	-0.83	-0.35	0.27	0.64	0.17	0.09	0.29	0.07	0.2	-0.05	-0.58	0.46	0.38	0.34	0.01	-2.69	-0.01	-0.06	0.12	0.17	-1.25	0.05	0.09	0.13	0.23	-0.16	0.2	0.18	0.17
Lsat_1_v5_gn_0_14720.1 (CYP712A2)	-1.64	-0.77	-1.39	-2.86	0.79	0.87	-0.19	-0.82	0.18	0.53	-0.21	-0.23	-0.62	0.82	1.28	0.67	-0.06	-2.42	0.25	0.21	-0.41	-0.26	-3.94	-1.05	-0.63	-0.09	0.07	-1.0	0.75	0.68	0.85
Lsat_1_v5_gn_0_45760.1	-0.45	0.06	-0.65	-0.78	0.67	0.46	0.2	-0.1	-0.19	-0.11	-0.05	-0.12	-0.02	0.61	0.62	0.01	-0.28	-0.09	0.0	-0.19	-0.29	-0.11	-0.59	-0.35	-0.35	-0.12	0.01	-0.19	0.48	0.21	0.3
Lsat_1_v5_gn_1_103341.1	-0.09	-0.24	-0.55	-0.29	0.33	0.59	0.26	0.48	-0.33	-0.25	-0.25	-0.23	-0.31	0.82	0.57	0.02	-0.12	-1.35	0.1	-0.18	-0.04	0.04	-0.87	0.12	-0.08	-0.18	-0.18	-0.13	0.23	0.19	0.16
Lsat_1_v5_gn_1_104861.1	-1.41	-0.7	-0.81	-0.56	-0.08	0.13	0.09	-0.09	0.19	0.09	-0.02	0.07	0.06	0.62	0.76	0.43	0.32	-0.47	0.2	0.02	0.04	-0.04	-0.73	-0.35	-0.17	0.1	0.15	-0.37	0.16	0.21	0.29
Lsat_1_v5_gn_1_105200.1 (PAM68)	-0.23	-0.59	-0.87	-0.55	0.25	0.94	-0.09	-0.76	-0.12	-0.11	0.11	-0.08	0.05	0.78	0.49	0.19	-0.01	-2.35	0.12	-0.1	-0.03	0.07	-1.72	0.05	0.09	0.13	0.2	-0.01	0.27	0.33	0.16
Lsat_1_v5_gn_1_109941.1	-0.68	-0.51	-1.3	-1.62	-0.28	0.86	0.17	-0.18	0.08	-0.03	0.06	-0.31	-0.39	1.02	0.8	0.47	0.14	-6.05	0.22	-0.11	0.28	0.38	-1.9	-0.03	0.16	0.53	0.36	0.03	0.13	-0.03	-0.81
Lsat_1_v5_gn_1_122000.1	-0.37	-0.77	-0.81	-0.73	0.11	0.38	-0.15	0.11	-0.22	-0.24	-0.05	0.11	0.27	0.71	0.41	-0.01	-0.02	-1.28	0.21	0.03	-0.04	0.02	-0.67	0.21	-0.29	0.0	0.03	0.03	0.44	0.3	0.48
Lsat_1_v5_gn_1_128760.1 (SS3)	0.05	0.13	-0.17	-0.34	0.19	0.26	-0.04	-0.13	-0.19	-0.15	-0.1	-0.18	-0.03	0.4	0.18	0.08	-0.05	-0.93	0.1	-0.24	-0.13	0.01	-0.46	0.03	-0.07	-0.09	0.02	-0.19	0.34	0.35	0.59
Lsat_1_v5_gn_1_280.1 (ATSLY1)	-0.76	-0.47	-0.63	-0.44	0.3	0.42	0.08	-0.15	-0.04	-0.11	0.04	-0.17	0.21	0.6	0.46	0.16	-0.06	-0.27	-0.03	-0.26	-0.09	0.03	-0.26	-0.14	-0.02	-0.05	-0.12	-0.15	0.27	0.34	0.32
Lsat_1_v5_gn_1_28241.1	0.07	-0.29	-0.35	-0.12	0.29	0.24	0.13	0.21	-0.14	-0.19	-0.09	-0.09	0.07	0.59	0.3	0.06	-0.04	-1.72	0.0	-0.13	0.02	-0.02	-0.51	-0.26	-0.05	0.08	-0.01	0.08	0.23	0.22	0.19
Lsat_1_v5_gn_1_32360.1	-0.79	-0.69	-0.88	-0.77	1.03	0.55	-0.09	0.02	0.03	-0.14	0.31	-0.28	-0.07	0.81	0.57	0.13	-0.07	-0.51	0.22	-0.32	-0.04	0.11	-2.84	-0.25	-0.24	-0.19	-0.23	-0.24	0.4	0.27	0.41
Lsat_1_v5_gn_1_36500.1 (PWWP3)	-1.22	-1.0	-1.17	-0.57	0.27	0.48	0.2	0.17	-0.11	-0.26	-0.23	-0.14	-0.07	0.74	0.75	0.12	-0.11	-0.7	0.03	-0.21	-0.0	-0.03	-0.4	0.05	0.03	-0.03	0.12	-0.21	0.43	0.31	0.51
Lsat_1_v5_gn_1_4680.1 (3BETAHSD/D1)	0.07	0.14	-0.68	-0.89	0.29	0.55	-0.19	-0.03	0.14	-0.43	-0.01	-0.29	0.0	0.8	0.45	-0.38	-0.23	-1.41	0.3	-0.15	-0.34	-0.39	-1.33	0.03	0.08	-0.11	0.19	-0.23	0.44	0.45	0.66
Lsat_1_v5_gn_1_48480.1	-0.54	-0.6	-0.8	-0.75	0.36	0.37	-0.13	-0.41	-0.03	0.01	0.13	0.11	0.14	0.51	0.37	0.17	-0.05	0.11	0.09	-0.11	-0.01	-0.03	-0.0	-0.21	-0.0	-0.09	-0.05	-0.04	0.17	0.15	0.19
Lsat_1_v5_gn_1_51441.1 (ATB' BETA)	-0.95	-0.71	-0.6	-0.36	0.4	0.37	0.12	0.01	-0.11	-0.14	0.07	-0.05	-0.04	0.44	0.5	0.19	0.05	-0.5	0.12	-0.19	-0.11	-0.22	-0.71	-0.14	-0.1	0.04	0.07	-0.23	0.38	0.46	0.54
Lsat_1_v5_gn_1_59680.1 (MLK2)	-0.31	0.06	-1.03	-0.79	0.23	0.41	0.27	0.06	-0.11	-0.15	-0.04	-0.17	0.12	0.45	0.32	0.13	0.02	-0.84	0.03	-0.19	-0.11	-0.03	-0.04	-0.15	-0.06	0.05	0.12	-0.12	0.22	0.24	0.33
Lsat_1_v5_gn_1_60340.1	-0.57	-0.39	-0.54	-0.9	-0.23	0.44	0.2	0.24	-0.16	-0.3	-0.01	-0.3	-0.44	0.59	0.56	0.35	0.2	-1.94	0.26	0.18	0.19	0.19	-2.07	0.07	0.05	0.28	0.43	0.16	0.19	0.19	-0.05
Lsat_1_v5_gn_1_61061.1 (Kin7.3)	-0.76	-0.85	-0.52	-0.53	-0.26	0.08	0.07	-0.06	-0.16	-0.12	-0.02	-0.09	0.22	0.6	0.38	0.19	0.11	-0.65	0.09	-0.08	-0.01	-0.0	-1.06	0.07	0.05	0.01	0.05	-0.05	0.39	0.45	0.79
Lsat_1_v5_gn_1_61501.1 (POP1)	-1.49	-0.44	-1.14	-0.34	0.01	0.22	-0.01	0.42	-0.53	-0.32	-0.49	-0.48	0.13	0.94	0.69	0.04	-0.21	-0.63	0.31	-0.69	0.1	-0.19	-0.05	-0.17	-0.43	-0.26	-0.13	-0.39	0.61	0.53	1.13
Lsat_1_v5_gn_1_61900.1	-0.24	-0.42	-0.13	-0.34	0.44	0.53	-0.03	-0.16	-0.05	-0.08	0.0	-0.2	-0.34	0.82	0.66	0.15	-0.02	-1.89	-0.02	-0.05	-0.12	0.02	-1.59	-0.21	-0.01	0.09	0.08	-0.18	0.3	0.35	0.21
Lsat_1_v5_gn_1_67541.1	-1.48	-1.05	-1.59	-1.83	0.68	0.71	0.04	0.25	-0.19	-0.13	-0.07	-0.25	-0.7	0.95	1.08	0.52	0.21	-1.53	0.21	0.04	0.1	0.11	-1.59	-0.17	-0.09	0.06	0.2	-0.26	0.16	0.15	0.22
Lsat_1_v5_gn_1_73901.1	-0.61	-0.39	-0.82	-1.05	-0.06	0.48	0.07	0.28	-0.38	-0.58	-0.24	-0.33	-0.07	1.03	0.61	0.22	0.09	-2.09	0.19	-0.18	-0.04	0.18	-0.44	0.14	0.15	0.04	0.11	-0.21	0.22	0.26	0.53
Lsat_1_v5_gn_1_80920.1 (PPP1)	-0.11	-0.22	-0.57	-0.45	0.15	0.47	0.29	0.39	0.02	-0.05	0.06	-0.13	-0.11	0.49	0.47	0.05	-0.11	-2.02	0.14	-0.15	-0.09	0.11	-1.32	0.03	-0.08	0.06	0.07	-0.0	0.23	0.22	0.15
Lsat_1_v5_gn_1_85201.1	-0.17	-0.12	-0.29	-0.08	0.7	0.3	0.04	0.29	-0.33	-0.14	-0.11	-0.14	0.04	0.35	0.44	0.11	-0.01	-0.11	-0.08	-0.3	-0.29	-0.09	-0.02	-0.43	-0.3	-0.05	-0.04	0.05	0.04	-0.03	0.09
Lsat_1_v5_gn_1_9780.1 (WRKY32)	-0.13	-0.4	-0.48	-0.54	0.08	0.32	-0.02	-0.09	0.1	0.03	0.07	0.02	-0.57	0.92	0.91	0.21	-0.08	-1.96	0.44	0.05	-0.02	0.06	-1.61	-0.15	-0.19	0.02	0.1	-0.22	0.15	0.06	0.15
Lsat_1_v5_gn_2_101421.1 (THFS)	-0.17	-0.16	-0.52	-0.59	0.55	0.57	0.1	0.06	-0.14	-0.23	-0.11	-0.21	-0.05	0.46	0.21	0.15	-0.07	-0.93	0.0	-0.23	-0.05	0.09	0.08	-0.12	-0.09	-0.03	-0.02	-0.1	0.29	0.21	0.1
Lsat_1_v5_gn_2_107041.1 (PGP1)	-1.03	-0.45	-0.97	-0.66	0.09	0.22	0.13	0.12	-0.09	-0.08	0.03	-0.02	0.26	0.32	0.35	0.43	0.23	-1.02	-0.01	-0.09	-0.06	0.05	-2.16	0.05	0.08	0.17	0.17	-0.31	0.31	0.45	0.77
Lsat_1_v5_gn_2_109900.1	-0.13	-0.22	-0.68	-0.81	-0.11	0.29	0.18	0.19	-0.05	-0.06	0.05	-0.04	0.01	0.39	0.34	0.2	0.13	-2.01	0.28	0.01	0.04	0.16	-0.77	0.18	0.06	0.06	0.05	-0.04	0.08	0.2	0.29
Lsat_1_v5_gn_2_113421.1	-0.64	-0.04	-0.38	-0.73	1.13	0.66	-0.38	0.12	0.17	-0.23	0.07	-0.09	-0.92	0.86	0.82	0.22	-0.3	-1.35	-0.12	-0.39	-0.43	-0.38	-1.11	-0.4	-0.47	-0.72	-0.4	-0.9	0.91	0.8	0.37
Lsat_1_v5_gn_2_113681.1 (SCPL27)	-0.55	-0.24	-1.1	-1.6	0.07	0.48	0.21	0.15	-0.14	-0.32	-0.05	-0.37	-0.01	0.86	0.82	0.43	0.3	-2.05	0.31	-0.04	0.17	0.24	-2.29	-0.03	0.05	0.12	0.2	0.27	0.13	-0.02	-0.2
Lsat_1_v5_gn_2_12201.1 (ASPG1)	-1.4	-1.07	-1.15	-0.88	-0.17	0.26	-0.02	0.13	0.24	0.2	0.26	0.13	-0.43	0.89	0.77	0.44	0.15	-1.15	0.22	0.17	0.12	0.11	-1.68	-0.02	-0.01	-0.04	0.12	-0.4	0.35	0.26	0.16
Lsat_1_v5_gn_2_124461.1	-0.56	-0.32	-0.39	-0.33	-0.02	0.3	0.13	0.06	-0.12	0.02	0.01	-0.05	0.09	0.36	0.31	0.18	0.14	-0.62	0.04	-0.11	-0.08	0.06	-0.67	-0.14	0.06	0.05	0.16	-0.08	0.29	0.26	0.27
Lsat_1_v5_gn_2_125321.1 (LSF2)	-0.07	0.14	-0.07	-0.14	0.25	0.41	-0.13	-0.19	-0.11	-0.23	0.03	-0.28	-0.45	0.53	0.39	0.07	-0.12	-1.67	0.33	-0.18	-0.09	0.03	-0.83	-0.14	-0.03	-0.13	0.03	-0.62	0.37	0.43	0.68
Lsat_1_v5_gn_2_128201.1	-0.4	-0.26	-0.63	-0.73	0.39	0.61	0.08	-0.06	-0.24	-0.25	-0.15	-0.19	0.02	0.46	0.22	0.24	0.11	-0.64	0.13	0.06	0.06	0.1	-1.29	0.09	0.16	0.09	0.15	0.04	0.04	0.08	0.32
Lsat_1_v5_gn_2_128600.1 (PEX11B)	-0.71	-0.73	-1.19	-1.44	-0.05	0.73	0.49	0.36	0.04	-0.06	0.0	-0.3	-0.17	0.66	0.39	0.16	0.02	-2.09	0.16	-0.23	0.15	0.16	-1.2	0.22	0.16	0.2	0.23	-0.08	0.3	0.37	0.01
Lsat_1_v5_gn_2_135361.1	-0.01	0.01	-0.34	-0.42	0.2	0.29	0.14	0.12	0.0	-0.05	-0.06	-0.19	-0.2	0.55	0.38	0.1	-0.01	-1.25	0.16	-0.1	-0.01	-0.01	-0.57	-0.05	-0.07	0.09	0.06	0.03	0.18	0.11	0.0
Lsat_1_v5_gn_2_135921.1 (SPMS)	-0.22	0.26	-0.04	-0.17	0.13	0.28	0.05	0.25	-0.38	-0.38	-0.25	-0.32	-0.01	0.79	0.49	-0.08	-0.19	-0.14	-0.06	-0.48	-0.39	-0.04	-0.73	-0.39	-0.18	-0.13	-0.16	-0.41	0.45	0.4	0.68
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Lsat_1_v5_gn_9_90160.1 (MRP7)	-0.24	-0.03	-0.21	-0.31	0.05	-0.07	0.19	0.12	-0.02	0.04	-0.0	-0.21	-0.38	0.57	0.53	0.16	-0.02	-0.61	-0.03	-0.31	-0.27	-0.25	-0.17	-0.4	-0.29	-0.07	-0.16	-0.52	0.51	0.64	0.6
Lsat_1_v5_gn_9_99500.1 (DJ1B)	-0.13	-0.09	-0.17	-0.15	0.26	0.4	0.13	0.12	-0.08	-0.04	-0.09	-0.2	0.04	0.5	0.31	0.18	0.08	-0.91	0.09	-0.12	-0.08	-0.03	-0.19	-0.21	-0.06	-0.04	-0.06	-0.09	0.03	-0.01	0.05

Details

Dark gray cells indicate values where the raw expression is zero (cannot be log-transformed). Blue cells indicate samples where the expression of the gene is below average and red cells indicate the gene is expressed above average in the sample. White cells are average.