1. Home
  2. Tools
  3. Expression Heatmap
  4. Results

Heatmap: Cluster_176 (Lactuca sativa (Lsa) Coexpression Clusters (HCCA Algorithm))

View as: (view raw or zlog-transformed)

View using InCHLib : here ( Experimental feature, still under development)

(Values are normalized against highest expression of the row)

 Transpose table  Download table
Gene
Light: 268 uE m-2 s-1
Light: 202.5 uE m-2 s-1 (Control)
Light: 135 uE m-2 s-1
Light: 67.5 uE m-2 s-1
Photoperiod: L24
Photoperiod: L20D4 (Control)
Photoperiod: L12D12
Photoperiod: L8D16
RBW: 4:1:1 (Control)
RBW: 4:1:0
RBW: 3:1:1
RBW: 3:1:0
Nitrogen: 0%
Nitrogen: 25%
Nitrogen: 50%
Nitrogen: 100% (Control)
Nitrogen: 150%
Phosphorous: 0%
Phosphorous: 25%
Phosphorous: 50%
Phosphorous: 100% (Control)
Phosphorous: 150%
Potassium: 0%
Potassium: 25%
Potassium: 50%
Potassium: 100% (Control)
Potassium: 150%
Temperature: 20°C
Temperature: 25°C (Control)
Temperature: 30°C
Temperature: 35°C
0.12 0.15 0.06 0.03 0.31 0.12 0.07 0.07 0.09 0.04 0.06 0.07 0.11 0.18 0.27 0.13 0.1 1.0 0.07 0.04 0.09 0.07 0.39 0.06 0.06 0.06 0.05 0.08 0.1 0.12 0.08
0.09 0.13 0.09 0.12 0.24 0.11 0.06 0.13 0.12 0.09 0.13 0.08 0.1 0.2 0.13 0.1 0.1 1.0 0.09 0.08 0.05 0.08 0.6 0.16 0.08 0.07 0.11 0.08 0.17 0.18 0.28
0.02 0.02 0.0 0.0 0.2 0.1 0.01 0.01 0.01 0.01 0.01 0.01 0.08 0.17 0.17 0.01 0.01 1.0 0.04 0.0 0.02 0.01 0.52 0.02 0.03 0.01 0.02 0.02 0.01 0.02 0.0
0.09 0.04 0.02 0.04 0.31 0.17 0.11 0.11 0.1 0.07 0.09 0.05 0.14 0.24 0.31 0.14 0.07 1.0 0.16 0.09 0.12 0.11 0.45 0.09 0.09 0.08 0.12 0.08 0.13 0.13 0.17
0.06 0.03 0.03 0.02 0.12 0.11 0.08 0.06 0.02 0.02 0.03 0.04 0.13 0.11 0.15 0.04 0.05 1.0 0.06 0.05 0.04 0.05 0.47 0.05 0.05 0.05 0.04 0.06 0.05 0.03 0.02
0.02 0.05 0.01 0.02 0.2 0.1 0.02 0.01 0.01 0.01 0.02 0.01 0.06 0.17 0.16 0.04 0.02 1.0 0.04 0.01 0.02 0.02 0.41 0.02 0.02 0.01 0.03 0.03 0.03 0.04 0.01
0.13 0.15 0.09 0.05 0.15 0.08 0.04 0.03 0.03 0.03 0.04 0.03 0.05 0.09 0.07 0.05 0.04 1.0 0.05 0.03 0.03 0.03 0.31 0.03 0.03 0.03 0.03 0.03 0.03 0.03 0.04
0.11 0.1 0.13 0.11 0.19 0.2 0.1 0.11 0.1 0.1 0.1 0.1 0.16 0.27 0.21 0.11 0.12 1.0 0.11 0.09 0.1 0.11 0.45 0.12 0.13 0.11 0.11 0.1 0.13 0.16 0.18
0.15 0.11 0.16 0.2 0.35 0.29 0.12 0.09 0.16 0.17 0.18 0.15 0.13 0.33 0.32 0.18 0.15 1.0 0.23 0.14 0.14 0.18 0.5 0.15 0.15 0.15 0.15 0.11 0.19 0.18 0.16
0.14 0.18 0.09 0.08 0.17 0.09 0.03 0.02 0.04 0.04 0.05 0.04 0.07 0.17 0.12 0.08 0.07 1.0 0.06 0.04 0.05 0.05 0.4 0.04 0.04 0.06 0.06 0.05 0.06 0.07 0.08
0.13 0.15 0.09 0.08 0.28 0.19 0.09 0.08 0.11 0.12 0.08 0.08 0.13 0.32 0.26 0.13 0.09 1.0 0.16 0.11 0.13 0.12 0.54 0.13 0.13 0.12 0.11 0.12 0.12 0.1 0.12
0.03 0.04 0.01 0.01 0.13 0.08 0.0 0.0 0.0 0.0 0.01 0.0 0.04 0.13 0.11 0.01 0.0 1.0 0.01 0.0 0.01 0.01 0.4 0.01 0.01 0.01 0.01 0.01 0.01 0.01 0.01
0.09 0.07 0.05 0.03 0.2 0.16 0.06 0.06 0.07 0.08 0.09 0.08 0.19 0.29 0.25 0.09 0.08 1.0 0.12 0.09 0.08 0.09 0.4 0.09 0.09 0.07 0.09 0.09 0.11 0.1 0.19
0.2 0.2 0.19 0.18 0.33 0.21 0.12 0.1 0.13 0.13 0.15 0.15 0.17 0.32 0.3 0.18 0.15 1.0 0.18 0.13 0.14 0.14 0.55 0.12 0.13 0.15 0.15 0.14 0.16 0.16 0.17
0.06 0.05 0.07 0.07 0.24 0.12 0.04 0.04 0.05 0.03 0.06 0.04 0.05 0.2 0.16 0.05 0.03 1.0 0.06 0.04 0.03 0.05 0.37 0.03 0.03 0.05 0.05 0.05 0.08 0.07 0.05
0.04 0.03 0.01 0.01 0.19 0.2 0.05 0.06 0.04 0.04 0.05 0.04 0.1 0.11 0.13 0.08 0.06 1.0 0.12 0.06 0.08 0.1 0.47 0.08 0.09 0.07 0.08 0.13 0.11 0.08 0.04
0.05 0.05 0.03 0.05 0.28 0.13 0.02 0.02 0.04 0.04 0.05 0.04 0.06 0.21 0.22 0.05 0.03 1.0 0.08 0.03 0.05 0.05 0.46 0.04 0.04 0.04 0.05 0.04 0.08 0.06 0.07
0.03 0.04 0.03 0.06 0.2 0.14 0.03 0.04 0.04 0.04 0.05 0.03 0.07 0.23 0.23 0.05 0.07 1.0 0.08 0.05 0.07 0.05 0.59 0.04 0.06 0.08 0.07 0.07 0.11 0.08 0.08
0.18 0.19 0.14 0.12 0.22 0.23 0.12 0.14 0.13 0.13 0.13 0.11 0.13 0.24 0.21 0.14 0.12 1.0 0.13 0.12 0.12 0.13 0.49 0.11 0.14 0.14 0.13 0.12 0.15 0.14 0.14
0.11 0.09 0.04 0.03 0.31 0.26 0.07 0.07 0.06 0.06 0.07 0.05 0.11 0.3 0.27 0.11 0.07 1.0 0.2 0.08 0.11 0.11 0.58 0.11 0.1 0.1 0.11 0.08 0.15 0.13 0.08
0.13 0.13 0.09 0.1 0.4 0.33 0.17 0.17 0.14 0.13 0.15 0.14 0.24 0.28 0.28 0.17 0.17 1.0 0.2 0.13 0.15 0.13 0.44 0.16 0.15 0.11 0.15 0.13 0.2 0.2 0.18
0.06 0.05 0.1 0.1 0.23 0.13 0.1 0.08 0.09 0.07 0.07 0.07 0.1 0.25 0.18 0.07 0.09 1.0 0.12 0.11 0.09 0.08 0.57 0.09 0.11 0.09 0.09 0.08 0.15 0.14 0.18
0.02 0.01 0.01 0.0 0.2 0.16 0.01 0.01 0.01 0.0 0.01 0.01 0.09 0.24 0.15 0.02 0.01 1.0 0.04 0.0 0.01 0.02 0.46 0.03 0.03 0.01 0.02 0.02 0.04 0.02 0.03
0.01 0.01 0.0 0.0 0.2 0.09 0.01 0.0 0.01 0.01 0.01 0.01 0.06 0.14 0.2 0.02 0.01 1.0 0.05 0.01 0.02 0.01 0.45 0.03 0.02 0.01 0.02 0.02 0.01 0.03 0.01
0.15 0.13 0.09 0.04 0.25 0.09 0.03 0.04 0.03 0.03 0.03 0.03 0.07 0.15 0.14 0.05 0.03 1.0 0.07 0.02 0.03 0.03 0.41 0.03 0.04 0.03 0.03 0.03 0.06 0.06 0.04
0.05 0.12 0.03 0.01 0.08 0.05 0.02 0.0 0.01 0.01 0.01 0.01 0.05 0.05 0.05 0.03 0.02 1.0 0.02 0.01 0.01 0.01 0.32 0.01 0.01 0.02 0.01 0.01 0.01 0.01 0.01
0.09 0.13 0.05 0.02 0.16 0.09 0.01 0.01 0.03 0.03 0.04 0.02 0.08 0.11 0.09 0.06 0.04 1.0 0.04 0.04 0.03 0.03 0.36 0.03 0.03 0.04 0.04 0.04 0.04 0.03 0.04
0.01 0.01 0.01 0.01 0.25 0.14 0.01 0.01 0.02 0.02 0.02 0.01 0.04 0.27 0.27 0.06 0.02 1.0 0.04 0.01 0.02 0.02 0.53 0.03 0.03 0.02 0.02 0.02 0.07 0.06 0.03
0.07 0.04 0.03 0.04 0.17 0.12 0.1 0.08 0.09 0.11 0.11 0.12 0.14 0.25 0.26 0.12 0.1 1.0 0.09 0.09 0.07 0.07 0.6 0.08 0.09 0.07 0.07 0.07 0.08 0.11 0.12
0.15 0.16 0.14 0.11 0.16 0.09 0.05 0.05 0.07 0.09 0.09 0.1 0.11 0.09 0.1 0.1 0.09 1.0 0.05 0.07 0.07 0.06 0.36 0.05 0.06 0.07 0.05 0.05 0.12 0.11 0.11
0.0 0.0 0.0 0.0 0.04 0.03 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.01 0.03 0.1 0.17 0.01 0.01 1.0 0.03 0.01 0.01 0.01 0.63 0.03 0.04 0.0 0.02 0.03 0.0 0.01 0.0
0.15 0.18 0.05 0.05 0.34 0.22 0.11 0.1 0.12 0.11 0.11 0.09 0.13 0.24 0.27 0.14 0.11 1.0 0.13 0.09 0.11 0.12 0.5 0.09 0.1 0.11 0.11 0.14 0.12 0.12 0.08
0.13 0.16 0.06 0.02 0.08 0.03 0.01 0.01 0.01 0.01 0.01 0.01 0.03 0.03 0.03 0.01 0.01 1.0 0.02 0.01 0.01 0.01 0.33 0.01 0.01 0.01 0.01 0.01 0.02 0.02 0.03
0.15 0.11 0.11 0.11 0.39 0.13 0.03 0.03 0.08 0.07 0.09 0.06 0.04 0.15 0.18 0.07 0.05 1.0 0.06 0.04 0.05 0.04 0.65 0.03 0.04 0.04 0.05 0.05 0.12 0.08 0.04
0.04 0.05 0.04 0.04 0.18 0.14 0.06 0.04 0.08 0.09 0.07 0.08 0.09 0.2 0.22 0.14 0.11 1.0 0.1 0.1 0.09 0.07 0.43 0.06 0.07 0.07 0.09 0.08 0.08 0.08 0.07
0.1 0.08 0.09 0.11 0.22 0.14 0.04 0.05 0.07 0.07 0.08 0.08 0.09 0.29 0.25 0.09 0.06 1.0 0.11 0.05 0.07 0.06 0.53 0.05 0.07 0.06 0.07 0.05 0.09 0.09 0.13
0.09 0.1 0.07 0.07 0.32 0.27 0.15 0.18 0.09 0.08 0.1 0.09 0.1 0.21 0.23 0.13 0.11 1.0 0.22 0.11 0.12 0.12 0.59 0.1 0.1 0.11 0.13 0.13 0.22 0.13 0.11
0.02 0.03 0.01 0.01 0.17 0.05 0.01 0.01 0.01 0.01 0.02 0.01 0.04 0.25 0.23 0.02 0.01 1.0 0.04 0.01 0.02 0.01 0.5 0.01 0.02 0.01 0.03 0.01 0.03 0.02 0.01
0.04 0.1 0.03 0.05 0.17 0.16 0.06 0.05 0.05 0.05 0.06 0.04 0.05 0.28 0.17 0.06 0.05 1.0 0.09 0.05 0.07 0.08 0.59 0.06 0.05 0.06 0.1 0.05 0.09 0.07 0.08
0.02 0.07 0.02 0.03 0.15 0.14 0.04 0.04 0.05 0.03 0.04 0.05 0.05 0.3 0.2 0.08 0.05 1.0 0.07 0.06 0.06 0.08 0.54 0.05 0.06 0.04 0.06 0.03 0.11 0.09 0.07
0.03 0.02 0.0 0.02 0.27 0.18 0.08 0.08 0.09 0.06 0.1 0.07 0.06 0.16 0.22 0.09 0.06 1.0 0.07 0.06 0.07 0.08 0.46 0.07 0.08 0.06 0.08 0.06 0.07 0.11 0.07
0.16 0.15 0.13 0.12 0.32 0.23 0.14 0.14 0.11 0.12 0.13 0.11 0.14 0.3 0.23 0.15 0.12 1.0 0.16 0.12 0.13 0.12 0.57 0.12 0.12 0.12 0.13 0.11 0.16 0.15 0.16
Lsat_1_v5_gn_7_1081.1 (UBDK GAMMA 4)
 0.22 0.25 0.14 0.07 0.22 0.16 0.06 0.06 0.07 0.07 0.07 0.07 0.12 0.29 0.21 0.1 0.09 1.0 0.21 0.07 0.07 0.08 0.49 0.07 0.07 0.08 0.08 0.07 0.08 0.09 0.1
0.03 0.03 0.05 0.05 0.17 0.04 0.03 0.03 0.03 0.02 0.05 0.03 0.04 0.1 0.11 0.05 0.04 1.0 0.03 0.04 0.03 0.03 0.5 0.04 0.04 0.04 0.03 0.03 0.05 0.04 0.04
0.18 0.15 0.14 0.21 0.29 0.21 0.21 0.16 0.16 0.17 0.17 0.15 0.21 0.34 0.37 0.2 0.18 1.0 0.21 0.18 0.17 0.15 0.65 0.16 0.15 0.16 0.19 0.17 0.24 0.22 0.21
0.02 0.05 0.01 0.04 0.06 0.12 0.11 0.1 0.05 0.05 0.05 0.04 0.1 0.16 0.16 0.07 0.06 1.0 0.05 0.04 0.06 0.07 0.45 0.04 0.07 0.05 0.07 0.04 0.12 0.1 0.15
0.05 0.04 0.04 0.06 0.14 0.2 0.09 0.08 0.08 0.07 0.06 0.06 0.11 0.19 0.15 0.1 0.08 1.0 0.09 0.08 0.06 0.05 0.52 0.06 0.07 0.1 0.06 0.05 0.12 0.12 0.14
0.21 0.21 0.2 0.2 0.38 0.22 0.1 0.1 0.11 0.1 0.11 0.11 0.11 0.28 0.27 0.14 0.1 1.0 0.11 0.09 0.1 0.11 0.63 0.1 0.1 0.12 0.12 0.11 0.14 0.13 0.12
0.15 0.19 0.08 0.06 0.24 0.16 0.02 0.02 0.06 0.05 0.08 0.04 0.05 0.25 0.24 0.07 0.03 1.0 0.13 0.03 0.05 0.04 0.53 0.05 0.03 0.06 0.06 0.03 0.13 0.11 0.08
0.0 0.0 0.0 0.0 0.13 0.11 0.0 0.01 0.0 0.01 0.02 0.01 0.12 0.08 0.06 0.0 0.01 1.0 0.02 0.01 0.0 0.0 0.44 0.0 0.03 0.0 0.01 0.02 0.0 0.02 0.03
0.02 0.02 0.01 0.02 0.28 0.13 0.04 0.02 0.04 0.04 0.06 0.03 0.05 0.23 0.21 0.05 0.03 1.0 0.06 0.03 0.05 0.04 0.37 0.02 0.03 0.03 0.04 0.02 0.07 0.1 0.1
0.16 0.19 0.1 0.08 0.25 0.15 0.09 0.08 0.07 0.07 0.09 0.06 0.09 0.2 0.2 0.1 0.08 1.0 0.13 0.07 0.09 0.08 0.46 0.07 0.08 0.09 0.09 0.08 0.11 0.09 0.07
0.1 0.11 0.08 0.12 0.28 0.17 0.07 0.08 0.11 0.1 0.11 0.11 0.11 0.22 0.2 0.11 0.09 1.0 0.11 0.1 0.09 0.11 0.47 0.1 0.1 0.12 0.12 0.11 0.16 0.14 0.16
0.2 0.18 0.17 0.21 0.25 0.23 0.2 0.2 0.16 0.14 0.16 0.15 0.2 0.3 0.25 0.15 0.14 1.0 0.16 0.13 0.15 0.15 0.59 0.13 0.16 0.16 0.18 0.16 0.17 0.14 0.16
0.06 0.1 0.08 0.07 0.23 0.28 0.18 0.23 0.1 0.11 0.11 0.1 0.14 0.28 0.16 0.17 0.11 1.0 0.16 0.12 0.15 0.13 0.58 0.09 0.15 0.18 0.15 0.11 0.21 0.2 0.25
0.15 0.14 0.11 0.15 0.29 0.25 0.14 0.11 0.15 0.16 0.17 0.14 0.14 0.34 0.32 0.17 0.14 1.0 0.17 0.12 0.13 0.13 0.66 0.13 0.15 0.13 0.13 0.12 0.23 0.27 0.23
0.19 0.19 0.13 0.15 0.37 0.16 0.08 0.06 0.06 0.06 0.08 0.07 0.11 0.26 0.22 0.1 0.07 1.0 0.1 0.06 0.08 0.07 0.6 0.06 0.06 0.07 0.08 0.06 0.07 0.06 0.02
0.14 0.17 0.16 0.16 0.27 0.33 0.25 0.28 0.19 0.2 0.22 0.19 0.23 0.35 0.29 0.23 0.23 1.0 0.23 0.21 0.22 0.22 0.53 0.2 0.23 0.22 0.25 0.22 0.28 0.28 0.32
0.01 0.02 0.0 0.0 0.1 0.1 0.0 0.0 0.0 0.05 0.0 0.0 0.0 0.02 0.01 0.0 0.01 1.0 0.05 0.01 0.0 0.0 0.48 0.0 0.0 0.03 0.01 0.02 0.0 0.01 0.0
0.14 0.11 0.13 0.17 0.33 0.26 0.17 0.18 0.15 0.17 0.2 0.17 0.2 0.35 0.36 0.2 0.18 1.0 0.2 0.16 0.17 0.18 0.52 0.15 0.16 0.2 0.19 0.18 0.22 0.18 0.22
0.1 0.16 0.05 0.02 0.1 0.12 0.02 0.02 0.01 0.01 0.02 0.01 0.04 0.07 0.09 0.04 0.02 1.0 0.03 0.02 0.02 0.01 0.42 0.02 0.01 0.03 0.02 0.02 0.02 0.02 0.01
0.06 0.1 0.04 0.02 0.16 0.1 0.04 0.03 0.03 0.04 0.05 0.04 0.07 0.12 0.11 0.05 0.04 1.0 0.06 0.04 0.03 0.04 0.47 0.02 0.03 0.03 0.04 0.04 0.04 0.05 0.06
0.13 0.09 0.09 0.14 0.33 0.16 0.09 0.06 0.1 0.11 0.11 0.08 0.08 0.24 0.22 0.1 0.07 1.0 0.12 0.08 0.08 0.08 0.53 0.07 0.09 0.07 0.08 0.09 0.14 0.12 0.11
0.03 0.04 0.01 0.04 0.24 0.14 0.0 0.0 0.0 0.01 0.01 0.01 0.06 0.16 0.08 0.01 0.0 1.0 0.04 0.0 0.02 0.02 0.46 0.02 0.03 0.02 0.0 0.04 0.04 0.02 0.04
0.14 0.12 0.11 0.12 0.38 0.15 0.05 0.06 0.08 0.08 0.11 0.08 0.08 0.25 0.23 0.1 0.08 1.0 0.14 0.07 0.07 0.08 0.55 0.07 0.05 0.08 0.08 0.08 0.12 0.1 0.09
0.04 0.06 0.01 0.01 0.2 0.08 0.04 0.03 0.05 0.06 0.04 0.05 0.03 0.22 0.23 0.09 0.04 1.0 0.05 0.04 0.03 0.03 0.49 0.03 0.03 0.03 0.04 0.02 0.09 0.11 0.05
0.09 0.1 0.07 0.07 0.3 0.22 0.06 0.06 0.11 0.1 0.15 0.15 0.17 0.28 0.27 0.13 0.11 1.0 0.12 0.12 0.12 0.09 0.43 0.12 0.12 0.12 0.14 0.1 0.18 0.19 0.21

Details

Expression values normalized per gene (using the maximum value, Green cells indicate low expression and red high. (Dark gray cells indicate missing values)