Heatmap: Cluster_37 (Lactuca sativa (Lsa) Coexpression Clusters (HCCA Algorithm))

View as: (view raw or row-normalized)

View using InCHLib : here ( Experimental feature, still under development)

(Values are log2 transformed ratios of a genes expression in a sample divided by the mean expression level)

Gene
Light: 268 uE m-2 s-1
Light: 202.5 uE m-2 s-1 (Control)
Light: 135 uE m-2 s-1
Light: 67.5 uE m-2 s-1
Photoperiod: L24
Photoperiod: L20D4 (Control)
Photoperiod: L12D12
Photoperiod: L8D16
RBW: 4:1:1 (Control)
RBW: 4:1:0
RBW: 3:1:1
RBW: 3:1:0
Nitrogen: 0%
Nitrogen: 25%
Nitrogen: 50%
Nitrogen: 100% (Control)
Nitrogen: 150%
Phosphorous: 0%
Phosphorous: 25%
Phosphorous: 50%
Phosphorous: 100% (Control)
Phosphorous: 150%
Potassium: 0%
Potassium: 25%
Potassium: 50%
Potassium: 100% (Control)
Potassium: 150%
Temperature: 20°C
Temperature: 25°C (Control)
Temperature: 30°C
Temperature: 35°C
- - - - - - - - - - - - 4.05 - - - - - 3.85 - - - - - - - - - - - -
-2.03 - 0.94 -0.5 0.22 -0.1 0.83 0.04 -0.61 -1.43 0.07 -0.03 -0.7 -0.4 -0.6 -0.91 0.35 0.52 -0.4 0.27 -0.1 - 0.46 -2.49 0.6 -1.08 -0.62 1.11 0.25 0.79 1.44
- - - - - - - - - - - - - - - - - - 4.95 - - - - - - - - - - - -
- - - - - - - - 0.89 - - - - - - - - 1.85 2.92 2.35 1.78 - - - - 1.02 - - 2.47 - 0.93
- - - - - 1.55 - - - - 1.72 2.67 - - - - - - - - - - - - 2.6 - - 2.65 - 1.6 1.61
- - - - - - - - - - - - - - - - - - - 4.95 - - - - - - - - - - -
- - - - - 2.83 - - - - - - - - - - - - 4.58 - - - - - - - - - - - -
0.74 -0.36 1.37 -1.44 -2.02 0.27 1.6 2.16 0.03 0.45 0.25 -0.36 -0.13 - -0.07 - -0.95 - - -1.95 - 1.73 - - -1.83 -0.76 - -0.11 0.8 1.27 -1.3
1.25 - - - - 1.7 - - - 2.66 - - - 1.1 - 1.15 - 1.47 2.99 - - - - - - - - 0.76 - - 1.2
- - - - - - - 4.42 - - - - - - -20.96 - - - - - - - - - - - - - - - 3.26
- - 1.32 - - - 0.95 - 1.06 - 2.5 - 1.14 - - - 0.97 - - 3.47 - - - - - 1.83 - - - - -
-0.34 1.68 - - -3.89 - - -0.36 0.16 - 1.96 -1.25 0.98 - -2.15 - -0.43 1.06 3.44 - -0.55 -0.42 - - - - 0.2 -0.78 -0.41 -0.09 -
- - 3.51 - - - - 3.47 - - - - - - - - - 3.09 - - - - - - - - - - - - -
- 0.08 -1.91 - -0.0 0.1 -0.51 - -1.39 0.67 -0.06 - 0.16 0.27 1.09 0.55 -2.42 -0.33 0.86 1.29 -1.38 0.03 - -1.26 0.69 -1.23 1.4 1.36 0.62 1.01 -2.28
- - - - - - - - 1.7 - - - 1.88 - - - - 2.59 1.79 - - - - - 1.8 - 1.99 2.84 - - -
- -0.75 -0.8 - - -1.19 - 0.72 -1.0 0.15 - 1.71 -0.96 -0.74 - - - - - 2.81 -0.19 0.11 0.14 -1.08 1.0 -0.15 0.14 1.96 - - 1.74
- - - - - 1.86 - - - - - - - - - - - - 4.29 - - - - 1.9 - - - 2.02 - - -
- - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 4.95 - - -
-0.54 -1.09 -1.19 0.38 -0.28 2.25 0.62 1.03 0.17 1.36 0.68 -0.14 -0.93 -1.16 0.71 0.81 0.21 -1.04 -2.75 - -0.19 -0.26 - -0.29 -0.93 -0.47 -0.49 - -0.3 - 0.37
- - - - 2.35 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 4.33 2.52 - -
- - - - - - - 3.06 - - - - - - - - - 3.45 - - - 2.56 1.76 - - - - - - - 1.25
- - - - - - - - - - - - - - - - - - - 4.4 - - - - - - - 3.31 - - -
- - - - - - 2.89 - - - - 1.16 - - - - - - 3.43 2.64 - - - - - - - - - - 2.13
- - - - - - - 4.95 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
- - - - - - - 4.08 - - - - - - - - - - 3.82 - - - - - - - - - - - -
- - - - - - - - - - - - - - - - - - 4.95 - - - - - - - - - - - -
- - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 4.95 - - -
- - - - - - - 4.95 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
- - - - -1.1 -0.06 - - 0.61 1.1 0.49 - - - 1.06 1.4 -0.11 - -1.34 1.48 1.27 0.74 - - 2.29 -1.11 1.38 - 0.94 0.77 -
- - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 4.95 - - -
- - - - - - - - - - - - - - - - - - 4.95 - - - - - - - - - - - -
- 1.16 - - - 0.82 - - 0.71 - - - - 1.97 - 2.01 - - - 1.62 - - 2.58 - - - - - 0.83 2.72 -
- - - - - - - - - - - 2.98 - - - 3.24 - - - - - - - - - - - 2.84 - 2.7 -
- - - - - - - 3.94 - - - - - - - - 3.97 - - - - - - - - - - - - - -
- - - - - - - - - - - - - - - - - - - 3.99 - - - - - - - 3.92 - - -
- 1.53 0.47 - -0.18 1.37 - 1.14 1.45 - - - - 0.3 1.36 0.03 0.89 - 2.13 -0.17 - - 1.25 0.05 0.01 0.06 - -0.1 - - -
2.24 -0.04 - - -1.93 0.03 -6.49 - - 0.43 2.31 - - - - 1.45 -1.44 - 3.54 - -1.03 -0.06 - - - -1.34 -0.08 - -4.04 -3.44 -
- - - - 2.41 - - - - - 2.63 - - - - - - - - 4.28 - - - - - - - - - - -
- - - - - - - 4.95 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
- - 0.73 - 1.94 - 1.41 1.56 - - - - - - - - 1.2 - 3.56 1.25 1.77 - - - - - - - - - -
- - - - - - - 4.95 - - - -16.44 - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
0.4 - 0.81 - 0.85 1.7 - - 0.63 1.19 - - -0.84 1.44 - 0.1 -0.91 2.47 1.43 - - - 0.02 - - 0.18 -0.95 -1.33 - 0.98 -0.13
- - - - - - -0.68 - - 0.8 - - - 0.49 - 1.79 1.13 - - 2.72 - 1.49 - - 0.84 -0.68 -0.47 2.21 1.4 0.25 -0.72
- - - - - - - - - - - - - 0.36 1.98 - - - 1.74 2.84 - - - - - - - - 1.76 2.04 2.96
- - - - 0.02 - - - 0.46 0.98 - -1.01 - 1.16 1.38 0.02 0.37 - - 0.96 - 1.71 - -1.3 1.11 -0.34 -0.38 1.23 0.48 2.56 -
- - - - 1.25 1.22 - 1.48 2.47 - - - - - - - - - 2.79 - 2.65 - - - 2.26 - - - - - -
- - - - 1.54 - - 2.09 - - - - - - - - 1.89 - - - - 2.8 - - - - - 2.67 2.76 - -
- - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 4.95 - - -
1.37 -2.54 -0.61 - -0.33 -1.46 -2.53 -0.88 -3.8 1.35 - - 1.03 -0.41 0.47 -0.29 -1.75 0.9 0.91 - -1.16 - - 0.28 -0.66 -1.01 1.29 1.68 -0.75 1.46 1.18
- - - - - - - - - - - 2.63 - 2.06 1.07 1.14 - 2.38 1.24 - - - - - - 0.71 0.68 2.47 - - -
- 0.7 -0.06 -0.69 -3.61 0.42 - - -0.92 -1.03 -0.39 0.55 -2.44 -0.07 0.39 -1.65 0.42 -3.09 -2.01 0.65 -2.05 1.39 -0.19 0.92 1.33 0.93 1.03 -0.85 - 2.03 -1.43
- - - - - - - - - - - 1.57 1.66 - - 2.83 - - - 2.47 - 1.7 - - - - - 3.16 - - -
- - - - 2.07 - 1.59 3.29 1.41 - - - - - 2.41 1.82 - - - - - - - - - - - - 1.33 - -
- - - - - - - 4.95 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
- - - - - - - 4.95 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
- - - - - - - - - - - 2.15 - - - 2.19 - 3.4 - - - - - - - - - 3.52 - - -
- - - - - - - 4.95 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
- - - 1.04 -1.42 1.11 - 0.25 - - - -0.87 - - 1.7 0.57 0.72 - 3.04 0.8 - - 0.35 - - -0.64 - 0.13 1.34 0.15 0.78
0.46 -0.51 1.39 0.97 0.01 -0.41 - - - -0.6 - 1.89 - -1.46 1.9 0.32 0.04 - 1.09 -0.12 1.05 0.54 - - -1.74 -0.16 -0.52 0.8 -1.63 -0.53 -0.69
- - - - - - - 4.95 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
- 0.83 - - - 1.46 - - - - - - - - - - - 0.21 2.41 - 1.3 0.75 1.59 0.45 - 0.17 1.28 - 2.98 - -
- - - - - - - - - - - - - - - - - - - 3.88 - - - - - - - - - 4.02 -
- - - - - - - - - 3.52 - - 2.92 - - - - - 2.59 - - - - - - - - - - 2.56 -
- - - - - - - - - - - - - - - - - - 3.85 3.7 1.84 - - - - - - - - - -
- - - - 0.36 - 2.38 - - - - 2.41 - - - 1.11 - - - - - - - - 1.56 - - 2.98 - 2.62 -
0.7 -1.03 -0.86 -1.09 -1.16 0.48 0.93 -0.32 -0.73 -1.02 -0.46 0.1 -0.21 -0.55 0.64 0.0 -0.42 0.31 0.61 0.3 0.47 -2.04 -1.13 0.88 -0.75 0.3 -0.35 -0.73 0.13 0.86 0.59
- - - - - - - - - - - - - - - - - - - 4.95 - - - - - - - - - - -
2.76 - - - - - 1.23 - - - - - - - - 0.98 - - 3.1 - - - - - 3.06 - - 1.59 - - -
- - - - - - - 4.95 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
- - - - - - - - - - - - - - - - - - 4.95 - - - - - - - - - - - -
- - - - - - - 4.95 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
- - 2.96 - - 0.4 - - - 0.94 - 1.53 - - - - - -0.14 - 3.46 - - 1.79 - - - - - - - 0.75
- - 0.83 - - 1.53 1.6 - - - - - - -0.36 1.68 - 1.9 -0.59 - 0.29 - 2.52 - - - 0.19 2.02 0.52 - -0.56 -0.54
- -0.27 0.37 0.87 -0.56 -0.03 - - -0.73 -1.06 - 0.52 -0.89 -0.49 - 1.03 1.37 1.32 1.83 - -0.2 - - - -0.02 - 0.24 0.1 1.18 0.3 1.73
- - - - - - - - 2.48 - - - 0.49 - - - - - 3.36 - - - 0.67 - - - - - - 3.61 -
1.15 - - - 1.2 -0.25 - - 1.02 - - - - 1.03 1.06 - - - 1.78 - 0.63 - 1.54 2.37 -0.21 -0.47 -0.35 - - 0.95 1.08
0.18 -2.47 -0.46 0.33 -0.82 0.59 -0.67 -1.27 -1.19 -1.14 - -0.88 0.82 0.29 0.21 -0.43 0.32 0.76 1.38 0.3 -0.01 -0.41 - -0.84 -1.19 -0.33 -0.34 -0.04 0.19 0.72 1.77
- - - 0.56 0.48 1.11 - 0.24 - - - - - 2.79 - 1.93 1.52 - - 2.81 - - - 2.06 - - - - - - -
- - - - 0.72 -0.34 - - -0.48 2.21 -0.2 1.55 - - -0.1 1.44 - -0.38 - 2.88 - - - - 1.24 1.88 - - - - 0.68
- - - - - - - - - - - - - - - - - - - 4.95 - - - - - - - - - - -
0.88 0.61 0.55 0.56 0.21 0.21 0.41 -0.65 0.6 -0.49 -1.46 - -1.39 0.39 1.24 0.5 -0.91 1.24 1.25 -1.72 -0.73 0.92 -0.15 -1.65 -2.53 -1.7 -1.73 - -0.17 -0.62 -0.43
0.55 -0.09 - - 0.2 -0.18 0.22 1.24 -1.61 -1.19 0.2 - -1.4 -0.27 -1.23 0.9 - - 0.53 -1.59 0.07 -0.27 - -0.55 1.11 0.61 1.53 2.02 0.22 0.58 -
- - - - - - - 2.68 - 0.35 - - - - - - - - 0.31 2.5 0.23 - 1.41 - 1.32 - - - 2.39 2.27 -
- 1.35 - - - - - - - - - - 1.25 - - 1.63 1.37 2.08 1.08 0.99 - - 1.68 - - - 1.28 2.14 1.03 - -
- - - -0.77 0.05 0.96 -1.65 -1.26 -1.27 1.78 -0.62 -0.62 0.65 -0.84 0.51 -0.45 0.54 0.29 -1.24 1.16 -0.84 -0.74 0.17 -1.48 0.35 -2.16 -0.21 0.52 0.78 1.04 0.79
- - - - - - - 3.57 - - - - - - - 2.88 - - - - - - - - - - 3.56 - - - -
- - - - - - - - - - - - - - - - - - 4.95 - - - - - - - - - - - -
- - - - - - - - - - - - - - - - - - 4.95 - - - - - - - - - - - -
- - - - - - - - - - - - 3.19 - - - - - - - - - - - - - - 4.45 - - -
-0.35 0.95 -0.77 1.2 - -2.18 -2.03 - -0.79 0.69 0.11 - 1.15 -0.47 0.01 -0.63 0.28 0.29 1.7 0.73 - -3.72 0.53 0.86 -2.82 0.77 0.69 - 0.74 0.32 -
- - - - - - - 3.0 - 1.36 1.46 - - - 1.67 - 2.43 - 2.09 - - - 1.39 1.16 - - - - - - -
0.35 - - 0.31 0.02 1.14 - - 0.41 - - - - - - - - - 3.12 - 0.98 0.27 - 1.7 1.13 0.17 1.98 - - - 0.63
- - - - - - - - - - - - - - - - - - - 4.95 - - - - - - - - - - -
- - - - -1.64 -6.35 0.22 2.46 -0.47 0.45 - - -1.15 - 0.49 -0.91 0.93 2.63 - - - - -1.13 1.17 -1.09 - 1.32 -2.25 1.41 1.16 -0.65
- - - - - - - - - - - - - - - - - - 4.95 - - - - - - - - - - - -
- -0.4 -1.43 -1.46 -0.12 0.34 -0.74 -1.5 0.12 - -0.45 1.03 0.84 -0.27 1.38 - 1.36 -0.27 0.38 1.63 0.47 1.17 0.64 -0.74 -1.75 -1.96 - -0.21 -1.56 -0.15 0.08
- - - - - - - - - - - - - - - - - - 3.79 - - - - - - - - 4.1 - - -
- - - - 2.2 - - - - - - - - - 2.26 - - - - 1.93 - - - - - - - 3.74 2.14 - -
-0.52 -0.21 -0.39 -0.22 0.42 0.26 -0.89 -0.24 0.5 0.2 0.03 -0.58 -0.23 0.15 0.41 -0.52 0.28 0.59 0.87 0.22 -0.03 -0.51 -1.17 -0.57 -0.13 -0.2 0.32 -0.8 0.5 0.37 -0.29
- - - - - - - 4.95 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
- - - - 0.84 1.15 - - 1.76 - - -0.15 0.61 1.25 1.7 0.87 -0.04 0.66 2.18 - - -0.12 - -0.21 0.45 0.34 -0.28 -0.08 - -1.14 -
-0.63 -0.1 -1.43 -0.54 -0.44 -0.24 -0.16 -0.68 0.16 0.3 0.04 -0.01 -0.27 0.04 0.23 -1.11 0.42 0.9 0.58 -0.1 0.47 -0.53 -0.47 0.08 0.2 0.13 0.24 -0.28 0.64 0.32 -0.21
- - - 1.34 1.62 1.98 - 1.71 1.39 - - 0.0 - - 1.75 - - 1.92 - 2.39 - - 0.01 - - - - - - 0.25 -
- - - - 0.0 - - - -0.21 - 1.01 - 0.07 0.35 0.16 - -0.19 1.49 1.77 2.1 0.76 - - - 1.47 - - - 2.33 0.88 -0.05
- - - - - - - - - - - - - - - - - - 4.95 - - - - - - - - - - - -
- - - - 0.86 - 1.53 - - - - - 0.24 - 1.27 - - 2.06 3.21 - 1.97 - 1.26 - - - - 0.9 0.15 - -
- - - - - - - 3.2 - - - - - - - - - - 4.45 - - - - - - - - - - - -
- - - - - - - 4.95 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
- - - - - 0.66 - - 1.07 - - - 0.81 - - - -0.2 - 2.83 - - - - 2.43 - - 2.52 - - - 2.69
- - - - - 2.87 2.82 2.97 - 1.45 1.3 - - - - - - - - - - 1.85 - - - - - - - - -
- - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 4.95 - - -
- - - - - - - - - - - - - - 2.8 - 1.8 - - 3.43 1.43 1.88 - - - - 1.76 - - - -
-1.96 -0.61 -1.62 -2.34 0.34 0.81 0.15 0.06 -0.71 0.13 0.73 -2.95 -0.77 -0.18 0.48 -0.76 -1.45 -1.69 0.34 0.67 -0.4 1.46 -0.42 -0.02 0.64 -0.87 0.77 0.81 0.2 0.01 -0.08
- - -0.01 0.52 -0.41 - 0.8 2.83 1.78 -0.09 - - - - - 2.34 -0.13 - - - 1.28 - -1.81 - 0.23 1.23 - -0.38 0.69 - -
- - - - - - - - - - - - - - - - - - - 4.95 - - - - - - - - - - -
- 0.63 - - - 1.22 1.67 2.49 - - 2.36 - - - 1.55 - - - - - - - - 2.27 - - 1.55 1.32 - - -
0.52 -0.44 - 0.48 -0.83 - 0.22 1.66 -0.98 - 0.31 0.71 0.27 0.5 0.28 - 2.04 -0.95 0.49 -0.97 0.51 - 1.26 -0.94 0.04 0.83 - - - - 0.69
- - - - - - - - 3.21 - - - 3.56 - - - - - 3.31 - - - - - - - - - - - -
- - - - - - - 4.95 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
- - - - - - - - - - - - - - - - - - - 4.95 - - - - - - - - - - -
- - - - - 2.0 - - - - - - - - - - - 2.47 - 3.35 - - 2.54 - - - - - - - 2.44
- - - - - - - 4.95 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
- - - - -0.4 -1.05 -1.87 - 0.27 1.5 1.5 -0.86 -0.9 0.44 0.95 -0.71 -0.57 - 1.13 1.37 -1.25 0.75 0.15 - 0.48 - 0.95 -0.41 1.15 0.9 -0.29
1.53 -0.08 0.11 2.01 1.14 -16.28 - -0.72 -0.94 - -11.03 - - 0.48 -2.62 0.21 - - -0.94 -27.23 0.61 -25.19 - 1.24 2.7 - - 1.39 0.31 0.31 -
- - - - - - - - - - - - - - - - - - - 4.95 - - - - - - - - - - -
- - - - - - - - - - - - - - - - - - - 4.95 - - - - - - - - - - -
- - - -0.32 0.86 -0.03 - -0.58 -0.99 0.49 - - 1.04 1.8 - -0.65 1.0 - 2.36 1.26 0.37 - 1.55 -0.63 -0.72 - - 0.16 1.34 - -
- - - - - - - - - - 3.49 2.36 - - - - - - 2.15 - - - - - - - - 2.36 2.36 - -
- - - 1.96 - -1.21 - 0.44 -0.35 - - -1.16 2.16 0.73 0.57 0.28 - -0.24 0.95 1.24 - - 1.43 - - - - -1.39 -1.05 1.1 2.14
0.31 0.35 - 1.17 1.39 0.46 -0.16 - - 0.58 - -0.8 - 1.24 -0.73 - - 0.91 2.29 - - - 1.37 - 1.04 - - -1.04 -1.1 1.34 0.5
- - - - - - - - - 2.9 - - - - - - - - 2.94 - - - - - - - - 3.06 - 2.91 -

Details

Dark gray cells indicate values where the raw expression is zero (cannot be log-transformed). Blue cells indicate samples where the expression of the gene is below average and red cells indicate the gene is expressed above average in the sample. White cells are average.