Heatmap: Cluster_24 (Lactuca sativa (Lsa) Coexpression Clusters (HCCA Algorithm))

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(Values are log₂ transformed ratios of a genes expression in a sample divided by the mean expression level)

Gene	Light: 268 uE m-2 s-1	Light: 202.5 uE m-2 s-1 (Control)	Light: 135 uE m-2 s-1	Light: 67.5 uE m-2 s-1	Photoperiod: L24	Photoperiod: L20D4 (Control)	Photoperiod: L12D12	Photoperiod: L8D16	RBW: 4:1:1 (Control)	RBW: 4:1:0	RBW: 3:1:1	RBW: 3:1:0	Nitrogen: 0%	Nitrogen: 25%	Nitrogen: 50%	Nitrogen: 100% (Control)	Nitrogen: 150%	Phosphorous: 0%	Phosphorous: 25%	Phosphorous: 50%	Phosphorous: 100% (Control)	Phosphorous: 150%	Potassium: 0%	Potassium: 25%	Potassium: 50%	Potassium: 100% (Control)	Potassium: 150%	Temperature: 20°C	Temperature: 25°C (Control)	Temperature: 30°C	Temperature: 35°C
Lsat_1_v5_gn_0_30021.1	-0.23	0.37	-0.59	-0.59	0.52	0.57	0.18	-0.29	-0.38	-0.51	-0.38	-0.88	-0.25	0.76	0.83	0.27	-0.05	0.51	0.13	-0.37	-0.1	-0.05	-0.11	-0.54	-0.17	-0.08	0.06	-0.14	0.29	-0.12	-0.59
Lsat_1_v5_gn_0_5220.1 (DND2)	0.37	0.36	-0.12	-0.74	0.45	0.2	-0.19	-1.02	-0.17	-0.1	-0.1	0.13	-0.31	1.32	0.62	-0.36	0.34	-2.91	0.34	0.12	-0.05	0.08	-0.9	-1.01	-0.02	-0.06	-0.07	0.14	-0.29	-0.2	0.06
Lsat_1_v5_gn_0_5240.1 (DND2)	0.29	0.32	-0.14	-0.58	0.65	0.56	-0.04	-0.8	0.08	-0.03	-0.07	0.17	-0.65	1.14	0.48	-0.37	-0.02	-2.63	0.36	0.12	0.04	0.14	-1.38	-0.99	0.1	0.09	0.11	0.09	-0.38	-0.53	-0.04
Lsat_1_v5_gn_1_109401.1 (SK21)	-0.02	-0.27	0.04	-0.04	0.38	0.46	-0.12	-0.29	-0.18	-0.15	-0.05	-0.13	-0.08	0.43	0.31	-0.01	-0.14	-0.71	0.0	-0.1	0.0	0.11	-0.51	-0.2	0.05	0.16	0.16	0.15	0.12	0.08	-0.06
Lsat_1_v5_gn_1_110081.1 (NTAN1)	-0.82	-0.83	-0.79	-0.41	0.49	0.66	-0.61	-0.71	-0.18	-0.1	0.03	-0.07	-0.05	1.16	0.48	0.58	0.16	-0.99	0.03	-0.24	-0.09	-0.1	-0.44	-0.24	-0.01	0.08	0.23	-0.24	0.23	0.09	0.2
Lsat_1_v5_gn_1_110100.1	0.24	0.04	-0.2	-0.32	0.64	0.47	-0.37	-0.12	-0.15	-0.27	-0.03	-0.14	-0.13	0.68	0.3	-0.02	-0.14	-1.92	0.2	-0.25	-0.12	0.03	-0.6	0.09	0.04	-0.05	-0.01	-0.02	0.21	0.17	0.06
Lsat_1_v5_gn_1_116121.1	-1.11	-1.16	-1.06	-1.55	0.42	1.02	-0.95	-1.14	-0.44	-0.55	-0.09	-0.74	-0.49	1.5	0.99	0.45	-0.27	-0.55	0.56	-0.44	-0.21	-0.09	-1.11	-0.23	-0.15	-0.13	0.04	-0.5	0.75	0.56	0.63
Lsat_1_v5_gn_1_128400.1 (SPL4)	0.67	0.78	0.06	-1.81	1.23	1.16	-1.46	-2.1	-1.09	-1.44	-0.95	-2.08	-4.88	2.32	1.94	-0.72	-1.42	-3.51	0.8	-0.81	-1.19	-0.39	-8.13	-0.36	-0.97	-1.29	-0.54	-1.0	0.67	-0.11	-0.44
Lsat_1_v5_gn_1_128440.1 (SPL4)	1.06	0.82	-0.06	-1.33	1.28	1.78	-1.45	-2.53	-0.81	-2.52	-0.61	-2.29	-4.62	2.26	0.71	-0.7	-1.85	-	0.7	-1.75	-0.18	-0.2	-5.75	-0.5	-0.66	-0.19	0.14	-0.32	0.3	-1.25	-0.06
Lsat_1_v5_gn_1_128700.1 (LAF6)	0.49	0.18	0.03	-0.06	0.48	0.36	0.01	-0.03	-0.19	-0.3	-0.1	-0.31	-0.41	0.55	0.35	-0.08	-0.21	-0.8	0.33	-0.09	-0.03	-0.02	-0.64	-0.14	-0.17	-0.09	-0.09	0.23	0.09	-0.03	-0.31
Lsat_1_v5_gn_1_129560.1 (RbcX1)	-0.54	-0.86	-1.68	-2.2	1.37	1.55	-0.94	-1.75	-0.97	-1.28	-0.64	-1.38	-0.72	1.24	0.47	0.27	-0.41	-0.61	0.71	-0.34	0.04	0.36	-1.38	0.22	0.23	-0.17	0.25	-0.02	0.46	0.16	-0.04
Lsat_1_v5_gn_1_130260.1 (ATPK5)	-0.09	0.07	-0.23	-0.49	0.32	0.47	0.05	0.01	-0.44	-0.39	-0.2	-0.29	0.01	0.53	0.62	0.04	-0.04	0.55	0.74	-0.03	-0.2	-0.2	-1.07	-0.02	-0.31	-0.2	-0.08	-0.26	-0.03	-0.14	-0.09
Lsat_1_v5_gn_1_19560.1 (AOS)	-1.04	0.58	-1.6	-1.67	0.67	0.43	0.23	0.02	-0.82	-0.96	-0.52	-1.19	-0.62	1.4	1.26	0.43	0.13	1.02	0.45	-0.46	-0.47	-0.41	-0.65	-0.57	-0.34	-0.51	-0.42	-0.72	0.13	0.0	0.09
Lsat_1_v5_gn_1_25241.1	-0.11	-0.25	-0.28	-0.41	0.25	0.5	-0.1	-0.2	-0.06	-0.04	-0.02	-0.28	-0.17	0.47	0.28	0.11	-0.22	-0.25	0.99	-0.06	-0.19	-0.14	-0.71	-0.1	-0.13	-0.14	-0.11	-0.33	0.18	0.19	0.21
Lsat_1_v5_gn_1_30801.1	-0.02	0.08	0.0	-0.35	0.09	0.31	0.14	0.22	-0.23	-0.29	-0.13	-0.3	-0.39	0.77	0.66	0.18	-0.0	0.61	0.42	-0.37	-0.27	-0.31	0.03	-0.37	-0.4	-0.2	-0.11	-0.5	-0.02	-0.16	-0.35
Lsat_1_v5_gn_1_34401.1 (PIFI)	0.5	0.32	-0.08	-0.42	1.3	0.9	-0.39	0.52	-0.34	-0.51	-0.24	-0.32	-0.75	1.06	0.24	-0.27	-0.78	-2.45	0.13	-0.73	-0.41	-0.24	-0.38	-0.04	-0.26	-0.43	-0.31	-0.45	0.32	0.13	0.05
Lsat_1_v5_gn_1_38421.1	-0.36	0.56	-1.09	-1.4	0.42	0.83	0.29	-0.25	-0.41	-0.47	-0.09	-0.77	-1.3	1.08	0.82	0.42	0.04	-0.06	0.05	-0.4	0.15	0.14	-1.21	-0.71	-0.27	0.37	0.29	0.36	-0.03	-0.13	-0.87
Lsat_1_v5_gn_1_39321.1 (OZS2)	0.05	0.25	-0.61	-1.18	0.48	0.9	-0.2	-0.72	-0.51	-0.84	-0.38	-0.97	-0.45	1.24	0.78	-0.14	-0.21	0.58	0.61	-0.39	-0.1	-0.1	-1.94	-0.0	-0.15	-0.37	-0.18	-0.73	0.08	0.03	0.73
Lsat_1_v5_gn_1_58500.1	-0.33	-0.19	-0.44	-0.44	0.61	0.85	-0.37	-0.46	-0.06	-0.36	0.14	-0.57	-0.87	1.15	0.76	0.12	-0.51	-1.18	0.24	-0.31	0.01	0.07	-1.08	-0.25	-0.15	0.07	0.22	-0.58	0.42	0.21	0.27
Lsat_1_v5_gn_1_61561.1	0.31	-0.09	-0.68	-0.83	1.09	1.19	-0.31	-0.46	-0.31	-0.39	-0.23	-0.58	0.07	1.25	0.63	-0.23	-0.53	-2.16	0.25	-0.33	-0.18	-0.27	-2.66	-0.08	-0.12	-0.36	-0.2	-0.48	0.55	0.5	-0.2
Lsat_1_v5_gn_1_66080.1 (MATE)	-0.1	-0.08	-0.6	-1.02	0.58	0.71	-0.12	-0.26	-0.28	-0.59	-0.41	-0.92	-0.62	0.68	0.72	0.11	-0.31	0.24	1.31	-0.21	-0.2	-0.19	-3.53	-0.13	-0.23	-0.09	-0.07	-0.34	0.49	0.31	0.1
Lsat_1_v5_gn_1_77640.1 (ROQH)	0.38	0.21	-0.04	-0.06	0.39	0.36	0.09	0.09	0.05	0.01	0.12	-0.02	-0.19	0.44	0.36	-0.04	-0.13	-2.35	0.09	-0.03	-0.05	-0.01	-1.43	0.05	-0.02	0.0	0.03	0.15	-0.08	-0.12	-0.38
Lsat_1_v5_gn_1_89581.1 (KCA2)	-0.06	-0.29	-1.51	-1.51	1.15	1.06	-0.39	-0.58	-0.07	-0.5	-0.32	-0.88	-0.7	1.19	1.35	0.17	-0.37	-1.41	0.52	-0.4	0.17	-0.0	-3.78	-0.15	-0.42	-0.24	-0.01	-0.02	0.52	0.14	-0.58
Lsat_1_v5_gn_1_93020.1 (PUP10)	0.61	0.67	0.3	-0.17	0.53	0.8	0.04	0.01	-0.64	-1.03	-0.63	-0.9	-1.03	1.7	1.09	-0.02	-0.39	-2.52	0.12	-0.61	-0.22	-0.18	-2.79	-0.73	-0.51	-0.01	-0.14	-0.53	0.34	0.05	-0.75
Lsat_1_v5_gn_1_99500.1 (ANX1)	0.5	0.89	0.31	-0.11	0.85	0.88	0.15	-0.63	-0.31	-0.64	-0.26	-0.76	-1.44	1.5	0.9	-0.24	-0.58	-1.89	0.52	-0.25	-0.36	-0.04	-3.17	-0.92	-0.57	-0.05	0.02	-0.76	0.05	-0.3	-0.54
Lsat_1_v5_gn_2_102120.1 (PT)	0.1	0.44	0.34	0.48	0.54	0.54	-0.23	-0.44	-0.01	-0.14	0.2	-0.05	-0.73	0.7	0.63	-0.01	-0.19	-1.12	-0.05	-0.37	-0.11	-0.12	-3.18	-0.29	-0.17	0.03	-0.02	-0.36	-0.06	-0.09	0.28
Lsat_1_v5_gn_2_103080.1 (SEX4)	0.41	0.25	0.32	0.05	0.59	0.36	-0.17	-0.37	-0.09	-0.06	0.06	-0.22	-0.48	0.42	0.25	0.04	-0.05	-0.66	0.26	-0.08	-0.09	0.02	-0.92	-0.26	-0.26	-0.1	-0.02	0.02	0.1	-0.05	-0.31
Lsat_1_v5_gn_2_104520.1 (AAPT1)	0.16	0.07	-0.03	-0.31	0.3	0.49	-0.36	-0.08	-0.41	-0.49	-0.42	-0.28	0.13	1.36	0.71	-0.07	-0.18	-0.83	0.05	-0.09	-0.17	-0.05	-0.55	-0.4	-0.3	0.01	0.09	0.3	0.16	-0.33	-0.62
Lsat_1_v5_gn_2_104821.1 (PDR11)	0.32	-0.58	-1.65	-1.63	1.28	1.02	-0.97	-0.65	-0.23	-0.61	-0.29	-0.71	-0.51	1.26	0.93	-0.16	-0.79	-0.91	0.21	-0.78	0.25	0.13	-0.3	-0.17	0.09	0.26	0.22	-0.51	0.38	-0.09	-0.35
Lsat_1_v5_gn_2_11741.1	-1.37	-0.14	-1.46	-1.28	0.92	1.21	0.18	0.09	-0.03	-0.4	-0.23	-0.69	-0.6	0.87	0.63	0.22	-0.2	-1.55	0.26	-0.33	-0.1	0.25	-1.02	-0.04	-0.41	-0.06	0.35	-0.35	0.38	0.21	0.15
Lsat_1_v5_gn_2_126000.1	-0.3	0.01	-0.23	-0.79	0.68	1.14	0.32	-0.09	-0.36	-0.41	-0.21	-0.48	-1.27	1.44	1.05	-0.05	-0.25	-4.69	0.43	-0.24	0.04	0.27	-1.77	-0.22	-0.24	0.11	0.21	0.17	-0.46	-0.92	-0.86
Lsat_1_v5_gn_2_131181.1 (FRO4)	-0.01	-0.04	-0.52	-0.55	0.42	0.78	0.0	-0.17	-0.61	-0.68	-0.44	-0.89	-0.8	1.58	1.1	-0.09	-0.55	-1.25	0.52	-0.38	-0.22	-0.09	-3.33	-0.02	-0.07	-0.09	-0.2	-0.11	0.27	0.19	0.35
Lsat_1_v5_gn_2_134000.1 (BFT)	0.21	0.24	-0.78	-1.37	0.6	0.72	0.24	0.38	-1.25	-1.06	-0.93	-1.46	-1.15	2.06	2.01	0.15	-0.29	-2.07	0.74	-0.43	-0.38	-0.43	-3.04	-0.47	-0.74	-0.69	-0.85	-0.83	0.0	-0.47	-0.78
Lsat_1_v5_gn_2_13421.1 (AtHMP25)	-0.19	-0.2	-0.79	-0.8	0.64	0.78	-0.15	-0.16	-0.5	-0.55	-0.46	-0.81	-1.24	1.53	0.97	0.15	-0.36	-0.81	0.11	-0.44	-0.1	0.17	-2.57	-0.45	-0.26	-0.03	-0.01	-0.51	0.87	0.5	0.12
Lsat_1_v5_gn_2_136280.1 (PPH1)	0.44	0.33	0.04	-0.1	0.32	0.45	0.09	0.13	0.19	0.08	0.12	-0.09	-0.58	0.39	0.23	0.24	-0.04	-2.73	0.04	-0.14	0.02	0.09	-1.3	0.06	-0.14	0.08	0.19	0.13	-0.08	-0.38	-0.72
Lsat_1_v5_gn_2_35160.1 (EAR1)	0.74	0.71	0.42	-0.34	0.7	0.62	-0.58	-0.42	-0.66	-0.79	-0.45	-0.47	-0.54	1.56	0.97	-0.25	-0.3	-1.84	0.62	-0.35	-0.25	-0.25	-1.9	-0.49	-0.61	-0.24	-0.39	-0.2	0.2	-0.47	-0.35
Lsat_1_v5_gn_2_45860.1 (J20)	-0.42	-0.42	-1.07	-1.11	0.6	1.0	-0.18	-0.27	-0.3	-0.64	-0.28	-0.88	-0.98	1.36	1.0	0.21	-0.4	-2.61	0.55	-0.38	0.02	0.06	-1.6	-0.02	-0.12	-0.04	0.01	-0.37	0.82	0.41	0.04
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Details

Dark gray cells indicate values where the raw expression is zero (cannot be log-transformed). Blue cells indicate samples where the expression of the gene is below average and red cells indicate the gene is expressed above average in the sample. White cells are average.