Heatmap: Cluster_174 (Lactuca sativa (Lsa) Coexpression Clusters (HCCA Algorithm))

View as: (view raw or zlog-transformed)

View using InCHLib : here ( Experimental feature, still under development)

(Values are normalized against highest expression of the row)

Gene	Light: 268 uE m-2 s-1	Light: 202.5 uE m-2 s-1 (Control)	Light: 135 uE m-2 s-1	Light: 67.5 uE m-2 s-1	Photoperiod: L24	Photoperiod: L20D4 (Control)	Photoperiod: L12D12	Photoperiod: L8D16	RBW: 4:1:1 (Control)	RBW: 4:1:0	RBW: 3:1:1	RBW: 3:1:0	Nitrogen: 0%	Nitrogen: 25%	Nitrogen: 50%	Nitrogen: 100% (Control)	Nitrogen: 150%	Phosphorous: 0%	Phosphorous: 25%	Phosphorous: 50%	Phosphorous: 100% (Control)	Phosphorous: 150%	Potassium: 0%	Potassium: 25%	Potassium: 50%	Potassium: 100% (Control)	Potassium: 150%	Temperature: 20°C	Temperature: 25°C (Control)	Temperature: 30°C	Temperature: 35°C
Lsat_1_v5_gn_1_116641.1 (SNZ)	0.39	0.6	1.0	0.92	0.37	0.32	0.27	0.16	0.27	0.2	0.22	0.24	0.08	0.17	0.21	0.15	0.12	0.1	0.26	0.07	0.24	0.16	0.13	0.13	0.28	0.22	0.31	0.18	0.41	0.23	0.25
Lsat_1_v5_gn_1_124201.1 (CYCD6;1)	0.74	0.48	1.0	0.63	0.21	0.12	0.16	0.04	0.22	0.2	0.21	0.26	0.25	0.15	0.11	0.23	0.26	0.25	0.15	0.22	0.2	0.19	0.21	0.21	0.18	0.24	0.22	0.28	0.26	0.25	0.34
Lsat_1_v5_gn_1_20960.1	0.73	0.32	1.0	0.56	0.12	0.09	0.08	0.05	0.13	0.15	0.14	0.17	0.16	0.14	0.09	0.15	0.19	0.05	0.12	0.14	0.12	0.14	0.05	0.12	0.13	0.16	0.15	0.21	0.1	0.12	0.12
Lsat_1_v5_gn_1_26001.1 (PATL3)	0.75	0.58	1.0	0.68	0.2	0.16	0.18	0.22	0.11	0.12	0.13	0.14	0.33	0.49	0.21	0.19	0.19	0.19	0.12	0.11	0.14	0.15	0.34	0.09	0.13	0.16	0.13	0.16	0.14	0.11	0.15
Lsat_1_v5_gn_1_69980.1 (ARA)	0.71	0.6	1.0	0.74	0.18	0.16	0.11	0.1	0.18	0.19	0.22	0.31	0.58	0.29	0.19	0.41	0.44	0.12	0.12	0.21	0.25	0.29	0.04	0.22	0.26	0.36	0.29	0.38	0.15	0.17	0.19
Lsat_1_v5_gn_2_105060.1 (AGC1-12)	0.53	0.43	0.84	1.0	0.22	0.24	0.26	0.16	0.25	0.17	0.26	0.22	0.09	0.48	0.37	0.48	0.42	0.03	0.18	0.21	0.23	0.31	0.0	0.13	0.22	0.26	0.27	0.27	0.19	0.18	0.03
Lsat_1_v5_gn_2_131600.1 (IQD24)	0.98	0.88	1.0	0.83	0.28	0.14	0.15	0.18	0.11	0.15	0.15	0.13	0.3	0.41	0.31	0.17	0.18	0.25	0.18	0.14	0.15	0.14	0.2	0.14	0.17	0.17	0.15	0.17	0.19	0.22	0.21
Lsat_1_v5_gn_2_136081.1 (SINAT3)	0.72	0.81	1.0	0.4	0.34	0.26	0.12	0.12	0.2	0.2	0.18	0.22	0.2	0.33	0.3	0.28	0.29	0.27	0.19	0.17	0.2	0.18	0.22	0.15	0.17	0.24	0.25	0.23	0.19	0.23	0.27
Lsat_1_v5_gn_2_45920.1 (XTH16)	0.58	0.43	1.0	0.95	0.15	0.12	0.1	0.06	0.11	0.14	0.12	0.13	0.2	0.42	0.28	0.29	0.24	0.3	0.1	0.11	0.13	0.15	0.26	0.07	0.12	0.18	0.17	0.19	0.1	0.11	0.08
Lsat_1_v5_gn_2_58201.1 (AGP12)	0.74	0.75	1.0	0.98	0.31	0.22	0.26	0.31	0.33	0.37	0.34	0.37	0.43	0.73	0.32	0.35	0.48	0.1	0.35	0.41	0.44	0.44	0.06	0.4	0.46	0.52	0.52	0.56	0.43	0.49	0.44
Lsat_1_v5_gn_2_65721.1 (GEM)	0.73	0.68	1.0	0.76	0.53	0.48	0.26	0.18	0.42	0.38	0.46	0.47	0.49	0.37	0.37	0.44	0.42	0.38	0.35	0.37	0.39	0.44	0.42	0.37	0.42	0.48	0.45	0.41	0.38	0.4	0.52
Lsat_1_v5_gn_2_73601.1 (PIRL5)	0.38	0.27	0.81	1.0	0.25	0.19	0.15	0.09	0.24	0.28	0.28	0.26	0.23	0.17	0.24	0.33	0.33	0.29	0.19	0.25	0.24	0.23	0.13	0.19	0.22	0.31	0.28	0.25	0.24	0.26	0.24
Lsat_1_v5_gn_2_95521.1 (NAT12)	0.88	0.7	1.0	0.6	0.23	0.24	0.33	0.31	0.33	0.34	0.34	0.38	0.61	0.31	0.28	0.38	0.41	0.18	0.26	0.35	0.32	0.32	0.11	0.34	0.37	0.38	0.37	0.38	0.29	0.31	0.51
Lsat_1_v5_gn_3_109941.1 (GLX2-5)	0.92	0.84	1.0	0.9	0.61	0.61	0.57	0.54	0.61	0.59	0.61	0.59	0.81	0.58	0.62	0.64	0.67	0.41	0.52	0.58	0.58	0.54	0.62	0.59	0.61	0.57	0.57	0.7	0.63	0.6	0.56
Lsat_1_v5_gn_3_1221.1 (PAWH1)	0.81	0.63	1.0	0.73	0.32	0.19	0.13	0.1	0.11	0.11	0.13	0.11	0.11	0.16	0.15	0.15	0.12	0.42	0.11	0.08	0.11	0.1	0.31	0.08	0.11	0.11	0.14	0.15	0.21	0.17	0.08
Lsat_1_v5_gn_3_26081.1	0.48	0.51	1.0	0.73	0.11	0.08	0.03	0.03	0.04	0.06	0.08	0.09	0.06	0.05	0.04	0.05	0.04	0.17	0.09	0.06	0.09	0.09	0.37	0.04	0.05	0.09	0.06	0.04	0.04	0.02	0.03
Lsat_1_v5_gn_3_3061.1 (VI2)	0.55	0.22	1.0	0.71	0.02	0.09	0.04	0.02	0.03	0.02	0.03	0.02	0.02	0.0	0.0	0.09	0.06	0.02	0.03	0.03	0.04	0.02	0.05	0.01	0.03	0.06	0.05	0.03	0.01	0.01	0.0
Lsat_1_v5_gn_3_53381.1 (VAC1)	0.86	0.51	1.0	0.72	0.35	0.31	0.22	0.23	0.22	0.21	0.23	0.22	0.28	0.43	0.36	0.26	0.24	0.36	0.23	0.2	0.21	0.22	0.43	0.21	0.21	0.24	0.24	0.24	0.27	0.27	0.29
Lsat_1_v5_gn_3_7300.1 (TUB8)	0.58	0.48	1.0	0.88	0.11	0.09	0.14	0.13	0.18	0.23	0.2	0.3	0.35	0.06	0.06	0.22	0.26	0.07	0.09	0.18	0.16	0.17	0.01	0.17	0.2	0.21	0.2	0.17	0.14	0.18	0.19
Lsat_1_v5_gn_3_89200.1 (RALF34)	0.64	0.57	1.0	0.76	0.28	0.28	0.21	0.15	0.23	0.24	0.24	0.26	0.39	0.43	0.3	0.35	0.37	0.19	0.31	0.3	0.31	0.32	0.12	0.28	0.33	0.38	0.36	0.35	0.24	0.27	0.28
Lsat_1_v5_gn_3_89220.1 (AIK1)	1.0	0.39	0.97	0.59	0.03	0.01	0.05	0.02	0.02	0.05	0.06	0.07	0.1	0.03	0.06	0.05	0.09	0.12	0.05	0.04	0.01	0.04	0.08	0.03	0.03	0.07	0.02	0.09	0.04	0.03	0.07
Lsat_1_v5_gn_4_146041.1	0.69	0.27	1.0	0.89	0.15	0.08	0.1	0.01	0.23	0.24	0.29	0.29	0.6	0.02	0.0	0.11	0.18	0.37	0.03	0.11	0.26	0.24	0.42	0.2	0.21	0.31	0.21	0.1	0.11	0.16	0.48
Lsat_1_v5_gn_4_153461.1 (GBF1)	0.85	0.47	1.0	0.94	0.31	0.36	0.25	0.23	0.29	0.29	0.32	0.28	0.27	0.38	0.33	0.34	0.28	0.22	0.28	0.23	0.27	0.28	0.25	0.21	0.25	0.35	0.32	0.27	0.3	0.33	0.34
Lsat_1_v5_gn_4_157080.1 (APE2)	1.0	0.46	0.59	0.32	0.17	0.23	0.06	0.04	0.02	0.02	0.01	0.07	0.13	0.02	0.05	0.12	0.13	0.0	0.03	0.08	0.08	0.1	0.05	0.11	0.17	0.14	0.05	0.07	0.08	0.07	0.03
Lsat_1_v5_gn_4_175421.1 (UBC22)	0.82	0.62	1.0	0.47	0.27	0.32	0.19	0.16	0.18	0.17	0.18	0.16	0.47	0.48	0.34	0.26	0.24	0.23	0.23	0.17	0.2	0.2	0.27	0.16	0.21	0.22	0.2	0.21	0.27	0.27	0.36
Lsat_1_v5_gn_4_46321.1	1.0	0.49	0.86	0.15	0.05	0.08	0.03	0.01	0.06	0.06	0.07	0.07	0.15	0.02	0.05	0.3	0.22	0.06	0.04	0.08	0.08	0.11	0.02	0.05	0.08	0.15	0.12	0.12	0.03	0.04	0.05
Lsat_1_v5_gn_4_75360.1 (CMU3)	0.77	0.59	1.0	0.8	0.32	0.33	0.25	0.23	0.26	0.27	0.28	0.28	0.39	0.5	0.33	0.37	0.39	0.24	0.27	0.25	0.27	0.31	0.46	0.25	0.28	0.32	0.33	0.35	0.3	0.32	0.31
Lsat_1_v5_gn_4_87701.1 (APT5)	0.64	0.2	0.79	1.0	0.4	0.26	0.18	0.12	0.16	0.18	0.17	0.23	0.35	0.16	0.11	0.17	0.19	0.4	0.1	0.13	0.2	0.22	0.09	0.13	0.16	0.25	0.2	0.3	0.07	0.06	0.15
Lsat_1_v5_gn_4_9820.1	0.86	0.91	1.0	0.94	0.53	0.51	0.43	0.41	0.46	0.45	0.48	0.46	0.55	0.55	0.47	0.42	0.42	0.45	0.4	0.41	0.44	0.48	0.63	0.4	0.46	0.55	0.5	0.54	0.4	0.38	0.36
Lsat_1_v5_gn_5_105880.1	1.0	0.71	0.94	0.59	0.39	0.35	0.26	0.24	0.31	0.38	0.4	0.39	0.38	0.52	0.4	0.48	0.47	0.24	0.33	0.37	0.31	0.29	0.22	0.33	0.33	0.34	0.35	0.38	0.3	0.38	0.53
Lsat_1_v5_gn_5_106741.1 (PNET2)	0.74	0.89	0.86	1.0	0.26	0.34	0.23	0.2	0.14	0.18	0.15	0.2	0.36	0.37	0.27	0.29	0.29	0.24	0.14	0.14	0.2	0.25	0.31	0.19	0.21	0.22	0.24	0.24	0.21	0.23	0.41
Lsat_1_v5_gn_5_106761.1 (XYL4)	0.74	0.62	1.0	0.99	0.18	0.31	0.38	0.21	0.15	0.16	0.17	0.22	0.3	0.07	0.12	0.43	0.49	0.05	0.23	0.29	0.33	0.33	0.04	0.25	0.32	0.35	0.33	0.35	0.18	0.18	0.14
Lsat_1_v5_gn_5_126841.1 (TTL1)	0.88	0.54	1.0	0.54	0.13	0.12	0.13	0.09	0.16	0.16	0.17	0.19	0.31	0.36	0.18	0.38	0.4	0.13	0.13	0.15	0.18	0.18	0.03	0.14	0.18	0.21	0.2	0.26	0.16	0.19	0.22
Lsat_1_v5_gn_5_135361.1 (BGAL1)	0.63	0.43	0.81	1.0	0.26	0.2	0.22	0.13	0.31	0.28	0.29	0.25	0.1	0.04	0.05	0.11	0.12	0.04	0.08	0.14	0.16	0.15	0.08	0.15	0.17	0.17	0.18	0.17	0.1	0.13	0.12
Lsat_1_v5_gn_5_161621.1 (EFOP2)	0.43	0.3	0.88	1.0	0.23	0.21	0.18	0.13	0.15	0.18	0.18	0.21	0.52	0.26	0.17	0.3	0.31	0.33	0.14	0.13	0.2	0.24	0.22	0.15	0.2	0.28	0.23	0.29	0.15	0.17	0.26
Lsat_1_v5_gn_5_29901.1	0.68	0.55	1.0	0.84	0.09	0.14	0.2	0.13	0.16	0.16	0.17	0.18	0.36	0.02	0.05	0.23	0.21	0.04	0.06	0.11	0.16	0.16	0.05	0.12	0.12	0.17	0.16	0.16	0.14	0.19	0.17
Lsat_1_v5_gn_5_57421.1 (UVR8)	0.68	0.46	1.0	0.59	0.22	0.18	0.1	0.12	0.25	0.23	0.27	0.28	0.18	0.3	0.29	0.18	0.16	0.22	0.24	0.16	0.17	0.15	0.08	0.16	0.15	0.18	0.2	0.14	0.22	0.28	0.36
Lsat_1_v5_gn_6_108381.1 (XF1)	0.53	0.41	1.0	0.86	0.23	0.24	0.18	0.1	0.29	0.35	0.32	0.4	0.49	0.18	0.21	0.37	0.4	0.16	0.2	0.29	0.27	0.31	0.06	0.26	0.24	0.35	0.3	0.45	0.18	0.2	0.34
Lsat_1_v5_gn_6_26160.1 (HKL1)	0.62	0.36	1.0	0.94	0.21	0.18	0.21	0.19	0.15	0.16	0.17	0.14	0.16	0.28	0.19	0.26	0.29	0.15	0.18	0.15	0.17	0.17	0.22	0.14	0.17	0.19	0.18	0.25	0.18	0.17	0.19
Lsat_1_v5_gn_6_66480.1	0.68	0.63	1.0	0.9	0.13	0.17	0.06	0.04	0.08	0.1	0.12	0.12	0.14	0.26	0.08	0.23	0.19	0.05	0.12	0.09	0.16	0.19	0.12	0.09	0.14	0.24	0.19	0.17	0.04	0.06	0.04
Lsat_1_v5_gn_6_72221.1 (AGL36)	0.26	0.14	1.0	0.73	0.08	0.03	0.03	0.03	0.07	0.04	0.08	0.1	0.2	0.02	0.02	0.14	0.11	0.02	0.04	0.06	0.03	0.02	0.11	0.04	0.05	0.04	0.03	0.04	0.06	0.11	0.1
Lsat_1_v5_gn_6_74421.1 (PAE8)	0.83	0.7	1.0	0.54	0.3	0.25	0.17	0.16	0.18	0.18	0.19	0.2	0.29	0.5	0.29	0.29	0.29	0.23	0.21	0.2	0.22	0.22	0.33	0.18	0.21	0.24	0.24	0.22	0.22	0.23	0.23
Lsat_1_v5_gn_6_89441.1 (SCC4)	0.7	0.57	1.0	0.53	0.04	0.15	0.07	0.08	0.04	0.05	0.07	0.07	0.17	0.25	0.11	0.15	0.11	0.01	0.1	0.08	0.11	0.11	0.05	0.07	0.08	0.12	0.09	0.11	0.06	0.04	0.04
Lsat_1_v5_gn_7_113720.1 (SVL2)	0.92	0.81	1.0	0.8	0.48	0.52	0.52	0.52	0.49	0.48	0.52	0.54	0.67	0.59	0.55	0.69	0.7	0.25	0.52	0.54	0.57	0.57	0.35	0.53	0.57	0.65	0.61	0.61	0.48	0.51	0.58
Lsat_1_v5_gn_7_13160.1 (AtHMP35)	0.84	0.61	1.0	0.56	0.12	0.18	0.3	0.16	0.26	0.29	0.31	0.43	0.58	0.06	0.11	0.36	0.43	0.22	0.06	0.19	0.23	0.24	0.22	0.26	0.28	0.21	0.2	0.3	0.16	0.25	0.42
Lsat_1_v5_gn_7_46821.1 (MICU)	0.37	0.58	1.0	0.97	0.19	0.2	0.17	0.14	0.17	0.28	0.28	0.16	0.16	0.32	0.26	0.24	0.23	0.27	0.18	0.16	0.21	0.16	0.15	0.12	0.14	0.21	0.21	0.13	0.3	0.29	0.23
Lsat_1_v5_gn_7_81800.1 (EXL2)	1.0	0.76	0.85	0.78	0.27	0.21	0.07	0.06	0.07	0.07	0.1	0.07	0.1	0.26	0.16	0.13	0.07	0.65	0.11	0.06	0.1	0.08	0.34	0.04	0.06	0.08	0.09	0.1	0.14	0.1	0.07
Lsat_1_v5_gn_8_103660.1 (CASPL4B1)	0.88	0.46	1.0	0.91	0.16	0.14	0.08	0.08	0.19	0.21	0.18	0.17	0.21	0.2	0.17	0.26	0.29	0.14	0.13	0.14	0.14	0.15	0.28	0.13	0.15	0.19	0.18	0.27	0.1	0.1	0.1
Lsat_1_v5_gn_8_121381.1 (AtMT4a)	0.48	0.37	1.0	0.72	0.07	0.02	0.12	0.02	0.12	0.0	0.11	0.04	0.1	0.14	0.13	0.28	0.35	0.01	0.1	0.13	0.15	0.13	0.0	0.02	0.09	0.08	0.15	0.29	0.03	0.0	0.01
Lsat_1_v5_gn_8_125980.1 (AVI2)	0.88	0.74	1.0	0.82	0.47	0.45	0.33	0.31	0.37	0.34	0.36	0.36	0.4	0.52	0.36	0.43	0.46	0.22	0.29	0.31	0.35	0.36	0.33	0.26	0.33	0.39	0.39	0.5	0.37	0.38	0.27
Lsat_1_v5_gn_8_135561.1	1.0	0.67	0.85	0.34	0.06	0.08	0.15	0.09	0.22	0.23	0.15	0.2	0.57	0.01	0.03	0.16	0.24	0.16	0.04	0.2	0.16	0.16	0.03	0.27	0.27	0.24	0.18	0.28	0.09	0.11	0.18
Lsat_1_v5_gn_8_86420.1 (MOB1A)	0.66	0.44	1.0	0.68	0.1	0.1	0.06	0.09	0.04	0.06	0.05	0.1	0.19	0.28	0.08	0.17	0.19	0.05	0.05	0.07	0.1	0.12	0.27	0.06	0.1	0.11	0.1	0.22	0.1	0.06	0.02
Lsat_1_v5_gn_8_8680.1	0.62	0.3	1.0	0.4	0.02	0.0	0.0	0.02	0.03	0.01	0.02	0.04	0.11	0.14	0.06	0.02	0.06	0.07	0.02	0.01	0.03	0.03	0.09	0.03	0.03	0.05	0.02	0.04	0.06	0.03	0.08
Lsat_1_v5_gn_8_87260.1	0.74	0.6	1.0	0.46	0.05	0.08	0.06	0.03	0.1	0.12	0.11	0.19	0.24	0.04	0.07	0.24	0.21	0.02	0.07	0.13	0.1	0.11	0.01	0.06	0.11	0.14	0.12	0.11	0.09	0.11	0.09
Lsat_1_v5_gn_8_8981.1 (PMEI13)	0.37	0.36	1.0	0.75	0.05	0.06	0.17	0.22	0.04	0.05	0.08	0.05	0.04	0.0	0.0	0.05	0.03	0.02	0.04	0.02	0.06	0.06	0.0	0.04	0.04	0.06	0.06	0.05	0.06	0.04	0.03
Lsat_1_v5_gn_9_115821.1 (GGP1)	0.9	0.69	1.0	0.97	0.4	0.32	0.24	0.22	0.28	0.26	0.27	0.24	0.28	0.22	0.16	0.23	0.2	0.28	0.13	0.18	0.25	0.26	0.1	0.22	0.28	0.29	0.24	0.23	0.34	0.24	0.3
Lsat_1_v5_gn_9_124960.1 (RUS6)	0.53	0.37	0.79	1.0	0.35	0.27	0.21	0.19	0.29	0.3	0.31	0.31	0.32	0.34	0.31	0.3	0.28	0.15	0.21	0.24	0.25	0.24	0.37	0.22	0.24	0.28	0.26	0.25	0.27	0.27	0.29
Lsat_1_v5_gn_9_2360.1 (ROXY5)	0.18	0.34	0.66	1.0	0.05	0.1	0.2	0.08	0.11	0.12	0.14	0.09	0.1	0.0	0.0	0.09	0.07	0.06	0.06	0.11	0.1	0.08	0.03	0.09	0.13	0.17	0.11	0.08	0.05	0.11	0.06
Lsat_1_v5_gn_9_2920.1 (BXL2)	0.8	0.47	1.0	0.73	0.12	0.12	0.13	0.06	0.16	0.16	0.16	0.19	0.13	0.04	0.08	0.19	0.23	0.2	0.09	0.16	0.15	0.14	0.07	0.07	0.1	0.15	0.12	0.16	0.07	0.1	0.12
Lsat_1_v5_gn_9_47120.1 (CAT6)	0.5	0.4	0.84	1.0	0.17	0.19	0.26	0.23	0.28	0.24	0.29	0.3	0.41	0.13	0.13	0.33	0.3	0.18	0.18	0.2	0.26	0.22	0.09	0.27	0.37	0.36	0.38	0.23	0.23	0.21	0.29
Lsat_1_v5_gn_9_71760.1 (PLL12)	0.88	0.5	1.0	0.79	0.57	0.33	0.21	0.23	0.36	0.39	0.41	0.41	0.17	0.26	0.27	0.31	0.31	0.07	0.25	0.26	0.32	0.3	0.05	0.26	0.28	0.36	0.37	0.38	0.24	0.26	0.23
Lsat_1_v5_gn_9_72100.1 (EXL2)	0.56	0.93	1.0	0.95	0.12	0.12	0.13	0.13	0.1	0.11	0.14	0.11	0.15	0.09	0.13	0.18	0.15	0.08	0.11	0.1	0.12	0.09	0.47	0.08	0.1	0.15	0.13	0.06	0.13	0.13	0.09
Lsat_1_v5_gn_9_79120.1	0.57	0.59	0.97	1.0	0.2	0.35	0.34	0.37	0.26	0.25	0.26	0.25	0.4	0.35	0.21	0.3	0.32	0.08	0.28	0.33	0.38	0.41	0.27	0.27	0.37	0.46	0.43	0.53	0.3	0.26	0.2
Lsat_1_v5_gn_9_95921.1 (BGLU47)	0.54	0.43	1.0	0.96	0.5	0.42	0.15	0.3	0.29	0.34	0.32	0.42	0.14	0.28	0.2	0.29	0.24	0.12	0.23	0.21	0.22	0.26	0.09	0.26	0.22	0.26	0.3	0.23	0.3	0.33	0.21

Details

Expression values normalized per gene (using the maximum value, Green cells indicate low expression and red high. (Dark gray cells indicate missing values)