Heatmap: Cluster_68 (Lactuca sativa (Lsa) Coexpression Clusters (HCCA Algorithm))

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(Values are log₂ transformed ratios of a genes expression in a sample divided by the mean expression level)

Gene	Light: 268 uE m-2 s-1	Light: 202.5 uE m-2 s-1 (Control)	Light: 135 uE m-2 s-1	Light: 67.5 uE m-2 s-1	Photoperiod: L24	Photoperiod: L20D4 (Control)	Photoperiod: L12D12	Photoperiod: L8D16	RBW: 4:1:1 (Control)	RBW: 4:1:0	RBW: 3:1:1	RBW: 3:1:0	Nitrogen: 0%	Nitrogen: 25%	Nitrogen: 50%	Nitrogen: 100% (Control)	Nitrogen: 150%	Phosphorous: 0%	Phosphorous: 25%	Phosphorous: 50%	Phosphorous: 100% (Control)	Phosphorous: 150%	Potassium: 0%	Potassium: 25%	Potassium: 50%	Potassium: 100% (Control)	Potassium: 150%	Temperature: 20°C	Temperature: 25°C (Control)	Temperature: 30°C	Temperature: 35°C
Lsat_1_v5_gn_1_107740.1 (P40)	-0.26	-0.49	-0.35	-0.4	0.29	0.43	0.19	0.4	-0.57	-0.51	-0.36	-0.5	0.11	0.55	0.38	-0.13	-0.22	0.43	-0.15	-0.28	-0.18	-0.15	0.92	-0.14	-0.25	-0.09	-0.19	-0.26	-0.01	-0.08	0.37
Lsat_1_v5_gn_1_110140.1 (MRP13)	0.09	0.03	-0.76	-1.11	0.66	0.6	-0.34	-0.41	-0.55	-0.62	-0.35	-0.56	-0.36	1.1	0.97	-0.23	-0.53	-0.47	0.19	-0.62	-0.42	-0.25	1.34	-0.25	-0.21	-0.32	-0.28	0.05	-0.02	-0.16	0.19
Lsat_1_v5_gn_1_21041.1	-0.15	-0.5	-0.24	-0.46	0.46	0.31	-0.1	0.24	-0.45	-0.36	-0.36	-0.35	0.14	0.69	0.44	-0.22	-0.31	0.08	-0.25	-0.54	-0.2	-0.24	1.23	-0.28	-0.32	-0.29	-0.11	-0.09	0.17	0.13	0.15
Lsat_1_v5_gn_1_29020.1 (PAP27)	-0.38	-0.69	-1.17	-1.41	0.13	0.37	-0.15	0.23	-0.61	-0.67	-0.49	-0.77	0.1	0.84	0.79	0.05	-0.07	0.37	0.3	-0.2	-0.21	-0.15	1.3	-0.14	-0.19	-0.15	-0.17	-0.05	0.19	-0.22	0.03
Lsat_1_v5_gn_1_42081.1	-0.53	-0.47	-0.96	-0.92	0.05	0.41	0.03	0.36	-0.53	-0.55	-0.28	-0.38	0.34	0.79	0.44	-0.03	-0.25	0.14	-0.1	-0.35	-0.2	-0.03	1.07	-0.11	-0.05	0.01	-0.04	-0.15	0.02	0.02	0.22
Lsat_1_v5_gn_1_5900.1 (MRF2)	-0.84	-0.9	-1.31	-1.12	0.29	0.71	0.01	0.14	-0.47	-0.54	-0.26	-0.32	0.2	0.86	0.4	0.05	-0.24	0.38	0.02	-0.36	-0.13	-0.1	1.15	-0.06	-0.07	-0.09	-0.02	-0.4	-0.1	-0.05	0.29
Lsat_1_v5_gn_1_60961.1	-0.33	-0.18	-0.55	-0.36	0.18	0.29	0.02	0.14	-0.34	-0.36	-0.15	-0.1	0.13	0.36	0.2	0.01	-0.03	0.41	-0.11	-0.31	-0.17	-0.11	0.79	-0.28	-0.12	0.06	0.01	-0.19	0.06	-0.0	0.2
Lsat_1_v5_gn_1_61700.1 (SKD1)	-0.27	-0.41	-0.51	-0.51	0.42	0.49	-0.05	0.04	-0.28	-0.37	-0.27	-0.45	0.12	0.5	0.35	0.15	-0.1	-0.0	0.04	-0.17	-0.1	-0.09	0.87	-0.21	-0.1	-0.09	-0.12	-0.07	0.07	0.04	0.01
Lsat_1_v5_gn_1_75161.1 (CYN)	-0.67	-0.89	-0.97	-0.87	0.4	0.38	-0.26	-0.21	-0.63	-0.63	-0.39	-0.51	-0.02	1.17	1.01	-0.07	-0.3	0.32	0.28	-0.34	-0.36	-0.26	1.42	-0.13	-0.13	-0.31	-0.25	-0.07	-0.07	-0.26	-0.14
Lsat_1_v5_gn_1_96760.1	-0.46	-0.56	-0.78	-0.47	0.22	0.49	0.0	0.22	-0.32	-0.35	-0.29	-0.4	-0.03	0.95	0.52	-0.12	-0.21	0.51	-0.14	-0.26	-0.22	-0.35	1.08	-0.34	-0.17	-0.15	-0.34	-0.26	-0.05	0.06	0.18
Lsat_1_v5_gn_1_9740.1	-0.68	-0.35	-0.95	-0.73	0.41	0.45	0.19	0.51	-0.79	-0.57	-0.62	-0.43	0.17	0.81	0.59	-0.1	-0.2	0.24	-0.03	-0.38	-0.17	0.04	1.08	-0.36	-0.39	-0.17	-0.28	-0.06	0.19	-0.05	0.12
Lsat_1_v5_gn_2_108140.1 (NAD-ME2)	-0.22	-0.13	-1.02	-0.76	0.35	0.3	-0.05	-0.37	-0.33	-0.36	-0.4	-0.29	-0.09	0.63	0.31	-0.14	0.04	-0.18	-0.0	-0.04	-0.07	0.05	1.04	-0.1	-0.04	-0.14	0.06	0.0	0.38	0.05	-0.01
Lsat_1_v5_gn_2_108321.1	-0.25	-0.11	-0.24	-0.13	0.59	0.58	0.04	0.09	-0.47	-0.76	-0.35	-0.72	-0.05	0.88	0.61	-0.05	-0.35	-0.09	-0.07	-0.51	-0.37	-0.02	1.05	-0.42	-0.28	-0.17	-0.33	-0.11	0.12	-0.14	-0.02
Lsat_1_v5_gn_2_124101.1 (LEW3)	-0.6	-0.27	-0.8	-0.73	0.5	0.37	0.1	0.29	-0.23	-0.3	-0.22	-0.32	-0.07	0.58	0.49	-0.04	-0.16	0.18	-0.09	-0.11	-0.29	-0.05	0.79	-0.27	-0.24	-0.21	-0.15	-0.09	0.12	0.13	0.28
Lsat_1_v5_gn_2_40320.1	-0.04	0.2	0.1	-0.31	0.4	0.46	0.04	0.4	-0.55	-0.48	-0.45	-0.43	-0.41	0.88	0.57	0.02	-0.23	0.57	-0.07	-0.33	-0.41	-0.27	0.58	-0.47	-0.3	-0.19	-0.04	-0.37	-0.18	-0.16	-0.17
Lsat_1_v5_gn_2_53800.1 (BLH1)	0.02	0.21	-0.13	-0.01	0.25	0.39	-0.01	0.12	-0.28	-0.38	-0.21	-0.47	-0.53	0.71	0.59	0.16	-0.25	0.05	-0.11	-0.58	-0.31	-0.32	1.21	-0.49	-0.37	-0.28	-0.29	-0.29	0.09	0.04	-0.34
Lsat_1_v5_gn_2_67761.1	-0.23	-0.15	-0.41	-0.21	0.71	0.65	0.04	0.33	-0.55	-0.42	-0.45	-0.62	0.2	1.0	0.57	-0.23	-0.43	0.04	0.02	-0.49	-0.37	-0.16	0.47	-0.21	-0.26	-0.23	-0.2	-0.1	0.04	-0.13	-0.0
Lsat_1_v5_gn_2_82241.1 (PAP29)	-0.8	0.19	-1.2	-1.47	0.41	0.49	0.13	0.38	-0.65	-0.7	-0.6	-0.64	0.4	0.72	0.55	-0.02	-0.31	0.54	-0.01	-0.38	-0.3	-0.29	1.22	-0.22	-0.22	-0.16	-0.19	-0.47	-0.15	-0.1	0.44
Lsat_1_v5_gn_2_88881.1 (MAG1)	-0.11	-0.31	-0.41	-0.53	0.42	0.5	-0.21	-0.13	-0.29	-0.3	-0.21	-0.26	0.11	0.51	0.26	0.07	-0.08	-0.3	-0.06	-0.24	-0.14	-0.04	0.83	-0.11	-0.03	0.03	0.04	-0.09	0.18	0.05	-0.11
Lsat_1_v5_gn_2_98340.1 (RVB1)	-0.17	-0.26	-0.52	-0.43	0.29	0.44	0.09	0.39	-0.82	-0.51	-0.52	-0.37	0.31	0.67	0.45	-0.01	-0.09	-0.01	-0.22	-0.37	-0.28	-0.16	1.05	-0.29	-0.17	-0.27	-0.42	-0.05	0.14	-0.03	0.33
Lsat_1_v5_gn_3_109781.1	-1.03	-0.69	-1.03	-0.91	0.34	0.58	-0.24	0.47	-0.77	-1.18	-0.79	-0.53	0.5	0.9	0.75	-0.01	-0.19	-0.22	-0.08	-0.34	-0.18	-0.18	1.18	-0.02	-0.25	-0.13	-0.17	0.01	0.19	-0.04	0.45
Lsat_1_v5_gn_3_121480.1 (ECI2)	-0.36	-0.43	-0.73	-0.2	0.54	0.46	-0.5	-0.63	-0.3	-0.23	-0.19	-0.42	-0.11	0.8	0.68	0.02	-0.22	0.13	0.09	-0.12	-0.1	-0.24	1.06	-0.15	-0.06	-0.2	-0.07	-0.29	0.11	-0.06	-0.19
Lsat_1_v5_gn_3_129561.1 (SD3)	-0.41	-0.48	-0.59	-0.79	0.34	0.37	0.05	0.21	-0.68	-0.37	-0.46	-0.12	0.35	0.38	0.3	-0.07	0.01	0.09	-0.26	-0.27	-0.24	-0.01	0.98	-0.04	0.04	-0.07	-0.19	0.07	0.12	0.02	0.28
Lsat_1_v5_gn_3_136701.1 (NAD-ME2)	-0.23	-0.27	-0.61	-0.67	0.46	0.38	0.12	-0.1	-0.26	-0.27	-0.28	-0.33	-0.08	0.48	0.27	-0.04	-0.13	-0.05	0.03	-0.18	-0.09	-0.01	1.0	-0.19	-0.11	-0.11	-0.11	0.05	0.26	0.04	-0.13
Lsat_1_v5_gn_3_2200.1 (SAUR35)	-0.28	-0.81	-1.41	-0.4	1.5	1.38	0.22	0.4	-0.5	-0.78	-0.66	-1.3	-1.32	0.57	0.52	-0.66	-1.17	0.78	-0.43	-1.11	-0.81	-0.88	1.88	-0.58	-0.67	-0.81	-0.96	-0.87	0.28	0.08	-0.13
Lsat_1_v5_gn_3_24020.1	-1.04	-1.07	-1.58	-1.67	-0.07	0.72	-0.14	-0.39	-0.55	-0.48	-0.45	-0.56	-0.18	1.26	0.98	0.31	-0.04	-0.14	0.14	-0.1	-0.1	-0.04	1.43	-0.38	-0.14	-0.13	-0.07	-0.31	-0.05	-0.1	0.06
Lsat_1_v5_gn_3_43721.1 (PEX22)	-0.58	-0.71	-1.27	-1.07	0.25	0.61	0.2	0.2	-0.38	-0.43	-0.34	-0.41	0.08	0.72	0.39	-0.11	-0.24	0.09	0.05	-0.32	-0.31	-0.18	1.14	-0.04	-0.17	-0.17	-0.18	-0.07	0.17	0.21	0.41
Lsat_1_v5_gn_3_54800.1 (JAR1)	-1.45	-0.94	-1.4	-1.32	0.02	0.4	0.11	0.04	-0.19	-0.26	-0.28	-0.44	-0.67	0.75	0.85	0.31	-0.02	0.28	0.14	-0.13	0.09	0.06	0.98	-0.24	0.01	0.22	0.09	-0.31	0.12	0.16	-0.18
Lsat_1_v5_gn_3_63261.1 (CCI2)	-2.08	-2.02	-1.85	-1.35	0.55	0.65	-0.18	-0.38	-0.22	-0.37	-0.21	-0.48	-0.82	1.38	0.98	0.07	-0.14	-0.15	-0.27	-0.47	-0.41	-0.26	1.57	-0.09	-0.29	-0.13	0.08	-0.45	0.06	0.04	0.41
Lsat_1_v5_gn_3_65880.1 (ARS1)	-0.63	-0.35	-0.64	-0.69	0.36	0.41	0.07	0.34	-0.52	-0.27	-0.54	-0.39	0.21	0.65	0.54	0.02	-0.07	0.08	-0.0	-0.23	-0.26	-0.09	0.89	-0.26	-0.15	-0.18	-0.2	-0.3	0.04	0.06	0.44
Lsat_1_v5_gn_3_88661.1	-0.49	-1.04	-0.86	-0.4	-0.01	0.31	-0.49	-0.44	-0.38	-0.17	-0.1	-0.13	-0.08	0.84	0.65	0.19	-0.27	-0.3	0.2	-0.07	-0.15	-0.13	1.34	0.1	-0.2	-0.1	-0.06	-0.37	0.06	0.08	0.09
Lsat_1_v5_gn_4_133620.1	-0.64	-0.5	-1.0	-0.97	0.39	0.45	0.04	0.14	-0.2	-0.08	-0.17	-0.18	0.15	0.46	0.33	0.0	-0.15	-0.02	-0.04	-0.26	-0.22	-0.09	0.85	-0.11	-0.15	0.01	-0.05	-0.16	0.14	0.08	0.45
Lsat_1_v5_gn_4_148240.1 (COAD)	-0.01	-0.25	-0.28	-0.6	0.43	0.48	0.22	0.43	-0.71	-0.7	-0.71	-0.81	0.07	0.83	0.63	-0.31	-0.48	0.87	-0.12	-0.52	-0.22	-0.17	1.04	-0.38	-0.37	-0.49	-0.32	-0.36	0.0	-0.09	0.15
Lsat_1_v5_gn_4_177001.1	-0.5	-0.5	-0.78	-0.52	0.24	0.19	-0.09	0.15	-0.36	-0.3	-0.13	-0.22	0.34	0.7	0.38	-0.08	0.01	0.03	0.06	-0.17	-0.31	-0.04	0.93	-0.12	-0.06	-0.26	-0.11	-0.1	0.05	-0.02	0.25
Lsat_1_v5_gn_4_182620.1 (TOT3)	-0.04	-0.24	-0.28	-0.31	0.33	0.49	0.19	0.35	-0.59	-0.59	-0.45	-0.54	-0.29	0.93	0.67	-0.02	-0.18	0.34	-0.12	-0.55	-0.34	-0.28	1.06	-0.54	-0.34	-0.3	-0.24	-0.23	0.18	-0.01	-0.21
Lsat_1_v5_gn_4_55321.1 (CCG)	-0.59	-0.41	-0.76	-0.5	0.29	0.5	-0.08	-0.16	-0.7	-0.68	-0.45	-0.39	-0.1	0.73	0.31	-0.04	-0.43	0.93	-0.01	-0.59	-0.49	-0.37	1.57	-0.47	-0.34	-0.23	-0.29	-0.48	0.27	-0.04	0.51
Lsat_1_v5_gn_4_6340.1	-0.37	-0.45	-0.63	-0.58	0.19	0.44	-0.39	-0.33	-0.24	-0.2	-0.16	-0.13	0.69	0.54	0.42	0.21	0.16	0.25	-0.07	-0.24	-0.15	0.05	0.73	-0.13	-0.15	-0.04	-0.12	-0.11	-0.18	-0.22	-0.05
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Details

Dark gray cells indicate values where the raw expression is zero (cannot be log-transformed). Blue cells indicate samples where the expression of the gene is below average and red cells indicate the gene is expressed above average in the sample. White cells are average.