1. Home
  2. Tools
  3. Expression Heatmap
  4. Results

Heatmap: Cluster_161 (Lactuca sativa (Lsa) Coexpression Clusters (HCCA Algorithm))

View as: (view zlog-transformed or row-normalized)

View using InCHLib : here ( Experimental feature, still under development)

(Showing raw values)

 Transpose table  Download table
Gene
Light: 268 uE m-2 s-1
Light: 202.5 uE m-2 s-1 (Control)
Light: 135 uE m-2 s-1
Light: 67.5 uE m-2 s-1
Photoperiod: L24
Photoperiod: L20D4 (Control)
Photoperiod: L12D12
Photoperiod: L8D16
RBW: 4:1:1 (Control)
RBW: 4:1:0
RBW: 3:1:1
RBW: 3:1:0
Nitrogen: 0%
Nitrogen: 25%
Nitrogen: 50%
Nitrogen: 100% (Control)
Nitrogen: 150%
Phosphorous: 0%
Phosphorous: 25%
Phosphorous: 50%
Phosphorous: 100% (Control)
Phosphorous: 150%
Potassium: 0%
Potassium: 25%
Potassium: 50%
Potassium: 100% (Control)
Potassium: 150%
Temperature: 20°C
Temperature: 25°C (Control)
Temperature: 30°C
Temperature: 35°C
0.18 0.12 0.12 0.09 0.58 0.26 0.07 0.07 0.18 0.1 0.16 0.13 0.31 0.9 0.51 0.1 0.15 2.87 0.14 0.1 0.12 0.12 1.7 0.09 0.2 0.1 0.13 0.09 0.16 0.25 0.81
1.09 1.59 1.32 2.06 3.07 2.89 1.58 1.32 2.0 2.05 2.02 1.98 2.47 4.48 3.63 2.23 1.68 11.27 2.36 1.64 1.48 1.81 4.95 1.26 1.7 1.76 2.08 1.22 3.54 3.59 5.96
111.57 124.67 107.5 88.59 132.45 148.59 90.07 95.24 95.99 87.3 125.37 112.02 131.84 228.75 199.65 111.76 109.66 530.54 197.14 121.7 120.83 137.83 292.74 135.3 131.27 143.75 131.91 101.19 195.38 185.96 268.1
0.22 0.0 0.02 0.0 0.7 0.28 0.02 0.04 0.33 0.25 0.35 0.22 1.27 0.61 0.59 0.15 0.29 13.27 0.07 0.02 0.09 0.18 1.36 0.61 0.21 0.29 0.12 0.38 0.4 0.28 3.24
0.0 0.01 0.0 0.0 0.02 0.04 0.01 0.03 0.03 0.04 0.05 0.05 1.0 0.0 0.03 0.03 0.0 4.46 0.04 0.03 0.02 0.03 0.38 0.04 0.07 0.01 0.08 0.05 0.08 0.05 0.46
1.53 1.8 1.44 1.79 2.15 2.23 2.29 2.2 2.23 2.41 2.34 2.93 3.0 3.86 3.09 1.81 2.2 7.63 2.07 2.24 2.15 1.92 2.28 2.3 2.24 2.23 1.95 2.1 2.82 2.95 3.71
0.32 0.55 0.2 0.62 0.55 0.65 0.36 0.27 0.49 0.29 0.52 0.37 3.23 1.15 0.64 0.35 0.36 15.67 0.27 0.38 0.4 0.17 5.12 0.38 0.34 0.34 0.49 0.3 0.74 0.87 4.05
0.11 0.3 0.38 0.48 0.92 0.6 0.67 0.56 1.48 2.54 1.56 3.99 10.45 1.4 2.63 1.76 2.04 80.62 1.36 1.68 1.98 1.52 35.27 2.79 2.16 2.52 1.65 0.78 1.79 3.42 11.86
2.24 2.75 1.87 3.79 7.38 8.49 5.99 6.11 6.44 5.64 5.81 5.57 4.89 12.56 12.52 7.45 6.2 35.67 7.97 6.3 6.33 6.01 12.3 6.2 6.41 6.09 6.54 4.5 9.23 8.16 8.04
0.31 0.55 0.35 0.28 0.37 0.34 0.27 0.41 0.54 0.33 0.48 0.61 0.91 1.1 1.04 0.61 0.72 3.01 0.43 0.73 0.68 0.56 0.75 0.4 0.31 0.47 0.62 0.61 0.86 0.87 1.35
Lsat_1_v5_gn_2_70180.1 (AtRLCK VI_A3)
 0.33 0.47 0.57 0.54 1.26 0.87 0.39 0.34 0.57 0.65 0.53 0.61 1.45 2.02 1.41 0.55 0.59 12.95 0.64 0.51 0.4 0.43 4.44 0.45 0.5 0.48 0.48 0.31 1.36 1.11 2.04
2.4 3.27 2.52 2.26 5.01 5.43 3.39 3.04 3.26 3.01 4.09 3.58 4.59 9.19 6.64 4.25 4.54 23.13 5.99 4.54 3.96 4.86 11.12 3.94 4.66 4.52 4.19 3.72 6.28 6.7 6.22
0.21 0.09 0.14 0.04 0.3 0.18 0.11 0.08 0.11 0.08 0.11 0.16 0.29 0.55 0.33 0.16 0.09 1.71 0.17 0.06 0.06 0.04 0.45 0.11 0.1 0.14 0.14 0.08 0.23 0.14 0.35
0.16 0.25 0.22 0.52 1.37 1.0 0.61 0.42 0.69 1.01 0.84 1.02 1.11 1.99 1.87 1.03 0.91 6.61 0.82 0.93 0.77 0.59 3.26 1.09 0.81 0.74 0.71 0.51 1.19 1.58 2.86
0.77 0.81 0.63 1.35 1.7 1.2 1.29 3.14 1.19 1.4 1.35 2.05 3.4 2.84 2.2 1.82 1.43 9.57 1.17 2.12 2.03 1.57 1.97 1.45 2.12 2.2 1.99 1.57 2.14 2.15 4.25
0.04 0.0 0.04 0.29 0.42 0.57 0.27 0.19 0.19 0.15 0.2 0.21 0.1 0.93 0.65 0.24 0.31 5.13 0.26 0.37 0.16 0.25 1.85 0.3 0.13 0.34 0.23 0.06 0.5 0.6 1.88
0.22 0.0 0.09 0.4 0.15 0.53 0.16 0.19 0.11 0.11 0.34 0.07 0.94 0.52 0.59 0.14 0.25 7.11 0.14 0.2 0.07 0.25 0.84 0.04 0.39 0.24 0.17 0.06 0.33 0.43 1.74
3.09 3.94 2.89 3.12 6.16 6.21 4.26 4.74 3.45 3.4 3.65 3.11 3.02 7.24 5.95 4.15 3.83 19.02 4.94 3.61 3.63 4.02 7.4 3.36 3.7 4.3 4.0 3.43 5.15 4.8 6.1
0.87 0.86 1.34 1.33 6.79 7.18 2.01 1.64 2.5 2.14 2.68 2.31 1.58 11.92 6.94 3.26 2.49 34.12 4.32 1.75 2.26 2.73 10.4 2.21 2.16 2.01 3.13 1.19 5.09 4.32 3.39
0.0 0.0 0.0 0.01 0.01 0.01 0.02 0.02 0.06 0.09 0.16 0.0 0.22 0.15 0.08 0.01 0.01 2.58 0.01 0.03 0.04 0.0 0.94 0.03 0.16 0.02 0.0 0.05 0.05 0.06 0.46
0.02 0.0 0.01 0.02 0.08 0.01 0.01 0.01 0.05 0.02 0.02 0.14 0.45 0.22 0.21 0.04 0.03 4.12 0.02 0.07 0.02 0.03 1.02 0.1 0.03 0.01 0.0 0.01 0.04 0.08 1.48
0.62 0.76 0.43 1.06 1.54 1.27 0.91 0.87 1.04 0.98 1.35 1.13 1.49 2.54 1.85 0.99 0.93 6.53 1.02 0.77 0.88 1.05 1.69 0.84 0.81 1.11 0.84 0.93 1.74 1.65 2.22
24.9 21.75 23.92 24.95 32.14 29.98 19.25 18.48 19.68 18.72 22.02 22.76 27.18 26.89 25.29 25.2 22.75 72.74 22.88 20.94 21.57 23.76 31.42 19.79 23.0 26.0 26.25 21.5 28.27 27.04 33.81
0.12 0.24 0.1 0.06 0.81 0.92 0.26 0.23 0.14 0.21 0.22 0.21 2.85 2.03 0.95 0.44 0.42 11.56 0.32 0.22 0.34 0.67 4.86 0.65 0.35 0.38 0.51 0.29 0.79 0.83 3.18
0.66 0.64 1.41 2.36 5.74 4.19 1.53 0.82 2.07 2.69 2.9 2.79 2.37 3.18 3.67 3.1 2.13 34.32 2.65 3.01 3.05 2.4 11.16 2.65 3.04 3.25 3.82 2.36 3.3 3.34 5.23
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.03 0.0 0.0 0.0 0.0 0.9 0.0 0.04 0.0 0.0 0.07 0.0 0.0 0.0 0.0 0.06 0.0 0.0 0.14
0.03 0.04 0.01 0.02 0.09 0.18 0.16 0.09 0.09 0.02 0.07 0.07 2.77 0.12 0.15 0.11 0.2 17.79 0.19 0.09 0.06 0.11 7.44 0.27 0.16 0.12 0.19 0.06 0.12 0.11 3.11
0.8 0.74 0.8 0.58 1.37 1.0 0.67 0.6 0.97 0.86 1.21 1.08 1.33 4.71 3.26 1.54 1.41 10.94 1.64 1.17 0.86 0.6 3.56 1.11 1.05 0.75 1.11 0.45 1.78 2.28 4.55
0.0 0.0 0.0 0.01 0.03 0.03 0.06 0.05 0.03 0.02 0.04 0.02 0.26 0.13 0.13 0.04 0.02 2.13 0.2 0.01 0.04 0.04 0.33 0.06 0.08 0.02 0.01 0.01 0.01 0.05 0.42
2.64 3.28 3.25 3.32 5.5 4.61 3.23 2.67 3.72 3.67 4.17 3.75 3.96 8.3 8.23 5.59 4.83 21.45 4.72 3.82 3.83 3.44 8.14 3.63 3.6 3.87 3.94 3.46 5.1 5.54 6.31
0.11 0.09 0.05 0.06 0.2 0.17 0.09 0.1 0.29 0.15 0.08 0.11 0.28 0.42 0.38 0.14 0.2 3.34 0.12 0.13 0.11 0.16 1.39 0.09 0.03 0.21 0.04 0.11 0.19 0.33 0.95
3.86 4.43 4.15 4.85 7.2 5.6 2.29 2.46 3.74 3.5 3.83 3.71 5.85 10.13 6.98 4.21 2.99 29.28 3.57 3.28 2.49 3.33 9.4 3.22 3.1 3.58 3.71 2.38 5.56 5.41 8.9
0.0 0.0 0.02 0.0 0.06 0.02 0.0 0.02 0.05 0.01 0.03 0.02 0.24 0.35 0.07 0.02 0.01 2.75 0.0 0.02 0.02 0.03 0.96 0.0 0.02 0.04 0.0 0.01 0.02 0.1 0.82
0.88 0.76 1.81 2.87 1.9 2.05 2.16 3.11 1.95 2.1 2.3 1.77 4.96 4.17 2.97 2.14 2.27 20.01 2.13 1.85 1.55 1.52 11.87 2.09 1.82 1.77 3.61 1.32 2.47 3.29 4.73
0.21 0.27 0.27 0.27 0.23 0.21 0.32 0.24 0.29 0.27 0.47 0.44 0.69 0.22 0.28 0.4 0.46 4.23 0.45 0.21 0.33 0.36 1.29 0.26 0.24 0.26 0.26 0.26 0.29 0.48 1.39
1.25 1.39 1.07 1.09 1.93 1.76 1.27 1.27 1.4 1.31 1.83 1.74 3.2 2.94 2.79 1.59 1.39 11.66 1.78 1.57 1.42 1.29 5.2 1.54 1.65 1.42 1.39 1.27 1.66 2.1 3.76
2.66 2.37 2.34 1.6 4.29 4.66 3.58 2.99 3.44 3.07 3.03 2.84 5.25 7.95 6.21 3.84 3.48 23.01 4.13 3.04 3.49 3.54 16.16 3.91 3.34 3.83 3.56 3.37 4.78 4.73 6.04
0.89 0.95 0.76 0.46 0.83 0.59 0.75 0.66 0.7 0.64 0.71 0.71 2.76 1.4 0.86 0.71 0.96 10.34 0.6 0.59 0.59 0.67 4.18 0.8 0.89 0.85 0.79 0.99 1.25 1.01 4.74
5.44 6.01 3.05 3.77 12.71 9.7 7.36 11.96 4.81 5.38 5.41 7.75 10.5 18.12 14.84 7.76 6.96 55.73 6.34 5.59 6.77 6.87 22.41 7.48 7.66 6.45 6.78 6.22 8.79 9.2 17.82
22.18 23.14 20.52 20.96 22.33 20.44 22.91 24.41 16.81 18.93 19.58 18.83 27.72 30.15 25.41 22.54 22.15 95.25 20.17 19.51 19.81 20.74 37.32 20.01 19.05 23.75 22.08 18.74 22.64 23.2 29.83
1.82 1.26 1.63 1.25 4.02 3.52 1.28 0.86 1.78 1.51 1.73 1.5 1.92 6.67 5.04 3.2 2.56 23.15 2.57 1.64 1.79 1.81 9.71 1.92 1.79 1.9 2.18 1.45 2.62 2.88 4.72
5.84 6.04 6.17 7.37 8.36 6.48 7.25 7.79 5.85 6.8 6.77 7.07 12.07 9.96 8.94 8.12 7.98 45.87 7.12 7.16 5.98 7.05 18.63 6.69 5.72 7.67 6.5 5.76 7.4 8.21 11.07
1.61 1.44 1.54 1.71 3.07 2.67 2.12 2.1 1.91 1.87 2.13 1.81 2.91 3.49 2.86 2.69 1.85 9.42 2.4 1.98 1.66 1.97 6.58 2.13 2.25 2.58 1.73 1.75 2.86 2.48 3.3
8.93 7.89 6.69 8.04 14.52 13.57 12.14 14.61 9.89 9.7 11.58 8.92 9.96 16.74 15.21 11.15 11.72 54.6 12.03 11.27 10.47 11.4 16.8 7.74 10.29 11.06 10.9 8.75 10.8 11.19 13.56
0.27 0.45 0.29 0.43 0.51 0.45 0.21 0.32 0.38 0.22 0.28 0.32 0.29 1.13 0.7 0.39 0.31 3.01 0.32 0.21 0.22 0.33 0.76 0.29 0.31 0.38 0.23 0.19 0.66 0.59 0.94
7.63 7.85 6.69 6.51 18.56 15.73 9.38 8.39 11.0 10.88 11.3 10.48 17.13 18.53 16.43 11.66 10.29 66.19 11.17 9.13 9.63 11.24 42.34 10.72 11.37 11.3 10.85 9.5 13.87 15.26 23.66
0.64 1.31 1.32 1.12 2.61 2.79 2.32 2.38 1.63 2.31 2.26 1.92 3.25 6.89 5.47 2.04 1.79 27.99 2.76 2.03 2.34 2.13 21.17 1.8 1.63 1.77 1.8 1.71 3.24 2.65 4.6
0.26 0.39 0.42 0.37 0.33 0.49 0.51 0.6 0.46 0.48 0.37 0.36 0.3 0.88 0.65 0.46 0.45 12.54 0.59 0.33 0.23 0.32 2.71 0.32 0.31 0.38 0.39 0.19 1.63 1.98 3.77
4.2 4.14 4.06 4.73 6.3 7.18 4.03 4.7 5.44 6.51 7.04 7.72 10.97 8.88 6.85 5.78 6.05 63.43 5.68 5.53 5.18 5.33 5.64 7.79 6.36 5.63 5.32 4.29 8.15 7.99 15.64
0.5 0.47 0.23 0.28 0.58 0.72 0.37 0.78 0.32 0.63 0.69 0.89 0.77 2.36 1.2 0.79 0.75 4.17 0.79 0.61 0.84 0.8 0.57 0.88 1.03 1.05 0.63 0.59 1.29 1.36 2.46
0.96 1.69 1.49 1.53 1.71 1.54 1.62 2.19 1.16 1.27 1.25 1.5 3.04 2.94 3.16 2.21 2.12 16.55 1.86 1.39 1.28 1.43 9.7 1.89 1.82 1.59 1.57 1.22 2.52 2.7 3.65
9.87 9.54 8.2 7.13 12.28 9.18 10.26 10.56 11.21 11.95 11.09 14.48 43.62 19.29 16.83 11.13 14.2 147.8 18.49 12.02 11.76 11.8 46.47 16.47 14.12 12.93 11.83 12.27 14.38 17.02 44.61
1.12 0.75 1.04 1.37 2.91 3.33 2.44 2.4 1.93 1.87 1.89 2.45 3.31 3.53 4.73 2.17 2.22 19.78 3.18 2.39 1.99 2.17 9.68 2.57 2.84 2.53 2.13 2.63 2.84 3.27 4.2
2.78 2.79 3.57 4.44 8.07 4.51 3.98 4.41 5.37 5.6 5.83 6.63 5.88 12.86 10.15 5.09 5.79 52.54 5.33 5.47 4.4 4.57 18.0 5.27 4.88 4.82 5.21 3.64 7.57 7.82 12.68
0.49 0.17 0.58 0.78 1.38 2.54 0.58 1.48 1.36 1.46 1.12 1.21 1.17 3.77 2.76 1.33 1.32 17.7 1.58 0.9 0.93 1.39 6.95 1.25 1.24 1.64 1.28 0.82 2.06 2.07 2.76
0.3 0.07 0.04 0.19 0.39 0.37 0.12 0.15 0.29 0.27 0.2 0.2 2.93 0.83 0.43 0.3 0.15 23.1 0.32 0.21 0.28 0.27 2.38 0.43 0.46 0.19 0.43 0.07 0.38 0.72 6.95
4.84 5.28 4.91 4.9 6.82 5.73 4.09 4.78 4.6 4.84 5.62 5.57 7.09 7.14 5.92 5.87 5.64 15.94 5.05 4.47 4.7 5.23 8.07 4.48 5.07 5.35 5.18 4.74 5.44 5.79 8.15
10.94 9.63 8.97 7.96 12.21 12.34 9.81 9.79 10.27 9.16 10.47 11.5 14.58 17.61 16.69 12.33 11.51 37.11 10.94 10.87 10.43 10.92 15.2 11.28 10.9 11.11 11.07 11.58 12.18 11.11 12.78
2.86 3.36 3.01 2.87 6.19 4.16 2.23 2.2 2.98 3.02 3.23 3.04 3.61 6.03 4.49 3.26 2.85 17.7 2.86 2.16 2.62 2.65 5.23 2.49 2.68 2.93 2.89 2.73 4.82 4.93 6.52
0.02 0.02 0.02 0.01 0.1 0.14 0.05 0.02 0.06 0.05 0.06 0.02 0.23 0.68 0.39 0.06 0.07 1.81 0.12 0.03 0.06 0.03 0.45 0.09 0.07 0.05 0.05 0.03 0.14 0.11 0.52
5.53 5.33 4.54 4.89 5.87 7.03 7.45 7.31 6.09 6.1 6.81 6.75 8.48 9.77 7.93 7.16 6.93 17.11 6.84 5.86 5.8 6.5 9.22 6.26 6.57 6.96 6.7 5.99 9.02 8.85 10.51
0.04 0.04 0.02 0.06 0.57 0.34 0.17 0.37 0.2 0.2 0.06 0.13 0.33 0.88 1.18 0.31 0.23 10.5 0.25 0.21 0.13 0.21 1.9 0.19 0.21 0.16 0.19 0.07 0.26 0.42 3.18
1.11 2.72 3.26 3.33 4.19 4.9 6.67 9.29 5.53 4.56 5.93 3.84 4.68 21.64 14.12 5.51 3.48 349.55 7.29 3.48 3.24 3.39 130.51 4.18 3.79 3.2 3.14 0.98 17.23 24.91 109.77
6.52 7.97 4.95 4.4 8.17 7.12 3.88 3.14 3.98 4.48 5.48 3.93 5.59 9.7 9.39 4.68 5.1 31.61 5.92 3.46 4.09 4.53 8.94 4.14 4.98 5.03 5.14 3.58 6.57 6.26 9.4
0.75 1.22 1.51 1.07 2.49 2.64 1.12 1.7 1.21 1.44 1.75 1.24 1.02 6.85 5.44 1.42 0.94 20.67 2.7 1.01 1.3 0.99 6.99 0.99 1.04 1.63 1.48 1.53 4.07 4.24 7.91

Details

Raw expression values (TPM normalized), Green cells indicate low expression and red high. (Dark gray cells indicate missing values)