Heatmap: Cluster_106 (Lactuca sativa (Lsa) Coexpression Clusters (HCCA Algorithm))

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(Values are log₂ transformed ratios of a genes expression in a sample divided by the mean expression level)

Gene	Light: 268 uE m-2 s-1	Light: 202.5 uE m-2 s-1 (Control)	Light: 135 uE m-2 s-1	Light: 67.5 uE m-2 s-1	Photoperiod: L24	Photoperiod: L20D4 (Control)	Photoperiod: L12D12	Photoperiod: L8D16	RBW: 4:1:1 (Control)	RBW: 4:1:0	RBW: 3:1:1	RBW: 3:1:0	Nitrogen: 0%	Nitrogen: 25%	Nitrogen: 50%	Nitrogen: 100% (Control)	Nitrogen: 150%	Phosphorous: 0%	Phosphorous: 25%	Phosphorous: 50%	Phosphorous: 100% (Control)	Phosphorous: 150%	Potassium: 0%	Potassium: 25%	Potassium: 50%	Potassium: 100% (Control)	Potassium: 150%	Temperature: 20°C	Temperature: 25°C (Control)	Temperature: 30°C	Temperature: 35°C
Lsat_1_v5_gn_0_29720.1 (MSBP2)	-0.99	-0.86	-0.63	-0.54	1.09	0.94	-0.37	-0.48	-0.51	-0.55	-0.24	-0.67	-0.83	1.5	1.28	0.04	-0.6	0.42	0.43	-0.5	-0.41	-0.31	0.56	-0.58	-0.67	-0.68	-0.48	-0.59	0.27	-0.24	-0.08
Lsat_1_v5_gn_0_30981.1 (LRRAC1)	-1.42	-0.88	-1.13	-0.47	0.81	0.67	-0.14	-0.49	-0.3	-0.23	-0.18	-0.53	-0.68	1.34	1.08	0.1	-0.25	-0.13	-0.14	-0.39	-0.21	-0.29	0.14	-0.6	-0.47	-0.29	-0.07	-0.78	0.43	0.47	0.76
Lsat_1_v5_gn_1_106561.1	-0.74	-0.57	-0.78	-0.53	0.43	0.61	0.07	-0.17	-0.15	-0.28	-0.19	-0.39	-0.02	0.78	0.58	0.03	-0.14	0.14	-0.17	-0.4	-0.23	-0.17	0.61	-0.34	-0.14	-0.03	-0.19	-0.29	0.35	0.2	0.39
Lsat_1_v5_gn_1_112181.1 (NMNAT)	-0.92	-1.13	-1.25	-0.86	0.28	0.57	-0.01	-0.01	-0.03	-0.2	0.03	-0.39	-0.5	1.11	0.96	0.09	-0.24	0.0	0.31	-0.28	-0.11	-0.1	0.32	-0.16	-0.25	-0.06	-0.02	-0.53	0.27	0.16	0.16
Lsat_1_v5_gn_1_117920.1 (WAKL1)	-0.6	-0.38	-0.56	-0.54	0.46	0.44	-0.11	-0.28	-0.3	-0.28	-0.21	-0.28	-0.21	0.85	0.59	0.09	-0.19	0.31	0.12	-0.22	-0.13	-0.15	0.18	-0.23	-0.27	-0.14	-0.02	-0.37	0.41	0.26	0.35
Lsat_1_v5_gn_1_128021.1	-0.81	-0.72	-1.04	-1.23	0.38	0.45	-0.19	-0.07	-0.13	0.02	-0.04	-0.25	0.05	1.12	0.65	0.2	-0.11	0.13	-0.15	-0.16	-0.2	-0.12	0.37	-0.38	-0.41	0.03	-0.26	-0.25	0.06	0.12	0.61
Lsat_1_v5_gn_1_13520.1 (LST8-1)	-0.48	-0.5	-0.78	-0.81	0.69	0.58	-0.2	-0.29	-0.18	-0.19	-0.13	-0.32	-0.14	0.93	0.75	0.09	-0.18	-0.28	0.15	-0.2	-0.12	-0.04	0.36	-0.17	-0.23	-0.12	0.02	-0.09	0.11	-0.07	0.15
Lsat_1_v5_gn_1_18980.1	-0.68	-0.45	-0.55	-0.69	0.54	0.54	-0.4	-0.98	-0.53	-0.52	-0.36	-0.66	-0.99	1.39	1.19	-0.02	-0.8	0.49	0.24	-0.76	-0.66	-0.63	1.2	-0.45	-0.41	-0.28	-0.31	-0.99	0.29	0.45	0.51
Lsat_1_v5_gn_1_20380.1	-0.57	-0.76	-0.64	-0.27	0.39	0.64	-0.01	-0.06	-0.21	-0.41	-0.08	-0.2	-0.37	0.95	0.66	0.09	-0.31	0.2	-0.07	-0.36	-0.18	-0.14	0.9	-0.33	-0.31	-0.17	-0.16	-0.43	0.13	-0.01	0.14
Lsat_1_v5_gn_1_23200.1 (MRG2)	-0.82	-0.78	-1.42	-1.94	0.72	0.8	-0.45	-0.64	-0.53	-0.55	-0.55	-0.53	-0.08	1.42	1.08	0.01	-0.3	0.1	0.35	-0.49	-0.16	0.07	0.63	-0.37	-0.29	-0.28	-0.19	-0.02	0.18	-0.06	0.31
Lsat_1_v5_gn_1_28980.1	-0.6	-0.47	-0.57	-0.3	0.52	0.54	-0.18	-0.29	-0.51	-0.66	-0.26	-0.4	-0.05	0.98	0.6	0.06	-0.29	0.26	0.08	-0.23	-0.07	-0.26	0.59	-0.22	-0.32	-0.17	-0.11	-0.3	0.22	0.06	0.52
Lsat_1_v5_gn_1_32200.1 (HSS)	-0.56	-0.42	-0.88	-0.67	0.59	0.52	0.04	0.02	-0.33	-0.34	-0.09	-0.4	-0.54	0.94	0.69	-0.09	-0.47	0.37	0.28	-0.39	-0.26	-0.15	0.26	-0.29	-0.24	-0.23	-0.11	-0.49	0.5	0.33	0.3
Lsat_1_v5_gn_1_33080.1	-1.05	-0.55	-1.25	-0.69	0.93	1.14	-0.07	0.13	-0.46	-0.9	-0.48	-1.15	-0.25	1.63	0.94	-0.18	-0.66	0.27	0.02	-0.84	-0.58	-0.31	0.38	-0.29	-0.24	-0.51	0.01	-1.01	0.27	0.13	0.15
Lsat_1_v5_gn_1_34781.1	-0.53	-0.52	-0.71	-0.61	0.48	0.73	0.02	0.29	-0.43	-0.37	-0.21	-0.44	-0.27	1.02	0.76	0.13	-0.17	-0.45	0.2	-0.23	-0.1	0.03	0.29	-0.21	-0.25	-0.11	-0.12	-0.18	0.16	-0.09	-0.02
Lsat_1_v5_gn_1_57321.1 (MMZ3)	-0.32	-0.37	-0.45	-0.33	0.39	0.37	-0.07	0.03	-0.28	-0.23	-0.13	-0.18	0.23	0.65	0.45	0.1	-0.1	0.02	-0.04	-0.25	-0.18	-0.03	0.22	-0.19	-0.17	-0.03	-0.03	-0.19	0.09	0.05	0.23
Lsat_1_v5_gn_1_65541.1	-0.31	-0.38	-0.34	-0.22	0.41	0.25	-0.3	-0.07	-0.36	-0.28	-0.22	-0.31	0.24	0.74	0.51	0.17	-0.06	0.11	0.02	-0.36	-0.21	-0.25	0.58	-0.18	-0.23	-0.18	-0.16	-0.16	0.2	0.14	0.17
Lsat_1_v5_gn_1_69641.1	-0.81	-0.62	-0.51	-0.22	0.73	0.4	-0.45	-0.7	-0.18	-0.18	-0.12	-0.25	-0.28	0.81	0.65	0.02	-0.31	0.31	0.11	-0.36	-0.28	-0.08	0.46	-0.4	-0.33	-0.18	-0.07	-0.32	0.37	0.27	0.55
Lsat_1_v5_gn_1_76940.1	-1.11	-1.49	-0.88	-0.43	1.03	1.05	-0.26	-0.37	-0.41	-0.41	-0.24	-0.62	-1.12	1.09	0.8	-0.06	-0.56	0.3	0.27	-0.44	-0.11	-0.03	0.54	-0.37	-0.23	-0.14	-0.0	-0.4	0.44	0.04	-0.04
Lsat_1_v5_gn_1_77161.1	-0.47	-0.35	-0.46	-0.37	0.27	0.31	-0.1	-0.16	-0.13	-0.2	-0.09	-0.19	-0.09	0.76	0.57	0.11	-0.11	0.1	0.09	-0.23	-0.21	-0.12	0.58	-0.2	-0.16	-0.07	-0.08	-0.32	0.16	0.08	0.13
Lsat_1_v5_gn_1_84721.1	-0.78	-0.37	-0.7	-0.51	0.39	0.23	-0.2	-0.17	-0.27	-0.3	-0.23	-0.32	-0.04	0.8	0.55	0.02	-0.17	0.38	0.27	-0.39	-0.22	-0.28	0.74	-0.3	-0.3	-0.15	-0.13	-0.24	0.33	0.31	0.37
Lsat_1_v5_gn_1_9840.1	-0.39	-0.35	-0.46	-0.42	0.58	0.55	-0.03	0.01	-0.32	-0.2	-0.28	-0.5	-0.25	0.9	0.67	-0.16	-0.36	0.28	0.12	-0.37	-0.29	-0.08	0.7	-0.44	-0.28	-0.06	-0.14	-0.42	0.16	-0.05	0.18
Lsat_1_v5_gn_2_104661.1 (ZPR3)	-0.75	-0.62	-0.54	-0.34	0.26	0.23	-0.17	-0.07	-0.22	-0.22	-0.06	-0.2	0.05	0.93	0.68	0.14	-0.06	0.19	-0.09	-0.21	-0.22	-0.18	0.53	-0.23	-0.17	-0.15	-0.2	-0.26	0.14	0.05	0.38
Lsat_1_v5_gn_2_111320.1	-0.81	-0.61	-1.11	-0.72	0.97	0.9	-0.35	0.07	-0.59	-0.58	-0.25	-0.64	-0.29	1.38	1.11	-0.03	-0.56	0.31	0.13	-0.55	-0.54	-0.21	0.66	-0.24	-0.5	-0.52	-0.3	-0.66	0.17	0.0	0.0
Lsat_1_v5_gn_2_112320.1 (GNAT4)	-0.3	-0.24	-0.39	-0.4	0.7	0.68	-0.12	-0.1	-0.24	-0.25	-0.15	-0.37	-0.31	0.94	0.66	0.05	-0.32	-0.91	0.08	-0.31	-0.23	-0.21	0.58	-0.24	-0.24	-0.23	-0.09	-0.26	0.43	0.04	-0.07
Lsat_1_v5_gn_2_121160.1	-0.54	-0.46	-1.31	-0.53	0.86	0.7	-0.34	-0.23	-0.19	-0.44	-0.12	-0.74	-0.52	0.81	0.87	0.24	-0.18	-0.2	0.05	-0.59	-0.28	0.0	0.85	-0.27	-0.68	-0.35	0.0	-0.59	0.38	0.35	0.33
Lsat_1_v5_gn_2_122000.1 (COI1)	-1.1	-0.83	-0.49	-0.36	-0.03	0.35	0.19	0.22	-0.05	-0.11	-0.02	-0.24	-0.32	0.76	0.58	0.15	-0.08	-0.13	-0.15	-0.23	-0.23	-0.1	0.62	-0.32	-0.21	-0.1	0.02	-0.42	0.29	0.3	0.43
Lsat_1_v5_gn_2_122861.1	-0.25	-0.69	-0.63	-0.51	1.18	0.99	-0.52	-0.97	-0.34	-0.38	-0.31	-0.5	-0.55	1.46	1.11	-0.12	-0.71	0.37	0.27	-0.56	-0.55	-0.4	0.85	-0.62	-0.68	-0.57	-0.38	-0.58	0.06	-0.22	-0.3
Lsat_1_v5_gn_2_131280.1	-0.73	-0.59	-0.76	-0.61	0.4	0.46	0.0	0.16	-0.34	-0.27	-0.3	-0.31	0.06	1.11	0.69	0.08	-0.18	0.12	-0.05	-0.42	-0.25	-0.15	0.31	-0.3	-0.3	-0.22	-0.15	-0.28	0.34	0.21	0.34
Lsat_1_v5_gn_2_134840.1 (RFA5)	-0.49	-0.58	-0.53	-0.38	0.48	0.38	-0.53	-0.66	-0.21	-0.35	-0.06	-0.36	-0.24	1.18	0.87	0.02	-0.39	0.47	0.03	-0.48	-0.35	-0.29	1.12	-0.43	-0.42	-0.31	-0.27	-0.59	0.12	0.07	0.26
Lsat_1_v5_gn_2_136800.1 (ATG13a)	-0.44	-0.47	-0.44	-0.41	0.59	0.45	-0.61	-0.76	-0.31	-0.23	-0.12	-0.23	-0.1	1.19	0.84	0.09	-0.34	0.19	-0.11	-0.34	-0.4	-0.25	0.74	-0.36	-0.27	-0.26	-0.13	-0.53	0.26	0.2	0.17
Lsat_1_v5_gn_2_29420.1 (PUMY)	-0.59	-0.37	-0.79	-0.93	0.39	0.62	0.01	0.04	-0.23	-0.25	-0.18	-0.29	0.01	0.84	0.73	0.1	-0.08	-0.12	0.09	-0.16	-0.12	-0.22	0.23	-0.11	-0.13	-0.08	-0.21	-0.02	0.04	0.03	0.25
Lsat_1_v5_gn_2_32401.1 (ZEU1)	-0.67	-0.93	-1.36	-1.05	1.0	0.55	-1.03	-0.79	-0.45	-0.51	-0.43	-0.32	-0.16	1.43	1.2	-0.02	-0.25	0.16	0.06	-0.4	-0.13	-0.47	0.82	-0.13	-0.57	-0.26	-0.16	-0.66	0.28	0.06	0.3
Lsat_1_v5_gn_2_3261.1	-1.49	-0.48	-0.75	-0.24	0.63	0.44	-0.68	-0.72	-0.41	-0.57	-0.04	-0.94	-0.51	1.59	0.93	-0.11	-0.58	0.57	-0.08	-0.74	-0.46	-0.67	0.91	-0.66	-0.48	-0.26	-0.32	-0.93	0.54	0.44	0.69
Lsat_1_v5_gn_2_34761.1 (SPPL5)	-0.45	-0.46	-0.56	-0.45	0.57	0.48	-0.29	-0.19	-0.36	-0.41	-0.25	-0.36	-0.04	1.01	0.64	0.1	-0.16	0.22	0.15	-0.3	-0.17	-0.12	0.5	-0.38	-0.19	-0.09	-0.1	-0.25	0.11	0.09	0.14
Lsat_1_v5_gn_2_36381.1	-1.66	-1.43	-1.3	-2.48	1.28	0.8	-0.4	-0.65	-0.62	-0.4	-0.52	-0.64	0.01	1.83	1.14	-0.6	-0.58	0.62	0.14	-0.86	-0.68	-0.61	0.78	-0.46	-0.33	-0.39	-0.16	-1.05	0.05	0.39	0.19
Lsat_1_v5_gn_2_43080.1 (COQ6)	-0.88	-0.86	-1.11	-0.84	0.4	0.57	-0.34	-0.33	-0.46	-0.6	-0.19	-0.54	0.1	1.16	0.93	0.07	-0.35	0.2	0.27	-0.34	-0.28	-0.09	0.75	-0.29	-0.2	-0.26	-0.25	-0.54	0.32	0.19	0.55
Lsat_1_v5_gn_2_4641.1 (NLP5)	-0.55	-0.79	-0.85	-0.54	0.63	0.64	-0.11	0.18	-0.26	-0.51	-0.17	-0.46	-0.29	1.43	0.96	0.1	-0.45	-0.07	-0.1	-0.52	-0.44	-0.35	0.81	-0.48	-0.51	-0.32	-0.26	-0.48	0.06	0.08	0.26
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Details

Dark gray cells indicate values where the raw expression is zero (cannot be log-transformed). Blue cells indicate samples where the expression of the gene is below average and red cells indicate the gene is expressed above average in the sample. White cells are average.