Heatmap: Cluster_41 (Lactuca sativa (Lsa) Coexpression Clusters (HCCA Algorithm))

View as: (view raw or zlog-transformed)

View using InCHLib : here ( Experimental feature, still under development)

(Values are normalized against highest expression of the row)

Gene	Light: 268 uE m-2 s-1	Light: 202.5 uE m-2 s-1 (Control)	Light: 135 uE m-2 s-1	Light: 67.5 uE m-2 s-1	Photoperiod: L24	Photoperiod: L20D4 (Control)	Photoperiod: L12D12	Photoperiod: L8D16	RBW: 4:1:1 (Control)	RBW: 4:1:0	RBW: 3:1:1	RBW: 3:1:0	Nitrogen: 0%	Nitrogen: 25%	Nitrogen: 50%	Nitrogen: 100% (Control)	Nitrogen: 150%	Phosphorous: 0%	Phosphorous: 25%	Phosphorous: 50%	Phosphorous: 100% (Control)	Phosphorous: 150%	Potassium: 0%	Potassium: 25%	Potassium: 50%	Potassium: 100% (Control)	Potassium: 150%	Temperature: 20°C	Temperature: 25°C (Control)	Temperature: 30°C	Temperature: 35°C
Lsat_1_v5_gn_0_10900.1	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.27	0.0	0.0	1.0	0.0	0.42	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0
Lsat_1_v5_gn_0_31881.1 (PIRL3)	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.75	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	1.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.74
Lsat_1_v5_gn_1_1881.1	0.05	0.05	0.04	0.04	0.08	0.71	0.08	0.06	0.13	0.09	0.67	0.13	0.09	0.3	0.25	1.0	0.17	0.06	0.14	0.13	0.11	0.16	0.02	0.07	0.1	0.09	0.12	0.09	0.13	0.14	0.51
Lsat_1_v5_gn_1_24280.1 (RSL2)	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	1.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0
Lsat_1_v5_gn_1_31001.1	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	1.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0
Lsat_1_v5_gn_1_38881.1	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.35	0.0	0.0	0.17	0.0	0.0	0.0	0.99	0.2	1.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.46	0.0	0.36	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.17	0.49
Lsat_1_v5_gn_1_7320.1 (FtsHi4)	0.0	0.0	0.0	0.0	0.01	0.44	0.12	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.13	0.64	0.24	0.0	0.0	0.11	0.2	0.0	0.0	0.0	0.0	0.64	1.0	0.0	0.72	0.46	0.0
Lsat_1_v5_gn_1_78921.1 (ASK2)	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.58	0.43	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	1.0
Lsat_1_v5_gn_2_102500.1	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	1.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.89
Lsat_1_v5_gn_2_115800.1	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	1.0	0.0	0.0	0.0	0.57	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.33	0.0	0.0	0.29	0.0
Lsat_1_v5_gn_2_119760.1 (DYAD)	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.63	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.64	1.0	0.0	0.0	0.8	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0
Lsat_1_v5_gn_2_129941.1 (ARA12)	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	1.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0
Lsat_1_v5_gn_2_25781.1 (WRKY30)	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	1.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0
Lsat_1_v5_gn_2_42301.1 (RABG3d)	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	1.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.77	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0
Lsat_1_v5_gn_2_53581.1	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	1.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0
Lsat_1_v5_gn_2_81901.1	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	1.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.5	0.0	0.0	0.58	0.0	0.0	0.44	0.65	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.43
Lsat_1_v5_gn_2_91201.1 (ESP)	0.0	0.0	0.0	0.31	0.0	0.37	0.35	0.0	0.1	0.73	0.0	0.75	0.14	1.0	0.14	0.75	0.55	0.0	0.0	0.51	0.53	0.0	0.0	0.26	0.27	0.0	0.0	0.13	0.0	0.0	0.36
Lsat_1_v5_gn_2_9540.1	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	1.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0
Lsat_1_v5_gn_3_107041.1 (SUS3)	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	1.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0
Lsat_1_v5_gn_3_110340.1 (MSD1)	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	1.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0
Lsat_1_v5_gn_3_111640.1 (RFL9)	0.0	0.38	0.0	0.0	0.48	0.1	0.0	0.33	0.0	0.29	0.0	0.0	0.31	0.23	0.7	0.79	0.31	0.19	0.29	0.36	0.0	0.0	0.14	0.0	0.0	0.31	0.0	0.1	0.11	0.3	1.0
Lsat_1_v5_gn_3_112100.1 (CO)	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	1.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0
Lsat_1_v5_gn_3_18141.1 (IGI1)	0.44	0.0	0.26	0.0	0.04	0.05	0.1	0.16	0.06	0.0	0.0	0.2	0.0	0.9	0.23	0.36	0.49	0.0	0.25	0.0	0.16	0.14	1.0	0.0	0.0	0.58	0.18	0.0	0.24	0.06	0.69
Lsat_1_v5_gn_3_37960.1 (SPL5)	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	1.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0
Lsat_1_v5_gn_3_39861.1	0.41	0.41	0.68	0.0	0.3	0.0	0.0	0.1	0.14	0.12	0.12	0.12	0.0	0.3	0.58	1.0	0.14	0.21	0.35	0.0	0.22	0.13	0.51	0.0	0.0	0.0	0.23	0.0	0.0	0.0	0.12
Lsat_1_v5_gn_3_61721.1	0.55	0.08	0.08	0.08	0.33	0.07	0.07	0.18	0.52	0.0	0.57	0.21	0.28	0.63	0.68	0.9	0.67	0.19	0.81	0.53	0.58	0.32	0.07	0.13	0.12	0.38	0.91	0.34	1.0	0.06	0.88
Lsat_1_v5_gn_3_79561.1	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.9	0.0	0.58	0.0	1.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0
Lsat_1_v5_gn_3_96480.1 (MDR1)	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	1.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0
Lsat_1_v5_gn_4_102600.1 (GC5)	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	1.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.82	0.0	0.0
Lsat_1_v5_gn_4_113781.1	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	1.0	0.96	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0
Lsat_1_v5_gn_4_115321.1 (RUBY)	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	1.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0
Lsat_1_v5_gn_4_128060.1 (PSBC)	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.11	0.0	1.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.54	0.0	0.0
Lsat_1_v5_gn_4_131280.1 (RSL2)	0.01	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	1.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0
Lsat_1_v5_gn_4_1620.1 (HDG12)	0.0	0.33	0.0	0.15	0.1	0.13	0.0	0.29	0.45	0.72	0.0	0.92	0.0	0.41	0.0	0.68	1.0	0.0	0.0	0.37	0.21	0.0	0.25	0.24	0.24	0.5	0.55	0.38	0.74	0.26	1.0
Lsat_1_v5_gn_4_163961.1 (RPS2)	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	1.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0
Lsat_1_v5_gn_4_37901.1	0.29	0.27	0.0	0.0	0.0	0.2	0.24	0.0	0.52	0.29	0.21	1.0	0.58	0.78	0.56	0.22	0.1	0.66	0.13	0.26	0.38	0.0	0.14	0.28	0.1	0.51	0.0	0.28	0.4	0.0	0.29
Lsat_1_v5_gn_5_13440.1 (DRP3B)	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	1.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0
Lsat_1_v5_gn_5_38501.1	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.39	0.82	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	1.0
Lsat_1_v5_gn_5_4220.1 (IMB1)	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	1.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.87	0.0
Lsat_1_v5_gn_5_47440.1	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	1.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0
Lsat_1_v5_gn_5_73400.1 (ROS4)	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.93	0.0	0.0	0.0	1.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.84
Lsat_1_v5_gn_5_77441.1	0.0	0.17	0.0	0.0	0.27	0.0	0.0	0.0	0.13	0.16	0.29	0.0	0.0	0.16	0.67	1.0	0.0	0.87	0.0	0.5	0.0	0.0	0.0	0.14	0.0	0.0	0.12	0.0	0.0	0.13	0.6
Lsat_1_v5_gn_6_13621.1 (KMS2)	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	1.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0
Lsat_1_v5_gn_6_47781.1	0.0	0.0	0.0	0.56	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.25	1.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0
Lsat_1_v5_gn_6_98061.1	0.0	0.0	0.0	0.0	0.08	0.2	0.0	0.21	0.13	0.48	0.0	0.11	0.14	0.0	0.52	1.0	0.34	0.2	0.49	0.38	0.0	0.62	0.0	0.2	0.1	0.0	1.0	0.42	0.0	0.3	0.58
Lsat_1_v5_gn_7_113821.1	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.94	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	1.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.58	0.23	0.0	0.0	0.0	0.66	0.0
Lsat_1_v5_gn_7_30101.1 (ERD7)	0.29	0.0	0.16	0.1	0.26	0.38	0.41	0.09	0.18	0.13	0.04	0.72	0.61	0.7	0.39	0.18	0.14	1.0	0.26	0.11	0.38	0.15	0.51	0.29	0.12	0.51	0.43	0.23	0.26	0.09	0.42
Lsat_1_v5_gn_7_48260.1	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.99	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.56	0.0	1.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0
Lsat_1_v5_gn_8_121601.1 (HAP15)	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	1.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.15
Lsat_1_v5_gn_8_161340.1 (PP2A)	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	1.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0
Lsat_1_v5_gn_8_162860.1 (ZIF2)	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	1.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0
Lsat_1_v5_gn_8_70001.1 (TASH3)	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.26	1.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.19	0.0	0.21	0.22
Lsat_1_v5_gn_8_75321.1 (LEA4-5)	0.0	0.0	0.49	0.24	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	1.0	0.0	0.45	0.21	0.0	0.92	0.89	0.59	0.19	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.57	0.0	0.0	0.92	0.0	0.43	0.19	0.28
Lsat_1_v5_gn_8_87801.1	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	1.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0
Lsat_1_v5_gn_8_95180.1	0.0	0.0	0.0	0.0	0.31	0.0	0.0	0.0	0.42	0.0	0.0	0.0	0.0	0.89	0.0	1.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.88	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.47	0.0	0.0
Lsat_1_v5_gn_9_21120.1	0.0	0.0	0.0	0.0	0.36	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.39	0.78	0.0	1.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.35
Lsat_1_v5_gn_9_28361.1	0.3	0.23	0.08	0.61	0.52	0.25	0.42	0.24	0.41	0.46	0.14	0.51	0.6	0.48	0.92	0.78	0.29	1.0	0.1	0.34	0.21	0.15	0.03	0.22	0.22	0.49	0.4	0.38	0.5	0.67	0.52
Lsat_1_v5_gn_9_39201.1 (RH8)	0.18	0.0	0.0	0.17	0.24	0.16	0.0	0.44	0.37	0.0	0.0	0.32	0.0	0.2	0.0	1.0	0.37	0.0	0.0	0.16	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.17	0.0	0.89
Lsat_1_v5_gn_9_3980.1 (ALP2)	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.61	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	1.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0
Lsat_1_v5_gn_9_61940.1 (RFO1)	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	1.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.33	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0
Lsat_1_v5_gn_9_77040.1 (KAK)	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	1.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0

Details

Expression values normalized per gene (using the maximum value, Green cells indicate low expression and red high. (Dark gray cells indicate missing values)