1. Home
  2. Tools
  3. Expression Heatmap
  4. Results

Heatmap: Cluster_141 (Lactuca sativa (Lsa) Coexpression Clusters (HCCA Algorithm))

View as: (view zlog-transformed or row-normalized)

View using InCHLib : here ( Experimental feature, still under development)

(Showing raw values)

 Transpose table  Download table
Gene
Light: 268 uE m-2 s-1
Light: 202.5 uE m-2 s-1 (Control)
Light: 135 uE m-2 s-1
Light: 67.5 uE m-2 s-1
Photoperiod: L24
Photoperiod: L20D4 (Control)
Photoperiod: L12D12
Photoperiod: L8D16
RBW: 4:1:1 (Control)
RBW: 4:1:0
RBW: 3:1:1
RBW: 3:1:0
Nitrogen: 0%
Nitrogen: 25%
Nitrogen: 50%
Nitrogen: 100% (Control)
Nitrogen: 150%
Phosphorous: 0%
Phosphorous: 25%
Phosphorous: 50%
Phosphorous: 100% (Control)
Phosphorous: 150%
Potassium: 0%
Potassium: 25%
Potassium: 50%
Potassium: 100% (Control)
Potassium: 150%
Temperature: 20°C
Temperature: 25°C (Control)
Temperature: 30°C
Temperature: 35°C
0.0 0.0 0.0 0.0 0.01 0.02 0.0 0.01 0.01 0.01 0.01 0.03 0.03 0.0 0.04 0.0 0.01 1.42 0.01 0.0 0.0 0.0 0.06 0.0 0.02 0.02 0.01 0.01 0.0 0.06 0.04
0.0 0.0 0.0 0.0 0.09 0.05 0.06 0.12 0.0 0.05 0.08 0.0 0.17 0.0 0.04 0.06 0.03 15.95 0.25 0.0 0.02 0.18 0.08 0.16 0.0 0.09 0.0 0.03 0.05 0.03 0.0
0.01 0.0 0.0 0.03 0.0 0.0 0.08 0.06 0.02 0.04 0.06 0.05 0.28 0.0 0.13 0.04 0.22 2.91 0.07 0.06 0.02 0.03 0.0 0.1 0.14 0.1 0.06 0.15 0.09 0.27 0.19
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 2.33 0.0 0.0 0.0 0.0 0.04 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.05 0.07 0.0 0.0 0.02 0.04 0.05 0.0 0.0 0.01 0.0 0.0 0.01 0.03 0.03 0.0 0.0 9.59 0.06 0.02 0.0 0.0 0.12 0.0 0.0 0.02 0.02 0.0 0.03 0.0 0.1
0.05 0.07 0.0 0.0 0.02 0.04 0.05 0.0 0.0 0.01 0.0 0.0 0.01 0.03 0.03 0.0 0.0 9.59 0.06 0.02 0.0 0.0 0.12 0.0 0.0 0.02 0.02 0.0 0.03 0.0 0.1
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.03 0.01 0.0 0.01 0.0 0.0 0.0 0.01 0.0 0.01 0.0 0.0 9.51 0.01 0.0 0.0 0.0 0.0 0.09 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.5
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.07 0.0 0.0 0.0 0.0 0.45 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 2.2 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.02 0.0 0.0 0.0 0.04 0.08 1.12 0.0 0.13 0.02 0.02 5.84 0.0 0.11 0.05 0.19 0.39 0.04 0.12 0.07 0.0 0.08 0.0 0.0 0.55
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.22 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.0 0.0 0.25 0.0 0.55 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 3.99 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.01 0.0 0.0 0.0 0.0 0.04 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.03 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.02 0.08 0.0 0.0 0.0 0.03 0.02 0.01 0.0 0.01 0.0 0.01 0.08 0.07 0.05 0.02 0.06 2.06 0.01 0.04 0.07 0.06 0.02 0.01 0.04 0.0 0.02 0.04 0.0 0.0 0.44
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.29 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.01
0.0 0.0 0.0 0.0 0.15 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 3.58 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 1.35 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.0 0.0 0.0 0.0 0.34 0.6 0.12 0.05 0.18 0.04 0.18 0.3 0.14 0.34 0.41 0.13 0.24 7.83 0.22 0.1 0.24 0.41 0.15 0.45 0.06 0.24 0.18 0.26 0.2 0.23 0.02
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.21 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.02 3.62 0.0 0.0 0.0 0.0 0.06 0.0 0.0 0.0 0.0 0.02 0.0 0.0 0.0
0.82 0.8 0.98 1.62 1.11 1.15 0.66 0.57 0.98 0.54 1.23 1.22 1.34 0.89 0.99 0.58 0.63 32.57 0.92 0.92 1.25 0.77 0.38 0.85 0.73 0.87 0.52 0.92 0.69 0.61 0.67
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.03 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 11.84 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.09 0.0 0.0 0.0 0.0 7.61 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.1 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 4.38 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.03 0.0 0.01 0.05 0.0 0.03 0.01 0.0 0.03 0.09 0.0 0.04 0.03 0.01 0.05 0.07 0.03 13.09 0.1 0.01 0.02 0.02 0.0 0.06 0.02 0.02 0.06 0.02 0.04 0.04 0.06
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 9.04 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.14 0.41 0.09 0.05 0.23 0.11 0.02 0.01 0.02 0.01 0.02 0.02 0.06 0.32 0.14 0.02 0.04 2.88 0.1 0.02 0.01 0.0 0.24 0.0 0.04 0.02 0.04 0.04 0.15 0.09 0.23
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.03 0.0 0.03 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.06 0.76 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.08 0.0 0.03 0.0 0.0
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.17 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.02
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.02 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.18 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.01 0.0 0.0 0.0 0.0 0.01 0.04 0.0 0.0 0.31 0.0 0.01 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.01 0.0 0.01
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.22 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.03 0.0 0.0 0.0 0.0 14.6 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 1.54 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.17 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.03 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.07 0.0 0.0 1.71 0.0 0.0 0.0 0.0 0.04 0.0 0.0 0.12 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.0 0.05 0.0 0.0 0.06 0.0 0.08 0.09 0.06 0.0 0.08 0.04 0.15 0.17 0.11 0.17 0.07 10.19 0.02 0.14 0.0 0.15 0.18 0.05 0.04 0.07 0.0 0.02 0.17 0.17 0.17
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.03 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 1.81 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.68 0.34 0.11 0.0 12.86 2.79 0.0 0.0 0.08 0.13 0.05 0.08 3.12 3.69 8.44 0.53 0.56 72.19 2.56 1.2 1.1 0.76 13.21 2.23 1.07 0.46 1.55 1.1 0.19 2.76 0.07
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 22.16 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.02 0.0 0.0 0.0 0.0
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.11 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.0 0.0 0.02 0.11 0.03 0.0 0.03 0.01 0.03 0.06 0.07 0.0 0.02 0.05 0.04 0.0 0.04 14.71 0.0 0.0 0.0 0.0 0.03 0.04 0.0 0.03 0.04 0.05 0.05 0.05 0.04
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.01 0.0 0.0 0.0 0.12 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.0 0.0 0.0 0.0 0.01 0.0 0.0 0.0 0.01 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.37 0.0 0.0 0.0 0.04 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
Lsat_1_v5_gn_7_380.1 (AUXILIN-LIKE4)
 0.18 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 8.35 0.0 0.15 0.0 0.0 0.25 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.0 0.0 0.01 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.49 0.0 0.0 0.0 0.0 0.01 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.01 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.01 0.0 0.01 0.0 0.01 0.0 0.0 0.0 0.31 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.01 0.0 0.0 0.0
0.18 1.06 0.45 0.22 1.36 0.3 0.23 0.09 0.14 0.11 0.33 0.14 0.43 0.76 1.33 0.3 0.44 28.66 0.26 0.25 0.27 0.29 6.64 0.2 0.16 0.11 0.34 0.17 0.08 0.21 0.38
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.08 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.0 0.0 0.03 0.0 0.02 0.0 0.0 0.02 0.05 0.0 0.0 0.0 0.02 0.02 0.07 0.0 0.0 2.04 0.02 0.0 0.04 0.02 0.43 0.02 0.0 0.0 0.0 0.0 0.02 0.07 0.15
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.05 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
2.61 3.37 2.47 1.31 3.38 1.38 0.79 0.7 0.67 0.55 0.55 0.59 1.82 1.56 1.77 1.79 1.99 22.83 1.46 1.51 0.8 1.04 4.82 1.07 1.35 1.42 1.37 1.36 0.91 1.23 1.35
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.85 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.99 1.85 0.52 0.38 1.61 0.45 0.22 0.07 0.19 0.08 0.38 0.11 0.7 0.45 0.74 0.32 0.54 15.88 0.34 0.1 0.17 0.32 0.37 0.29 0.57 0.42 0.46 0.25 0.09 0.14 0.87
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.31 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.0 0.0 0.01 0.01 0.0 0.01 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 25.72 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.07 0.22 0.03 0.12 0.23 0.23 0.13 0.22 0.18 0.12 0.16 0.08 0.27 0.03 0.19 0.13 0.09 14.92 0.09 0.03 0.09 0.12 0.62 0.13 0.2 0.16 0.08 0.14 0.22 0.19 0.28
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.22 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.08 0.08 0.07 0.03 0.2 0.15 0.12 0.05 0.03 0.17 0.06 0.03 0.94 0.07 0.18 0.1 0.14 26.3 0.08 0.18 0.04 0.07 0.12 0.18 0.05 0.1 0.05 0.03 0.1 0.21 1.14
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 2.85 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.03
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 14.21 0.0 0.0 0.16 0.0 1.02 0.0 0.0 0.0 0.06 0.0 0.0 0.0 0.0
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.52 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 2.12 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 32.04 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.34 0.0 0.0 0.0
0.0 0.0 0.0 0.0 0.01 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.02 0.0 0.03 0.0 0.0 4.58 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.0 2.27 0.0 0.0 0.88 1.16 0.73 2.91 1.62 0.0 0.95 0.0 19.0 0.7 2.12 0.33 0.58 40.07 1.36 0.0 0.0 0.42 3.2 0.64 0.0 0.0 0.0 0.53 1.34 1.33 5.15
0.0 0.0 0.0 0.0 0.01 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.01 0.0 0.0 0.0 0.01 0.25 0.0 0.01 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.0 0.0 0.0 0.0 0.01 0.02 0.0 0.01 0.01 0.01 0.01 0.03 0.03 0.0 0.04 0.0 0.01 1.42 0.01 0.0 0.0 0.0 0.06 0.0 0.02 0.02 0.01 0.01 0.0 0.06 0.04
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.02 0.0 0.08 0.0 0.0 0.0 0.0 6.08 0.0 0.01 0.0 0.0 0.0 0.01 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.07

Details

Raw expression values (TPM normalized), Green cells indicate low expression and red high. (Dark gray cells indicate missing values)