1. Home
  2. Tools
  3. Expression Heatmap
  4. Results

Heatmap: Cluster_58 (Lactuca sativa (Lsa) Coexpression Clusters (HCCA Algorithm))

View as: (view raw or zlog-transformed)

View using InCHLib : here ( Experimental feature, still under development)

(Values are normalized against highest expression of the row)

 Transpose table  Download table
Gene
Light: 268 uE m-2 s-1
Light: 202.5 uE m-2 s-1 (Control)
Light: 135 uE m-2 s-1
Light: 67.5 uE m-2 s-1
Photoperiod: L24
Photoperiod: L20D4 (Control)
Photoperiod: L12D12
Photoperiod: L8D16
RBW: 4:1:1 (Control)
RBW: 4:1:0
RBW: 3:1:1
RBW: 3:1:0
Nitrogen: 0%
Nitrogen: 25%
Nitrogen: 50%
Nitrogen: 100% (Control)
Nitrogen: 150%
Phosphorous: 0%
Phosphorous: 25%
Phosphorous: 50%
Phosphorous: 100% (Control)
Phosphorous: 150%
Potassium: 0%
Potassium: 25%
Potassium: 50%
Potassium: 100% (Control)
Potassium: 150%
Temperature: 20°C
Temperature: 25°C (Control)
Temperature: 30°C
Temperature: 35°C
0.33 0.29 0.3 0.32 0.42 0.44 0.36 0.35 0.26 0.26 0.29 0.24 0.52 0.6 0.5 0.39 0.37 1.0 0.39 0.31 0.33 0.32 0.98 0.33 0.33 0.34 0.35 0.34 0.4 0.38 0.48
0.23 0.13 0.12 0.09 0.14 0.2 0.52 0.66 0.13 0.12 0.14 0.13 0.34 0.41 0.33 0.2 0.23 0.78 0.3 0.25 0.19 0.21 1.0 0.24 0.24 0.23 0.21 0.21 0.19 0.19 0.19
0.08 0.11 0.05 0.0 0.11 0.01 0.35 0.68 0.14 0.15 0.1 0.11 0.27 0.16 0.2 0.11 0.22 1.0 0.41 0.15 0.16 0.09 0.71 0.19 0.14 0.04 0.07 0.1 0.15 0.15 0.14
0.11 0.16 0.1 0.1 0.36 0.58 0.44 0.73 0.22 0.17 0.24 0.2 0.22 0.59 0.51 0.34 0.31 1.0 0.27 0.26 0.27 0.32 0.45 0.33 0.29 0.28 0.34 0.2 0.29 0.27 0.37
0.04 0.04 0.01 0.02 0.05 0.07 0.21 0.46 0.04 0.04 0.04 0.06 0.21 0.14 0.1 0.07 0.08 0.54 0.11 0.08 0.06 0.06 1.0 0.09 0.07 0.06 0.06 0.06 0.05 0.06 0.06
0.17 0.28 0.1 0.1 0.25 0.33 0.45 0.43 0.19 0.17 0.19 0.16 0.35 0.23 0.26 0.27 0.27 0.72 0.24 0.22 0.22 0.23 1.0 0.22 0.27 0.3 0.25 0.19 0.25 0.31 0.32
0.19 0.18 0.13 0.15 0.31 0.45 0.47 0.67 0.31 0.36 0.32 0.33 0.69 0.6 0.57 0.45 0.39 1.0 0.38 0.39 0.42 0.42 0.84 0.42 0.45 0.42 0.47 0.41 0.33 0.41 0.47
0.11 0.17 0.06 0.07 0.22 0.3 0.42 0.54 0.18 0.18 0.21 0.19 0.27 0.36 0.38 0.26 0.23 1.0 0.24 0.25 0.26 0.24 0.91 0.23 0.23 0.26 0.25 0.22 0.24 0.22 0.21
0.13 0.15 0.14 0.12 0.2 0.3 0.36 0.4 0.18 0.17 0.2 0.17 0.31 0.45 0.47 0.31 0.27 0.96 0.24 0.23 0.22 0.24 1.0 0.28 0.23 0.32 0.27 0.27 0.25 0.25 0.31
0.24 0.3 0.19 0.16 0.41 0.42 0.36 0.55 0.22 0.22 0.25 0.25 0.28 0.43 0.39 0.29 0.26 1.0 0.32 0.26 0.29 0.29 0.76 0.26 0.27 0.3 0.3 0.28 0.34 0.31 0.31
0.04 0.1 0.02 0.02 0.13 0.08 0.32 0.76 0.03 0.04 0.04 0.04 0.23 0.3 0.4 0.15 0.23 1.0 0.29 0.13 0.09 0.1 0.38 0.13 0.08 0.08 0.1 0.09 0.11 0.09 0.06
0.35 0.37 0.25 0.29 0.46 0.6 0.43 0.5 0.31 0.26 0.29 0.27 0.42 0.55 0.46 0.36 0.32 1.0 0.4 0.35 0.3 0.37 0.66 0.33 0.34 0.39 0.36 0.35 0.36 0.33 0.32
0.13 0.17 0.09 0.16 0.27 0.3 0.17 0.22 0.17 0.2 0.19 0.18 0.38 0.35 0.33 0.21 0.18 1.0 0.2 0.18 0.17 0.22 0.78 0.19 0.23 0.26 0.21 0.2 0.23 0.29 0.39
0.29 0.4 0.14 0.13 0.4 0.34 0.34 0.38 0.23 0.24 0.24 0.25 0.4 0.51 0.42 0.32 0.29 1.0 0.31 0.28 0.29 0.29 0.75 0.26 0.3 0.31 0.38 0.26 0.43 0.43 0.45
0.56 0.42 0.36 0.4 0.53 0.62 0.61 0.66 0.46 0.43 0.49 0.47 0.56 0.65 0.66 0.55 0.56 0.91 0.57 0.53 0.56 0.57 1.0 0.54 0.55 0.58 0.58 0.57 0.52 0.49 0.51
0.33 0.33 0.28 0.3 0.45 0.47 0.44 0.57 0.31 0.32 0.33 0.36 0.46 0.61 0.52 0.43 0.4 0.89 0.39 0.35 0.35 0.37 1.0 0.37 0.36 0.36 0.37 0.34 0.39 0.41 0.49
0.24 0.28 0.23 0.2 0.42 0.4 0.4 0.47 0.26 0.3 0.34 0.37 0.6 0.56 0.5 0.38 0.4 1.0 0.28 0.33 0.35 0.37 0.89 0.39 0.37 0.35 0.32 0.4 0.36 0.41 0.58
0.33 0.34 0.34 0.32 0.61 0.64 0.73 0.79 0.47 0.46 0.5 0.46 0.86 0.79 0.71 0.57 0.56 1.0 0.54 0.51 0.5 0.52 0.99 0.48 0.51 0.54 0.52 0.47 0.58 0.56 0.57
0.22 0.18 0.08 0.07 0.24 0.26 0.42 0.66 0.11 0.09 0.1 0.08 0.18 0.4 0.3 0.15 0.14 0.93 0.19 0.12 0.14 0.16 1.0 0.14 0.15 0.13 0.14 0.17 0.15 0.12 0.12
0.09 0.05 0.09 0.16 0.53 0.4 0.33 0.54 0.23 0.2 0.22 0.17 0.08 0.58 0.51 0.19 0.12 1.0 0.32 0.19 0.18 0.2 0.73 0.26 0.2 0.15 0.24 0.15 0.45 0.37 0.41
0.26 0.24 0.24 0.31 0.4 0.38 0.34 0.45 0.2 0.23 0.26 0.26 0.48 0.41 0.38 0.29 0.28 1.0 0.26 0.3 0.28 0.32 0.71 0.27 0.3 0.32 0.27 0.27 0.35 0.36 0.51
0.13 0.13 0.05 0.03 0.19 0.18 0.28 0.28 0.16 0.13 0.14 0.14 0.22 0.53 0.42 0.21 0.17 1.0 0.19 0.17 0.16 0.16 0.78 0.16 0.13 0.13 0.16 0.17 0.16 0.14 0.1
0.1 0.18 0.08 0.12 0.24 0.25 0.38 0.48 0.21 0.25 0.24 0.28 0.48 0.45 0.37 0.31 0.31 0.79 0.26 0.3 0.29 0.26 1.0 0.32 0.34 0.27 0.27 0.28 0.28 0.29 0.34
0.3 0.34 0.27 0.23 0.49 0.57 0.61 0.89 0.33 0.33 0.37 0.49 0.85 0.81 0.65 0.51 0.6 1.0 0.41 0.45 0.44 0.38 0.55 0.53 0.43 0.43 0.46 0.37 0.53 0.56 0.72
0.38 0.65 0.2 0.17 0.39 0.35 0.48 0.76 0.26 0.3 0.29 0.37 0.57 0.43 0.38 0.37 0.41 1.0 0.26 0.32 0.32 0.34 0.56 0.34 0.33 0.39 0.34 0.39 0.3 0.32 0.31
Lsat_1_v5_gn_4_49221.1 (Sec. 61-alpha1)
 0.25 0.27 0.22 0.21 0.42 0.36 0.3 0.34 0.24 0.26 0.27 0.28 0.5 0.47 0.44 0.35 0.33 1.0 0.32 0.3 0.3 0.32 0.83 0.31 0.33 0.32 0.32 0.31 0.4 0.37 0.54
0.26 0.23 0.28 0.39 0.48 0.5 0.46 0.41 0.41 0.39 0.38 0.38 0.4 0.61 0.65 0.46 0.42 0.79 0.46 0.37 0.38 0.38 1.0 0.4 0.43 0.41 0.39 0.41 0.53 0.47 0.47
0.25 0.12 0.16 0.11 0.41 0.47 0.21 0.23 0.22 0.26 0.21 0.27 0.44 0.58 0.38 0.27 0.28 1.0 0.29 0.33 0.28 0.33 0.76 0.29 0.23 0.33 0.37 0.25 0.36 0.37 0.62
0.18 0.25 0.19 0.23 0.35 0.46 0.44 0.67 0.21 0.2 0.21 0.3 0.65 0.53 0.45 0.38 0.37 1.0 0.25 0.32 0.34 0.39 0.73 0.34 0.34 0.33 0.32 0.4 0.38 0.32 0.53
0.19 0.27 0.16 0.24 0.3 0.35 0.4 0.58 0.24 0.26 0.3 0.31 0.56 0.43 0.34 0.35 0.41 1.0 0.47 0.32 0.32 0.28 0.58 0.36 0.36 0.33 0.3 0.31 0.29 0.29 0.42
0.18 0.19 0.12 0.11 0.24 0.26 0.32 0.49 0.15 0.16 0.17 0.26 0.5 0.34 0.33 0.26 0.31 1.0 0.21 0.22 0.25 0.25 0.87 0.31 0.28 0.24 0.21 0.31 0.25 0.29 0.44
0.15 0.18 0.1 0.09 0.26 0.34 0.38 0.37 0.23 0.22 0.25 0.22 0.29 0.42 0.42 0.32 0.29 0.76 0.32 0.27 0.25 0.26 1.0 0.27 0.27 0.24 0.26 0.22 0.33 0.35 0.34
0.41 0.32 0.26 0.29 0.41 0.55 0.59 0.81 0.38 0.38 0.34 0.38 0.63 0.52 0.54 0.39 0.49 1.0 0.4 0.48 0.47 0.47 0.83 0.44 0.48 0.46 0.46 0.52 0.4 0.47 0.57
0.34 0.33 0.25 0.27 0.56 0.5 0.44 0.54 0.31 0.37 0.35 0.33 0.47 0.57 0.49 0.43 0.4 1.0 0.37 0.32 0.38 0.38 0.86 0.32 0.34 0.36 0.39 0.35 0.4 0.38 0.46
0.18 0.32 0.14 0.16 0.36 0.34 0.49 0.87 0.26 0.29 0.29 0.34 0.64 0.62 0.51 0.39 0.48 1.0 0.32 0.33 0.33 0.33 0.49 0.38 0.39 0.34 0.36 0.32 0.39 0.38 0.54
0.21 0.16 0.14 0.15 0.44 0.39 0.17 0.2 0.18 0.2 0.21 0.22 0.38 0.4 0.37 0.24 0.23 1.0 0.31 0.2 0.22 0.24 0.7 0.26 0.25 0.23 0.24 0.25 0.36 0.33 0.47
0.25 0.21 0.21 0.21 0.42 0.44 0.3 0.34 0.25 0.29 0.31 0.34 0.45 0.45 0.41 0.36 0.33 1.0 0.33 0.26 0.24 0.3 0.62 0.34 0.33 0.3 0.32 0.29 0.34 0.38 0.52
0.03 0.04 0.07 0.1 0.19 0.19 0.2 0.41 0.11 0.11 0.16 0.14 0.25 0.49 0.27 0.12 0.1 1.0 0.16 0.13 0.13 0.2 0.4 0.15 0.12 0.12 0.12 0.09 0.27 0.19 0.3
0.39 0.43 0.28 0.32 0.45 0.61 0.56 0.74 0.31 0.42 0.32 0.41 0.73 0.72 0.53 0.43 0.49 1.0 0.39 0.4 0.39 0.45 0.72 0.45 0.46 0.43 0.44 0.51 0.43 0.41 0.59
0.2 0.34 0.15 0.13 0.37 0.4 0.42 0.67 0.16 0.17 0.18 0.23 0.42 0.46 0.4 0.33 0.33 0.84 0.26 0.25 0.26 0.3 1.0 0.29 0.29 0.28 0.26 0.32 0.37 0.34 0.39
0.26 0.2 0.23 0.25 0.34 0.41 0.38 0.26 0.32 0.28 0.31 0.26 0.29 0.55 0.47 0.38 0.36 0.66 0.39 0.33 0.33 0.32 1.0 0.35 0.33 0.32 0.35 0.3 0.45 0.45 0.36
0.16 0.17 0.15 0.21 0.2 0.27 0.25 0.26 0.18 0.16 0.18 0.16 0.21 0.63 0.46 0.19 0.18 1.0 0.23 0.18 0.19 0.2 0.71 0.18 0.19 0.21 0.17 0.18 0.18 0.14 0.17
0.21 0.23 0.2 0.21 0.42 0.45 0.22 0.24 0.19 0.22 0.21 0.21 0.31 0.47 0.35 0.26 0.21 1.0 0.3 0.24 0.26 0.29 0.65 0.3 0.3 0.29 0.3 0.23 0.36 0.34 0.42
0.51 0.49 0.36 0.2 0.43 0.57 0.47 0.55 0.27 0.26 0.28 0.27 0.38 0.52 0.45 0.37 0.32 1.0 0.41 0.34 0.32 0.35 0.59 0.34 0.33 0.34 0.38 0.31 0.35 0.34 0.36
0.36 0.45 0.18 0.18 0.48 0.54 0.56 0.63 0.33 0.33 0.33 0.35 0.46 0.52 0.51 0.46 0.43 1.0 0.37 0.35 0.37 0.42 0.79 0.35 0.37 0.43 0.41 0.39 0.47 0.43 0.36
0.27 0.32 0.19 0.17 0.45 0.43 0.42 0.48 0.26 0.27 0.29 0.31 0.61 0.43 0.41 0.37 0.37 1.0 0.28 0.28 0.27 0.31 0.58 0.33 0.34 0.29 0.31 0.32 0.35 0.35 0.44
0.02 0.07 0.02 0.06 0.12 0.22 0.07 0.08 0.05 0.06 0.11 0.05 0.12 0.44 0.22 0.12 0.05 1.0 0.08 0.06 0.09 0.12 0.64 0.05 0.07 0.1 0.1 0.07 0.27 0.09 0.14
0.37 0.45 0.29 0.4 0.43 0.45 0.59 0.74 0.44 0.51 0.45 0.44 0.53 0.56 0.54 0.46 0.48 1.0 0.44 0.47 0.47 0.43 1.0 0.44 0.48 0.44 0.47 0.42 0.45 0.45 0.41
0.27 0.3 0.24 0.24 0.44 0.47 0.36 0.47 0.29 0.3 0.32 0.36 0.51 0.45 0.46 0.4 0.4 1.0 0.37 0.36 0.34 0.36 0.78 0.37 0.38 0.39 0.4 0.37 0.37 0.38 0.52
0.5 0.58 0.39 0.37 0.58 0.59 0.51 0.63 0.41 0.43 0.43 0.42 0.67 0.68 0.65 0.55 0.51 1.0 0.51 0.45 0.46 0.43 0.86 0.43 0.45 0.48 0.5 0.43 0.48 0.51 0.62
0.33 0.33 0.31 0.38 0.54 0.44 0.4 0.61 0.28 0.33 0.34 0.36 0.4 0.59 0.53 0.33 0.3 0.79 0.29 0.28 0.27 0.29 1.0 0.33 0.3 0.31 0.31 0.31 0.38 0.39 0.47
0.17 0.23 0.19 0.2 0.34 0.37 0.45 0.38 0.31 0.34 0.31 0.29 0.39 0.57 0.6 0.42 0.44 0.89 0.34 0.33 0.34 0.31 1.0 0.29 0.32 0.33 0.35 0.27 0.5 0.49 0.5
0.4 0.4 0.34 0.29 0.35 0.3 0.44 0.61 0.31 0.3 0.3 0.34 0.34 0.48 0.42 0.28 0.28 0.8 0.35 0.28 0.27 0.27 1.0 0.32 0.3 0.28 0.28 0.32 0.34 0.34 0.36
0.26 0.23 0.21 0.32 0.48 0.49 0.41 0.55 0.2 0.25 0.18 0.24 0.42 0.66 0.45 0.37 0.3 0.8 0.3 0.33 0.26 0.3 1.0 0.33 0.35 0.27 0.28 0.28 0.31 0.36 0.42
0.12 0.13 0.06 0.08 0.14 0.22 0.29 0.37 0.19 0.18 0.17 0.17 0.2 0.11 0.11 0.16 0.17 0.55 0.2 0.18 0.2 0.2 1.0 0.24 0.22 0.2 0.21 0.18 0.25 0.25 0.23
0.26 0.36 0.24 0.25 0.55 0.52 0.49 0.55 0.31 0.3 0.31 0.33 0.46 0.76 0.76 0.54 0.52 1.0 0.45 0.38 0.38 0.37 0.69 0.31 0.36 0.45 0.36 0.31 0.39 0.38 0.54
0.24 0.24 0.15 0.18 0.33 0.38 0.44 0.62 0.22 0.22 0.25 0.23 0.44 0.47 0.47 0.32 0.36 1.0 0.35 0.3 0.27 0.33 0.6 0.28 0.31 0.32 0.32 0.29 0.35 0.33 0.35
0.23 0.19 0.19 0.18 0.33 0.43 0.19 0.23 0.16 0.17 0.15 0.19 0.27 0.45 0.38 0.21 0.18 1.0 0.32 0.21 0.21 0.25 0.67 0.23 0.22 0.21 0.24 0.23 0.32 0.32 0.38
0.1 0.1 0.07 0.08 0.17 0.17 0.24 0.31 0.14 0.17 0.14 0.21 0.41 0.3 0.28 0.24 0.26 1.0 0.18 0.22 0.18 0.21 0.8 0.25 0.23 0.21 0.18 0.17 0.18 0.18 0.31
0.21 0.48 0.19 0.1 0.31 0.3 0.38 0.54 0.2 0.21 0.24 0.31 0.48 0.36 0.3 0.31 0.36 1.0 0.31 0.27 0.33 0.35 0.66 0.3 0.33 0.36 0.29 0.3 0.28 0.3 0.35
0.47 0.47 0.45 0.33 0.47 0.47 0.5 0.54 0.31 0.33 0.37 0.36 0.51 0.63 0.53 0.47 0.41 0.96 0.34 0.36 0.36 0.4 1.0 0.34 0.4 0.41 0.41 0.43 0.45 0.46 0.53
0.33 0.34 0.29 0.23 0.45 0.44 0.47 0.59 0.29 0.27 0.31 0.32 0.42 0.61 0.66 0.47 0.45 1.0 0.36 0.36 0.39 0.39 0.73 0.31 0.34 0.37 0.34 0.36 0.39 0.37 0.46
0.23 0.28 0.22 0.19 0.35 0.36 0.35 0.38 0.25 0.25 0.27 0.29 0.41 0.51 0.47 0.33 0.3 0.79 0.36 0.3 0.27 0.28 1.0 0.26 0.29 0.27 0.27 0.26 0.3 0.34 0.45
0.12 0.15 0.08 0.07 0.27 0.27 0.36 0.49 0.2 0.18 0.22 0.18 0.14 0.54 0.48 0.25 0.22 1.0 0.25 0.19 0.2 0.2 0.52 0.16 0.17 0.19 0.18 0.11 0.29 0.31 0.45
0.28 0.34 0.28 0.28 0.46 0.38 0.36 0.32 0.26 0.26 0.27 0.26 0.5 0.52 0.46 0.38 0.35 1.0 0.35 0.28 0.31 0.33 0.87 0.28 0.3 0.35 0.28 0.28 0.32 0.32 0.47
0.22 0.2 0.14 0.14 0.29 0.35 0.35 0.46 0.21 0.21 0.23 0.26 0.39 0.51 0.39 0.31 0.3 1.0 0.29 0.26 0.23 0.3 0.76 0.27 0.29 0.27 0.25 0.29 0.28 0.28 0.34
0.15 0.18 0.2 0.17 0.46 0.47 0.22 0.24 0.26 0.27 0.28 0.29 0.28 0.46 0.42 0.29 0.28 1.0 0.34 0.23 0.3 0.28 0.83 0.27 0.25 0.28 0.34 0.25 0.34 0.42 0.56
0.21 0.16 0.13 0.14 0.36 0.41 0.46 0.51 0.24 0.21 0.27 0.23 0.43 0.64 0.54 0.32 0.35 0.96 0.4 0.37 0.36 0.4 1.0 0.37 0.34 0.34 0.37 0.31 0.37 0.36 0.4
0.37 0.34 0.37 0.42 0.63 0.55 0.47 0.62 0.36 0.39 0.45 0.39 0.39 0.77 0.69 0.43 0.39 1.0 0.46 0.37 0.38 0.43 0.93 0.35 0.37 0.42 0.41 0.38 0.59 0.56 0.59
0.4 0.35 0.26 0.28 0.48 0.4 0.38 0.48 0.3 0.27 0.32 0.36 0.56 0.52 0.47 0.38 0.36 1.0 0.37 0.34 0.36 0.4 0.99 0.4 0.39 0.39 0.35 0.47 0.45 0.42 0.52

Details

Expression values normalized per gene (using the maximum value, Green cells indicate low expression and red high. (Dark gray cells indicate missing values)