Heatmap: Cluster_218 (Lactuca sativa (Lsa) Coexpression Clusters (HCCA Algorithm))

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(Values are log₂ transformed ratios of a genes expression in a sample divided by the mean expression level)

Gene	Light: 268 uE m-2 s-1	Light: 202.5 uE m-2 s-1 (Control)	Light: 135 uE m-2 s-1	Light: 67.5 uE m-2 s-1	Photoperiod: L24	Photoperiod: L20D4 (Control)	Photoperiod: L12D12	Photoperiod: L8D16	RBW: 4:1:1 (Control)	RBW: 4:1:0	RBW: 3:1:1	RBW: 3:1:0	Nitrogen: 0%	Nitrogen: 25%	Nitrogen: 50%	Nitrogen: 100% (Control)	Nitrogen: 150%	Phosphorous: 0%	Phosphorous: 25%	Phosphorous: 50%	Phosphorous: 100% (Control)	Phosphorous: 150%	Potassium: 0%	Potassium: 25%	Potassium: 50%	Potassium: 100% (Control)	Potassium: 150%	Temperature: 20°C	Temperature: 25°C (Control)	Temperature: 30°C	Temperature: 35°C
Lsat_1_v5_gn_0_42180.1 (CSLC12)	-0.93	-1.03	-1.58	-0.94	-0.21	0.34	0.18	0.23	-0.07	-0.08	0.07	-0.25	0.05	0.81	0.54	0.2	0.11	-0.65	0.04	-0.05	-0.13	-0.02	-0.32	0.02	-0.0	0.0	0.26	-0.39	0.32	0.46	0.58
Lsat_1_v5_gn_0_44640.1 (IMB1)	-0.33	-0.17	-0.57	-0.34	0.23	0.21	0.18	0.42	-0.34	-0.22	-0.12	0.06	0.45	0.53	0.29	0.23	0.18	-0.56	-0.3	-0.29	-0.26	-0.13	0.06	-0.22	-0.18	-0.03	-0.21	0.08	0.06	0.1	0.3
Lsat_1_v5_gn_0_47681.1 (PLIP1)	-1.45	-1.01	-1.28	-0.8	-0.27	0.38	0.52	0.54	-0.02	-0.13	-0.19	-0.43	-0.46	0.6	0.41	0.09	0.14	-0.81	0.24	0.04	0.1	0.25	0.2	-0.02	0.1	0.26	0.29	-0.2	0.18	0.12	0.16
Lsat_1_v5_gn_1_100400.1 (PERK9)	-0.22	-0.61	-0.98	-0.68	-0.08	0.36	-0.11	0.25	-0.2	-0.21	-0.01	-0.06	-0.11	0.68	0.46	0.16	0.05	-0.7	0.03	-0.04	-0.03	0.12	-0.19	0.16	0.08	0.07	0.07	-0.21	0.16	0.21	0.4
Lsat_1_v5_gn_1_10781.1 (HB6)	-1.48	-1.37	-1.6	-1.33	0.5	1.14	0.52	0.35	-0.38	-0.41	-0.18	-0.61	-0.62	1.18	1.07	0.44	-0.21	-0.49	0.01	-0.48	-0.19	-0.18	-0.14	-0.39	-0.18	-0.04	0.04	-0.38	0.43	0.28	-0.29
Lsat_1_v5_gn_1_14680.1	-1.06	-0.42	-0.94	-0.29	0.33	0.17	0.01	0.6	-0.31	-0.23	-0.16	-0.1	-0.15	0.7	0.72	-0.07	-0.22	-0.42	0.08	-0.14	-0.22	-0.13	0.52	-0.23	-0.25	-0.08	-0.0	-0.4	0.19	0.2	0.54
Lsat_1_v5_gn_1_15581.1	-0.6	-0.89	-1.3	-1.37	-0.46	0.25	0.38	0.85	-1.06	-0.84	-0.99	-0.49	0.61	1.1	0.89	0.29	0.21	-0.41	-0.15	-0.27	-0.06	0.18	-0.53	0.09	0.03	0.04	-0.16	0.21	0.37	-0.2	0.3
Lsat_1_v5_gn_1_21441.1 (SBT1.9)	-0.73	-0.69	-1.34	-1.35	0.13	0.97	0.56	0.57	-0.27	-0.51	-0.24	-0.54	-0.23	1.11	0.91	0.37	-0.03	-1.27	0.48	-0.15	-0.02	0.04	-0.72	-0.14	-0.15	-0.17	-0.07	-0.26	0.06	-0.02	-0.16
Lsat_1_v5_gn_1_32961.1 (FP3)	-1.53	-1.06	-1.97	-1.83	-0.18	0.51	0.23	0.05	-0.32	-0.58	-0.35	-0.53	0.03	1.06	0.97	0.47	0.19	-0.94	0.07	-0.1	-0.13	0.11	-0.75	0.02	0.1	0.36	0.28	-0.46	0.39	0.49	0.56
Lsat_1_v5_gn_1_36441.1	-0.12	-0.32	-0.65	-0.49	0.36	0.49	0.21	0.41	-0.41	-0.35	-0.31	-0.24	0.24	0.64	0.36	0.05	-0.04	-0.37	-0.03	-0.14	-0.07	0.06	-0.11	-0.08	-0.09	-0.1	-0.09	-0.03	0.06	-0.01	0.23
Lsat_1_v5_gn_1_56180.1	-0.57	-0.54	-0.43	-0.33	0.2	0.44	0.34	0.53	-0.31	-0.36	-0.26	-0.36	0.4	0.54	0.23	0.11	0.15	-0.21	-0.37	-0.12	0.03	-0.02	-0.69	0.12	0.04	0.07	0.08	0.15	0.03	-0.19	0.18
Lsat_1_v5_gn_1_76380.1	-0.22	-0.35	-0.78	-1.01	-0.06	0.62	0.2	0.11	-0.43	-0.6	-0.39	-0.68	-0.34	0.52	0.54	0.21	-0.1	-0.19	0.35	-0.26	0.08	0.18	0.44	-0.03	0.02	-0.1	0.05	-0.26	0.29	0.18	0.39
Lsat_1_v5_gn_1_96721.1 (UREG)	-0.51	-0.47	-1.29	-1.25	0.41	0.63	-0.22	0.09	-0.25	-0.27	-0.01	-0.19	0.18	0.86	0.59	0.13	-0.12	-0.55	0.07	-0.28	-0.12	0.08	-0.63	-0.04	0.04	0.01	0.09	-0.11	0.24	0.25	0.47
Lsat_1_v5_gn_2_108280.1	-0.91	-0.89	-1.31	-1.36	-0.14	0.23	0.24	0.64	-0.17	-0.3	-0.05	-0.21	0.08	1.04	0.78	0.18	0.02	-1.19	0.17	-0.19	-0.31	-0.29	-0.01	0.13	-0.17	-0.26	-0.23	-0.59	0.38	0.52	0.75
Lsat_1_v5_gn_2_10961.1 (PHT4;3)	-0.25	-0.18	-0.46	-0.63	0.12	0.23	0.14	0.3	-0.16	-0.21	-0.3	-0.25	-0.15	0.53	0.32	0.04	0.0	-0.48	0.09	0.01	0.04	0.1	0.2	-0.04	0.02	0.07	0.03	-0.08	0.19	0.09	0.07
Lsat_1_v5_gn_2_131460.1 (emb1417)	-0.21	-0.46	-0.53	-0.66	0.14	0.28	-0.21	0.27	-0.4	-0.2	-0.1	-0.38	0.03	0.84	0.53	-0.09	-0.29	-0.57	0.44	-0.19	-0.17	-0.03	0.52	-0.02	-0.18	-0.01	-0.04	-0.25	0.16	0.11	0.34
Lsat_1_v5_gn_2_133601.1 (SCO4)	-1.82	-1.56	-1.41	-1.87	-0.29	0.35	0.19	0.74	-0.38	-0.48	-0.13	-0.04	-0.27	0.73	0.63	0.48	0.09	-0.63	0.17	-0.05	0.15	0.22	0.51	0.08	0.09	0.02	0.13	-0.25	0.06	0.06	0.44
Lsat_1_v5_gn_2_32541.1	-0.95	-1.0	-1.2	-0.8	0.13	0.44	0.34	0.52	-0.02	-0.08	0.01	-0.28	0.01	0.3	0.51	0.41	0.22	-0.77	-0.09	-0.11	-0.07	0.1	0.07	-0.22	-0.07	0.1	0.1	-0.11	0.32	0.28	0.05
Lsat_1_v5_gn_2_3341.1	-1.02	-0.65	-1.18	-1.37	-0.07	0.45	-0.02	-0.05	-0.01	-0.05	0.21	-0.12	0.0	0.9	0.53	0.41	0.08	-1.05	0.03	-0.3	0.01	0.21	-0.12	-0.22	-0.15	0.1	0.03	-0.16	0.13	0.33	0.63
Lsat_1_v5_gn_2_4080.1 (AAE1)	-0.86	-0.5	-1.09	-1.12	0.14	0.72	0.31	0.49	-0.4	-0.39	-0.2	-0.24	0.12	0.76	0.33	0.2	-0.14	-1.07	0.16	-0.36	-0.07	0.02	0.15	0.11	0.09	0.0	-0.12	-0.46	0.25	0.23	0.56
Lsat_1_v5_gn_2_54221.1 (PP2A-3)	-0.31	-0.19	-0.91	-1.02	0.04	0.29	0.15	0.29	-0.27	-0.21	-0.11	-0.17	0.42	0.5	0.4	0.16	0.16	-0.15	-0.01	-0.15	-0.11	0.04	0.06	-0.23	-0.04	-0.0	0.09	-0.03	0.09	0.06	0.19
Lsat_1_v5_gn_2_71401.1	-0.67	-0.61	-1.26	-1.14	0.1	0.66	0.3	0.51	-0.29	-0.28	-0.16	-0.27	-0.16	0.77	0.57	0.17	0.09	-1.28	0.27	-0.1	0.13	0.24	-0.72	0.08	0.09	0.09	0.07	-0.02	0.15	0.09	0.11
Lsat_1_v5_gn_2_87320.1 (DAR1)	-1.42	-1.23	-1.76	-1.81	0.29	1.07	-0.08	0.02	-0.38	-0.45	-0.33	-0.59	-0.05	1.21	0.82	0.24	-0.15	-0.65	0.2	-0.36	-0.18	0.01	0.08	-0.02	-0.04	-0.03	0.08	-0.32	0.37	0.33	0.49
Lsat_1_v5_gn_2_89461.1	-1.7	-0.59	-1.96	-0.87	0.29	0.5	0.16	0.49	-0.42	-0.17	-0.34	-0.41	0.09	0.93	0.6	-0.07	0.05	-0.37	0.33	-0.3	-0.37	-0.17	-0.07	-0.0	-0.25	0.02	-0.06	-0.63	0.4	0.36	0.91
Lsat_1_v5_gn_2_91661.1 (SK13)	-0.22	-0.21	-0.21	-0.18	0.13	0.18	-0.1	-0.1	-0.13	-0.13	-0.01	-0.14	0.24	0.44	0.39	0.11	0.01	-0.07	-0.04	-0.14	-0.08	-0.12	0.27	-0.07	-0.14	-0.07	-0.07	-0.03	0.09	-0.02	0.1
Lsat_1_v5_gn_3_102200.1 (NPF5.1)	-0.43	-0.4	-0.99	-0.73	0.21	0.58	0.16	0.47	-0.43	-0.55	-0.18	-0.48	-0.53	0.99	0.7	-0.03	-0.18	-0.72	0.43	-0.12	-0.06	0.02	0.45	0.1	-0.19	-0.15	0.0	-0.23	0.09	-0.04	0.11
Lsat_1_v5_gn_3_103240.1 (NRF1)	-0.83	-0.97	-0.81	-0.78	-0.12	0.25	0.11	0.49	-0.37	-0.57	-0.21	-0.06	0.35	0.76	0.52	0.08	-0.1	-0.61	0.29	0.02	0.01	0.03	0.37	-0.08	0.05	0.16	-0.07	-0.09	0.16	-0.1	0.34
Lsat_1_v5_gn_3_10761.1	-1.0	-0.85	-0.99	-0.71	0.21	0.44	0.01	-0.0	-0.38	-0.25	-0.24	-0.3	0.56	0.78	0.73	-0.0	0.01	-0.17	-0.1	-0.32	-0.08	0.01	0.41	0.04	0.0	-0.08	-0.06	0.05	0.1	-0.05	0.35
Lsat_1_v5_gn_3_129821.1 (DES1)	-0.93	-1.01	-1.21	-0.68	-0.14	0.71	0.04	0.53	-0.45	-0.34	-0.15	-0.29	-0.13	0.78	0.55	0.2	-0.08	-0.92	0.23	-0.37	-0.02	-0.36	0.26	0.27	0.03	0.04	-0.06	-0.36	0.23	0.39	0.64
Lsat_1_v5_gn_3_133301.1	-0.73	-0.27	-0.58	-0.43	-0.02	0.18	-0.01	0.19	-0.35	-0.1	-0.02	-0.07	0.31	0.64	0.53	0.07	-0.12	-0.65	0.09	-0.21	-0.2	-0.03	0.26	-0.18	-0.1	0.02	-0.08	-0.19	0.2	0.17	0.58
Lsat_1_v5_gn_3_13821.1	-0.62	-0.8	-1.0	-0.34	0.12	0.24	0.21	0.47	-0.22	-0.25	0.02	-0.09	0.1	0.57	0.47	-0.05	-0.11	-0.54	-0.01	-0.19	-0.08	0.12	0.25	0.19	-0.04	-0.12	-0.01	-0.03	0.15	0.13	0.27
Lsat_1_v5_gn_3_15201.1	-0.65	-0.5	-1.81	-2.21	0.23	0.91	0.31	0.12	-0.42	-0.56	-0.3	-0.48	0.26	1.34	0.72	0.3	0.04	-1.08	0.06	-0.3	-0.07	0.09	-0.22	0.04	0.09	0.02	0.12	0.07	-0.1	-0.09	-0.21
Lsat_1_v5_gn_3_20980.1 (AtDEK36)	-1.19	-0.93	-0.9	-0.92	0.33	0.42	0.13	0.3	-0.23	-0.01	0.03	-0.17	0.14	0.71	0.43	-0.02	-0.03	-0.61	-0.01	-0.12	-0.11	0.05	-0.01	0.06	-0.23	0.14	0.31	-0.21	-0.01	0.11	0.65
Lsat_1_v5_gn_3_2841.1 (CYP93D1)	-0.92	-0.8	-2.16	-2.55	0.0	0.9	0.42	0.57	-0.48	-0.66	-0.54	-0.76	-0.44	0.88	0.76	0.28	-0.05	-0.3	0.73	-0.28	-0.11	0.06	0.81	-0.05	-0.26	-0.29	-0.13	-0.39	0.13	0.09	0.32
Lsat_1_v5_gn_3_36161.1 (PP5)	-0.32	-0.4	-0.64	-0.42	0.11	0.29	0.13	0.29	-0.31	-0.29	-0.2	-0.25	0.29	0.55	0.43	0.09	-0.01	-0.51	-0.12	-0.13	-0.03	-0.05	0.45	-0.09	-0.04	0.05	-0.08	0.11	0.14	-0.02	0.13
Lsat_1_v5_gn_3_43101.1	-0.48	-0.62	-0.93	-0.76	0.31	0.35	0.03	0.17	-0.38	-0.18	-0.22	-0.09	0.29	0.62	0.28	-0.02	0.02	-0.03	0.14	-0.15	-0.06	0.02	0.22	0.0	0.03	-0.01	-0.01	0.05	0.07	-0.04	0.3
Lsat_1_v5_gn_3_541.1 (ALY2)	-0.63	-0.5	-0.56	-0.27	0.21	0.23	0.07	0.32	-0.18	-0.16	0.05	-0.14	0.07	0.64	0.4	0.13	-0.21	-0.04	-0.22	-0.18	-0.08	-0.2	0.24	-0.17	-0.13	-0.09	-0.05	-0.32	0.14	0.21	0.52
Lsat_1_v5_gn_3_57300.1 (DCP5)	-0.73	-0.62	-0.94	-0.7	0.15	0.27	0.26	0.39	-0.33	-0.35	-0.21	-0.18	0.28	0.44	0.4	0.26	0.06	-0.4	0.17	-0.01	0.01	0.11	-0.06	-0.06	0.06	0.03	-0.0	-0.07	0.17	0.11	0.31
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Details

Dark gray cells indicate values where the raw expression is zero (cannot be log-transformed). Blue cells indicate samples where the expression of the gene is below average and red cells indicate the gene is expressed above average in the sample. White cells are average.