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Heatmap: Cluster_127 (Lactuca sativa (Lsa) Coexpression Clusters (HCCA Algorithm))

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(Values are log2 transformed ratios of a genes expression in a sample divided by the mean expression level)

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Gene
Light: 268 uE m-2 s-1
Light: 202.5 uE m-2 s-1 (Control)
Light: 135 uE m-2 s-1
Light: 67.5 uE m-2 s-1
Photoperiod: L24
Photoperiod: L20D4 (Control)
Photoperiod: L12D12
Photoperiod: L8D16
RBW: 4:1:1 (Control)
RBW: 4:1:0
RBW: 3:1:1
RBW: 3:1:0
Nitrogen: 0%
Nitrogen: 25%
Nitrogen: 50%
Nitrogen: 100% (Control)
Nitrogen: 150%
Phosphorous: 0%
Phosphorous: 25%
Phosphorous: 50%
Phosphorous: 100% (Control)
Phosphorous: 150%
Potassium: 0%
Potassium: 25%
Potassium: 50%
Potassium: 100% (Control)
Potassium: 150%
Temperature: 20°C
Temperature: 25°C (Control)
Temperature: 30°C
Temperature: 35°C
0.23 0.58 0.47 -0.01 0.2 0.23 -0.22 -0.16 -0.53 -0.5 -0.33 -0.43 0.09 0.76 0.56 0.25 0.07 -0.29 -0.15 -0.24 -0.39 -0.42 0.01 -0.37 -0.23 -0.19 -0.13 -0.49 0.28 0.1 -0.05
0.52 1.63 0.21 0.33 0.55 -0.11 -0.35 -0.52 -0.45 -0.2 -0.05 -0.25 -0.17 0.24 0.38 -0.03 -0.37 -1.12 -0.43 -0.35 -0.1 -0.76 -1.12 -0.77 -0.64 -0.09 -0.15 -0.62 0.31 0.44 0.46
0.34 -0.02 1.29 0.85 -0.2 -0.17 -1.11 -1.57 -0.56 -0.6 -0.54 -0.44 0.57 0.7 0.08 -0.02 -0.11 0.92 -0.56 -0.61 -0.57 -0.48 0.96 -0.66 -0.55 -0.54 -0.37 -0.34 0.03 -0.15 0.1
0.86 0.78 0.24 -0.22 0.12 -0.01 -0.27 -0.16 -0.31 -0.35 -0.23 -0.41 -0.07 0.77 0.49 -0.02 -0.1 -0.29 -0.33 -0.52 -0.53 -0.49 1.24 -0.49 -0.48 -0.45 -0.39 -0.59 -0.31 -0.19 0.15
0.73 0.8 1.05 0.72 -0.57 0.15 -0.83 -1.41 -0.75 -0.88 -0.62 -0.78 -0.03 1.16 0.71 -0.01 -0.13 -0.25 0.58 -0.52 -0.75 -0.57 0.29 -1.15 -0.95 -0.41 -0.33 -0.54 0.19 -0.04 0.25
0.41 0.2 0.41 -0.17 0.38 0.17 -0.24 -0.36 -0.58 -0.59 -0.36 -0.6 -0.04 1.05 0.65 0.06 -0.08 0.16 -0.17 -0.45 -0.36 -0.39 1.12 -0.45 -0.48 -0.34 -0.22 -0.21 -0.16 -0.36 -0.35
1.18 0.43 1.29 0.38 0.07 -0.05 -1.4 -2.12 -1.3 -0.83 -0.36 -0.18 0.06 0.5 0.62 0.02 -0.08 -0.72 -0.1 -0.68 -0.65 -0.07 -0.13 -0.49 0.07 -0.57 -0.3 -0.61 -0.16 0.27 0.81
0.84 1.0 1.2 0.55 -0.02 -0.18 -0.39 -0.61 -1.39 -1.2 -1.06 -1.04 -0.57 1.15 0.82 0.24 0.22 0.62 0.13 -0.28 -0.48 -0.05 -1.09 -0.9 -0.33 0.06 0.15 -0.03 -0.94 -1.33 -1.39
0.48 0.49 0.26 0.03 0.07 0.45 -0.27 -0.95 0.02 -0.63 -0.42 -0.6 -0.16 1.13 0.82 -0.2 -0.29 -0.07 -0.19 -0.39 -0.71 -0.47 0.97 -0.38 -0.35 -0.37 -0.39 -0.3 -0.17 0.01 -0.09
0.49 0.27 0.27 0.23 0.31 0.38 -0.22 -0.4 -0.24 -0.24 -0.12 -0.41 -0.15 0.41 0.33 0.02 -0.24 -0.22 -0.2 -0.44 -0.33 -0.26 0.85 -0.37 -0.26 -0.16 -0.13 -0.36 0.12 0.0 -0.07
-0.16 -0.24 0.28 0.27 0.13 0.29 0.14 0.07 -0.08 -0.08 0.03 0.01 0.05 0.29 0.22 0.07 -0.15 -0.19 -0.18 -0.17 -0.13 -0.12 0.02 -0.31 -0.1 -0.11 -0.09 -0.24 -0.04 0.09 0.12
0.76 0.68 0.91 0.15 0.14 0.0 -0.5 -0.64 -0.42 -0.36 -0.25 -0.13 0.05 0.05 -0.13 -0.12 -0.14 0.39 -0.11 -0.45 -0.38 -0.22 -0.52 -0.35 -0.24 -0.22 -0.11 -0.42 0.11 0.22 0.56
-0.15 0.14 1.05 0.74 0.11 0.24 -0.01 -0.19 -0.68 -0.53 -0.46 -0.3 -0.22 1.68 0.74 -0.15 -0.29 -0.12 0.2 -0.32 -0.49 -0.33 -1.34 -0.85 -0.89 -0.54 -0.46 0.05 -0.03 -0.34 -0.41
0.86 0.59 0.43 -0.38 0.66 0.54 -1.03 -0.37 -0.49 -0.43 -0.28 -0.49 -0.02 0.84 0.31 -0.6 -0.72 0.01 0.01 -0.34 -0.29 -0.4 -0.22 -0.52 -0.68 -0.57 -0.35 -0.43 0.41 0.3 0.75
0.66 0.66 0.93 0.22 0.17 -0.1 -0.41 -0.51 -0.28 -0.45 -0.31 -0.39 -0.44 0.9 0.78 -0.02 -0.3 -0.9 -0.13 -0.5 -0.39 -0.26 -0.06 -0.54 -0.46 -0.43 -0.42 -0.58 0.16 0.28 0.47
0.11 0.03 1.37 1.05 0.21 0.22 -1.08 -1.63 -0.95 -0.76 -0.91 -0.56 -0.65 1.8 1.51 0.42 0.48 -1.21 0.11 -0.38 -0.51 -0.4 -1.8 -1.01 -0.77 -0.35 -0.22 0.03 -1.29 -1.48 -0.76
0.8 0.28 1.11 0.5 0.18 -0.1 -0.52 -0.64 -0.25 -0.27 -0.06 -0.08 0.11 0.31 0.19 0.1 0.03 -0.78 -0.26 -0.37 -0.29 -0.26 -0.49 -0.39 -0.32 -0.16 -0.21 -0.31 -0.02 0.07 0.29
0.23 0.26 0.53 0.15 0.24 0.19 -0.17 -0.27 -0.36 -0.16 -0.1 -0.24 -0.13 0.33 0.33 -0.15 -0.28 0.37 -0.14 -0.41 -0.45 -0.31 0.51 -0.45 -0.4 -0.24 -0.14 -0.67 0.12 0.17 0.51
0.56 -0.05 0.68 0.47 -0.0 -0.08 -0.29 -0.42 -0.18 -0.2 -0.1 -0.3 -0.1 0.33 0.43 0.08 -0.15 0.28 -0.1 -0.3 -0.28 -0.14 0.55 -0.45 -0.35 -0.29 -0.06 -0.35 -0.08 -0.09 -0.08
1.03 0.39 0.81 -0.16 0.91 0.2 -0.84 -0.7 -0.01 -0.23 -0.23 -0.08 -0.74 0.76 0.17 -0.58 -0.62 -1.16 0.09 -0.37 -0.35 -0.61 -1.57 -0.83 -0.45 -0.86 -0.15 -0.31 0.62 0.54 0.86
0.32 0.26 0.26 -0.15 0.67 0.4 -0.29 -0.43 -0.26 -0.26 -0.19 -0.38 -0.13 0.83 0.65 -0.14 -0.28 -0.01 -0.2 -0.44 -0.42 -0.27 0.82 -0.53 -0.35 -0.25 -0.15 -0.12 -0.11 -0.33 -0.18
0.73 0.41 0.3 -0.98 0.15 0.01 -0.67 -0.84 -0.66 -0.55 -0.61 -0.43 -0.39 1.24 0.74 0.12 0.09 1.0 -0.12 -0.51 -0.68 -0.64 1.38 -0.67 -0.64 -0.48 -0.45 -0.55 -0.24 -0.28 -0.41
0.64 0.2 0.94 0.78 0.63 0.39 -0.37 -0.93 -0.25 0.08 0.1 -0.08 0.41 -0.81 -0.63 -0.12 -0.12 0.02 -1.02 -0.41 -0.38 -0.18 0.13 -0.65 -0.05 -0.26 -0.11 0.04 -0.38 -0.07 0.1
0.69 0.58 0.1 -0.45 0.45 0.39 -0.08 -0.13 -0.4 -0.49 -0.61 -0.79 0.28 1.04 0.56 -0.03 -0.3 0.22 -0.03 -0.81 -0.35 -0.53 1.22 -0.54 -0.46 -0.24 -0.39 -0.45 -0.37 -0.51 -0.85
0.68 0.29 0.6 -0.17 -0.15 0.11 -0.2 -0.25 -0.46 -0.36 -0.33 -0.49 -0.08 0.9 0.46 0.24 0.14 -0.47 -0.15 -0.23 -0.35 -0.3 -0.32 -0.34 -0.26 -0.02 -0.08 -0.19 -0.06 0.09 0.33
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0.32 0.18 0.27 0.09 0.29 0.12 -0.2 -0.22 -0.22 -0.28 -0.27 -0.23 0.32 0.17 0.02 -0.19 -0.14 0.21 -0.19 -0.08 -0.16 -0.03 0.13 -0.07 -0.03 -0.04 -0.06 0.07 -0.13 -0.17 0.15
0.28 0.38 0.39 0.28 0.5 0.27 -0.21 -0.55 -0.44 -0.45 -0.09 -0.22 0.11 0.78 0.28 0.08 -0.19 -0.8 -0.38 -0.65 -0.6 -0.33 -0.27 -0.61 -0.54 -0.24 -0.3 -0.5 0.29 0.43 1.03
0.52 0.53 1.02 0.84 0.27 -0.14 -0.96 -1.14 -0.25 -0.07 -0.04 -0.07 0.39 0.59 0.13 0.08 -0.01 -0.89 -0.38 -0.45 -0.4 -0.41 -0.14 -0.48 -0.35 -0.22 -0.17 -0.37 -0.03 0.1 0.01
0.05 0.34 0.27 0.27 0.59 0.17 -0.47 -0.8 -0.45 -0.26 -0.19 -0.28 0.33 0.5 0.08 -0.29 -0.21 0.16 -0.19 -0.17 -0.32 -0.15 0.3 -0.37 -0.11 -0.13 -0.1 -0.16 0.13 0.06 0.39
-0.03 0.26 0.38 0.32 0.45 0.32 -0.23 -0.18 -0.38 -0.21 -0.31 -0.24 0.07 0.11 0.13 0.02 -0.02 0.2 -0.13 -0.28 -0.24 -0.08 0.15 -0.28 -0.14 0.03 -0.06 -0.21 0.06 -0.03 0.04
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1.06 1.36 1.24 0.99 0.15 -0.41 -1.96 -3.14 -1.13 -0.99 -0.82 -0.19 -0.68 1.5 1.28 0.01 -0.32 -0.24 -0.91 -0.63 -0.85 -0.7 1.09 -1.3 -1.33 -0.5 -0.84 -0.92 -1.4 -0.91 -0.29
-0.01 0.1 0.49 0.22 -0.02 -0.03 -0.81 -0.9 -0.33 -0.29 -0.18 -0.16 -0.08 0.03 -0.06 0.08 0.13 0.83 -0.27 -0.16 -0.01 0.01 0.27 -0.27 -0.08 0.26 0.3 -0.61 -0.26 0.02 0.49
0.53 0.47 0.08 -0.87 -0.36 0.22 0.12 0.28 -0.57 -0.54 -0.55 -0.59 -0.23 1.2 0.71 0.34 0.24 1.06 -0.18 -0.33 -0.16 -0.13 -0.4 -0.52 -0.49 -0.17 -0.1 0.09 -0.68 -0.61 -1.04
1.08 0.64 1.09 0.41 -0.98 -0.57 -0.95 -1.35 -1.12 -0.9 -1.58 -1.05 1.56 -0.34 -0.43 0.36 0.17 1.65 -0.92 -1.06 -0.96 -0.57 1.41 -1.54 -0.52 0.16 -0.06 -0.35 -1.0 -1.36 -1.83
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1.15 1.89 1.45 0.27 -0.81 -2.01 -2.93 -3.23 -1.6 -2.13 -2.2 -0.96 0.56 1.72 -0.42 -0.35 0.08 1.71 -1.58 -2.72 -1.18 -0.68 -0.99 -1.88 -1.12 -1.05 -0.31 -1.35 -1.97 -1.14 1.57
0.99 0.39 1.27 0.24 -0.24 -0.05 -0.65 -0.1 -0.39 -1.6 -0.51 -0.47 0.06 1.12 0.28 -0.04 0.2 1.08 -1.06 -0.7 -0.53 -0.63 0.16 -1.13 -0.44 -0.22 0.24 -0.53 -0.45 -0.85 -0.35
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1.2 0.97 0.8 -0.25 -1.68 -0.74 0.07 -0.44 -0.22 -0.57 -0.34 0.08 1.07 0.07 -0.37 0.61 0.51 1.36 -0.83 -0.66 -0.47 -0.44 -2.76 -0.45 -0.43 -0.38 -0.32 0.1 -1.81 -0.67 -0.31
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0.46 0.22 0.09 -0.08 0.35 0.39 0.05 -0.16 -0.19 -0.29 -0.23 -0.44 -0.25 0.68 0.54 -0.21 -0.38 -0.1 -0.07 -0.57 -0.22 -0.17 0.74 -0.43 -0.31 -0.27 -0.16 -0.1 0.19 -0.02 -0.3
0.54 0.19 0.84 0.35 0.08 -0.06 -0.61 -0.5 -0.39 -0.32 -0.26 -0.05 0.16 0.12 0.19 0.05 0.13 0.26 -0.25 -0.39 -0.24 -0.63 0.13 -0.39 -0.35 -0.24 -0.15 -0.43 0.04 0.28 0.56
-0.21 0.03 0.55 1.11 -0.37 0.21 -1.53 0.48 -0.48 -0.69 -0.53 -0.1 -0.18 1.62 0.84 -1.26 -0.8 0.86 -0.39 -1.12 -0.28 -0.25 -0.66 -0.63 -0.85 -0.76 -0.9 -0.46 0.36 -1.73 1.1
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0.71 1.19 0.56 -0.37 -0.68 -0.86 -0.33 -1.09 0.05 -0.39 0.17 -0.2 1.37 -0.24 -0.01 0.32 0.12 0.42 -0.6 -0.43 -0.27 -0.65 1.29 -1.38 -0.87 -0.79 -0.45 -1.16 -0.26 -0.4 -0.14
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0.81 0.6 1.2 -0.29 -0.44 -0.42 -0.84 -1.4 -0.79 -0.6 -0.68 -0.26 0.44 0.88 -0.18 0.47 0.33 0.94 -0.8 -0.51 -0.44 -0.49 0.07 -0.36 -0.29 -0.07 -0.2 -0.29 -0.66 -0.39 0.55
0.36 0.2 0.28 -0.49 0.96 0.42 -0.57 -0.16 -1.23 -1.56 -1.03 -1.41 -0.37 1.45 1.05 -0.32 -0.6 0.8 -0.38 -1.15 -0.26 -0.71 1.81 -0.87 -0.92 -0.44 -0.63 -0.22 -0.52 -1.01 -0.5
0.27 0.36 0.81 0.77 0.31 0.34 -0.6 -0.96 -0.7 -0.74 -0.62 -0.41 -0.64 1.09 0.92 0.38 0.17 -0.38 0.04 -0.26 -0.0 -0.02 -1.35 -0.71 -0.38 0.06 0.04 -0.19 -0.83 -0.79 0.23
0.64 0.45 0.84 0.39 -0.21 -0.05 -0.31 0.17 -0.96 -0.83 -0.49 -0.45 0.26 1.5 0.43 0.22 0.12 -0.06 -0.16 -0.58 -0.43 -0.15 -0.63 -0.71 -0.45 -0.03 -0.23 -0.13 -0.62 -0.35 -0.45
0.31 0.65 0.49 0.13 0.31 0.19 -0.42 -0.57 -0.28 -0.35 -0.17 -0.31 -0.68 0.71 0.45 -0.02 -0.25 -0.26 -0.18 -0.66 -0.35 -0.28 0.64 -0.52 -0.48 -0.25 -0.21 -0.15 0.24 0.33 0.22
0.81 0.07 0.7 0.29 0.46 0.11 -0.52 -0.39 -0.28 -0.58 -0.24 -0.36 -0.37 0.77 0.44 -0.06 -0.25 -0.33 -0.12 -0.5 -0.64 -0.39 0.9 -0.55 -0.46 -0.26 -0.22 -0.42 0.16 -0.0 -0.01
0.15 0.26 0.06 -0.12 0.1 0.13 -0.15 -0.18 -0.16 -0.04 -0.07 0.0 0.5 -0.22 -0.13 0.11 -0.0 0.21 -0.08 -0.15 -0.1 -0.09 -0.31 -0.18 -0.06 0.02 0.05 0.01 -0.0 0.07 0.1
0.67 1.23 0.54 0.49 0.98 0.57 -1.62 -2.47 -1.7 -1.99 -1.73 -1.77 -1.42 1.49 1.41 -0.5 -0.9 0.88 -1.22 -1.42 -1.37 -1.35 2.4 -1.66 -1.52 -1.39 -1.12 -1.5 -0.92 -0.95 -1.4
1.49 0.93 0.28 -0.69 0.17 -0.21 -0.89 -0.46 -1.56 -2.13 -1.33 -2.1 -0.89 1.98 0.22 -1.43 -1.52 0.36 -0.29 -1.84 -1.9 -1.73 2.8 -1.41 -1.29 -1.7 -1.07 -1.54 -0.4 -0.93 -0.91
1.33 0.75 1.33 1.15 0.7 0.1 -5.89 - -0.87 -0.43 -0.67 -1.08 -2.08 1.09 1.24 0.4 -0.19 -0.08 -0.02 -0.72 -0.89 -0.63 1.62 -2.31 -1.44 -0.86 -0.59 -1.09 -0.91 -1.11 -7.19
1.15 1.36 0.62 -0.95 -0.8 -1.2 -1.14 -1.18 -1.69 -1.3 -1.28 -0.88 0.37 1.83 0.5 0.38 0.47 1.55 -0.44 -0.64 -0.65 -0.53 -1.8 -0.92 -0.6 -0.4 -0.43 -0.21 -0.66 -0.52 -0.27
0.7 0.42 0.88 0.62 -0.67 -0.47 -0.1 -0.61 -0.49 -0.27 -0.32 -0.06 0.95 -0.15 0.07 0.03 0.34 0.71 -0.1 -0.29 -0.35 -0.3 -0.54 -0.35 -0.18 -0.14 -0.31 0.17 -1.46 -1.17 0.35
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0.22 0.12 0.63 0.42 0.02 -0.19 -0.4 -0.6 -0.29 -0.22 -0.16 -0.35 0.04 0.53 0.38 0.08 -0.14 0.29 -0.02 -0.27 -0.29 -0.2 0.47 -0.45 -0.23 -0.14 -0.28 -0.51 0.07 0.04 0.33
0.69 0.06 0.58 0.28 0.22 -0.29 -0.9 -1.21 -0.15 -0.09 -0.02 -0.09 0.08 0.96 0.62 0.27 0.07 -0.65 -0.07 -0.37 -0.39 -0.23 -1.72 -0.22 -0.25 -0.17 -0.04 -0.41 0.06 0.16 0.48

Details

Dark gray cells indicate values where the raw expression is zero (cannot be log-transformed). Blue cells indicate samples where the expression of the gene is below average and red cells indicate the gene is expressed above average in the sample. White cells are average.