1. Home
  2. Tools
  3. Expression Heatmap
  4. Results

Heatmap: Cluster_241 (Lactuca sativa (Lsa) Coexpression Clusters (HCCA Algorithm))

View as: (view raw or zlog-transformed)

View using InCHLib : here ( Experimental feature, still under development)

(Values are normalized against highest expression of the row)

 Transpose table  Download table
Gene
Light: 268 uE m-2 s-1
Light: 202.5 uE m-2 s-1 (Control)
Light: 135 uE m-2 s-1
Light: 67.5 uE m-2 s-1
Photoperiod: L24
Photoperiod: L20D4 (Control)
Photoperiod: L12D12
Photoperiod: L8D16
RBW: 4:1:1 (Control)
RBW: 4:1:0
RBW: 3:1:1
RBW: 3:1:0
Nitrogen: 0%
Nitrogen: 25%
Nitrogen: 50%
Nitrogen: 100% (Control)
Nitrogen: 150%
Phosphorous: 0%
Phosphorous: 25%
Phosphorous: 50%
Phosphorous: 100% (Control)
Phosphorous: 150%
Potassium: 0%
Potassium: 25%
Potassium: 50%
Potassium: 100% (Control)
Potassium: 150%
Temperature: 20°C
Temperature: 25°C (Control)
Temperature: 30°C
Temperature: 35°C
0.35 0.38 0.34 0.36 1.0 0.68 0.32 0.4 0.41 0.41 0.49 0.46 0.25 0.95 0.69 0.38 0.3 0.18 0.63 0.34 0.34 0.35 0.08 0.38 0.33 0.33 0.37 0.33 0.59 0.56 0.55
0.16 0.15 0.12 0.14 0.92 0.76 0.17 0.27 0.32 0.33 0.34 0.3 0.06 1.0 0.8 0.47 0.29 0.01 0.46 0.36 0.29 0.36 0.01 0.32 0.28 0.3 0.38 0.28 0.51 0.52 0.38
0.14 0.14 0.07 0.06 0.29 0.41 0.22 0.21 0.19 0.16 0.21 0.16 0.08 1.0 0.67 0.25 0.2 0.0 0.43 0.25 0.31 0.3 0.02 0.22 0.24 0.25 0.3 0.16 0.24 0.18 0.13
0.18 0.17 0.14 0.11 0.36 0.49 0.35 0.18 0.29 0.28 0.27 0.24 0.17 1.0 0.85 0.36 0.34 0.02 0.44 0.33 0.31 0.31 0.04 0.29 0.27 0.27 0.28 0.24 0.35 0.33 0.33
0.16 0.24 0.2 0.21 0.49 0.51 0.39 0.32 0.42 0.42 0.47 0.36 0.25 1.0 0.87 0.4 0.38 0.25 0.57 0.44 0.44 0.46 0.08 0.36 0.34 0.43 0.46 0.37 0.43 0.43 0.45
0.34 0.34 0.29 0.29 0.53 0.6 0.38 0.36 0.33 0.33 0.35 0.28 0.29 1.0 0.77 0.49 0.4 0.53 0.56 0.34 0.4 0.45 0.34 0.36 0.39 0.43 0.44 0.36 0.48 0.42 0.36
0.08 0.1 0.16 0.19 0.43 0.42 0.22 0.14 0.21 0.17 0.27 0.23 0.06 1.0 0.96 0.36 0.18 0.08 0.31 0.16 0.24 0.21 0.03 0.15 0.18 0.15 0.2 0.19 0.31 0.21 0.28
0.19 0.15 0.17 0.12 0.39 0.5 0.38 0.29 0.39 0.35 0.49 0.39 0.21 1.0 0.78 0.42 0.38 0.12 0.49 0.42 0.38 0.38 0.08 0.28 0.33 0.33 0.33 0.33 0.48 0.51 0.53
0.34 0.25 0.36 0.35 0.43 0.56 0.5 0.32 0.39 0.32 0.37 0.27 0.26 1.0 0.86 0.43 0.45 0.09 0.42 0.39 0.36 0.37 0.11 0.29 0.28 0.43 0.41 0.42 0.41 0.43 0.48
0.04 0.1 0.05 0.08 0.59 0.72 0.32 0.14 0.35 0.39 0.3 0.22 0.09 1.0 1.0 0.43 0.29 0.06 0.65 0.44 0.39 0.41 0.0 0.28 0.29 0.42 0.44 0.3 0.6 0.34 0.18
0.37 0.29 0.34 0.34 0.47 0.53 0.55 0.46 0.62 0.52 0.57 0.46 0.4 1.0 0.96 0.62 0.63 0.03 0.63 0.51 0.54 0.52 0.09 0.5 0.49 0.4 0.44 0.47 0.57 0.64 0.57
0.18 0.21 0.23 0.28 0.56 0.66 0.39 0.38 0.38 0.38 0.4 0.36 0.33 1.0 0.97 0.54 0.41 0.18 0.61 0.42 0.4 0.42 0.13 0.39 0.36 0.36 0.4 0.35 0.45 0.4 0.38
0.09 0.06 0.12 0.03 0.4 0.41 0.15 0.19 0.24 0.19 0.22 0.12 0.11 1.0 0.76 0.35 0.15 0.06 0.3 0.24 0.12 0.13 0.04 0.18 0.17 0.25 0.27 0.13 0.22 0.23 0.38
0.38 0.34 0.31 0.27 0.78 0.75 0.49 0.47 0.52 0.5 0.58 0.47 0.39 0.97 1.0 0.56 0.41 0.25 0.49 0.41 0.4 0.43 0.45 0.42 0.41 0.46 0.48 0.39 0.58 0.56 0.58
0.21 0.24 0.2 0.14 0.57 0.6 0.3 0.37 0.24 0.27 0.33 0.27 0.34 1.0 0.55 0.34 0.23 0.17 0.38 0.23 0.22 0.27 0.18 0.29 0.26 0.25 0.25 0.26 0.41 0.38 0.42
0.09 0.19 0.12 0.08 0.55 0.6 0.31 0.29 0.29 0.32 0.34 0.33 0.14 1.0 0.95 0.6 0.35 0.16 0.51 0.31 0.32 0.4 0.11 0.41 0.27 0.35 0.33 0.18 0.61 0.63 0.69
0.15 0.23 0.15 0.15 0.7 0.67 0.3 0.32 0.38 0.36 0.39 0.35 0.27 1.0 0.86 0.51 0.39 0.16 0.41 0.35 0.37 0.36 0.07 0.41 0.36 0.35 0.39 0.29 0.57 0.52 0.55
0.27 0.3 0.24 0.39 0.99 0.89 0.4 0.28 0.5 0.46 0.51 0.36 0.25 1.0 0.92 0.52 0.37 0.4 0.59 0.37 0.47 0.5 0.12 0.36 0.46 0.57 0.55 0.31 0.6 0.56 0.71
0.28 0.29 0.28 0.34 0.58 0.66 0.51 0.47 0.45 0.51 0.53 0.47 0.4 1.0 0.84 0.57 0.51 0.29 0.5 0.49 0.46 0.45 0.44 0.43 0.47 0.45 0.46 0.45 0.66 0.58 0.61
0.11 0.16 0.14 0.24 0.62 0.66 0.35 0.29 0.38 0.34 0.4 0.29 0.2 1.0 0.82 0.44 0.38 0.38 0.47 0.38 0.37 0.37 0.25 0.3 0.32 0.37 0.38 0.37 0.44 0.39 0.26
0.43 0.45 0.47 0.46 0.73 0.76 0.66 0.81 0.58 0.6 0.7 0.56 0.53 1.0 0.85 0.59 0.51 0.36 0.59 0.53 0.53 0.56 0.31 0.55 0.55 0.56 0.61 0.52 0.65 0.71 0.69
0.27 0.32 0.3 0.4 0.79 0.79 0.5 0.41 0.54 0.49 0.54 0.45 0.34 1.0 0.99 0.6 0.51 0.21 0.57 0.47 0.49 0.49 0.22 0.5 0.47 0.56 0.55 0.44 0.6 0.52 0.66
0.3 0.35 0.3 0.34 0.6 0.62 0.46 0.49 0.56 0.56 0.55 0.48 0.4 1.0 0.85 0.46 0.47 0.3 0.57 0.45 0.42 0.45 0.43 0.41 0.44 0.43 0.45 0.42 0.54 0.51 0.63
0.51 0.51 0.46 0.46 0.7 0.73 0.57 0.6 0.53 0.53 0.55 0.52 0.58 1.0 0.91 0.68 0.62 0.34 0.65 0.54 0.56 0.57 0.38 0.51 0.55 0.63 0.6 0.54 0.65 0.62 0.62
0.32 0.39 0.28 0.34 0.79 0.72 0.5 0.56 0.54 0.57 0.5 0.43 0.31 1.0 0.79 0.47 0.39 0.21 0.47 0.38 0.37 0.45 0.12 0.39 0.37 0.44 0.47 0.36 0.61 0.59 0.5
0.5 0.3 0.26 0.2 0.55 0.6 0.49 0.33 0.58 0.49 0.59 0.47 0.28 1.0 0.95 0.58 0.52 0.14 0.74 0.57 0.57 0.54 0.1 0.41 0.42 0.41 0.44 0.61 0.66 0.57 0.48
0.23 0.19 0.14 0.13 0.57 0.7 0.36 0.33 0.37 0.29 0.33 0.3 0.36 1.0 0.83 0.52 0.41 0.09 0.48 0.37 0.37 0.4 0.04 0.41 0.35 0.36 0.41 0.32 0.45 0.44 0.4
0.07 0.14 0.06 0.04 0.5 0.28 0.24 0.3 0.26 0.26 0.32 0.24 0.15 1.0 0.71 0.26 0.25 0.06 0.39 0.21 0.12 0.15 0.01 0.19 0.13 0.16 0.16 0.11 0.35 0.33 0.39
0.15 0.13 0.24 0.33 0.45 0.31 0.19 0.13 0.31 0.34 0.33 0.32 0.29 0.92 1.0 0.44 0.36 0.13 0.31 0.33 0.24 0.21 0.1 0.31 0.23 0.24 0.27 0.21 0.28 0.36 0.34
0.44 0.33 0.39 0.33 0.61 0.7 0.53 0.48 0.39 0.42 0.4 0.39 0.38 1.0 0.86 0.6 0.54 0.19 0.49 0.43 0.47 0.4 0.2 0.44 0.34 0.42 0.42 0.34 0.48 0.49 0.56
0.34 0.37 0.31 0.31 0.52 0.63 0.43 0.49 0.36 0.36 0.42 0.39 0.39 1.0 0.71 0.46 0.38 0.24 0.48 0.38 0.38 0.42 0.32 0.38 0.4 0.42 0.41 0.38 0.48 0.44 0.48
0.26 0.24 0.24 0.32 0.56 0.68 0.49 0.32 0.48 0.55 0.48 0.51 0.37 1.0 0.8 0.57 0.55 0.32 0.67 0.5 0.51 0.51 0.27 0.5 0.47 0.41 0.44 0.56 0.63 0.62 0.54
0.09 0.15 0.19 0.26 0.71 0.77 0.26 0.2 0.4 0.29 0.38 0.29 0.16 1.0 0.71 0.4 0.3 0.2 0.55 0.36 0.37 0.38 0.05 0.42 0.41 0.43 0.42 0.29 0.47 0.33 0.41
0.27 0.26 0.3 0.34 0.67 0.58 0.32 0.34 0.33 0.37 0.39 0.38 0.28 1.0 0.7 0.39 0.32 0.24 0.43 0.32 0.32 0.33 0.22 0.31 0.32 0.32 0.36 0.32 0.45 0.44 0.37
0.29 0.4 0.27 0.35 0.79 0.75 0.43 0.43 0.44 0.49 0.44 0.47 0.5 1.0 0.72 0.35 0.37 0.27 0.51 0.35 0.37 0.5 0.25 0.4 0.42 0.42 0.45 0.42 0.64 0.54 0.54
0.17 0.2 0.21 0.27 0.61 0.55 0.32 0.26 0.34 0.3 0.37 0.34 0.23 1.0 0.73 0.41 0.37 0.16 0.45 0.34 0.32 0.31 0.18 0.34 0.34 0.29 0.31 0.26 0.35 0.38 0.5
0.24 0.23 0.27 0.32 0.53 0.51 0.52 0.54 0.54 0.53 0.56 0.48 0.43 1.0 0.91 0.59 0.57 0.39 0.68 0.53 0.48 0.5 0.26 0.51 0.44 0.44 0.47 0.39 0.7 0.64 0.68
0.13 0.23 0.12 0.13 0.63 0.67 0.42 0.25 0.56 0.51 0.5 0.32 0.12 0.93 1.0 0.65 0.47 0.03 0.62 0.46 0.5 0.46 0.06 0.49 0.4 0.42 0.53 0.13 0.65 0.83 0.66
0.09 0.14 0.08 0.09 0.5 0.61 0.42 0.34 0.33 0.28 0.32 0.22 0.18 1.0 0.8 0.39 0.29 0.2 0.5 0.34 0.34 0.33 0.09 0.31 0.27 0.33 0.38 0.27 0.34 0.26 0.22
0.28 0.29 0.24 0.26 0.54 0.61 0.38 0.34 0.37 0.33 0.43 0.31 0.23 1.0 0.72 0.4 0.36 0.41 0.56 0.35 0.35 0.38 0.18 0.34 0.37 0.4 0.53 0.33 0.43 0.34 0.28
0.43 0.55 0.44 0.45 0.9 0.87 0.61 0.74 0.5 0.45 0.53 0.44 0.4 1.0 0.85 0.5 0.4 0.28 0.51 0.39 0.38 0.4 0.21 0.36 0.42 0.39 0.42 0.37 0.64 0.6 0.63

Details

Expression values normalized per gene (using the maximum value, Green cells indicate low expression and red high. (Dark gray cells indicate missing values)