Heatmap: Cluster_142 (Lactuca sativa (Lsa) Coexpression Clusters (HCCA Algorithm))

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(Values are log₂ transformed ratios of a genes expression in a sample divided by the mean expression level)

Gene	Light: 268 uE m-2 s-1	Light: 202.5 uE m-2 s-1 (Control)	Light: 135 uE m-2 s-1	Light: 67.5 uE m-2 s-1	Photoperiod: L24	Photoperiod: L20D4 (Control)	Photoperiod: L12D12	Photoperiod: L8D16	RBW: 4:1:1 (Control)	RBW: 4:1:0	RBW: 3:1:1	RBW: 3:1:0	Nitrogen: 0%	Nitrogen: 25%	Nitrogen: 50%	Nitrogen: 100% (Control)	Nitrogen: 150%	Phosphorous: 0%	Phosphorous: 25%	Phosphorous: 50%	Phosphorous: 100% (Control)	Phosphorous: 150%	Potassium: 0%	Potassium: 25%	Potassium: 50%	Potassium: 100% (Control)	Potassium: 150%	Temperature: 20°C	Temperature: 25°C (Control)	Temperature: 30°C	Temperature: 35°C
Lsat_1_v5_gn_0_21000.1 (FLA17)	-1.36	-1.19	-0.79	-0.46	-0.15	-0.21	-0.11	-0.64	0.16	0.15	0.17	0.12	-0.0	0.88	0.98	0.37	0.37	0.06	0.35	0.15	-0.01	-0.12	-3.18	-0.15	-0.14	0.04	0.09	-0.19	-0.03	0.13	0.47
Lsat_1_v5_gn_0_22980.1 (SRF8)	-1.88	-0.97	-1.53	-1.65	-0.6	-0.37	0.3	-0.15	-0.32	-0.36	-0.16	-0.07	0.57	0.94	0.75	0.22	0.58	-0.2	0.34	0.2	0.05	0.02	-3.35	0.06	0.11	0.11	0.07	0.06	0.26	0.2	0.78
Lsat_1_v5_gn_0_9201.1 (AGD4)	-0.35	-0.43	-0.38	-0.49	0.03	0.2	0.14	0.15	-0.21	-0.02	0.08	-0.04	0.24	0.41	0.2	0.14	0.11	-0.11	0.08	-0.15	-0.13	-0.01	-0.23	-0.16	-0.07	0.03	-0.0	-0.05	0.12	0.16	0.27
Lsat_1_v5_gn_1_12201.1	-0.67	-0.85	-0.73	-0.51	-0.01	0.22	0.06	0.29	-0.3	-0.08	-0.22	-0.11	0.42	0.77	0.41	0.14	0.09	-0.49	-0.02	-0.03	-0.16	0.07	-0.13	-0.01	-0.08	-0.03	-0.0	-0.15	0.21	0.05	0.53
Lsat_1_v5_gn_1_123940.1	-0.93	-1.11	-1.04	-0.92	-0.16	0.31	0.13	-0.09	0.08	-0.01	0.06	-0.0	0.07	0.22	0.38	0.29	0.19	-0.47	0.19	0.11	0.07	0.1	-0.45	-0.02	0.07	0.22	0.31	0.02	0.13	0.28	0.37
Lsat_1_v5_gn_1_13741.1 (GUS2)	-1.38	-1.6	-1.29	-0.78	0.22	0.33	-0.04	-0.42	0.08	0.18	0.14	0.14	0.35	0.58	0.83	0.22	0.08	-0.21	0.3	0.16	-0.08	-0.01	-1.46	-0.0	0.02	-0.06	-0.04	-0.21	-0.02	0.12	0.67
Lsat_1_v5_gn_1_18200.1 (BZR1)	-1.25	-0.67	-0.46	-0.02	0.25	0.19	-0.36	-1.14	0.21	0.22	0.25	0.27	0.19	0.54	0.42	0.36	0.18	-0.26	-0.16	0.04	-0.1	-0.22	-1.65	-0.26	-0.03	0.04	0.02	-0.35	0.25	0.26	0.79
Lsat_1_v5_gn_1_19200.1	-0.73	-0.67	-1.31	-1.1	-0.02	0.26	0.35	0.15	-0.14	-0.07	-0.07	-0.2	0.48	0.34	0.31	0.12	0.07	-0.45	0.11	0.01	-0.04	0.07	-0.35	0.11	0.17	0.09	0.06	0.03	0.2	0.2	0.45
Lsat_1_v5_gn_1_20400.1 (FLDH)	-0.86	-0.48	-0.42	-0.29	-0.13	0.23	0.11	-0.09	0.14	0.29	0.23	0.07	0.32	0.73	0.55	0.4	0.15	-0.49	0.03	-0.05	-0.07	-0.0	-2.65	-0.38	-0.34	-0.13	-0.15	-0.34	0.04	0.13	0.7
Lsat_1_v5_gn_1_24320.1 (ATB2)	-0.98	-0.87	-1.2	-1.14	0.17	0.37	0.02	0.08	-0.32	-0.41	0.04	-0.21	0.33	0.69	0.67	0.21	0.0	-0.44	0.25	0.09	-0.1	-0.02	-0.61	-0.03	0.01	0.04	-0.03	-0.03	0.24	0.15	0.74
Lsat_1_v5_gn_1_28101.1 (FIP37)	-0.55	-0.53	-0.76	-0.53	0.03	0.15	-0.03	0.25	-0.21	-0.06	-0.07	0.08	0.69	0.28	0.19	-0.03	0.14	-0.54	-0.12	-0.09	-0.03	-0.11	-0.1	0.01	0.09	-0.03	-0.02	-0.1	0.0	0.16	0.75
Lsat_1_v5_gn_1_39900.1	-0.98	-0.87	-0.82	-0.44	0.42	0.3	-0.38	-0.57	-0.05	0.1	0.15	0.11	0.49	0.24	0.31	-0.0	-0.01	0.09	-0.1	-0.01	-0.15	-0.0	-0.56	-0.07	0.0	-0.01	0.02	0.17	0.19	0.3	0.65
Lsat_1_v5_gn_1_43100.1 (TIFY8)	-0.66	-0.73	-0.64	-0.37	0.14	0.25	-0.69	-0.77	-0.14	-0.14	0.03	-0.02	0.47	0.97	0.78	0.22	0.09	-0.46	0.06	-0.16	-0.15	-0.11	-0.89	-0.27	-0.08	0.13	0.01	0.11	0.22	0.14	0.58
Lsat_1_v5_gn_1_65381.1	-0.72	-0.24	-0.38	-0.55	-0.07	0.09	-0.19	-0.26	0.09	0.14	-0.07	0.08	-0.26	0.78	0.77	0.06	-0.01	-0.49	0.25	-0.13	-0.19	-0.08	-1.64	-0.29	-0.05	0.02	-0.1	-0.35	0.4	0.47	0.79
Lsat_1_v5_gn_1_77081.1 (SAV4)	-0.65	-0.4	-0.82	-0.77	-0.09	0.13	0.18	0.17	-0.28	-0.07	-0.07	0.09	0.54	0.33	0.22	0.15	0.17	-0.48	0.0	0.07	0.06	-0.06	-0.29	0.0	0.04	0.05	0.03	-0.1	0.2	0.21	0.42
Lsat_1_v5_gn_1_84880.1	-0.43	-0.44	-0.68	-0.51	0.17	0.31	-0.21	-0.42	-0.37	-0.26	0.12	-0.03	-0.22	1.1	0.77	-0.02	-0.28	-0.27	0.46	-0.14	-0.2	-0.18	-0.26	-0.26	-0.23	0.13	-0.03	-0.2	0.23	0.11	0.54
Lsat_1_v5_gn_1_98861.1	-0.89	-0.98	-0.77	-0.73	0.26	0.31	0.12	0.06	-0.12	0.03	0.03	0.05	0.29	0.49	0.46	0.3	0.11	-0.45	0.01	0.01	-0.08	-0.03	-0.11	0.01	-0.05	-0.02	-0.03	-0.13	-0.06	0.16	0.46
Lsat_1_v5_gn_2_112481.1	-0.57	-0.42	-0.86	-0.36	0.02	0.04	0.05	-0.16	0.08	0.03	0.04	0.12	0.08	0.85	0.84	0.15	0.04	-0.88	0.04	-0.14	-0.22	-0.2	-1.48	-0.11	-0.02	0.01	-0.06	-0.28	0.24	0.34	0.67
Lsat_1_v5_gn_2_39781.1 (FAO3)	-3.85	-3.59	-3.97	-4.72	-1.06	-0.96	0.33	-0.36	-0.57	-0.47	-0.73	-1.1	-1.18	2.25	2.29	0.68	0.57	-1.18	0.64	0.15	-0.56	-0.71	-2.81	-0.3	-0.29	-0.76	-0.22	-2.07	-0.1	0.44	0.96
Lsat_1_v5_gn_2_47601.1 (SHM4)	-0.71	-0.72	-1.22	-1.34	0.38	0.26	-0.13	-0.19	-0.3	-0.22	-0.15	-0.09	0.46	0.27	0.11	0.11	0.15	-0.5	0.14	-0.03	0.01	0.11	-0.38	0.41	0.16	0.03	0.11	0.07	0.44	0.43	0.45
Lsat_1_v5_gn_2_54440.1	-1.61	-1.01	-1.67	-1.15	-0.35	-0.04	0.14	-0.22	0.11	0.13	0.23	0.09	0.29	0.06	0.55	0.44	0.31	-0.59	0.21	0.23	0.1	0.07	-0.98	0.08	0.13	0.23	0.09	-0.13	0.32	0.44	0.52
Lsat_1_v5_gn_2_59441.1 (NF-YB11)	-0.65	-0.85	-1.05	-1.02	-0.03	0.23	-0.07	0.15	-0.42	-0.26	-0.2	0.18	1.0	0.14	0.07	-0.11	-0.03	-0.32	0.0	0.1	-0.04	0.13	-0.1	0.14	-0.04	0.07	0.02	-0.06	-0.08	-0.05	1.05
Lsat_1_v5_gn_2_66440.1	-0.85	-0.79	-1.13	-0.39	-0.12	-0.04	-0.03	0.07	-0.23	-0.09	-0.06	-0.22	0.38	0.53	0.48	0.05	0.13	-0.33	0.14	-0.13	-0.05	0.1	-0.06	0.06	0.22	0.15	0.15	0.01	0.18	0.19	0.42
Lsat_1_v5_gn_2_75321.1	-0.97	-0.83	-1.38	-1.56	-0.12	0.28	-0.18	0.05	-0.1	-0.17	0.0	-0.07	-0.07	1.13	0.73	-0.03	-0.02	-0.03	0.27	-0.26	-0.13	-0.01	-0.51	-0.1	-0.02	0.13	0.02	-0.59	0.01	0.54	0.87
Lsat_1_v5_gn_2_83060.1 (MEL2)	-3.0	-2.35	-1.76	-1.23	0.53	0.39	-1.03	-0.77	-0.48	-0.6	-0.17	0.02	0.7	1.53	0.78	-0.34	-0.33	0.64	-0.26	-0.29	-0.61	-0.46	-0.19	0.25	0.06	-0.14	-0.09	-0.38	-0.07	0.09	1.42
Lsat_1_v5_gn_2_88360.1 (SS2)	-0.98	-0.87	-1.79	-1.88	-0.54	0.45	-0.14	-0.33	0.0	-0.21	-0.07	-0.28	0.45	0.53	0.52	0.54	0.38	-1.17	0.31	0.0	-0.09	-0.01	-0.71	0.19	0.33	0.17	0.11	-0.32	0.15	0.5	0.89
Lsat_1_v5_gn_2_89281.1 (GN)	-0.9	-0.61	-0.52	-0.39	0.29	0.23	-0.33	-0.47	-0.24	0.03	0.14	0.08	0.44	0.4	0.27	0.07	0.1	0.06	-0.08	-0.07	-0.04	-0.01	-0.34	-0.17	-0.09	0.04	0.13	-0.05	0.12	0.28	0.58
Lsat_1_v5_gn_2_98921.1 (PNF)	-1.26	-0.8	-1.05	-0.93	-0.53	0.04	0.09	0.04	-0.43	-0.34	-0.41	-0.39	0.4	1.34	0.97	0.45	0.35	-0.33	0.15	-0.05	-0.41	-0.4	-1.02	-0.1	-0.13	-0.19	0.06	-0.55	0.36	0.55	0.69
Lsat_1_v5_gn_3_10240.1 (TBL25)	-0.8	-0.86	-0.72	-0.79	0.12	0.34	0.12	0.11	-0.09	0.05	-0.13	0.16	0.31	0.38	0.21	0.21	0.19	-0.43	0.21	0.03	-0.05	0.08	-0.96	0.1	0.01	-0.01	0.11	-0.15	0.02	0.23	0.54
Lsat_1_v5_gn_3_114660.1 (IQD5)	-0.32	-0.76	-0.81	-0.23	0.15	0.28	-0.05	0.06	-0.15	-0.08	-0.05	-0.01	0.39	0.52	0.43	0.14	-0.04	-0.52	0.06	-0.04	-0.05	0.01	-0.12	0.01	-0.13	-0.1	-0.03	0.09	-0.01	0.04	0.45
Lsat_1_v5_gn_3_116300.1 (LRRAC1)	-0.7	-0.28	-0.03	-0.07	-0.05	0.21	-0.07	-0.15	-0.3	-0.29	-0.23	-0.26	0.15	1.11	0.72	0.15	0.14	-0.9	0.23	-0.3	-0.31	-0.11	-1.42	-0.37	-0.22	0.03	-0.04	-0.49	0.33	0.33	0.8
Lsat_1_v5_gn_3_136160.1	-0.44	-0.38	-0.51	-0.46	0.03	0.1	-0.06	0.05	0.06	0.05	-0.09	-0.13	0.29	0.42	0.13	0.04	0.12	-0.44	0.09	-0.02	-0.01	0.03	-0.28	-0.09	0.03	0.06	0.05	-0.02	0.1	0.23	0.46
Lsat_1_v5_gn_3_137960.1 (GT2L)	-1.55	-0.98	-0.91	-1.01	-0.13	0.27	-0.32	-0.82	-0.22	-0.04	-0.08	-0.0	0.44	1.05	0.78	0.41	0.34	-2.03	0.18	0.15	-0.08	0.14	-4.47	-0.04	0.05	0.21	0.16	-0.33	0.4	0.46	0.83
Lsat_1_v5_gn_3_1800.1	-1.61	-1.51	-0.62	0.45	-0.77	-0.61	0.31	0.34	-0.06	0.05	-0.0	0.12	0.4	0.64	0.76	0.39	0.57	-1.34	0.06	0.27	-0.21	-0.12	-3.29	-0.05	-0.11	0.02	-0.14	-0.17	-0.19	0.15	0.92
Lsat_1_v5_gn_3_19140.1 (LUP1)	-5.74	-1.84	-2.02	-1.35	-0.75	-0.95	0.08	-0.78	-0.27	-0.5	-0.3	-0.24	0.88	1.97	1.49	-0.16	0.74	-0.25	0.07	0.25	-0.45	-0.79	-2.48	-0.49	-0.09	-0.29	-0.23	-2.07	0.3	0.24	1.28
Lsat_1_v5_gn_3_23040.1	-1.4	-0.86	-1.52	-0.97	0.11	0.42	0.04	-0.08	-0.13	-0.08	-0.04	-0.08	0.19	0.51	0.51	0.36	0.16	-0.64	0.21	0.05	0.06	0.06	-0.68	-0.06	0.11	0.24	0.29	-0.0	0.25	0.17	0.46
Lsat_1_v5_gn_3_23361.1	-0.74	-1.16	-0.61	-0.16	0.13	0.43	0.01	0.3	-0.03	-0.19	-0.03	0.01	0.15	0.66	0.61	0.1	0.05	-1.08	0.0	-0.26	-0.13	-0.12	-0.52	-0.05	0.05	0.17	-0.11	-0.03	0.15	0.06	0.6
Lsat_1_v5_gn_3_24340.1 (ATH1)	-1.07	-1.36	-2.21	-2.91	-0.52	0.17	0.03	-0.19	-0.46	-0.6	-0.23	-0.43	0.93	1.48	1.24	0.08	-0.21	-0.17	-0.01	-0.38	-0.3	-0.23	-0.89	-0.06	-0.24	-0.22	-0.2	-0.67	0.24	0.41	1.35
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Details

Dark gray cells indicate values where the raw expression is zero (cannot be log-transformed). Blue cells indicate samples where the expression of the gene is below average and red cells indicate the gene is expressed above average in the sample. White cells are average.