Heatmap: Cluster_215 (Lactuca sativa (Lsa) Coexpression Clusters (HCCA Algorithm))

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(Values are log₂ transformed ratios of a genes expression in a sample divided by the mean expression level)

Gene	Light: 268 uE m-2 s-1	Light: 202.5 uE m-2 s-1 (Control)	Light: 135 uE m-2 s-1	Light: 67.5 uE m-2 s-1	Photoperiod: L24	Photoperiod: L20D4 (Control)	Photoperiod: L12D12	Photoperiod: L8D16	RBW: 4:1:1 (Control)	RBW: 4:1:0	RBW: 3:1:1	RBW: 3:1:0	Nitrogen: 0%	Nitrogen: 25%	Nitrogen: 50%	Nitrogen: 100% (Control)	Nitrogen: 150%	Phosphorous: 0%	Phosphorous: 25%	Phosphorous: 50%	Phosphorous: 100% (Control)	Phosphorous: 150%	Potassium: 0%	Potassium: 25%	Potassium: 50%	Potassium: 100% (Control)	Potassium: 150%	Temperature: 20°C	Temperature: 25°C (Control)	Temperature: 30°C	Temperature: 35°C
Lsat_1_v5_gn_0_14741.1 (DCL2)	-0.05	-0.08	0.34	0.31	0.11	-0.29	-0.16	-0.63	-0.59	-0.28	-0.17	-0.11	0.37	0.4	0.32	0.16	0.11	-1.11	-0.59	-0.41	-0.53	-0.51	1.47	-0.43	-0.29	-0.33	-0.45	-0.4	-0.23	0.32	0.83
Lsat_1_v5_gn_0_18380.1 (DCL2)	-0.19	-0.11	0.27	-0.13	0.13	-0.01	-0.14	-0.46	-0.13	-0.04	-0.13	-0.22	0.19	0.39	0.56	0.16	0.08	-0.46	-0.38	-0.25	-0.46	-0.4	1.39	-0.56	-0.32	-0.29	-0.18	-0.59	-0.23	0.16	0.4
Lsat_1_v5_gn_0_32880.1 (TOT3)	-0.47	-0.39	0.12	0.46	0.35	0.1	-0.44	-0.53	-0.09	0.01	0.13	-0.04	0.07	0.73	0.27	-0.18	-0.17	-0.18	-0.11	-0.32	-0.14	-0.2	0.6	-0.37	-0.26	-0.24	-0.22	-0.23	0.06	0.19	0.41
Lsat_1_v5_gn_0_7881.1 (DYRKP-2A)	0.04	0.18	0.16	-0.3	0.34	0.19	-0.24	-0.22	-0.34	-0.28	-0.1	-0.38	0.16	0.37	0.34	-0.04	-0.25	-0.37	0.01	-0.26	-0.28	-0.19	0.53	-0.32	-0.16	-0.12	-0.14	-0.25	0.13	0.23	0.69
Lsat_1_v5_gn_1_2001.1 (UPL1)	-0.15	-0.18	-0.23	0.02	0.36	0.08	-0.45	-0.44	-0.13	-0.06	0.01	-0.1	0.3	0.78	0.38	0.01	-0.21	-0.3	-0.25	-0.52	-0.41	-0.4	0.85	-0.41	-0.33	-0.24	-0.35	-0.31	0.23	0.29	0.65
Lsat_1_v5_gn_1_61441.1 (ICU9)	-0.16	-0.29	0.05	-0.27	0.36	-0.07	-0.52	-0.38	-0.37	-0.24	-0.14	-0.11	0.28	0.96	0.67	-0.13	-0.2	-0.07	-0.09	-0.33	-0.49	-0.45	0.7	-0.37	-0.33	-0.37	-0.34	-0.58	0.04	0.46	0.81
Lsat_1_v5_gn_1_65581.1 (BIB)	0.13	-0.1	0.01	-0.11	0.23	0.21	-0.17	-0.11	-0.04	-0.01	0.07	-0.06	-0.09	0.61	0.63	0.17	-0.12	-1.74	-0.11	-0.35	-0.19	-0.2	0.26	-0.2	-0.21	-0.07	-0.06	-0.33	0.24	0.24	0.16
Lsat_1_v5_gn_1_6720.1 (PEX1)	-0.14	-0.01	-0.07	-0.04	0.24	0.27	-0.02	-0.19	-0.07	-0.1	-0.03	-0.22	0.1	0.67	0.32	0.04	-0.17	-0.93	-0.22	-0.39	-0.23	-0.03	0.19	-0.32	-0.24	-0.07	-0.18	-0.17	0.23	0.33	0.54
Lsat_1_v5_gn_2_104501.1 (SCS1)	0.25	-0.02	0.53	0.58	0.39	-0.06	-0.37	-0.44	-0.36	-0.27	-0.14	-0.32	0.08	0.41	0.23	-0.11	-0.38	0.08	-0.11	-0.51	-0.44	-0.41	0.98	-0.42	-0.37	-0.32	-0.4	-0.55	0.07	0.14	0.55
Lsat_1_v5_gn_2_106480.1 (EIN2)	-0.31	-0.28	0.49	1.06	0.56	0.26	-0.71	-0.75	-0.13	-0.02	0.07	-0.07	-0.63	0.54	0.21	-0.24	-0.44	-0.52	-0.45	-0.69	-0.54	-0.58	1.65	-0.66	-0.55	-0.46	-0.31	-0.64	0.08	0.07	0.17
Lsat_1_v5_gn_2_108341.1	0.28	0.06	0.1	-0.28	0.36	0.16	-0.35	-0.22	-0.34	-0.24	-0.17	-0.23	0.32	0.5	0.35	-0.0	-0.27	0.17	-0.3	-0.38	-0.39	-0.25	0.73	-0.4	-0.27	-0.25	-0.23	-0.27	0.11	0.11	0.51
Lsat_1_v5_gn_2_110120.1 (MOS11)	0.21	0.24	0.5	0.15	0.11	-0.25	-0.52	-0.28	-0.38	-0.3	-0.4	-0.3	0.19	0.57	0.5	-0.18	-0.25	0.12	-0.18	-0.35	-0.42	-0.33	1.18	-0.35	-0.33	-0.3	-0.29	-0.63	0.03	-0.03	0.47
Lsat_1_v5_gn_2_113740.1 (PWR)	-0.0	0.2	-0.04	-0.15	0.42	0.33	0.03	0.14	-0.34	-0.31	-0.15	-0.25	0.01	0.56	0.45	0.05	-0.18	-0.14	-0.18	-0.47	-0.35	-0.38	0.8	-0.44	-0.4	-0.24	-0.27	-0.48	0.15	0.2	0.28
Lsat_1_v5_gn_2_118821.1 (PUM2)	-0.63	-0.66	-0.15	0.4	0.4	0.23	-0.59	-0.57	-0.18	-0.07	0.11	0.08	0.43	0.39	0.22	-0.17	-0.31	-0.22	-0.32	-0.36	-0.32	-0.2	1.15	-0.25	-0.18	-0.23	-0.27	-0.3	0.15	0.04	0.58
Lsat_1_v5_gn_2_120680.1 (BORR)	-0.86	-0.8	-0.59	-0.65	0.42	0.5	-0.11	0.18	-0.2	-0.31	-0.25	-0.32	0.33	1.0	0.56	0.13	-0.16	0.01	-0.07	-0.2	-0.26	-0.22	0.18	-0.29	-0.2	0.04	-0.07	-0.01	0.24	0.06	0.24
Lsat_1_v5_gn_2_133101.1 (SLK2)	-0.43	-0.26	-0.14	0.05	0.27	0.04	-0.5	-0.58	-0.19	-0.18	-0.09	-0.15	-0.03	0.8	0.51	-0.04	-0.32	0.1	-0.2	-0.38	-0.39	-0.43	0.67	-0.17	-0.14	-0.28	-0.25	-0.33	0.37	0.38	0.75
Lsat_1_v5_gn_2_16061.1 (XPO4)	-0.17	-0.1	-0.08	-0.0	0.28	0.33	-0.18	-0.22	-0.19	-0.22	-0.06	-0.19	0.14	0.73	0.36	0.04	-0.17	-0.47	-0.12	-0.43	-0.34	-0.13	0.35	-0.35	-0.23	-0.23	-0.38	-0.32	0.34	0.34	0.62
Lsat_1_v5_gn_2_17061.1 (OTU1)	0.32	0.04	0.15	-0.36	0.28	0.08	-0.26	-0.16	-0.51	-0.53	-0.45	-0.49	0.46	0.51	0.29	-0.03	-0.12	0.52	-0.43	-0.36	-0.29	-0.1	0.95	-0.23	-0.3	-0.23	-0.31	-0.21	-0.16	0.03	0.4
Lsat_1_v5_gn_2_27520.1 (TTN7)	-0.12	-0.15	-0.01	-0.17	0.39	0.13	-0.35	-0.32	-0.41	-0.38	-0.18	-0.32	0.28	0.81	0.56	-0.08	-0.33	-0.06	-0.14	-0.46	-0.46	-0.39	0.85	-0.4	-0.33	-0.43	-0.32	-0.45	0.32	0.35	0.75
Lsat_1_v5_gn_2_58060.1	-0.07	0.03	0.08	0.12	0.53	0.3	-0.27	-0.41	-0.08	-0.02	0.05	-0.15	-0.07	0.33	0.38	0.1	-0.15	-1.15	-0.12	-0.31	-0.23	-0.13	0.52	-0.45	-0.45	-0.03	-0.01	-0.12	0.18	0.15	0.35
Lsat_1_v5_gn_2_78280.1 (emb1967)	-0.29	-0.21	-0.31	-0.17	0.22	0.15	-0.22	0.03	-0.41	-0.4	-0.12	-0.25	0.04	0.84	0.5	-0.09	-0.37	-0.09	0.0	-0.29	-0.37	-0.2	0.77	-0.23	-0.44	-0.25	-0.21	-0.35	0.23	0.37	0.68
Lsat_1_v5_gn_3_118860.1	-0.6	-0.81	-0.46	-0.43	0.44	0.49	-0.24	-0.17	-0.37	-0.3	-0.29	-0.32	0.45	0.91	0.48	0.03	-0.13	0.1	-0.05	-0.43	-0.19	-0.07	0.32	-0.16	-0.18	-0.14	-0.06	-0.07	0.28	0.08	0.38
Lsat_1_v5_gn_3_140760.1 (CAF)	0.35	0.08	0.07	0.04	0.26	0.07	-0.15	0.06	-0.45	-0.4	-0.21	-0.25	0.07	0.58	0.32	-0.09	-0.18	-0.45	-0.17	-0.45	-0.36	-0.31	0.79	-0.21	-0.24	-0.28	-0.27	-0.29	0.16	0.17	0.58
Lsat_1_v5_gn_3_39301.1	-0.27	0.05	-0.18	-0.36	0.28	0.44	-0.18	0.17	-0.45	-0.41	-0.43	-0.54	-0.11	1.05	0.53	-0.03	-0.26	-0.95	0.08	-0.63	-0.35	-0.07	0.53	-0.33	-0.26	-0.21	-0.5	-0.53	0.35	0.36	0.9
Lsat_1_v5_gn_3_43740.1 (APO1)	-0.4	-0.33	-0.44	-0.02	0.84	0.4	-0.63	0.45	-0.26	-0.26	-0.14	-0.01	-0.3	1.11	0.46	-0.21	-0.68	-1.14	0.14	-0.64	-0.49	-0.4	0.9	-0.3	-0.45	-0.66	-0.45	-0.9	0.42	0.32	0.7
Lsat_1_v5_gn_3_5900.1 (SMD2)	0.16	-0.05	0.06	-0.07	0.51	0.34	-0.18	-0.37	-0.39	-0.27	-0.18	-0.2	0.25	0.62	0.34	-0.05	-0.09	-0.44	-0.2	-0.33	-0.26	-0.14	0.62	-0.19	-0.33	-0.04	-0.0	-0.27	0.02	-0.15	0.34
Lsat_1_v5_gn_4_134081.1 (ANU1)	0.05	-0.03	-0.08	0.0	0.35	0.17	-0.39	-0.14	-0.23	-0.27	-0.03	-0.2	-0.05	0.98	0.44	-0.21	-0.27	-0.56	-0.13	-0.51	-0.28	-0.17	0.68	-0.14	-0.22	-0.24	-0.28	-0.2	0.17	0.02	0.48
Lsat_1_v5_gn_4_143680.1 (TOR)	-0.41	-0.3	-0.23	-0.12	0.55	0.21	-0.53	-0.64	-0.23	-0.21	-0.17	-0.26	0.13	1.06	0.61	-0.01	-0.29	-0.4	-0.25	-0.61	-0.46	-0.36	0.88	-0.5	-0.36	-0.31	-0.38	-0.4	0.45	0.4	0.72
Lsat_1_v5_gn_4_173941.1	0.07	-0.01	0.28	0.45	0.36	0.01	-0.49	-0.57	-0.22	-0.25	-0.13	-0.14	-0.01	0.71	0.38	0.03	-0.13	-0.75	-0.22	-0.68	-0.33	-0.45	0.94	-0.46	-0.31	-0.23	-0.3	-0.22	0.15	0.3	0.46
Lsat_1_v5_gn_4_185081.1 (CHC1)	-0.02	-0.05	0.26	0.36	0.15	-0.06	-0.36	-0.25	-0.36	-0.26	-0.1	-0.28	-0.06	0.43	0.23	-0.08	-0.24	0.24	-0.09	-0.38	-0.3	-0.19	0.68	-0.28	-0.16	-0.09	-0.12	-0.3	0.23	0.26	0.4
Lsat_1_v5_gn_4_186200.1	-0.31	-0.39	0.32	0.61	0.64	0.49	-0.28	-0.17	-0.17	-0.11	0.07	-0.11	-0.11	0.46	0.41	0.05	-0.38	-0.5	-0.08	-0.54	-0.41	-0.36	1.03	-0.54	-0.45	-0.3	-0.25	-0.44	-0.0	0.06	-0.01
Lsat_1_v5_gn_4_22000.1 (AGO2)	0.42	0.26	0.1	-0.25	0.39	0.47	-0.29	0.03	-0.46	-0.56	-0.27	-0.39	0.28	0.81	0.45	0.03	-0.25	-0.54	-0.27	-0.56	-0.42	-0.34	0.95	-0.25	-0.32	-0.31	-0.17	-0.37	-0.13	-0.13	0.29
Lsat_1_v5_gn_4_75001.1	-0.13	-0.01	0.61	0.21	-0.06	-0.3	-0.24	-0.72	-0.04	-0.29	0.03	-0.03	0.12	-0.44	-0.02	0.28	0.18	-0.74	-0.37	-0.38	-0.27	-0.62	1.5	-0.29	-0.06	-0.06	-0.42	-0.54	-0.38	0.16	0.81
Lsat_1_v5_gn_4_75221.1 (FAB1B)	-0.01	0.05	-0.14	-0.11	0.41	-0.02	-0.14	-0.25	-0.01	-0.08	0.04	-0.02	-0.24	0.71	0.48	-0.02	-0.19	-0.72	0.08	-0.28	-0.25	-0.18	0.05	-0.27	-0.17	-0.1	-0.11	-0.21	0.29	0.27	0.33
Lsat_1_v5_gn_4_79881.1	0.85	-0.09	0.8	0.64	0.89	0.44	-0.84	-0.67	-0.32	-0.39	-0.32	-0.56	-0.81	0.42	0.19	-0.33	-0.95	-0.81	-0.56	-1.05	-0.59	-0.69	1.96	-0.65	-0.73	-0.82	-0.4	-0.96	0.25	0.16	-0.23
Lsat_1_v5_gn_4_79960.1	-0.23	-0.3	-0.31	0.04	0.45	0.28	-0.39	-0.52	-0.15	-0.01	-0.11	0.03	0.21	0.31	0.19	-0.05	-0.21	0.01	-0.06	-0.26	-0.29	-0.12	0.78	-0.32	-0.1	-0.18	-0.14	-0.1	0.19	0.16	0.35
Lsat_1_v5_gn_5_105860.1 (MORF1)	0.2	-0.07	-0.04	-0.42	0.21	0.33	-0.41	-0.29	-0.77	-0.84	-0.74	-0.58	0.27	1.08	0.64	0.09	-0.21	0.13	-0.39	-0.55	-0.35	-0.35	0.63	-0.21	-0.37	-0.32	-0.47	-0.56	0.45	0.29	0.91
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Lsat_1_v5_gn_9_61600.1 (JAO2)	-3.81	0.53	-0.25	2.53	-3.36	-3.61	-1.93	-	-	-3.04	-4.09	-	-6.08	-3.16	-6.05	-3.34	-2.65	-1.26	-6.23	-	-4.8	-	3.82	-	-3.91	-	-3.78	-	1.52	2.1	-
Lsat_1_v5_gn_9_7140.1	-0.08	-0.09	-0.05	0.13	0.36	0.43	-0.16	-0.4	0.02	-0.03	0.09	-0.11	-0.29	0.32	0.2	0.02	-0.31	-0.69	0.18	-0.42	-0.28	-0.24	0.67	-0.31	-0.21	-0.12	-0.15	-0.49	0.23	0.3	0.48

Details

Dark gray cells indicate values where the raw expression is zero (cannot be log-transformed). Blue cells indicate samples where the expression of the gene is below average and red cells indicate the gene is expressed above average in the sample. White cells are average.