Heatmap: Cluster_52 (Lactuca sativa (Lsa) Coexpression Clusters (HCCA Algorithm))

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(Values are log₂ transformed ratios of a genes expression in a sample divided by the mean expression level)

Gene	Light: 268 uE m-2 s-1	Light: 202.5 uE m-2 s-1 (Control)	Light: 135 uE m-2 s-1	Light: 67.5 uE m-2 s-1	Photoperiod: L24	Photoperiod: L20D4 (Control)	Photoperiod: L12D12	Photoperiod: L8D16	RBW: 4:1:1 (Control)	RBW: 4:1:0	RBW: 3:1:1	RBW: 3:1:0	Nitrogen: 0%	Nitrogen: 25%	Nitrogen: 50%	Nitrogen: 100% (Control)	Nitrogen: 150%	Phosphorous: 0%	Phosphorous: 25%	Phosphorous: 50%	Phosphorous: 100% (Control)	Phosphorous: 150%	Potassium: 0%	Potassium: 25%	Potassium: 50%	Potassium: 100% (Control)	Potassium: 150%	Temperature: 20°C	Temperature: 25°C (Control)	Temperature: 30°C	Temperature: 35°C
Lsat_1_v5_gn_0_3201.1 (NAP14)	0.11	-0.18	-0.34	-0.31	-0.06	0.04	-0.14	-0.13	0.11	0.12	0.05	0.02	0.38	0.19	-0.03	-0.06	0.07	-0.86	-0.28	-0.16	0.0	0.11	0.17	0.11	0.06	0.03	0.35	0.28	-0.05	-0.1	-0.02
Lsat_1_v5_gn_0_4201.1 (SOS4)	-0.57	-0.71	-0.47	-0.45	0.31	0.13	-0.32	-0.16	0.09	0.17	0.15	0.33	0.61	0.33	0.18	0.17	0.13	-0.86	-0.36	-0.19	-0.16	-0.1	0.49	0.04	-0.13	0.0	-0.06	0.16	-0.2	0.01	0.24
Lsat_1_v5_gn_1_114280.1 (ANN6)	-	-	-	-	2.3	2.0	-1.72	-1.0	-3.13	-1.71	-2.91	-1.77	2.64	-1.07	-1.75	-2.15	-0.42	-0.91	-0.06	-2.04	-2.56	-0.2	2.77	-	-1.64	0.54	-0.49	-2.32	-4.01	-	-2.97
Lsat_1_v5_gn_1_129281.1	0.18	-0.27	-0.33	-0.41	0.24	0.37	-0.05	0.05	-0.21	-0.19	-0.13	-0.23	0.35	0.02	-0.07	-0.24	-0.16	-0.1	-0.06	-0.16	-0.14	-0.01	0.63	0.08	0.09	-0.07	-0.07	0.31	0.12	-0.07	-0.02
Lsat_1_v5_gn_1_17601.1	-0.04	-0.14	-0.25	-0.31	0.21	0.34	-0.19	-0.08	-0.08	-0.1	-0.05	0.05	0.25	0.44	0.26	0.03	-0.04	-0.52	-0.08	-0.11	-0.01	0.01	0.01	0.14	0.01	-0.02	0.03	-0.07	-0.01	-0.06	0.02
Lsat_1_v5_gn_1_27961.1 (DCA1)	0.48	0.16	0.04	-0.04	0.26	0.03	-0.11	0.01	-0.12	-0.17	0.0	0.0	0.16	0.49	0.14	-0.06	-0.08	-1.24	0.03	-0.21	-0.17	-0.15	0.61	-0.01	-0.08	-0.21	-0.23	0.02	-0.1	-0.18	-0.19
Lsat_1_v5_gn_1_41100.1 (HY3)	-0.37	-0.18	-0.5	-0.67	0.03	0.37	0.3	0.39	-0.17	-0.15	-0.1	-0.23	0.26	0.36	0.22	0.26	0.08	-1.29	-0.07	-0.16	-0.1	-0.0	0.5	-0.09	-0.02	-0.05	0.0	-0.21	-0.05	0.11	0.34
Lsat_1_v5_gn_1_43360.1	-0.2	-0.54	-0.52	-0.54	-0.2	0.22	0.05	0.27	-0.14	-0.15	-0.06	-0.1	0.07	0.3	0.04	0.13	0.01	-0.26	-0.17	-0.01	-0.03	0.21	0.71	0.12	0.04	0.12	0.24	0.13	-0.23	-0.26	0.03
Lsat_1_v5_gn_1_66000.1 (RbcX2)	-0.01	-0.01	-0.23	-0.6	0.03	-0.03	0.51	0.53	-0.12	-0.15	-0.24	-0.36	-0.25	0.18	0.36	0.03	0.04	-0.65	0.05	-0.09	-0.04	0.03	0.1	-0.06	-0.04	-0.03	-0.07	-0.21	0.27	0.27	0.08
Lsat_1_v5_gn_1_87200.1 (BTL08)	-0.18	-0.45	-0.56	-0.06	0.14	0.2	0.13	0.25	-0.11	-0.06	-0.06	-0.1	0.29	0.52	0.56	0.14	0.18	-1.02	0.02	-0.08	-0.08	-0.11	-0.19	-0.04	-0.1	0.01	-0.06	0.01	0.2	-0.07	-0.16
Lsat_1_v5_gn_1_92920.1 (RWA1)	-0.96	-0.71	-1.1	-0.76	0.2	0.15	0.19	-0.05	-0.03	0.08	-0.05	0.11	0.44	0.23	0.24	0.14	0.31	-0.45	0.03	-0.03	-0.14	-0.13	0.28	-0.14	0.03	-0.08	0.04	-0.05	0.1	0.33	0.42
Lsat_1_v5_gn_1_97840.1	-0.28	0.13	-0.12	-0.17	0.28	0.6	0.59	0.59	-0.45	-0.62	-0.34	-0.73	-0.29	0.65	0.27	0.07	-0.35	0.19	-0.19	-0.6	-0.28	-0.23	0.9	-0.38	-0.25	-0.1	-0.13	-0.56	0.0	-0.23	0.14
Lsat_1_v5_gn_2_104420.1 (TMT1)	0.77	0.13	-0.06	-0.15	-0.48	-0.82	-0.06	-0.06	0.34	0.28	0.27	0.59	0.3	-0.23	-0.3	-0.32	0.02	-2.43	-0.26	0.13	-0.2	-0.08	0.85	0.33	-0.01	-0.21	-0.24	0.36	-0.62	-0.34	-0.31
Lsat_1_v5_gn_2_110160.1 (GET4)	0.12	-0.11	-0.62	-0.64	0.33	0.51	0.26	0.05	-0.2	-0.15	-0.06	-0.19	0.17	0.12	0.31	0.08	-0.09	-0.09	-0.21	-0.38	-0.07	-0.11	0.58	-0.03	-0.01	-0.11	-0.09	-0.05	0.04	-0.02	-0.08
Lsat_1_v5_gn_2_112341.1	0.16	-0.16	-0.35	-0.5	0.05	0.24	-0.09	-0.04	-0.22	-0.27	-0.17	-0.15	0.07	0.58	0.46	0.09	0.06	-0.45	0.25	-0.02	-0.01	-0.02	0.26	0.0	-0.05	-0.03	-0.03	0.23	-0.03	-0.16	-0.27
Lsat_1_v5_gn_2_114921.1	-1.02	-0.76	-1.44	-0.67	0.16	0.37	0.1	0.17	-0.16	-0.09	-0.15	-0.24	0.17	0.63	0.31	0.28	0.26	-1.44	0.02	-0.07	0.03	0.13	0.8	-0.18	0.03	0.18	0.22	0.2	-0.09	0.06	-0.2
Lsat_1_v5_gn_2_125000.1 (MSD1)	0.3	-0.04	-0.43	-0.53	0.26	0.27	-0.15	-0.02	-0.27	-0.25	-0.15	-0.05	0.23	0.68	0.43	-0.2	-0.3	-0.55	0.04	-0.01	-0.08	-0.06	0.27	0.13	-0.05	-0.21	-0.14	0.14	0.04	-0.15	0.08
Lsat_1_v5_gn_2_16321.1 (LUT5)	0.44	0.1	-0.06	-0.13	0.03	-0.11	0.11	0.19	0.04	0.01	0.12	0.15	0.09	0.36	0.22	-0.11	0.0	-1.58	0.12	0.01	-0.07	-0.04	0.0	0.07	-0.03	-0.18	-0.13	0.31	-0.24	-0.27	-0.42
Lsat_1_v5_gn_2_3240.1	-0.34	-0.16	-0.19	0.17	0.47	0.54	-0.17	-0.23	-0.23	-0.21	0.0	-0.39	0.18	0.36	0.17	0.17	-0.11	-0.86	-0.09	-0.21	-0.06	0.16	-0.01	-0.17	-0.03	0.13	0.13	0.18	0.14	0.03	-0.14
Lsat_1_v5_gn_2_46060.1 (IAGLU)	0.33	0.59	-0.88	-1.44	-0.5	0.71	-0.12	-0.19	-0.36	-0.56	-0.43	-0.61	0.6	0.88	0.48	0.32	0.2	-2.19	0.13	-0.25	0.06	-0.08	1.28	-0.33	-0.2	0.15	-0.27	0.32	-1.07	-0.83	-0.42
Lsat_1_v5_gn_2_94460.1 (MEF14)	-0.68	-0.66	-0.36	-0.06	0.11	0.03	-0.23	-0.44	0.06	0.11	0.15	0.24	0.71	0.12	0.04	0.23	0.17	-0.51	-0.23	-0.04	-0.22	-0.11	0.1	-0.0	-0.04	0.21	0.12	-0.01	-0.09	0.12	0.3
Lsat_1_v5_gn_2_9501.1 (A/N-InvD)	-0.07	-0.31	-0.15	0.01	0.25	0.07	-0.26	-0.54	-0.27	0.03	-0.06	0.14	0.67	0.05	0.09	0.0	0.14	0.36	-0.3	-0.15	-0.25	-0.22	0.26	-0.09	0.05	-0.04	-0.09	0.07	-0.03	0.06	0.02
Lsat_1_v5_gn_2_96860.1 (MGT10)	0.2	-0.11	-0.09	-0.05	-0.12	0.09	0.26	0.25	-0.04	-0.04	-0.02	-0.04	0.14	0.1	0.05	0.09	0.06	-0.99	-0.33	-0.13	-0.04	0.06	0.54	-0.04	-0.07	0.13	0.16	0.11	-0.13	-0.21	-0.4
Lsat_1_v5_gn_2_97760.1	-0.04	-0.11	-0.22	-0.21	0.06	0.21	-0.11	-0.05	-0.2	-0.09	-0.02	0.01	0.25	-0.02	-0.23	0.02	0.0	-0.16	-0.02	-0.16	-0.04	0.16	0.21	-0.03	0.04	0.02	0.07	0.19	0.08	0.03	0.18
Lsat_1_v5_gn_3_129181.1	-0.15	-0.24	-0.87	-0.8	0.09	0.46	-0.08	0.04	-0.22	-0.52	-0.38	-0.61	-0.37	0.72	0.36	0.0	-0.2	-0.81	0.41	-0.16	-0.01	0.1	1.24	-0.0	0.11	-0.05	0.02	-0.15	0.09	0.0	-0.17
Lsat_1_v5_gn_3_16821.1 (CYK8)	-0.16	-0.13	-0.41	-0.43	0.12	0.31	0.08	0.13	-0.19	-0.25	-0.05	-0.09	0.02	0.39	0.26	-0.01	-0.09	-0.98	0.19	-0.07	-0.16	-0.02	0.5	0.09	0.03	0.01	0.05	-0.08	0.15	0.01	0.07
Lsat_1_v5_gn_3_22540.1 (Tic55)	-0.13	-0.27	-0.44	-0.35	-0.15	0.13	-0.01	-0.26	-0.15	-0.17	-0.06	-0.21	0.05	0.38	0.21	0.13	0.05	-0.62	0.13	-0.06	0.06	0.06	0.81	0.09	0.11	0.01	-0.04	0.07	0.04	0.07	-0.2
Lsat_1_v5_gn_3_27640.1	0.26	-0.13	-0.65	-1.06	0.09	0.55	0.08	0.04	-0.17	-0.16	0.04	-0.24	-0.24	0.6	0.38	0.09	-0.16	-3.13	0.27	-0.08	0.11	0.15	-0.11	0.27	0.18	0.13	0.18	-0.02	0.04	-0.12	0.02
Lsat_1_v5_gn_3_3161.1 (ClpT1)	-0.0	-0.47	-0.34	-0.25	0.06	0.07	-0.28	-0.41	-0.09	0.01	0.12	0.2	0.55	-0.1	-0.07	0.13	0.21	-0.89	-0.05	0.01	0.03	0.01	0.37	0.2	0.17	0.0	0.01	0.38	-0.19	-0.15	0.0
Lsat_1_v5_gn_3_32320.1	0.43	0.17	-0.08	-0.25	0.25	0.34	-0.11	-0.03	-0.06	-0.17	-0.03	-0.05	-0.06	0.53	0.07	-0.14	-0.14	-1.67	0.01	-0.18	-0.06	-0.01	0.3	0.08	-0.03	-0.0	0.03	0.12	0.01	-0.13	-0.22
Lsat_1_v5_gn_3_44281.1 (VHA-c5)	-0.18	-0.32	-0.35	-0.39	0.18	0.28	-0.11	-0.18	-0.14	0.03	-0.09	0.15	0.47	-0.28	-0.31	0.0	0.05	0.36	-0.43	-0.26	-0.06	0.09	0.36	-0.05	0.08	0.13	0.07	0.25	-0.02	0.02	0.07
Lsat_1_v5_gn_3_45540.1 (EDA30)	-0.15	-0.21	-0.27	-0.33	0.09	0.21	-0.03	-0.08	-0.18	0.02	0.02	-0.04	0.09	0.21	0.15	0.15	0.11	-0.43	0.04	-0.09	0.04	0.05	-0.14	-0.32	-0.06	0.15	0.12	0.18	0.14	0.09	0.17
Lsat_1_v5_gn_3_47561.1	0.4	0.2	0.02	-0.04	0.18	0.2	-0.07	-0.12	0.01	-0.07	-0.1	-0.12	-0.14	0.24	0.03	-0.14	-0.05	-1.8	-0.02	-0.13	0.02	0.07	0.22	0.03	0.02	0.03	0.04	0.07	0.15	-0.01	-0.06
Lsat_1_v5_gn_3_49320.1 (IAR4L)	0.24	-0.1	-0.31	-0.36	0.01	0.15	0.1	0.02	-0.27	-0.3	-0.23	-0.15	0.26	0.37	0.26	-0.09	-0.06	0.3	-0.07	-0.18	0.01	0.05	0.57	-0.16	-0.02	0.06	-0.01	0.37	-0.2	-0.38	-0.59
Lsat_1_v5_gn_3_53200.1 (NUDX26)	-0.03	-0.43	-0.6	-0.65	0.34	0.55	-0.17	-0.14	-0.21	-0.16	-0.03	-0.2	0.33	0.52	0.23	-0.2	-0.05	-0.66	0.03	-0.19	-0.06	0.09	0.55	-0.04	0.15	0.08	-0.14	0.07	-0.16	-0.06	0.24
Lsat_1_v5_gn_3_54960.1	-	-	-	-	-	0.52	1.5	2.29	-	-	-	-	1.34	-	0.12	0.84	0.5	1.79	-0.49	-1.94	-0.84	-0.97	2.51	-1.74	0.5	-1.69	-	0.8	-	-4.87	-
Lsat_1_v5_gn_3_94020.1 (HCF164)	0.15	-0.23	-0.32	-0.24	0.29	0.4	-0.65	-0.01	-0.38	-0.39	-0.05	-0.18	0.1	0.33	0.06	-0.09	-0.17	-1.79	0.31	-0.21	-0.0	0.14	0.8	0.08	0.13	-0.04	-0.06	0.24	0.18	0.04	-0.03
Lsat_1_v5_gn_4_137440.1 (ABCF5)	-0.14	-0.23	-1.05	-1.18	-0.03	0.45	0.41	0.32	-0.08	-0.16	-0.11	-0.32	-0.13	0.34	0.29	0.1	-0.04	-2.07	0.31	-0.07	0.06	0.13	0.54	0.08	0.09	0.04	-0.04	0.15	0.21	0.04	-0.09
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Details

Dark gray cells indicate values where the raw expression is zero (cannot be log-transformed). Blue cells indicate samples where the expression of the gene is below average and red cells indicate the gene is expressed above average in the sample. White cells are average.