Heatmap: Cluster_38 (Lactuca sativa (Lsa) Coexpression Clusters (HCCA Algorithm))

View as: (view raw or row-normalized)

View using InCHLib : here ( Experimental feature, still under development)

(Values are log₂ transformed ratios of a genes expression in a sample divided by the mean expression level)

Gene	Light: 268 uE m-2 s-1	Light: 202.5 uE m-2 s-1 (Control)	Light: 135 uE m-2 s-1	Light: 67.5 uE m-2 s-1	Photoperiod: L24	Photoperiod: L20D4 (Control)	Photoperiod: L12D12	Photoperiod: L8D16	RBW: 4:1:1 (Control)	RBW: 4:1:0	RBW: 3:1:1	RBW: 3:1:0	Nitrogen: 0%	Nitrogen: 25%	Nitrogen: 50%	Nitrogen: 100% (Control)	Nitrogen: 150%	Phosphorous: 0%	Phosphorous: 25%	Phosphorous: 50%	Phosphorous: 100% (Control)	Phosphorous: 150%	Potassium: 0%	Potassium: 25%	Potassium: 50%	Potassium: 100% (Control)	Potassium: 150%	Temperature: 20°C	Temperature: 25°C (Control)	Temperature: 30°C	Temperature: 35°C
Lsat_1_v5_gn_0_16821.1 (LRX9)	-	-	-	-	-	-	4.95	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-
Lsat_1_v5_gn_0_25701.1 (VHA-A)	-	-	-	-	-	-	4.95	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-
Lsat_1_v5_gn_0_31201.1 (VDD)	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	3.38	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	4.36	-
Lsat_1_v5_gn_0_46281.1 (HRS1)	0.35	-	-0.02	1.31	1.74	2.44	2.62	0.81	-20.64	-6.52	-0.89	-	-	0.92	-1.79	-18.63	-16.6	0.8	-0.11	-0.11	-7.91	-4.54	-0.19	-12.27	-20.64	-1.34	-	0.1	-0.23	-	-24.85
Lsat_1_v5_gn_0_6040.1	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	3.98	-	2.96	-	-	-	-	-	-	-	-	-	2.9	-
Lsat_1_v5_gn_0_6721.1	-	-	-	-	-	-	4.28	-	-	-	-	-	-	-	-	-	3.53	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-
Lsat_1_v5_gn_1_109481.1	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	3.16	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	4.46	-
Lsat_1_v5_gn_1_118581.1 (RHON1)	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	3.28	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	4.41	-
Lsat_1_v5_gn_1_21240.1 (D2HGDH)	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	4.95	-
Lsat_1_v5_gn_1_29841.1 (RHD2)	-0.71	-	0.23	0.8	-	-1.16	-	-0.92	-	-	-	-1.13	-	-	-	0.3	-	2.52	-	-0.33	-	-	2.57	-	-	-	0.26	-1.35	-1.01	2.53	2.16
Lsat_1_v5_gn_1_67100.1 (DGL)	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	4.45	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	3.2	-
Lsat_1_v5_gn_1_6921.1 (ATPA)	-	-	-	-	-	-	4.17	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	3.71
Lsat_1_v5_gn_1_74460.1	-	-	-	-	2.1	-	3.23	-	0.9	-	-	-	-	-	2.28	1.24	-	1.83	-	-	-	-	-	-	1.11	-	-	-	-	1.33	-
Lsat_1_v5_gn_1_77401.1	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	4.95	-
Lsat_1_v5_gn_1_95440.1 (EDA18)	-	-	-	-	-	-	3.68	-	-	-	-	-	-	-	-	-	2.2	2.98	-	-	-	-	2.5	-	-	-	-	-	-	-	-
Lsat_1_v5_gn_1_98321.1	-	-	-	-	-	-	4.95	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-
Lsat_1_v5_gn_2_40000.1 (RIC7)	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	4.95	-
Lsat_1_v5_gn_2_70561.1 (ACCD)	-	3.34	-	-	-	-	4.01	-	-	-	-	-	-	-	2.24	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-
Lsat_1_v5_gn_2_73260.1 (FIP1)	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	4.95	-
Lsat_1_v5_gn_2_8501.1 (GH9B5)	-	-	-	-	0.92	-	1.32	1.38	-	-	-	-	-	1.35	-	-	2.72	2.68	-	-	-	-	2.65	-	-	-	-	-	-	-	1.14
Lsat_1_v5_gn_2_85360.1 (FRK7)	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	4.95	-
Lsat_1_v5_gn_3_112240.1	-	-	-	-	-	-	2.34	-	2.85	-	-	1.61	-	-	-	0.34	-	-	-	0.99	-	0.34	-	0.06	-	0.89	0.0	0.96	-	2.41	-
Lsat_1_v5_gn_3_116660.1 (CtpB)	-	-	-	-	-	-	4.95	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-
Lsat_1_v5_gn_3_22320.1	-	-	-	-	-	-	2.74	-	-	-	-	-	1.63	-	-	-	1.48	-	-	-	-	-	3.11	-	-	-	-	-	1.71	2.71	-
Lsat_1_v5_gn_4_185780.1	-	-	-	-	-	3.59	3.14	2.23	-	-	-	-	-	2.45	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-
Lsat_1_v5_gn_4_2761.1 (KJK)	-	-	-	-	-	0.19	2.74	0.47	1.83	-	-	-	2.36	0.69	0.53	0.78	-	2.8	-	-	-	-	0.43	-	-	-	-	-	-	-	-
Lsat_1_v5_gn_4_45660.1 (HB5)	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	4.95	-
Lsat_1_v5_gn_4_6241.1 (CNGC18)	-	-	-	-	-	-	4.95	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-
Lsat_1_v5_gn_4_68821.1	-	0.17	-	-	-0.27	-	2.31	-0.94	-1.19	-	-	0.96	-	0.14	1.48	-	0.9	-1.33	-0.13	-1.05	0.44	-1.07	1.49	-	-1.07	0.32	-12.28	-0.11	1.73	0.19	0.92
Lsat_1_v5_gn_4_70460.1	-	-	-	-	1.31	-	3.38	1.51	-	-	-	-	-	-	-	-	1.24	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	2.44	2.9
Lsat_1_v5_gn_4_88121.1 (CYP57)	-	-	-	-	-	-	-	-	-	3.01	-	-	-	-	3.18	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	3.79	-
Lsat_1_v5_gn_4_95640.1 (PATROL1)	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	4.95	-
Lsat_1_v5_gn_5_111301.1 (ADF11)	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	3.35	-	-	-	-	-	-	-	4.38	-
Lsat_1_v5_gn_5_160100.1	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	4.95	-
Lsat_1_v5_gn_5_41360.1 (IREH1)	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	2.95	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	3.93	3.0
Lsat_1_v5_gn_5_50481.1 (RPL22)	-	-	-	-	-	-	4.95	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-
Lsat_1_v5_gn_5_56060.1	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	4.95	-
Lsat_1_v5_gn_5_74941.1 (GPAT1)	-	-	-	-	2.57	-	1.75	1.52	-	-	-	-	-	1.91	3.52	1.86	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-
Lsat_1_v5_gn_6_103521.1	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	4.95	-
Lsat_1_v5_gn_6_16320.1	-	-	-	-	-	-	4.31	-	2.46	2.51	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-
Lsat_1_v5_gn_6_23060.1 (PK3)	-	-	-	-	-	-	4.95	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-
Lsat_1_v5_gn_6_31441.1 (PKp3)	-	-	-	-	-	-	3.47	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	3.28	-	-	-	-	-	3.35	-	-	-	-	-	-
Lsat_1_v5_gn_6_32000.1 (ARS1)	-	-	-	-	1.24	-0.57	-	-	-	-0.55	1.45	1.59	2.89	-	-	-	-1.69	-0.64	-	-0.06	-1.77	-	-	-1.63	-0.02	0.18	0.99	0.33	-	1.93	1.27
Lsat_1_v5_gn_6_32980.1	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	4.07	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	3.83	-
Lsat_1_v5_gn_6_37940.1 (AR2)	-	-	-	-	-	-	4.95	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-
Lsat_1_v5_gn_6_59741.1 (TPS14)	-	-	-	-	-	-	3.87	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	3.59	-	-	-	-	-	-	-	2.1
Lsat_1_v5_gn_6_62541.1 (H2B)	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	4.95	-
Lsat_1_v5_gn_6_73621.1	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	4.95	-
Lsat_1_v5_gn_6_77221.1 (LecRK-IX.1)	-	-	-	-	-	-	-	0.94	0.89	-	-	-	-	-	2.51	-	-	-	-	0.64	-	-	-	-	-	-	2.55	-	-	3.82	-
Lsat_1_v5_gn_7_105920.1	-	-	-	-	-	-	3.54	-	-	-	-	2.23	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	3.87	-	-	-	-	-	-	-	-
Lsat_1_v5_gn_7_106121.1	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	4.95	-
Lsat_1_v5_gn_7_114741.1 (GCN4)	-	-	-	-	-	-	3.42	-	-	-	-	-	-	2.35	2.37	-	2.37	-	-	-	-	-	2.28	-	-	-	-	-	-	-	-
Lsat_1_v5_gn_7_115460.1	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	4.95	-
Lsat_1_v5_gn_7_115481.1 (CYR1)	-	-	-	-	-	-	2.12	-	-	-	-	-	2.0	-	-	-	-	3.23	-	1.63	-	2.01	-	-	-	-	-	-	-	2.63	-
Lsat_1_v5_gn_7_1560.1	-	-	3.47	-	-	-	3.3	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	3.33	-	-	-	-	-	-	-	-
Lsat_1_v5_gn_7_28201.1 (GA2OX1)	-	-	-	-	-	-	0.73	-	-	0.49	-	0.58	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	1.7	-	2.08	-	1.39	-	2.16	3.57	-
Lsat_1_v5_gn_7_39260.1 (SR34b)	1.18	0.15	-	1.67	-	-	1.89	-0.21	-0.29	-0.23	-0.49	-	-	0.9	1.26	0.86	0.66	0.48	-	-0.4	-	-	-	1.2	-	-0.53	0.69	-0.39	-	-	1.19
Lsat_1_v5_gn_7_41860.1	-	-	3.66	-	-	-	3.41	-	-	2.96	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-
Lsat_1_v5_gn_7_5761.1 (PSBD)	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-21.69	-	-	-	-	-	-	-	-	3.13	-	-	-	-	-	-	4.48	-
Lsat_1_v5_gn_7_58740.1	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	4.95	-
Lsat_1_v5_gn_7_61501.1 (CASPL4A3)	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	4.95	-
Lsat_1_v5_gn_7_8760.1	-	-	-	-	2.64	-	2.77	-	-	2.59	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	2.49	2.65	-	-	-	-	-	-
Lsat_1_v5_gn_7_98620.1 (LACS5)	-	-	-	-	-	3.01	3.07	2.23	-	-	-	-	-	3.3	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-
Lsat_1_v5_gn_8_109660.1 (AtSEC23B)	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	2.37	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	2.1	-	-	-	-	-	3.66	3.15
Lsat_1_v5_gn_8_136380.1 (ISTL10)	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	3.96	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	3.95	-
Lsat_1_v5_gn_8_27941.1 (CYP96A2)	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	3.69	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	4.18	-
Lsat_1_v5_gn_8_44140.1 (mTERF34)	-	-	-	-	-	-	3.54	-	2.75	-	-	-	-	-	-	2.29	-	-	-	-	-	-	2.95	-	-	-	-	-	-	-	-
Lsat_1_v5_gn_8_5000.1 (FKBP15-2)	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	3.38	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	4.37	-
Lsat_1_v5_gn_8_54580.1	-	-	-	-	-	1.99	-	1.12	-	-	-	1.06	-	-	-	-	-	-	-	-	-	1.12	-	0.91	-	1.71	-	-	-	3.53	1.97
Lsat_1_v5_gn_8_94880.1 (IBM1)	-	-	1.57	1.64	-	-	-	-	2.26	-	1.45	-	-	-	1.4	-	-	-	-	-	-	-	2.53	-	-	-	-	-	-	3.17	-
Lsat_1_v5_gn_8_98201.1 (SCPL32)	-	-	-	-	1.63	-	2.42	-	0.64	-	-	-	-	1.95	-	1.26	-	-	-	1.57	-	-	-	-	-	0.44	2.48	-	-	0.66	1.71
Lsat_1_v5_gn_9_117121.1 (STP10)	-	0.51	-	-	0.85	-	1.92	-0.01	2.28	2.31	-	-	-	-	-	-	0.26	-	-	-0.02	-	-	2.5	-	-	0.1	-	-	0.2	-	1.64
Lsat_1_v5_gn_9_14140.1	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	4.95	-
Lsat_1_v5_gn_9_15580.1	-	-	-	-	-	3.91	4.0	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-
Lsat_1_v5_gn_9_21560.1 (NIK2)	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	2.81	-	-	-	-	-	-	4.59	-
Lsat_1_v5_gn_9_39480.1	-	-	-	-	-	-	4.95	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-
Lsat_1_v5_gn_9_52561.1	-	-	-	-	2.14	-	3.26	-	-	-	-	-	-	-	-	2.27	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	3.6	-
Lsat_1_v5_gn_9_62801.1 (FHY3)	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	4.95	-
Lsat_1_v5_gn_9_84361.1 (PRX40)	-	-	-	-	-	-	4.03	-	-	-	-	-	2.9	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	2.85
Lsat_1_v5_gn_9_92020.1 (GGL23)	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	4.95	-

Details

Dark gray cells indicate values where the raw expression is zero (cannot be log-transformed). Blue cells indicate samples where the expression of the gene is below average and red cells indicate the gene is expressed above average in the sample. White cells are average.