1. Home
  2. Tools
  3. Expression Heatmap
  4. Results

Heatmap: Cluster_206 (Lactuca sativa (Lsa) Coexpression Clusters (HCCA Algorithm))

View as: (view raw or zlog-transformed)

View using InCHLib : here ( Experimental feature, still under development)

(Values are normalized against highest expression of the row)

 Transpose table  Download table
Gene
Light: 268 uE m-2 s-1
Light: 202.5 uE m-2 s-1 (Control)
Light: 135 uE m-2 s-1
Light: 67.5 uE m-2 s-1
Photoperiod: L24
Photoperiod: L20D4 (Control)
Photoperiod: L12D12
Photoperiod: L8D16
RBW: 4:1:1 (Control)
RBW: 4:1:0
RBW: 3:1:1
RBW: 3:1:0
Nitrogen: 0%
Nitrogen: 25%
Nitrogen: 50%
Nitrogen: 100% (Control)
Nitrogen: 150%
Phosphorous: 0%
Phosphorous: 25%
Phosphorous: 50%
Phosphorous: 100% (Control)
Phosphorous: 150%
Potassium: 0%
Potassium: 25%
Potassium: 50%
Potassium: 100% (Control)
Potassium: 150%
Temperature: 20°C
Temperature: 25°C (Control)
Temperature: 30°C
Temperature: 35°C
0.33 0.33 0.28 0.25 0.56 0.49 0.32 0.36 0.28 0.29 0.32 0.29 0.37 0.65 0.57 0.37 0.33 0.73 0.35 0.29 0.32 0.34 1.0 0.27 0.32 0.31 0.34 0.34 0.37 0.34 0.35
0.3 0.3 0.24 0.27 0.69 0.55 0.23 0.25 0.25 0.27 0.26 0.25 0.26 0.56 0.52 0.34 0.28 0.6 0.32 0.23 0.3 0.28 1.0 0.2 0.23 0.26 0.3 0.3 0.34 0.32 0.27
0.28 0.26 0.27 0.26 0.59 0.57 0.27 0.28 0.26 0.25 0.33 0.27 0.38 0.58 0.5 0.33 0.27 0.59 0.36 0.27 0.28 0.33 1.0 0.26 0.31 0.29 0.35 0.29 0.42 0.37 0.44
0.28 0.36 0.28 0.31 0.66 0.53 0.22 0.19 0.29 0.29 0.32 0.3 0.31 0.6 0.56 0.35 0.28 0.66 0.37 0.23 0.25 0.28 1.0 0.24 0.25 0.26 0.29 0.26 0.41 0.39 0.46
0.39 0.34 0.26 0.29 0.79 0.7 0.29 0.24 0.35 0.32 0.37 0.33 0.33 0.78 0.71 0.41 0.31 0.58 0.42 0.3 0.32 0.39 1.0 0.33 0.34 0.29 0.36 0.33 0.55 0.48 0.46
0.54 0.46 0.46 0.47 0.79 0.69 0.42 0.41 0.39 0.43 0.39 0.37 0.49 0.82 0.65 0.43 0.39 0.65 0.52 0.38 0.42 0.44 1.0 0.41 0.4 0.41 0.41 0.47 0.51 0.45 0.49
0.17 0.13 0.08 0.09 0.41 0.32 0.17 0.14 0.15 0.14 0.14 0.1 0.11 0.34 0.43 0.21 0.14 0.63 0.23 0.15 0.17 0.15 1.0 0.14 0.14 0.12 0.16 0.17 0.23 0.17 0.13
0.23 0.22 0.2 0.22 0.46 0.41 0.2 0.2 0.22 0.24 0.27 0.22 0.24 0.53 0.52 0.27 0.22 0.72 0.31 0.25 0.26 0.26 1.0 0.21 0.24 0.25 0.26 0.25 0.35 0.27 0.26
0.34 0.31 0.29 0.27 0.65 0.47 0.25 0.25 0.27 0.26 0.28 0.26 0.26 0.59 0.58 0.34 0.25 0.58 0.28 0.23 0.26 0.26 1.0 0.22 0.24 0.25 0.26 0.27 0.38 0.35 0.34
0.17 0.18 0.14 0.15 0.43 0.32 0.1 0.11 0.14 0.15 0.18 0.15 0.16 0.47 0.44 0.21 0.16 0.73 0.23 0.13 0.16 0.17 1.0 0.14 0.16 0.16 0.17 0.17 0.28 0.23 0.18
0.32 0.28 0.25 0.26 0.46 0.44 0.31 0.29 0.23 0.23 0.29 0.27 0.34 0.47 0.5 0.32 0.28 0.84 0.33 0.23 0.28 0.28 1.0 0.24 0.28 0.3 0.26 0.32 0.34 0.31 0.32
0.46 0.44 0.4 0.37 0.63 0.61 0.46 0.41 0.44 0.46 0.47 0.45 0.51 0.61 0.56 0.49 0.45 0.51 0.51 0.4 0.41 0.43 1.0 0.43 0.43 0.41 0.43 0.46 0.49 0.49 0.51
0.26 0.27 0.27 0.28 0.47 0.4 0.23 0.22 0.21 0.23 0.24 0.21 0.24 0.64 0.49 0.27 0.22 0.68 0.28 0.21 0.22 0.23 1.0 0.22 0.21 0.24 0.25 0.17 0.32 0.31 0.28
0.34 0.24 0.22 0.27 0.63 0.45 0.15 0.15 0.15 0.11 0.14 0.09 0.17 0.51 0.42 0.17 0.09 0.58 0.17 0.09 0.14 0.18 1.0 0.14 0.15 0.15 0.15 0.13 0.23 0.14 0.18
0.11 0.13 0.09 0.07 0.54 0.3 0.08 0.1 0.14 0.14 0.17 0.11 0.17 0.39 0.34 0.15 0.12 0.52 0.18 0.11 0.12 0.14 1.0 0.13 0.14 0.13 0.14 0.12 0.19 0.16 0.26
0.08 0.04 0.02 0.03 0.4 0.17 0.01 0.01 0.02 0.02 0.07 0.03 0.06 0.22 0.19 0.03 0.02 0.62 0.04 0.02 0.04 0.03 1.0 0.02 0.04 0.03 0.02 0.03 0.04 0.04 0.03
0.06 0.1 0.04 0.04 0.42 0.39 0.06 0.09 0.07 0.07 0.09 0.05 0.18 0.43 0.41 0.17 0.09 0.52 0.19 0.07 0.12 0.12 1.0 0.1 0.1 0.09 0.14 0.08 0.24 0.2 0.23
0.09 0.02 0.03 0.01 0.47 0.28 0.05 0.05 0.06 0.07 0.09 0.05 0.11 0.31 0.31 0.09 0.08 0.67 0.12 0.04 0.08 0.12 1.0 0.08 0.09 0.09 0.07 0.05 0.1 0.07 0.15
0.35 0.36 0.3 0.31 0.84 0.6 0.25 0.23 0.29 0.31 0.34 0.28 0.33 0.69 0.7 0.38 0.31 0.6 0.37 0.26 0.31 0.32 1.0 0.28 0.27 0.31 0.31 0.33 0.39 0.41 0.41
0.26 0.26 0.14 0.16 0.68 0.5 0.21 0.19 0.25 0.23 0.24 0.22 0.29 0.4 0.37 0.27 0.23 0.66 0.26 0.21 0.27 0.26 1.0 0.22 0.21 0.26 0.27 0.29 0.33 0.31 0.25
0.1 0.08 0.05 0.1 0.54 0.28 0.1 0.12 0.12 0.12 0.14 0.12 0.12 0.32 0.32 0.14 0.1 0.62 0.15 0.12 0.1 0.13 1.0 0.11 0.11 0.11 0.13 0.11 0.21 0.18 0.18
0.11 0.07 0.07 0.04 0.6 0.35 0.02 0.02 0.09 0.1 0.1 0.07 0.11 0.43 0.49 0.19 0.11 0.6 0.12 0.04 0.05 0.1 1.0 0.1 0.09 0.08 0.14 0.07 0.16 0.14 0.09
0.14 0.19 0.16 0.14 0.65 0.47 0.12 0.14 0.21 0.21 0.23 0.17 0.15 0.53 0.44 0.26 0.18 0.72 0.18 0.16 0.18 0.19 1.0 0.13 0.16 0.19 0.22 0.11 0.31 0.3 0.25
0.17 0.28 0.08 0.03 0.56 0.31 0.03 0.08 0.07 0.1 0.06 0.05 0.1 0.25 0.33 0.13 0.1 0.62 0.19 0.09 0.16 0.12 1.0 0.14 0.17 0.08 0.17 0.14 0.2 0.17 0.08
0.25 0.29 0.22 0.22 0.5 0.41 0.22 0.21 0.16 0.17 0.19 0.16 0.21 0.66 0.52 0.22 0.17 0.75 0.27 0.17 0.17 0.17 1.0 0.18 0.18 0.17 0.2 0.18 0.3 0.26 0.29
0.13 0.07 0.06 0.04 0.6 0.43 0.03 0.04 0.11 0.1 0.15 0.08 0.1 0.45 0.45 0.23 0.11 0.63 0.14 0.07 0.08 0.1 1.0 0.09 0.09 0.06 0.13 0.07 0.19 0.14 0.11
0.29 0.4 0.25 0.31 0.76 0.62 0.36 0.37 0.38 0.34 0.41 0.35 0.35 0.67 0.74 0.46 0.38 0.69 0.42 0.34 0.33 0.4 1.0 0.33 0.35 0.41 0.42 0.4 0.47 0.45 0.38
0.24 0.25 0.21 0.27 0.57 0.51 0.25 0.23 0.24 0.25 0.25 0.23 0.3 0.63 0.53 0.32 0.26 0.6 0.33 0.23 0.25 0.27 1.0 0.22 0.24 0.24 0.24 0.22 0.4 0.36 0.46
0.27 0.28 0.25 0.3 0.51 0.46 0.24 0.25 0.26 0.25 0.28 0.24 0.32 0.61 0.48 0.29 0.23 0.72 0.26 0.21 0.23 0.26 1.0 0.22 0.22 0.25 0.28 0.23 0.36 0.34 0.4
0.36 0.34 0.32 0.33 0.59 0.54 0.34 0.35 0.33 0.34 0.34 0.32 0.43 0.53 0.49 0.41 0.33 0.49 0.41 0.35 0.35 0.36 1.0 0.35 0.33 0.35 0.38 0.35 0.42 0.41 0.45
0.12 0.06 0.03 0.04 0.63 0.31 0.05 0.03 0.07 0.06 0.07 0.05 0.11 0.24 0.28 0.11 0.05 0.36 0.11 0.05 0.08 0.11 1.0 0.08 0.08 0.07 0.1 0.1 0.15 0.14 0.08
0.35 0.29 0.24 0.21 0.6 0.45 0.25 0.27 0.23 0.21 0.27 0.26 0.25 0.59 0.52 0.27 0.21 0.65 0.28 0.2 0.25 0.25 1.0 0.21 0.23 0.26 0.26 0.2 0.3 0.29 0.26
0.13 0.15 0.07 0.06 0.8 0.44 0.13 0.1 0.23 0.21 0.22 0.22 0.33 0.56 0.47 0.21 0.15 0.82 0.24 0.13 0.21 0.28 1.0 0.13 0.18 0.18 0.21 0.13 0.27 0.3 0.32
0.13 0.1 0.06 0.02 0.58 0.4 0.07 0.05 0.12 0.06 0.12 0.08 0.13 0.42 0.48 0.13 0.08 0.54 0.18 0.08 0.11 0.12 1.0 0.1 0.13 0.12 0.17 0.1 0.12 0.09 0.07
0.15 0.07 0.06 0.06 0.52 0.4 0.08 0.09 0.1 0.09 0.13 0.09 0.15 0.36 0.3 0.15 0.09 0.32 0.15 0.07 0.13 0.14 1.0 0.11 0.13 0.13 0.16 0.12 0.19 0.18 0.15
0.17 0.18 0.13 0.13 0.45 0.29 0.11 0.12 0.13 0.12 0.13 0.12 0.16 0.41 0.36 0.15 0.13 0.76 0.16 0.11 0.15 0.15 1.0 0.15 0.15 0.15 0.14 0.13 0.19 0.18 0.21
0.16 0.15 0.09 0.1 0.68 0.42 0.16 0.17 0.15 0.14 0.15 0.13 0.22 0.47 0.49 0.22 0.16 0.44 0.21 0.13 0.16 0.18 1.0 0.16 0.16 0.16 0.18 0.23 0.25 0.21 0.16
0.38 0.4 0.33 0.26 0.54 0.47 0.36 0.36 0.25 0.26 0.3 0.26 0.38 0.58 0.54 0.36 0.33 0.83 0.34 0.29 0.32 0.32 1.0 0.31 0.32 0.3 0.32 0.39 0.38 0.35 0.33
0.06 0.07 0.07 0.11 0.41 0.26 0.08 0.08 0.07 0.07 0.07 0.05 0.14 0.37 0.37 0.14 0.08 0.73 0.11 0.06 0.09 0.08 1.0 0.06 0.07 0.07 0.07 0.09 0.1 0.09 0.06
0.17 0.13 0.04 0.03 0.55 0.21 0.07 0.09 0.11 0.1 0.11 0.08 0.13 0.36 0.37 0.12 0.08 0.72 0.12 0.09 0.14 0.13 1.0 0.08 0.12 0.07 0.11 0.11 0.16 0.14 0.11
0.21 0.2 0.24 0.23 0.52 0.33 0.18 0.17 0.2 0.21 0.24 0.18 0.2 0.63 0.52 0.21 0.18 0.57 0.23 0.17 0.17 0.17 1.0 0.17 0.17 0.17 0.18 0.16 0.28 0.26 0.28
0.34 0.34 0.33 0.32 0.6 0.51 0.31 0.3 0.28 0.31 0.33 0.3 0.37 0.51 0.47 0.37 0.33 0.81 0.34 0.3 0.32 0.34 1.0 0.28 0.32 0.33 0.34 0.33 0.4 0.39 0.36
0.3 0.3 0.27 0.26 0.52 0.42 0.23 0.19 0.22 0.24 0.27 0.25 0.28 0.58 0.48 0.31 0.26 0.84 0.27 0.22 0.25 0.25 1.0 0.22 0.24 0.25 0.25 0.24 0.36 0.33 0.34
0.43 0.44 0.39 0.42 0.58 0.59 0.36 0.34 0.33 0.32 0.34 0.3 0.38 0.65 0.55 0.38 0.33 0.69 0.33 0.29 0.33 0.32 1.0 0.32 0.31 0.33 0.34 0.33 0.42 0.36 0.35
0.19 0.24 0.2 0.28 0.71 0.44 0.18 0.17 0.25 0.3 0.35 0.25 0.37 0.54 0.51 0.32 0.24 0.72 0.26 0.19 0.22 0.29 1.0 0.27 0.21 0.24 0.22 0.25 0.4 0.33 0.44
0.36 0.28 0.26 0.2 0.83 0.54 0.16 0.16 0.18 0.18 0.19 0.15 0.22 0.68 0.54 0.26 0.16 0.62 0.28 0.13 0.17 0.23 1.0 0.14 0.15 0.19 0.16 0.18 0.33 0.25 0.28
0.17 0.13 0.06 0.06 0.73 0.47 0.12 0.11 0.24 0.21 0.18 0.13 0.12 0.43 0.49 0.22 0.12 0.47 0.2 0.11 0.21 0.25 1.0 0.15 0.19 0.18 0.22 0.17 0.3 0.26 0.18
0.05 0.02 0.02 0.02 0.54 0.44 0.04 0.03 0.09 0.08 0.08 0.06 0.16 0.33 0.41 0.14 0.1 0.77 0.11 0.06 0.09 0.12 1.0 0.09 0.1 0.1 0.13 0.09 0.13 0.13 0.09
0.24 0.29 0.17 0.16 0.54 0.32 0.14 0.14 0.16 0.17 0.19 0.15 0.13 0.44 0.42 0.2 0.16 0.59 0.2 0.16 0.15 0.17 1.0 0.16 0.16 0.15 0.16 0.17 0.26 0.26 0.18
0.09 0.08 0.06 0.09 0.64 0.36 0.06 0.06 0.1 0.09 0.11 0.09 0.11 0.43 0.34 0.16 0.1 0.35 0.11 0.08 0.09 0.12 1.0 0.09 0.11 0.11 0.13 0.09 0.2 0.19 0.26
0.21 0.19 0.13 0.17 0.93 0.49 0.14 0.11 0.2 0.19 0.22 0.18 0.16 0.68 0.6 0.28 0.19 0.41 0.24 0.14 0.16 0.19 1.0 0.17 0.18 0.17 0.23 0.17 0.3 0.31 0.33
0.14 0.12 0.04 0.03 0.48 0.34 0.04 0.03 0.06 0.05 0.07 0.03 0.12 0.38 0.33 0.12 0.06 0.7 0.12 0.04 0.11 0.1 1.0 0.06 0.06 0.09 0.11 0.06 0.12 0.09 0.03
0.32 0.32 0.24 0.21 0.61 0.44 0.21 0.19 0.2 0.21 0.25 0.21 0.3 0.54 0.49 0.3 0.22 0.87 0.29 0.19 0.2 0.22 1.0 0.19 0.23 0.22 0.21 0.22 0.32 0.3 0.28

Details

Expression values normalized per gene (using the maximum value, Green cells indicate low expression and red high. (Dark gray cells indicate missing values)