Heatmap: Cluster_98 (Lactuca sativa (Lsa) Coexpression Clusters (HCCA Algorithm))

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(Values are log2 transformed ratios of a genes expression in a sample divided by the mean expression level)

Gene
Light: 268 uE m-2 s-1
Light: 202.5 uE m-2 s-1 (Control)
Light: 135 uE m-2 s-1
Light: 67.5 uE m-2 s-1
Photoperiod: L24
Photoperiod: L20D4 (Control)
Photoperiod: L12D12
Photoperiod: L8D16
RBW: 4:1:1 (Control)
RBW: 4:1:0
RBW: 3:1:1
RBW: 3:1:0
Nitrogen: 0%
Nitrogen: 25%
Nitrogen: 50%
Nitrogen: 100% (Control)
Nitrogen: 150%
Phosphorous: 0%
Phosphorous: 25%
Phosphorous: 50%
Phosphorous: 100% (Control)
Phosphorous: 150%
Potassium: 0%
Potassium: 25%
Potassium: 50%
Potassium: 100% (Control)
Potassium: 150%
Temperature: 20°C
Temperature: 25°C (Control)
Temperature: 30°C
Temperature: 35°C
-0.73 -0.63 -0.42 -0.3 0.46 0.45 -0.69 -0.88 -0.29 -0.18 -0.05 -0.3 -0.19 0.62 0.42 -0.08 -0.38 0.6 -0.28 -0.48 -0.36 -0.38 1.98 -0.46 -0.31 -0.35 -0.25 -0.54 0.01 -0.1 -0.01
-1.48 -1.45 -1.47 -0.93 0.79 0.5 -1.33 -1.29 -0.6 -0.65 -0.23 -0.62 0.17 1.01 0.44 -0.07 -0.42 0.74 -0.08 -0.6 -0.68 -0.39 2.14 -0.51 -0.34 -0.33 -0.47 -0.82 0.23 0.25 0.51
-0.48 -0.6 -0.47 -0.34 0.27 0.14 -0.45 -0.26 -0.46 -0.66 -0.38 -0.51 -0.03 0.84 0.71 -0.13 -0.38 0.63 -0.04 -0.5 -0.48 -0.32 1.67 -0.44 -0.38 -0.34 -0.17 -0.57 0.3 0.03 0.37
-0.14 -0.31 -0.57 -0.69 0.52 0.51 -0.84 -0.85 -0.5 -0.57 -0.3 -0.52 -0.35 0.88 0.36 -0.12 -0.63 0.68 0.02 -0.65 -0.35 -0.22 1.8 -0.26 -0.23 -0.23 -0.28 -0.65 0.11 0.02 0.22
-2.75 -1.26 -2.32 -1.9 0.18 -0.3 -1.05 -3.09 -0.69 -0.12 -1.16 -0.97 -1.06 1.28 0.78 -0.86 -0.38 0.6 -0.98 -0.37 -1.14 -0.24 2.98 -0.82 -1.24 -1.03 -0.65 -1.11 0.25 0.3 0.97
-0.91 -0.68 -1.23 -0.77 0.38 0.17 -0.56 -0.17 -0.5 -0.47 -0.38 -0.57 -0.0 0.74 0.58 -0.22 -0.52 0.74 -0.26 -0.49 -0.42 -0.39 2.19 -0.51 -0.59 -0.53 -0.33 -0.48 0.14 0.01 0.36
-0.75 -0.7 -1.29 -1.16 0.73 0.41 -0.67 -0.18 -0.89 -0.93 -0.66 -0.73 0.0 1.2 0.95 -0.2 -0.46 0.64 -0.16 -0.71 -0.56 -0.69 2.22 -0.58 -0.53 -0.56 -0.46 -0.68 0.13 -0.16 -0.18
-0.31 -0.24 -0.16 0.06 0.51 0.2 -0.25 -0.37 -0.18 -0.28 -0.11 -0.39 -0.27 0.66 0.36 -0.13 -0.32 0.32 -0.13 -0.31 -0.33 -0.23 1.25 -0.37 -0.31 -0.24 -0.17 -0.31 0.22 0.04 0.16
-0.99 -0.88 -0.96 -0.8 0.84 0.66 -1.24 -1.71 -0.52 -0.6 -0.48 -1.02 -0.77 0.82 0.67 -0.07 -0.71 1.26 -0.16 -0.76 -0.53 -0.69 2.34 -0.65 -0.58 -0.47 -0.22 -0.81 0.09 -0.01 -0.12
0.01 -0.2 -0.2 -0.07 0.35 0.25 -0.21 -0.33 -0.22 -0.24 -0.23 -0.35 -0.1 0.66 0.46 -0.1 -0.29 0.37 -0.37 -0.46 -0.33 -0.34 1.29 -0.45 -0.37 -0.31 -0.3 -0.36 0.22 0.14 0.26
-0.6 -0.33 -0.7 -0.54 0.26 0.16 -0.36 -0.36 -0.09 -0.1 -0.09 -0.3 -0.28 0.67 0.23 -0.1 -0.2 0.29 -0.11 -0.23 -0.23 -0.2 1.61 -0.48 -0.24 -0.17 -0.2 -0.17 0.25 0.1 0.15
-0.1 -0.46 -0.36 -0.13 0.68 0.3 -0.76 -0.98 -0.38 -0.58 -0.32 -0.58 -0.07 0.84 0.63 -0.06 -0.44 0.86 0.08 -0.44 -0.47 -0.26 1.53 -0.74 -0.37 -0.41 -0.31 -0.45 0.09 -0.17 0.19
-0.23 -0.35 -0.24 -0.18 0.32 0.08 -0.42 -0.64 -0.34 -0.35 -0.22 -0.28 -0.2 0.64 0.32 -0.11 -0.24 0.52 -0.1 -0.54 -0.27 -0.29 1.45 -0.27 -0.22 -0.17 -0.1 -0.4 0.14 0.22 0.37
-1.13 -1.14 -1.4 -1.28 -0.15 0.3 -0.2 -0.39 -0.14 -0.24 -0.18 -0.53 -0.33 0.67 0.37 -0.19 -0.46 1.07 -0.38 -0.7 -0.46 -0.41 2.4 -0.51 -0.35 -0.38 -0.57 -0.96 0.04 0.08 0.21
-0.96 -0.77 -1.02 -1.55 0.59 0.92 -1.08 -0.9 -0.76 -1.02 -0.74 -1.17 -1.01 1.42 0.48 -0.44 -0.84 0.35 -0.52 -1.15 -0.67 -0.46 2.59 -0.43 -0.58 -0.63 -0.38 -1.22 0.16 0.19 0.46
-0.48 -0.17 -0.44 -0.27 0.62 0.57 -0.47 -0.06 -0.63 -0.57 -0.26 -0.33 0.16 0.78 0.43 -0.06 -0.38 0.53 -0.28 -0.7 -0.45 -0.31 1.5 -0.51 -0.28 -0.31 -0.32 -0.27 -0.06 -0.06 0.16
-0.68 -0.21 -0.84 -1.1 0.37 0.3 -0.37 -0.55 -0.5 -0.54 -0.43 -0.6 0.07 1.07 0.61 -0.2 -0.39 0.3 -0.07 -0.46 -0.44 -0.54 2.04 -0.19 -0.22 -0.49 -0.44 -0.42 0.04 -0.21 0.15
-0.81 -0.44 -0.2 0.21 -0.1 0.13 -0.21 -0.39 -0.31 -0.32 -0.1 -0.35 -0.54 0.45 0.3 0.07 -0.32 0.78 -0.17 -0.36 -0.38 -0.28 1.76 -0.47 -0.37 -0.14 -0.11 -0.5 0.01 0.13 0.05
-0.79 -0.78 -1.23 -1.07 1.12 0.59 -1.17 -0.73 -0.7 -0.79 -0.66 -0.57 -0.38 1.16 0.72 -0.61 -0.87 0.82 -0.12 -0.78 -0.75 -0.79 2.35 -0.84 -0.66 -0.88 -0.72 -0.74 0.32 0.07 0.11
-0.52 -0.62 -0.59 -0.21 0.29 0.26 -0.34 -0.19 -0.61 -0.55 -0.44 -0.45 -0.29 0.59 0.39 -0.33 -0.49 0.6 -0.05 -0.62 -0.39 -0.22 1.81 -0.29 -0.42 -0.22 -0.12 -0.35 0.37 0.14 0.38
-0.74 -0.5 -1.1 -1.14 0.73 0.4 -1.01 -1.17 -0.56 -0.75 -0.38 -0.77 0.04 1.26 0.84 -0.32 -0.68 1.1 -0.18 -0.58 -0.87 -0.83 2.21 -0.82 -0.79 -0.64 -0.65 -1.44 -0.06 -0.11 0.53
-0.25 -0.27 -0.37 -0.12 0.45 0.29 -0.21 -0.25 -0.33 -0.31 -0.17 -0.31 0.18 0.55 0.37 -0.01 -0.25 0.54 -0.13 -0.43 -0.22 -0.23 1.28 -0.41 -0.27 -0.24 -0.21 -0.21 -0.02 -0.09 -0.05
-0.3 -0.31 -0.44 -0.26 0.6 0.35 -0.36 -0.43 -0.35 -0.3 -0.15 -0.51 -0.12 0.67 0.63 0.03 -0.29 0.74 -0.27 -0.57 -0.46 -0.36 1.54 -0.59 -0.52 -0.37 -0.24 -0.38 0.13 -0.01 -0.02
-0.69 -0.61 -1.1 -0.71 0.59 0.51 -0.08 -0.26 -0.49 -0.43 -0.4 -0.45 -0.22 0.74 0.58 0.09 -0.43 0.12 -0.02 -0.52 -0.32 -0.27 1.88 -0.46 -0.46 -0.18 -0.27 -0.53 0.11 -0.0 0.2
-0.48 -0.54 -0.7 -0.47 0.63 0.32 -0.37 -0.33 -0.43 -0.37 -0.3 -0.52 -0.03 0.67 0.5 -0.26 -0.55 0.67 -0.0 -0.44 -0.33 -0.35 1.69 -0.42 -0.32 -0.4 -0.35 -0.49 0.16 0.0 0.37
-1.72 -2.53 -6.16 -3.18 0.19 -0.27 -1.48 -2.79 -2.44 -1.84 -2.52 -1.82 -1.68 1.44 1.27 -0.85 -1.02 2.15 -0.91 -0.93 -0.55 -0.79 3.3 -2.6 -1.46 -1.04 -1.36 -1.39 0.13 -0.22 -2.54
-1.2 -1.05 -1.11 -0.44 0.61 0.02 -0.82 -1.13 -0.35 -0.39 -0.21 -0.3 -0.07 0.47 0.29 -0.16 -0.46 0.37 -0.33 -0.68 -0.44 -0.45 2.39 -0.52 -0.69 -0.32 -0.36 -0.23 0.21 0.12 0.54
-0.39 -0.46 -0.47 -0.54 0.19 0.22 -0.03 -0.18 -0.42 -0.49 -0.34 -0.37 -0.08 0.61 0.63 -0.13 -0.28 0.81 -0.09 -0.41 -0.27 -0.3 1.7 -0.47 -0.23 -0.37 -0.28 -0.13 -0.08 -0.26 -0.1
-0.33 -0.48 -0.54 -0.67 0.46 0.35 -0.27 -0.48 -0.41 -0.22 -0.33 -0.24 -0.05 0.54 0.43 -0.21 -0.22 0.32 -0.12 -0.4 -0.35 -0.33 1.68 -0.27 -0.29 -0.34 -0.26 -0.37 0.04 0.17 0.38
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-0.45 -0.26 -0.46 -0.16 0.47 0.36 -0.16 -0.44 -0.18 -0.2 -0.1 -0.34 -0.04 0.58 0.48 -0.07 -0.46 0.46 -0.28 -0.4 -0.43 -0.26 1.42 -0.52 -0.4 -0.31 -0.19 -0.27 0.09 0.06 0.27
-1.98 -0.81 -2.62 -2.78 0.69 0.8 -1.1 -1.15 -2.53 -2.14 -1.58 -1.71 -1.32 1.98 0.97 -1.11 -1.95 0.78 -0.27 -1.73 -1.13 -1.71 3.0 -0.99 -0.87 -0.8 -0.5 -1.61 0.43 -0.22 0.07
-0.47 -0.57 -0.42 -0.16 0.45 0.07 -0.54 -0.67 -0.49 -0.38 -0.26 -0.52 -0.11 1.09 0.72 -0.23 -0.51 0.68 -0.31 -0.65 -0.59 -0.54 1.8 -0.5 -0.48 -0.41 -0.47 -0.81 0.13 0.2 0.48
-0.98 -0.93 -1.7 -1.65 0.82 0.61 -0.79 -0.88 -1.09 -1.17 -0.81 -1.3 -0.38 1.35 1.15 -0.44 -0.73 1.2 0.15 -0.64 -0.79 -0.66 2.4 -0.83 -0.62 -0.7 -0.88 -0.84 0.04 -0.41 -0.13
-0.5 -0.69 -0.6 -1.06 0.54 0.54 -0.62 -0.4 -0.58 -0.63 -0.46 -0.63 -0.0 1.09 0.56 -0.3 -0.58 0.21 -0.2 -0.58 -0.58 -0.46 2.18 -0.48 -0.44 -0.77 -0.58 -0.65 0.1 -0.07 0.53
-1.24 -1.21 -2.13 -1.56 1.35 0.67 -2.57 -2.29 -0.49 -0.71 -0.29 -0.97 -0.57 1.51 1.25 0.38 -0.83 1.13 -0.51 -2.06 -1.21 -0.95 2.57 -1.49 -1.11 -1.12 -0.58 -1.51 -0.24 -0.28 -0.59
-0.22 -0.38 -0.5 -0.58 0.52 0.39 -0.51 -0.62 -0.76 -0.62 -0.63 -0.86 -0.22 0.94 0.62 -0.22 -0.69 0.81 -0.16 -0.6 -0.5 -0.48 2.13 -0.65 -0.42 -0.55 -0.35 -0.6 0.03 -0.06 0.07
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-0.56 -0.62 -0.82 -0.69 0.5 0.37 -0.34 -0.43 -0.38 -0.45 -0.47 -0.49 0.15 0.85 0.56 -0.01 -0.28 0.74 -0.3 -0.38 -0.35 -0.24 1.61 -0.36 -0.43 -0.24 -0.24 -0.34 0.05 0.0 0.17
-0.82 -0.77 -1.05 -1.14 0.86 0.75 -0.66 -0.66 -0.9 -0.87 -0.78 -1.06 -0.22 1.07 0.72 -0.08 -0.48 1.0 0.12 -0.72 -0.49 -0.36 1.99 -0.67 -0.53 -0.55 -0.49 -0.55 0.33 0.13 -0.22
-0.62 -0.62 -0.02 -0.26 0.59 0.26 -0.6 -0.82 -0.41 -0.25 -0.25 -0.39 -0.3 0.81 0.54 -0.07 -0.55 0.66 -0.42 -0.83 -0.39 -0.34 1.88 -0.73 -0.42 -0.4 -0.27 -0.53 0.04 0.0 0.39
-0.92 -0.91 -1.2 -1.52 0.91 0.79 -0.92 -0.87 -0.93 -1.04 -0.64 -1.09 -0.47 1.48 1.06 -0.19 -0.68 1.13 -0.2 -0.91 -0.71 -0.39 2.18 -1.03 -0.65 -0.48 -0.45 -0.79 -0.03 -0.29 -0.33
-0.45 -0.28 -0.52 -0.51 0.53 0.26 -0.43 -0.45 -0.46 -0.45 -0.25 -0.52 0.03 0.72 0.57 -0.04 -0.33 0.66 -0.21 -0.5 -0.43 -0.43 1.82 -0.57 -0.35 -0.38 -0.35 -0.45 0.04 -0.07 0.17
-0.6 -0.52 -0.63 -0.46 0.39 0.25 -0.33 -0.51 -0.28 -0.22 -0.11 -0.24 0.11 0.51 0.35 -0.13 -0.1 0.22 -0.12 -0.36 -0.39 -0.3 1.56 -0.36 -0.24 -0.16 -0.26 -0.41 0.12 0.22 0.53
-1.32 -0.82 -1.1 -0.48 0.77 0.58 -1.53 -1.69 -0.66 -0.89 -0.38 -0.57 0.01 1.02 0.28 -0.45 -0.47 1.07 -0.75 -0.61 -0.61 -0.76 2.38 -0.3 -0.42 -0.24 -0.45 -0.61 -0.31 -0.24 0.53
-0.6 -0.77 -0.81 -0.69 0.87 0.6 -1.02 -0.81 -0.54 -0.68 -0.38 -0.72 -0.53 1.13 0.49 -0.49 -1.0 0.85 -0.15 -0.85 -0.62 -0.56 2.43 -0.63 -0.66 -0.67 -0.51 -0.94 0.06 -0.12 -0.23
-0.64 -0.62 -0.53 -0.37 0.18 0.36 -0.52 -0.46 -0.44 -0.46 -0.36 -0.4 0.05 0.78 0.54 0.03 -0.2 0.43 -0.48 -0.47 -0.32 -0.29 1.97 -0.34 -0.21 -0.26 -0.25 -0.31 -0.13 -0.08 -0.02
-0.33 -0.26 -0.63 -0.38 0.4 0.31 -0.1 -0.05 -0.38 -0.32 -0.21 -0.24 0.04 0.31 0.18 -0.1 -0.26 0.38 -0.18 -0.47 -0.33 -0.33 1.65 -0.46 -0.25 -0.19 -0.21 -0.34 -0.0 -0.03 0.4
-0.84 -1.1 -1.07 -0.95 0.44 0.47 -0.5 -0.71 -0.17 -0.36 -0.43 -0.87 -0.8 0.91 0.59 -0.54 -0.77 0.91 -0.03 -0.6 -0.41 -0.49 2.17 -0.41 -0.41 -0.24 -0.36 -0.84 0.2 0.21 0.31
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-2.22 -2.0 -3.04 -3.27 0.59 0.42 -1.36 -1.68 -1.26 -1.42 -1.16 -1.32 -0.54 1.35 1.21 -0.34 -0.8 1.48 0.06 -1.02 -0.69 -0.73 3.02 -1.08 -1.03 -0.88 -0.58 -1.24 -0.4 -0.5 -0.97
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-0.35 -0.39 -0.61 -0.39 0.37 0.38 -0.31 -0.39 -0.24 -0.32 -0.29 -0.25 0.09 0.69 0.34 -0.07 -0.2 0.63 -0.16 -0.36 -0.26 -0.31 1.41 -0.42 -0.22 -0.11 -0.21 -0.35 0.06 -0.06 0.13
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Details

Dark gray cells indicate values where the raw expression is zero (cannot be log-transformed). Blue cells indicate samples where the expression of the gene is below average and red cells indicate the gene is expressed above average in the sample. White cells are average.