1. Home
  2. Tools
  3. Expression Heatmap
  4. Results

Heatmap: Cluster_86 (Brassica rapa (Bra) Coexpression Clusters (HCCA Algorithm))

View as: (view raw or zlog-transformed)

View using InCHLib : here ( Experimental feature, still under development)

(Values are normalized against highest expression of the row)

 Transpose table  Download table
Gene
Light: 268 uE m-2 s-1
Light: 202.5 uE m-2 s-1 (Control)
Light: 135 uE m-2 s-1
Light: 67.5 uE m-2 s-1
Photoperiod: L24
Photoperiod: L20D4 (Control)
Photoperiod: L12D12
Photoperiod: L8D16
RBW: 4:1:1 (Control)
RBW: 4:1:0
RBW: 3:1:1
RBW: 3:1:0
Nitrogen: 0%
Nitrogen: 25%
Nitrogen: 50%
Nitrogen: 100% (Control)
Nitrogen: 150%
Phosphorous: 0%
Phosphorous: 25%
Phosphorous: 50%
Phosphorous: 100% (Control)
Phosphorous: 150%
Potassium: 0%
Potassium: 25%
Potassium: 50%
Potassium: 100% (Control)
Potassium: 150%
Temperature: 20°C
Temperature: 25°C (Control)
Temperature: 30°C
Temperature: 35°C
Bra000625 (CPI1)
 0.56 0.58 1.0 0.74 0.34 0.34 0.45 0.47 0.26 0.4 0.27 0.4 0.72 0.33 0.37 0.51 0.41 0.59 0.25 0.25 0.37 0.37 0.98 0.48 0.49 0.53 0.45 0.4 0.39 0.41 0.46
0.55 0.74 1.0 0.78 0.25 0.35 0.36 0.39 0.22 0.37 0.26 0.26 0.33 0.23 0.26 0.29 0.34 0.42 0.26 0.33 0.3 0.41 0.95 0.18 0.19 0.34 0.21 0.2 0.31 0.25 0.17
Bra001567 (LIK1)
 0.13 0.07 1.0 0.26 0.11 0.1 0.05 0.15 0.06 0.0 0.12 0.09 0.14 0.01 0.02 0.03 0.09 0.15 0.22 0.01 0.03 0.12 0.5 0.07 0.01 0.01 0.05 0.01 0.03 0.07 0.14
Bra001638 (SWEET16)
 0.0 0.0 1.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.07 0.24 1.0 0.77 0.1 0.02 0.09 0.08 0.06 0.3 0.23 0.12 0.37 0.05 0.03 0.36 0.35 0.36 0.06 0.06 0.14 0.1 0.23 0.03 0.0 0.13 0.02 0.02 0.0 0.06 0.03
0.27 0.09 1.0 0.23 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.03 0.0 0.0 0.0 0.08 0.0 0.0 0.0 0.03 0.0 0.0 0.0 0.03 0.08 0.0 0.0 0.12 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.14 0.41 0.94 1.0 0.02 0.01 0.17 0.35 0.04 0.12 0.04 0.08 0.13 0.01 0.02 0.02 0.02 0.07 0.03 0.01 0.01 0.05 0.71 0.02 0.02 0.01 0.04 0.01 0.02 0.12 0.01
0.23 0.33 1.0 0.71 0.24 0.31 0.11 0.13 0.13 0.23 0.23 0.21 0.26 0.3 0.33 0.26 0.2 0.41 0.16 0.2 0.19 0.24 0.9 0.2 0.15 0.23 0.21 0.17 0.2 0.26 0.63
Bra004712 (HLH1)
 0.38 0.51 1.0 0.3 0.04 0.02 0.08 0.12 0.22 0.24 0.28 0.22 0.13 0.06 0.06 0.11 0.14 0.12 0.06 0.13 0.19 0.12 0.16 0.16 0.13 0.22 0.16 0.09 0.04 0.16 0.08
0.31 0.72 0.87 0.8 0.57 0.52 0.48 0.52 0.15 0.38 0.14 0.23 1.0 0.19 0.29 0.44 0.35 0.61 0.21 0.32 0.26 0.26 1.0 0.42 0.41 0.34 0.43 0.26 0.18 0.26 0.55
Bra006236 (ROXY2)
 0.0 0.28 1.0 0.98 0.04 0.0 0.02 0.07 0.03 0.01 0.02 0.0 0.1 0.03 0.0 0.04 0.05 0.0 0.01 0.11 0.01 0.06 0.16 0.01 0.06 0.0 0.04 0.01 0.0 0.05 0.08
Bra006324 (bZIP3)
 0.1 1.0 0.97 0.2 0.13 0.03 0.04 0.06 0.03 0.14 0.12 0.13 0.12 0.0 0.0 0.08 0.12 0.02 0.0 0.13 0.1 0.12 0.49 0.24 0.21 0.88 0.24 0.05 0.18 0.86 0.44
0.39 0.42 0.65 0.54 0.27 0.28 0.54 0.54 0.18 0.25 0.26 0.19 0.67 0.16 0.22 0.44 0.44 1.0 0.4 0.31 0.34 0.34 0.75 0.53 0.6 0.55 0.61 0.41 0.43 0.54 0.87
0.2 0.41 1.0 0.5 0.34 0.16 0.1 0.13 0.06 0.1 0.09 0.05 0.06 0.18 0.18 0.16 0.04 0.19 0.14 0.09 0.09 0.05 0.24 0.11 0.1 0.16 0.06 0.03 0.09 0.15 0.13
0.16 0.3 1.0 0.62 0.14 0.1 0.22 0.36 0.28 0.33 0.28 0.26 0.29 0.17 0.21 0.24 0.27 0.25 0.18 0.26 0.23 0.34 0.43 0.19 0.23 0.17 0.18 0.12 0.1 0.1 0.1
Bra007890 (GSTU11)
 0.0 0.0 0.45 0.0 0.01 0.02 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.02 0.02 0.0 0.0 0.0 0.02 0.0 0.0 0.01 0.0 0.02 1.0 0.07 0.0 0.0 0.01 0.0 0.0 0.0 0.0
Bra008754 (GALK2)
 0.0 0.0 0.67 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.08 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 1.0 0.04 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.18 0.74 1.0 0.68 0.05 0.05 0.04 0.05 0.07 0.07 0.04 0.25 0.0 0.06 0.33 0.13 0.05 0.25 0.09 0.0 0.13 0.0 0.72 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.08 0.1 0.13
Bra010234 (beta1-COP)
 0.86 1.0 0.83 0.9 0.84 0.61 0.69 0.88 0.67 0.8 0.7 0.72 0.88 0.74 0.7 0.79 0.75 0.95 0.7 0.63 0.6 0.7 0.93 0.76 0.72 0.79 0.78 0.75 0.68 0.8 0.91
Bra010639 (AGP3)
 0.16 0.43 1.0 0.55 0.07 0.0 0.0 0.03 0.0 0.09 0.03 0.02 0.0 0.02 0.0 0.0 0.04 0.0 0.01 0.04 0.0 0.0 0.09 0.0 0.0 0.0 0.0 0.05 0.0 0.12 0.0
0.36 0.45 0.42 0.53 0.48 0.48 0.56 0.66 0.27 0.4 0.34 0.39 0.7 0.35 0.39 0.4 0.56 1.0 0.39 0.37 0.49 0.45 0.71 0.66 0.62 0.76 0.61 0.4 0.48 0.61 0.69
Bra011562 (DEG4)
 0.16 0.27 1.0 0.78 0.06 0.02 0.02 0.01 0.03 0.09 0.1 0.07 0.02 0.02 0.0 0.03 0.03 0.03 0.0 0.0 0.02 0.04 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.5 0.49 0.79 1.0 0.49 0.56 0.47 0.39 0.37 0.38 0.42 0.41 0.67 0.47 0.54 0.49 0.38 0.66 0.41 0.47 0.49 0.41 0.81 0.5 0.39 0.42 0.36 0.41 0.4 0.43 0.73
0.53 0.85 1.0 0.79 0.03 0.03 0.03 0.05 0.07 0.0 0.03 0.13 0.0 0.0 0.03 0.0 0.0 0.11 0.0 0.0 0.0 0.05 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
Bra012016 (NF-YB11)
 0.62 0.68 0.86 0.8 0.64 0.45 0.46 0.72 0.27 0.47 0.41 0.28 0.93 0.41 0.5 0.64 0.41 0.64 0.39 0.47 0.57 0.44 1.0 0.55 0.64 0.59 0.66 0.66 0.43 0.45 0.66
Bra012129 (RPP5)
 0.0 0.1 1.0 0.0 0.0 0.15 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.19 0.0 0.0 0.0
Bra012993 (COBL5)
 0.12 0.31 1.0 0.31 0.12 0.02 0.06 0.15 0.08 0.13 0.08 0.17 0.24 0.02 0.08 0.07 0.25 0.33 0.07 0.04 0.08 0.12 0.74 0.02 0.1 0.14 0.11 0.06 0.18 0.22 0.08
0.21 0.38 1.0 0.22 0.27 0.09 0.06 0.17 0.07 0.09 0.0 0.07 0.0 0.11 0.0 0.01 0.13 0.03 0.02 0.15 0.03 0.05 0.04 0.06 0.0 0.05 0.06 0.05 0.02 0.2 0.07
0.39 0.21 0.63 0.75 0.62 0.49 0.34 0.18 0.33 0.26 0.35 0.26 0.5 0.37 0.4 0.31 0.31 0.64 0.37 0.15 0.36 0.29 1.0 0.23 0.35 0.23 0.25 0.31 0.35 0.37 0.45
Bra014789 (ARP1)
 0.18 0.25 1.0 0.05 0.0 0.0 0.11 0.0 0.02 0.02 0.11 0.12 0.03 0.03 0.0 0.18 0.05 0.0 0.0 0.05 0.06 0.06 0.55 0.0 0.04 0.19 0.04 0.11 0.02 0.0 0.07
0.0 0.0 1.0 0.01 0.0 0.0 0.0 0.0 0.45 0.0 0.0 0.32 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.2 0.0 0.1 0.09 0.09 0.23 0.0 0.0 0.23
0.52 1.0 0.79 0.6 0.15 0.07 0.08 0.28 0.13 0.22 0.16 0.16 0.26 0.04 0.15 0.14 0.25 0.92 0.2 0.14 0.08 0.16 0.94 0.32 0.42 0.72 0.49 0.23 0.23 0.75 0.68
Bra018160 (DIN6)
 0.03 0.13 0.47 0.08 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 1.0 0.0 0.0 0.02 0.0 0.0 0.0 0.01 0.02
Bra018710 (STMP6)
 0.04 0.16 0.16 0.04 0.06 0.12 0.03 0.03 0.01 0.04 0.01 0.03 0.06 0.02 0.11 0.07 0.14 0.29 0.05 0.02 0.02 0.14 1.0 0.06 0.02 0.03 0.04 0.01 0.01 0.06 0.04
0.27 0.44 0.67 0.27 0.23 0.12 0.1 0.13 0.06 0.09 0.09 0.07 0.14 0.16 0.17 0.1 0.1 0.11 0.07 0.1 0.11 0.07 1.0 0.14 0.12 0.32 0.17 0.19 0.25 0.21 0.09
Bra019905 (PRS3)
 0.84 0.89 0.87 0.79 0.45 0.42 0.59 0.85 0.32 0.51 0.46 0.5 0.76 0.53 0.54 0.57 0.62 1.0 0.53 0.44 0.48 0.56 0.99 0.58 0.61 0.74 0.62 0.46 0.49 0.72 0.87
Bra021292 (BGLU44)
 0.42 0.41 0.64 0.23 0.24 0.13 0.39 0.36 0.21 0.38 0.33 0.31 0.52 0.09 0.1 0.45 0.45 1.0 0.42 0.29 0.33 0.4 0.81 0.52 0.61 0.51 0.63 0.46 0.41 0.66 0.63
0.39 0.61 0.68 0.46 0.4 0.33 0.25 0.28 0.34 0.4 0.31 0.38 0.24 0.25 0.36 0.32 0.3 0.38 0.32 0.24 0.23 0.28 1.0 0.43 0.36 0.5 0.43 0.38 0.4 0.52 0.23
Bra022957 (FES1)
 0.11 0.46 1.0 0.08 0.08 0.04 0.0 0.06 0.11 0.07 0.08 0.01 0.0 0.0 0.12 0.02 0.04 0.03 0.01 0.03 0.0 0.04 0.31 0.01 0.03 0.0 0.0 0.02 0.0 0.03 0.02
Bra023336 (NADP-ME2)
 0.1 0.18 0.38 0.09 0.17 0.16 0.08 0.09 0.08 0.16 0.09 0.11 0.13 0.11 0.12 0.16 0.17 0.36 0.17 0.1 0.08 0.14 1.0 0.12 0.11 0.12 0.11 0.1 0.08 0.15 0.08
0.51 0.65 0.64 1.0 0.0 0.19 0.66 0.21 0.17 0.09 0.0 0.0 0.11 0.48 0.13 0.0 0.0 0.2 0.11 0.0 0.18 0.0 0.48 0.0 0.0 0.1 0.19 0.0 0.0 0.0 0.11
0.48 0.35 1.0 0.27 0.36 0.37 0.15 0.16 0.46 0.47 0.51 0.56 0.15 0.19 0.24 0.2 0.23 0.26 0.25 0.22 0.21 0.35 0.27 0.29 0.29 0.43 0.32 0.35 0.46 0.56 0.34
0.79 1.0 0.87 0.93 1.0 0.66 0.47 0.47 0.23 0.33 0.34 0.43 0.93 0.26 0.34 0.4 0.43 0.69 0.23 0.37 0.63 0.37 0.85 0.31 0.22 0.44 0.58 0.67 0.32 0.4 0.46
0.36 0.72 1.0 0.44 0.03 0.04 0.05 0.06 0.07 0.2 0.15 0.2 0.13 0.01 0.01 0.05 0.14 0.6 0.12 0.06 0.07 0.09 0.82 0.14 0.16 0.62 0.24 0.08 0.12 0.49 0.39
Bra028281 (TRM24)
 0.07 0.14 1.0 0.3 0.09 0.06 0.02 0.03 0.04 0.01 0.07 0.02 0.14 0.04 0.08 0.03 0.04 0.28 0.08 0.04 0.04 0.02 0.17 0.03 0.0 0.07 0.04 0.06 0.03 0.05 0.02
Bra028865 (APD7)
 0.43 0.72 1.0 0.39 0.13 0.01 0.1 0.14 0.08 0.21 0.13 0.17 0.1 0.02 0.02 0.09 0.14 0.09 0.09 0.28 0.21 0.18 0.05 0.09 0.05 0.15 0.1 0.04 0.06 0.16 0.07
0.0 0.0 0.68 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 1.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.0 0.2 1.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.28 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.16 0.18
0.75 0.57 0.97 0.73 0.83 0.38 0.32 0.15 0.17 0.27 0.24 0.21 1.0 0.21 0.12 0.23 0.22 0.48 0.12 0.11 0.11 0.19 0.9 0.31 0.25 0.37 0.29 0.4 0.14 0.23 0.28
0.07 0.29 1.0 0.47 0.11 0.14 0.06 0.06 0.04 0.04 0.03 0.01 0.31 0.08 0.06 0.1 0.04 0.24 0.03 0.06 0.09 0.04 0.64 0.06 0.05 0.12 0.08 0.08 0.02 0.07 0.03
Bra031072 (FMO1)
 0.59 0.43 0.83 1.0 0.04 0.02 0.04 0.2 0.06 0.1 0.03 0.17 0.01 0.0 0.0 0.0 0.02 0.0 0.03 0.0 0.01 0.11 0.0 0.02 0.01 0.11 0.01 0.0 0.06 0.26 0.05
0.45 0.64 1.0 0.26 0.55 0.05 0.1 0.22 0.14 0.39 0.22 0.19 0.18 0.02 0.03 0.22 0.28 0.51 0.12 0.17 0.13 0.33 0.74 0.19 0.15 0.14 0.25 0.35 0.1 0.39 0.07
Bra031128 (TAX2)
 0.01 0.19 0.47 0.09 0.16 0.02 0.03 0.09 0.04 0.17 0.04 0.23 0.12 0.04 0.04 0.05 0.06 0.47 0.09 0.02 0.11 0.09 1.0 0.05 0.06 0.1 0.08 0.08 0.01 0.1 0.03
Bra031221 (WRKY59)
 0.01 0.21 0.0 0.03 0.03 0.05 0.0 0.01 0.0 0.09 0.0 0.03 0.0 0.03 0.0 0.04 0.02 0.29 0.0 0.0 0.03 0.08 1.0 0.01 0.01 0.03 0.0 0.04 0.04 0.04 0.0
0.42 0.78 1.0 0.56 0.1 0.15 0.16 0.17 0.19 0.2 0.22 0.2 0.19 0.12 0.17 0.18 0.2 0.44 0.22 0.16 0.09 0.11 0.66 0.24 0.32 0.35 0.33 0.12 0.17 0.33 0.57
Bra032935 (PIRL2)
 0.47 0.92 1.0 0.63 0.14 0.3 0.43 0.26 0.11 0.12 0.06 0.06 0.07 0.02 0.11 0.07 0.12 0.37 0.33 0.1 0.04 0.14 0.96 0.27 0.28 0.87 0.24 0.11 0.26 0.55 0.7
Bra034022 (CYP735A2)
 0.0 0.0 0.77 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.58 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 1.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.52
Bra035645 (XPO2)
 0.36 0.14 1.0 0.49 0.0 0.0 0.09 0.0 0.0 0.06 0.03 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.21 0.0 0.0 0.0 0.0
Bra036502 (QWRF3)
 0.08 0.24 1.0 0.81 0.02 0.0 0.04 0.0 0.0 0.01 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.07 0.0 0.12 0.02 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
Bra036701 (MIOX2)
 0.03 0.06 0.88 0.37 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.01 0.0 0.0 0.0 0.0 1.0 0.0 0.0 0.01 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
Bra038169 (SAR1)
 0.29 0.41 0.49 0.34 0.61 0.42 0.54 0.62 0.23 0.41 0.44 0.52 0.8 0.48 0.41 0.42 0.57 1.0 0.52 0.38 0.53 0.43 0.73 0.61 0.57 0.63 0.69 0.49 0.42 0.6 0.63
Bra038347 (PPRT1)
 0.07 0.2 1.0 0.37 0.13 0.0 0.0 0.03 0.0 0.06 0.03 0.01 0.06 0.0 0.0 0.07 0.02 0.02 0.02 0.0 0.05 0.01 0.05 0.0 0.03 0.03 0.01 0.03 0.05 0.01 0.03
Bra038577 (FBS1)
 0.07 0.14 0.97 0.24 0.26 0.03 0.0 0.0 0.02 0.0 0.03 0.02 0.32 0.02 0.02 0.06 0.05 0.26 0.03 0.01 0.0 0.03 1.0 0.08 0.33 0.07 0.07 0.21 0.3 0.14 0.22
Bra039021 (MIOX2)
 0.04 0.07 1.0 0.36 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.01 0.0 0.0 0.0 0.0 0.42 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
Bra041014 (MIOX4)
 0.0 0.02 0.31 0.01 0.0 0.0 0.0 0.03 0.0 0.05 0.0 0.02 0.02 0.0 0.01 0.0 0.0 0.04 0.0 0.06 0.0 0.08 1.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0

Details

Expression values normalized per gene (using the maximum value, Green cells indicate low expression and red high. (Dark gray cells indicate missing values)