1. Home
  2. Tools
  3. Expression Heatmap
  4. Results

Heatmap: Cluster_53 (Brassica rapa (Bra) Coexpression Clusters (HCCA Algorithm))

View as: (view raw or zlog-transformed)

View using InCHLib : here ( Experimental feature, still under development)

(Values are normalized against highest expression of the row)

 Transpose table  Download table
Gene
Light: 268 uE m-2 s-1
Light: 202.5 uE m-2 s-1 (Control)
Light: 135 uE m-2 s-1
Light: 67.5 uE m-2 s-1
Photoperiod: L24
Photoperiod: L20D4 (Control)
Photoperiod: L12D12
Photoperiod: L8D16
RBW: 4:1:1 (Control)
RBW: 4:1:0
RBW: 3:1:1
RBW: 3:1:0
Nitrogen: 0%
Nitrogen: 25%
Nitrogen: 50%
Nitrogen: 100% (Control)
Nitrogen: 150%
Phosphorous: 0%
Phosphorous: 25%
Phosphorous: 50%
Phosphorous: 100% (Control)
Phosphorous: 150%
Potassium: 0%
Potassium: 25%
Potassium: 50%
Potassium: 100% (Control)
Potassium: 150%
Temperature: 20°C
Temperature: 25°C (Control)
Temperature: 30°C
Temperature: 35°C
0.5 0.53 0.76 0.42 0.47 0.4 0.13 0.2 0.36 0.35 0.18 0.42 0.37 0.33 0.49 0.27 0.23 0.45 0.38 0.3 0.34 0.42 1.0 0.42 0.49 0.46 0.41 0.32 0.47 0.49 0.4
Bra001560 (CYP72A9)
 0.0 0.0 1.0 0.0 0.0 0.24 0.0 0.25 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.52 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.3
0.64 0.74 0.56 0.44 0.48 0.6 0.36 0.15 0.48 0.42 0.42 0.44 0.29 0.62 0.86 0.34 0.34 0.61 0.47 0.22 0.45 0.41 1.0 0.59 0.38 0.42 0.32 0.51 0.42 0.38 0.62
0.0 0.0 1.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.01 0.0 0.0 0.02 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.0 0.0 1.0 0.21 0.0 0.0 0.0 0.23 0.0 0.0 0.0 0.0 0.24 0.0 0.0 0.13 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.11 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.0 0.0 1.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
Bra006705 (PUM19)
 0.0 0.0 1.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.3 0.0 0.37 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.0 0.0 1.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
Bra008222 (GASA1)
 0.0 0.0 1.0 0.35 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.45 0.0 0.0 0.0
0.0 0.0 1.0 0.0 0.0 0.3 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.3 0.3 0.0 0.0 0.0
0.2 0.64 0.65 0.28 0.06 0.16 0.19 0.13 0.16 0.09 0.17 0.11 0.14 0.02 0.06 0.08 0.03 0.05 0.07 0.12 0.13 0.14 1.0 0.05 0.03 0.14 0.29 0.0 0.0 0.12 0.14
Bra010029 (BLOS2)
 0.29 0.54 0.83 0.27 0.44 0.39 0.14 0.15 0.16 0.24 0.38 0.34 0.37 0.37 0.63 0.37 0.19 0.26 0.44 0.11 0.34 0.32 1.0 0.47 0.21 0.33 0.24 0.29 0.37 0.35 0.21
0.21 0.58 0.7 0.21 0.11 0.17 0.02 0.0 0.11 0.13 0.15 0.09 0.16 0.04 0.03 0.11 0.13 0.5 0.38 0.15 0.07 0.07 1.0 0.16 0.14 0.18 0.12 0.23 0.16 0.19 0.38
Bra012302 (DD46)
 0.0 0.0 0.65 0.0 0.17 0.0 0.0 0.16 0.0 0.0 0.34 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 1.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
Bra012399 (NUDT10)
 0.34 0.16 1.0 0.0 0.0 0.1 0.0 0.12 0.33 0.1 0.09 0.0 0.2 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.36 0.0 0.0 0.8 0.0 0.0 0.11 0.21 0.0 0.28 0.4 0.43
Bra012686 (MVP17)
 0.0 0.0 1.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.53 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.29 0.0 0.0 0.0
0.25 0.22 1.0 0.43 0.24 0.79 0.0 0.0 0.04 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.04 0.07 0.12 0.0 0.0 0.0 0.0 0.07 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.07 0.0 0.15
Bra014781 (SANT4)
 0.0 0.0 1.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.0 0.0 1.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.34 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.0 0.0 1.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
Bra018038 (THFS)
 0.0 0.0 1.0 0.0 0.31 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.0 0.99 0.64 0.04 0.1 0.18 0.08 0.09 0.05 0.05 0.09 0.03 0.12 0.09 0.18 0.22 0.05 0.0 0.2 0.2 0.0 0.24 1.0 0.0 0.09 0.18 0.31 0.09 0.05 0.0 0.09
Bra018308 (LecRK-IX.1)
 0.0 0.0 1.0 0.68 0.12 0.59 0.05 0.35 0.18 0.0 0.0 0.0 0.32 0.0 0.0 0.07 0.06 0.0 0.0 0.0 0.36 0.05 0.0 0.0 0.0 0.14 0.0 0.13 0.06 0.56 0.19
Bra020409 (MyoB12)
 0.0 1.0 0.78 0.33 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.21 0.0 0.0 0.0 0.99 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.81 0.0 0.0
Bra020552 (AGL36)
 0.0 0.0 1.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.2 0.0 0.0
Bra021507 (TMN7)
 0.0 0.0 1.0 0.0 0.0 0.11 0.0 0.13 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
Bra022825 (CLE6)
 0.15 0.08 1.0 0.12 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.08 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.07 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
Bra023701 (IPT5)
 0.0 0.0 1.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
Bra023853 (NPY7)
 0.0 0.0 1.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
Bra024944 (FL6)
 0.47 0.0 0.57 0.28 0.23 0.02 0.03 0.02 0.0 0.05 0.0 0.03 0.04 0.15 0.08 0.0 0.03 0.02 0.01 0.03 0.0 0.03 1.0 0.3 0.33 0.3 0.21 0.25 0.35 0.46 0.46
0.0 0.0 1.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.22 0.0 0.48 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
Bra026943 (FRL1)
 0.12 0.07 1.0 0.28 0.02 0.01 0.08 0.0 0.01 0.01 0.0 0.17 0.0 0.0 0.07 0.03 0.02 0.0 0.0 0.06 0.0 0.0 0.0 0.0 0.01 0.0 0.0 0.01 0.0 0.0 0.0
0.07 0.07 0.95 0.53 0.0 0.0 0.1 0.1 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.07 0.0 0.0 0.0 0.14 0.0 0.0 0.0 0.0 0.41 0.0 0.0 1.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
Bra028022 (NRT2.4)
 0.0 0.0 1.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.0 0.0 1.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
Bra029156 (RPL4)
 0.0 0.0 1.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.4 0.0 0.0 0.0 0.29 0.31
Bra029877 (PP1R3)
 0.0 0.0 1.0 0.24 0.32 0.66 0.04 0.0 0.0 0.04 0.04 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.0 0.0 1.0 0.0 0.0 0.39 0.17 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.13 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
Bra036505 (MTP5)
 0.23 0.0 1.0 0.63 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.18 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.19 0.0 0.0 0.0
Bra037392 (PYL7)
 0.93 0.7 1.0 0.41 0.06 0.17 0.04 0.04 0.0 0.0 0.0 0.0 0.07 0.0 0.08 0.12 0.0 0.0 0.0 0.02 0.0 0.0 0.75 0.23 0.27 0.28 0.49 0.19 0.26 0.25 0.41
Bra037886 (GNT2)
 0.0 0.26 1.0 0.0 0.0 0.15 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.37 0.23 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.13 0.0 0.0 0.13 0.15 0.0 0.0 0.0
Bra038376 (SINE2)
 0.0 0.22 1.0 0.22 0.0 0.17 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.21 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
Bra038414 (SDT)
 0.0 0.0 0.7 0.0 0.14 0.0 0.06 0.49 0.25 0.21 0.0 0.06 0.08 0.0 0.16 0.08 0.0 0.45 0.2 0.15 0.0 0.14 1.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.09 0.0 0.22 0.09
Bra038820 (PP1R3)
 0.0 0.0 1.0 0.08 0.36 0.25 0.15 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.04 0.0 0.03 0.0 0.0 0.0 0.0 0.19 0.0 0.0 0.0 0.0 0.34 0.07 0.07 0.0
Bra038902 (TMT3)
 0.28 0.56 1.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.22 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.43 0.55 0.86 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.5
Bra039568 (FOL2)
 0.0 0.0 1.0 0.13 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.0 0.18 1.0 0.31 0.02 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
Bra040622 (RIK)
 0.24 0.57 1.0 0.28 0.07 0.23 0.15 0.31 0.04 0.09 0.06 0.06 0.05 0.23 0.22 0.71 0.05 0.0 0.07 0.02 0.18 0.0 0.88 0.4 0.2 0.51 0.52 0.66 0.47 0.28 0.62
Bra040912 (COST4)
 0.0 0.0 1.0 0.34 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.1 0.0 0.0 0.29 0.0 0.18 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0

Details

Expression values normalized per gene (using the maximum value, Green cells indicate low expression and red high. (Dark gray cells indicate missing values)