Heatmap: Cluster_166 (Marchantia polymorpha (Mpo) Coexpression Clusters (HCCA Algorithm))

View as: (view zlog-transformed or row-normalized)

View using InCHLib : here ( Experimental feature, still under development)

(Showing raw values)

Gene
Control
Cold (3°C)
Dark (3 days)
Heat (33°C)
Light (435 uEm-2s-1)
Osmotic (100 mM mannitol)
Nitrogen deficiency (0 mM KNO3)
Salt (40 mM NaCl)
Cold-Dark
Cold-Light
Cold-Mannitol
Cold-Nitrogen deficiency
Cold-Salt
Heat-Dark
Heat-Mannitol
Heat-Nitrogen deficiency
Heat-Salt
Light-Salt
Mannitol-Dark
Mannitol-Light
Mannitol-Nitrogen deficiency
Nitrogen deficiency-Dark
Nitrogen deficiency-Light
Salt-Dark
Salt-Mannitol
Salt-Nitrogen deficiency
ZT2 (2 hours after light)
ZT6 (6 hours after light)
ZT10 (10 hours after light)
ZT14 (2 hours after dark)
ZT18 (6 hours after dark)
ZT22 (10 hours after dark)
Mp1g01080.1 (VPS3)
6.09 3.44 7.45 8.66 7.84 5.76 7.34 5.77 5.67 5.43 5.35 5.13 5.57 10.16 8.05 10.78 8.53 7.28 11.04 7.67 5.91 9.18 9.63 8.96 5.88 6.61 5.3 5.53 6.04 6.1 6.12 5.76
121.97 49.69 109.96 153.28 163.1 113.86 123.26 102.16 110.67 63.61 58.29 62.94 54.55 179.8 121.11 158.5 130.47 137.93 130.41 142.39 108.01 129.34 179.38 137.9 107.49 123.01 68.42 95.23 108.09 100.27 95.71 76.33
Mp1g09540.1 (SOS1)
0.79 0.65 1.72 1.86 1.25 0.91 0.93 0.91 0.9 0.62 0.71 0.68 0.71 1.79 1.94 3.01 1.94 1.3 2.86 1.49 0.73 2.11 1.36 2.47 0.95 0.65 0.74 0.68 0.7 0.85 1.24 1.39
Mp1g11960.1 (FRG2)
6.79 2.75 9.8 12.46 7.76 6.77 7.64 6.28 5.24 3.79 3.91 3.72 3.07 16.47 13.71 14.51 13.79 8.93 13.36 8.37 6.67 13.04 10.84 11.52 6.58 7.44 6.22 6.49 6.13 5.93 7.86 7.33
Mp1g13190.1 (BAG7)
7.53 6.85 10.03 11.35 9.19 8.49 8.57 8.04 8.6 6.75 8.75 8.05 7.32 14.48 11.5 13.25 12.01 11.42 14.99 10.87 9.71 11.92 13.57 14.59 9.45 10.69 7.15 7.74 7.19 6.53 6.91 8.44
Mp1g19180.1 (NHX6)
13.94 14.44 17.79 28.51 20.66 14.57 20.75 14.83 21.45 14.26 17.54 20.01 18.63 21.82 27.51 30.17 29.24 24.39 22.28 20.96 15.8 20.6 27.71 20.27 14.97 17.87 12.88 13.04 13.63 11.62 11.98 10.97
Mp1g20600.1 (VETH1)
16.75 17.93 21.59 26.69 21.25 20.93 23.34 19.33 19.69 19.8 24.41 24.11 23.56 28.36 27.4 30.39 27.91 26.71 34.07 26.3 22.19 27.86 25.8 30.81 23.37 22.12 17.69 17.08 18.97 19.58 20.54 16.88
3.01 1.72 3.66 4.55 2.91 2.77 2.68 2.59 2.63 1.56 2.66 1.85 2.17 4.89 3.93 5.41 4.2 2.86 4.94 3.13 2.64 4.51 3.47 5.01 2.77 2.98 2.5 2.9 3.15 2.73 2.97 2.64
6.04 3.91 10.48 10.74 8.66 7.05 10.37 7.24 8.06 4.92 5.85 7.45 6.86 13.69 9.67 13.03 10.09 10.77 14.39 10.38 7.98 13.5 13.0 12.7 7.75 8.57 6.65 6.29 5.46 4.91 5.6 6.42
9.71 10.45 13.27 17.7 9.18 9.51 11.04 8.28 11.04 7.36 11.46 13.48 12.85 18.31 16.33 24.33 17.12 11.29 18.09 12.64 10.05 16.53 12.87 17.94 10.35 11.13 7.08 9.62 9.31 13.02 15.05 13.12
6.37 3.81 7.56 12.4 9.84 3.46 8.5 7.82 5.01 4.8 6.62 5.73 6.63 14.85 13.54 14.55 13.94 10.37 12.9 10.7 8.54 11.87 12.91 10.16 9.35 8.74 6.68 7.17 6.56 5.86 6.4 6.36
Mp2g01010.1 (SRD2)
3.52 2.7 4.24 4.3 4.07 3.42 4.68 3.4 4.15 2.94 3.62 3.66 3.45 5.23 4.63 5.82 4.31 4.14 6.01 4.14 3.79 5.22 5.56 5.18 3.74 4.09 3.12 3.34 3.84 4.01 3.76 3.38
6.48 4.75 9.2 12.81 7.27 5.76 9.62 5.74 7.18 5.02 5.7 6.98 5.8 14.48 11.12 18.78 11.88 6.98 11.74 8.12 7.08 10.21 11.12 11.53 5.83 7.91 5.46 6.17 6.95 9.3 10.92 9.71
2.94 1.53 3.98 12.31 8.89 3.75 7.43 5.09 1.14 0.8 1.31 1.3 1.24 8.67 13.39 13.03 12.59 11.94 6.83 6.75 5.34 6.49 13.28 7.63 5.04 4.1 1.97 2.06 3.38 1.63 2.97 2.23
5.48 4.81 5.99 9.15 7.33 6.68 7.93 6.53 6.61 4.42 7.81 6.16 7.21 5.28 11.74 11.92 11.01 9.5 8.04 9.42 7.62 7.36 9.65 7.24 8.08 7.26 5.35 5.36 6.18 5.26 4.94 4.26
530.38 261.58 610.97 802.67 738.64 576.44 584.52 531.77 599.61 387.23 409.74 492.36 376.2 944.25 743.47 814.9 814.25 780.57 724.97 734.1 637.54 619.34 830.12 847.38 647.67 676.65 385.93 411.7 424.26 395.19 419.41 446.36
3.95 1.99 4.87 8.05 4.92 4.44 4.33 4.76 3.49 1.82 3.17 2.98 2.93 7.56 8.59 9.11 8.26 5.67 10.54 6.23 5.06 8.41 6.31 9.31 5.7 5.21 4.27 4.58 4.83 4.7 5.49 4.45
Mp2g21900.1 (MED30)
7.56 5.72 14.8 14.05 12.52 8.53 9.57 7.01 7.31 11.98 6.3 7.41 5.42 17.56 11.45 16.36 11.94 9.55 19.51 9.73 6.92 15.03 11.38 18.12 6.96 6.92 5.88 6.04 7.5 9.56 13.64 12.54
Mp2g23110.1 (ERDJ3B)
13.3 9.21 17.59 23.82 22.64 14.57 22.88 13.14 14.97 13.15 14.73 15.01 15.41 18.86 27.33 30.82 27.74 23.1 23.16 24.58 19.1 23.28 29.92 22.63 18.39 18.71 13.09 14.8 15.15 11.1 10.89 10.03
98.78 74.01 126.1 158.23 136.66 105.08 88.08 90.7 138.11 80.49 129.61 122.93 114.3 180.91 177.92 170.54 168.98 141.07 183.13 147.68 131.42 166.94 152.44 189.5 122.59 124.22 88.12 105.85 110.51 88.73 91.1 82.01
Mp3g01270.1 (ATL47)
3.79 2.84 5.27 6.22 4.88 4.4 5.34 3.54 5.51 3.95 4.69 3.88 3.84 7.2 6.39 9.75 6.22 4.89 7.41 4.6 4.17 6.04 6.31 6.87 3.98 4.51 2.93 3.64 4.47 5.22 5.94 5.34
4.9 1.74 6.79 9.01 6.01 4.95 5.88 5.04 3.24 2.36 2.83 2.51 2.53 12.42 7.96 9.66 8.52 7.11 10.17 5.85 5.63 9.78 7.92 8.89 5.38 5.98 4.38 4.46 4.57 4.99 6.44 5.76
Mp3g09100.1 (CHS1)
16.65 11.79 20.77 31.2 27.09 20.37 27.21 18.65 17.41 7.42 12.96 16.17 11.17 21.87 29.81 38.78 27.24 24.16 29.19 28.77 18.55 28.0 31.21 22.74 19.18 17.23 17.17 15.43 16.27 15.2 17.56 15.59
Mp3g11230.1 (PEX22)
52.53 35.05 65.12 69.69 56.8 47.01 56.99 46.94 38.68 38.8 39.13 43.55 39.57 96.52 65.21 87.84 67.72 67.04 89.43 56.78 49.01 80.99 78.23 81.76 47.86 53.61 44.22 45.76 45.18 48.68 59.35 60.92
9.24 7.85 13.78 14.88 13.42 9.47 11.24 8.17 12.53 8.93 8.66 8.58 8.26 14.27 13.72 18.87 13.37 10.79 16.77 11.78 9.06 15.49 13.06 16.7 8.37 9.25 8.11 9.12 9.88 10.19 12.37 10.89
10.68 6.04 16.2 17.13 12.71 10.39 13.45 10.12 11.48 8.69 7.62 9.75 8.11 19.56 15.92 28.88 16.78 14.06 23.02 14.25 12.27 19.81 18.18 21.92 11.71 12.61 8.95 9.67 11.37 14.06 12.85 11.5
Mp3g15640.1 (MIP1)
10.79 8.73 10.74 16.93 14.93 11.24 14.56 11.8 14.42 9.82 10.98 10.71 10.8 17.06 17.9 17.66 16.96 15.6 16.91 15.97 11.1 13.48 16.78 13.64 12.01 12.48 9.86 10.64 11.25 9.61 8.92 7.76
Mp3g23810.1 (DIS1)
14.43 8.46 15.3 26.57 15.16 15.35 16.75 16.27 16.02 10.44 11.46 12.52 10.74 23.65 24.95 28.71 25.87 19.6 23.47 17.97 16.2 22.37 21.45 21.83 17.32 17.21 14.82 15.07 15.36 14.56 14.74 12.77
Mp4g03770.1 (MSRA5)
41.4 20.03 43.2 47.84 43.31 34.86 44.02 37.71 46.34 36.64 25.78 27.78 26.92 74.02 39.21 52.33 44.47 50.1 59.29 43.29 40.04 50.65 49.06 61.83 39.3 39.69 31.44 33.59 34.08 44.28 42.54 46.99
Mp4g06310.1 (DDRGK1)
10.23 6.92 11.86 15.7 12.92 10.07 13.82 10.25 11.08 8.42 10.72 10.65 10.88 16.04 14.54 22.3 14.5 15.88 21.03 13.43 12.29 17.34 17.73 21.64 12.29 13.14 8.74 10.18 10.8 11.84 12.76 11.72
10.64 5.26 14.21 21.1 14.2 10.11 14.62 11.19 10.2 6.53 7.51 8.66 7.61 24.68 20.37 26.6 21.43 19.25 21.94 15.43 12.61 23.13 22.51 20.25 11.58 12.91 8.15 9.93 10.73 9.39 10.47 9.17
5.42 1.86 7.11 9.04 6.79 4.65 5.95 5.28 6.83 4.1 2.92 3.0 3.29 14.32 7.7 11.92 8.31 6.91 12.18 6.94 5.32 7.85 8.23 11.46 4.74 5.21 4.7 6.11 5.7 8.45 7.41 6.98
Mp4g11630.1 (PEX6)
0.51 0.21 0.62 0.92 0.79 0.5 0.49 0.46 0.39 0.26 0.32 0.23 0.3 1.21 1.09 0.96 0.93 0.81 1.06 0.83 0.48 1.04 0.82 0.77 0.53 0.55 0.54 0.59 0.7 0.43 0.47 0.44
4.92 1.94 8.96 16.69 7.25 5.74 7.0 5.93 4.05 3.95 3.63 2.8 3.72 11.18 11.25 18.09 13.96 9.19 10.35 8.21 6.54 9.03 10.62 8.96 6.51 6.55 3.29 5.64 5.33 5.78 5.92 5.0
15.35 12.62 28.88 37.75 16.52 19.06 24.49 17.98 26.17 11.72 12.79 23.42 12.41 41.69 33.67 69.74 35.61 26.18 43.97 16.47 18.48 35.95 32.01 36.76 14.49 21.07 10.18 9.88 9.64 14.28 19.96 18.99
Mp4g13420.1 (CYP705A15)
5.13 3.49 6.66 7.17 6.64 6.55 8.1 5.23 7.7 4.93 4.19 6.28 3.59 9.69 8.43 9.76 8.08 5.44 10.18 7.99 6.9 9.3 9.27 8.64 7.61 6.64 4.09 4.89 4.03 4.53 4.55 4.13
6.28 5.65 24.43 20.85 10.22 5.9 8.52 5.46 14.6 5.87 6.88 4.51 5.49 20.81 22.11 31.48 23.55 12.01 24.77 12.19 9.91 21.37 16.88 26.94 5.76 7.44 4.43 2.21 3.23 3.91 9.96 16.57
11.71 6.7 14.11 17.63 14.14 11.68 16.03 12.17 12.1 13.9 8.45 11.43 8.44 14.48 15.91 20.2 16.81 15.57 20.09 15.78 13.57 17.36 19.55 20.79 12.92 15.35 10.17 12.17 12.16 9.33 10.13 9.28
6.89 5.1 6.56 9.8 9.08 7.25 9.34 7.3 6.14 7.28 6.72 6.12 6.89 9.45 9.99 11.6 9.76 9.69 9.69 9.37 7.45 7.75 10.41 7.24 7.74 7.62 6.98 6.87 6.81 6.02 5.48 5.01
20.22 16.91 26.25 48.91 39.4 25.61 36.18 26.68 23.15 17.87 26.7 29.24 28.18 26.2 59.25 67.96 53.0 52.93 37.53 43.9 31.55 34.36 50.0 33.38 39.69 31.51 20.44 19.06 19.34 20.54 23.62 18.74
12.89 9.63 14.12 25.0 21.41 12.1 21.64 12.12 14.04 12.66 10.91 9.99 13.1 33.84 19.5 25.69 22.32 18.55 23.79 25.7 15.05 21.92 26.94 22.26 15.02 16.66 10.15 11.98 12.67 18.61 14.22 11.34
Mp5g04400.1 (CDKC;1)
15.62 8.78 20.14 20.43 19.67 15.51 17.63 14.94 16.53 10.97 12.56 10.9 12.15 24.85 21.01 25.53 20.76 17.59 29.4 17.65 15.27 24.65 21.92 25.6 15.86 16.76 14.38 14.66 15.24 13.33 15.65 14.66
4.72 3.0 8.91 9.72 6.59 6.1 5.08 4.78 5.8 2.71 3.03 3.0 2.53 9.56 8.87 11.14 9.2 7.29 13.11 7.23 4.62 10.57 7.31 11.29 4.92 4.64 4.6 4.19 4.66 3.81 6.17 5.63
113.58 102.81 239.47 304.56 201.08 124.89 196.43 125.67 189.25 124.82 130.68 157.0 125.43 364.77 273.29 310.55 300.78 232.73 289.35 248.81 149.82 269.04 267.74 309.86 169.47 159.92 66.62 84.2 120.27 127.39 154.7 149.7
7.42 7.87 11.04 11.78 8.71 6.95 10.3 6.18 8.6 6.59 7.93 8.85 7.75 13.42 11.52 16.32 12.03 7.13 13.26 9.24 6.88 12.22 10.23 11.3 6.79 7.84 6.13 7.18 7.72 8.71 9.58 8.1
Mp5g14770.1 (YAK1)
12.96 12.03 14.33 21.84 15.59 12.91 13.14 12.38 19.39 8.64 13.66 13.09 13.34 16.99 23.4 23.86 23.28 18.85 17.84 17.89 12.19 17.46 20.03 16.66 12.91 13.74 11.79 13.66 14.57 12.11 13.04 11.66
6.85 3.7 9.99 10.95 7.56 6.17 5.99 5.79 7.6 5.2 4.99 4.58 4.74 18.32 10.65 10.86 11.24 7.62 14.53 7.13 6.03 11.93 8.93 12.6 6.0 7.16 6.47 6.45 6.72 6.93 7.86 7.07
Mp6g06080.1 (CRP1)
0.18 0.19 0.28 0.65 0.23 0.19 0.38 0.17 0.33 0.19 0.18 0.37 0.15 0.67 0.65 1.19 0.65 0.35 0.85 0.56 0.26 0.72 0.44 0.53 0.32 0.22 0.17 0.13 0.12 0.23 0.34 0.3
2.35 0.66 4.59 5.72 3.96 2.62 3.42 2.52 3.33 1.22 0.94 0.92 0.77 11.0 6.37 7.25 6.21 3.58 7.55 3.51 2.66 6.05 4.58 6.92 2.63 3.26 2.38 2.76 2.7 2.57 3.82 4.02
5.12 2.21 9.48 11.39 8.55 5.06 6.78 5.36 5.34 2.44 3.47 3.3 3.32 11.86 9.62 13.05 10.87 7.85 11.31 7.47 5.38 11.6 9.37 11.72 5.36 6.11 4.86 4.97 4.35 4.58 6.31 6.26
14.73 12.86 17.45 17.03 16.31 15.25 17.34 14.98 13.72 11.51 18.18 13.79 15.84 22.82 17.28 26.02 17.15 17.57 25.97 17.21 14.64 21.61 21.54 21.94 15.03 16.08 14.05 16.06 16.76 13.77 16.48 15.63
8.13 6.14 11.22 10.47 9.16 7.57 8.7 7.51 7.84 5.41 6.61 6.07 6.19 13.92 9.88 14.08 10.01 9.3 15.1 8.14 7.46 13.09 12.05 13.69 7.65 8.47 7.02 8.36 7.19 8.97 10.5 10.38
9.91 6.88 15.63 16.83 14.28 9.59 13.83 9.23 12.09 10.73 9.4 10.03 9.37 22.24 15.26 24.36 15.73 13.89 21.83 13.69 9.9 18.33 15.94 21.55 9.63 11.29 6.94 8.45 8.76 13.21 14.3 11.98
Mp6g14090.1 (CYP81D2)
2.92 1.04 7.23 9.08 4.78 3.42 4.1 3.41 2.5 1.64 1.64 1.84 1.48 17.94 12.24 13.42 12.92 6.39 15.38 6.75 3.89 14.19 6.95 11.58 4.69 3.99 2.89 3.5 3.67 3.93 5.04 5.17
41.71 35.32 41.62 67.85 50.73 46.0 61.02 44.81 44.84 30.53 45.15 46.21 45.42 47.79 65.21 75.94 62.81 73.48 54.18 63.13 51.83 52.92 68.22 56.39 53.89 51.39 37.9 45.29 50.15 37.27 36.68 28.2
Mp7g04930.1 (NTRA)
5.47 4.42 6.64 8.9 6.84 5.84 7.08 6.05 4.14 4.73 4.84 5.75 4.07 10.1 9.11 9.29 8.98 8.24 10.26 6.83 6.06 9.07 7.77 9.25 7.04 6.12 4.87 4.54 4.13 4.54 5.64 5.44
8.06 5.8 9.51 13.21 11.2 8.3 10.02 8.01 7.37 6.65 8.34 6.87 7.2 16.37 13.75 16.02 13.55 12.07 14.68 10.45 8.61 12.55 14.46 12.4 8.6 10.14 8.31 9.26 8.4 6.81 8.54 8.07
Mp7g05610.1 (PSS1)
10.31 5.63 11.55 17.55 16.68 13.0 12.5 12.53 13.95 11.93 10.17 8.79 9.0 26.1 15.37 19.54 17.0 16.54 20.14 19.24 13.21 14.17 18.2 18.61 13.32 13.52 8.92 11.4 11.29 8.31 8.46 7.26
Mp7g05700.1 (Pol{lambda})
5.78 2.4 10.86 15.41 10.27 5.42 6.99 7.2 11.62 4.31 5.55 3.19 5.13 17.43 16.45 16.47 16.59 9.39 25.08 13.36 7.9 20.91 12.15 18.07 8.19 7.75 9.71 8.17 6.11 8.64 12.17 13.21
10.3 5.86 15.18 19.98 12.54 11.15 12.61 9.6 6.93 4.11 7.03 5.68 5.74 21.17 20.9 24.45 19.93 13.81 22.83 12.64 10.86 18.45 18.25 22.52 9.76 12.77 8.04 9.79 12.9 9.72 10.81 8.71
Mp7g07830.1 (TPPF)
26.25 14.33 33.18 40.83 36.19 26.54 33.78 27.25 29.18 17.34 21.31 29.79 20.24 49.93 45.5 47.92 47.54 48.43 46.14 42.04 32.3 43.03 47.97 35.64 30.86 36.11 17.88 23.55 27.6 20.91 25.53 24.22
15.73 8.84 17.03 23.11 31.01 16.77 25.17 14.35 20.75 18.41 10.76 15.24 12.55 38.48 24.46 28.76 23.94 23.23 22.08 23.71 17.49 23.81 33.39 23.55 15.5 19.99 10.5 11.92 14.18 14.89 13.85 12.1
Mp7g19400.1 (CAR1)
9.0 5.41 9.62 12.13 9.67 8.46 9.75 9.44 9.0 7.46 6.63 5.94 6.74 17.51 12.85 15.89 13.98 12.48 16.22 9.3 9.01 12.9 13.55 16.92 9.72 10.63 9.32 9.86 9.01 9.02 10.5 11.26
1.89 2.12 2.69 4.63 3.11 2.65 2.79 2.72 3.63 2.69 2.93 2.54 3.01 3.41 3.9 5.34 4.05 4.12 5.16 3.98 2.81 3.56 4.06 4.25 3.15 2.96 1.9 2.22 1.96 2.37 2.2 2.03
Mp8g04550.1 (CIAF1)
30.84 19.22 31.71 59.36 43.87 37.55 45.62 33.87 27.57 27.01 31.99 36.14 28.36 41.31 65.76 70.74 64.94 54.38 41.58 54.28 44.02 42.5 58.29 41.49 48.17 49.4 21.98 24.39 29.23 33.24 33.49 29.61
Mp8g08610.1 (AGO5)
1.16 0.12 1.93 3.36 1.13 1.47 1.71 1.37 0.22 0.26 0.38 0.17 0.26 4.56 3.49 3.28 3.88 2.03 3.33 1.7 1.65 4.23 2.51 2.93 1.5 1.86 1.37 2.02 2.16 0.91 1.2 0.86
Mp8g09390.1 (GLX2-5)
29.7 23.47 34.19 44.64 49.41 33.37 34.13 32.64 29.03 31.48 27.03 26.15 28.35 64.1 38.54 46.35 39.69 40.16 56.81 46.48 31.46 37.45 39.95 56.52 32.95 30.03 20.53 24.05 25.39 30.89 28.9 25.79
18.73 17.85 22.1 30.29 23.28 20.4 22.94 18.97 24.07 13.85 20.33 21.68 21.62 18.46 30.91 35.28 31.54 26.73 23.94 27.03 20.54 20.86 27.19 21.62 21.32 20.73 15.35 17.01 20.09 15.14 13.77 11.1

Details

Raw expression values (TPM normalized), Green cells indicate low expression and red high. (Dark gray cells indicate missing values)