Heatmap: Cluster_157 (Marchantia polymorpha (Mpo) Coexpression Clusters (HCCA Algorithm))

View as: (view raw or zlog-transformed)

View using InCHLib : here ( Experimental feature, still under development)

(Values are normalized against highest expression of the row)

Gene
Control
Cold (3°C)
Dark (3 days)
Heat (33°C)
Light (435 uEm-2s-1)
Osmotic (100 mM mannitol)
Nitrogen deficiency (0 mM KNO3)
Salt (40 mM NaCl)
Cold-Dark
Cold-Light
Cold-Mannitol
Cold-Nitrogen deficiency
Cold-Salt
Heat-Dark
Heat-Mannitol
Heat-Nitrogen deficiency
Heat-Salt
Light-Salt
Mannitol-Dark
Mannitol-Light
Mannitol-Nitrogen deficiency
Nitrogen deficiency-Dark
Nitrogen deficiency-Light
Salt-Dark
Salt-Mannitol
Salt-Nitrogen deficiency
ZT2 (2 hours after light)
ZT6 (6 hours after light)
ZT10 (10 hours after light)
ZT14 (2 hours after dark)
ZT18 (6 hours after dark)
ZT22 (10 hours after dark)
0.55 0.58 0.72 0.6 0.73 0.63 0.77 0.64 0.83 0.5 0.63 0.59 0.67 0.95 0.65 0.8 0.63 0.75 1.0 0.75 0.61 0.88 0.84 0.94 0.62 0.65 0.52 0.57 0.56 0.55 0.55 0.46
0.54 0.48 0.69 0.65 0.69 0.55 0.52 0.55 1.0 0.68 0.61 0.52 0.55 0.45 0.71 0.68 0.68 0.67 0.81 0.68 0.51 0.7 0.69 0.88 0.53 0.54 0.46 0.5 0.57 0.62 0.56 0.53
0.31 0.24 0.63 0.53 0.49 0.33 0.31 0.37 0.57 0.3 0.37 0.27 0.33 0.37 0.54 0.52 0.56 0.41 1.0 0.67 0.35 0.76 0.42 0.87 0.38 0.33 0.32 0.34 0.34 0.39 0.41 0.35
Mp1g13270.1 (UCC3)
0.18 0.1 0.38 0.39 0.46 0.43 0.2 0.18 0.31 0.26 0.25 0.07 0.12 0.23 0.6 0.36 0.54 0.24 0.83 0.52 0.33 0.5 0.29 1.0 0.44 0.2 0.08 0.24 0.11 0.05 0.17 0.06
Mp1g21790.1 (PAT4)
0.57 0.52 0.68 0.84 0.85 0.63 0.67 0.55 0.7 0.82 0.82 0.6 0.75 0.52 0.81 0.93 0.87 0.83 1.0 0.87 0.6 0.83 0.91 0.86 0.65 0.65 0.44 0.58 0.64 0.58 0.51 0.43
Mp1g26180.1 (LACS9)
0.62 0.62 0.79 0.7 0.98 0.6 0.53 0.63 0.92 1.0 0.82 0.65 0.91 0.5 0.68 0.63 0.72 0.98 0.92 0.99 0.58 0.86 0.78 0.82 0.63 0.55 0.74 0.59 0.45 0.48 0.6 0.81
0.61 0.42 0.69 0.52 0.73 0.63 0.53 0.57 0.45 0.59 0.62 0.43 0.63 0.59 0.51 0.62 0.52 0.67 1.0 0.77 0.58 0.8 0.7 0.91 0.65 0.58 0.57 0.56 0.58 0.53 0.65 0.66
0.59 0.4 0.52 0.86 0.74 0.65 0.59 0.62 0.4 0.34 0.51 0.38 0.52 0.63 0.85 1.0 0.78 0.71 0.77 0.78 0.64 0.58 0.85 0.92 0.73 0.58 0.64 0.6 0.48 0.57 0.68 0.9
0.61 0.33 0.9 0.51 0.58 0.67 0.71 0.63 0.63 0.44 0.49 0.45 0.45 0.44 0.48 0.48 0.49 0.51 1.0 0.6 0.66 0.87 0.66 0.94 0.61 0.73 0.53 0.65 0.66 0.63 0.55 0.57
0.14 0.19 0.27 0.32 0.29 0.15 0.22 0.21 0.82 0.23 0.24 0.29 0.37 0.74 0.35 0.5 0.33 0.5 1.0 0.48 0.22 0.56 0.38 0.93 0.23 0.19 0.1 0.09 0.09 0.12 0.19 0.24
Mp2g09260.1 (RGI3)
0.03 0.0 0.0 0.11 0.05 0.07 0.32 0.05 0.0 0.05 0.07 0.07 0.09 0.0 0.44 0.36 0.09 0.03 0.49 1.0 0.06 0.51 0.34 0.19 0.16 0.07 0.04 0.0 0.02 0.0 0.0 0.04
Mp2g09480.1 (CP31B)
0.62 0.46 0.78 0.58 0.77 0.77 0.64 0.73 0.69 0.44 0.53 0.41 0.45 0.41 0.63 0.56 0.66 0.73 1.0 0.83 0.66 0.77 0.75 0.83 0.7 0.66 0.52 0.67 0.7 0.61 0.68 0.67
Mp2g10880.1 (OFP7)
0.71 0.59 1.0 0.73 0.68 0.78 0.92 0.73 0.7 0.57 0.57 0.6 0.61 0.72 0.72 0.8 0.72 0.68 0.88 0.74 0.71 0.77 0.73 0.89 0.77 0.75 0.65 0.66 0.66 0.71 0.68 0.63
Mp2g10920.1 (GALK2)
0.3 0.21 0.45 0.53 0.69 0.41 0.39 0.41 0.22 0.36 0.33 0.26 0.31 0.64 0.53 0.49 0.49 0.63 1.0 0.82 0.49 0.54 0.68 0.97 0.49 0.41 0.3 0.28 0.32 0.44 0.47 0.47
Mp2g11180.1 (TBL11)
0.54 0.48 0.93 0.71 0.49 0.51 0.55 0.47 0.59 0.28 0.45 0.33 0.44 0.45 0.58 0.51 0.63 0.49 1.0 0.56 0.54 0.91 0.61 0.92 0.55 0.6 0.54 0.61 0.57 0.5 0.55 0.55
0.59 0.47 0.67 0.78 0.75 0.67 0.69 0.62 0.87 0.53 0.63 0.43 0.57 0.45 0.76 0.78 0.75 0.73 1.0 0.79 0.63 0.8 0.84 0.9 0.63 0.67 0.52 0.65 0.72 0.69 0.6 0.54
0.75 0.37 0.88 0.38 0.64 0.77 0.73 0.71 0.63 0.39 0.47 0.48 0.42 0.28 0.44 0.43 0.41 0.65 1.0 0.63 0.67 0.92 0.64 0.91 0.71 0.75 0.59 0.81 0.8 0.71 0.8 0.72
Mp2g16900.1 (RPL16A)
0.01 0.08 0.44 0.11 0.3 0.03 0.24 0.09 0.35 0.04 0.05 0.12 0.09 0.04 0.05 0.32 0.16 0.36 0.41 1.0 0.08 0.85 0.33 0.34 0.06 0.1 0.03 0.05 0.0 0.09 0.09 0.02
0.42 0.44 0.6 0.69 0.74 0.59 0.45 0.5 0.47 0.8 0.58 0.46 0.48 0.56 0.76 0.78 0.7 0.65 1.0 0.82 0.53 0.73 0.69 0.96 0.59 0.49 0.37 0.42 0.49 0.56 0.53 0.47
Mp2g25450.1 (ABI3)
0.21 0.18 0.49 0.45 0.33 0.18 0.16 0.14 0.71 0.19 0.19 0.18 0.18 0.41 0.4 1.0 0.45 0.18 0.84 0.46 0.14 0.71 0.42 0.86 0.19 0.2 0.2 0.27 0.2 0.26 0.27 0.17
Mp2g25600.1 (RPK2)
0.23 0.18 0.41 0.1 0.82 0.26 0.11 0.18 0.06 0.09 0.06 0.05 0.06 0.0 0.11 0.07 0.05 0.07 0.95 0.15 0.08 0.67 0.14 1.0 0.06 0.11 0.11 0.09 0.11 0.11 0.29 0.29
Mp3g01870.1 (PDI6)
0.3 0.31 0.61 0.65 0.58 0.31 0.47 0.36 0.34 0.75 0.43 0.51 0.36 0.67 0.67 1.0 0.76 0.49 0.77 0.78 0.38 0.69 0.58 0.84 0.54 0.42 0.22 0.18 0.3 0.33 0.45 0.29
Mp3g04810.1 (RBL15)
0.52 0.32 0.65 0.55 0.55 0.56 0.57 0.57 0.46 0.38 0.4 0.39 0.4 0.97 0.46 0.62 0.52 0.61 0.95 0.55 0.5 0.84 0.62 1.0 0.49 0.53 0.49 0.5 0.51 0.51 0.44 0.34
0.32 0.23 0.82 0.49 0.91 0.35 0.52 0.3 0.51 0.38 0.26 0.37 0.3 0.84 0.41 0.56 0.44 0.46 0.83 0.55 0.34 0.98 0.7 1.0 0.29 0.36 0.26 0.39 0.38 0.26 0.23 0.19
Mp3g23050.1 (COQ3)
0.39 0.21 0.61 0.48 0.74 0.39 0.51 0.39 0.45 0.27 0.27 0.29 0.26 1.0 0.46 0.55 0.43 0.45 0.97 0.57 0.43 0.84 0.74 0.91 0.39 0.49 0.32 0.34 0.37 0.31 0.39 0.39
Mp4g06100.1 (LUP1)
0.18 0.06 0.33 0.39 0.63 0.24 0.13 0.21 0.05 0.49 0.21 0.07 0.14 0.69 0.29 0.26 0.26 0.29 1.0 0.52 0.31 0.49 0.44 0.89 0.32 0.24 0.15 0.14 0.15 0.28 0.25 0.28
0.16 0.06 0.26 0.35 0.38 0.18 0.17 0.17 0.09 0.06 0.08 0.06 0.08 0.88 0.35 0.3 0.44 0.43 0.63 0.34 0.19 0.67 0.44 1.0 0.14 0.2 0.22 0.12 0.06 0.05 0.08 0.13
0.47 0.32 0.73 0.54 0.94 0.38 0.54 0.35 0.95 0.43 0.47 0.49 0.45 0.39 0.68 0.62 0.61 0.57 1.0 0.73 0.54 0.88 0.76 0.9 0.38 0.45 0.36 0.36 0.53 0.59 0.46 0.47
Mp4g16020.1 (cPT6)
0.11 0.06 0.46 0.47 0.45 0.11 0.27 0.12 0.46 0.52 0.25 0.18 0.18 0.46 0.41 0.71 0.45 0.29 1.0 0.52 0.21 0.7 0.46 0.85 0.16 0.19 0.07 0.11 0.11 0.19 0.21 0.14
0.61 0.47 0.84 0.65 0.95 0.72 0.69 0.71 0.65 0.76 0.66 0.54 0.65 0.83 0.63 0.69 0.64 0.74 1.0 0.83 0.65 0.82 0.81 0.98 0.7 0.61 0.56 0.53 0.52 0.66 0.66 0.63
Mp4g20580.1 (AtHMP49)
0.66 0.49 0.95 0.66 0.56 0.76 0.72 0.71 0.72 0.31 0.55 0.43 0.54 0.54 0.58 0.61 0.66 0.69 1.0 0.61 0.64 0.86 0.74 0.94 0.64 0.65 0.58 0.61 0.7 0.63 0.63 0.55
0.22 0.19 0.48 0.39 1.0 0.28 0.24 0.28 0.31 0.26 0.26 0.34 0.22 0.64 0.39 0.41 0.33 0.53 0.85 0.6 0.31 0.62 0.58 0.77 0.31 0.28 0.24 0.23 0.25 0.26 0.31 0.29
0.1 0.14 0.57 0.24 0.39 0.34 0.12 0.26 0.13 0.22 0.48 0.19 0.39 0.22 0.51 0.15 0.29 0.43 0.81 1.0 0.22 0.4 0.44 0.7 0.53 0.16 0.17 0.12 0.12 0.1 0.11 0.11
0.3 0.21 0.52 0.34 1.0 0.41 0.21 0.37 0.45 0.3 0.31 0.14 0.31 0.19 0.34 0.16 0.29 0.47 0.95 0.59 0.28 0.4 0.43 0.93 0.37 0.28 0.14 0.16 0.26 0.33 0.34 0.19
0.24 0.25 0.5 0.68 0.52 0.27 0.33 0.28 1.0 0.44 0.36 0.38 0.38 0.27 0.56 0.69 0.61 0.55 0.59 0.64 0.32 0.53 0.6 0.52 0.33 0.29 0.19 0.24 0.25 0.25 0.22 0.16
0.44 0.56 0.49 0.82 0.71 0.51 0.55 0.51 0.37 0.49 0.54 0.63 0.56 0.48 0.78 0.92 0.79 0.78 1.0 0.86 0.51 0.58 0.75 0.9 0.49 0.54 0.37 0.41 0.44 0.51 0.5 0.41
0.2 0.12 0.33 0.4 0.38 0.15 0.19 0.2 0.26 0.27 0.21 0.15 0.23 0.77 0.31 0.26 0.29 0.2 1.0 0.53 0.2 0.35 0.36 0.54 0.22 0.26 0.19 0.19 0.17 0.15 0.21 0.19
Mp5g21590.1 (ATL42)
0.26 0.05 0.52 0.17 0.53 0.29 0.16 0.42 0.11 0.18 0.09 0.08 0.11 0.77 0.24 0.16 0.28 0.69 0.88 0.49 0.26 0.84 0.55 1.0 0.29 0.23 0.22 0.2 0.15 0.14 0.24 0.35
Mp5g22420.1 (NAPRT1)
0.25 0.12 0.43 0.3 0.14 0.34 0.26 0.27 0.22 0.1 0.18 0.08 0.13 0.27 0.3 0.22 0.24 0.15 1.0 0.46 0.29 0.51 0.13 0.68 0.27 0.22 0.25 0.23 0.26 0.35 0.21 0.2
0.66 0.5 1.0 0.61 0.66 0.69 0.84 0.7 0.51 0.37 0.49 0.61 0.5 0.58 0.75 0.78 0.67 0.81 0.78 0.71 0.75 0.82 0.84 0.97 0.81 0.75 0.43 0.48 0.51 0.56 0.7 0.67
Mp6g05630.1 (MES8)
0.28 0.28 0.64 0.69 1.0 0.25 0.38 0.41 0.71 0.63 0.41 0.41 0.52 0.35 0.64 0.64 0.73 0.81 0.72 0.82 0.35 0.65 0.8 0.8 0.38 0.33 0.28 0.25 0.2 0.25 0.29 0.32
0.41 0.27 0.59 0.45 0.63 0.42 0.53 0.43 0.39 0.39 0.33 0.32 0.29 1.0 0.51 0.67 0.49 0.51 0.96 0.52 0.4 0.7 0.65 0.79 0.39 0.44 0.32 0.39 0.4 0.39 0.47 0.4
0.38 0.15 0.63 0.68 0.93 0.59 0.42 0.6 0.28 0.31 0.31 0.19 0.29 0.47 0.79 0.7 0.8 0.87 0.69 1.0 0.54 0.55 0.76 0.84 0.63 0.44 0.55 0.34 0.31 0.59 0.62 0.78
Mp6g12850.1 (CCZ1b)
0.74 0.58 0.75 0.8 0.81 0.76 0.89 0.74 0.87 0.73 0.72 0.58 0.68 0.7 0.72 0.91 0.79 0.82 1.0 0.73 0.71 0.95 0.88 0.9 0.7 0.78 0.63 0.73 0.74 0.72 0.72 0.72
Mp7g03140.1 (MYA1)
0.1 0.06 0.83 0.53 0.39 0.08 0.15 0.15 0.23 0.17 0.11 0.11 0.18 0.38 0.55 0.46 0.55 0.34 0.99 0.87 0.17 1.0 0.56 0.97 0.19 0.15 0.12 0.15 0.05 0.18 0.15 0.17
Mp7g03580.1 (MUR3)
0.5 0.41 0.69 0.48 0.69 0.49 0.7 0.53 0.77 0.51 0.55 0.71 0.69 0.84 0.58 1.0 0.64 0.68 0.89 0.63 0.47 0.74 0.65 0.88 0.51 0.53 0.39 0.48 0.47 0.57 0.45 0.38
Mp7g06190.1 (SDE3)
0.47 0.66 0.8 0.82 0.69 0.55 0.52 0.49 0.74 0.47 0.76 0.54 0.71 0.45 0.77 0.96 0.84 0.75 0.99 0.87 0.55 1.0 0.78 0.86 0.57 0.55 0.41 0.47 0.51 0.55 0.63 0.58
Mp7g07350.1 (RGI1)
0.01 0.0 0.28 0.13 0.34 0.06 0.0 0.0 0.08 0.01 0.02 0.01 0.0 0.04 0.17 0.03 0.1 0.03 0.77 1.0 0.02 0.55 0.11 0.68 0.03 0.0 0.0 0.0 0.01 0.0 0.0 0.01
0.0 0.0 0.19 0.02 0.07 0.01 0.0 0.0 0.08 0.0 0.01 0.0 0.0 0.01 0.02 0.0 0.01 0.01 1.0 0.68 0.01 0.7 0.03 0.87 0.01 0.0 0.0 0.0 0.01 0.0 0.0 0.01
0.38 0.23 0.42 0.8 0.76 0.53 0.5 0.48 0.2 0.19 0.31 0.21 0.32 0.67 0.93 1.0 0.77 0.65 0.77 0.86 0.52 0.67 0.79 0.81 0.66 0.45 0.3 0.38 0.53 0.52 0.73 0.62
Mp7g10410.1 (NAC014)
0.07 0.02 0.43 0.14 0.32 0.11 0.06 0.21 0.0 0.0 0.03 0.0 0.19 0.28 0.28 0.32 0.34 0.59 0.56 1.0 0.12 0.24 0.35 0.37 0.1 0.03 0.05 0.0 0.03 0.02 0.05 0.11
0.76 0.58 1.0 0.86 0.81 0.84 0.9 0.87 0.75 0.52 0.61 0.65 0.6 0.71 0.81 0.94 0.83 0.91 0.93 0.74 0.78 0.88 0.84 0.96 0.8 0.76 0.64 0.73 0.75 0.73 0.71 0.59
0.07 0.0 0.4 0.23 0.7 0.15 0.0 0.09 0.03 0.05 0.13 0.02 0.1 0.33 0.91 0.06 0.39 0.25 1.0 0.87 0.15 0.19 0.2 0.72 0.22 0.01 0.04 0.07 0.04 0.05 0.29 0.21
0.27 0.19 0.5 0.57 0.51 0.32 0.29 0.26 0.47 0.17 0.3 0.17 0.26 0.53 0.52 0.73 0.52 0.39 1.0 0.68 0.31 0.65 0.52 0.98 0.37 0.33 0.3 0.32 0.36 0.42 0.61 0.54
Mp8g06270.1 (SIR1)
0.42 0.28 0.56 0.58 0.84 0.53 0.29 0.51 0.46 0.41 0.38 0.2 0.33 0.32 0.65 0.45 0.6 0.85 1.0 0.83 0.41 0.68 0.53 0.92 0.6 0.38 0.35 0.46 0.44 0.41 0.49 0.38
0.41 0.4 0.76 0.51 0.55 0.55 0.48 0.5 0.86 0.27 0.6 0.55 0.55 1.0 0.47 0.6 0.54 0.63 0.85 0.53 0.48 0.76 0.59 0.86 0.51 0.51 0.4 0.41 0.45 0.45 0.48 0.36
Mp8g14830.1 (NMT1)
0.74 0.68 0.92 0.72 0.6 0.73 0.84 0.66 0.69 0.49 0.7 0.68 0.66 0.62 0.61 0.81 0.65 0.67 1.0 0.62 0.64 0.96 0.8 1.0 0.64 0.75 0.6 0.69 0.88 0.81 0.75 0.58
0.23 0.13 0.42 0.56 0.71 0.32 0.14 0.28 0.25 0.14 0.24 0.14 0.22 0.78 0.53 0.45 0.53 0.65 0.75 1.0 0.34 0.45 0.56 0.74 0.47 0.3 0.36 0.23 0.17 0.21 0.41 0.56
0.06 0.02 0.57 0.13 0.61 0.1 0.15 0.11 0.22 0.05 0.03 0.02 0.04 0.38 0.18 0.11 0.16 0.5 0.56 0.25 0.05 1.0 0.27 0.47 0.08 0.04 0.06 0.01 0.01 0.02 0.02 0.02
0.53 0.41 0.66 0.79 0.75 0.52 0.54 0.5 0.76 0.49 0.6 0.51 0.5 0.29 0.82 0.75 0.86 0.77 0.98 0.68 0.55 1.0 0.95 0.78 0.53 0.62 0.45 0.51 0.5 0.42 0.46 0.43
0.87 0.4 0.76 0.28 0.68 0.48 0.5 0.73 0.79 0.32 0.26 0.3 0.32 0.21 0.23 0.14 0.2 0.71 0.88 0.51 0.6 0.96 0.65 0.88 0.62 0.61 0.81 1.0 0.88 0.53 0.72 0.58

Details

Expression values normalized per gene (using the maximum value, Green cells indicate low expression and red high. (Dark gray cells indicate missing values)